• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 4
  • Tagged with
  • 4
  • 4
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
1

Estudo da sinalização por GMP cíclico em Blastocladiella emersonii / Studies in cyclic GMP signaling pathway in Blastocladiella emersonii

Tamaki, Gabriela Mól Avelar 10 December 2014 (has links)
O segundo mensageiro cGMP está envolvido em diversas funções celulares incluindo a visão em mamíferos. Embora trabalhos anteriores mostrassem variações nos níveis de cGMP durante o ciclo de vida de Blastocladiela emersonii e evidências da existência de enzimas específicas envolvidas na sua síntese (guanilato ciclase) e degradação (cGMP fosfodiesterase), nenhum genoma de fungo publicado até o momento mostrou a existência de genes codificando estas enzimas. Este fato é atribuído por evolucionistas à completa perda de motilidade dos fungos em geral, já que cGMP está primordialmente associado a células com cílios. Blastocladiomicetos, como Blastocladiella, apresentam células móveis em pelo menos um estágio do seu ciclo de vida, o que poderia explicar a existência dessa via nesses fungos. Uma investigação no banco de ESTs de B. emersonii revelou a existência de cDNAs codificando parte de prováveis guanilato ciclases (BeGC1, BeGC2 e BeGC3) e uma possível cGMP fosfodiesterase (BePDE). Assim, este trabalho buscou confirmar a existência destas enzimas e caracterizar a sinalização por cGMP em B. emersonii. A proteína recombinante selvagem correspondente ao domínio catalítico de BePDE mostrou atividade de degradação sobre cGMP e a mutação E389A foi capaz de alterar a especificidade por cGMP. Com o sequênciamento do genoma de B. emersonii obteve-se as sequências completas das guanilato ciclases. Em BeGC2 não foi possível identificar o ligante responsável por sua ativação. Em BeGC3, a presença de um domínio Heme-Pas sugeriu sua ativação por óxido nítrico. A presença de um domínio rodopsina em BeGC1 sugeriu sua ativação por luz. Experimentos de microscopia por imunofluorescência localizaram BeGC1 no \"eyespot\", BeGC2 no capacete nuclear e BeGC3 no citoplasma de zoósporos de B. emersonii. Verificamos também que zoósporos realizam fototaxia em direção à luz verde e que a adição de hidroxilamina, inibidor de rodopsina, ou do inibidor de guanilato ciclase LY83583 tem efeito negativo na fototaxia, bem como impede o aumento dos níveis de cGMP observado em zoósporos expostos à luz verde. O bloqueio da síntese de retinal por Norflurazon também inibiu a fototaxia sendo esta restaurada quando adicionamos retinalA1. Estes dados, juntamente com o fato de o domínio rodopsina de BeGC1 ser a única rodopsina presente no genoma, indicam que BeGC1 é responsável pela fototaxia nos zoósporos de B. emersonii. O genoma do fungo apresenta ainda um possível canal de potássio ativado por cGMP (BeCNG1) localizado na membrana plasmática de zoósporos, similar ao canal regulado por cGMP envolvido na visão em humanos. Ensaios de microfluorimetria também evidenciaram a presença de um canal ativado por cGMP relacionado com o influxo de potássio e a motilidade dos zoósporos. Um modelo para a via de sinalização da fototaxia em B.emersonii foi proposto e comparado com a sinalização presente na visão de mamíferos, destacando a existência de cGMP e rodopsina em ambos os processos e sugerindo uma possível origem comum. Portanto, os resultados obtidos suportam a existência da sinalização por cGMP em B. emersonii, além de indicar o papel dessa sinalização na fototaxia dos zoósporos, sendo esta a primeira via de sinalização por cGMP caracterizada em fungos. / The second messenger cyclic GMP is involved in a wide array of cellular processes including vision in mammals. Although previous studies demonstrated changes in cGMP levels during the life cycle of Blastocladiela emersonii and evidences of specific enzymes involved in its synthesis (guanylyl cyclase) and hydrolysis (cGMP-phosphodiesterase), no fungal genome published so far shows the presence of genes encoding these enzymes. Evolutionists attribute the absence of cGMP signaling pathways in higher fungi to the sedentary life style of these organisms, since cGMP is primarily associated with ciliated cells. However, blastocladiomycetes like Blastocladiella, have motile cells in at least one stage of their life cycle, which could explain the existence of this pathway in these primitive fungi. Inspection of B. emersonii EST data bank, revealed cDNAs encoding part of three putative guanylyl cyclases (BeGC1, BeGC2 e BeGC3) and one possible cGMP phosphodiesterase (BePDE). Thus, the purpose of this study was to confirm the existence of these enzymes and characterize the cGMP signaling pathway in this model. The recombinant protein containing the wild type catalytic domain of BePDE presented activity towards hydrolysis of cGMP and the E389A mutation of this domain changed the cGMP specificity of this enzyme. The complete nucleotide sequence of the guanylyl cyclases were obtained by sequencing of B. emersonii genome. In BeGC2 we were unable identify the ligand responsible for its activation, but in BeGC3, the presence of a Heme-Pas domain suggested its activation by nitric oxide. The presence of a rhodopsin domain in BeGC1 suggested its activation by light. Immunofluorescence microscopy localized BeGC1 in the \"eyespot\" structure, BeGC2 in the nuclear cap and BeGC3 in the cytoplasm of zoospores of B. emersonii. We found that Blastocladiella zoospores performed phototaxis toward green light and photobleaching of rhodopsin function using hydroxylamine prevented both phototaxis and the increased cGMP levels observed when zoospores were exposed to green light. The same effect was observed using the guanylyl cyclase inhibitor LY83583. Inhibition of retinal synthesis using Norflurazon prevented the phototaxis response, which could be restored by zoospore complementation with retinalA1. The BeGC1 gene is the only rhodopsin found in the draft assembly of B. emersonii genome, which indicates that BeGC1 is responsible for phototaxis observed in zoospores. We also found in the genome a possible cGMP-activated potassium channel (BeCNG1), localized in the plasma membrane of the zoospores, which is similar to the cGMP-activated channel involved in human vision. In addition, microfluorimetry assays revealed the presence of a cGMP-activated potassium channel involved in potassium influx and zoospore motility. The signaling model of B. emersonii phototaxis was proposed and compared with the mammalian vision system, with cGMP and rhodopsin acting in both signaling pathways, suggesting a common origin. Altogether our data indicate that Blastocladiella emersonii has a cGMP signaling system involved in phototaxis, being the first cGMP signaling pathway characterized in fungi.
2

Estudo da sinalização por GMP cíclico em Blastocladiella emersonii / Studies in cyclic GMP signaling pathway in Blastocladiella emersonii

Gabriela Mól Avelar Tamaki 10 December 2014 (has links)
O segundo mensageiro cGMP está envolvido em diversas funções celulares incluindo a visão em mamíferos. Embora trabalhos anteriores mostrassem variações nos níveis de cGMP durante o ciclo de vida de Blastocladiela emersonii e evidências da existência de enzimas específicas envolvidas na sua síntese (guanilato ciclase) e degradação (cGMP fosfodiesterase), nenhum genoma de fungo publicado até o momento mostrou a existência de genes codificando estas enzimas. Este fato é atribuído por evolucionistas à completa perda de motilidade dos fungos em geral, já que cGMP está primordialmente associado a células com cílios. Blastocladiomicetos, como Blastocladiella, apresentam células móveis em pelo menos um estágio do seu ciclo de vida, o que poderia explicar a existência dessa via nesses fungos. Uma investigação no banco de ESTs de B. emersonii revelou a existência de cDNAs codificando parte de prováveis guanilato ciclases (BeGC1, BeGC2 e BeGC3) e uma possível cGMP fosfodiesterase (BePDE). Assim, este trabalho buscou confirmar a existência destas enzimas e caracterizar a sinalização por cGMP em B. emersonii. A proteína recombinante selvagem correspondente ao domínio catalítico de BePDE mostrou atividade de degradação sobre cGMP e a mutação E389A foi capaz de alterar a especificidade por cGMP. Com o sequênciamento do genoma de B. emersonii obteve-se as sequências completas das guanilato ciclases. Em BeGC2 não foi possível identificar o ligante responsável por sua ativação. Em BeGC3, a presença de um domínio Heme-Pas sugeriu sua ativação por óxido nítrico. A presença de um domínio rodopsina em BeGC1 sugeriu sua ativação por luz. Experimentos de microscopia por imunofluorescência localizaram BeGC1 no \"eyespot\", BeGC2 no capacete nuclear e BeGC3 no citoplasma de zoósporos de B. emersonii. Verificamos também que zoósporos realizam fototaxia em direção à luz verde e que a adição de hidroxilamina, inibidor de rodopsina, ou do inibidor de guanilato ciclase LY83583 tem efeito negativo na fototaxia, bem como impede o aumento dos níveis de cGMP observado em zoósporos expostos à luz verde. O bloqueio da síntese de retinal por Norflurazon também inibiu a fototaxia sendo esta restaurada quando adicionamos retinalA1. Estes dados, juntamente com o fato de o domínio rodopsina de BeGC1 ser a única rodopsina presente no genoma, indicam que BeGC1 é responsável pela fototaxia nos zoósporos de B. emersonii. O genoma do fungo apresenta ainda um possível canal de potássio ativado por cGMP (BeCNG1) localizado na membrana plasmática de zoósporos, similar ao canal regulado por cGMP envolvido na visão em humanos. Ensaios de microfluorimetria também evidenciaram a presença de um canal ativado por cGMP relacionado com o influxo de potássio e a motilidade dos zoósporos. Um modelo para a via de sinalização da fototaxia em B.emersonii foi proposto e comparado com a sinalização presente na visão de mamíferos, destacando a existência de cGMP e rodopsina em ambos os processos e sugerindo uma possível origem comum. Portanto, os resultados obtidos suportam a existência da sinalização por cGMP em B. emersonii, além de indicar o papel dessa sinalização na fototaxia dos zoósporos, sendo esta a primeira via de sinalização por cGMP caracterizada em fungos. / The second messenger cyclic GMP is involved in a wide array of cellular processes including vision in mammals. Although previous studies demonstrated changes in cGMP levels during the life cycle of Blastocladiela emersonii and evidences of specific enzymes involved in its synthesis (guanylyl cyclase) and hydrolysis (cGMP-phosphodiesterase), no fungal genome published so far shows the presence of genes encoding these enzymes. Evolutionists attribute the absence of cGMP signaling pathways in higher fungi to the sedentary life style of these organisms, since cGMP is primarily associated with ciliated cells. However, blastocladiomycetes like Blastocladiella, have motile cells in at least one stage of their life cycle, which could explain the existence of this pathway in these primitive fungi. Inspection of B. emersonii EST data bank, revealed cDNAs encoding part of three putative guanylyl cyclases (BeGC1, BeGC2 e BeGC3) and one possible cGMP phosphodiesterase (BePDE). Thus, the purpose of this study was to confirm the existence of these enzymes and characterize the cGMP signaling pathway in this model. The recombinant protein containing the wild type catalytic domain of BePDE presented activity towards hydrolysis of cGMP and the E389A mutation of this domain changed the cGMP specificity of this enzyme. The complete nucleotide sequence of the guanylyl cyclases were obtained by sequencing of B. emersonii genome. In BeGC2 we were unable identify the ligand responsible for its activation, but in BeGC3, the presence of a Heme-Pas domain suggested its activation by nitric oxide. The presence of a rhodopsin domain in BeGC1 suggested its activation by light. Immunofluorescence microscopy localized BeGC1 in the \"eyespot\" structure, BeGC2 in the nuclear cap and BeGC3 in the cytoplasm of zoospores of B. emersonii. We found that Blastocladiella zoospores performed phototaxis toward green light and photobleaching of rhodopsin function using hydroxylamine prevented both phototaxis and the increased cGMP levels observed when zoospores were exposed to green light. The same effect was observed using the guanylyl cyclase inhibitor LY83583. Inhibition of retinal synthesis using Norflurazon prevented the phototaxis response, which could be restored by zoospore complementation with retinalA1. The BeGC1 gene is the only rhodopsin found in the draft assembly of B. emersonii genome, which indicates that BeGC1 is responsible for phototaxis observed in zoospores. We also found in the genome a possible cGMP-activated potassium channel (BeCNG1), localized in the plasma membrane of the zoospores, which is similar to the cGMP-activated channel involved in human vision. In addition, microfluorimetry assays revealed the presence of a cGMP-activated potassium channel involved in potassium influx and zoospore motility. The signaling model of B. emersonii phototaxis was proposed and compared with the mammalian vision system, with cGMP and rhodopsin acting in both signaling pathways, suggesting a common origin. Altogether our data indicate that Blastocladiella emersonii has a cGMP signaling system involved in phototaxis, being the first cGMP signaling pathway characterized in fungi.
3

Deslocamento Seletivo Induzido do Zooplâncton Marinho em Resposta a Percepção Espectral da Luz Visível / Selective Induced Displacement from Marine Zooplankton at Responding to perception of spectral Visible Light

Baldasso, Luis Fabiano 18 February 2016 (has links)
A distribuição da biomassa do plâncton é a chave para o entendimento de vários processos inclusive a compreensão da migração vertical diurna. Entender a fototaxia positiva, como responsável por esta distribuição, com enfoque na qualidade espectral da luz é uma campo vasto a ser explorado. Investigamos a percepção espectral luminosa do mesozooplâncton marinho através da quantificação de capturas em uma nova arte de coleta com armadilha de luz. Estas armadilhas foram testadas com tratamentos luminosos na cor vermelha, verde, azul e branco. Elas foram fundeadas na enseada do Flamengo e de Ubatuba (Ubatuba-SP) no fim do verão e outono de 2015 durante a lua cheia e lua nova em três noites consecutivas. Foram avaliadas as associações de exposição (fase lunar, local de coleta e esquema de randomização dos tratamentos) baseada nos dados de captura através de gráficos NMDS, teste PERMANOVA e tabelas de contingência de Chi-quadrado. Os táxons mais abundantes nas capturas foram dois gêneros de copépodes Calanoida (Acartia sp e Temora sp) seguidos pela família Podonidae e Brachyura. Demonstramos que os organismos capturados do zooplâncton marinho expressaram seleção espectral induzidos pela fototaxia positiva. O tratamento luminoso verde exerceu maior atração nos organismos em detrimento ao tratamento luminoso vermelho. A influência das fases lunares ou dos esquemas de randomização dos tratamentos luminosos dependem da sensibilidade espectral de cada táxon. Porém local não implicou em diferenças entre as coletas. Estas particularidades da fototaxia positiva seletiva podem explicar a variação vertical da biomassa do zooplâncton marinho na coluna d\'água inclusive no entendimento da MVD. / The distribution of plankton biomass is the key for understanding many processes including diel vertical migration (DVM). Understand the positive phototaxis, as responsible for this distribution, with a focus on spectral quality of light is a vast field to be explored. We investigate the spectral light perception of the marine mesozooplankton through quantification of catches in a new art with light trap. These traps were tested with light treatments in red, green, blue and white. They were anchored in the Flamengo and Ubatuba bay (Ubatuba-SP) in late summer and autumn of 2015 during the full moon and new moon on three consecutive nights. Exposure associations were evaluated (lunar phase, site and treatment randomization scheme) based on the data capture through NMDS graphics, PERMANOVA test and Chi-square contingency tables. Most abundant taxa catched were two kinds of copepods Calanoida (Acartia sp and Temora sp) followed by Podonidae and Brachyura. We have demonstrated that the captured marine zooplankton showed spectral selection induced by positive phototaxis. The green light treatment exerted biggest attraction in organisms over the red light treatment. The influence of lunar phases or randomization schemes of bright treatments depend on the spectral sensitivity of each taxon. But location did not result in differences between collections. These specifics of selective phototaxis may explain the vertical variation of marine zooplankton biomass in water column including the understanding of DVM.
4

Deslocamento Seletivo Induzido do Zooplâncton Marinho em Resposta a Percepção Espectral da Luz Visível / Selective Induced Displacement from Marine Zooplankton at Responding to perception of spectral Visible Light

Luis Fabiano Baldasso 18 February 2016 (has links)
A distribuição da biomassa do plâncton é a chave para o entendimento de vários processos inclusive a compreensão da migração vertical diurna. Entender a fototaxia positiva, como responsável por esta distribuição, com enfoque na qualidade espectral da luz é uma campo vasto a ser explorado. Investigamos a percepção espectral luminosa do mesozooplâncton marinho através da quantificação de capturas em uma nova arte de coleta com armadilha de luz. Estas armadilhas foram testadas com tratamentos luminosos na cor vermelha, verde, azul e branco. Elas foram fundeadas na enseada do Flamengo e de Ubatuba (Ubatuba-SP) no fim do verão e outono de 2015 durante a lua cheia e lua nova em três noites consecutivas. Foram avaliadas as associações de exposição (fase lunar, local de coleta e esquema de randomização dos tratamentos) baseada nos dados de captura através de gráficos NMDS, teste PERMANOVA e tabelas de contingência de Chi-quadrado. Os táxons mais abundantes nas capturas foram dois gêneros de copépodes Calanoida (Acartia sp e Temora sp) seguidos pela família Podonidae e Brachyura. Demonstramos que os organismos capturados do zooplâncton marinho expressaram seleção espectral induzidos pela fototaxia positiva. O tratamento luminoso verde exerceu maior atração nos organismos em detrimento ao tratamento luminoso vermelho. A influência das fases lunares ou dos esquemas de randomização dos tratamentos luminosos dependem da sensibilidade espectral de cada táxon. Porém local não implicou em diferenças entre as coletas. Estas particularidades da fototaxia positiva seletiva podem explicar a variação vertical da biomassa do zooplâncton marinho na coluna d\'água inclusive no entendimento da MVD. / The distribution of plankton biomass is the key for understanding many processes including diel vertical migration (DVM). Understand the positive phototaxis, as responsible for this distribution, with a focus on spectral quality of light is a vast field to be explored. We investigate the spectral light perception of the marine mesozooplankton through quantification of catches in a new art with light trap. These traps were tested with light treatments in red, green, blue and white. They were anchored in the Flamengo and Ubatuba bay (Ubatuba-SP) in late summer and autumn of 2015 during the full moon and new moon on three consecutive nights. Exposure associations were evaluated (lunar phase, site and treatment randomization scheme) based on the data capture through NMDS graphics, PERMANOVA test and Chi-square contingency tables. Most abundant taxa catched were two kinds of copepods Calanoida (Acartia sp and Temora sp) followed by Podonidae and Brachyura. We have demonstrated that the captured marine zooplankton showed spectral selection induced by positive phototaxis. The green light treatment exerted biggest attraction in organisms over the red light treatment. The influence of lunar phases or randomization schemes of bright treatments depend on the spectral sensitivity of each taxon. But location did not result in differences between collections. These specifics of selective phototaxis may explain the vertical variation of marine zooplankton biomass in water column including the understanding of DVM.

Page generated in 0.0344 seconds