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Diversidade genética e estrutura populacional de queixadas (Tayassu pecari) da Floresta Atlântica da região do Pontal do Paranapanema, SPMartin, Anna Carolina Russo Curbelo January 2018 (has links)
Orientadora: Profa. Dra. Cibele Biondo / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, São Bernardo do Campo, 2018. / A queixada (Tayassu pecari) é uma espécie considerada vulnerável globalmente e criticamente ameaçada em áreas de Mata Atlântica, devido à pressão de caça e fragmentação de habitat. A fragmentação de habitat devido a atividades antrópicas pode acarretar em estruturação genética das populações, além perda de diversidade genética e aumento de endogamia, o que pode contribuir para o processo de extinção local. O presente estudo teve como objetivo estimar o status genético da população de queixadas da região do Pontal do Paranapanema, na Mata Atlântica de SP. Essa região foi altamente fragmentada por atividades antrópicas e, no momento da realização da amostragem para este trabalho, a espécie se encontrava em apenas três dos fragmentos remanescentes (Parque Estadual do Morro do Diabo ¿ PEMD, Fazenda Ponte Branca ¿ FPB e Fazenda Santa Mônica ¿ FSM). Atualmente, é considerada extinta na região. Foram analisadas 47 amostras de sangue, coletadas entre os anos de 1999 e 2005, que foram genotipadas para 11 locos de microssatélites. Observou-se uma estruturação genética das três localidades amostradas em duas subpopulações. Duas das três localidades foram agrupadas em uma única subpopulação (PEMD e FPB) e houve diferenciação genética significativa apenas entre duas delas (PEMD e FSM). Os índices de diversidade genética foram similares para as três localidades e não foram encontradas evidências significativas de endogamia. Esses resultados podem ser explicados de duas formas: 1) existência de fluxo gênico, mesmo que baixo, entre as localidades amostradas (principalmente entre PEMD e FPB); 2) diferenciação recente das subpopulações. Conforme esperado para populações fragmentadas, houve evidências de gargalo populacional recente nas três localidades. Os resultados aqui obtidos podem ser indicativos do papel da paisagem antropizada na estruturação de populações de queixadas mesmo em pequena escala, já que o mesmo não tem sido registrado para regiões mais conservadas. Desta forma, estas evidências podem servir de direcionamento para planos de manejos e ações conservacionistas para outras populações de queixadas que se encontram em condições semelhantes a esta, visando diminuir as chances de extinção local em outras regiões. / The white-lipped peccary (Tayassu pecari) is considered vulnerable throughout its distribution and it is critically endangered in the Atlantic Forest, due to hunting pressure and habitat fragmentation. Habitat fragmentation caused by anthropic activities usually lead to population genetic structure, loss of genetic diversity and higher levels of inbreeding, which contributes to local extinctions. In this study, we addressed the genetic status of a white-lipped peccary population from Pontal do Paranapanema region, located in the Atlantic Forest of São Paulo State in Brazil. This area was highly fragmented by anthropic activities and white-lipped peccaries were found only in three remnant fragments (Parque Estadual do Morro do Diabo ¿ PEMD, Fazenda Ponte Branca ¿ FPB e Fazenda Santa Mônica ¿ FSM) when they were sampled for this work. Currently, they are considered extinct in the region. A total of 47 blood samples were collected between 1999 and 2005 and were genotyped for 11 microsatellite loci. We found that the three fragments sampled were structured in two subpopulations, with two of them being grouped into a single subpopulation (PEMD and FPB). We observed significant genetic differentiation only between two fragments (PEMD and FSM). The genetic diversity indices were similar for the three fragments and no indicators of inbreeding were found. These results can be explained in two ways: 1) existence of gene flow, even if low, between fragments (mainly between PEMD and FPB); 2) recent differentiation of the subpopulations. As expected for fragmentated populations, we found evidence of a population bottleneck for all the fragments sampled. These results can be indicative of the role of anthropized landscape in the structuration of white-lipped peccary populations even on a small scale, since it has not been recorded for well conserved regions. These finds can serve to delineate management plans and conservation actions for other white-lipped peccary populations that are in similar conditions, aiming to reduce the chances of local extinction in other regions.
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Análise populacional genética de Larus dominicanus através do uso de microssatélites / Population genetic analysis of Larus dominicanus using microsatellitesSantos, Fernanda de Almeida 07 February 2012 (has links)
As alterações que a ação antrópica vem causando nos ambientes costeiros tem provocado impactos sobre as espécies a eles associadas. Larus dominicanus é uma espécie de ave marinha amplamente distribuída ao longo do Hemisfério Sul. Por possuir um hábito alimentar generalista, os resíduos da ação antrópica tem beneficiado a espécie, que, assim como outras gaivotas, vem apresentando um crescimento demográfico acelerado. O presente estudo, através do uso de marcadores de microssatélites, mostra que, apesar disso, a espécie possui uma baixa variabilidade genética, com fraca estruturação populacional, que provavelmente são o reflexo da origem recente da espécie e de uma diferenciação recente entre as populações. Múltiplas forças atuam para determinar a estruturação populacional, sendo elas o isolamento por distância, as barreiras físicas e a filopatria. Os sinais de gargalo populacional encontrados em algumas das colônias levantam a possibilidade de efeitos fundadores por colonização recente nas colônias mais ao norte da costa brasileira e redução populacional nas colônias da Argentina e da Antártica como conseqüência da última glaciação. Estes dados chamam a atenção para a necessidade de considerar as informações genéticas para a implantação de planos de manejo. Uma vez que a diferenciação entre as populações é recente, a variabilidade dentro de cada uma delas deve ser mantida. O controle populacional da espécie através de métodos diretos deve ser também acompanhado por planos de manejo ambiental, visando reduzir ou eliminar as condições que propiciam o crescimento desequilibrado dos gaivotões. / The changes in the coast that has been caused by human action has led to impacts on species associated with this environment. Larus dominicanus is a seabird species widely distributed throughout the Southern Hemisphere. The generalist feeding habits allow this species take advantage from human action, leading to population growth, which is also observed in other species of gulls. This study, through the use of microsatellite markers, shows that, despite of the population growth, Larus dominicanus has a low genetic variability, with low population structure, which probably reflects the recent origin of species and a recent differentiation among populations. Multiple forces act to determine the population structure, among them the isolation by distance, physical barriers and philopatry. Some colonies presents a bottleneck sign, raising the hypothesis of recent founder effects in the colonies to the north of Brazil and population reduction of colonies of Argentine and Antarctic as consequence of the last glaciation. These data show the need to consider genetic information for the implementation of management plans. The variability within populations must be maintained, since the differentiation between them is recent. Furthermore, the species population control by direct methods must also be accompanied by environmental management plans, to reduce or eliminate the conditions that favor the unbalanced growth of the gulls
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Análise populacional genética de Larus dominicanus através do uso de microssatélites / Population genetic analysis of Larus dominicanus using microsatellitesFernanda de Almeida Santos 07 February 2012 (has links)
As alterações que a ação antrópica vem causando nos ambientes costeiros tem provocado impactos sobre as espécies a eles associadas. Larus dominicanus é uma espécie de ave marinha amplamente distribuída ao longo do Hemisfério Sul. Por possuir um hábito alimentar generalista, os resíduos da ação antrópica tem beneficiado a espécie, que, assim como outras gaivotas, vem apresentando um crescimento demográfico acelerado. O presente estudo, através do uso de marcadores de microssatélites, mostra que, apesar disso, a espécie possui uma baixa variabilidade genética, com fraca estruturação populacional, que provavelmente são o reflexo da origem recente da espécie e de uma diferenciação recente entre as populações. Múltiplas forças atuam para determinar a estruturação populacional, sendo elas o isolamento por distância, as barreiras físicas e a filopatria. Os sinais de gargalo populacional encontrados em algumas das colônias levantam a possibilidade de efeitos fundadores por colonização recente nas colônias mais ao norte da costa brasileira e redução populacional nas colônias da Argentina e da Antártica como conseqüência da última glaciação. Estes dados chamam a atenção para a necessidade de considerar as informações genéticas para a implantação de planos de manejo. Uma vez que a diferenciação entre as populações é recente, a variabilidade dentro de cada uma delas deve ser mantida. O controle populacional da espécie através de métodos diretos deve ser também acompanhado por planos de manejo ambiental, visando reduzir ou eliminar as condições que propiciam o crescimento desequilibrado dos gaivotões. / The changes in the coast that has been caused by human action has led to impacts on species associated with this environment. Larus dominicanus is a seabird species widely distributed throughout the Southern Hemisphere. The generalist feeding habits allow this species take advantage from human action, leading to population growth, which is also observed in other species of gulls. This study, through the use of microsatellite markers, shows that, despite of the population growth, Larus dominicanus has a low genetic variability, with low population structure, which probably reflects the recent origin of species and a recent differentiation among populations. Multiple forces act to determine the population structure, among them the isolation by distance, physical barriers and philopatry. Some colonies presents a bottleneck sign, raising the hypothesis of recent founder effects in the colonies to the north of Brazil and population reduction of colonies of Argentine and Antarctic as consequence of the last glaciation. These data show the need to consider genetic information for the implementation of management plans. The variability within populations must be maintained, since the differentiation between them is recent. Furthermore, the species population control by direct methods must also be accompanied by environmental management plans, to reduce or eliminate the conditions that favor the unbalanced growth of the gulls
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