Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-22Bitstream added on 2014-06-13T18:35:04Z : No. of bitstreams: 1 silva_rb_me_botfca.pdf: 752709 bytes, checksum: 1c8874b0cf7a904e4abe6060f9ec4cc0 (MD5) / A cultura do chá na região do Vale do Ribeira está localizada ao Sul do Estado de São Paulo, onde se concentra uma grande área de Floresta Mata Atlântica do Brasil. A ‘Queima dos fios’ causada pelo fungo Rhizoctonia binucleada (Ceratobasidium spp.; sin. Pellicularia koleroga) é a principal doença que ataca a cultura. A espécie deste fungo ainda não é totalmente conhecida, bem como as informações sobre sua biologia. Deste modo, o objetivo do presente trabalho foi elucidar aspectos da biologia do fungo, realizando a caracterização citomorfológica, cultural, patogênica e molecular de Rhizoctonia binucleada associada a queima dos fios do chá no Vale do Ribeira - SP. Em uma área de cultivo do chá, rodeado por um fragmento de Floresta Mata Atlântica, realizou-se a coleta de ramos e folhas atacadas pela queima do fio e o isolamento em laboratório, obtendo cinco isolados com características específicas de Rhizoctonia spp. Verificou-se que todos os isolados apresentaram dois núcleos por célula, sendo considerados binucleados. A indução da fase teleomórfica foi realizada, mas não houve sucesso na formação completa das estruturas sexuadas de Ceratobasidium spp., porém, houve escassa formação de himênio e metabasidios por alguns isolados, nos meios de cultura Batata dextrose ágar, Agua ágar, Corn meal ágar e Czapeck dox ágar, sob maior ocorrência na condição de fotoperíodo 12h luz/12h escuro a 24°C. Todos os isolados do chá não apresentaram interação de anastomose de hifas com os isolados padrões de Rhizoctonia binucleada GA-A, GA-Bo, GA-P e GA-Q, não pertencendo a estes grupos. A compatibilidade somática entre os isolados do chá apresentaram a formação de três grupos de compatibilidade somática:... / The tea culture in the Vale do Ribeira is located in south of Sao Paulo State which concentrates the large area of Brazil Atlantic Forest. The ‘Thread blight ' caused by the fungus binucleate Rhizoctonia (Ceratobasidium spp.; Sin. Pellicularia koleroga) is the main disease that attacks the culture. The species of this fungus is not yet fully known, as well as information about its biology. Thus, the aim of this study was to elucidate the fungus biology, by the characterization of cytomorphological, cultural, molecular and pathogenic binucleate Rhizoctonia associated with the tea thread blight in the Ribeira Valley - SP, Brazil. In a area of growing tea, surrounded by a fragment of Atlantic Forest was collect branches and leaves attacked by thread blight and forwarded by laboratory isolation, obtaining five isolates with specific characteristics of Rhizoctonia spp. It was verified that all isolates showed two nuclei per cell being considered binucleate. The teleomorph induction was performed, but there was no success in the complete formation of sexed Ceratobasidium sp structures. However, there was scarce formation of hymenium and metabasidias by some isolates in culture medium Potato dextrose agar, Water agar, Corn meal agar and Czapeck dox agar, under increased occurrence in photoperiod condition 12h light /12h dark at 24 ° C. All isolates of tea showed no interaction of hyphal anastomosis with the standard isolates of binucleate Rhizoctonia GA-A, GA-Bo, GA and GA-P-Q not belonging to these anastomosis groups. The somatic compatibility among isolates of tea showed the formation of three somatic compatibility groups: GCS-1, GCS-2 and GCS-1 among the five isolates showing similarity between the microscopic and macroscopic reactions. The morphological characteristics of the colonies also allowed the... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-19Bitstream added on 2014-08-13T17:59:56Z : No. of bitstreams: 1 000768708_20151231.pdf: 188240 bytes, checksum: 0f01455be27277c72533dc3397c9c910 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-01-04T10:26:15Z: 000768708_20151231.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-04T10:28:12Z : No. of bitstreams: 1 000768708.pdf: 2231965 bytes, checksum: 7187f796d0e723914be797421e7ab56c (MD5) / Canoparmelia s.l. (Canoparmelia e Crespoa) é representativa nas áreas abertas nos cerrados e sua capacidade de tolerar ambientes secos e ensolarados contribui para que várias espécies se instalem em áreas urbanizadas. Os objetivos deste trabalho foram realizar a descrição morfológica minuciosa de seis espécies de Canoparmelia s.l., incluindo o estudo de espécimes-tipo, a verificação da variabilidade química dos grupos de táxons estudados e um estudo anatômico comparado do talo, procurando características que sirvam como subsídio para os estudos taxonômicos neste grupo. As espécies estudadas foram Canoparmelia caroliniana, C. cryptochlorophaea, C. texana, Crespoa carneopruinata, C. crozalsiana e C. scrobicularis. Para os estudos anatômicos, foram utilizadas amostras de material fresco, fixado em FAA 50 e infiltradas em resina metacrilato, seccionadas em micrótomo rotativo, coradas com azul de toluidina e as lâminas montadas em resina sintética Entellan®. Para as descrições das lâminas seguiu-se o protocolo de descrição anatômica desenvolvido pelo Grupo de Estudos Liquenológicos (GEL). Os espécimes foram descritos baseados no protocolo de descrição morfológica também desenvolvido pelo GEL e, para as análises químicas, foram feitos testes de spot, teste de fluorescência aos raios UV e cromatografia em camada delgada. Os espécimestipo referentes aos táxons escolhidos para este estudo foram solicitados aos herbários LD, H, S, W e SP. Os estudos anatômicos se mostraram eficientes frente aos objetivos propostos e, por meio das secções transversais das espécies estudadas, foram encontradas diferenças significativas nos córtices e na camada de algas que sustentam a distinção entre Canoparmelia e Crespoa. Algumas estruturas necessitarão de estudos adicionais, como é o caso das pseudocifelas encontradas em Crespoa scrobicularis e dos hápteros visualizados em Canoparmelia cryptochlorophaea. A ... / Canoparmelia s.l. (Canoparmelia and Crespoa) is representative in open areas in cerrados and its ability to tolerate dry sunny environments contributes to the settlement of several species in urbanized areas. This work intended to describe the morphology of six species of Canoparmelia s.l., including the study of type specimens, the verification of chemical variability and a comparative study of thallus anatomy, looking for characteristics that can be used to support taxonomic studies in this group. The selected species were Canoparmelia caroliniana, C. cryptochlorophaea, C. texana, Crespoa carneopruinata, C. crozalsiana and C. scrobicularis. To perform the anatomical studies, samples of the material were fixed in FAA 50 and included in resin methacrylate, cut in rotary microtome, stained with toluidine blue and mounted on microscope slides with synthetic resin Entellan®. The protocol of anatomic description developed by the Lichenological Group of Studies (GEL) was used to describe the microscope slides. The protocol of morphological description also developed by the GEL was used to describe the specimens. Spot tests, UV fluorescence tests and thin layer chromatography were conducted to perform the chemical analysis. The type specimens were requested to LD, H, S, W and SP herbaria. The anatomical studies were efficient to reach the proposed objectives and revealed significant differences in the cortex and algal layer in the transversal sectioning of the studied species; these differences support the distinction between Canoparmelia and Crespoa. Some structures, such as the pseudocyphellae found in Crespoa scrobicularis and the haptera observed in Canoparmelia cryptochlorophaea require further studies. Chromatography showed that three specimens of C. texana have a chemical profile that differs from the type and probably belong to a new taxon. This work has shown that anatomy has an important role to the understanding of the development ...

Orientador: Marcelo Pinto Marcelli / Coorientador: Patrícia Jungbluth / Resumo: Canoparmelia s.l. (Canoparmelia e Crespoa) é representativa nas áreas abertas nos cerrados e sua capacidade de tolerar ambientes secos e ensolarados contribui para que várias espécies se instalem em áreas urbanizadas. Os objetivos deste trabalho foram realizar a descrição morfológica minuciosa de seis espécies de Canoparmelia s.l., incluindo o estudo de espécimes-tipo, a verificação da variabilidade química dos grupos de táxons estudados e um estudo anatômico comparado do talo, procurando características que sirvam como subsídio para os estudos taxonômicos neste grupo. As espécies estudadas foram Canoparmelia caroliniana, C. cryptochlorophaea, C. texana, Crespoa carneopruinata, C. crozalsiana e C. scrobicularis. Para os estudos anatômicos, foram utilizadas amostras de material fresco, fixado em FAA 50 e infiltradas em resina metacrilato, seccionadas em micrótomo rotativo, coradas com azul de toluidina e as lâminas montadas em resina sintética Entellan®. Para as descrições das lâminas seguiu-se o protocolo de descrição anatômica desenvolvido pelo Grupo de Estudos Liquenológicos (GEL). Os espécimes foram descritos baseados no protocolo de descrição morfológica também desenvolvido pelo GEL e, para as análises químicas, foram feitos testes de spot, teste de fluorescência aos raios UV e cromatografia em camada delgada. Os espécimestipo referentes aos táxons escolhidos para este estudo foram solicitados aos herbários LD, H, S, W e SP. Os estudos anatômicos se mostraram eficientes frente aos objetivos propostos e, por meio das secções transversais das espécies estudadas, foram encontradas diferenças significativas nos córtices e na camada de algas que sustentam a distinção entre Canoparmelia e Crespoa. Algumas estruturas necessitarão de estudos adicionais, como é o caso das pseudocifelas encontradas em Crespoa scrobicularis e dos hápteros visualizados em Canoparmelia cryptochlorophaea. A ... / Abstract: Canoparmelia s.l. (Canoparmelia and Crespoa) is representative in open areas in cerrados and its ability to tolerate dry sunny environments contributes to the settlement of several species in urbanized areas. This work intended to describe the morphology of six species of Canoparmelia s.l., including the study of type specimens, the verification of chemical variability and a comparative study of thallus anatomy, looking for characteristics that can be used to support taxonomic studies in this group. The selected species were Canoparmelia caroliniana, C. cryptochlorophaea, C. texana, Crespoa carneopruinata, C. crozalsiana and C. scrobicularis. To perform the anatomical studies, samples of the material were fixed in FAA 50 and included in resin methacrylate, cut in rotary microtome, stained with toluidine blue and mounted on microscope slides with synthetic resin Entellan®. The protocol of anatomic description developed by the Lichenological Group of Studies (GEL) was used to describe the microscope slides. The protocol of morphological description also developed by the GEL was used to describe the specimens. Spot tests, UV fluorescence tests and thin layer chromatography were conducted to perform the chemical analysis. The type specimens were requested to LD, H, S, W and SP herbaria. The anatomical studies were efficient to reach the proposed objectives and revealed significant differences in the cortex and algal layer in the transversal sectioning of the studied species; these differences support the distinction between Canoparmelia and Crespoa. Some structures, such as the pseudocyphellae found in Crespoa scrobicularis and the haptera observed in Canoparmelia cryptochlorophaea require further studies. Chromatography showed that three specimens of C. texana have a chemical profile that differs from the type and probably belong to a new taxon. This work has shown that anatomy has an important role to the understanding of the development ... / Mestre

Orientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Marco Antonio Basseto / Banca: Ana Carolina Firmino / Resumo: A cultura do chá na região do Vale do Ribeira está localizada ao Sul do Estado de São Paulo, onde se concentra uma grande área de Floresta Mata Atlântica do Brasil. A 'Queima dos fios' causada pelo fungo Rhizoctonia binucleada (Ceratobasidium spp.; sin. Pellicularia koleroga) é a principal doença que ataca a cultura. A espécie deste fungo ainda não é totalmente conhecida, bem como as informações sobre sua biologia. Deste modo, o objetivo do presente trabalho foi elucidar aspectos da biologia do fungo, realizando a caracterização citomorfológica, cultural, patogênica e molecular de Rhizoctonia binucleada associada a queima dos fios do chá no Vale do Ribeira - SP. Em uma área de cultivo do chá, rodeado por um fragmento de Floresta Mata Atlântica, realizou-se a coleta de ramos e folhas atacadas pela queima do fio e o isolamento em laboratório, obtendo cinco isolados com características específicas de Rhizoctonia spp. Verificou-se que todos os isolados apresentaram dois núcleos por célula, sendo considerados binucleados. A indução da fase teleomórfica foi realizada, mas não houve sucesso na formação completa das estruturas sexuadas de Ceratobasidium spp., porém, houve escassa formação de himênio e metabasidios por alguns isolados, nos meios de cultura Batata dextrose ágar, Agua ágar, Corn meal ágar e Czapeck dox ágar, sob maior ocorrência na condição de fotoperíodo 12h luz/12h escuro a 24°C. Todos os isolados do chá não apresentaram interação de anastomose de hifas com os isolados padrões de Rhizoctonia binucleada GA-A, GA-Bo, GA-P e GA-Q, não pertencendo a estes grupos. A compatibilidade somática entre os isolados do chá apresentaram a formação de três grupos de compatibilidade somática: ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The tea culture in the Vale do Ribeira is located in south of Sao Paulo State which concentrates the large area of Brazil Atlantic Forest. The 'Thread blight ' caused by the fungus binucleate Rhizoctonia (Ceratobasidium spp.; Sin. Pellicularia koleroga) is the main disease that attacks the culture. The species of this fungus is not yet fully known, as well as information about its biology. Thus, the aim of this study was to elucidate the fungus biology, by the characterization of cytomorphological, cultural, molecular and pathogenic binucleate Rhizoctonia associated with the tea thread blight in the Ribeira Valley - SP, Brazil. In a area of growing tea, surrounded by a fragment of Atlantic Forest was collect branches and leaves attacked by thread blight and forwarded by laboratory isolation, obtaining five isolates with specific characteristics of Rhizoctonia spp. It was verified that all isolates showed two nuclei per cell being considered binucleate. The teleomorph induction was performed, but there was no success in the complete formation of sexed Ceratobasidium sp structures. However, there was scarce formation of hymenium and metabasidias by some isolates in culture medium Potato dextrose agar, Water agar, Corn meal agar and Czapeck dox agar, under increased occurrence in photoperiod condition 12h light /12h dark at 24 ° C. All isolates of tea showed no interaction of hyphal anastomosis with the standard isolates of binucleate Rhizoctonia GA-A, GA-Bo, GA and GA-P-Q not belonging to these anastomosis groups. The somatic compatibility among isolates of tea showed the formation of three somatic compatibility groups: GCS-1, GCS-2 and GCS-1 among the five isolates showing similarity between the microscopic and macroscopic reactions. The morphological characteristics of the colonies also allowed the... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Antonio de Goes / Coorientador: Fernanda Dias Pereira / Banca: Gabriella Souza Cintra / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Resumo: Fungos do gênero Colletotrichum causam infecções em pré e pós-colheita em frutos de goiabeiras, causando prejuízos significativos. Neste estudo foram avaliados 26 isolados de Colletotrichum oriundo de frutos de goiabeiras com sintomas de antracnose, de diversos municípios do estado de São Paulo, com caracterização morfológica de conídios e apressórios, caracterização molecular com PCR espécie-específica e avaliação in vitro quanto à sua sensibilidade aos fungicidas tiofanato-metílico, trifloxistrobina e tebuconazole. Os resultados foram submetidos a análise de variância e teste de Scott-Knott, Tukey, a 5% de probabilidade e IC50. Os isolados avaliados apresentaram alto polimorfismo, sendo C. gloeosporioides a espécie predominante. Outras espécies foram também encontradas. Os isolados, na sua maioria foram altamente sensíveis a tebuconazole e insensíveis a trifloxistrobina e tiofanato-metílico, in vitro. Revisão das estratégias de controle da doença fazem-se necessárias, sendo discutidas no presente trabalho. / Abstract: Fungi of the genus Colletotrichum cause infections in pre and post harvest in fruits of guava trees, causing significant losses. This study evaluated 26 isolates of Colletotrichum from guava fruits with symptoms of anthracnose from several municipalities in the state of São Paulo, with morphological characterization of conidia and apressoris, molecular characterization with species-specific PCR and in vitro evaluation of their sensitivity to the thiophanate-methyl fungicides, trifloxystrobin and tebuconazole. The results were submitted to analysis of variance and Scott-Knott's test, Tukey, at 5% probability and IC50. The evaluated isolates showed a high polymorphism, being C. gloeosporioides the predominant species. Other species were also found. The isolates were mostly highly sensitive to tebuconazole and insensitive to trifloxystrobin and thiophanate-methyl in vitro. Review of disease control strategies are necessary, being discussed in the present work. / Mestre

Orientador: Maria Helena Andrade Santana / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-23T11:08:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gomes_LedaMariadeSouza_D.pdf: 4411705 bytes, checksum: f7b72ffd75c1d44a2fec3441e1684626 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: o bioprocesso para a obtenção de cefalosporina C foi realizado abordando os aspectos de composição do meio, produtividades específicas e caracterização reológica em processos conduzidos em batelada e batelada alimentada. O processo em batelada foi feito em frascos agitados e em reator do tipo tanque agitado de 5 litros, com controle de pH, temperatura, agitação e aeração. Nas fermentações em frascos agitados verificou-se a resposta da linhagem de Cephalosporium acremonium ATCC 48272 em meio sintético, com diferentes fontes de carbono, empregando-se meios contendo glicose, frutose e sacarose. O meio com glicose e sacarose, na relação de 27:36 proporcionou à linhagem um melhor desempenho com relação à produtividade que foi de 0,18 mgcpc/gcél.h.Nos ensaios em biorreator de tanque agitado, em batelada, foi usada a relação de 27:36 de glicose e sacarose, e nos bioprocessos em batelada alimentada foi verificada a influência da relação da glicose e sacarose como fontes de carbono no meio empregando as relações 81:100; 27:126 e 26:187. A melhor produtividade específica obtida nos processos em batelada alimentada foi de 0,62 mgcpc/gcél.hpara o cultivo glicose e sacarose na relação de 81:100. A produtividade específicado processo em batelada foi de 0,74 mgcpc/gcél.h para relação de glicose/sacarose de 27:36. A caracterização reológica dos caldos em viscosímetro de cilindros concêntricos apresentou, para cada bioprocesso estudado, comportamento Newtoniano e pseudoplástico, para tempos distintos de fermentação. O índice de consistência (K) atingiu valor máximo no intervalo entre 3O e 40 horas de fermentação, e o índice de escoamento (n) para todos os ensaios mostrou semelhantes valores. As fotomicrografias realizadas durante os processos mostraram uma correspondência entre as formas das células e as fases do processo: fase inicial de crescimento celular, fase de esgotamento de glicose e formação de cefalosporina C / Abstract: Bioprocess for cephalosporin C production in fed-batch fermentor was studied concermng medium composition, specific productivity and rheological characterization. The batch process was performed in shake flasks and in 5 liters stirred tank reactor provided with pH, temperature, aeration and agitation control. In the shake flask experiments the performance of the strain Cephalosporium acremonium ATCC 48272, was examined with media containing glucose, fructose and sucrose. The medium with glucose and sucrose at the ratio 27:36 enable the best behavior concerning specific productivity, 0.18 mgcpc/gcél.h. In the runs carried out in stirred tank biorreactor the 27:36 ratio for glucose and sucrose was utilized, while in the fed-batch experiments the effect of different glucose ratios, 81:100; 27:126; 26:187 was examined. The higher specific productivity (0.62 mgcpdgcél.h) was observed for the experiment with 81:100 ratio glucose:sucrose. For the batch process with 27:36 glucose:sacarose ratio, the specific productivity was 0.74 mgcpdgcél.h. The rheological characterization of the mash were made in concentric cylinders viscometer. For each bioprocess it presented Newtonian and pseudoplastic behavior depending on the fermentation time. The consistency index (K) reached its maximum value between 3Oand 40 hours fermentation time, while the flow behavior index (n) showed similar values for all experiments. The photomicrographs taken during the process showed a relationship between the three cell morphologies and the three bioprocess phases: initial phase, glucose depletion phase and cephalosporin C production phase / Doutorado / Desenvolvimento de Processos Químicos / Doutor em Engenharia Química