A deficiência hereditária da enzima lisossômica G-galactosidase, codificada pelo gene GLB1, causa duas doenças humanas clinicamente distintas, a Gangliosidose GM1 e Morquio B. Clinicamente, pacientes com Gangliosidose GM1 mostram graus variados de neurodegeneração e anormalidades esqueléticas, enquanto que os com Mórquio B apresentam displasia esquelética e opacidade de córnea, sem envolvimento do sistema nervoso central. Neste trabalho foi realizada a análise da freqüência populacional das mutações mais comuns no Brasil para Gangliosidose GM1, e a tentativa de comprovação da hipótese de efeito fundador destas mutações. Também foi realizada a pesquisa clínica e molecular de pacientes com Gangliosidose GM1 na tentativa de caracterizar os pacientes brasileiros, identificando novas mutações e traçando um panorama clínico e genético dessa população. Com a intenção de compreender os efeitos das novas mutações encontradas entre os pacientes brasileiros sobre a estrutura da proteína codificada por GLB1, modelos tridimensionais foram gerados através de ferramentas de bioinformática. Neste estudo foi possível predizer as conseqüências biológicas destas mutações, correlacionando às mesmas com os achados fenotípicos dos pacientes. Um esforço na busca de novas terapias para a doença também foi realizado, visto que não existe tratamento eficaz contra a Gangliosidose GM1. Para tanto, três terapias foram testadas em fibroblastos de paciente com a mutação mais comum encontrada na população brasileira: a terapia de tradução alternativa com o uso de geneticina e cloranfenicol, e a terapia de chaperonas farmacológicas, através do uso de galactose. Nenhuma das terapias foi eficaz no aumento da atividade enzimática da G-galactosidase, mas um aumento da expressão gênica pode ser observado para o gene GLB1. / The inherited deficiency of the lysosomal enzyme G-galactosidase, encoded by the gene GLB1, causes two clinically distinct human diseases: GM1Gangliosidosis and Morquio B. Clinically, patients with GM1 Gangliosidosis show varying degrees of neurodegeneration and skeletal abnormalities, while Morquio B shows skeletal dysplasia and corneal opacity, without involving the central nervous system. This work was performed to analyze the population frequency of the most common mutations in Brazil for Gangliosidosis GM1, and the attempt to prove the hypothesis of a founder effect for these mutations. A clinical and molecular research in patients with Gangliosidosis GM1 was also performed, in an attempt to characterize Brazilian patients, identifying new mutations and drawing a picture of the clinical and genetic aspects of this population. Trying to understand the effects of new mutations found among Brazilian patients on the structure of the protein encoded by GLB1, threedimensional models were generated using bioinformatics tools. In this study it was possible to predict the biological consequences of these mutations, correlating them with the phenotypic findings of the patients. An effort in finding new therapies for the disease was also performed, since there is no effective treatment for GM1 Gangliosidosis. Therefore, three treatments were tested in fibroblasts from patients with the most common mutation found in Brazil: the alternative translation therapy using geneticin and chloramphenicol, and the pharmacological chaperone therapy, using galactose. None of these therapies was effective in increasing the enzyme activity of G-galactosidase, but an increase in gene expression could be observed in the GLB1 gene.

A deficiência hereditária da enzima lisossômica G-galactosidase, codificada pelo gene GLB1, causa duas doenças humanas clinicamente distintas, a Gangliosidose GM1 e Morquio B. Clinicamente, pacientes com Gangliosidose GM1 mostram graus variados de neurodegeneração e anormalidades esqueléticas, enquanto que os com Mórquio B apresentam displasia esquelética e opacidade de córnea, sem envolvimento do sistema nervoso central. Neste trabalho foi realizada a análise da freqüência populacional das mutações mais comuns no Brasil para Gangliosidose GM1, e a tentativa de comprovação da hipótese de efeito fundador destas mutações. Também foi realizada a pesquisa clínica e molecular de pacientes com Gangliosidose GM1 na tentativa de caracterizar os pacientes brasileiros, identificando novas mutações e traçando um panorama clínico e genético dessa população. Com a intenção de compreender os efeitos das novas mutações encontradas entre os pacientes brasileiros sobre a estrutura da proteína codificada por GLB1, modelos tridimensionais foram gerados através de ferramentas de bioinformática. Neste estudo foi possível predizer as conseqüências biológicas destas mutações, correlacionando às mesmas com os achados fenotípicos dos pacientes. Um esforço na busca de novas terapias para a doença também foi realizado, visto que não existe tratamento eficaz contra a Gangliosidose GM1. Para tanto, três terapias foram testadas em fibroblastos de paciente com a mutação mais comum encontrada na população brasileira: a terapia de tradução alternativa com o uso de geneticina e cloranfenicol, e a terapia de chaperonas farmacológicas, através do uso de galactose. Nenhuma das terapias foi eficaz no aumento da atividade enzimática da G-galactosidase, mas um aumento da expressão gênica pode ser observado para o gene GLB1. / The inherited deficiency of the lysosomal enzyme G-galactosidase, encoded by the gene GLB1, causes two clinically distinct human diseases: GM1Gangliosidosis and Morquio B. Clinically, patients with GM1 Gangliosidosis show varying degrees of neurodegeneration and skeletal abnormalities, while Morquio B shows skeletal dysplasia and corneal opacity, without involving the central nervous system. This work was performed to analyze the population frequency of the most common mutations in Brazil for Gangliosidosis GM1, and the attempt to prove the hypothesis of a founder effect for these mutations. A clinical and molecular research in patients with Gangliosidosis GM1 was also performed, in an attempt to characterize Brazilian patients, identifying new mutations and drawing a picture of the clinical and genetic aspects of this population. Trying to understand the effects of new mutations found among Brazilian patients on the structure of the protein encoded by GLB1, threedimensional models were generated using bioinformatics tools. In this study it was possible to predict the biological consequences of these mutations, correlating them with the phenotypic findings of the patients. An effort in finding new therapies for the disease was also performed, since there is no effective treatment for GM1 Gangliosidosis. Therefore, three treatments were tested in fibroblasts from patients with the most common mutation found in Brazil: the alternative translation therapy using geneticin and chloramphenicol, and the pharmacological chaperone therapy, using galactose. None of these therapies was effective in increasing the enzyme activity of G-galactosidase, but an increase in gene expression could be observed in the GLB1 gene.

A deficiência hereditária da enzima lisossômica G-galactosidase, codificada pelo gene GLB1, causa duas doenças humanas clinicamente distintas, a Gangliosidose GM1 e Morquio B. Clinicamente, pacientes com Gangliosidose GM1 mostram graus variados de neurodegeneração e anormalidades esqueléticas, enquanto que os com Mórquio B apresentam displasia esquelética e opacidade de córnea, sem envolvimento do sistema nervoso central. Neste trabalho foi realizada a análise da freqüência populacional das mutações mais comuns no Brasil para Gangliosidose GM1, e a tentativa de comprovação da hipótese de efeito fundador destas mutações. Também foi realizada a pesquisa clínica e molecular de pacientes com Gangliosidose GM1 na tentativa de caracterizar os pacientes brasileiros, identificando novas mutações e traçando um panorama clínico e genético dessa população. Com a intenção de compreender os efeitos das novas mutações encontradas entre os pacientes brasileiros sobre a estrutura da proteína codificada por GLB1, modelos tridimensionais foram gerados através de ferramentas de bioinformática. Neste estudo foi possível predizer as conseqüências biológicas destas mutações, correlacionando às mesmas com os achados fenotípicos dos pacientes. Um esforço na busca de novas terapias para a doença também foi realizado, visto que não existe tratamento eficaz contra a Gangliosidose GM1. Para tanto, três terapias foram testadas em fibroblastos de paciente com a mutação mais comum encontrada na população brasileira: a terapia de tradução alternativa com o uso de geneticina e cloranfenicol, e a terapia de chaperonas farmacológicas, através do uso de galactose. Nenhuma das terapias foi eficaz no aumento da atividade enzimática da G-galactosidase, mas um aumento da expressão gênica pode ser observado para o gene GLB1. / The inherited deficiency of the lysosomal enzyme G-galactosidase, encoded by the gene GLB1, causes two clinically distinct human diseases: GM1Gangliosidosis and Morquio B. Clinically, patients with GM1 Gangliosidosis show varying degrees of neurodegeneration and skeletal abnormalities, while Morquio B shows skeletal dysplasia and corneal opacity, without involving the central nervous system. This work was performed to analyze the population frequency of the most common mutations in Brazil for Gangliosidosis GM1, and the attempt to prove the hypothesis of a founder effect for these mutations. A clinical and molecular research in patients with Gangliosidosis GM1 was also performed, in an attempt to characterize Brazilian patients, identifying new mutations and drawing a picture of the clinical and genetic aspects of this population. Trying to understand the effects of new mutations found among Brazilian patients on the structure of the protein encoded by GLB1, threedimensional models were generated using bioinformatics tools. In this study it was possible to predict the biological consequences of these mutations, correlating them with the phenotypic findings of the patients. An effort in finding new therapies for the disease was also performed, since there is no effective treatment for GM1 Gangliosidosis. Therefore, three treatments were tested in fibroblasts from patients with the most common mutation found in Brazil: the alternative translation therapy using geneticin and chloramphenicol, and the pharmacological chaperone therapy, using galactose. None of these therapies was effective in increasing the enzyme activity of G-galactosidase, but an increase in gene expression could be observed in the GLB1 gene.

Submitted by Rafael Santana (rafael.silvasantana@ufpe.br) on 2018-01-30T17:59:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Versão Final-TESE-EICB-10-02-2017.pdf: 2121418 bytes, checksum: ad23456aec856da13a2581e107c840e7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-30T17:59:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Versão Final-TESE-EICB-10-02-2017.pdf: 2121418 bytes, checksum: ad23456aec856da13a2581e107c840e7 (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / REUNI / O câncer de mama é o segundo tipo de câncer mais frequente no mundo e o mais comum entre as mulheres, correspondendo a 25% de todos os cânceres do sexo feminino. No Brasil, representa a primeira incidência de neoplasia na mulher. O gene c-myc codifica fatores de transcrição que participam, direta e indiretamente, da regulação do ciclo celular, diferenciação, metabolismo, crescimento, apoptose, instabilidade genômica, angiogênese e imortalização celulares. O c-myc tem sido apontado como peça central no processo tumorigênico e sua amplificação está relacionada com carcinomas invasivos que apresentam comportamento clínico mais agressivo e prognóstico reservado. Diante disto, o presente estudo objetivou investigar a relação da amplificação do gene c-myc com fatores prognósticos entre os subtipos moleculares de câncer de mama diagnosticado com carcinoma ductal invasivo (CDI). As amostras de CDI (n=60), fixadas em formalina e embebidas em parafina, foram obtidas no Arquivo de Biópsias do Serviço de Anatomia Patológica do Hospital das Clínicas (HC) da Universidade Federal de Pernambuco (UFPE). A caracterização dos tumores em subtipos moleculares foi realizada utilizando imunohistoquímica para receptor de fator de crescimento epidérmico do tipo 2 (HER-2), receptores de estrógeno (RE) e progesterona (RP) e o fator de proliferação celular (Ki-67). A detecção da amplificação do gene c-myc foi realizada através de Hibridização in situ cromógena (CISH). Os resultados mostraram maiores frequências para os subtipos Luminal A (37,7%) e Triplo-Negativo (40%). Neste estudo tumores Luminais, notadamente Luminal A, apresentaram correlação estatistica quanto ao nível de diferenciação (p=0,0135), tamanho menor (p=0.5715), em estádio inicial no momento do diagnóstico; e com baixo a médio grau histológico e nuclear ao diagnóstico, respectivamente. Tumores dos subtipos superexpressão de HER-2 e Triplo-Negativo se relacionaram com caraterísticas prognósticas desfavoráveis, apresentando maiores taxas de invasão linfonodal, maiores chances de tumores indiferenciados e predomínio de diagnóstico entre as pacientes mais jovens, respectivamente. A maior frequência de amplificação do c-myc foi observada em 21 tumores (35%) no subtipo Triplo-Negativo, indicando que a amplificação pode estar associada a tumores mais agressivos e por isso um prognóstico reservado. / Breast cancer is the second most common cancer type worldwide and the most common among women, accounting for 25% of all female cancers. In Brazil, it represents the most incident cancer type in women. C-myc gene encodes transcription factors which are, directly and indirectly, involved in cell cycle regulation, differentiation, metabolism, growth, apoptosis, genomic instability, angiogenesis and cell immortalization. It has been considered as playing a role in tumorigenesis and its amplification is associated with more aggressive clinical behavior and poor prognosis in invasive carcinomas. This study aimed to investigate the relationship of c-myc amplification and clinicopathologic features amog the subtypes of invasive ductal carcinomas (IDC) of breast. Formalin-fixed and paraffin-embeded tissues samples (n=60) were retrieved from the Biopsies Archives of Anatomy and Pathology Sector of University Hospital at Federal University of Pernambuco. Tumors subtyping was developed using immunohistochemistry against epidermal growth factor receptor type 2 (HER-2), estrogen and progesterone receptors (ER and PR) and cell proliferating factor Ki-67. c-myc amplification was evaluated via chromogenic in situ hybridization (CISH). Results showed that the most frequent breast carcinomas subtypes were Luminal A (37.7%) and Triple-Negative (40%). Luminal tumors, mainly subtype A, showed to be well differentiated tumours regarding histological grade (p=0.0135), of small size (p=0.5715) at an early stage and presented a low and medium histologic and nuclear grade, respectively, at the time of diagnosis. Triple-Negative and HER-2 superexpression carcinomas were larger tumours, poorly differentiated (p= 0.0570), presenting higher rates of ganglionar involvement, advanced stages tumors and younger patients at the time of diagnosis, presenting the worst prognosis. We observed c-myc amplification in 21 tumours (35%) but no statistical difference was found between amplified and nonamplified and molecular subtypes of breast cancer.

Orientador: Bernardo Beiguelman / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-22T03:37:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Molina_SilviaMariaGuerra_D.pdf: 12433136 bytes, checksum: 5ae098167fd3f5963f96032dd02450f8 (MD5) Previous issue date: 1997 / Doutorado / Genetica Medica e Antropologica / Doutor em Ciências Biológicas

Orientador: Denise Yvonne Janovitz Norato / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T23:31:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Volpe_RobertaMazzariol_D.pdf: 9122725 bytes, checksum: 352bf95c00bccbe6502d1ec65ed071a8 (MD5) Previous issue date: 1998 / Doutorado / Genetica / Doutor em Ciências Biológicas

Orientador: Antonio Sergio Ramalho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-13T21:45:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sonati_MariadeFatima_D.pdf: 1534851 bytes, checksum: 49eb27f5b822c6436d060ca4eeacbc03 (MD5) Previous issue date: 1990 / Doutorado / Doutor em Ciências

Orientador : Maria Luiza S. Mello / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-13T22:48:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Penna_MariaLecticiaFirpe_M.pdf: 3414482 bytes, checksum: 6a8e1df3b4b5c80949f4faa3becf307d (MD5) Previous issue date: 1990 / Resumo: A possibilidade de provocar instabilidade e alterações na cinética celular pelo ácido retinóico, ácido derivado da vitamina A, em cromossomos humanos, foi pesquisada em culturas de linfócitos de 10 indivíduos do sexo feminino entre 20 e 30 anos de um grupo considerado controle. Para tal foram utilizadas culturas incubadas nas últimas 5 horas com ácido retinóico em concentrações de 20 µg/ml de meio e 2µg/ml de meio. O ácido retinóico foi diluído em DMSO e apresentou como concentração final na cultura de linfócitos 0,5% v/v e 0,05% v/v, respectivamente. Foram obtidas também culturas controle com DMSO puro nas concentrações supra-citadas e sem nenhuma droga. Utilizaram-se frascos em duplicata para cada situação experimental, um crescido na presença de BrdU e outro sem esta droga. Nas culturas crescidas em presença de BrdU foram realizadas contagens de trocas entre cromátides irmãs e freqüência de metáfases em diferentes gerações celulares e nas mantidas na ausência de DrdU freqüência de aberrações numéricas e/ou estruturais, índice mitótico e freqüência relativa de fenótipos nucleares. A instabilidade cromossômica foi pesquisada através das freqüências de trocas entre cromátides irmãs e de aberrações numéricas e/ou estruturais e a cinética celular, através dos valores de índice mitótico, freqüência relativa de células nas diferentes gerações e freqüência relativa dos fenótipos nucleares. A análise estatística dos dados permitiu concluir que o ácido retinóico promoveu um pequeno, mas significativo aumento na freqüência de trocas entre cromátides irmãs em linfócitos em cultura, independente da concentração da droga utilizada. Este aumento ocorreu de forma global na cultura, sem preferência por nenhuma região, par ou grupo cromossômico. Por outro lado, ele não foi capaz de provocar aberrações cromossômicas numéricas e/ou estruturais estatisticamente significativas. Em relação à cinética celular e dadas as condições utilizadas neste trabalho, não foram constatadas alterações significativas promovidas pelo ácido retinóico / Abstract: The possibility of using retinoic acid (derived from Vitamin A) to provoke instability and alterations in the ceIIuIar kinetics of human chromosomes was studied in cultures of lymphocytes from 10 women, considered to be a control group, all between 20 and 30 years of age. Cultures were incubated for the last 5 hours in media containing retinoic acid at concentrations of 20 µ/ml and 2 µ/m. The retinoic acid was diluted in DMSO and presented concentrations of 0.5% v/v and 0.05% v/v respectively in the cultures of lymphocytes. Control cultures were also prepared containing pure DMSO in the same concentrations but containing no drug. Duplicate flasks were used in each experimental situation, one grown in the presence of DrdU and the other in its absence. Counts of crossing over between sister chromatids and the frequency of metaphases in different cellular generations were determined in the cultures grown in the presence of DrdU. In those grown without DrdU, the frequency of numerical and/or structural aberrations was determined, and also the mytotic index and the relative frequency of nuclear phenotypes. Chromosomic instability was investigated using the frequency of crossing over between sister chromatids and numerical and/or structural aberrations. Cellular kinetics were investigated through the values for mitotic index, relative frequency of the different generations of cells and the relative frequency of nuclear phenotypes. A statistical analysis of the data allows one to conclude that retinoic acid provoked a small, but significant increase. ln the frequency of crossing over between sister chromatids in cultured lymphocytes, independent of the concentration of drug used. This increase occurred throughout the culture, with no preference for region or chromosomic pair or group. On the other hand, it was not capable of causing significant numerical and/or structural chromosomic aberrations. With respect to the cellular kinetics and given the conditions used in this research, no significant alterations provoked by the retinoic acid were detected. / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas

Orientador : Solange Bento Farah / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-13T22:44:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cerutti_JaneteMaria_M.pdf: 2982145 bytes, checksum: 69768617bb052fbd8234a583cb8f7482 (MD5) Previous issue date: 1991 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas

Orientador : Bernardo Beiguelman / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-07-16T02:49:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PintoJunior_Walter_D.pdf: 5456329 bytes, checksum: 1c9a3a1c7e164e6dd54fe78519585a85 (MD5) Previous issue date: 1972 / Resumo: Em um capítulo introdutório, após ressaltar a posição da Citogenética Humana na Medicina atual, o autor analisou de modo sucinto, as situações em que as anomalias determinadas por aberrações cromossômicas podem mostrar recorrência familial e fez uma sinopse da literatura a respeito da síndrome do "cri du chat", antes de apresentar os objetivos de sua tese. O segundo capítulo foi dedicado à apresenta-. çao da casuística estudada e a descrição detalhada de todas as técnicas empregadas em seu estudo, ou seja, à descrição das técnicas de obtenção de cariótipos ( preparo do material, tipo de meio de cultura empregado, obtenção e exame de metáfases, e registro de cariótipos), de autorradiografia, de obtenção de bandas cromossômicas, de exame de dermatóglifos e de exames imuno-hematológicos . Finaliza o capítulo uma breve notícia a respeito do tratamento estatístico dos dados. O terceiro capítulo foi dividido em duas secções. Na primeira, foram apresentados os resultados do estudo genético-clínico de sua casuística. Na segunda foi feita a apresentação dos resultados da revisão e análise crítica feita pelo autor a respeito de todos os casos de síndrome do "cri du chat" descritos na literatura específica. O quarto e último capítulo foram dedicados à discussão dos dados analisados e ao estabelecimento de catorze conclusões que satisfizeram os objetivos da tese. Assim, o autor pôde demonstrar, usando as técnicas mais recentes de identificação de cromossomos, que a casuística por ele estudada era decorrente de uma translocação até agora, inédita, presente na progenitora dos casos afetados, que mostrou o cariótipo 46,XX,t(5p-;2lq+). A mesma translocação equilibrada foi transmitida a uma das irmãs de dois casos com síndrome do "cri du chat", as quais receberam apenas o cromossomo 5p- mas não o 21q+. O autor pôde também demonstrar que a responsabilidade pela determinação do quadro clínico exibido pelos pacientes com síndrome do "cri du chat" deve ser atribuída à deficiência do braço menor do cromossomo número 5, independentemente de ter sido esse cromossomo aberrante transmitido por um dos genitores com translocação equilibrada, ou de ter tal deficiência ocorrido durante a gametogênese de progenitores com cariótipo normal, ou pós-zigoticamente, associada ou não a outras aberrações dos cromossomos. Finalmente, o autor chegou ao estabelecimento dos critérios necessários ao diagnostico da sindrome do "cri du chat" em recém-nascidos e durante a evolução dos casos / Abstract: Not informed / Doutorado / Doutor em Medicina