Spelling suggestions: "subject:"genetica vegetal"" "subject:"genetica segetal""
1 |
Potencial ornamental e variabilidade genética de Tropaeolum pentaphyllum LAMPrestes, Daniele Kiel Penteado January 2015 (has links)
Orientador : Drª. Raquel R. B. Negrelle / Co-orientador : Drª. Francine L. Cuquel / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia. Defesa: Curitiba, 28/08/2015 / Inclui referências : f. 37-43 / Área de concentração: Produção vegetal / Resumo: Tropaeolum pentaphyllum Lam. (Tropaeolaceae) conhecida popularmente como crem é uma planta herbácea, geófita, trepadeira volúvel nativa do sul e sudeste do Brasil. Em alguns locais onde ocorrem, os tubérculos do crem são apreciados na culinária regional como condimento em sopas e carnes. Esta espécie também é apontada na literatura como potencialmente ornamental. Visando subsidiar a validação de crem como recurso ornamental, apresenta-se resultado de pesquisa que avaliou o crescimento e desenvolvimento dessa espécie, quantificou seu potencial ornamental com base em características agromorfológicas e analisou a aceitabilidade desta espécie junto a comerciantes e potenciais consumidores do mercado floricultor. Adicionalmente, apresenta-se resultado da avaliação da divergência genética entre oito acessos procedentes de áreas de cultivo e de ocorrência espontânea em Xaxim (SC), Caiçara (RS) e Frederico Westphalen (RS). O potencial ornamental foi validado tanto pelas características morfológicas quanto pela aceitação de comerciantes e consumidores de flores. Evidenciou-se a existência de dois grupos divergentes entre os acessos avaliados. Os critérios agromorfológicos que determinaram maior divergência foram tempo para brotação, cor das folhas, cor predominante das flores, quantidade e peso dos tubérculos. Palavra-chave: crem, trepadeira, floricultura, paisagismo, Tropaeolaceae, conservação. / Abstract: Tropaeolum pentaphyllum Lam. (Tropaeolaceae) is an herbaceous, geophyte and climbing native species of the Atlantic Forest in the South and Southeast region of Brazil, known popularly as crem. In some places, the crem tubercles are appreciated in the traditional cuisine by adding flavor to soups and meats. This species is also pointed in the literature as potentially ornamental. Aiming to subsidize the validation of crem as ornamental resource, the results of the evaluation of its ornamental characteristics (morphology, growth and development) are presented as well as the result of the analysis of its acceptance as ornamental resource by floriculture traders and consumers. Additionally, the results of the genetic divergence of eight accesses from natural areas and agricultural fields in Xaxim (SC), Caiçara (RS) and Frederico Westphalen (RS) are presented. The ornamental potential of this species was validated by its morphological characteristics as well as by its acceptance by traders and consumers. It was evidenced two distinct genetic groups among the evaluated accesses. The morphological and agronomic criteria that determined the higher divergence were flowering time, leaf color, flower predominant color, quantity and weight of the tubercles. Key words: crem, climber, floriculture, landscaping, Tropaeolaceae, conservation.
|
2 |
Análise fitoquímica sazonal e cultura de tecidos in vitro de Duroia macrophylla HuberZanca, Sabrina Schumacker 26 May 2015 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-06T18:26:59Z
No. of bitstreams: 2
Dissertação_Sabrina Schumacker Zanca.pdf: 5039439 bytes, checksum: 5efe72ddb5b05b30355272db0d78ee68 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-06T18:26:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2
Dissertação_Sabrina Schumacker Zanca.pdf: 5039439 bytes, checksum: 5efe72ddb5b05b30355272db0d78ee68 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
Previous issue date: 2015-05-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Amazon species Duroia macrophylla Huber (Rubiaceae) produces triterpenes and alkaloids with activity against Mycobacterium tuberculosis and an indole alkaloid active against tumoral cell lines. Previous studies showed that different plant extracts had difference on the chemical composition. So, the present study aim to assess the seasonal production of secondary metabolites in Duroia macrophylla extracts, in two specimens for one year. Also, callus in vitro were obtained for phytochemical extraction and secondary metabolites production analysis. For the two plants phytochemical analysis, leaves were collected monthly from April/2013 to March/2014. Plant material was grounded and extracted with hexane and methanol, with ultrasound bath. The concentrated extracts were analyzed by thin layer chromatography (TLC) and 1H-nuclear magnetic resonance (1H-NMR). The NMR spectra were compared by principal component analysis (PCA). The in vitro tissue cultures were established from young leaves with 50% of asepsis after several assays and with different immersion times of the chemical reagents: 70% etanol, 2% sodium hypochlorite and biocide solution. In vitro explants were induced to callus formation process by adding the growth regulators kinetin and 2,4-D, on Murashige & Skoog media, and then extracted with hexane and methanol. The production of secondary metabolites was analysed by TLC and 1H-NMR. All hexane and methanol extracts of two Duroia macrophylla individuals showed evidence of the presence of alkaloids and terpenes during a year. The PCA analysis showed seasonal variation on the chemical composition of the hexane extracts of Duroia macrophylla’s leaves, where the production of alkaloids increased during the rainy season. Regarding the methanol extracts of the leaves, the extract from November showed a lower alkaloid content. Being November the flowering species period, we can infer that the plant is redirecting its biosynthetic route for the production of less polar indole alkaloids or other metabolites. D. macrophylla callus extracts showed terpenes but not alkaloids production, and showed no antioxidant, toxic and antibacterial activities in the performed assays. / A espécie amazônica Duroia macrophylla Huber (Rubiaceae) é produtora de triterpenos e alcaloides com atividades sobre Mycobacterium tuberculosis e um alcaloide com atividade tumoral. Entretanto, coletas realizadas em épocas diferentes mostraram diferença na composição química de diferentes indivíduos. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a sazonalidade da produção de metabólitos secundários em extratos de Duroia macrophylla, durante um ano, em dois espécimes. Também foram obtidos calos in vitro da espécie para extrações fitoquímicas e análise da produção dos metabólitos secundários. Para as análises fitoquímicas dos dois indivíduos foram utilizadas folhas coletadas mensalmente de abril/2013 a março/2014. O material vegetal foi submetido à extração com hexano e metanol, em banho de ultrassom. Os extratos foram concentrados e posteriormente analisados por cromatografia em camada delgada comparativa (CCDC) e ressonância magnética nuclear (RMN) de 1H. Os espectros foram comparados por meio de uma análise de componentes principais. As culturas de tecidos in vitro foram estabelecidas com 50% de assepsia, após vários testes, a partir de explantes provindos de folhas jovens e com diferentes tempos de imersão dos reagentes químicos: etanol 70%, hipoclorito de sódio 2% e solução biocida. Depois de estabelecidos, os explantes in vitro foram induzidos ao processo de calogênese através da adição dos reguladores de crescimento cinetina e 2,4-D, em meio Murashige & Skoog. Os calos foram posteriormente extraídos com hexano e metanol e a produção dos metabólitos secundários foi avaliada por análise em CCDC e RMN de 1H. Os extratos hexânicos e extratos metanólicos obtidos dos dois indivíduos de Duroia macrophylla apresentaram indícios da presença de alcaloides e terpenos em todos os meses, durante um ano. A análise de componentes principais demonstrou que há uma variação sazonal na composição química dos extratos hexânicos de folhas de Duroia macrophylla, onde o teor de alcaloides indólicos foi maior na época mais chuvosa. Nos extratos metanólicos das folhas, o mês de novembro apresentou teores significativamente menores de alcaloides indólicos em relação aos outros meses, para os dois indivíduos estudados. Sendo o mês de novembro a época de floração da espécie, pode-se inferir que a planta está redirecionando a sua rota biossintética para a produção de alcaloides indólicos menos polares e também para a produção de outros metabólitos. Os extratos dos calos de D. macrophylla apresentaram terpenos, mas não alcaloides, e não apresentaram atividades antioxidante, tóxica e antibacteriana nos ensaios realizados.
|
3 |
Análise da expressão dos genes envolvidos na via de síntese de cafeína em plantas de café (Coffea arabica) apresentando diferentes teores de cafeínaTavares, Aline Gomes [UNESP] 01 October 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2010-10-01Bitstream added on 2014-06-13T19:54:08Z : No. of bitstreams: 1
tavares_ag_me_botib.pdf: 1952903 bytes, checksum: b683758c447a987faa46eedb5d509b32 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A cafeína é um alcalóide do grupo das metilxantinas. Em café, sua síntese depende da ação de três enzimas: Metilxanthosina sintase (MS), Teobromina sintase (TS) e Cafeina sintase (CS). A crença de que o consumo de cafeína pode trazer problemas à saúde como também a sensibilidade aos efeitos da cafeína, em alguns consumidores, determinou um crescimento do mercado dos cafés descafeinados em pelo menos 10%. O processo de descafeinização hoje é baseado no uso de solventes, que acarreta em significante perda de compostos essenciais ao sabor e qualidade de bebida. Recentemente, foram descobertas três plantas de Coffea arabica naturalmente descafeinadas no banco de germoplasma do Instituto Agronômico de Campinas (IAC). Estas plantas foram nomeadas AC. Análises bioquímicas nas folhas de AC1 mostraram que esta planta acumula teobromina, percussor da cafeína, não sendo detectada atividade da cafeína sintase. Maluf em 2009 descreveu, a existência de transcritos extras em todas as fases de desenvolvimento de frutos de AC1. Estes transcritos também estão presentes nos estágios verde-cana e cereja de frutos do cultivar mundo novo. Esses resultados obtidos sugerem que o transcrito extra está relacionado ao mecanismo de não produção de cafeína em frutos maduros. Tais resultados representam a possibilidade do desenvolvimento de um cultivar naturalmente descafeinado, e estratégias de melhoramento vêm sendo utilizadas para a transferência desta característica para outros cultivares. O presente trabalho caracterizou as plantas com baixos teores de cafeína através de análises genéticas e moleculares. Através da analise da regulação da expressão do gene caffeine sinthase (CCS), em folhas de café com teores normais e baixos de cafeína. As quantificação dos níveis de expressão, analisados via PCR quantitativo em tempo real revelaram baixa expressão do gene em folhas... / Caffeine is an alkaloid from the methilxanthine group. In coffee the synthesis of caffeine is carried out by three enzymes, methylxanthosine synthase (MS), theobromine synthase (TS) and caffeine synthase (CS). Due to the belief that the caffeine could cause health problems and also to consumers sensitivity to caffeine, the consumption of decaffeinated coffee increased in about 10%. The decaffeination process is based on the use of solvents, this process results in a loss of essentials compounds of flavor and cup quality. Recently, three coffee plants with extremely low levels of caffeine were identified in the IAC Coffea Germoplasm Collection, among non-cultivated C. arabica accessions. They are named AC´s. Bioquimistry assays in AC1 leaves show teobromine accumulation, caffeine precursor, no activity of caffeine synthase was detected. Maluf in 2009 described the existence of extra transcript in all development of AC1 fruit. Those transcripts are also present on latter development stages, yellowish-green and cherry. The Author suggest that this extra transcript is related to non-synthesis of caffeine in mature fruits of cultivar MN and during the development of AC1 fruits. These results represent the possibility of the development of low-caffeine cultivars and coffee breeding programs are been used due to transfer this characteristic to others cultivars. In this work, the naturally caffeine free plants have been caracterizated by molecular and genetics assays. Throught the characterization of the regulation of caffeine synthase gene expression. The quantification of expression by qRT PCR show low expression in leaves of ACs plants comparing the expression of MN and ET4, same cultivar of AC. Expression assays show that abramulosa mutant has low expression comparing to MN cultivar but seperflorens mutant showed a normal expression... (Complete abstract click electronic access below)
|
4 |
Isolamento e caracterização de um gene que codifica uma isofalvona redutase like de café(Coffea arábica L.) e análise de sua região promotoraSeverino, Fábio Eduardo [UNESP] 25 April 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2008-04-25Bitstream added on 2014-06-13T19:02:40Z : No. of bitstreams: 1
severino_fe_me_botib.pdf: 458536 bytes, checksum: 4b14f0a6dbecd176db24c8a5d13b8b0c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Sendo o café (Coffea arabica) um dos mais importantes produtos agrícolas do mundo, o segmento cafeeiro é de grande relevância para o Brasil, que é o seu maior produtor mundial. Doenças e pragas reduzem consideravelmente a produtividade da cultura e conseqüentemente, as margens de lucro. Nesse contexto, a disponibilidade de promotores tecido-específicos, responsáveis pela regulação de genes responsivos a estresses bióticos e abióticos, constitui uma ferramenta fundamental para os programas de melhoramento genético do café visando o incremento de resistência. Pensando nisso, o presente trabalho teve como objetivo realizar a caracterização de um gene que codifica uma Isoflavona Redutase-Like em café (CaIRL), cuja expressão é específica em folha e induzida por estresses, bem como do seu promotor. Para tal, um cDNA cobrindo toda a região codificadora do gene CaIRL foi obtido por 3’RACE e sua seqüência determinada. Uma análise filogenética foi empreendida e mostrou que a CaIRL representa uma nova redutase específica de café. A quantificação da expressão desse gene em folhas de café, via PCR em tempo real, revelou que mesmo é rápida e fortemente induzido pelo fungo da ferrugem alaranjada do cafeeiro (Hemileia vastatrix) e por danos mecânicos realizados no limbo foliar. Uma análise de deleção do promotor CaIRL em plantas de tabaco (Nicotiana tabacum) transgênicas demonstrou que a versão integral desse promotor (0.9 kb) é capaz de garantir uma expressão basal do gene repórter, sendo a mesma induzida por estresse mecânico. Por outro lado, uma expressão bastante reduzida do gene repórter, e não mais induzida por estresse mecânico, foi observada nas plantas transformadas com a versão menor do promotor (0.4 kb). A atividade do promotor CaIRL foi portanto bastante afetada pela deleção efetuada, e uma possível explicação para esse fato está na... / Not available
|
5 |
Análise bioquímica, estudos da relação estrutura-função e de expressão da proteína desacopladora mitocondrial de plantasFávaro, Regiane Degan [UNESP] 30 May 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2008-05-30Bitstream added on 2014-06-13T19:42:40Z : No. of bitstreams: 1
favaro_rg_dr_botib.pdf: 702142 bytes, checksum: 37419e284ee746774dfc59ce6ab27b1b (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Proteínas desacopladoras (UCPs; do inglês uncoupling proteins) são proteínas especializadas no transporte mitocondrial que desacoplam a respiração da síntese de ATP. UCPs geram um fluxo de prótons através da membrana mitocondrial interna, dependente de ácidos graxos e sensível a nucleotídeos purínicos (PN). No presente trabalho, foram realizados vários estudos empregando UCPs de plantas (pUCP). Inicialmente, foi empreendida a caracterização bioquímica de uma UCP de milho (Zea mays; ZmUCP), representativa de espécies monocotiledôneas. Essa proteína, quando expressa em Escherichia coli e reconstituída em lipossomos, foi capaz de induzir um fluxo de prótons dependente de ácido linoléico (LA) e sensível a ATP com valores de Km, Vmax e Ki similares àqueles observados para pUCPs de espécies dicotiledôneas. A ZmUCP foi utilizada para investigar a importância de um par de histidinas presente no segundo loop matricial da UCP1 de mamíferos e ausente nas pUCPs. A introdução do referido par de histidinas na ZmUCP (Lys155His e Ala157His) provocou um aumento na afinidade por LA enquanto que a sua atividade permaneceu inalterada. Em um estudo mais abrangente de estrutura-função, mutações pontuais nos resíduos Lys147, Arg155 e Tyr269, localizados nas chamadas assinaturas das UCPs, e Cys28 e His83, específicos para pUCPs, foram introduzidas na proteína AtUCP1 de Arabidopsis. Os efeitos de tais mutações nas propriedades bioquímicas da AtUCP1 foram examinados usando sistema de reconstituição em lipossomos. O resíduo Arg155 parece ser crucial para a afinidade da AtUCP1 por LA enquanto que His83 tem importante função na atividade de transporte. Os resíduos Cys28, Lys147, e também Tyr269, são importantes para a correta funcionalidade da AtUCP1, já que suas substituições... / Uncoupling proteins (UCPs) are specialized mitochondrial transporter proteins, which uncouple respiration from ATP synthesis. UCPs mediate a fatty acid (FA)-dependent, purine nucleotide (PN)-inhibitable proton flux across the inner membrane mitochondrial. In the present study, several assays on plant UCPs (pUCP) were performed. Firstly, we biochemically characterized an UCP from maize (Zea mays; ZmUCP), a representative uncoupling protein from monocot species. This protein was expressed in Escherichia coli and reconstituted in liposomes. ZmUCP was fully active and induced a linoleic acid-dependent proton flux that was sensitive to ATP. The obtained Km, Vmax and Ki values were similar to those observed for dicot pUCPs. ZmUCP was also used to investigate the importance of a histidine pair present in the second matrix loop of mammalian UCP1 and absent in pUCPs. ZmUCP with the introduced histidine pair (Lys155His and Ala157His) displayed increased LA-affinity while its activity remained unchanged. In a subsequent study using AtUCP1, point mutations were introduced in amino acid residues Lys147, Arg155 and Tyr269, located inside the so-called UCP-signatures, and Cys28 and His83, specific for pUCPs. The effects of amino acid replacements on AtUCP1 biochemical properties were examined using reconstituted liposomes. Residue Arg155 appears to be crucial for AtUCP1 affinity to LA whereas His83 plays an important role in transport activity. Residues Cys28, Lys147, and also Tyr269 are important for correct AtUCP1 function, as their substitutions affected either the AtUCP1 affinity to LA and its transport activity, or sensitivity to PN inhibitors. Furthermore, we analyzed the expression profiles of the six genes encoding pUCP in Arabidopsis thaliana (AtUCP1-6) in response to salt (NaCl) and osmotic (mannitol)... (Complete abstract click electronic access below)
|
6 |
Propagação, variabilidade genética e química de Zeyheria montana MartBertoni, Bianca Waléria [UNESP] 16 January 2003 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2003-01-16Bitstream added on 2014-06-13T20:03:26Z : No. of bitstreams: 1
bertoni_bw_dr_jabo.pdf: 1300029 bytes, checksum: 7da6157902f737e2dd32614591c690f5 (MD5) / Zeyheria montana é uma espécie arbustiva conhecida no Brasil como bolsa de pastor. Tintura das raízes tem sido popularmente utilizada para eliminar tumores e, as folhas para combater inflamações de modo geral. Neste trabalho, foram avaliados índices de germinação de sementes de Z montana coletadas nos estados de São Paulo, Minas Gerais e Goiás e também a influência do período de armazenamento das sementes e incidência de luz na germinação. Foi constatado que os índices de geminação das sementes coletadas nos diferentes estados Brasileiros diferem entre si, provavelmente em decorrência da variabilidade genética existente entre os acessos estudados ou devido aos distintos graus de maturação e ou qualidade fisiológica. A incidência de luz não interferiu na germinação. A exposição das sementes à temperaturas sub-zero mostrou comportamento ortodoxo, porém elas não são longévoas... / Root extracts of Zeyheria montana a shrub species we!l known in Brazil as bolsa de pastor, have been popularly used to eliminate tumors and leaf extracts to combat generai inflammations. In this work, seeds of Z. montana collected in the states of São Paulo, Minas Gerais and Goiás were evaluated for germination and influence of the period of storage and light incidence. It was verified that germination rates of the seeds collected in the different states of Brazil varied significantly, probably due to the genetic diversity existent among the studied accesses or to different stages of maturation and physiologic quality. Light didn't interfere on germination. Seeds exposed to sub-zero temperatures showed orthodox behavior, but they are not longevous... (Complete abstract, access undermentioned eletronic address)
|
7 |
Caracterização de Retrotransposons com LTR no gênero Eucalyptus / Characterization of LTR Retrotransposon un Eucalyptus genusMarcon, Helena Sanches [UNESP] 28 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2014-02-28Bitstream added on 2015-03-03T12:06:25Z : No. of bitstreams: 1
000807323_20160228.pdf: 863780 bytes, checksum: f9edab5c1d353f33385731e8fc06aa46 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-29T12:16:26Z: 000807323_20160228.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-29T12:17:25Z : No. of bitstreams: 1
000807323.pdf: 3263368 bytes, checksum: e50d8228791f0d071b3e2c640b0eefa9 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Os retrotransposons com LTR (long terminal repeats) (LTR-RTEs) são os componentes mais abundantes nos genomas vegetais. Eles são divididos em duas superfamílias, Copia e Gypsy, de acordo com a ordem dos domínios internos e com a similaridade das sequências. São conhecidos pela sua natureza ubíqua e plasticidade, o que os leva a serem explorados como ferramentas para o desenvolvimento de marcadores moleculares, utilizando-se assim o padrão de inserção dos LTR-RTEs para geraçã o de polimorfismos. As famílias de LTR-RTEs apresentam número de cópias variável dentro de um mesmo genoma, mas a amplificação de poucas famílias pode contribuir com grandes diferenças de tamanho entre genomas próximos. Em plantas do gênero Eucalyptus existem poucos estudos relacionados aos LTR-RTEs, que geralmente limitam-se a análises em bancos de dados privados. Este trabalho tem como objetivo a caracterização de LTR-RTEs transcricionalmente ativos pertencentes as superfamílias Copia e Gypsy, encontrados no genoma de eucalipto. A partir de análises preliminares de bioinformática, um total de nove famílias de LTR-RTEs foram identificadas; os elementos da superfamília Copia foram classificadas em cinco linhagens e elementos da superfamília Gypsy foram divididos em três linhagens. As análises in silico no genoma draft de Eucalyptus grandis identificaram que as famílias caracterizadas possuem entre 38 e 290 cópias. Os LTR-RTEs foram utilizados para o desenvolvimento de marcadores moleculares IRAP, REMAP e RBIP, que foram avaliados em cinco espécies de eucalipto. Dezesseis primers IRAP foram avaliados e um total de 1521 fragmentos foram gerados, com 321 fragmentos polimórficos, em um intervalo de 250 a 2500 bp e uma média de 19,01 fragmentos amplificados por primer. Vinte e oito combinações de primers REMAP foram avaliadas e geraram 1910 fragmentos, dos quais 492 são polimórficos, em um intervalo de 200 a 1250 bp, com uma média de ... / Long Terminal Repeat Retrotransposons (LTR-RTEs) are the most abundant component of plant genomes. They are divided into two superfamilies, Copia and Gypsy, based on coding domain order and sequence similarity. As dynamic and ubiquitous entities in plant genomes, marker systems based in LTR-RTEs were developed to exploit LTR-RTEs insertion pattern polymorphism. In most angiosperm genomes, LTR-RTEs families have a wide range of copy number, but the amplification of a few families individually contribute to a large fraction of the genome. LTR-RTEs were scarcely studied in the Eucalyptus genus, with most findings derived from global analyses of private genomic databases. The aim of this work is to characterize transcriptionally active Copia and Gypsy LTR-RTEs in Eucalyptus sp genomes. After preliminary bioinformatics analyses, a total of 9 full-length LTR-RTEs families were classified into five Copia and three Gypsy lineages. BLAT analysis in Eucalyptus grandis draft genome identified that these elements have between 38 and 290 copies. These LTR-RTEs were used to develop IRAP, REMAP and RBIP markers, which were evaluated in five Eucalyptus species (Eucalyptus brassiana, E. grandis, Eucalyptus saligna, Eucalyptus tereticornis and Eucalyptus urophylla). Sixteen IRAP primers produced 321 polymorphic fragments from a total of 1521 bands, ranging from 250 to 2500 bp, with an average of 19.01 bands amplified per IRAP primer. Twenty-eight REMAP primer combinations produced 1910 bands. 492 of them were polymorphic, ranging from 200 to 1250 bp. An average of 13.64 REMAP bands was scored per primer. Our results showed that the genetic similarity assessed by both IRAP and REMAP markers did not reflect molecular phylogenetic analysis. Nonetheless, these markers are useful for the assessment of genetic diversity the individual level and population analysis. We developed RBIP markers for three site-specific ...
|
8 |
Expressão de genes em sementes de lobeira (Solanum Lycocarpum St Hill) submetidas ao condicionamento fisiológicoSouza, Bruna Luiza de [UNESP] 11 March 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2014-03-11Bitstream added on 2014-06-13T18:48:50Z : No. of bitstreams: 1
000752466.pdf: 1219268 bytes, checksum: 46a6451baf87c6f487174495f002af34 (MD5) / Sementes de Solanum lycocarpum, lobeira, apresentam resistência mecânica ao crescimento do embrião causada por polissacarídeos da parede celular presentes no endosperma micropilar. Para que a germinação ocorra é necessário que haja a hidrólise desses polissacarídeos para promover enfraquecimento do endosperma, permitindo crescimento do embrião. Assim, enzimas associadas com o crescimento do embrião e enfraquecimento do endosperma podem ser importantes durante a germinação. O condicionamento fisiológico é uma técnica que aumenta a velocidade e a uniformidade da germinação e promove a superação da dormência de algumas espécies. Logo, o objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do hidrocondicionamento na qualidade fisiológica das sementes e estudar a expressão de genes associados com o crescimento do embrião e degradação do endosperma micropilar em sementes de Solanum lycocarpum. As sementes de lobeira foram submetidas ao hidrocondicionamento e condicionamento com PEG (-0,2 MPa) e avaliadas com relação a sua qualidade fisiológica, determinando-se; porcentagem de germinação, índice de velocidade de germinação (IVG), tempo médio de germinação e frequência relativa da germinação. A expressão gênica foi realizada usando a técnica de PCR em tempo real. Para isso, o RNA foi extraído e cDNA foi confeccionado. Os genes estudados no embrião foram expansina (EXP8 e EXP10), α-galactosidase (LeaGal) e poligalacturonase(XOPG1), e no endosperma micropilar foram a α-galactosidase (LeaGal), β-manosidase (LeMside1), endo-β-mananase (LeMAN2) e poligalacturonase... / Priming is a technique that increases the speed and uniformity of germination and promotes the break of dormancy in some species. Therefore, the aim of this study was to evaluate the effect of priming on seed quality and to study the expression of genes associated with embryo growth and degradation of the micropylar endosperm of seeds of Solanum lycocarpum. The seeds were subjected hydropriming and osmoprimig conditioning with PEG (-0.2 MPa ). There were evaluated the germination percentage, the germination speed index (GSI ), the average time to germination and relative frequency of germination. The gene expression was performed using the real-time PCR technique. For this, RNA was extracted and cDNA synthesis was performed. The genes studied in the embryo were expansins (EXP8 and EXP10 ), α-galactosidase (LeaGal) and polygalacturonase ( XOPG1 ), and in the micropylar endosperm were α - galactosidase(LeaGal), β- mannosidase (LeMside1) , endo-β- mannanase ( LeMAN2 ) and polygalacturonase(XOPG1). The highest speed, lowest average time to germination and ...
|
9 |
Estresse hídrico e osmocondicionamento de sementes de espécies e híbridos de eucaliptoJustus, Rafael Aranha Pereira [UNESP] 27 June 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2014-06-27Bitstream added on 2015-03-03T12:06:08Z : No. of bitstreams: 1
000811967.pdf: 992303 bytes, checksum: 45769526368a8c41c31996dad950f71f (MD5) / O presente trabalho objetivou avaliar o efeito do estresse hídrico sobre a germinação de sementes de seis espécies (Eucalyptus brassiana, E. camaldulensis, E. grandis, E. pellita, E. resinifera e E. urophylla) e quatro híbridos (E. brassiana x E. pellita, E. brassiana x E. tereticornis, E. grandis x E. camaldulensis e E. grandis x E. urophylla) de eucalipto, submetendo-os a seis potenciais hídricos (0, -0,2, -0,4, -0,6, -0,8 e -1,0 MPa) simulados por soluções aquosas de polietilenoglicol 6000 (PEG 6000). Pretendeu-se também avaliar o efeito do condicionamento osmótico de sementes sobre a porcentagem, velocidade de emergência em viveiro, sobre o desenvolvimento de mudas e sobre a possível indução de maior tolerância dessas mudas ao déficit hídrico, em casa de vegetação. Os experimentos realizados no laboratório e em viveiro foram conduzidos em delineamento experimental inteiramente ao acaso, e o realizado na casa de vegetação foi conduzido em blocos ao acaso. Os dados foram submetidos a análise de variância com comparação de médias pelo teste de Tukey e análise de regressão. Observou-se que o aumento da restrição hídrica afeta de forma diferenciada a germinação das espécies e híbridos de eucalipto, sendo E. brassiana x E. tereticornis, E. grandis x E. camaldulensis e E. resinífera os mais tolerantes à deficiência hídrica. O osmocondicionamento proporcionou o aumento na velocidade de emergência de E. brassiana x E pellita e E. brassiana x E. tereticornis, mas prejudicou a emergência de E. grandis x E. camaldulensis e de E. urophylla x E. grandis. Na etapa realizada na casa de vegetação o osmocondicionamento resultou na diminuição da média da altura das mudas de E. resinifera, E. grandis e E. grandis x E. camaldulensis, e no aumento da média desse caráter em E. brassiana x E pellita. Não houve diferença no período de sobrevivência das mudas provenientes de sementes osmocondicionadas e ... / This research aimed valuate the effect of the water stress under the seed germination of six eucalypt species (Eucalyptus brassiana, E. camaldulensis, E. grandis, E. pellita, E. resinifera and E. urophylla) and four eucalypt hybrids (E. brassiana x E. pellita, E. brassiana x E. tereticornis, E. grandis x E. camaldulensis e E. grandis x E. urophylla), subjecting to six osmotic potentials (0, -0,2, -0,4, -0,6, -0,8 e -1,0 MPa) simulated by solutions of polyethylene glycol 6000 (PEG 6000) The aim was also to evaluate the effect of seed priming on percentage and emergence in nursery, on seedling development and the possible induction of drought tolerance to these seedlings, in greenhouse The experiments were carried out in completely randomized design, in laboratory and in nursery, and in completely randomized block in greenhouse. The data were subjected to analysis of variance and means compared by the Tukey test and regression analyses It was noted that the rising of water restriction affects in a different way the germination of the species and hybrids of eucalyptus, E. brassiana x E. tereticornis, E. grandis x E. camaldulensis and E. resinífera the most tolerant to the water deficit. The effect of the priming was little among the species and hybrids studied, giving a increasing in the emergency speed of the E. brassiana x E pellita e E. brassiana x E. tereticornis, but damaging the emergency rate of E. grandis x E. camaldulensis and de E. urophylla x E. grandis. In stage conducted in a greenhouse priming resulted in decreased of average seedling height on genotypes E. resinifera, E. grandis and E. grandis x E. camaldulensis, and increasing this characteristic of E. brassiana x E. pellita. No significant differences were found in survival time between the seedlings from primed seeds and the unprimed
|
10 |
Análises citogenéticas em linhagens sintéticas de Triticum aestivum L. em Thell. (T. durum L. X Aegilops tauschii Coss) e seus cruzamentos com cultivares de trigo, visando a introgressão de resitência à ferrugem da folhaCardoso, Milena Barcelos January 2007 (has links)
Uma estratégia bem reconhecida para aumentar o pool gênico do trigo consiste na introdução de genes de espécies selvagens afins. Aegilops tauschii Coss. possui muitas características agronomicamente desejáveis, não facilmente encontradas em trigo (Triticum aestivum L. em Thell), tal como a resistência a patógenos. Com o objetivo de aumentar a resistência do trigo cultivado à ferrugem da folha, quatro hexaplóides sintéticos (PF844005, PF964001, PF964004 e PF964009), desenvolvidos a partir do cruzamento de T. durum L. (AABB) X Ae. tauschii (DD), foram cruzados com quatro cultivares brasileiras de trigo (AABBDD - BRSAngico, RS120, BRS209 e CD104). Foram realizadas análises citogenéticas visando avaliar a estabilidade meiótica dos hexaplóides sintéticos, cultivares e suas progênies F1, F2 e RC1F1. Nas cultivares, os índices meióticos variaram de 85,1 a 94,1 indicando uma estabilidade citológica relativamente alta. Três formas sintéticas apresentaram índices meióticos variando de 78,2 a 80,6, o que indica um comportamento meiótico razoavelmente regular. A quarta forma sintética apresentou um índice meiótico estatisticamente mais baixo (40,4). A meiose foi estudada em algumas plantas, mostrando que univalentes e retardatários são as causas da formação de micronúcleos. A freqüência de grãos de pólen viáveis variou de 90,4 a 94,0% para as cultivares, enquanto as formas sintéticas exibiram viabilidade polínica variando de 79,9 a 92,0%. Assim como para o índice meiótico, a comparação das médias gerais mostrou que as freqüências de grãos de pólen viáveis das cultivares são estatisticamente superiores às das formas sintéticas. O efeito da combinação de cruzamento bem como das gerações no índice meiótico e na viabilidade do pólen foi estatisticamente significante. Entretanto, na viabilidade do pólen, houve uma interação significativa entre combinação de cruzamento X geração. Embora a análise estatística não tenha discriminado claramente as combinações genotípicas, uma tendência foi evidenciada nos dados de viabilidade do pólen e índice meiótico, sendo que os cruzamentos envolvendo a cultivar CD104 apresentaram repetidamente médias mais elevadas. Por outro lado, as combinações incluindo a cultivar BRS120 apareceram com as médias mais baixas. A resposta à raça SPJ-RS de Puccinia triticina foi avaliada ao longo das gerações. Oito combinações genotípicas exibiram resistência à ferrugem da folha em todas as gerações. Estes resultados confirmam que Ae. tauschii pode ser usado como fonte de recursos genéticos para aumentar a resistência à ferrugem da folha em cultivares comerciais, usando linhas hexaplóides sintéticas como ponte. O tamanho do grão de pólen foi avaliado nos níveis diplóide (2n=2X=14, Ae. tauschii = T. tauschii, um acesso), tetraplóide (2n=4X=28, T. durum, quatro cultivares) e hexaplóide (2n=6X=42, T. aestivum, quatro cultivares brasileiras e quatro formas sintéticas). Grãos de pólen com o menor diâmetro (39,14 μm) foram encontrados na espécie diplóide Ae. tauschii. Os grãos maiores (55,82 a 59,87 μm) foram observados nas cultivares e sintéticos hexaplóides. Valores intermediários foram apresentados pelas cultivares tetraplóides de T. durum (46,57 a 47,64 μm). Além da associação entre tamanho de pólen e nível de ploidia, foi verificado em todos os genótipos que o diâmetro dos grãos de pólen viáveis foi significativamente maior do que aquele observado para os grãos inviáveis. A detecção de diferenças significativas no diâmetro dos grãos de pólen permitiria o uso de citômetro de fluxo para obter uma estimativa rápida tanto do nível de ploidia como da viabilidade do pólen em Triticum. / One well-recognized means to increase the wheat gene pool is to introduce genes from wild relatives. Aegilops tauschii Coss. posses many agronomically identified desirable characteristics not readily found in wheat (Triticum aestivum L. em Thell), such as resistance to pathogens. Aiming to improve the resistance of cultivated wheat to leaf rust, four synthetic hexaploids (PF844005, PF964001, PF964004 and PF964009), developed from T. durum L. (AABB) and Ae. tauschii (DD), were crossed with four Brazilian commercial wheat cultivars (AABBDD - BRSAngico, RS120, BRS209 and CD104). Cytogenetical analyses were performed aiming to evaluate the meiotic stability of the synthetic hexaploids, cultivars and their F1, F2 and BC1F1 progenies. Meiotic indices varied from 85.1 to 94.1, indicating a relatively high cytological stability of the cultivars. Three synthetic forms presented meiotic indices that varied from 78.2 to 80.6, indicating a quite regular meiotic behavior. The fourth synthetic form presented a statistically lower meiotic index (40.4). Meiosis was studied in some plants, showing that univalents and laggards were the causes of micronuclei formation. The frequency of viable pollen grains varied from 90.4 to 94.0% for T. aestivum cultivars and from 79.9 to 92.0% for synthetic forms. As well as for meiotic index, the comparison between general means showed that the frequencies of viable pollen grains are statistically higher in cultivars than in synthetic forms. The effect of cross combinations as well as generations on the meiotic index and pollen viability was highly significant. However, in pollen viability, statistical analysis showed that interaction between cross combinations and generations, as well as their simple effects were significant. Although the statistical analysis had not clearly discriminated the genotype combinations, there was a clear tendency in pollen viability and meiotic index data, with crosses involving CD104 cultivar showing up repeatedly with higher means. On the other hand, combinations including BRS120 cultivar appeared with the lowest means. The responses to the Puccinia triticina SPJ-RS race were evaluated over generations. Eight genotype combinations exhibited leaf rust resistance in all generations. These results confirm that Ae. tauschii can be used as a good genetic source for improving leaf rust resistance in commercial cultivars, using synthetic hexaploid lines as a bridge. Pollen grain size was evaluated in diploid (2n=2X=14, Aegilops tauschii = T. tauschii, one accession), tetraploid (2n=4X=28, T. durum, four commercial cultivars), and hexaploid (2n=6X=42, T. aestivum, four Brazilian cultivars, and four synthetic forms) levels. The pollen grains with the smallest diameter (39.14 μm) were found in Ae. tauschii, the diploid species. The largest pollen grains (55.82 to 59.87 μm) were observed in the hexaploids T. aestivum and synthetic forms. Intermediate values were presented by tetraploid cultivars of T. durum (46.57 to 47.64 μm). In addition to an association between pollen size and ploidy level, it was found that the mean diameter of viable grains was significantly larger than that of inviable grains for all the genotypes studied. The significant differences detected in pollen diameter could allow the use of particle counters to obtain a rapid estimation of ploidy level as well as pollen viability in Triticum.
|
Page generated in 0.0732 seconds