Orientadores: Paulo Inacio de Knegt Lopez de Prado, Carlos Roberto Sorensen Dutra da Fonseca / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-08T17:25:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Becker_CarlosGuilherme_M.pdf: 2929831 bytes, checksum: 6d4d242a4fbe6aac18c4546b538bce05 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: O nicho dos anfíbios muda drasticamente ao longo da ontogenia, forçando larvas e pós-metamórficos a ocuparem dois hábitats distintos. Em áreas desmatadas, sítios reprodutivos aquáticos e fragmentos florestais podem ser muito desconectados, isolando o hábitat dos girinos do hábitat dos adultos, em um padrão de fragmentação que chamamos de desconexão de hábitats. Neste estudo, avaliamos os impactos da desconexão de hábitats sobre os anfíbios (i) através de migrações reprodutivas e de padrões de abundância populacional dos anfíbios com larva aquática entre fragmentos com e sem riachos em uma paisagem fragmentada de Mata Atlântica; (ii) através do uso diferencial de hábitat por diferentes guildas nesta mesma paisagem; (iii) por meio de uma análise macroecológica avaliando o efeito da desconexão entre riachos e fragmentos florestais sobre anfíbios de serrapilheira ao longo de 13 pontos na Mata Atlântica. Em nível populacional, detectamos um forte padrão de migração dos anfíbios florestais com desenvolvimento larval aquático entre fragmentos sem riachos e os riachos da matriz de pastagem. Estas espécies foram dramaticamente mais abundantes em fragmentos com riachos do que sem riachos. A estrutura de comunidades variou consistentemente entre hábitats, sendo a guilda das espécies florestais de desenvolvimento larval aquático a mais prejudicada pela desconexão. Tratando-se de grande escala geográfica, a desconexão de hábitat foi o único atributo da paisagem afetando negativamente a riqueza de espécies com desenvolvimento larval aquático, enquanto que a perda de habitat teve influência negativa somente nas espécies com desenvolvimento direto. Estes resultados sugerem que paisagens com altas taxas de desconexão entre fragmentos florestais e sítios reprodutivos têm maior chance de sofrerem declínios populacionais, especialmente de anfíbios associados à floresta e com desenvolvimento larval aquático. Estratégias de conservação em qualquer país devem considerar o fortalecimento das leis, tendo em mente a importância das matas de galeria e a configuração de cada paisagem, minimizando a desconexão entre hábitats florestais e os sítios reprodutivos dos anfíbios / Abstract: The niche of amphibians changes drastically along the ontogeny, forcing larvae and post-metamorphics to occupy two distinct habitats. In deforested areas, aquatic breeding sites and forest fragments can be far apart, isolating the habitat of tadpoles from the habitat of adults, in a landscape pattern we call habitat-split. In this study, we evaluated the impacts of habitat-split on amphibians (i) through breeding migrations and abundance patterns of species with aquatic larvae between fragments with and without streams in a severely fragmented landscape of Brazilian Atlantic Forest; (ii) by the habitat use of different guilds in this landscape; (iii) through a macroecological analysis, evaluating the effect of habitat-split on litter-amphibians throughout 13 Atlantic Forest sites. At the population level, we detected a migration pattern for the stream-breeding forest amphibians between the fragments without streams and the streams of adjacent grass fields. These species were dramatically more abundant in fragments with streams than in fragments without streams. The community structure varied consistently across habitats, being the guild of forest-associated species with aquatic larvae the most affected by habitat-split. At a larger geographic scale, habitat-split was the only landscape attribute negatively affecting the richness of species with aquatic larval stage, whereas habitat loss had negative influences on direct development species only. These results suggest that landscapes with high mismatches between forest fragments and breeding sites are more prone to experience population declines, especially of forest-associated amphibians with aquatic larval stage. Conservation strategies in any country must regard the law reinforcement, considering the importance of riparian buffers and the configuration of each landscape, minimizing the mismatch between non-reproductive habitats and breeding sites for amphibians / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Paulo Inacio de Knegt Lopez de Prado / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-10T22:02:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Torres_PatriciaCarignano_M.pdf: 994827 bytes, checksum: 783f69cfeebf179301aa38f51ed8b078 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O cão doméstico tem atuado como espécie exótica invasora, perturbando e modificando ecossistemas nativos de diferentes maneiras. Porém, pouco se sabe sobre o tamanho da população de cães que habitam locais próximos a áreas de interesse ambiental e se isso pode influenciar a chance de entrada desses animais em tais áreas. Além disso, apesar de sua estreita ligação com a população humana, pouco se sabe sobre a relação desta com a população de cães. Sendo assim, o presente estudo teve como objetivos estimar o tamanho de populações de cães, em área urbana e rural próximas a fragmentos florestais, entender de que modo a população humana dessas áreas maneja seus cães e qual a freqüência de ocorrência de cães nos fragmentos florestais. Assim, foram feitas entrevistas com os residentes de modo a obter informações sobre o número de cães com dono e o regime de manejo dado a eles, censos de cães soltos nas áreas e foram montadas parcelas de areia dentro dos fragmentos, a distâncias crescentes da borda, para verificar a freqüência de ocorrência dos cães e se ela diferia da borda para o interior. Os resultados indicaram que ter cães é mais comum em área rural, bem como deixá-los soltos fora da propriedade. Apesar disso, o tamanho da população de cães é maior nas áreas urbanas estudadas, devido a grande densidade populacional humana. Também nessas áreas há cães sem dono, algo raro nas áreas rurais estudadas. O tamanho da população de cães no entorno não influencia a freqüência de ocorrência desses animais dentro dos fragmentos e em ambos os ambientes (rural e urbano), os cães parecem ser um efeito de borda nos fragmentos florestais. Apesar de serem pouco freqüentes a distâncias maiores da borda, esses animais foram marcadamente muito mais freqüentes que carnívoros silvestres, podendo ser mais um impacto importante causado pela presença humana nessas áreas. Assim, o efeito direto que os cães domésticos exercem sobre a fauna local é algo que ainda precisa ser estudado no Brasil / Abstract: Domestic dogs (Canis familiaris) have been acting as invasive exotic species in many instances, disturbing and modifying natural ecosystems in many ways. Still, little is know about the dogs population size near areas of conservation interest and if that can influence dog¿s chance of using those areas. In addiction, despite their close relationship with humans, little is know about the people¿s attitudes towards the dog population. Thus, this study intends to estimate dog populations sizes in urban and rural areas near forest patches, to investigate the people¿s attitudes towards dogs in those areas and to quantify dog frequencies inside forest patches. For that purpose, questionnaires with local residents were conducted to obtain information about dogs¿ number and the owners¿ attitudes towards caring for their dogs. Censuses on the areas were conducted to estimate numbers of unrestricted and stray dogs. Scent-stations were installed inside the forest patches, at different distances from the edge, to evaluate the frequency of those animals and see if it differed between patches¿ edge and their interior. Having a dog is more common in the rural area, as well as keeping them unrestricted. Yet, dogs¿ population is larger in the urban areas studied, due to high human densities. Also, in those areas there are stray dogs, which is uncommon in the rural areas studied. The dogs¿ population size in the surroundings don¿t influence their presence inside the forest patches and in both landscapes (rural and urban), dogs seems to be an edge effect. Despite not being very common inside the patches other than in its edge, these animals seem to occur more frequently than wild carnivores. For that reason they can represent another important negative impact cause by the human presence in those areas. Domestic dogs¿ direct effects on wildlife still have to be studied in Brazil, nonetheless these potential impacts can be minored by preventing dogs from entering the forest patches. To do so, the residents¿ attitudes towards dogs, in the surrounding areas, are of extreme importance / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Flavio Antonio Maes dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T08:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Portela_RitadeCassiaQuitete_D.pdf: 6621618 bytes, checksum: 9d154b095412a40c5fe90a3fb97f0ef0 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O objetivo dessa tese foi comparar a densidade, estrutura e dinâmica de populações de três espécies de palmeiras (Astrocaryum aculeatissimum (Schott) Burret, Euterpe edulis Mart. e Geonoma schottiana Mart.) em uma paisagem fragmentada de Mata Atlântica. As populações foram marcadas em 2005, reamostradas em 2006 e 2007 em cinco fragmentos florestais (19, 21, 57, 2.400 e 3.500 ha). Todos os indivíduos das três espécies dentro das parcelas foram marcados e medidos: diâmetro à altura do solo, altura até a inserção da última folha, número de folhas e tipo de folha. Esses dados serviram para classificar os indivíduos em cinco classes: plântula, infante, jovem, imaturo e reprodutivo (Capítulo 1). Para testar a existência de relação entre densidade de cada espécie e o tamanho do fragmento, nós fizemos uma correlação para dados ranqueados, usando coeficiente de Spearman. A comparação das estruturas demográficas de cada espécie foi feita pela soma das diferenças entre o número de indivíduos em cada classe, em cada ano, para cada dois fragmentos (Capítulo 2). Para cada espécie, matrizes agregadas foram construídas para cada transição de ano, onde foram juntadas todas as parcelas de todos os fragmentos, depois estimadas as probabilidades de transição e fecundidade e calculado o ? e a sensibilidade (Capítulo 3). Matrizes agregadas foram construídas para E. edulis com os dados dos três fragmentos pequenos para comparar com a população do maior fragmento para cada transição de ano. Comparamos a dinâmica (? e elasticidade) entre os fragmentos, e quantificamos a contribuição de cada taxa vital básica para a diferença observada entre os ? das áreas através do LTRE (Capítulo 4). As densidades de A. aculeatissimum, E. edulis e G. schottiana não foram influenciadas pelo tamanho do fragmento, mas apresentaram grande variação entre as áreas. A estrutura da população de A.aculeatissimum foi alterada nos menores fragmentos, principalmente as plântulas e os reprodutivos. A estrutura populacional de E. edulis nos menores fragmentos foi fortemente impactada pela exploração do palmito; a maior parte da população estava representada por imaturos. A estrutura populacional de G. schottiana não foi afetada pelo tamanho do fragmento ou pela exploração de suas folhas. Baseado nas matrizes agregadas, os ?s de A. aculeatissimum e G. schottiana não foram diferentes de um, sugerindo que essas populações não estão crescendo e nem diminuindo de tamanho. As populações de E. edulis foram projetadas para diminuir de tamanho no segundo intervalo de amostragem. As sobrevivências das três espécies foram altas para todos os estádios e a taxa vital mais importante é a sobrevivência dos maiores indivíduos. Baseado na matriz do maior fragmento, a população de E. edulis está projetada para decrescer e baseado nas matrizes agregadas dos fragmentos pequenos, a população do E. edulis está projetada para crescer. O padrão da elasticidade para as populações foi muito similar para as duas transições de ano, com os maiores valores de elasticidade sendo para a sobrevivência das classes mais desenvolvidas. A análise do LTRE revelou que o maior ? encontrado para os menores fragmentos foi principalmente influenciado pela maior sobrevivência dos imaturos e reprodutivos. De maneira geral, sobrevivência e fecundidade contribuíram de maneira positiva para ? ?, e o crescimento teve uma contribuição negativa para o ? ?. Portanto, foram encontrados resultados bastante contrastantes para as três espécies de palmeiras estudadas. Apesar de pertencerem à mesma família botânica, as três espécies possuem características e sofrem pressões ambientais bem distintas, resultando em um comportamento diferente frente à redução do habitat e a exploração de seus recursos / Abstract: The aim of this thesis was to compare the density, the structure and the dynamic of populations of three tropical palm species, Astrocaryum aculeatissimum (Schott) Burret, Euterpe edulis Mart. and Geonoma schottiana Mart., in different size fragments of Atlantic Rain Forest. For these analysis palms were censused five forest fragments (19, 21, 57, 2.400 e 3.500 ha). We tracked the survival of the palms from year 2005 through the year 2007, and recorded all new individuals encountered. Each individual had its diameter and height measured; also the number and the kind of leaf recorded. With these measures we assigned each individual to one of the five pre-established class: seedling, infant, juvenile, immature and reproductive (Chapter 1). To test if there was a relationship between density of each species and the size of the fragment we did a correlation for rank-order data, using Spearman coefficients. The comparison of the demographic structure of each palm was analyzed with the sums of the differences between the numbers of individuals in each class in each year between two fragments (Chapter 2). Summary matrices were constructed for each transition years by pooling data from all plots of all fragments together for each species, and then estimating the transition probabilities and fecundity using pooled data. With these matrices we calculated the population growth rate (?) and its elasticities for each species (Chapter 3). We found difference between ? of E. edulis in a big and the smaller fragment. Therefore, to quantify the contribution of each lower level vital rate to the observed differences in ? between the fragments, we used a fixed-design LTRE (Chapter 4). A. aculeatissimum, E. edulis and G. schottiana densities were not influenced by the size of the fragment, but showed a high variation between areas. A. aculeatissimum population structure was altered, especially by the proportion of seedlings and reproductive individuals. E. edulis population structure in the smaller fragments seemed to be highly impacted by palm heart harvest where a large proportion of the populations were represented by immature individuals. On the other hand, fragment structure and leaf harvest did not have a strong effect on the population structure of G. schottiana. In a landscape level, A. aculeatissimum and G. schottiana asymptotic population growth rates were not significantly different from one, suggesting that populations of these palms were stable. E. edulis populations are projected to decrease in size in the second transition year. A. aculeatissimum, E. edulis and G. Schottiana survivorship was high for all stage classes. We found that the more important vital rates were the survival rates in larger stages for all three species. Based on the matrix of the bigger fragment, E. Edulis populations are projected to decrease in size. On the other hand, based on summary matrices made by pooling the three smaller fragments together, E. edulis populations are projected to growth. Our LTRE analysis revealed that the generally upper ? in the smaller fragments was due primarily to great survival of immatures and reproductives in both transitions years. On average, survival and fecundity made the largest positive total contribution to ? ?, and growth made a negative contribution to ? ?. Therefore, we found very different results or the three palms studied. In spite of being the same botany family, the species are very different in its characteristics and environmental pressure, resulting in a very different behavior in face of habitat reduction and harvesting / Doutorado / Doutor em Ecologia

A conservação da biodiversidade e de ecossistemas saudáveis é extremamente necessária para a saúde dos indivíduos, das populações humanas e das demais espécies encontradas na natureza. Como conseqüência desses múltiplos estresses ambientais estão certas doenças emergentes, a desestabilização de cadeias tróficas e os efeitos deletérios na saúde de populações silvestres e na ecologia dos habitats fragmentados. O objetivo principal deste estudo foi estudar as conseqüências epidemiológicas da fragmentação florestal nas populações de animais domésticos, felinos silvestres e taiassuídeos presentes no Parque Estadual Morro do Diabo e fragmentos florestais próximos, intencionando determinar o padrão de ocorrência de doenças na população silvestre. Para isso foram capturados e tiveram amostras coletadas: 39 catetos (Tayassu tajacu), 61 queixadas (Tayassu peccari), 2 jaguatiricas (Leopardus pardalis), 2 onças pardas (Puma concolor), 8 onças pintadas (Panthera onca), e 100 Rattus rattus bem como os seguintes animais domésticos: 782 bovinos, 214 caninos, 193 eqüinos, 108 ovinos, 97 suínos e 17 gatos domésticos do entorno do PEMD e fragmentos florestais. Para os animais silvestres e domésticos amostrados, com exceção dos gatos domésticos foi realizado sorodiagnóstico para Leptospira spp (MAT) e Brucella spp. (rosa bengala e fixação de complemento) e tentativas de isolamento para Leptospira spp e Brucella spp. ; para os caninos domésticos, felídeos silvestres e taiassuídeos foi realizado sorodiagnóstico para cinomose (soroneutralização); para felídeos silvestres e felinos domésticos foi realizado sorodiagnóstico para imunodeficiência felina e leucemia felina (ELISA indireto). Dentre os felídeos selvagens e domésticos, nenhum animal foi reagente para imunodeficiência felina e leucemia felina; também não foi identificado animal reagente para cinomose entre os felídeos silvestres e taiassuídeos, porém os caninos domésticos 12 de 200 animais foram reagentes; para brucelose 7 queixadas, 1 cateto, 13 bovinos, 3 cães e 1 onça pintada foram reagentes, as outras espécies como ovinos, suínos e equinos não foram reagentes; para leptospirose 18 queixadas, 4 catetos, 1 onça pintada, 322 bovinos, 12 ovinos, 15 suínos e 64 equinos. As tentativas de isolamento para leptospirose e brucelose foram inconclusivas. Os resultados indicam que os animais silvestres e os animais domésticos do entorno das florestas foram expostos a alguns agentes pesquisados. É urgente um programa de extensionismo rural visando o incremento da saúde animal doméstica que vive no entorno do PEMD e fragmentos florestais. As altas prevalências de leptospirose em animais domésticos e silvestres, e outras doenças infecto contagiosas que possam estar presentes no estoque animal doméstico da região devem ser minimizadas com um trabalho de medicina preventiva nesta população. A presença de zoonoses como a leptospirose e brucelose nos animais domésticos são um risco de saúde pública para os proprietários rurais. Um programa de conscientização deve ser realizado na região perante os resultados desse estudo, envolvendo saúde pública, controle populacional de cães e gatos, e vacinação dos animais domésticos. Na elaboração dos planos de manejo das UCs deve ser incluído diagnóstico da fauna selvagem a patógenos, e conhecer o risco existente de doenças infectocontagiosas nos animais domésticos que vivem no entorno das UCs. / The biodiversity conservation and healthy ecossistems are extremely necessary for human health and wild animal species. As a consequence of environmental stresses are emerging diseases, trofic disrupten and harmful effects in the wildlife health population and fragmented landscape ecology. The main objective of this study is to study relationships between forest fragmentation in domestic stock, white-lipped, collared peccary, wild felides in Morro do Diabo state Park and forest fragments, to determining the pattern of disease occurrence in the wildlife population. 39 collared peccaries (Tayassu tajacu), 61 white lipped peccaries (Tayassu peccari), 2 ocelots (Leopardus pardalis), 2 pumas (Puma concolor), 8 jaguars (Panthera onca), e 100 rats (Rattus rattus) as well: 782 cattle, 214 dogs, 193 horses, 108 sheeps, 97 pigs e 17 cats surrounded MDSP and forest fragments. Serological tests were conducted for wild animals and domestic stock for Leptospira spp (MAT) e Brucella spp. (rose Bengal test, standard serum agglutination test , complement fixation) and cultures for Leptospira spp e Brucella spp..Serological tests for canine distemper (SN) were conducted for dogs, wild felides and peccaries; FIV and FelV were conducted for wild felides and cats (ELISA). Among wild felides and cats were no exposure for FIV and FeLV, as well dogs, wild felides, peccaries were no positives for canine distemper, however 12 of 200 dogs tested for canine distemper were serologically positive; for brucellosis 7 white lipped peccaries, 1 collared peccary, 13 cattle, 3 dogs, 1 jaguar were serologically positive instead of pigs, horses and sheeps, were serologically negative. For Leptospira spp. 18 white lipped peccaries, 4 collared peccaries, 1 jaguar, 322 cattle, 12 sheeps, 15 pigs, 64 horses were serologically positive instead the rats were all serologically negatives. Leptospirosis and brucellosis isolation were inconclusive. These results demonstrate that wild animals and domestic animals were exposed by these pathogens. An outreach program is necessary to improve the livestock health surround the forest fragments and the state Park. High levels of exposure of leptospirosis and brucellosis found in wild animals and livestock indicates that these pathogens are in contact with the animal population. A preventive medicine work is urgent in this area. The presence of zoonosis such as leptospirosis and brucellosis in the domestic stock are a threat to human health. An outreach program must be develop in the region facing these results and should involve public health, dogs and cats population vaccination and sterilization, vaccination of livestock. The management plans for protected areas should include screening for diseases in wild animals and domestic stock, to the acquire knowledge of infectious diseases risk nearby protected areas.

O noroeste de São Paulo, transição entre a Floresta Atlântica e o Cerrado, é uma das regiões mais fragmentadas do estado. Investigando a regeneração natural de remanescentes florestais é possível compreender como a diversidade de espécies e os processos ecológicos são mantidos nessas paisagens agrícolas muito fragmentadas, gerando subsídios para ações de conservação e restauração. Nesse sentido, as perguntas norteadoras deste estudo foram: 1) o conhecimento do componente regenerante de remanescentes florestais inseridos em matrizes agrícolas muito fragmentadas permite avaliar a perpetuação dos mesmos ao longo do tempo? 2) quais fatores, de qualidade de hábitat ou de estrutura da paisagem, exercem maior influência sobre composição, densidade e riqueza de espécies no componente regenerante desses remanescentes florestais? Para isso, foi comparada a riqueza, diversidade e composição de espécies entre o componente regenerante (altura >1,0 m e DAS< 5 cm) e arbóreo (DAS> 5 cm) de 18 fragmentos de florestas nativas do noroeste de São Paulo. Em seguida, foi analisada a relação entre a qualidade do hábitat (soma de bases do solo, teor de argila do solo e frequência de incêndio) e estrutura da paisagem (conectividade, isolamento e tamanho total do fragmento) com os valores descritivos do componente regenerante. Foram registrados no componente regenerante 5.989 indivíduos e 207 espécies, o que equivale a uma média de 4968±3584 ind.ha-1 e 33±14 espécies por fragmento. As famílias mais ricas foram Fabaceae (28 espécies), Myrtaceae (25), Rubiaceae (21) e os gêneros foram Eugenia (12), Ocotea (6), Campomanesia (5) e Psychotria (5). Comparado ao componente arbóreo, o componente regenerante apresentou significativamente menor riqueza e diversidade &alpha;, pois 71% das espécies do componente arbóreo não foram registradas na regeneração natural. Porém, ambos componentes apresentaram composição florística significativamente correlacionada. Com relação à diversidade &beta;, em média, o componente regenerante apresentou valor significativamente maior entre os fragmentos. A qualidade de habitat foi mais importante para explicar a estrutura e riqueza da comunidade regenerante. Frequência de incêndio contribuiu negativamente para a densidade total comunidade e de indivíduos zoocóricos, clímaces de sub-bosque e de dossel, assim como para a riqueza de espécies zoocóricas, pioneiras e colonizadoras. A riqueza de especialistas de florestas apresentou relação positiva com a soma de bases enquanto para a riqueza e densidade de generalistas a relação foi negativa. Soma de bases e teor de argila no solo foram as variáveis mais relacionadas com a composição florística da comunidade regenerante. Dentre as variáveis de paisagem, conectividade relacionou-se negativamente com a densidade de espécies generalistas enquanto área do fragmento apresentou relação positiva com a densidade de zoocóricas com propágulos de tamanho médio. Portanto, a regeneração natural representou um subconjunto de espécies do componente arbóreo com menor diversidade, riqueza e número de espécies compartilhadas entre os fragmentos e por isso seriam necessárias ações de manejo adaptativo para garantir a perpetuação dos remanescentes florestais nessas paisagens muito fragmentadas. Frequência de incêndios foi o principal fator comprometedor da perpetuação da biodiversidade e a importância do gradiente edáfico para composição de espécies dos remanescentes florestais da região foi confirmada. / The northwestern São Paulo, a transition area between the Atlantic Forest and Cerrado, is one of the most fragmented region of the state. Investigating the sapling community of forest communities would be possible understanding how species diversity and ecological processes are maintained in this kind of landscape and therefore it would help creating subsides for forest restoration. For this reason, the questions of this research were: 1) Does the survey of sapling community of forest remnants in highly fragmented agricultural landscape allows assessing their self-perpetuating capacity? 2) Which factors of habitat quality or landscape structure exerts greater influence on the species composition, density and species-richness of the sapling community of these forest remnants? Thus, it was assessed the sapling community (height >one, 0 m and DSH< 5,0 cm) density and compared the observed and the relative species-richness of functional groups, &alpha; and &beta; diversity and species composition to the tree community (DSH> 5,0 cm) in the same forest remnant. After that, was assessed the influence of habitat quality (soil sum of bases, soil clay content, fire frequency) and landscape structure (functional connectivity, isolation and total size of these forest remnants) on the descriptive values of sapling communities. Overall, the sapling community showed 5.989 individuals and 207 species that represent on average 4968±3584 ind.ha-1 and 33±14 species for forest fragments. The botanic families with higher species-richness were Fabaceae (28 species), Myrtaceae (25), Rubiaceae (21) and genera were Eugenia (12), Ocotea (6), Campomanesia (5) e Psychotria (5).Compared to the tree community, the sapling community had significantly smaller species-richness (observed and estimated) and &alpha; diversity, because 71 % of species from the tree community did not occur in sapling community. However, both communities had species composition significantly correlated, the sapling communities showed significantly higher &beta; diversity than trees communities. The habitat quality were more important to explain the density, species-richness and species composition of the sapling communities. Fire frequency contributed negatively to species-richness of zoochorous species, pioneer species and colonizers group (species found only at sapling community) and to the sapling density of zoochorous species, shade-tolerant canopy species and shade-tolerant understory species. The species-richness of forest-specialist species was positively related to the soil sum of bases but to the sapling density and species-richness of generalist species was found the opposite relation. Similarly, sum of base and clay content were the variables most related to the species composition of sapling community. Functional connectivity and the total area of the forests fragments explained only the density of generalist and zoochorous medium-seeded species, but with relatively smaller importance than the habitat quality variables. Thus, the sapling community of these forest remnants represented a subset of the tree community but with significant smaller diversity, species richness and number of common species among fragments and then adaptive management efforts is needed to assist long-term biodiversity persistence in forests fragments in highly fragmented agricultural landscape. Frequent fires was the main factor affecting negatively the biodiversity perpetuation and the importance of an edaphic gradient to species composition of forests remnants in the region was validated.

Tabebuia roseo-alba (Ridl.) Sand. (ipê branco) é uma árvore semidecídua que floresce abundantemente entre os meses de Agosto e Setembro. Valiosa pela qualidade de sua madeira, bem como por sua capacidade de ornamentação, esta espécie tem sido largamente utilizada em reflorestamentos e arborização urbana. A fragmentação florestal reduz o tamanho da população reprodutiva, a densidade populacional e pode isolar populações e indivíduos em campos e pastagens. Dessa forma, entender seus efeitos é fundamental para providenciar recomendações para conservação in situ e ex situ de espécies florestais. Assim, os objetivos desse trabalho foram: transferir, padronizar e caracterizar marcadores moleculares microssatélites previamente desenvolvidos em Tabebuia aurea para Tabebuia roseo-alba; avaliar a diversidade e divergência genética, o sistema reprodutivo e o fluxo de pólen em duas populações de T. roseo-alba submetidas a diferentes condições de preservação localizadas em área urbana no município de Ribeirão Preto- SP e ambiente natural em Selvíria-MS. Para isso, sementes de polinização aberta derivadas de árvores matrizes procedentes das duas populações em estudo foram coletadas. Todas as amostras tiveram seu DNA extraído e amplificado com oito pares de microssatélites heterólogos. As análises mostraram que todos os locos avaliados apresentaram herança mendeliana simples e segregam independentes, sendo, portanto, adequados para estudos de sistema de cruzamento, estrutura genética de populações e análise de paternidade. Também foi constatado que as duas populações têm elevada diversidade genética (He variando de 0,743 a 0,835) sendo as amostras de Selvíria mais diversas. Os níveis de divergência genética entre as populações foram altos e com tendência a aumentar quando comparadas as gerações de progênies. A análise do sistema de cruzamento, permitiu afirmar que as populações estudadas são mistas ( m t Ribeirão Preto = 0,840 e m t Selvíria = 0,963) com maior probabilidade de aumento na autofecundação nas árvores isoladas da população urbana. Significantes desvios do cruzamento aleatório foram observados através do cruzamento entre parentes e cruzamentos correlacionados entre e dentro de frutos, indicando endogamia nas populações. O número efetivo de doadores de pólen foi muito baixo para um mesmo fruto (1,21 em Ribeirão Preto e 1,50 em Selvíria) e mais alto entre frutos de uma mesma árvore (8,20 em Ribeirão Preto e 9,8 em Selvíria). A distância média do fluxo de pólen acessada pela análise TWOGENER foi baixa nas duas populações tanto para o modelo normal (35,4m em Ribeirão Preto e 57,3m em Selvíria) quanto para o exponencial (39,9m em Ribeirão Preto e 64,6m em Selvíria). Como o conhecimento da endogamia, cruzamentos correlacionados, autofecundação e estrutura genética espacial são fatores chave na tomada de decisões para a coleta de sementes e o plantio das mudas, estes resultados podem auxiliar programas de restauração florestal e conservação da espécie. / Tabebuia roseo-alba (Ridl.) Sand (Guayacan blanco) is one semideciduous tree that blossoms massively between August and September. Valuable for the quality of its wood, as well as its ability to ornamentation, this species has been used in urban afforestation and reforestation. The forest fragmentation reduces the size of the reproductive population, population density and can isolate populations and individuals in fields and pastures. Thus, the knowledge of the fragmentation effects may be indispensable for successful tree species conservation, breeding and regeneration. So, the aims of this study were: transfer, standardize and characterize molecular markers microsatellites developed for Tabebuia aurea; assess the diversity and genetic divergence, the mating system and the flow of pollen in two populations of T. roseoalba in different preservation conditions in an urban area located in Ribeirao Preto- SP and in a natural environment from Selvíria-MS. Therefore, open-pollinated seeds derived from seed-trees coming from the two populations above were collected. All samples had their DNA extracted and amplified with eight pairs of heterologous microsatellites. The analysis showed that all assessed loci have simple Mendelian inheritance and independent segregation, and are, therefore, suitable for studies of mating system, genetic structure of populations and paternity analysis. It was also noted that the two populations have high genetic diversity (He ranging from 0.743 to 0.835) being Selvíria samples more diversified. The levels of genetic divergence among populations were high and with a tendency to increase when the generations of offspring were compared. The analysis of the mating system showed that the populations have a mixed-mating system ( m t Ribeirão Preto = 0.840 e m t Selvíria = 0.963) with an increasing of self-fertilization in isolated trees from the urban population. Significant deviations from random mating were observed through of mating among relatives and correlated matings among and within fruits, indicating inbreeding in the populations. The effective number of pollen donors was very low for the same fruit (1.21 in Ribeirão Preto and 1.50 in Selvíria) and higher among fruits of the same tree (8.20 in Ribeirão Preto and 9.8 in Selvíria ). The average distance of the pollen flow accessed by TWOGENER analysis was low in the two populations in both normal (35.4 m in Ribeirão Preto and 57.3 m in Selvíria) and exponential models (39.9 m in Ribeirão Preto and 64.6 m in Selvíria). As the knowledge of inbreeding, correlated matings, self-fertilization and spatial genetic structure are key factors to making decisions for the collection of seeds and planting seedlings, these results may help forest restoration programs and conservation of this species.

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T12:04:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Macrini_CamilaMenezesTrindade_D.pdf: 8857853 bytes, checksum: 881e366a70a23fe7a69154f9b30021f3 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Genetica Animal e Evolução / Mestra em Genética e Biologia Molecular

Orientador:: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T17:59:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bartoleti_LuizFilipedeMacedo_M.pdf: 981663 bytes, checksum: 9efdfd02f5146e866175388d02da7638 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Processos históricos e contemporâneos moldaram os padrões de variabilidade genética das espécies da Mata Atlântica, um dos biomas mais diversos do mundo. Além disso, a fragmentação recente das florestas brasileiras pode causar sérios efeitos na estruturação genética das populações naturais, intensificando processos como deriva genética e endogamia. Os efeitos da fragmentação dependem principalmente da matriz entre os fragmentos e das características de dispersão da espécie. As aranhas são organismos que possuem modos de vida bastante diversos e as características de dispersão podem também variar bastante. Nephila clavipes é uma aranha que possui ampla distribuição na Mata Atlântica e considera-se que a espécie é capaz de dispersão por balonismo (dispersão aérea). Os objetivos desse trabalho foram estudar os padrões de variabilidade e estruturação genética em populações de fragmentos de Mata Atlântica, usando N. clavipes. Os estudos foram realizados em micro e macro escala, para inferir padrões de fluxo gênico e relacionar os resultados a aspectos ecológicos e comportamentais da espécie. Além disso, buscou-se explorar aspectos da história evolutiva da espécie e sua corrente distribuição em populações. Para isso, foi sequenciado o gene mitocondrial Citocromo Oxidase I de 323 indivíduos coletados em 15 populações de cinco Estados. Foram calculados índices de diversidade genética, além de parâmetros filogeográficos, por meio de análises bayesianas e de máxima verossimilhança. Todas as populações apresentaram polimorfismo sendo que, em geral, as populações de Minas Gerais apresentaram índices de diversidade mais altos. Os valores médios de diversidade ficaram próximos aos encontrados para outras espécies do gênero. Foi encontrada grande estruturação genética, principalmente em distâncias médias e grandes, com FST geral de 0,30178. O FST no Estado de São Paulo (a microescala geográfica) foi de apenas 0,02996, indicando baixa estruturação em baixas distâncias. A distância genética não apresentou claras relações com a distância geográfica (Teste de Mantel, p > 0,05), o que pode ser devido à dispersão por agentes, inclusive antrópicos. A análise dos valores de FST obtidos apenas com as fêmeas indica que os machos podem ter efeito de manutenção do fluxo gênico em baixas distâncias. A rede de haplótipos e as árvores de máxima verossimilhança e bayesiana indicaram a presença de três clados genéticos, não inteiramente concordantes com a distribuição dos grupos geográficos. As estimativas apontam para divergências entre esses clados genéticos datadas do Pleistoceno, assim como reportado em vários outros organismos que habitam a Mata Atlântica. Nossos resultados mostram uma espécie de invertebrado apresentando padrões filogeográficos semelhantes aos encontrados para organismos de outros grupos, o que pode indicar processos em comum na diversificação das espécies da Mata Atlântica / Abstract: Historic and contemporary processes have shaped the patterns of genetic variability of the species from Brazilian Atlantic Rainforest, one of the world's most diverse biomes. Furthermore, the recent fragmentation of Brazilian Rainforests may cause serious effects in genetic structure of natural populations, intensifying processes like genetic drift and endogamy. Fragmentation effects depend mainly on the matrix between the fragments and the species' dispersion characteristics. Spiders are organisms that show different lifestyles, and dispersion characteristics may also vary within the group. Nephila clavipes is a spider that is widely distributed in the Atlantic Rainforest and it is widely accepted that it is capable of ballooning (aerial dispersal). In the present work, we sought to study the patterns of genetic variability and structure in populations from fragments of Atlantic Rainforest, using N. clavipes. The studies have been made in micro and macro scale, looking forward to infer gene flow patterns and relate the results to ecologic and behavioral aspects of the species. Furthermore, we sought to explore aspects of the species' evolutionary history and its current distribution in populations. With those objectives in mind, we sequenced the mitochondrial gene Cytochrome Oxidase I from 323 individuals sampled in 15 populations from five States. We calculated genetic diversity indexes, phylogeographic parameters, and performed bayesian and maximum likelihood analysis. All populations presented polymorphism and, in general, Minas Gerais populations showed higher diversity indexes. Diversity mean values were close to that found in others species from the genera. We found high genetic structure, mainly at medium and great distances, with a FST value of 0,30178. The FST in São Paulo State (the geographic micro scale) was as low as 0,02996, showing low genetic structure at short distances. The genetic distance didn't show clear relationships with the geographic distance (Mantel test, p > 0,05), which may be due to the agent-guide dispersal, including anthropic agents. The analysis of the FST values obtained exclusively from the females indicates that the males may have a gene flow maintenance effect at short distances. The haplotype network and the bayesian and maximum likelihood phylogenetic trees reported the presence of three genetic clades, not entirely in agreement with the geographic groups' distribution. The estimates point to divergences between the genetic clades dated from the Pleistocene, like reported for various other organisms that live in the Atlantic Rainforest. Our results present an invertebrate species showing phylogeographic patterns similar to that found to other groups, which may indicate common processes in the diversification of Atlantic Rainforest species / Mestrado / Genetica Animal e Evolução / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientadora: Eleonore Zulnara Freire Setz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T18:01:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nagy-Reis_MarianaBaldy_M.pdf: 70885205 bytes, checksum: c47da08b5a6303f670a2ad95f9faf467 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O gênero Callicebus é o segundo maior dentre os primatas neotropicais e possui ampla distribuição geográfica. No entanto, também e um dos gêneros menos estudados e pouco se sabe sobre sua ecologia e comportamento. Dessa forma, estudamos a ecologia alimentar e o comportamento de C. nigrifrons, com ênfase na dieta, padrão de atividade, uso de espaço e estratégias adotadas em resposta a abundancia de recursos no ambiente. Observações sistemáticas de um grupo de sauás foram conduzidas ao Iongo de um ano (547hs) em um fragmento de Mata Atlântica em Campinas, SP...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Callicebus is the second largest genus among neotropical primates and is widely distributed. However, it is also one of the less-studied genera and there is little information on its ecology and behavior. Therefore, we studied the feeding ecology and behavior of C. nigrifrons, focusing on its diet, activity pattern, use of space, and strategies in response to food abundance. Information was collected during systematic observations on a titi monkey group during a one-year period (547hs) in an Atlantic Forest fragment in Carnpinas, SP...Note: The complete abstract is available with the full electronic document / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientadores: Eleonore Zulnara Freire Setz, Fernando Gertum Becker / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T16:26:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lokschin_LuisaXavier_M.pdf: 10314057 bytes, checksum: 6d5803664758c20fc4e44437cfeccda5 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: As características de fragmentos florestais e seu contexto podem contribuir para a manutenção de populações de primatas, assim como mudanças na paisagem ao longo do tempo podem alterar sua distribuição. O objetivo deste trabalho é identificar se características de fragmentos florestais e seu contexto na paisagem são determinantes na distribuição de Alouatta clamitans bem como relacionar padrões de mudanças na paisagem ao longo do tempo com a distribuição da espécie, em uma grande cidade no sul do Brasil (Porto Alegre, RS). Dados de presença e ausência da espécie foram obtidos na região de estudo em quadrículas de 25 ha. Os dados de quadrículas foram convertidos para presença/ausência de bugios nos fragmentos florestais. As variáveis (área, forma, isolamento, antropização, distância de via e de urbanização) foram obtidas por ferramentas de geoprocessamento para os 214 fragmentos. Para a análise da distribuição temporal da espécie, a presença/ausência de bugios em 65 quadrículas foi comparada em dois momentos no tempo (1995 e 2010). Obtivemos variáveis de mudança na paisagem através de ferramentas de geoprocessamento, com base em fotografias aéreas e imagens de satélite. Os fragmentos de mata com bugios são em menor número, mais conectados e estão em contexto menos antropizado. Em 63% das quadrículas houve persistência de bugios, em 3% desaparecimento, em 26% colonização e em 8% manutenção de ausência. As mudanças ocorridas na paisagem não estão diretamente relacionadas com a variação na distribuição da espécie. Os bugios estão distribuídos em boa parte dos remanescentes florestais do município, em fragmentos grandes, conectados e em contexto menos antropizado e se mantém, pelo período de 15 anos, num mosaico de paisagem com fragmentos florestais em contexto predominantemente rural / Abstract: Forest fragment characteristics and context may contribute to the persistence of primate population, as well as landscape alteration in time can change their distribution. Our objective is to identify which are those forest fragments and context characteristics that determine the distribution of Alouatta clamitans and also relate landscapes changes in 15 years time with changes in the species distribution in Porto Alegre, RS. The species has been recorded in the municipality in 25 ha squares. Howler monkey presence or absence data in squares were transposed to forest fragments. Areas, shape, isolation, anthopization and distances from roads and urban areas were obtained by geoprocessing tools. Sixty five squares were visited twice, in 1995 and in 2010 to verify changes in howler monkey distribution. Landscape change analysis was made by geoprocessing tools based on aerial photos and satellite images. There are more fragments with howlers' presence than without, and they are also larger, less isolated and in context less anthropized than those where howlers were absent. In 63% of the squares howlers persisted, in 3% they disappeared, 26% were colonized and kept absent in 8%. There were little changes in the landscape, and they're not related to changes in howlers' distribution. Landscape mosaics, with natural and rural areas seem to contribute to the occurrence, and persistence, of the species. Conservation strategies should keep large and connected areas in predominant rural landscapes / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia