Submitted by MARÍLIA FREITAS DE VASCONCELOS MELO null (mariliafvm@yahoo.com.br) on 2017-01-30T15:23:39Z No. of bitstreams: 1 TESE_FINAL_novas_normas_Marília.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-02-03T11:57:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 melo_mfv_dr_bot.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-03T11:57:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 melo_mfv_dr_bot.pdf: 1896101 bytes, checksum: 142600ba35ab52814844133ca6cc3e98 (MD5) Previous issue date: 2016-12-15 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Estudos sobre ecologia e genética de populações são fundamentais para entender os efeitos da fragmentação sobre espécies florestais. Um estudo baseado em genética quantitativa e marcadores microssatélites foi realizado para investigar a diversidade genética, estrutura genética espacial, sistema de reprodução e a dispersão de pólen em uma população natural e em um teste de progênies de Genipa americana L. para fins de conservação e melhoramento genético. As coletas foram realizadas em duas populações: a primeira localizada no nordeste do Brasil, em uma área de transição entre a Mata Atlântica e a Caatinga (POP-SE) e a segunda no sudeste, em um Banco Ativo de Germoplasma estabelecido em área de transição entre a Mata Atlântica representada pela Florestal Estacional Semidecidual e o Cerrado (POP-SP). Foram coletados tecidos foliares de 30 árvores matrizes e 20 plantas/progênie em cada uma das populações. As análises do sistema de reprodução foram realizadas com base no modelo misto de reprodução e modelo de cruzamentos correlacionados. Como esperado em espécies dióicas, todas as progênies foram originadas de cruzamento (tm = 1). A taxa de cruzamento entre parentes (tm – ts) e a correlação de paternidade (rp) foram variáveis entre famílias (tm – ts= 0,03-0,19; rp= 0,04-0,40). O índice de fixação (F) foi significativamente menor em adultos que em progênies, indicando seleção contra indivíduos endogâmicos. A correlação de paternidade dentro de frutos (0,40) foi maior que entre frutos (0,26), indicando um menor número efetivo de doadores de pólen (Nep) dentro de frutos (2,5) que entre frutos (3,8). Devido a maior rp na POP-SE, o tamanho efetivo dentro de famílias nesta população foi menor (2,69) que na POP-SP (3,27). O coeficiente de correlação de Spearman mostrou que o aumento no Nep aumenta a diversidade genética e o Ne dentro de famílias. O padrão de dispersão de pólen foi fortemente leptocúrtico, sugerindo dispersão de pólen a longa distância (média = 179 m). Os resultados evidenciam a variabilidade genética entre os indivíduos e indicam a potencialidade dos mesmos para a conservação in situ, coleta de sementes para formação de bancos de germoplasma, bem como para a recuperação de áreas degradadas e futuros programas de melhoramento genético em áreas de transição entre diferentes biomas. / Studies about ecology and population genetics are essential to understand the effects of fragmentation on forest species. A study based on quantitative genetics and microsatellite markers was conducted to investigate the genetic diversity, spatial genetic structure, mating system and pollen dispersal in a natural population and onan progenies test of Genipa americana L. aiming conservation and breeding. Samples were collected in two populations: the first located in the northeast of Brazil, in a transition area between the Atlantic Forest and Caatinga (POP-SE) and the second in the southeast, in an Active Germplasm Bank established in area transition between the Atlantic represented by Forest Semideciduous and the Cerrado (POPSP). Leaf tissues were collected from 30 seed-trees and 20 plants/progeny in each of the populations. The analysis of the mating system were performed based on the mixed mating model and correlated crosses model. As expected in dioecious species, all offspring were originated from outcrossing ( m t = 1). The mating among relatives rate ( m s t t ) and paternity correlation ( p r ) were variable among families ( m s t t = 0.03-0.19; p r = 0.04-0.40), especially in NP. Fixation index ( F ) was generally significant lower in the adults than offspring, indicating selection against inbreed individuals. The paternity correlation within fruits (0.40) was higher than among fruits (0.26), indicating that lower effective number of pollen donors ( ep N ) within fruit (2.5) than among fruits (3.8). Due to the highest p r in NP, the effective size within families ( e N ) was lower in NP (2.69) than PT (3.27). The Spearman ranking correlation showed that the increase in ep N increase the genetic diversity and e N within families. The pollen dispersal pattern was strongly leptokurtic, suggesting long pollen dispersal distance (mean= 179 m). The results show the genetic variability among individuals and indicate the suitability of the same for conservation in-situ, seed collection for genebanks in training, as well as the recovery of degraded areas and future programs of breeding in transition areas between different biomes. / FAPESP: 13/19444-6

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-11T15:00:49Z No. of bitstreams: 2 Tese Edgar A E S Silva .pdf: 1480606 bytes, checksum: 5f83b405866d21135bd0eb3bac6eae6e (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T15:00:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Edgar A E S Silva .pdf: 1480606 bytes, checksum: 5f83b405866d21135bd0eb3bac6eae6e (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / FACEPE; CNPq; CAPES / Dentre as hipóteses criadas para explicar a manutenção da diversidade de árvores em florestas tropicais, uma das mais aceitas é a hipótese de Janzen-Connell. Essa hipótese propõe que inimigos naturais diminuem a probabilidade de sobrevivência de sementes e plântulas quando estas estão adensadas ou próximas ao adulto parental. Entretanto, é provável que esse mecanismo proposto por Janzen-Connell seja menos intenso em florestas fragmentadas. Esta tese teve como objetivo avaliar se a alta densidade de determinadas espécies arbóreas em paisagens fragmentadas é resultado de um relaxamento na mortalidade dependente da densidade e distância. Foram realizados três estudos em uma paisagem fragmentada de Floresta Atlântica, comparando pequenos fragmentos florestais com áreas de floresta madura no interior de um grande remanescente. No primeiro, foram analisados os padrões de mudança nas densidades de populações arbóreas no estágio de plântula e adulto para investigar quais espécies tendem a predominar em pequenos fragmentos florestais. No segundo, foi analisada a distribuição espacial de árvores adultas e jovens para inferir se a distância entre indivíduos coespecíficos é menor nos pequenos fragmentos. No terceiro, foi realizado um experimento de predação de sementes com a espécie Tapirira guianensis para avaliar se existe uma redução na predação de sementes em pequenos fragmentos florestais. Em síntese, os resultados demonstram que: (1) apenas um pequeno grupo de espécies pioneiras apresenta um aumento na densidade populacional em pequenos fragmentos florestais, enquanto muitas espécies tendem a se extinguir localmente ou apresentar abundâncias extremamente baixas nesses fragmentos; (2) não existe uma redução na distância entre jovens e adultos coespecíficos nos pequenos fragmentos ao analisar todas as espécies, apenas quando analisadas somente as espécies pioneiras; (3) exceto pela pequena redução na distância média (2 m) entre adultos coespecíficos, não foi observada uma agregação nas populações nos pequenos fragmentos florestais; (4) não existe um relaxamento na predação de sementes dependente da distância em Tapirira guianensis. Os resultados obtidos não indicam que as mudanças observadas na estrutura das assembleias arbóreas nos pequenos fragmentos resultam de relaxamentos na mortalidade dependente da densidade e distância. Entretanto, mesmo após 200 anos, esses fragmentos ainda apresentam uma redução na diversidade de árvores.

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-12T18:32:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Schwarcz_KaiserDias_M.pdf: 1400141 bytes, checksum: dd7ec0c32ab504bed6d9f8912fc65118 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A floresta atlântica semidecídua, um dos principais tipos de formações vegetais constituintes da Mata Atlântica Brasileira, estende-se ao longo das regiões central e sudeste do interior do país. A sua destruição tem resultado na eliminação de muitas populações e, potencialmente, na erosão da diversidade genética de diversas espécies. A área originalmente coberta pela Mata Atlântica era de cerca de 15% do território nacional, indo do atual Estado do Rio Grande do Norte até o Rio Grande do Sul, estendendo-se, nas regiões sul e sudeste, do litoral brasileiro até a Argentina e o Paraguai. Desde então, a Mata Atlântica tem sido devastada principalmente devido à exploração predatória dos recursos florestais, causando sua redução a 7,3% de sua área original, distribuídos de forma fragmentada pelo território brasileiro. No estado de São Paulo a Mata Atlântica está reduzida a menos de 5% de sua área original e em Campinas, ocupa apenas 2,42% da área municipal. O agravamento da fragmentação florestal causado pela ação humana podem alterar os fluxos de vento, radiação e água ao longo da paisagem, bem como os padrões de migração e dispersão de animais, pólen e sementes. Uma vez que a maior parte da Mata Atlântica se apresenta hoje distribuída em fragmentos descontínuos, é fundamental estudar os efeitos desta nova situação ecológica sobre os atributos genéticos das populações vegetais. Neste trabalho, foi estudada a variabilidade e estruturação genéticas de Metrodorea nigra e Astronium graveolens com síndrome de dispersão autocórica e anemocárica, respectivamente. Foram coletados 47 indivíduos adultos e 113 jovens de M. Nigra e 28 adultos e 84 jovens de A. graveolens em dois fragmentos de mata atlântica localizados na Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídeo no município de Campinas, São Paulo. Os indivíduos adultos, devido ao seu longo tempo de vida, refletem um evento reprodutivo menos influenciados pelos processos de fragmentação, quando em comparação com os indivíduos jovens. Através da comparação entre jovens e adultos, esperava-se verificar o efeito da fragmentação sobre a variabilidade de espécies com síndromes de dispersão distintas. Ambas as espécies apresentaram deficiência de heterozigottos. M. nigra apresentou coeficiente de endogamia (f) médio de 0,64 ; enquanto A. graveolens apresentou f de 0,21. O alto valor de f para M. nigra é uma conseqüência da síndrome de dispersão autocórica e do comportamento de forrageio dos polinizadores preferenciais desta espécie. O grupo de indivíduos jovens de A. graveolens apresentaram heterozigozidade (HO) maior que os adultos, indicando uma redução na incidência de acasalamentos entre indivíduos aparentados. Esta redução provavelmente está relacionada à maior eficiência da dispersão anemocórica desta espécie após a degradação ambiental dos fragmentos. Em A. graveolens a estruturação genética entre os grupos de jovens foi maior que entre os grupos de adultos; indicando uma menor eficiência na dispersão de pólen após a fragmentação. Os resultados indicam que a fragmentação, acompanhada da degradação ambiental dentro dos fragmentos, pode reduzir o número de cruzamentos endogâmicos em espécies com sementes dispersas pelo vento. Já em espécies com dispersão autocórica de sementes, a fragmentação tem efeitos menos evidentes sobre os atributos genéticos. Entretanto, o fluxo de pólen pode ser reduzido pelo dificultamento do vôo de insetos entre os fragmentos. Para uma maior compreensão do atual estado genético das populações arbóreas da Mata Atlântica, são necessários novos estudos envolvendo maior número de fragmentos florestais, espécies arbóreas com diferentes características biológicas; assim como o estudo dos efeitos da fragmentação sobre as espécies polinizadoras. / Abstract: The Semideciduous Forest is one of the major formations of the Brazilian Atlantic Forest. It extends along the central and southeast regions of the country's interior. Its destruction has resulted in the elimination of many populations and the erosion of genetic diversity in different species. The Atlantic Forest originally covered about 15% of the national territory, ranging from the current state of Rio Grande do Norte to Rio Grande do Sul, and from the brazilian coast to Argentina and Paraguay. Since then, the Atlantic Forest has been devastated mainly due to the predatory exploitation of forest resources, causing a reduction to 7.3% of its original area, distributed in fragmented remnants through brazilian territory. In the state of São Paulo, the Atlantic Forest is reduced to less than 5% of its original area. In Campinas, occupies only 2.42% of the municipal area. The forest fragmentation increase caused by human action can change the flow of the wind, the solar irradiation and the water along the landscape, as well as patterns of migration and dispersal of animals, pollen and seeds. As most of the Atlantic Forest is today distributed in discontinued fragments, it is essential to study the effects of this new ecological situation on the genetic attributes of plant populations. In this work, we studied the genetic structure and variability of Metrodorea nigra and Astronium graveolens wich have explosive dehiscence and wind-mediated seed dispersion mechanisms, respectively. Forty seven adults and 113 young individuals of M. nigra were collected; while for A. graveolens this number were of 28 adults and 84 young. The field studies were conducted in two diferent remnants of Atlantic Forest in the reserve of Souzas and Joaquim Egídeo (Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídeo) in Campinas, São Paulo. We also made a comparison between young and adult specimens of each species. The adults, due to their long lifetime, preserves information of a reproductive event less influenced by fragmentation processes compared to young individuals. Trougth this comparison, it was expected to detect differential fragmentation influences on the diversity of species with distinct seeds dispersion mechanisms. The two species showed heterozigosity deficience in both populations. M. nigra had a mean endogamy coefficiente (f) of 0,64; while A. graveolens had 0,21. The high value of f in M. nigra is an consequence of its autocoric seed dispersion machanism and also of its polinators behavior. The group of young individuals of A. graveolens showed heterozigosity (HO) higher than the adults; suggesting a lower incidence of endogamy after the fragmentation. This could be probabily ralated to the better eficience os wind-mediated seed dispersion of this species after the enviromental degradation in those remnants. Also in A. graveolens the genetic structure between the two young groups was higher than between the adults, suggesting a lower eficience in the pollen dispersion after fragmentation. The results sugests that the fragmentation, accompanied by environmental degradation in the fragments, may reduce inbreding in wind dispersed species. In autochoric dispersed species, fragmentation has a lighter effect on the genetic attributes. However, the flow of pollen can be reduced by hindering the flight of insects between the fragments. To better understand the current genetic status of tropical tree populations, new studies involving more forest fragments are required, as well as tree species with different biological characteristics and the study of the effects of fragmentation on the pollinating species. / Mestrado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-08T11:25:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bertagna_Maina_M.pdf: 3610709 bytes, checksum: 15a2936742bc15364c08a56eed4dbbeb (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A fragmentação do habitat é o processo pelo qual uma área contínua pode ser tanto reduzida quanto dividida em áreas menores, chamadas de fragmentos. Conforme as paisagens florestais tornam-se fragmentadas, as populações são reduzidas, diminuindo a diversidade de espécies. A perda de espécies pode ser devido à redução da área, à perda de heterogeneidade ambiental e à perda de variabilidade genética. Em plantas, as conseqüências genéticas da fragmentação do habitat são mais complexas devido a características da história de vida de cada espécie. Em espécies arbóreas pioneiras, a extinção e a recolonização podem aumentar o fluxo gênico e reduzir a diferenciação entre as populações. Assim, estudos de genética de populações de ambientes fragmentados permitiriam entender quais são os mecanismos que envolvem desde a dinâmica destas populações nestes ambientes e o fluxo gênico entre elas. Através da eletroforese de isozimas, Croton floribundus (Euphorbiaceae) foi estudada em seis remanescentes de Mata Atlântica, pertencentes à Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídio, Campinas, SP. Os objetivos deste trabalho foram investigar e comparar a variabilidade genética entre e dentro de fragmentos, de adultos e jovens de C. floribundus, fazendo inferências sobre o fluxo gênico e sua importância em uma paisagem fragmentada. Amostras de adultos e jovens foram coletadas e analisadas através das estimativas de variabilidade genética intrapopulacional e dos níveis de estruturação populacional a partir das estatísticas-F de Wright (parâmetro q). Os altos índices de diversidade genética e pouca diferenciação genética entre as amostras estudadas indicam que C. floribundus consiguiu manter a variabilidade genética de suas populações em curto prazo, sob condições de paisagem antropizada. Foi observada uma alta variabilidade genética e um alto índice de endocruzamento que podem ser explicados pelas características da história de vida de C. floribundus. A fragmentação recente, o número limitado de gerações transcorridas após a fragmentação, a dominância na paisagem, a alta densidade de indivíduos e à ocorrência de fluxo gênico entre fragmentos mais próximos podem ter facilitado a manutenção da variabilidade genética e a baixa diferenciação entre as amostras de adultos e jovens de C. floribundus estudadas / Abstract: Habitat fragmentation is the process during which a large and continuous area is reduced or divided in small patches, called remnants. As forest landscapes are fragmented, their populations are reduced, so the species diversity. The loss of species may be due to the reduction of the area, of the environmental heterogeneity and of the genetic variability. In plants, the genetic consequences of habitat fragmentation are complex due to the particularities of the of each species¿ life history. In pioneer species, recurrent events of extinction and recolonization can promote gene flow and reduce the differentiation between populations. Thus, genetic studies of fragmented populations may help to understand the mechanisms involved in the dynamics of these populations as well as the levels of gene flow among them. Through electrophoretic procedures, Croton floribundus (Euphorbiaceae) was studied in six remnants of Atlantic Forest, belonging to the Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídio, Campinas, SP. The objectives of this study were to investigate and compare the genetic variability within and among samples of adults and juveniles of C. floribundus, making inferences about the levels of gene flow and its importance in a fragmented landscape. Samples were collected and analyzed through estimates of intrapopulacional genetic variability and levels of population estrutucture. The high populational genetic diversity and the low genetic differentiation between the studied samples indicate that populations of C. floribundus keep their genetic variability in a short term, under the conditions of a disturbed landscape. The high genetic variability and the high levels of inbreeding can be explained by the life history characteristics of C. floribundus. The recent fragmentation, with a limited number of generations, the abundance of this species in the landscape, the high density of individuals and the occurrence of gene flow between close remnants may mantain of the high genetic variability and the low differentiation among the studied samples of adults and juveniles of C. floribundus / Mestrado / Genetica Animal e Evolução / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Eleonore Zulnara Freire Setz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T17:03:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Castilho_CamilaPaulade_M.pdf: 1116230 bytes, checksum: e9733bf18b309857ead4034f314a0bca (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: No presente estudo avaliei a comunidade de mamíferos de médio e grande porte em 13 fragmentos pequenos (1 a 12 ha) e um fragmento controle (220 ha) da Área de Proteção Ambiental de Campinas, estado de São Paulo. A comunidade foi estudada através de parcelas de areia iscadas com dois tipos de iscas odoríferas (Pro's Choice e Canine Call) ao longo das quatro estações do ano, durante o período de julho de 2007 a junho de 2009. O esforço variou de 15 a 170 parcelas-noite entre os fragmentos, com um esforço total de 665 parcelas-noite para o conjunto de fragmentos. A comunidade foi composta por 20 espécies, variando de uma a sete espécies por fragmento e 11 no controle, sendo a maioria espécies generalistas e oportunistas, incluindo três espécies exóticas: o cachorro-doméstico (Canis lupus familiaris), a lebre européia (Lepus europaeus) e o ratão-do-banhado (Myocastor coypus). A riqueza da comunidade não esteve relacionada com a área dos fragmentos (rs = 0,083; p>0,05). A análise de similaridade também não evidenciou nenhum padrão na composição entre os fragmentos. Grandes carnívoros predadores de topo não foram verificados no interior dos fragmentos através das parcelas de areia, sendo a jaguatirica (Leopardus pardalis) o maior carnívoro registrado. No entanto, a riqueza registrada para o conjunto dos fragmentos foi superior em relação a outros fragmentos florestais maiores em tamanho e número em outras regiões do estado de São Paulo. A análise de abundância e de freqüência de ocorrência revelou o domínio da comunidade por três espécies mesopredadoras, o gambá (Didelphis sp), o cachorrodoméstico e o cachorro-do-mato (Cerdocyon thous) e uma presa, o tatu-galinha (Dasypus novemcinctus). Esse predomínio aparentemente parece estar relacionado à ausência de grandes predadores de topo, devido à liberação dessas espécies do controle demográfico imposto por esses últimos, bem como à plasticidade comportamental dessas espécies. Na ausência de predadores, essas espécies estiveram negativamente correlacionadas às áreas dos fragmentos, exceto o gambá. Em conclusão, a comunidade da APA de Campinas demonstrou-se simplificada e dominada por espécies generalistas. Os últimos remanescentes da região representam os últimos refúgios para a comunidade de médios e grandes mamíferos / Abstract: I evaluated the medium and large mammal community in 13 small fragments (1 to 12ha) and a control (220ha) in the Environmental Protected Area of Campinas, São Paulo state. The community was sampled using baited track stations (Pro's Choice and Canine Call bait) over a year (once each quarter) from July 2007 to June 2009, giving 15 to 170 track-station nights among the fragments and 665 track-station nights for all the remnants. Twenty species were recorded, varying from one to ten species per fragment, and eleven in the control. Most species was generalist and opportunist. Three exotic species (domestic dog, Canis lupus familiaris; European hare, Lepus europaeus; and nutria, Myocastor coypus) were among those recorded. No correlation between richness and fragment size was found (rs = 0,083; p> 0,05). No pattern in similarity was found among them. Although the smaller fragments had fewer species than the control, the species were often distinct. Large carnivores, top predators, were not sampled in the fragments interior by the track-stations and ocelot was the biggest carnivore registered. Opossums, domestic dog, nine-banded armadillo and crab-eating fox were the most abundant and frequent species in the community. As expected, the generalist species (except opossums) were negatively correlated with fragment area. Interactions between predator-prey and competitor abundances among those species were not detected. In conclusion, the mammal community was simplified and dominated by a few generalist species. The fragments seem representative of the last refuges to the community of the medium and large mammals / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T21:43:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Peres_ElenArroyo_M.pdf: 3413124 bytes, checksum: 396b939134071fb3306c13d15c7080d9 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A Mata Atlântica e uma das mais importantes florestas tropicais do mundo e, devido a sua grande riqueza de espécies e altas taxas de endemismo, e considerada um hotspot mundial para conservação. Entretanto, o bioma tem sido intensamente devastado nos últimos 500 anos, ficando restrito a pequenos fragmentos isolados. A fragmentação do habitat pode afetar diretamente a biodiversidade, já que o tamanho dos fragmentos e a conectividade entre eles exercem grande influencia sobre a estrutura das populações. Embora não tenha efeitos previsíveis sobre a variabilidade genética das espécies, a subdivisão do habitat favorece a ação da deriva genética e, conseqüentemente, o acumulo de divergências entre as populações locais, caso o fluxo gênico entre elas seja diminuído. Assim, as conseqüências da fragmentação dependem da habilidade de migração dos indivíduos entre fragmentos, o que e influenciado pelas propriedades especificas da matriz, pela distancia entre os fragmentos e pela capacidade de dispersão de cada espécie. Sendo um grupo bastante variável quanto aos meios de dispersão, as aranhas constituem um bom modelo para o estudo da fragmentação. O objetivo deste trabalho foi investigar, por meio de PCR-RFLP do mtDNA, a variabilidade genética e estrutura populacional da aranha Araneus venatrix dentro e entre cinco fragmentos de Mata Atlântica do Estado de São Paulo, alem de inferir os prováveis processos evolutivos responsáveis pela distribuição dos haplóipos na região estudada. Foram observados altos índices de variabilidade, o que pode estar relacionado ao habito de forrageamento e comportamento social da espécie. A fragmentação do habitat parece afetar a diversidade genética, apesar de não haver correlação significativa entre tamanho do fragmento e variabilidade, sugerindo que fatores como grau de conservação dos fragmentos e conectividade entre eles também são importantes para a variabilidade genética na espécie. A forte estruturação populacional encontrada sugere que a capacidade de dispersão de A. venatrix e relativamente limitada a longas distancias, ao menos entre as fêmeas. A migração dos indivíduos também pode ter sido prejudicada pela fragmentação do habitat, já que a matriz urbano-industrial e agrícola entre os fragmentos pode ter aumentado o isolamento de algumas populações. As analises fitogeográficas não apontaram para eventos históricos de fragmentação ou expansão demográfica recente entre as populações de A. venatrix, sugerindo que a distribuição dos alótipos provavelmente se deve a restrições ao fluxo gênico entre as populações, sendo influenciada posteriormente pelos efeitos da fragmentação antropica do habitat. / Abstract: Brazilian Atlantic Forest is considered a biodiversity hotspot due to its high pecies richness and endemism. However, this biome has been intensively depleted in the last 500 years, and now the remains are found in more or less isolated patches of different sizes. Habitat fragmentation may directly affect biodiversity once patch size and connectivity play important roles in the structure of communities. Though the genetic effects of habitat subdivision cannot be predicted, it may promote random genetic drift and interpopulational divergence when gene flow is reduced or absent. Therefore, the consequences of habitat fragmentation depend on the dispersal ability of each species, which may be influenced by the properties of the surrounding matrix and the distance between fragments. Spiders are a very diverse group regarding dispersal behavior and, hence, represent a suitable model for fragmentation studies. The aim of this work was to investigate, with analysis of mtDNA PCR-RFLP, intra and interpopulational genetic variability and structure of the spider Araneus venatrix in five patches of Brazilian Atlantic Forest. We discuss the likely evolutionary processes responsible for haplotypes distribution in this region. High levels of genetic diversity were observed, which may be related to species' foraging and social behavior. Habitat fragmentation also seems to affect genetic variance, although no significant correlation between variability and patch size was found, suggesting that levels of disturbance and patch connectivity may also be important for the species genetic diversity. High levels of populational structure reveal limited dispersal ability in A. venatrix, at least among females. Migration may also be affected by fragmentation, since the urban and agroecossystem matrix could isolate some of the patches. Phylogeographic analysis did not indicate fragmentation historic events or demographic expansion in A. venatrix populations, suggesting that the distribution of haplotypes is probably due to restricted gene flow and isolation by distance, influenced by antropogenic habitat fragmentation. / Mestrado / Genetica Animal e Evolução / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Um modelo dedicado ao planejamento da conservação e restauração de habitats deve incluir informações estratégicas para assegurar a eficácia e de fácil obtenção, para assegurar a agilidade necessária. Planos e estratégias para conservação usualmente são complexos e demandam informações detalhadas, difíceis de se obter, como inventários biológicos e certos tipos de mapeamento, o que traz limitações em termos de disponibilidade, qualidade e custo das informações. Assim, procurou-se testar a eficiência de métodos simples para a seleção, em escala local, de áreas prioritárias para conservação de habitats fortemente fragmentados e reduzidos, uma situação comum no sul do Brasil, usando dados de imagens LANDSAT e planos de informações disponíveis em mapeamentos comuns, e trabalho de campo. Inicialmente analisou-se a estrutura da paisagem e o padrão de fragmentação em parte da região norte do estado do Paraná, e testar se tamanho e forma são adequados para selecionar os fragmentos florestais mais importantes para a conservação, ou seja, as que contribuem para manter maior quantidade e melhor qualidade de habitats, bem como tenham maior impacto (positivo) na conectividade e em outras variáveis da paisagem. Os resultados mostram que a floresta madura cobre cerca de 3% da paisagem, e a cobertura florestal total atinge perto de 8%, consistindo principalmente de pequenos fragmentos (82% tem entre 1 e 10 ha). Fragmentos grandes (>100 ha) são apenas 1,4% dos remanescentes, mas somam 34% da área de floresta. Apesar de estarem sujeitos a efeitos de borda em toda ou quase toda a sua área, fragmentos pequenos mostraram ter um papel importante na conectividade da paisagem. Numa área maior, foi feita uma pré-seleção de áreas com potencial para estabelecimento de redes de conservação. A pré-seleção procurou responder às seguintes perguntas: 1-Quais são os sítios com maior potencial para a conservação da biodiversidade? 2-Quais são os sítios sob maior risco para objetivos de conservação? e 3-Quais sítios têm melhores oportunidades para o estabelecimento de zonas de conservação de uso múltiplo? Foi identificado um conjunto de 11 fragmentos pertencendo a 5 sub-regiões, sofrendo variados graus de pressão antrópica. Adicionalmente, usando medidas simples de estrutura da paisagem, relacionadas com tamanho, forma e conectividade dos fragmentos, procurou-se identificar tipos estruturais de fragmentos, como uma forma alternativa para auxiliar o estabelecimento de prioridades para conservação a partir do seu papel, efetivo ou potencial, na paisagem. Foram identificados 5 tipos de fragmentos, pequenos (ilhotas isoladas, trampolins), médios (núcleos auxiliares e corredores) e grandes (núcleos principais), que podem ser usados para subsidiar estratégias de conservação. Utilizando informações sobre a estrutura da paisagem, hidrografia e legislação ambiental, propõe-se aqui uma estratégia de conservação para o complexo das bacias dos ribeirões Apertados-Três Bocas (CATB), ordenando atividades de restauração e conservação de fragmentos florestais, criação e expansão de unidades de conservação, além da proposição de formas de uso do solo compatíveis com o entorno de unidades de conservação. / Models dedicated to habitat conservation, management and restoration planning must include information both strategic, to ensure effectiveness, and of easy collection, to ensure agility. Plans and strategies for conservation usually are complex and demand detailed data, such as biological inventories and fine scale mapping, which limits work due to information availability, quality and cost. Hence, as a first approach, we tested the efficacy of a simple methods for selection, in local scale, of conservation sites in strongly fragmented landscapes, a common situation in southern Brazil, using LANDSAT data, common mapping data layers, and fieldwork. First, we analyzed landscape structure and fragmentation patterns in the northern portion of Paraná state, looking for the suitability of using size and shape of forest fragments for selection of most important sites for conservation, i.e. fragments that contribute to encompass large and of best quality forest areas, as well have higher positive impact on connectivity and overall landscape structure. Results show that mature forest cover near 3% of landscape area, with total forest cover reaching near 8%, mostly small fragments (82% between 1 and 10 ha). Large fragments (>100 ha) are only 1,4% of fragment number, but encompass 34% of forest area. In spite of suffering of edge effects in almost or all their area, small fragments showed an important role in landscape connectivity. In a larger area we did a pre-selection of suitable areas for establishing conservation networks. Such pre-selection were intended to answer the following questions: 1-What sites have higher biodiversity conservation potential? 2-What sites have higher threats to conservation goals? and 3-What sites have better opportunity to establish multiple-use conservation zones? A set of 11 fragments over 500 ha were selected, being part of 5 conservation sites, of varying degree of development pressure. Using simple landscape structure measures, such as size, shape and connectivity, we tried to identify structural types of habitat fragments, as an alternative way of fragment prioritizing. We identified 5 fragment types, small (stepping-stones and small isolated islands), mid-sized (auxiliary nuclei and corridors) and large (main nuclei), that can be used for landscape conservation strategies. Finally, using information about landscape structure, hidrography, human impacts and environmental legislation, we proposed a integrated conservation strategy for the Apertados-Três Bocas river basin complex (CATB), near Londrina city, encompassing ordination of restoration activities, establishment of new conservation units and expansion of existing ones, as well as proposing land uses compatible with conservation goals.

Avaliou-se o impacto da fragmentação florestal na diversidade de carrapatos de vida-livre e a presença de patógenos nestes carrapatos em remanescentes florestais do Pontal do Paranapanema, estado de São Paulo, Brasil. Estes fragmentos florestais abrigam uma rica e importante biodiversidade, com espécies endêmicas e ameaçadas como o mico-leão-preto (Leontopithecus chrysopygus), a anta (Tapirus terrestris), a onça pintada (Panthera onca), o macuco (Tinamus solitarius) e várias outras espécies de aves, mamíferos, répteis, anfíbios e peixes. Aproximadamente 90% das espécies de carrapatos parasitam exclusivamente hospedeiros selvagens. O restante pode ter animais domésticos e humanos como hospedeiros. Embora a maioria das pesquisas tenha sido dirigida a espécies de importância econômica, os carrapatos que parasitam animais selvagens possuem relevante papel na manutenção dos níveis de patógenos em populações de vida livre. Algumas destas espécies, por exemplo, demonstraram que podem parasitar hospedeiros não selvagens e promover o surgimento de zoonoses. Em habitats fragmentados, a diversidade de espécies vertebradas é menor se comparado a habitats com pouca alteração antrópica. Portanto, a fragmentação do habitat diminui a diversidade de espécies de carrapatos também. Para estudar a relação entre a fragmentação florestal e a ecologia das populações de carrapatos foram coletados carrapatos em 8 fragmentos florestais pelo método de arrasto de flanela e inspeção visual da vegetação. Os índices de comparação utilizados foram de similaridade de Jaccard, de diversidade de Shannon e complexidade do fragmento florestal de Patton. Utilizou-se o modelo de regressão linear para compara os índices de Shannon e Patton. Um total de 2149 ninfas de Amblyomma spp foi coletado e foram identificadas as espécies de 629 carrapatos. As espécies coletadas foram Amblyomma cajennense (94,28%), A. coelebs (1,59%), A. naponense (2,86%), A. ovale (0,64%), A. nodosum (0,32%), A. brasiliense (0,16%) e Haemaphysalis juxtakochi (0,16%). Nenhum indivíduo testado foi positivo pelo teste da hemolinfa. Os resultados mostraram uma tendência de correlação entre a fragmentação floresta, e a diversidade de espécies de carrapatos. / This study evaluated the impact of forest fragmentation on diversity of freeliving ticks and prevalence of tick pathogens in remaining forest fragments in the Pontal do Paranapanema, São Paulo state, Brazil. These forest fragments shelter rich and important biodiversity, with endemic and threatened species such as the black lion tamarin (Leontopithecus chrysopygus), the tapir (Tapirus terrestris), jaguar (Panthera onca), the solitary tinamou (Tinamus solitarius) and various other species of birds, mammals, reptiles, amphibians and fish. Approximately 90% of tick species parasitize exclusively wild hosts. The remainder can also have domestic animals and humans as hosts. Although most research has been directed to species of economic importance, ticks that parasitize wild animals are also relevant due to their role in maintaining enzootic pathogen levels in wild populations. Some of these species, for example, have been shown to cross-over onto non-wild hosts and promote emergent zoonoses. In fragmented habitats, the diversity of vertebrate species is normally lower than comparable habitats with minimal anthropic alteration. Thus, habitat fragmentation decreases the diversity of tick species too. To study the relationship between forest fragmentation and population ecology of ticks, ticks were collected in 8 forest fragments using dragging and visual inspection of vegetation. The index used were Jaccard´s similarity, diversity f Shannon and Patton. The linear regression model was used to compare Shannon and Patton indexes. A total of 2149 nymphs of Amblyomma spp. And 629 identified ticks was collected. The species of ticks collected was Amblyomma cajennense (94,28%), A. coelebs (1,59%), A. naponense (2,86%), A. ovale (0,64%), A. nodosum (0,32%), A. brasiliense (0,16%) e Haemaphysalis juxtakochi (0,16%). All ticks were negative by hemolimph test. The results showed a tendency of correlation between forest fragmentation and diversity of tick species.

Made available in DSpace on 2016-02-26T12:59:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 HeloisaHelenaGianotti_Parte 1.pdf: 1389090 bytes, checksum: 6332e048ab00a43141d7fec1a2b1af1c (MD5) Previous issue date: 2010-02-26 / One of the connection form between fragments of vegetation, the ecological corridor, it s one of the strategies for biodiversity conservation and in the course of the decision on its localization, Geographic Information Systems (GIS) can contribute as an effective supportive tool to this process. In this context, this study was developed as a methodology to allow the definition of paths for ecological corridors, giving priority to the connection of remaining vegetation, based on low cost GIS. Dourados river basin was taken as a case study, located in southern Mato Grosso do Sul, with great regional importance and a high level of deforestation. Using the GIS Spring, Idrisi and GRASS, at different times, a map of the Land Use Basin from Landsat 5-TM, March-April 2008, was generated, as well as various plans of information (PI), distinguishing such uses. These P.I. were superimposed using a File Values of Friction associated with the uses, thus generating a surface of friction. The PI containing the simulated corridors points of exit was conjugated with the Surface Friction, resulting in a Cost Surface for each, which, in turn, associated with the arrival PI resulted in the definition of corridors routes. Measurements were taken and the creation of the buffer of 120m side of the each line of trajectory, totalizing 240m. Besides the main corridor, which followed the axis of Dourados River, seven others secondary corridors were simulated, all of which followed the drainage lines, diverting away from them when meeting with arrangements of use with high friction, or being attracted to those with a degree far from its own, proving the efficiency of the methodology adopted. In the layout of the secondary corridors was found a significant overlap with the path of the main corridor, demonstrating that along the banks of Dourados River and in its immediate surrounding area were concentrated most of the areas with the lowest cost for the implementation of an ecological corridor. Due to the level of deforestation of the basin, the layouts of the eight corridors involved farming areas in less than 20%, except two of them. Simulating the implementation of the eight units and considering the total area of the municipalities within the basin, none of them was over the limit of 0.40% of its area under agricultural activity. The expansion of the corridors may occur with the inclusion of permanent preservation areas (PPA) in its entirety and not just in the range of 240 m band, and of areas occupied by vegetation and lowland forest fragments derived from the legal reserve. Thus, the methodological procedure developed was proven to be valid for a preliminary definition of the trajectory of the ecological corridors, favoring larger and more circular fragments, in addition to permanent preservation areas and lowlands, as well as it demonstrated its facility for the inclusion or exclusion of variables in the course of the review process. In addition to these aspects, the use of free satellite images by INPE and the use of GIS with a low or no cost may turn this procedure into a useful tool in the definition of conservation strategies / Uma das formas de conexão entre fragmentos de vegetação, o corredor ecológico, constitui-se em uma das estratégias para a conversação da biodiversidade e, no transcorrer da tomada de decisão sobre sua localização, os Sistemas de Informações Geográficas (SIGs) podem contribuir como ferramenta efetiva de apoio a esse processo. Nesse contexto, o presente trabalho teve como objetivo desenvolver metodologia que possibilitasse a definição de trajetos para corredores ecológicos, privilegiando a conexão de remanescentes de vegetação, utilizando SIG de baixo custo. Como estudo de caso foi tomada a bacia do Rio Dourados, localizada no Sul de Mato Grosso do Sul, com grande importância regional e elevado nível de desflorestamento. Utilizando-se os SIG Spring, Idrisi e GRASS, em diferentes momentos, gerou-se o Mapa de Uso da Terra da bacia, a partir de imagens Landsat 5-TM, de março-abril de 2008, assim como vários planos de informação (P.I.), individualizando tais usos. Esses P.I. foram sobrepostos e, utilizando-se um Arquivo Valores de Atrito associados aos usos, gerou-se uma Superfície de Atrito. O P.I. contendo os pontos de saídas dos corredores simulados foi conjugado à Superfície de Atrito, resultando em uma Superfície de Custo para cada um, a qual, por sua vez, associada ao P.I. de Chegada, resultou na rota dos corredores. Foram realizadas as mensurações e criação do buffer de 120 m de cada lado da linha de trajetória, totalizando 240m. Além do corredor principal, que seguiu o eixo do Rio Dourados, foram simulados mais sete corredores secundários, sendo que todos acompanharam as linhas de drenagem, afastando-se delas quando do encontro com modalidades de uso com elevado grau de atrito, ou sendo atraídas por aquelas com menor, comprovando a eficiência da metodologia adotada. No traçado dos corredores secundários constatou-se uma significativa sobreposição com o trajeto do corredor principal, demonstrando com isso que junto às margens do Rio Dourados e em seu entorno imediato se concentra a maior parte das áreas com o menor custo para a implantação de um corredor ecológico. Devido ao nível do desflorestamento da bacia, os traçados dos oito corredores atingiram áreas com agropecuária em menos de 20%, exceto dois deles. Simulando a implantação das oito unidades e considerando a área total dos municípios que compõem a bacia, em nenhum deles é ultrapassado o limite de 0,40% de sua superfície ocupada com atividade agropecuária. A ampliação dos corredores pode ocorrer com a inclusão das áreas de preservação permanente (APP) em sua totalidade e não só na faixa de 240 m de largura, assim como das áreas ocupadas com vegetação de várzea e fragmentos de mata oriundos de reserva legal. Dessa forma, constatou-se que o procedimento metodológico desenvolvido é válido para a definição preliminar da trajetória de corredores ecológicos, privilegiando fragmentos maiores e mais circulares, além de áreas de preservação permanente e várzeas, assim como possui facilidade para a inclusão ou exclusão de variáveis no transcorrer do processo de análise. Dessa forma, a utilização de imagens de satélite disponibilizadas gratuitamente pelo INPE e o uso de SIG de baixo ou nenhum custo podem tornar tal procedimento um instrumento útil na definição de estratégias conservacionistas.

As alterações ambientais antrópicas são os principais fatores de emergência ou reemergência de doenças infecciosas. A leishmaniose cutânea é uma doença que está relacionada, em caráter epidêmico, com episódios de desmatamento. No entanto, o caráter endêmico da doença ocorre quando o homem se encontra próximo de áreas florestais já colonizadas. O Pontal do Paranapanema é uma área onde ocorreu intenso desmatamento e a mata nativa remanescente está representada pelo Parque Estadual Morro do Diabo e alguns fragmentos florestais. Casos de leishmaniose cutânea em humanos são comuns na região, principalmente em áreas marginais de floresta. O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento da fauna flebotomínica e de mamíferos silvestres potencialmente reservatórios no Parque Estadual Morro do Diabo e alguns fragmentos da região, buscando avaliar se o tamanho do fragmento tem influência na ocorrência das espécies e na freqüência de Leishmania sp, através da técnica da PCR. Foram capturadas 26 espécies de flebótomos e sete espécies de mamíferos silvestres. O gênero Brumptomyia foi predominante em quase todas as áreas florestais, com exceção da borda do Parque, que apresentou dominância de Nyssomyia neivai. Os resultados das análises da PCR demonstraram quatro espécies de mamíferos portadores de Leishmania sp, Akodon cursor, Dasyprocta azarae, Didelphis albiventris e Oligoryzomys sp. As amostras de pools de flebotomíneos apresentaram resultados negativos. Não foi observada diferença significativa na freqüência de mamíferos infectados em relação ao tamanho da área florestal. / Anthropogenic environmental changes are the main factors of emergence or reemergence of infectious diseases. Cutaneous leishmaniasis is a disease that is related, in an epidemic form, with episodes of deforestation. However, the endemicity of the disease occurs when the man is close to forest areas already colonized. The Pontal of Paranapanema is an area where massive deforestation has occurred and the remaining native forest is represented by the Morro do Diabo State Park and a few forest fragments. Cases of cutaneous leishmaniasis in humans are common in the region, especially in marginal areas of forest. The aim of this study was a survey of sand flies and mammals potentially reservoirs, in Morro do Diabo State Park and some fragments of the region, seeking to assess whether the fragment size has an influence on species occurrence and frequency of Leishmania, through the PCR technique. We captured 26 species of sandflies and seven species of wild mammals. The genus Brumptomyia was prevalent in almost all forest areas, except the edge of the park, which showed dominance of Nyssomyia neivai. The results of PCR analysis revealed four species of mammals suffering from Leishmania, Akodon cursor, Dasyprocta azarae, Didelphis albiventris and Oligoryzomys sp. Samples of sandfly pools tested negative. There was no significant difference in the frequency of infected mammals in relation to the size of the forest.