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DivergÃncia genÃtica entre progÃnies de meios-irmÃos de cajueiro anÃo precoce / Genetic divergence among half-sib progenies precocious dwarf cashewJosà Itamar Frota JÃnior 28 February 2012 (has links)
nÃo hà / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar e avaliar a diversidade
genÃtica de progÃnies de meios-irmÃos de cajueiro anÃo precoce da Embrapa AgroindÃstria
Tropical por meio de marcadores moleculares e morfolÃgicos, assim como, a indicaÃÃo dos
materiais divergentes para o programa de melhoramento genÃtico. Foram utilizadas 50
progÃnies instaladas no Campo Experimental de Pacajus, CE. Na anÃlise molecular, cada
progÃnie foi amostrada coletando-se folhas de duas plantas/parcela e analisadas no laboratÃrio
de Biologia Molecular da Embrapa AgroindÃstria Tropical. Foram realizadas extraÃÃes de
DNA baseadas no mÃtodo CTAB (brometo de cetiltrimetilamÃnio) ajustado por Cavalcanti
(2004) e utilizados marcadores do tipo ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Utilizou-se o
coeficiente de Jaccard e anÃlise de agrupamento UPGMA (MÃtodo de MÃdia AritmÃtica NÃo
Ponderada) para anÃlise dos grupos. Doze iniciadores ISSR geraram 71 bandas das quais 27
foram polimÃrficas. A anÃlise de agrupamento permitiu a divisÃo em quatorze grupos de
similaridade genÃtica, onde as progÃnies mais divergentes foram CNPAT 92-56, CNPAT 92-
62 e CNPAT 92-385 e as mais similares foram CNPAT 92-331 e CNPAT 92-335. Na anÃlise
quantitativa foram utilizadas as seguintes variÃveis: altura da planta, diÃmetro da copa,
nÃmero de castanhas e produÃÃo. Foi utilizada a DistÃncia Euclidiana para anÃlise da distÃncia
genÃtica e UPGMA para a anÃlise de agrupamento. A produÃÃo foi a variÃvel que obteve
maior contribuiÃÃo relativa para a divergÃncia genÃtica com 97,80%. A anÃlise de
agrupamento UPGMA possibilitou a distribuiÃÃo de 11 grupos. O material mais divergente foi
o CNPAT 92-331 oriundo da Fazenda Capisa (PiauÃ). Os mais similares formaram o subgrupo
I do grupo I, CNPAT 92-54 e CNPAT 92-58 com 95% de similaridade. HÃ variabilidade
genÃtica, no entanto nÃo foram encontradas relaÃÃes diretas entre a anÃlise molecular e a
quantitativa / The present work was developed in order to characterize and evaluate the genetic diversity of
dwarf cashew progenies from Embrapa AgroindÃstria Tropical using molecular and
morphological markers as well as the indication of divergent materials to the breeding
program. It was used 50 dwarf cashew progenies from Embrapa AgroindÃstria Tropical
collection located in the Experimental Center of Pacajus, CearÃ. In the molecular analysis,
each progeny was sampled by collecting leaves from two plants per plot and then analyzed at
EmbrapaÂs molecular biology lab. It was performed DNAÂs extractions based on CTAB
(Cetyltrimethylammonium bromide) method, adapted by Cavalcanti (2004). ISSRÂs markers
(Inter Simple Sequence Repeat) were used. JaccardÂs coefficient and UPGMA (Unweighted
Pair Group Method with Arithmetic Mean) cluster analysis were applied in the group
analysis. Cluster analysis allowed the division into fourteen groups of genetic similarity being
the most divergent progenies CNPAT 92-56, 92-62 and 92-385, and the most similar ones
CNPAT 92-331 and 92-335. Variables such as plant height, diameter, number of nuts and
production, were used in the quantitative analysis. Euclidian distance was used in the genetic
distance analysis. UPGMA method were used in cluster analysis. The variable with highest
relative contribution to genetic divergence was production, with 97,80%. The UPGMA cluster
analysis allowed the division into eleven groups. The most divergent material was
CNPAT 92-331 coming from Capisa farm in Piauà state. The most similar materials
formed the subgroup I of group I, CNPAT 92-54 and 92-58 with 95% similarity. There is
genetic variability, however no direct relationship between molecular and quantitative analysis was
found
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Divergência genética entre progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce / Genetic divergence among half-sib progenies precocious dwarf cashewFrota Júnior, José Itamar January 2012 (has links)
FROTA JUNIOR, José Itamar. Divergência genética entre progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce. 2012. 106 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Rede Nordeste de Tecnologia, Fortaleza-CE, 2012. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-24T13:27:22Z
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Previous issue date: 2012 / The present work was developed in order to characterize and evaluate the genetic diversity of dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical using molecular and morphological markers as well as the indication of divergent materials to the breeding program. It was used 50 dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical collection located in the Experimental Center of Pacajus, Ceará. In the molecular analysis, each progeny was sampled by collecting leaves from two plants per plot and then analyzed at Embrapa´s molecular biology lab. It was performed DNA´s extractions based on CTAB (Cetyltrimethylammonium bromide) method, adapted by Cavalcanti (2004). ISSR´s markers (Inter Simple Sequence Repeat) were used. Jaccard´s coefficient and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) cluster analysis were applied in the group analysis. Cluster analysis allowed the division into fourteen groups of genetic similarity being the most divergent progenies CNPAT 92-56, 92-62 and 92-385, and the most similar ones CNPAT 92-331 and 92-335. Variables such as plant height, diameter, number of nuts and production, were used in the quantitative analysis. Euclidian distance was used in the genetic distance analysis. UPGMA method were used in cluster analysis. The variable with highest relative contribution to genetic divergence was production, with 97,80%. The UPGMA cluster analysis allowed the division into eleven groups. The most divergent material was CNPAT 92-331 coming from Capisa farm in Piauí state. The most similar materials formed the subgroup I of group I, CNPAT 92-54 and 92-58 with 95% similarity. There is genetic variability, however no direct relationship between molecular and quantitative analysis was found / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar e avaliar a diversidade genética de progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce da Embrapa Agroindústria Tropical por meio de marcadores moleculares e morfológicos, assim como, a indicação dos materiais divergentes para o programa de melhoramento genético. Foram utilizadas 50 progênies instaladas no Campo Experimental de Pacajus, CE. Na análise molecular, cada progênie foi amostrada coletando-se folhas de duas plantas/parcela e analisadas no laboratório de Biologia Molecular da Embrapa Agroindústria Tropical. Foram realizadas extrações de DNA baseadas no método CTAB (brometo de cetiltrimetilamônio) ajustado por Cavalcanti (2004) e utilizados marcadores do tipo ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Utilizou-se o coeficiente de Jaccard e análise de agrupamento UPGMA (Método de Média Aritmética Não Ponderada) para análise dos grupos. Doze iniciadores ISSR geraram 71 bandas das quais 27 foram polimórficas. A análise de agrupamento permitiu a divisão em quatorze grupos de similaridade genética, onde as progênies mais divergentes foram CNPAT 92-56, CNPAT 92- 62 e CNPAT 92-385 e as mais similares foram CNPAT 92-331 e CNPAT 92-335. Na análise quantitativa foram utilizadas as seguintes variáveis: altura da planta, diâmetro da copa, número de castanhas e produção. Foi utilizada a Distância Euclidiana para análise da distância genética e UPGMA para a análise de agrupamento. A produção foi a variável que obteve maior contribuição relativa para a divergência genética com 97,80%. A análise de agrupamento UPGMA possibilitou a distribuição de 11 grupos. O material mais divergente foi o CNPAT 92-331 oriundo da Fazenda Capisa (Piauí). Os mais similares formaram o subgrupo I do grupo I, CNPAT 92-54 e CNPAT 92-58 com 95% de similaridade. Há variabilidade genética, no entanto não foram encontradas relações diretas entre a análise molecular e a quantitativa
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