Dissertação apresentada para obtenção do grau de Doutor em Engenharia Mecânica, na Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto, sob a orientação do Prof. Doutor Eduardo Maldonado

Tese de Doutoramento. Engenharia Electrotécnica e de Computadores. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2011

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação dos Programas de Pos-Graduação em Engenharia / Made available in DSpace on 2012-10-15T19:54:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-graduação em Engenharia Mecânica. / Made available in DSpace on 2012-10-16T21:20:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2016-01-08T14:13:13Z : No. of bitstreams: 1 180783.pdf: 4585696 bytes, checksum: f631f0ba98a34fa9346341ab3964ee55 (MD5)

Orientador: Maria José Soares Mendes Giannini / Banca: Márcia de Souza Carvalho Melhem / Banca: Maysa Furlan / Resumo: Cryptococcus neoformans é o patógeno fúngico mais comumente encontrado em infecções do sistema nervoso central, que desperta interesse devido a sua associação com os pacientes imunocomprometidos, em especial aqueles com AIDS. Embora haja ainda pouco relatados, isolados resistentes têm emergido nos últimos anos, e a disponibilidade de um método de sensibilidade rápido e reprodutível pode contribuir para a escolha do tratamento adequado. Os antifúngicos sintéticos possuem elevada toxicidade e sua disponibilidade na prática médica é relativamente pequena, algumas vezes ineficiente, o que reforça a demanda por novas alternativas terapêuticas. A busca por novos agentes antifúngicos a partir de plantas pode viabilizar o tratamento das principais micoses, diminuindo as reações adversas. Neste âmbito, pretendeuse padronizar a citometria de fluxo para a determinação da sensibilidade de anfotericina B e de substâncias de fontes naturais, comparando-as com o micrométodo. A citometria de fluxo foi utilizada no presente estudo para testar a sensibilidade de C. neoformans baseada na ligação de iodeto de propídeo na célula fúngica. Para tanto, isolados clínicos foram selecionados para análise da sensibilidade em citometria de fluxo depois de realizada a tipagem molecular de 151 isolados de Cryptococcus spp. das regiões de São José do Rio Preto e Rio de Janeiro por RFLP do gene URA5, em que a prevalência segue igual ao quadro mundial, em que o tipo molecular VNI é o mais prevalente, bem como verificou-se que a infecção por uma nova cepa e/ou diferentes espécies pode ocorrer com relativa freqüência. Foram ainda testados 57 extratos brutos, 52 frações e 53 substâncias puras isoladas de plantas do Cerrado e Mata Atlântica contra a cepa ATCC 90012 de C. neoformans... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Cryptococcus neoformans is a fungal pathogen most commonly found in infections of the central nervous system that arouses interest because of its association with immunocompromised patients, especially those with AIDS. Although have not been much reported, resistant isolates have emerged in recent years, and the availability of a method for rapid and reproducible susceptibility may contribute to the choice of treatment. The synthetic antifungal agents have high toxicity and its availability in medical practice is relatively small, sometimes inefficient, which reinforces the demand for new therapies. The search for new antifungal agents from natural products may facilitate the treatment of major fungal infections, reducing adverse reactions. In this context, we intended to standardize the flow cytometry to determine the susceptibility of amphotericin B and natural sources substances against C. neoformans, based on binding of propidium iodide (PI) in the fungal cell. For this, clinical isolates were selected for susceptibility analysis in flow cytometry after molecular typing of 151 Cryptococcus spp isolates from São José do Rio Preto and Rio de Janeiro by RFLP of the URA5 gene. The molecular type VNI is the most prevalent, as well as verified that infection by a new strain and / or different species can occur with relative frequency. We also tested 57 crude extracts, 52 fractions and 53 pure compounds isolated from plants of the Cerrado and the Atlantic forest against the C. neoformans ATCC 90012 strain. The pure substances sorbifolin, nitensoside B and isoquercitrin, from the plant Pterogyne nitens, presented MIC of 7.8μg/ml against C. neoformans, These data were confirmed by flow cytometry, after standardizing the method for amphotericin B, whose endpoint was 50% of the PI intensity, corresponding to the... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

PAULA, F. S. M. Proposta de adaptação da metodologia do highway capacity manual 2000 para análise de vias arteriais urbanas em Fortaleza. 2006. 158 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Transportes) – Centro de Tecnologia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2006. / Submitted by Zacarias Barbosa Matias Junior (zaca@det.ufc.br) on 2013-05-21T19:34:56Z No. of bitstreams: 1 2006_dis_fsmpaula.pdf: 3768647 bytes, checksum: b7469c301d167688db28b89bfc50b40c (MD5) / Approved for entry into archive by Marlene Sousa(mmarlene@ufc.br) on 2013-05-27T16:13:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_dis_fsmpaula.pdf: 3768647 bytes, checksum: b7469c301d167688db28b89bfc50b40c (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-27T16:13:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_dis_fsmpaula.pdf: 3768647 bytes, checksum: b7469c301d167688db28b89bfc50b40c (MD5) Previous issue date: 2006-02 / Arterial streets are responsible for the vast majority of the transient traffic in large Brazilian cities, thus their adequate supervision is a major concern in order to maintain acceptable levels of mobility in the network. The Highway Capacity Manual – HCM 2000 is a manual produced by United States transportation agencies providing methodologies for the assessment of the level ofservice and to estimate the capacity of several components of the traffic system, including a specific section regarding urban streets analysis. This methodology is divided in two methods: 1st Method – Street class determination; 2nd Method – Level of service assessment; and 3rd Method – Simulation of the space average speed . In this work, however, the assumed research hypothesis has considered this methodology to be inappropriate to the Brazilian reality due to differences in the physical-operational aspects of the network as well as differences in drivers behaviour characteristics. Consequently, this research aimed to verify the feasibility of the HCM 2000 methodology to arterial streets of Fortaleza and suggest adjustments to improve its effectiveness vis-à-vis the quality assessment of the transient traffic corridors in this city. Conceptual debates were complemented by the quantitative analysis of a 15 sample dataset obtained from the most important traffic corridors in Fortaleza. As a result, adjustments in the two first methods were suggested and the 3rd method was found to be recommended for planning analysis purpose only. The findings in this research are expected to contribute for the further development of a fully national methodology that would able to accurately reflect the Brazilian urban arterial streets traffic scenario. / As vias arteriais são responsáveis pelo deslocamento da maioria do tráfego de passagem nas grandes cidades brasileiras, tornando prioritário o gerenciamento desses corredores com o intuito de manter níveis aceitáveis de fluidez do tráfego veicular. O Highway Capacity Manual– HCM 2000 é um manual americano que contém metodologias para a avaliação do nível deserviço e estimação da capacidade de diversos elementos do sistema viário, incluindo uma específica para a análise de vias urbanas. Essa metodologia pode ser dividida em três métodos: 1o Método – Determinação da classe da via; 2o Método – Estimação do nível de serviço; e 3o Método – Simulação da velocidade média de percurso. Neste trabalho, entretanto, considerou-se como hipótese de pesquisa que essa metodologia não é adequada à realidade brasileira, devido às diferenças existentes tanto em relação às características físico-operacionais do sistema viário, quanto ao comportamento dos seus usuários. Portanto, esta pesquisa de dissertação objetivou verificar a adequabilidade da metodologia do HCM 2000 às vias arteriais de Fortaleza, propondo adaptações para torná-la mais eficaz na avaliação da qualidade do tráfego de passagem nos corredores arteriais dessa cidade. As discussões conceituais foram complementadas por análises quantitativas dos dados de uma amostra de 15 dos principais corredores de Fortaleza, resultando em propostas de alteração nos dois primeiros métodos, além de recomendação de utilização do 3º Método apenas em análises de planejamento. Espera-se que as conclusões deste estudo contribuam para o futuro desenvolvimento de uma metodologia genuinamente nacional que retrate com precisão a realidade do tráfego nas vias arteriais urbanas brasileiras.

Made available in DSpace on 2008-05-13T13:16:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1414.pdf: 388559 bytes, checksum: 15c794df0f37360a736c8b8d4439a559 (MD5) Previous issue date: 2002-06-25 / A liberalização da conta capital foi um fato marcante na década de 1990, no Brasil. Este trabalho se propõe a construir um índice baseado em Cardoso e Goldfajn (1997), para estudar, em termos quantitativos, a influência da legislação de controle de capital. Para isso, foi realizado um minucioso trabalho de pesquisa que abordou cerca de 200 principais normativos editados pelo Banco Central e Ministério da Fazenda, que afetaram o fluxo de capital no período 1990 - 2000. Concluímos que esse período foi marcado pela liberalização do fluxo de capital, com alguns subperíodos onde houve restrição, principalmente, à saída de capital. Nosso estudo também confirmou que o diferencial entre a taxa de juros doméstica e externa, o Plano Real, a legislação e os efeitos provocados pelas crises mexicana, asiática e russa foram fatores determinantes para explicar o fluxo de capital total entre 1990 e 2000. Ou seja, os fatores pull, push e efeito contágio foram importantes, conjuntamente, para determinar o fluxode capital total

Made available in DSpace on 2008-05-13T15:53:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2000-08-07 / A teoria clássica considera a taxa de retorno esperada como único determinante do fluxo internacional de capitais. Por sua vez, da teoria da paridade de juros resultam duas condições de equilíbrio - paridade coberta e paridade descoberta - que têm sido marcantemente utilizadas na mensuração do retorno esperado. Haja vista a ligação entre os fluxos de capitais e a teoria da paridade de juros, esta é motivo de uma discussão preliminar no Capítulo 1. Embora a teoria da paridade ensine que, sob algumas hipóteses simplifícadoras, a existência de um diferencial de juros entre duas economias seja uma condição suficiente para promover deslocamentos de capitais na direção daquela onde se observam as maiores taxas, as pesquisas empíricas quase sempre registram a presença de um diferencial de juros sem a contrapartida dos fluxos de capitais. A fim de encontrar repostas para esse desencontro entre a predição teórica e a evidência empírica, a literatura tem explorado as imperfeições de mercado. Dentre as distorções mais largamente consideradas, quatro são objeto de análise no Capítulo 1: (1) custos de transação; (2) a mobilidade imperfeita; (3) a substitutibilidade imperfeita entre títulos semelhantes emitidos em economias distintas; e (4) a assimetria de informação.

SILVA, C. R. Avaliação in vitro da atividade antifúngica da β-lapachona frente a cepas de Candida spp. resistentes a derivados azólicos na forma planctônica e em isolados formadores de biofilme. 2016. 106 f. Tese (Doutorado em Microbiologia Médica) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-01-18T14:18:45Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_crsilva.pdf: 2139615 bytes, checksum: c01276373b5208634c9333640fffcd4c (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2017-01-18T14:18:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_crsilva.pdf: 2139615 bytes, checksum: c01276373b5208634c9333640fffcd4c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-18T14:18:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_tese_crsilva.pdf: 2139615 bytes, checksum: c01276373b5208634c9333640fffcd4c (MD5) Previous issue date: 2016-07-12 / At the present time, a significant increase of opportunistic fungal infections is observed, mainly in immunocompromised patients. Candidiasis has been the most documented and are often associated with the formation of biofilms. Commercially available antifungal agents are restricted to a small number of drugs when compared to antibacterial agents. These facts, associated with the increase in the resistance frequency of Candida species, demonstrate the need to search for new therapeutic strategies, where natural products stand out. Several works have already demonstrated different biological activities of β-lapachone (naphthoquinone), including antifungal. Thus, the aim of the present study was to evaluate the antifungal potential of β-lapachone on the growth of Candida spp. Resistant to azole derivatives, in planktonic forms and biofilm, as well as to elucidate their possible mechanisms of action. For this, the evaluation of the anti-fungal effect of β-lapachone was performed on 22 strains of Candida spp. Using microdilution in broth. Subsequently, parameters such as cell viability, generation of reactive oxygen species (EROS), mitochondrial damage and phosphatidylserine externalization were evaluated by means of flow cytometric analysis and DNA damage by comet test, contributing to elucidation of the probable mechanism of Β-lapachone action. In addition, a protein expression profile was obtained by proteomic analysis in a representative C. albicans strain after treatment with the compound. And, finally, the cell viability of the biofilms was determined by the tetrazolium salt reduction (MTT) assay. According to the results, β-lapachone presented antifungal activity against strains of Candida spp. Azole resistant, with minimal inhibitory concentration (MIC) ranging from 4 - 16 μg / mL. Β-lapachone altered the permeability of the mitochondrial membrane, increased the intracellular levels of EROS, decreased cell viability in a dose-dependent manner, caused DNA damage and, consequently, led to cell death by apoptosis. Among the proteins identified, some are related to the translation process, energy metabolism, genetic processing and defense against reactive oxygen species. In relation to the biofilm assays, β-lapachone presented an effect on biofilm formed (24 hours), with the C. albicans isolate presenting a 50% reduction in concentrations of 2x MIC, 10x MIC and 50x MIC, while C. tropicalis and C In the concentrations of 10x MIC and 50x MIC (p <0.05). The use of subinhibitory concentrations was able to significantly reduce (p <0.05) the biofilm formation of Candida spp. Therefore, we conclude that β-lapachone is able to inhibit the in vitro growth of Candida spp. Resistant in both planktonic and biofilm forms suggesting that this compound molecule has the potential to act as an antifungal agent with apoptotic activity. / Nos dias atuais, observa-se um aumento significativo das infecções fúngicas oportunistas, principalmente em pacientes imunocomprometidos. A candidíase tem sido a mais documentada e muitas vezes estão associadas à formação de biofilmes. Os agentes antifúngicos disponíveis no mercado são restritos a um pequeno número de fármacos quando comparados aos agentes antibacterianos. Esses fatos associados ao aumento da frequência de resistência de espécies de Candida, demonstram a necessidade de buscar por novas estratégias terapêuticas, onde os produtos naturais se destacam. Diversos trabalhos já demonstram diferentes atividades biológicas de β-lapachona (naftoquinona), incluindo antifúngica. Assim, o objetivo do presente trabalho foi avaliar o potencial antifúngico da β-lapachona sobre o crescimento de Candida spp. resistentes a derivados azólicos, nas formas planctônicas e biofilme, bem como elucidar os seus possíveis mecanismos de ação. Para isso, a avaliação do efeito antifúngico da β-lapachona foi realizada em 22 cepas de Candida spp. utilizando microdiluição em caldo. Posteriormente, parâmetros como viabilidade celular, geração de espécies reativas de oxigênio (EROS), danos na mitocôndria e externalização de fosfatidilserina foram avaliados por meio de análises de citometria de fluxo e os danos ao DNA pelo teste do cometa contribuindo para elucidação do provável mecanismo de ação da β-lapachona. Além disso, por meio da análise proteômica foi obtido um perfil de expressão de proteínas em uma cepa representativa de C. albicans após tratamento com o composto. E, por fim, a viabilidade celular dos biofilmes foi determinada por meio do ensaio de redução do sal de tetrazólio (MTT). De acordo com os resultados obtidos, β-lapachona apresentou atividade antifúngica frente a cepas de Candida spp. resistentes a azólicos, com concentração inibitória mínima (CIM) variando entre 4 - 16 μg/mL. β-lapachona alterou a permeabilidade da membrana mitocondrial, aumentou os níveis intracelulares de EROS, diminuiu a viabilidade celular de forma dose-dependente, causou danos ao DNA e, consequentemente, conduziu morte celular por apoptose. Dentre as proteínas identificadas, algumas estão relacionadas com o processo de tradução, metabolismo energético, processamento genético e de defesa contra espécies reativas de oxigênio. Em relação aos ensaios de biofilmes, β-lapachona apresentou efeito sobre biofilme formado (24 horas), com o isolado de C. albicans apresentando redução de 50% nas concentrações de 2x CIM, 10x CIM e 50x CIM, enquanto C. tropicalis e C. parapsilosis nas concentrações de 10x CIM e 50x CIM (p < 0,05). O uso de concentrações subinibitórias foi capaz de reduzir significativamente (p < 0,05) a formação dos biofilmes de Candida spp. Portanto, conclui-se que β-lapachona é capaz de inibir o crescimento in vitro de Candida spp. resistentes a azólicos tanto na forma planctônica como em biofilme sugerindo que esta molécula composto tem potencial para agir como agente antifúngico com atividade apoptótica.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8335_Dissertação Final Thais Lazarino Maciel.pdf: 1070464 bytes, checksum: 3d18affc30d69470a0ba54528e98ca5e (MD5) Previous issue date: 2015-07-29 / Parâmetros populacionais inferidos a partir de dados genéticos são úteis na caracterização de populações naturais e importantes na determinação de áreas prioritárias para conservação, a exemplo da Floresta Atlântica, que possui uma extensa biodiversidade, inviabilizando a avaliação completa de suas espécies. Assim, estudos genéticos de algumas populações permitem interpretar a comunidade e extrapolar os resultados para outras espécies similares. Myrsine umbellata, é uma espécie arbustiva, amplamente distribuída na Floresta Atlântica, umbellata devem priorizar amostras populacionais que sejam internas, dado que estas são uma importante fonte de germoplasma para a conservação in situ. pioneira, facilitadora em áreas de regeneração natural, com dispersão zoocórica, sendo seus frutos importantes na dieta da avifauna. Com o objetivo de identificar a diversidade genética entre e dentro das populações, foram amostradas seis populações de M. umbellata, sendo elas: Macieira, Ibitirama, Iúna, Parque Estadual do Forno Grande, Santa Teresa e Parque Estadual da Pedra Azul, totalizando 63 indivíduos. Foram utilizados 10 marcadores moleculares ISSR para amplificações de 129 locos, obtendo 100% de polimorfismo para nove primers. Os dados foram submetidos à análise de similaridades entre indivíduos pelo coeficiente de Jaccard, evidenciando maior similaridade entre as populações de Ibitirama e Iúna. O índice de diversidade de Nei (He) e o índice de Shannon (H) nas populações variaram de 0,28 a 0,18 e 0,18 a 0,12, respectivamente, sendo a população da Macieira a que apresentou os maiores valores e a população de Ibitirama os menores valores. A AMOVA mostrou que a maior parte da diversidade genética ocorre dentro das populações (67,41%) do que entre (32,58%), com a estatística &#934;ST apresentando um alto nível de diferenciação genética em 0,32. O fluxo gênico estimado para o conjunto de populações foi alto (Nm = 1,24), mas acredita-se que esse valor esteja atribuído a um fluxo gênico histórico de quando as populações faziam parte de metapopulações, antes dos processos de fragmentação florestal. Foi feita também uma AMOVA para analisar par a par os valores de ØST das populações e os valores encontrados indicam que as populações estão de moderada a altamente estruturadas. Foi utilizado o método de agrupamento UPGMA tanto para indivíduos quanto para populações, e dois grandes grupos foram formados, confirmado pela avaliação feita pelo programa STRUCTURE que obteve melhor K igual a 2. A manutenção da variabilidade genética em populações é a base da conservação das espécies, dessa forma, os dados encontrados indicam que estratégias de conservação para populações de M. um