Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2012. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-05-08T15:32:15Z No. of bitstreams: 1 2012_EderMarques_Parcial.pdf: 5107444 bytes, checksum: 349073f1d914e332ff3eeb2b86f6289a (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-05-10T12:08:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_EderMarques_Parcial.pdf: 5107444 bytes, checksum: 349073f1d914e332ff3eeb2b86f6289a (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-10T12:08:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_EderMarques_Parcial.pdf: 5107444 bytes, checksum: 349073f1d914e332ff3eeb2b86f6289a (MD5) / A murcha bacteriana do eucalipto é causada por Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi, biovares 1 e 3. Entretanto, em 2009, foi descrita a biovar 2 em cultivo do campo de híbrido "urograndis" de eucalipto no município de Alexânia GO, Brasil. O controle dessa bacteriose é dificultado devido a natureza sistêmica da infecção e pela eficiente sobrevivência do patógeno. Além disso, pouco se conhece a cerca da ecologia, evolução, resistência genética e de fontes de controle da doença. Dessa forma, torna-se necessário um maior conhecimento do patógeno e a busca por formas de controle, tais como: o controle biológico e o emprego de fontes de resistência genética. Este trabalho teve como objetivos: 1) caracterizar isolados de R. solanacearum de eucalipto com o uso de testes bioquímicos, além da avaliação de diferentes plantas hospedeiras e identificação por PCR com oligonucleotídios iniciadores para espécie, biovar e filótipo; 2) realizar a prospecção de bactérias isoladas em condições extremas de temperatura, pH e salinidade, de cinco diferentes tipos de solo com potencial no controle in vitro e in vivo de R. R3bv2T solanacearum da, 3) avaliar a interação entre R. solanacearum da R3bv2T e cinco diferentes tipos de solo, no desenvolvimento de miniestacas do híbrido urograndis; 4) avaliar a suscetibilidade, in vitro através do teste de microbiolização de sementes, de dezessete espécies de Eucalyptus a duas estirpes de R. solanacearum (R3bv2T e R1bv1) e 5) avaliar bactérias extremófilas facultativas com potencial na promoção do crescimento do eucalipto. De acordo com os testes, os isolados são pertencentes à biovar 2T, filótipo II de R. solanacearum e foram capazes de induzir sintomas da doença e de serem recuperados de: eucalipto, batata, berinjela, tomate, datura, nabo, gerânio, girassol, beterraba, capuchinha, feijão, mostarda, cravo-de-defunto, moringa e caju. A partir dos solos coletados foram obtidos 61 isolados bacterianos nas diferentes condições extremas, sendo que 30 tiveram ação in vitro, contra a fitobactéria. As 10 estirpes selecionadas foram identificadas, com base no sequenciamento de parte do gene do 16S rDNA, como Bacillus sp. e Enterobacter sp. e dentre elas, a UnB 1370 (Enterobacter sp.) se destacou ao mostrar uma maior atividade contra a bactéria no solo, permitindo maior desenvolvimentos das plantas. No estudo da interação de R. solanacearum versus tipos de solos, de maneira geral, a presença da bactéria no solo prejudicou o desenvolvimento das plantas, com exceção do peso seco da raiz no cambissolo onde o tratamento com a bactéria mostrou média maior que a testemunha e diferença estatisticamente significativa. O organossolo se destacou no peso seco da parte aérea e raízes, diferindo-se estatisticamente dos demais tratamentos, ao garantir melhores condições para as plantas resistirem ao ataque da bactéria. Os latossolos, mais utilizados para plantio de eucalipto no Brasil, foram considerados, neste estudo, conducivos ao patógeno. Nas espécies de Eucalyptus analisadas, a suscetibilidade variou e foi maior devido a estirpe UnB 1359 (biovar 2T), quando comparada a UnB 575 (biovar 1), ambas de eucalipto. A primeira estirpe levou a morte de mais 50% das sementes em 13 das 17 espécies analisadas, enquanto a segunda estirpe somente em 8 espécies. O híbrido urograndis e as espécies E. deanei, E. pilularis e E. robusta foram consideradas tolerantes a ambas as estirpes. Ao contrário E. cloeziana, E. paniculata, E. exserta, E. acmenoides, E. botryoides, E. pellita, E. propinqua e E. resinifera exibiram baixa tolerância. Nos testes de promoção do crescimento, a avaliação do peso seco da parte aérea revelou que todas as estirpes bacterianas levaram a ganhos quando comparados à testemunha, variando entre 11,3 e 78,0%. Entretanto, as estirpes UnB 1366, UnB 1371, UnB 1375, UnB 1370 e UnB 1373, foram as que se diferiram significativamente da testemunha. Em contrapartida, a estirpe UnB 1368 (Bacillus sp.) se destacou individualmente no incremento (130,0%) da biomassa massa radicular. Pôde-se observar também, aparentemente, que algumas estirpes induziram uma germinação precoce das sementes, em destaque a UnB 1366 (Bacillus sp.). __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Bacterial wilt of eucalyptus is caused by Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi, biovars 1 and 3. However, in 2009, biovar 2 was described in a cultivated field of the hybrid "urograndis" of the eucalyptus in the municipality of Alexânia-Goiás state, Brazil. It is difficult to control this bacterial disease because of the infection's systemic nature and the pathogen's ability to survive. Moreover, little is known about the ecology, evolution, genetic resistance and sources of control of this disease. To this end, it is necessary to carry out a more thorough knowledge of the pathogen and to search for ways to control it, such as the use of biological control and use of sources of genetic resistance. This work had the following objectives: 1) to characterize isolates of R. solanacearum from eucalyptus with the use of biochemical tests, and to carry out evaluation of various host plants and identification by PCR primers for species, biovar and phylotype; 2) to prospect for bacteria isolated in extreme temperature, pH and salinity conditions, from five different types of soil with potential for use for in vitro and in vivo control of R. solanacearum; 3) to evaluate the interaction between R. solanacearum and five different types of soil, in the development of mini-cuttings of the hybrid urograndis; and 4) to evaluate the susceptibility, in vitro, of 17 species of Eucalyptus, by means of the seed microbiolization test to two strains of R. solanacearum and 5) evaluate a potential of extremophile bacteria in promoting eucalyptus growth. According to the tests, the isolates belong to biovar 2T, phylotype II of R. solanacearum, and were capable of inducing symptoms of the disease and being recovered from, the following plants: eucalyptus, potato, eggplant, tomato, datura, turnip, geranium, sunflower, beetroot, nasturtium, bean, mustard, tagetes minuta, moringa and cashew. From the collected soils 61 bacterial isolates were obtained under different extreme conditions, and among them 30 showed in vitro action against the plant bacterium. The 10 selected strains were identified, based on sequencing some of the 16S rDNA genes, as Bacillus sp. and Enterobacter sp. Among these, UnB 1370 (Enterobacter sp.) stood out by showing a higher activity against the bacteria in the soil, allowing for greater plants development. The organosol stood out in terms of dry weight of the aerial part and roots, differing statistically from the other treatments, in that it provided better conditions for the plants to resist bacterial attack. The latosols, most xxiii used for planting eucalyptus in Brazil, were considered in this study to be conducive to the pathogen. In the species of Eucalyptus analyzed, suscetibility varied and was greatest due to the UnB 1359 strain (biovar 2T), when compared to the UnB 575 (biovar 1), both from eucalyptus. The former presented more than 50% of dead seeds in 13 of the 17 species analyzed, while the latter did so in only 8 species. The hybrid E. deanei, E. pilularis and E. robusta were considered tolerant to both strains, while E. cloeziana, E. paniculata, E. exserta, E. acmenoides, E. botryoides, E. pellita, E. propinqua and E. resinifera exhibited low tolerance. In tests for growth promotion, the evaluation of the dry weight of the aerial part revealed that all the bacterial strains led to gains compared to the control, varying from 11.3 to 78.0%. However, strains UnB 1366, UnB 1371, UnB 1375, UnB 1370 and UnB 1373 were the ones that differed significantly compared to the control. In contrast, the UnB 1368 strain (Bacillus sp.) stood out in the increase (130,0%) it showed in root biomass. It could also be observed that some strains apparently induced early seed germination, especially UnB 1366 (Bacillus sp.). In the study on interaction of R. solanacearum with types of soil, the presence of the bacterium in the soil generally hampered plant development, apart from the root dry weight in cambisol, where the treatment with the bacterium showed a higher mean weight than the control and a statistically significant difference.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-25Bitstream added on 2014-06-13T18:09:08Z : No. of bitstreams: 1 kodaira_jy_me_botib.pdf: 813284 bytes, checksum: 8a31684d77b5886e0104b40a4777583b (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Na epidemiologia matemática, uma importante medida derivada do modelo determinístico associado à dinâmica de transmissão de uma doença infecciosa é o número esperado de infecções secundárias produzidas por um caso indexado em uma população completamente suscetível, conhecido como número de reprodução básica R0. Utilizando simulações de Monte Carlo, estudamos o efeito da incerteza sobre R0 em modelos compartimentos de transmissão de doenças, associando variáveis aleatórias uniformemente distribuídas a cada parâmetro constituinte de R0. Esta pertubação sobre os parâmetros corresponde à imprecisão intrínseca de seus valores na natureza. Neste trabalho também consideramos diferentes intervalos para as taxas de transmissão de doença com o intuito de avaliar seus efeitos dinâmicos. Aplicamos este método à modelagem da ferrugem do eucalipto, que é uma doença muito comum e severa em plantações de Eucalyptus spp. e outras mirtáceas, transmitida pelo fungo Puccinia psidii Winter. Hoje o eucalipto possui importância significativa tanto no mercado nacional quanto internacional e, portanto, iniciativas que auxiliem seu manejo integrado de doenças são imprescindíveis. Nossos resultados mostram que o método utilizado é eficiente, pois representa a influência das taxas de transmissão de doença no padrão da distribuição de probabilidade aproximada de R0, permitindo a obtenção das funções empíricas percentílicas complementares para os modelos considerados / In mathematical epidemiology, an important measure derived from the deterministic model associated with the transmission dynamics of an infectious disease is the expected number of secondary infections produced by an indexed case in a completely susceptible population, known as the basic reproduction number R0. Using Monte Carlo simulations, we studied the effect of the uncertainty on R0 in compartmental disease transmission models, associating random variables uniformly distributed to each constituent parameter of R0. This perturbation on the parameters correspond to the intrinsic imprecision of their values in nature. In this work we also consider different ranges for the disease transmission rates in order to evaluate their dynamical effects. We apply this method to the eucalyptus rust, which is a very common and severe disease in plantations of Eucalyptus spp. and others Myrtaceae, transmitted by the fungus Puccinia psidii Winter. Today, eucalyptus has significant importance in both national and international market. Therefore, initiatives to help its integrated disease management are essential. Our results show that the method is efficient, since it represents the influence of the disease transmission rates in the approximated probability distribution pattern of R0, allowing us to obtain the empirical percentile complementary functions for the considered models

Orientador: José Raimundo de Souza Passos / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Laécio Carvalho de Barros / Resumo: Na epidemiologia matemática, uma importante medida derivada do modelo determinístico associado à dinâmica de transmissão de uma doença infecciosa é o número esperado de infecções secundárias produzidas por um caso indexado em uma população completamente suscetível, conhecido como número de reprodução básica R0. Utilizando simulações de Monte Carlo, estudamos o efeito da incerteza sobre R0 em modelos compartimentos de transmissão de doenças, associando variáveis aleatórias uniformemente distribuídas a cada parâmetro constituinte de R0. Esta pertubação sobre os parâmetros corresponde à imprecisão intrínseca de seus valores na natureza. Neste trabalho também consideramos diferentes intervalos para as taxas de transmissão de doença com o intuito de avaliar seus efeitos dinâmicos. Aplicamos este método à modelagem da ferrugem do eucalipto, que é uma doença muito comum e severa em plantações de Eucalyptus spp. e outras mirtáceas, transmitida pelo fungo Puccinia psidii Winter. Hoje o eucalipto possui importância significativa tanto no mercado nacional quanto internacional e, portanto, iniciativas que auxiliem seu manejo integrado de doenças são imprescindíveis. Nossos resultados mostram que o método utilizado é eficiente, pois representa a influência das taxas de transmissão de doença no padrão da distribuição de probabilidade aproximada de R0, permitindo a obtenção das funções empíricas percentílicas complementares para os modelos considerados / Abstract: In mathematical epidemiology, an important measure derived from the deterministic model associated with the transmission dynamics of an infectious disease is the expected number of secondary infections produced by an indexed case in a completely susceptible population, known as the basic reproduction number R0. Using Monte Carlo simulations, we studied the effect of the uncertainty on R0 in compartmental disease transmission models, associating random variables uniformly distributed to each constituent parameter of R0. This perturbation on the parameters correspond to the intrinsic imprecision of their values in nature. In this work we also consider different ranges for the disease transmission rates in order to evaluate their dynamical effects. We apply this method to the eucalyptus rust, which is a very common and severe disease in plantations of Eucalyptus spp. and others Myrtaceae, transmitted by the fungus Puccinia psidii Winter. Today, eucalyptus has significant importance in both national and international market. Therefore, initiatives to help its integrated disease management are essential. Our results show that the method is efficient, since it represents the influence of the disease transmission rates in the approximated probability distribution pattern of R0, allowing us to obtain the empirical percentile complementary functions for the considered models / Mestre

Orientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Martha Maria Passador / Banca: Christiane Ceriani Aparecido / Banca: Luiz Alberto Blanco Jorge / Banca: Waldir Cintra de Jesus Junior / Resumo: A cultura do eucalipto é uma das mais importantes do Brasil, constituindo-se em fonte de energia e madeira renovável, suportando importantes processos agroindustriais, dentre eles, a produção de celulose, papel e essências. O eucalipto, como outras espécies vegetais, é infectado por diversos patógenos, principalmente fungos, desde o viveiro até plantios adultos. Neste trabalho, será estudado o agente causador do cancro basal, Chrysoporthe cubensis. Esta doença possui ampla distribuição geográfica, ocorrendo desde o extremo sul do Estado de São Paulo até a Amazônia, observando-se prejuízos em regiões de baixa altitude de Espírito Santo, do Vale do rio Doce em Minas Gerais e Recôncavo Baiano. Sua sintomatologia é bastante variada, podendo atacar plantas de cinco meses de idade até o final da rotação. As plantas jovens, por apresentarem diâmetros reduzidos, podem ser aneladas na sua base pelo cancro, sendo levadas à morte. Do ataque em plantas mais velhas resultam lesões com pouco ou abundante trincamento até cancros típicos, podendo ser encontrados a diversas alturas do tronco. O local escolhido para a realização do trabalho, foi a área do projeto EUCFLUX, onde estão implantadas parcelas experimentais com 16 materiais genéticos, em diferentes condições de solo e altitude. Os estudos sobre a influência de doenças no acúmulo de biomassa e fixação de carbono são escassos, sendo assim, os objetivos desse trabalho foram: a) verificar a suscetibilidade ao cancro basal dos seis clones com maior produtividade utilizados nas parcelas experimentais do EUCFLUX; b) proceder o estudo espaço-temporal da doença e c) verificar a influência do cancro basal no acúmulo de biomassa e fixação de carbono das plantas atacadas. Foram avaliadas três repetições quanto à incidência da doença, sendo que tais dados formaram a base para a análise espaço-temporal... / Abstract: Eucalyptus' culture is one of the most important in Brazil being a source of renewable energy and wood. In addition, it supports important agro-industrial processes for the production of pulp, paper and essences. Eucalyptus, like any other plant species, can be infected by many pathogens, especially fungi, from nurseries to adult plantations. In this work, the causal agent of basal canker, Chrysoporthe cubensis, were studied. This disease has a wide geographical distribution, occurring from the southern end of São Paulo State to the Amazon, observing sensitive damages in low-lying regions of Espírito Santo State, Rio Doce Valley in Minas Gerais State and Reconcavo Baiano. Its symptons are quite varied and the fungi can attack plants from five months of age until the end of forest rotation. Young plants with small diameters may be girdled at their base by canker, being put to death. Attack in older plants may result in low or heavy typical cankers, that can be found at different heights of the trunk. The work was conducted in the area of EUCFLUX project, which were established with 16 clones in 10 experimental plots with different soil conditions and elevation. Studies of disease influence in carbon fixation and biomass accumulation are scarce, therefore, the objectives of this work were: a) verify the susceptibility to basal canker of the six clones with higher productivity used in experimental plots of EUCFLUX; b) conduct the spatiotemporal study of the disease and; c) verify the influence of basal canker in the accumulation of biomass and carbon fixation of the attacked plants. Incidence of the disease were evaluated in three plots and these data were the basis for spatiotemporal analysis. To determine biomass parameters, inventory was done in the same three plots and volume and biomass equations were adjusted. In addition, specific gravity of the wood and bark were calculated to healthy ... / Doutor

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-25T14:18:50Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 564862 bytes, checksum: e73502ca79bb97cacf0e6be99e49cbd0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-25T14:18:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 564862 bytes, checksum: e73502ca79bb97cacf0e6be99e49cbd0 (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Atualmente muitas metodologias têm sido propostas para melhoria da predição de valores genéticos genômicos, no entanto, muitas delas assumem a pressuposição de que as variáveis respostas possuem distribuição gaussiana. Contudo, existem características como resistência a doença, bifurcação em árvores de eucalipto, estágios de florescimento e acamamento em plantas, entre outras, que são classificadas como categóricas, não possuindo distribuição gaussiana para os dados. Diante do exposto, objetivou-se comparar o modelo linear generalizado com o modelo linear de Gauss-Markov, obtendo os valores genéticos genômicos de indivíduos com fenótipos categóricos referentes a resistência à ferrugem do eucalipto, causada pelo patógeno Puccinia psidii Winter. Ambos os modelos foram aplicados quando a característica fenotípica possuía quatro classes de infecção (planta imune ou com reação de hipersensibilidade, pequenas pústulas, pústulas medianas e pústulas grandes) e quando estava categorizada como tipos de reação (resistente ou suscetível). O critério de informação da deviance (DIC - Deviance Information Criterion) foi utilizado para seleção do modelo adequado para descrever a característica fenotípica. O procedimento de validação cruzada via Jacknife foi utilizado para validação das estimativas. A acurácia preditiva e o viés foram utilizados para comparação dos modelos. Quando a característica foi categorizada com quatro classes de infecção, os valores de acurácia foram semelhantes para os dois modelos (diferença menor que 0,03). No entanto, quando a categorização foi realizada com duas classes, estas diferenças foram maiores que 0,03 para apenas um dos estimadores de acurácia. O viés na predição de valores genéticos genômicos foi melhor no modelo linear de Gauss- Markov em ambos os tipos de categorização. / Currently many methodologies have been proposed for improvement on the prediction of genomic breeding values, but many of them assume that the response variables have Gaussian distribution. However, there are trait such as resistance to disease in plants, bifurcation in eucalyptus trees, flowering of plants and others, which are classified as categorical data. In view of the above, the objective was to compare the use of generalized linear model with the linear Gauss-Markov model to obtain genomic breeding values of the categorical phenotypes related to resistance to rust in eucalyptus caused by Puccinia psidii Winter pathogen. Both models were applied when the trait had four infection levels (four classes) and when the trait was classified as reaction types (in this case, having two classes). The DIC (Deviation Information Criterion) was used to choose a model, which the effects explained better the variation of the trait. The cross validation procedure via Jacknife was used to validate the estimates of the models. The predictive accuracy and bias were used to compare the models when the evaluated traits had two and four classes. When trait had four classes, the models had similar accuracy values (difference less than 0.03) and when the trait was classified in two classes, the models presented different accuracy values for only one of the accuracy estimators applied. The bias in the prediction of genomic breeding values was better in the linear Gauss-Markov model.

Made available in DSpace on 2016-12-09T13:52:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-12-09T13:55:27Z : No. of bitstreams: 1 000872895.pdf: 2530449 bytes, checksum: b7b0839ed7ed72df3a453cac568f274c (MD5) / A cultura do eucalipto é uma das mais importantes do Brasil, constituindo-se em fonte de energia e madeira renovável, suportando importantes processos agroindustriais, dentre eles, a produção de celulose, papel e essências. O eucalipto, como outras espécies vegetais, é infectado por diversos patógenos, principalmente fungos, desde o viveiro até plantios adultos. Neste trabalho, será estudado o agente causador do cancro basal, Chrysoporthe cubensis. Esta doença possui ampla distribuição geográfica, ocorrendo desde o extremo sul do Estado de São Paulo até a Amazônia, observando-se prejuízos em regiões de baixa altitude de Espírito Santo, do Vale do rio Doce em Minas Gerais e Recôncavo Baiano. Sua sintomatologia é bastante variada, podendo atacar plantas de cinco meses de idade até o final da rotação. As plantas jovens, por apresentarem diâmetros reduzidos, podem ser aneladas na sua base pelo cancro, sendo levadas à morte. Do ataque em plantas mais velhas resultam lesões com pouco ou abundante trincamento até cancros típicos, podendo ser encontrados a diversas alturas do tronco. O local escolhido para a realização do trabalho, foi a área do projeto EUCFLUX, onde estão implantadas parcelas experimentais com 16 materiais genéticos, em diferentes condições de solo e altitude. Os estudos sobre a influência de doenças no acúmulo de biomassa e fixação de carbono são escassos, sendo assim, os objetivos desse trabalho foram: a) verificar a suscetibilidade ao cancro basal dos seis clones com maior produtividade utilizados nas parcelas experimentais do EUCFLUX; b) proceder o estudo espaço-temporal da doença e c) verificar a influência do cancro basal no acúmulo de biomassa e fixação de carbono das plantas atacadas. Foram avaliadas três repetições quanto à incidência da doença, sendo que tais dados formaram a base para a análise espaço-temporal... / Eucalyptus' culture is one of the most important in Brazil being a source of renewable energy and wood. In addition, it supports important agro-industrial processes for the production of pulp, paper and essences. Eucalyptus, like any other plant species, can be infected by many pathogens, especially fungi, from nurseries to adult plantations. In this work, the causal agent of basal canker, Chrysoporthe cubensis, were studied. This disease has a wide geographical distribution, occurring from the southern end of São Paulo State to the Amazon, observing sensitive damages in low-lying regions of Espírito Santo State, Rio Doce Valley in Minas Gerais State and Reconcavo Baiano. Its symptons are quite varied and the fungi can attack plants from five months of age until the end of forest rotation. Young plants with small diameters may be girdled at their base by canker, being put to death. Attack in older plants may result in low or heavy typical cankers, that can be found at different heights of the trunk. The work was conducted in the area of EUCFLUX project, which were established with 16 clones in 10 experimental plots with different soil conditions and elevation. Studies of disease influence in carbon fixation and biomass accumulation are scarce, therefore, the objectives of this work were: a) verify the susceptibility to basal canker of the six clones with higher productivity used in experimental plots of EUCFLUX; b) conduct the spatiotemporal study of the disease and; c) verify the influence of basal canker in the accumulation of biomass and carbon fixation of the attacked plants. Incidence of the disease were evaluated in three plots and these data were the basis for spatiotemporal analysis. To determine biomass parameters, inventory was done in the same three plots and volume and biomass equations were adjusted. In addition, specific gravity of the wood and bark were calculated to healthy ...

Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-09-18T12:47:00Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 639206 bytes, checksum: dd32762cb50ada1c756583f194533ca7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-18T12:47:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 639206 bytes, checksum: dd32762cb50ada1c756583f194533ca7 (MD5) Previous issue date: 2017-07-21 / A seca-de-ponteiros, causada por Erwinia psidii é, atualmente, uma das doenças emergentes mais importantes na cultura do eucalipto no Brasil. Por se tratar de uma enfermidade recentemente descrita, pouco se sabe sobre a relação patógeno-hospeiro, cujo conhecimento pode auxiliar na determinação de medidas de controle. Assim, o presente estudo teve como objetivos: 1) Estudar a translocação e colonização de E. psidii em mudas de eucalipto; 2) Avaliar as alterações fisiológicas de plantas infectadas em relação a plantas sadias, principalmente quanto a trocas gasosas e danos ocorridos na maquinaria fotossintética e 3) Avaliar diferentes espécies de Eucalyptus e Corymbia quanto à resistência à seca-de ponteiros e ampliar o conhecimento sobre a gama de hospedeiros da bactéria em espécies da família Myrtaceae. No primeiro estudo, por meio de microscopia eletrônica de varredura, determinou-se que a colonização é principalmente acropetal e ocorre pelos vasos do xilema. Além dos vasos xilemáticos, a bactéria coloniza os espaços intercelulares e os tecidos parenquimáticas. Dentro destes tecidos, as células bacterianas formam agregados, que podem conter material fibrilar envolvendo-as, o que sugere a formação de biofilme, o qual pode desempenhar importante papel na agressidade da bactéria. No segundo estudo, não se detectaram alterações de trocas gasosas nem de fluorescência da clorofila a de plantas do clone resistente inoculadas ou não inoculadas. Entretanto, nas plantas do clone suscetível, houve redução significativa nos valores de taxa de assimilação líquida de CO 2 , condutância estomática ao vapor de água, concentração interna de CO 2 , taxa de transpiração, máxima eficiência fotoquímica, rendimento da fotoquímica, rendimento para dissipação e aumento nos valores de rendimento por outras perdas não-fotoquímicas em relação às plantas não-inoculadas (testemunhas) do mesmo clone. A infecção de E. psidii alterou a maquinaria fotossintética das plantas do clone suscetível principalmente quanto aos mecanismos de fotodissipação e fotoproteção. No terceiro estudo, por meio de inoculações conduzidas em casa de vegetação, determinou-se que todas as outras oito espécies da família Myrtaceae avaliadas foram suscetíveis à seca de ponteiros, constituindo potenciais novos hospedeiros do patógeno. Encontrou-se, contudo, ampla variação na intensidade da doença entre as 28 espécies de Eucalyptus e quatro de Corymbia testadas. A variabilidade intra e interespecífica quanto à resistência permite a seleção de materiais superiores para plantio. Os resultados deste trabalho fornecem informações importantes sobre a interação E. psidii - eucalipto e para o estabelecimento de estratégias de controle da doença por meio do plantio de genótipos resistentes. / Dieback caused by Erwinia psidii is one of the most important emerging diseases eucalypt in Brazil. Because it is a disease recently described in eucalypt, little is known about host-pathogen relations, which knowledge may help in establishing control measures. Thus, the present study aimed: 1) to study translocation and colonization of E. psidii in eucalypt cuttings; 2) to evaluate the physiological changes, estimated by gas exchanges and damages in the photosynthetic machinery and 3) to evaluate resistance of Eucalyptus spp., Corymbia spp. and several other species of Myrtaceae.to E. psidii. In the first study, we found that colonization occurs mainly acropetally by xylem vessels. In addition to the xylem vessel, the bacterium colonizes the intercellular spaces and the parenchyma cells. Intracellularly, bacterial cells form clusters, which may contain fibrillar material, suggesting biofilm formation, which may play an important role in agressiveness of the te bacterium. In the second study, no differences in gas exchange or chlorophyll fluorescence parameters were detected in either inoculated or non-inoculated plants of a resistant clone, but net CO 2 assimilation rate, stomatal conductance to water vapor, internal CO 2 concentration, transpiration rate, maximum quantum yield, effective PSII quantum yield, quantum yield of regulated energy dissipation, quantum yield of non-regulated energy dissipation were altered in infected plants in relation to non-inoculated (control). Changes occurred in photosynthetic machinery of the susceptible clone mainly for photodisipation and photoprotection mechanisms. In the third study, through inoculations conducted in greenhouse, it was determined that all the other eight species of the Myrtaceae family evaluated were susceptible to dieback, constituting potential new hosts of the pathogen. However, there was a wide variation in disease intensity of 28 species of Eucalyptus spp. and four species of Corymbia spp. tested. The intra and interspecific variability of the resistance allows the selection of superior materials for planting. The results of this work provide important information on the host-pathogen interactions between E. psidii - eucalyptus and the establishment of strategies of disease control by selecting and planting resistant genotypes.

Orientador: Carlos Frederico Wilcken / Coorientador: José Cola Zanuncio / Banca: Gabriel Moura Mascarin / Banca: Inajá Marchizel Wenzel / Banca: Everton Pires Soliman / Banca: José Eduardo Marcondes de Almeida / Resumo: Thaumastocoris peregrinus Carpintero & Dellapé, 2006 (Hemiptera: Thaumastocoridae), originário da Austrália e com ampla distribuição geográfica é responsável por perdas econômicas na cultura do eucalipto em várias regiões no mundo. Devido ao hábito alimentar deste inseto em várias espécies de Eucalyptus, este é classificado como uma praga de importância mundial. A busca por controle biológico de T. peregrinus, aliada à investigação de métodos para produção de micopesticidas bem como a necessidade de maior entendimento de fungos entomopatogênicos para controle de uma praga florestal, nos objetivou em estudar: seleção de isolados e avaliação da patogenicidade ao T. peregrinus; caracterização de Metarhizium anisopliae e Beauveria bassiana em diferentes temperaturas; fermentação sólida e líquida destes fungos nos biorreatores JKI-Solid Fermenter System, Laboratory Fermenter Prophyta L03® (M. anisopliae) e Minifors Infors HT® (B. bassiana) com diferentes escalas de produção; colheita de conídios puros oriundos de fermentação sólida; otimização dos processos de produção através de secagem em sistema estéril durante a produção do fungo; colheita e estabilidade de M. anisopliae através da secagem automatizada e caracterização de conídios puros dispersos em líquidos (Tween® 0,1% e óleo) quanto ao processo de sedimentação acelerada e distribuição do tamanho de partículas. Metarhizium anisopliae, B. bassiana, Cordyceps spp. e Sporothrix insectorum são fungos entomopatogênicos com alto p... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Thaumastocoris peregrinus Carpintero & Dellapé, 2006 (Hemiptera: Thaumastocoridae), originated in Australia and has a wide geographic distribution is responsible for economic losses in the eucalyptus plantations in several regions in the world. Due to the feeding behavior of this insect on several species of Eucalyptus, this is classified as a pest of world importance. The search for biological control of T. peregrinus, together with the investigation of methods to produce myopesticides as well as the need for a better understanding of entomopathogenic fungi to control a forest pest, aimed to study: selection of isolates and evaluation of pathogenicity to T. peregrinus; characterization of Metarhizium anisopliae and Beauveria bassiana at different temperatures; solid and liquid fermentation of these fungi in the JKI-Solid Fermenter System, Laboratory Fermenter Prophyta L03® (M. anisopliae) and Minifors Infors HT® (B. bassiana) bioreactors with different production scales; harvesting of pure conidia from solid fermentation; optimization of the production processes through drying in a sterile system during fungus production; harvesting and stability of M. anisopliae by automated drying and characterization of the pure conidia of this fungus dispersed in liquids (Tween® 0.1% and oil) in the process of accelerated sedimentation and distribution of particle size. Metarhizium anisopliae, B. bassiana, Cordyceps spp. and Sporothrix insectorum are entomopathogenic fungi with high potential to control T. peregrinus, with emphasis on M. anisopliae, the most virulent. Temperatures of 25 and 30 °C are the best for the fungi B. bassiana (IBCB227), M. anisopliae (IBCB425) and Cordyceps farinosa (IBCB220) controlling T. peregrinus. Temperatures above 37 °C can cause inactivation of IBCB425 and IBCB227 isolates, the ideal condition being 20-30 °C and 15-30 °C, respectively. In the production phase, ... / Doutor

Orientador: Carlos Frederico Wilcken / Banca: Alberto Soares Corrêa / Banca: Pedro José Ferreira Filho / Resumo: O psilídeo-de-concha do eucalipto, Glycaspis brimblecombei (Hemiptera: Aphalaridae) é uma das principais pragas exóticas do eucalipto e foi relatado no estado de São Paulo em 2003, causando danos em plantios de Eucalyptus camaldulensis. O parasitoide Psyllaephagus bliteus (Hymenoptera: Encyrtidae) foi notificado juntamente com a praga e uma nova introdução de parasitoides do México foi realizada para maximizar a eficiência de programas de controle biológico dessa praga. Os objetivos foram avaliar a diversidade genética do psilídeo-de-concha e do seu parasitoide no Brasil utilizando sequenciamento de genes mitocondriais. Insetos das duas espécies, praga e parasitoide, foram coletados em diferentes regiões do Brasil para o sequenciamento de um fragmento de genes mitocondriais. Trinta e quatro indivíduos de G. brimblecombei e 12 de Psyllaephagus spp. foram sequenciados. Um único haplótipo de COI foi encontrado nas populações de G. brimblecombei do Brasil e este é compartilhado com amostras oriundas de Portugal. Isso indica que, provavelmente, houve apenas uma ou poucas introduções do mesmo centro de origem dessa espécie no Brasil e proveniente de uma linhagem invasora presente em diferentes locais do mundo. Este fato sugere que as rotas de invasão de G. brimblecombei no mundo estão interligadas, o que parece ser um padrão para pragas invasoras de eucalipto. Para o parasitoide dois haplótipos distintos foram encontrados, com alta distância genética entre eles, sugerindo a presenç... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Red gum lerp psyllid, Glycaspis brimblecombei (Hemiptera: Aphalaridae) is one of the most important Eucalyptus exotic pests. Its first report in Brazil was in 2003, in the state of São Paulo, damaging Eucalyptus camaldulensis plantations. The parasitoid Psyllaephagus bliteus (Hymenoptera: Encyrtidae) was recorded together with the past and a new introduction of parasitoids from Mexico was carried out to improve the efficiency of biological control programs of this pest. The objectives were to evaluate the genetic diversity of the red gum lerp psyllid and its parasitoid in Brazil using mitochondrial genes sequencing. Insects of both species were collected from different regions in Brazil. Thirty-four individuals of G. brimblecombei and twelve samples of Psyllaephagus spp. were successful sequenced. A single COI gene haplotype was found in G. brimblecombei populations from Brazil and this is the same haplotype that occurs in Portugal samples, indicating one or few introduction events of G. brimblecombei in Brazil is originated from an invasive lineage distributed in other regions from the world. This fact suggests that the invasion routes of G. brimblecombei in the world are interconnected, which seems to be a standard for invasive Eucalyptus pests. Two distinct haplotypes, with a high genetic distance between them, were identified for the parasitoid. It confirms the presence of two parasitoid species in Brazil, one already identified, P. bliteus, and a second species of Psyllaephagus not morphologically identified. However, we can confirm that both parasitoid species collected in Brazil are exotic species originated from Australia / Mestre

Orientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Antonio Ribeiro da Cunha / Banca: Aparecida Conceição Boliani / Banca: Paulo Cesar Sentelhas / Banca: Clayton Alcarde Alvares / Banca: Adriana Zanin Kronka / Resumo: A ferrugem, causada pelo fungo PucciniapsidiiWinter, é uma das doenças mais importantes para a eucaliptocultura. O patógeno causa doença em minijardim clonal e em plantas novas no campo, principalmente em folhas e em brotações jovens. As condições climáticas favoráveis para infecção deste patógeno em eucalipto incluem temperatura entre 18 a25 °C, com períodos de pelo menos 6 horas de molhamento foliar, por 5 a 7 dias consecutivos. Considerando a interação entre ambiente e patógeno, e a avaliação de métodos de aplicação de fungicidas no controle da ferrugem do eucalipto, o presente trabalho teve como objetivos: (i)avaliar a dinâmica espaço-temporal da ferrugem do eucalipto, possibilitando escolhas de regiões, época de plantio e condução de rebrota com baixo favorabilidade climática de ocorrência da doença; (ii) selecionar adequadamente as áreas para a distribuição dos clones (materiais genéticos), considerando o nível de resistência dos mesmos; (iii) testar o modelo de índice de infecção para o zoneamento de favorabilidadeclimátíca e (iv) avaliar três métodos de aplicação de fungicida no controle da ferrugem do eucalipto e sua viabilidade econômica. Em relação à distribuição temporal da doença, a estação do ano com maior área favorável foi o outono com 92,90 % de áreas com índice de favorabilidade climática (IF) maior que 70%. Quanto à distribuição espacial para o Brasil, as regiões norte, centro-oeste e sudeste apresentaram grandes áreas com IF acima de 70%, ao longo de todo o ano. A região sul no período de outono e inverno, possui grande parte de seu território com o IF de 0% a 60%. No nordeste, existe uma maior área com IF abaixo de 60%, principalmente ao que ... / Abstract: The rust, caused by the fungus PucciniapsidiiWinter, is one of the most important disease of eucalyptus culture. The pathogen causes the disease in clonal mini garden and in young plants in the field, mainly in leaves and in young shoots. Favorable climatic conditions for infection of this pathogen in Eucalyptus include temperature between 18 to 25° C, with periods of at least 6 hours of leaf wetness, for 5-7 consecutive days. Considering the interaction between the envrionment and the pathogen, and, the evaluation of fungicides application methods to control the eucalyptus rust, our goals in this work were: (i) evaluate the spatiotemporal dynamic of eucalyptus rust, enabling choices of geographic areas, time of planting and regrowth conditions with low risk of disease occurrence; (ii) select rightly areas to clones distribution (genetic material), considering them resistance level; (iii) validate the zoning model of the climatic favorabiltyareas and, (iv) evaluate three fungicide application methods in the eucalyptus rust control and, the economic viability. Regarding the disease temporal distribution, the season with more favorable areas was autumn with 92,90% of areas with climatic favorabilty index (FI) greater than 70%. ... / Doutor