隨著金融控股公司法的實施，國內的金融機構紛紛朝金融控股公司的型態發展。然而，金控銀行的經營效率是否如預期般的有明顯的改善? 隸屬於金控集團的銀行其生產力是否優於無金控背景銀行?其生產力差異源自於哪些因素?。本研究採DEA模型，衡量金融控股公司與非金融控股公司效率差異，並透過差額變數分析（Slack Variable Analysis），使相對無效率銀行瞭解其缺失所在，進而尋求改進之道，將過多的投入量減少及過少的產出量增加；再利用Tobit迴歸模型，探討銀行之資本適足率、逾放比率、市場佔有率、風險水準、成本收益指標與經營效率之關係。 研究發現「金融控股公司」的平均總效率、技術效率值均高於「非金融控股公司」 。且不論是「金融控股公司」或「非金融控股公司」相對上都需減少固定資產及增加非利息收入，因而全體樣本銀行不僅需裁減人員還需廣增存款以外的利息收入或費用，以免在存款減少下引發資金不足的營運危機。

金控銀行和獨立銀行在傳統在做績效評估時，可能都只考慮相同的技術水準，如此可能無法正確來衡量不同群體的的差異，而忽略其潛在的效率改善指標。因此，本文將先採用隨機邊界模型(SFA)，估出兩體系的隨機邊界模型，接著，再運用Rao (2006)所提出的共同邊界模型(metafrontier)，來進行兩個體系的銀行效率評估。 本研究運用了民國91年到民國97年期間，13家金控銀行與24家獨立銀行的資料為樣本，去分析此兩個群體的效率比較，可得以下結論： 1.在金控銀行與獨立銀行的個別隨機邊界中，兩個群體在於技術效率的表現上差異不大。 2.金控銀行的技術效率變動有越來越小的趨勢；而獨立銀行術效率沒有明顯的縮小的趨勢。 3.獨立銀行的技術缺口比TGR有顯著的大於金控銀行的TGR。 4.在共同邊界的技術效率中，獨立銀行的技術效率顯著的大於金控銀行 / Most of traditional banking performance evaluation analyses assume both financial holding banks and independent banks share the same level of technology, thus it may not able to identify the managerial efficiency difference of different groups correctly . In this research, a SFA model (Battese and Coelli, 1995) is used first to estimate the technologies and inefficiency factors for both systems. Then a deterministic linear programming metafrontier (Rao, 2006) is adopted to evaluate the technology gap ratio between two bank systems. We collect data of 13 financial holding banks and 24 independentbanks from 2001~2008. After analyzing two systems and making comparison, the main conclusions are as follows: 1.Two bank systems have a minor difference in SFA. 2.The variance on technical efficiency becomes smaller with time in financial holding banks, but not in independent banks. 3.Independentbanks’ TGR is significantly larger than financial holding banks’. 4.In metafrontier, technical efficiency of independent banks is significantly larger than financial holding Bbnks.