Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-10T13:54:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Jose Domingues Ribeiro Neto.pdf: 910227 bytes, checksum: 5cf7fb621d27bed8f260c1e9407c0e36 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-10T13:54:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Jose Domingues Ribeiro Neto.pdf: 910227 bytes, checksum: 5cf7fb621d27bed8f260c1e9407c0e36 (MD5) Previous issue date: 2013 / FACEPE; CNPq; CAPES; / As perturbações antrópicas são, atualmente, as maiores responsáveis pela crise de extinção de espécies. A perda de habitat, poluição e as consequências decorrentes desses processos modificam as condições ambientais em nível global, ameaçando até mesmo os organismos em partes dos ecossistemas ainda não diretamente perturbadas. Os diferentes grupos de organismos respondem de maneira diferente a essas perturbações ambientais, o que propicia a identificação de espécies indicadoras de perturbação. Alguns grupos, como formigas e árvores, são, em conjunto, considerados como bons indicadores da diversidade de diversos outros grupos de organismos tanto em ecossistemas de Caatinga quanto em ecossistemas de Floresta Atlância. Entretanto, não se conhecem ainda detalhes da resposta desses dois grupos de organismos às perturbações antrópicas, especialmente em ambientes de Caatinga. Assim, o objetivo deste trabalho foi testar a hipótese de que ecossistemas de Caatinga sob níveis de perturbação mais alto retém menos diversidade de plantas e formigas. Nossas expectativas são que, conforme aumenta o nível de perturbação antrópica: (1) diminui a riqueza de espécies de plantas e formigas; (2) ocorrem modificações na composição de espécies de plantas e formigas; (3) ocorrem modificações na composição funcional de plantas e formigas; 2 (4) como as plantas são alvos diretos da perturbação, seus efeitos sobre a comunidade vegetal são mais intensos que sobre a comunidade de plantas. Este trabalho foi desenvolvido em 26 áreas de Caatinga no município de Parnamirim, Pernambuco. Foram medidos diversos descritores de perturbação antrópica ligados à distância aos núcleos de atividade humanas (sede do município, assentamentos humanos rurais e estradas), tamanho da população humana residente na área de estudo e tamanho dos rebanhos bovino e caprino (pastejo). Houve um decréscimo na riqueza de espécies de plantas conforme aumentou o nível de perturbação antrópica, mas não foi 18 evidenciada mudança na riqueza de espécies de formigas. As perturbações antrópicas modificaram a composição de espécies e funcional tanto das comunidades plantas quanto das de formigas, entretanto, enquanto que as comunidades de plantas foram afetadas por mais de um descritor de perturbação (pastejo, para composição taxonômica e funcional, distância para a sede do município, composição de espécies, e distância para assentamentos humanos, composição funcional), a composição de espécies de formiga foi afetada apenas pelo número de pessoas residentes na área de estudo, e a composição funcional da comunidade de formigas não foi afetada pelas pertubações antrópicas. Esses resultados sugerem que particularidades na resposta de plantas e formigas à perturbação, sendo que as plantas são mais sobejamente afetadas, e que, de modo geral, áreas mais perturbadas retém menor biodiversidade. Além disso, o efeito dos diferentes descritores de perturbação sugerem que variáveis como distância para as cidades e tamanho dos rebanhos bovino e caprino são importantes nos padrões de composição de espécies e funcional e devem ser levadas em consideração no manejo de áreas degradadas e na definição de áreas prioritárias para a conservação.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-06-02T22:29:36Z No. of bitstreams: 1 FlaviaMolLanna_DISSERT.pdf: 2377354 bytes, checksum: 0fe56f07a87578273cda933a22b3a564 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-06-08T22:58:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FlaviaMolLanna_DISSERT.pdf: 2377354 bytes, checksum: 0fe56f07a87578273cda933a22b3a564 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-08T22:58:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FlaviaMolLanna_DISSERT.pdf: 2377354 bytes, checksum: 0fe56f07a87578273cda933a22b3a564 (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Quais os processos e mecanismos respons?veis pela diversifica??o das esp?cies? Essa ? uma quest?o antiga que tem sido revolucionada com o avan?o tecnol?gico, computacional e metodol?gico, e tem sido agora compreendida de uma forma que antes n?o era poss?vel. A filogeografia ? uma multidisciplina que utiliza ferramentas derivadas da biogeografia, filogenia molecular e gen?tica de popula??es para entender o contexto da distribui??o dos genes no tempo e espa?o. O presente estudo utiliza an?lises filogen?ticas e filogeogr?ficas para inferir os processos determinantes na diversifica??o de lagartos do g?nero Lygodactylus nas Florestas Tropicais Sazonalmente Secas (FTSS) da Am?rica do Sul. No primeiro cap?tulo n?s investigamos as rela??es entre os Lygodactylus Sul Americanos, buscando entender a influ?ncia do Arco Pleistoc?nico em sua diversifica??o e se essas esp?cies representam um grupo monofil?tico. Atrav?s de an?lises filogen?ticas e de delimita??o de esp?cie, n?s recuperamos o monofiletismo do grupo quando comparado com as esp?cies Africanas e reconhecemos L. klugei como um complexo de esp?cies cr?pticas. N?s sugerimos o aumento de duas para cinco esp?cies de Lygodactylus na Am?rica do Sul. O tempo de diverg?ncia entre L. klugei e as esp?cies candidatas end?micas das FTSSs n?o foi congruente com a hip?tese do Arco Pleistoc?nico. Por?m, a fragmenta??o das FTSS pode ter influenciado na diverg?ncia de L. wetzeli e uma esp?cie candidata end?mica de um enclave de FTSS no Cerrado (S?o Domingos, regi?o do Vale do Paran?). No segundo cap?tulo investigamos a diversifica??o dentro da Caatinga, testando o papel do rio S?o Francisco (RSF) como barreira geogr?fica nesse bioma. Utilizamos um lagarto end?mico dessa regi?o (L. klugei) como modelo de estudo. N?s delimitamos as poss?veis linhagens, investigamos as rela??es filogen?ticas entre elas, a hist?ria de difus?o espa?otemporal e, para testar a hip?tese do rio (barreira para fluxo g?nico), n?s utilizamos uma an?lise de migra??o. N?s recuperamos duas linhagens estruturadas de acordo com o RSF: uma ao norte e outra ao sul do rio. A diverg?ncia dessas linhagens ocorreu ? 295 mil anos atr?s, congruente com a mudan?a do curso do RSF para seu atual curso. N?o encontramos influ?ncia do paleocurso do RSF na estrutura??o de L. klugei. / Which processes and mechanisms are responsible for species diversification? This old question has been revolutionized with technological, computational and methodological advancements, and is now being understood in a way that was previously not possible. Phylogeography is a multidiscipline that uses tools derived from biogeography, molecular phylogeny, and population genetics to understand the context of gene distribution in time and space. The present study uses phylogenetic and phylogeographic analyses to infer determinant processes in the diversification of the lizard genus Lygodactylus in Seasonally Dry Tropical Forests (SDTF) in South America. In the first chapter we investigate the relationships among South American Lygodactylus species, seeking to understand the influence of the Pleistocenic Arc on its diversification and whether these species represent a monophyletic group. Through phylogenetics and species delimitation analyses we recovered the monophyly of the group in relation to African species and recognized L. klugei as a cryptic species complex. We suggest that Lygodactylus in South America actually comprises five species instead of two. The divergence time among L. klugei and candidate species endemic to SDTFs was not congruent with the Pleistocenic Arc Hypothesis. However, we suggest that the fragmentation of SDTFs likely influenced the divergence of L. wetzeli, and of a candidate species endemic to a SDTF enclave within the Cerrado biome (S?o Domingos, Vale do Paran? region). In the second chapter we investigate the diversification within the Caatinga, testing the role of the S?o Francisco River (SFR) as a prominent geographic barrier. We used a lizard endemic to this region (L. klugei) as study model. We delimited the existent lineages, investigated the genetic relationships between them, the spatio-temporal diffusion history, and used a migration analysis to test the riverine hypothesis (barrier to gene flow). We recovered two lineages structured in respect to the SFR: a northern and a southern one. Lineage divergence occurred 295 kya, congruent with the course change of the SFR to its current position. We found no influence of the paleo-SFR on L. klugei structure.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-03-30T13:02:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação_Daniela_Reis_FINAL.pdf: 1679628 bytes, checksum: 38cb33a0301c9b8b0b881b5bee95a35c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-30T13:02:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação_Daniela_Reis_FINAL.pdf: 1679628 bytes, checksum: 38cb33a0301c9b8b0b881b5bee95a35c (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Universidade Federal de Pernambuco / Florestas Secas são ecossistemas expostos às perturbações antrópicas crônicas (PAC) e estão entre os mais ameaçados por mudanças climáticas devido às previsões de aumento de temperatura e redução de precipitação. Apesar de parecerem gradativos, os efeitos podem ser também bastante deletérios para a biota deste ecossistema. Neste estudo, foi investigado se o aumento da PAC e a redução da precipitação afetam a comunidade e populações de plantas com NEFs e os atributos morfo-anatômicos destas glândulas de duas espécies da Caatinga. O estudo foi realizado no Parque Nacional do Catimbau, onde os indivíduos com NEFs presentes em 19 parcelas ao longo de dois gradientes independentes de PAC e de precipitação foram marcados e suas espécies identificadas. Para análise anatômica foram coletadas amostras de glândulas de Poincianella microphylla e Pityrocarpa moniliformis. Foram encontradas 28 espécies pertencentes a 5 famílias. A composição de espécies variou apenas ao longo do gradiente de precipitação. As abundâncias de Senegalia bahiensis e Senna velutina aumentaram com a precipitação enquanto Po. microhylla e Sapium glandulosum diminuíram. Em relação aos atributos morfológicos, apenas a largura do tecido secretor e o comprimento e largura das glândulas de Pi. moniliformis foram relacionados positivamente com a precipitação e não com o gradiente de perturbação. Nossos resultados indicam que a disponibilidade de água é um fator chave para a Caatinga uma vez que o nível de precipitação local tem uma influência mais forte sobre comunidades e populações de plantas com NEF que a PAC. / Dry forests are exposed to chronic anthropogenic disturbances (CAD) and are one of the ecosystems most threatened by climate changes due to future previsions involving increasing in temperature and decreasing in rainfall. Besides the effects seem to be gradual, they can be seriously deleterious for the biota of this ecosystem. In this study was investigated if an increasing in CAD and a reduction in rainfall level affect the community and population of EFN-bearing plants and the morph-anatomical characters of these glands in Caatinga. The study was carried out at the National Park of Catimbau (Pernambuco, Brazil), where individuals with EFNs were found in 19 plots through two independent gradients of CAD and rainfall where species were marked and then identified. For the morph-anatomical analyses were collected glands surveys of Poincianella microphylla and Pityrocarpa moniliformis. It was found 28 species belonging to 5 families. Species composition changed only through the rainfall gradient. The abundances of Senegalia bahiensis and Senna velutina were positively related to the rainfall, as Po. microhylla and Sapium glandulosum were negatively related. In relation to the morphological attributes only the width of secretory tissue and the lenght of glands of Pi. moniliformis were positively related with the rainfall and not with the disturbance gradient. The results indicate that water availability is a key factor for Caatinga once the rainfall level has stronger influence on communities and populations of plants bearing EFNs than PAC do.

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Resumo: Nesta tese exploramos a diversificação de espécies de anuros da Tribo Lophyohylini distribuídas na Mata Atlântica (MA) e Caatinga, biomas do Brasil. Para tanto, utilizamos dados genômicos e métodos de filogeografia estatística para analisá-los, uma abordagem robusta e até então ainda escassa na filogeografia dos organismos sul-americanos. Através do sequenciamento Sanger amostramos trechos de DNA mitocondrial (mtDNA) e através do sequenciamento de alto rendimento obtivemos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) do DNA nuclear (nDNA). No primeiro capítulo, reunimos 82 amostras da espécie Aparasphenodon brunoi que apresenta distribuição nas terras baixas e costeiras do bioma MA, sendo considerada ideal para investigar o papel da instabilidade climática do Pleistoceno em seu processo de diversificação. Ainda no primeiro capítulo, para avaliar a influência do comportamento filopátrico, associado às diferenças no modo reprodutivo, na dispersão e consequentemente, no fluxo gênico entre populações, reunimos 72 amostras de A. arapapa e A. aff. brunoi. Estas tratam-se de espécies simpátricas, de distribuição mais restrita e com modos reprodutivos contrastantes o que as tornam ideais para esse tipo de comparação. De acordo com a inferência baseada em modelos demográficos, por volta do último máximo glacial (UMG) a população norte de A. brunoi se manteve estável enquanto que a do sul experimentou um gargalo seguido de expansão recente. Além disso, a população norte de A. brunoi apres... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In this dissertation we explored the diversification of anuran species of the Lophyohylini Tribe distributed in the Atlantic Forest (AF) and Caatinga biomes of Brazil. To do so, we used genomic data and methods of statistical phylogeography to analyze them, a robust and until then still scarce approach in the phylogeography of South American organisms. Through the Sanger sequencing we sampled mitochondrial DNA (mtDNA) and through high-throughput sequencing we obtained single nucleotide polymorphisms (SNPs) from nuclear DNA (nDNA). In the first chapter, we collected 82 samples of the species Aparasphenodon brunoi that is distributed in the low and coastal lands of the AF biome, being considered ideal to investigate the role of Pleistocene climatic instability in its diversification process. In the first chapter, to evaluate the influence of philopatric behavior, associated with differences in reproductive mode, dispersion and consequent gene flow among populations, we also collected 72 samples of A. arapapa and A. aff. brunoi species. These are sympatric species with a narrower distribution and with contrasting reproductive modes, making them ideal for this type of comparison. According to the inference based on demographic models, around the last glacial maximum (LGM) the northern population of A. brunoi remained stable while the southern one experienced a bottleneck followed by recent expansion. In addition, the northern population of A. brunoi exhibits greater nuclear diver... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor