• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 86
  • 1
  • Tagged with
  • 87
  • 87
  • 34
  • 34
  • 31
  • 24
  • 22
  • 11
  • 11
  • 11
  • 11
  • 10
  • 9
  • 9
  • 9
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
1

Análise fitoquímica sazonal e cultura de tecidos in vitro de Duroia macrophylla Huber

Zanca, Sabrina Schumacker 26 May 2015 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-06T18:26:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Sabrina Schumacker Zanca.pdf: 5039439 bytes, checksum: 5efe72ddb5b05b30355272db0d78ee68 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-06T18:26:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Sabrina Schumacker Zanca.pdf: 5039439 bytes, checksum: 5efe72ddb5b05b30355272db0d78ee68 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-05-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Amazon species Duroia macrophylla Huber (Rubiaceae) produces triterpenes and alkaloids with activity against Mycobacterium tuberculosis and an indole alkaloid active against tumoral cell lines. Previous studies showed that different plant extracts had difference on the chemical composition. So, the present study aim to assess the seasonal production of secondary metabolites in Duroia macrophylla extracts, in two specimens for one year. Also, callus in vitro were obtained for phytochemical extraction and secondary metabolites production analysis. For the two plants phytochemical analysis, leaves were collected monthly from April/2013 to March/2014. Plant material was grounded and extracted with hexane and methanol, with ultrasound bath. The concentrated extracts were analyzed by thin layer chromatography (TLC) and 1H-nuclear magnetic resonance (1H-NMR). The NMR spectra were compared by principal component analysis (PCA). The in vitro tissue cultures were established from young leaves with 50% of asepsis after several assays and with different immersion times of the chemical reagents: 70% etanol, 2% sodium hypochlorite and biocide solution. In vitro explants were induced to callus formation process by adding the growth regulators kinetin and 2,4-D, on Murashige & Skoog media, and then extracted with hexane and methanol. The production of secondary metabolites was analysed by TLC and 1H-NMR. All hexane and methanol extracts of two Duroia macrophylla individuals showed evidence of the presence of alkaloids and terpenes during a year. The PCA analysis showed seasonal variation on the chemical composition of the hexane extracts of Duroia macrophylla’s leaves, where the production of alkaloids increased during the rainy season. Regarding the methanol extracts of the leaves, the extract from November showed a lower alkaloid content. Being November the flowering species period, we can infer that the plant is redirecting its biosynthetic route for the production of less polar indole alkaloids or other metabolites. D. macrophylla callus extracts showed terpenes but not alkaloids production, and showed no antioxidant, toxic and antibacterial activities in the performed assays. / A espécie amazônica Duroia macrophylla Huber (Rubiaceae) é produtora de triterpenos e alcaloides com atividades sobre Mycobacterium tuberculosis e um alcaloide com atividade tumoral. Entretanto, coletas realizadas em épocas diferentes mostraram diferença na composição química de diferentes indivíduos. Assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a sazonalidade da produção de metabólitos secundários em extratos de Duroia macrophylla, durante um ano, em dois espécimes. Também foram obtidos calos in vitro da espécie para extrações fitoquímicas e análise da produção dos metabólitos secundários. Para as análises fitoquímicas dos dois indivíduos foram utilizadas folhas coletadas mensalmente de abril/2013 a março/2014. O material vegetal foi submetido à extração com hexano e metanol, em banho de ultrassom. Os extratos foram concentrados e posteriormente analisados por cromatografia em camada delgada comparativa (CCDC) e ressonância magnética nuclear (RMN) de 1H. Os espectros foram comparados por meio de uma análise de componentes principais. As culturas de tecidos in vitro foram estabelecidas com 50% de assepsia, após vários testes, a partir de explantes provindos de folhas jovens e com diferentes tempos de imersão dos reagentes químicos: etanol 70%, hipoclorito de sódio 2% e solução biocida. Depois de estabelecidos, os explantes in vitro foram induzidos ao processo de calogênese através da adição dos reguladores de crescimento cinetina e 2,4-D, em meio Murashige & Skoog. Os calos foram posteriormente extraídos com hexano e metanol e a produção dos metabólitos secundários foi avaliada por análise em CCDC e RMN de 1H. Os extratos hexânicos e extratos metanólicos obtidos dos dois indivíduos de Duroia macrophylla apresentaram indícios da presença de alcaloides e terpenos em todos os meses, durante um ano. A análise de componentes principais demonstrou que há uma variação sazonal na composição química dos extratos hexânicos de folhas de Duroia macrophylla, onde o teor de alcaloides indólicos foi maior na época mais chuvosa. Nos extratos metanólicos das folhas, o mês de novembro apresentou teores significativamente menores de alcaloides indólicos em relação aos outros meses, para os dois indivíduos estudados. Sendo o mês de novembro a época de floração da espécie, pode-se inferir que a planta está redirecionando a sua rota biossintética para a produção de alcaloides indólicos menos polares e também para a produção de outros metabólitos. Os extratos dos calos de D. macrophylla apresentaram terpenos, mas não alcaloides, e não apresentaram atividades antioxidante, tóxica e antibacteriana nos ensaios realizados.
2

Estresse de metais na produtividade de compostos oriundos do metabolismo secund?rio de martianthus leucocephalus (mart. Ex benth.) J.f.b. Pastore

Jesus, Daniel da Silva de 29 April 2016 (has links)
Submitted by Jadson Francisco de Jesus SILVA (jadson@uefs.br) on 2017-02-15T01:08:04Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o DANIEL DA SILVA DE JESUS - PDF.pdf: 3083183 bytes, checksum: bd6b14e2cc2a38ab54b674866d480292 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T01:08:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o DANIEL DA SILVA DE JESUS - PDF.pdf: 3083183 bytes, checksum: bd6b14e2cc2a38ab54b674866d480292 (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Lamiaceae species have been widely studied due to their antioxidant, antimicrobial and antiviral properties. There is scientific interest in developing technologies for the enhancement of production systems of medicinal plants, given that the low concentration of bioactive compounds is a major obstacle to their economic exploitation. Works with some species have shown that traces metals such as Cd, Cu and Zn, act as abiotic elicitors, directly influencing in the production of bioactive substances. Martianthus leucocephalus (Mart. Ex Benth.) J.F.B. Pastore produces rich essential oil in isobornyl formate with high antimicrobial activity. This work aimed to evaluate the effect of Cd, Cu and Zn stress, on the species through growth, minerals accumulation, essential oil content and its major components, phenolic content and antioxidant enzymes. Furthermore, the phytoremediation potential of this species was observed in the presence of the tested metals. When applied in high concentrations all metals caused sharp reduction in the M. leucocephalus growth, however, was observed that Zn stress caused an increase in the content of volatile compounds. Plant exposure of to milder metals concentrations caused less growth reduction and nutritional unbalance M. leucocephalus. In this case, Cd stress stimulate higher production of volatile compounds. No metal treatment alters the essential oils quality. Cd, Cu and Zn was accumulated in higher concentration in the roots, demonstrating the potential of this species to phytostabilization in contaminated environments. The Cd stress caused an increase in total phenolics concentration, while the peroxidases activity and lipid peroxidation was higher in metals stressed plants. / Esp?cies da fam?lia Lamiaceae t?m sido amplamente estudadas, devido as suas propriedades antioxidantes, antimicrobianas e antivirais. Existe interesse cientifico no desenvolvimento de tecnologias para a potencializa??o de sistemas de produ??o das plantas medicinais, tendo em vista que a baixa concentra??o dos compostos bioativos representa um dos maiores obst?culos para a sua explora??o econ?mica. Trabalhos com algumas esp?cies t?m demonstrado que os metais tra?os, como o Cd, Cu e Zn, atuam como eliciadores abi?ticos, influenciando de forma direta na produ??o de subst?ncias bioativas. Martianthus leucocephalus (Mart. ex Benth.) J.F.B. Pastore ? uma esp?cie que produz ?leo essencial rico em formiato de isobornila, com elevada atividade antimicrobiana. Neste trabalho objetivou-se avaliar o efeito do estresse por Cd, Cu e Zn, sobre a esp?cie, quantificando-se o crescimento, ac?mulo de minerais nas diversas partes da planta, teor de ?leo essencial e de seus componentes majorit?rios, teor de compostos fen?licos e de enzimas antioxidantes. Al?m disso, foi verificado o potencial fitorremediador desta esp?cie, na presen?a dos metais testados. Quando aplicados em elevadas concentra??es todos os metais provocaram forte redu??o no crescimento de M. leucocephalus, entretanto, nestas condi??es apenas o Zn provocou incremento no teor dos compostos vol?teis. A exposi??o das plantas desta esp?cie a concentra??es mais amenas dos metais provocou menor redu??o no crescimento e desbalan?o nutricional de M. leucocephalus. Neste caso, apenas o Cd estimulou maior produ??o de compostos vol?teis, mas nenhum tratamento com metal alterou a qualidade dos ?leos essenciais obtidos. As plantas acumularam Cd, Cu e Zn em maior concentra??o nas ra?zes, demonstrando o potencial da esp?cie para a fitoestabiliza??o desses metais em ambientes contaminados. O estresse por Cd provocou aumento da concentra??o de fen?licos totais, enquanto que a atividade das peroxidases e a peroxida??o lip?dica foi maior nas plantas submetidas aos tr?s metais.
3

Transferibilidade e variabilidade genética de marcadores microssatélites gênicos em Egenia klotzschiana Berg (Myrtaceae) / Transferability and genetic variability of microsatellite markers genec Eugenia klotzschiana Berg (Myrtaceae)

Siqueira, Mariana Natalice de 11 August 2014 (has links)
Submitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-02-06T20:08:28Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Natalice de Siqueira - 2014..pdf: 2279133 bytes, checksum: 6e154dbf06fec9fd7fd142269ced0028 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-02-19T14:38:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Natalice de Siqueira - 2014..pdf: 2279133 bytes, checksum: 6e154dbf06fec9fd7fd142269ced0028 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-19T14:38:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Natalice de Siqueira - 2014..pdf: 2279133 bytes, checksum: 6e154dbf06fec9fd7fd142269ced0028 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-08-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Eugenia klotzschiana Berg is a species of Myrtaceae with restricted distribution in the Cerrado. Its fruits present nutritional potential and can be used in extractive way, as raw material for production of jams, jellies and juices. In this context, it is necessary to evaluate population-genetic aspects in order to provide information to assist in targeting strategies for management and conservation. To assess the genetic variability in a population context microsatellite markers have been used in recent years. The sequences flanking the microsatellite regions of the genome are highly conserved between related species, enabling the portability of these markers, reducing thereby the costs of developing the same for each species under study. In this context, the aim of this study was to test the potential for transferability to the genome of E. klotzschiana of genic microsatellite markers developed for Eucalyptus, as well as to characterize the genetic variability in their populations. For this purpose, DNA was extracted from leaf tissue of E. klotzschiana individuals and used to test the cross 120 pairs of amplification primers. Samples from seven locations were used to characterize the population genetic variability. The amplification products were analyzed on agarose and polyacrylamide capillary electrophoresis gel in different stages. Of total primers tested, 67 (55.83%) did not amplify, 42 (35%) had many nonspecific amplification products and 11 (9.2%) were successfully transferred. Of the 11 transferred eight showed polymorphism. For the eight polymorphic markers, the probability of identity was high (2.02 x10-3) and the power of paternity exclusion was moderated (0.74). In this population the average value of expected heterozygosity (He) was 0.28 and observed heterozygosity (Ho) was 0.44, as in subpopulations of He mean values ranged from 0.18 to 0.27 and the mean values Ho ranged from 0.36 to 0.53, respectively. No significant for the fixation index (f) were observed in the populations values indicating allele frequencies below the expected Hardy-Weinberg proportions.The extent of genetic divergence among subpopulations showed relatively high genetic differentiation, with a value of θ equal to 0.20, and peerto- peer values ranging between 0.00 and 0.34. The strategy of transferability of microsatellite markers was efficient to generate a panel of polymorphic microsatellite markers and learn a little of the genetic variability of the species. It was possible to verify that there is a low genetic variability within subpopulations for biomarkers. However, this work is a starting point for future studies to better understand the reproductive biology of the species Eugenia klotzschiana. / Eugenia klotzschiana Bergé uma espécie da família Myrtaceae com distribuição restrita no Cerrado. Seus frutos apresentam potencial alimentício e podem ser utilizados de forma extrativista,como matéria-primapara produção de doces, geleias e sucos. Neste contexto, torna-se necessário a avaliação de aspectos genético-populacionais a fim de disponibilizar informações que auxiliem no direcionamento de estratégias de manejo e conservação. Marcadores microssatélites têm sido utilizados nos últimos anospara avaliar a variabilidade genética em um contexto populacional. As sequências que flanqueiam as regiões microssatélites no genoma encontram-se altamente conservadas entre espécies relacionadas, o que possibilita a transferibilidade destes marcadores, reduzindo, desta forma, os custos de desenvolvimento dos mesmos para cada uma das espécies que se pretende estudar. Nesse contexto, o objetivo do presente estudo foi testar o potencial de transferibilidade para o genoma de Eugenia klotzschiana, de marcadores microssatélites gênicos desenvolvidos para Eucalyptus, assim como caracterizar a variabilidade genética existente em suas populações. Para tanto, o DNA foi extraído a partir de tecido foliar de indivíduos de E. klotzschianae utilizado para testar a amplificação cruzada de 120 pares de primers. Amostras oriundas de sete localidades foram utilizadas para a caracterização da variabilidade genética populacional. Os produtos de amplificação foram analisados em gel de agarose, poliacrilamida e emeletroforese capilar, em diferentes etapas. Do total deprimers testados, 67 (55,83%) não amplificaram, 42 (35%) apresentaram muitos produtos de amplificação inespecíficos e 11 (9,2%) foram considerados transferidos com sucesso. Dos 11 transferidos, oito apresentaram polimorfismo. Para os oito marcadores polimórficos, a probabilidade de identidade foi alta (2,02x10-3) e o poder de exclusão de paternidade foi moderado (0,74). Na população, o valor médio da heterozigosidade esperada (He) foi de 0,28 e a heterozigosidade observada (Ho) foi de 0,44, já nas subpopulações os valores médios de He variaram de 0,18 a 0,27 e os valores médios de Ho variaram de 0,36 a 0,53.Não foram observados valores significativos para o índice de fixação (f) nas subpopulações, indicando que as frequências alélicas seguem as proporções esperadas pelo equilíbrio de Hardy-Weinberg. A medida de divergência genéticaentre as subpopulações apresentou diferenciação genética relativamente alta,com valor de θigual a0,20, e com valores par-a-par variando entre 0,00 e 0,34. A estratégia de transferibilidade de marcadores microssatélites foi eficiente para gerar um painel de marcadores microssatélites polimórficos e conhecer um pouco da variabilidade genética da espécie. Foi possível verificar que existe uma baixa variabilidade genética dentro das subpopulações para os marcadores avaliados. Todavia, esse trabalho é um ponto de partida para futuros estudos que permitam conhecer melhor a biologia reprodutiva da espécie Eugenia klotzschiana.
4

Avaliação de testadores para capacidade de combinação em linhagens endogâmicas de milho (zea mays l.) / Evaluation of testes for combining ability in maize (Zea mays L.) imbreed lines

Pimentel, Alexandre Lopes 30 August 2001 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-18T13:55:45Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexandre Lopes Pimentel - 2001.pdf: 2600476 bytes, checksum: 34c037bb591d8dbf3b4ea3bf4da41be6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-18T13:56:01Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexandre Lopes Pimentel - 2001.pdf: 2600476 bytes, checksum: 34c037bb591d8dbf3b4ea3bf4da41be6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-18T13:56:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexandre Lopes Pimentel - 2001.pdf: 2600476 bytes, checksum: 34c037bb591d8dbf3b4ea3bf4da41be6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2001-08-30 / The main objective of this work is to compare different testes to evaluate for combining ability a group of unselected lines. Twenty eight lines from the CMS 04C population and six testers were used. The testers were the BR105 population, three imbreed lines from the BR105, one single cross proceeding from crossing of two of the used lines as testers and the EMGOPA 501 population. Because of the limited amounts of seeds, the topcrosses of the 20 from the 28 lines were evaluated in two places. The incomplete block design with two common treatments and three replicates were used for the topcrosses evaluation. The trials were installed in 2000/01 season, in the experimental stations of the Planagri company, in Goianésia-Goiás, and at the Escola de Agronomia of Universidade Federal de Goiás, in Goiânia-Goiás.The diallel analysis followed the model of Griffing (1956), adapted by Geraldi & Miranda Filho (1988). The correlations of Spearman, percentage of coincidence based in selection intensity and the variances between topcrosses were used, to compare the testers. It wasn’t observed consistency of the lines rank among the testers and not even for each tester between the two places. The results were different for each place. In Goianésia, the BR105 population, that got greater estimative of General Combining Ability, was the most convenient tester to discriminate the lines. However, in Goiânia, the EMGOPA 501 population, that got the lowest estimative of General Combining Ability, was the most convenient tester to evaluate the lines. In the combined analysis of the two places, the EMGOPA was only able to discriminate the lines. Some lines were superior in hybrid combining and some crossings will have to be evaluated in other environments to confirm its good performance. / Esse trabalho teve como objetivo principal comparar diferentes testadores para avaliar um grupo de linhagens não selecionadas. Foram utilizadas 28 linhagens provenientes da população CMS04C e seis testadores. Os testadores utilizados foram a população BR105, três linhagens endogâmicas provenientes da população BR105, um híbrido simples obtido pelo cruzamento de duas das linhagens usadas como testadores e a população EMGOPA 501. Devido às quantidades de sementes obtidas, somente os “topcrosses” de 20 das 28 linhagens puderam ser avaliados em dois locai. Foi utilizado o delineamento de blocos incompletos com dois tratamentos comuns e três repetições para as avaliações dos “topcrosses”. Os ensaios foram instalados na safra 2000/01, nas estações experimentais da empresa Planagri S.A., em Goianésia-GO, e da Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás, em Goiânia-GO. A análise dialélica seguiu o modelo de Griffing (1956), adaptado por Geraldi & Miranda Filho (1988). Foram utilizadas as correlações de Spearman, porcentagem de coincidência em função da intensidade de seleção e as variâncias entre “topcrosses”, para comparar os testadores. Em geral, não houve consistência das classificações das linhagens entre os testadores e nem mesmo para cada testador entre os dois locais. Os resultados obtidos foram diferentes para os dois locais. Em Goianésia, a população BR105, que obteve a maior estimativa de CGC, foi o testador mais adequado para discriminar as linhagens. Já em Goiânia, foi a população EMGOPA 501, que obteve a menor estimativa de CGC, o testador mais indicado para avalia-las. Na análise conjunta dos dois locais, somente a população EMGOPA 501 foi capaz de discriminar as linhagens. Algumas linhagens que se destacaram em combinações híbridas e alguns cruzamentos deverão ser avaliados em outros ambientes para confirmar o seu bom desempenho.
5

Caracterização fenotípica de acessos crioulos de Phaseolus vulgaris L. do tipo carioca baseada em análise multivariada / Phenotypic characterization creole accessions of Phaseolus vulgaris L. commercialtype cariocabased on multivariate analysis

Moçambique, Pedro Antônio 31 August 2010 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-05T17:35:36Z No. of bitstreams: 2 Moçambique, Pedro Antonio - 2010.pdf: 1847856 bytes, checksum: 913aad73e5dbc897fff5c2698ba75f38 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-05T17:35:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Moçambique, Pedro Antonio - 2010.pdf: 1847856 bytes, checksum: 913aad73e5dbc897fff5c2698ba75f38 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2010-08-31 / Common beans (Phaseolus vulgaris L.) are widely cropped in Brazil, the largest world consumer. P. Vulgaris species is an important source of proteins in the human diet in developing countries in tropical and sub tropical regions, especially in the Americas and West Africa. To know the genetic diversity among commercial and Creole cultivars is very useful to breeders because it allows an adequate organization of the genetic resources and a better exploitation of the available genetic diversity. The objective of this work was to identify the genetic diversity among and into Carioca type common bean accesses stored in the Active Germplasm Bank at Embrapa Arroz e Feijão. The experimental design was a completely randomized bloc with three replicates and carried out at the same institution in the municipality of Santo Antônio de Goiás with the following geographical coordinates: 16.30´S; 49.17´W at 814 m altitude. The evaluation was performed based on fifteen morphoagronomic qualitative descriptors and fifteen quantitative descriptors as well. Nine out of fifteen descriptors were uniform in all accesses. The quantitative descriptors were analyzed using canonical variate analysis; the agglomerative clustering method of Ward, and the univariate variance analysis associated with the Tukey test to evaluate the effect of clustering on the variables and to compare the means of the groups among them. Through the canonical variate analysis it was possible to discard three variables with little contribution to the total phonotypical variability among the accesses. Taking in account the twelve variables left, it was necessary to consider the first five canonical variables to explain 68% of the total variance. Even though the dispersion plot of the accesses related to the two first canonical variables (57%) evidenced phonotypical variability in the accesses studied. Variables flowering days, number of locules per pods and pod beak length were considered the most discriminatory. Accesses CF870015 and CF 830128 were identified as the most diverging between themselves. Through cluster analysis, using the fifteen quantitative descriptors, six similar groups were established. Observing the average of the phenotypic characteristics of each group and the dispersion of the accessions, it was observed concordance between the canonical variate analysis and clustering. Based on the analysis of variance of the quantitative descriptors, the variables leaf width, number of pods per plant, pod beak length and number of locules per pods indicate non significant difference, while the other variables presented highly significant differences at the 5% level. / O feijão (Phaseolus vulgaris L.) é uma cultura amplamente difundida no Brasil, que é o maior produtor e consumidor mundial. A espécie P.vulgaris representa uma importante fonte protéica na dieta humana dos países em desenvolvimento das regiões tropicais e subtropicais, particularmente nas Américas e no leste e sul da África. O conhecimento da diversidade genética entre as cultivares comerciais e crioulas é útil aos melhoristas, por permitir melhor organização dos recursos genéticos e maior aproveitamento da diversidade genética disponível. O objetivo deste trabalho foi identificar a existência de diversidade entre e dentro dos acessos de feijão comum de tipo grão Carioca armazenados no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com três repetições, e foi realizado na área experimental da Embrapa Arroz e Feijão, localizada no município de Santo António de Goiás, com coordenadas geográficas 16,30´S, 49,17´W e 814 m. Os acessos foram avaliados com base em quinze descritores morfoagronômicos qualitativos e quinze quantitativos. Em nove, dos quinze descritores qualitativos foram uniformes em todos os acessos. Os descritores quantitativos foram analisados utilizando-se a análise de variáveis canônicas; o método de agrupamento aglomerativo de Ward; e a análise de variância univariada, associada ao teste de Tukey, para avaliar os efeitos dos grupos sobre as variáveis e comparar as médias dos grupos entre si. Pela análise de variáveis canônicas, foi possível descartar três variáveis que pouco contribuíram para a variabilidade fenotípica total entre os acessos. Considerando-se as doze variáveis restantes, foram necessários as três primeiras variáveis canônicas para explicar 68% da variância total. Mesmo assim, o gráfico de dispersão dos acessos em relação as duas primeiras variáveis canônicas (57%) evidenciou variabilidade fenotípica existente nos acessos. As variáveis dias de floração, número de lóculos por vagem e comprimento do dente apical, foram consideradas como os mais discriminantes. Os acessos CF870015 e CF830128 foram identificados como os mais divergentes entre si. Pela análise de agrupamento, utilizando-se os quinze descritores quantitativos, foram estabelecidos seis grupos de similaridade. Observando-se as médias das características fenotípicas de cada grupo, e a dispersão dos acessos, verificou-se concordância entre as análises de variáveis canônicas e de agrupamento. Pela análise de variância dos descritores quantitativos, os variáveis largura foliar, número de vagens por planta, largura da vagem, comprimento do dente apical, e número de lóculos por vagem, indicaram diferença não significativa, enquanto que as outras variáveis apresentaram diferença altamente significativa ao nível de significância 5%.
6

Caracterização da estrutura genética de populações de Caryocar brasiliense Camb. no estado de Goiás utilizando marcadores moleculares microssatélites / Characterization genetic structure of populations of Caryocar brasiliense Camb.in the Goiás State, using molecular microssatelites markers

Chaves, Sivany Rodrigues 25 August 2005 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-05T17:48:20Z No. of bitstreams: 2 Chaves, Sivany Rodrigues - 2005.pdf: 4355157 bytes, checksum: b939ddc1c468c5979f9e561e5ea8bd22 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-05T17:48:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Chaves, Sivany Rodrigues - 2005.pdf: 4355157 bytes, checksum: b939ddc1c468c5979f9e561e5ea8bd22 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2005-08-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The species Caryocar brasiliense Camb. (pequizeiro) is a common tree fruitful in the Brazilian savannah (Cerrado) with great economic and social potential. The objective of this study goals the increase of information for an efficient breeding program for specie domestication and conservation. Eleven natural populations of “pequizeiro”, 30 individuals each, was sampled on five different regions of Goiás state. The genetics structure of these natural populations was analyzed based on variability at eight microsatellite loci in about 330 individuals. The number of alleles per locus it varied of 22 to 32 (mean = 28). The waited and observed heterozigosity varied of 0,843 to 0,920 and 0,546 to 0,758, respectively. Measures of genetic differentiation indicated significant differences between most populations (FST = 0,064 and RST = 0,439). RST values among samples were high and much higher than FST indicating a divergence between the model that consider alleles to be identical by descent, and the model of identity by state in these populations. Estimated number of migrants was high, Nm = 3,63 (mean), and the existence of private alleles indicated reduced gene flow and a consequently possible damage to the metapopulations structure. Significant correlation was not found between geographical distance and measure of genetic divergence, suggesting the intense gene flow in the past that joined the populations that are separated today. / O pequizeiro (Caryocar brasiliense Camb) é uma espécie frutífera do Cerrado brasileiro que possui grande potencial econômico e social. Este estudo visa o acúmulo de informações para um programa eficiente de domesticação da espécie e sua conservação. Onze populações naturais de pequizeiro, contendo 30 indivíduos cada, foram amostradas em cinco regiões diferentes do Estado de Goiás. A estrutura genética dessas populações foram avaliadas utilizando a variação de oito locos microssatélites, em cerca de 330 indivíduos. O número de alelos por loco variou de 22 a 32 (media de 28). As heterozigosidades esperada e observada variaram de 0,843 a 0,920 e de 0,546 a 0,758, respectivamente. Medidas da diferenciação genética indicaram diferenças significativas entre as populações (FST = 0,064 e RST = 0,439). Os valores de RST entre as amostras foram altos e muito maiores que FST indicando uma divergência entre o modelo que considera os alelos serem idênticos por descendência e o modelo de identidade por estado nestas populações. O número estimado de migrantes foi elevado, Nm = 3,63 na média. Não foi encontrada correlação significativa entre as distâncias geográficas e as medidas de diversidade genética, sugerindo que provavelmente ocorreu um intenso fluxo no passado unindo as populações hoje separadas.
7

Caracteriza??o citogen?tica e morfoagron?mica de acesso de Stylosanthes spp. (Fabaceae ? Papilionoideae) coletados no Nordeste brasileiro

Lira, Irlane Cristine de Souza Andrade 27 February 2015 (has links)
Submitted by Verena Bastos (verena@uefs.br) on 2015-08-04T00:07:37Z No. of bitstreams: 1 dissertacao.RGV.2015.1.pdf: 1835460 bytes, checksum: 8d5b6650247801f1f7f07285b2eedfe0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-04T00:07:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao.RGV.2015.1.pdf: 1835460 bytes, checksum: 8d5b6650247801f1f7f07285b2eedfe0 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Searches related to evaluation and selection of native forages can contribute to improvement in feeding cattle in the Brazilian semiarid region, highlighting the Stylosanthes gender as an important source of forage species with great potential. This study aimed to perform morphoagronomic and cytogenetics Stylosanthes accessions, to contribute to studies that promote the inclusion of this legume in animal feed, seeking to characterize and select superior genotypes, and also select important in the characterization of germplasm of the species. To characterize morphoagronomic were evaluated 19 descriptors and of these, four were immediately discarded for not having variability among accessions, with the statistical analysis performed in the remaining 15 descriptors. The data were submitted to univariate and multivariate analyzes. Analysis of variance was performed only in quantitative descriptors NRP, CHP, Lfo, Cfo, ECAA, ECAS and CP, as to the qualitative descriptors CC, AC, PC, HC, CF, AF, PF and FF, descriptive analysis was performed. For cytogenetic characterization were obtained root tips used seed access Stylosantes 17, following the method described by War and Souza (2002). Scott and Knott test was performed for the grouping of averages, the descriptors were significant at (p ? 0.01) which allowed the formation of two groups, multivariate analysis was also performed by calculating the Mahalanobis distance using the method original Tocher, there is the formation of two groups. Group 1 consisted of 42 accesses and the group 2 only through access CPAC 4955. We observed the formation of four groups where the dendrogram also be noted that only the access CPAC 4955 did not group with any other access. This access, for long leaves that too, very thick stem and lack of body hair on the sheets. The descriptors evaluated by Singh test is observed that the main contributors to the diversity of genotypes were CP (11,64%) and NRP (10,98%) followed by HC (8,62%) and FF (8, 44%). By cytogenetic analysis were observed hits with 2n = 20 and 2n = 40 chromosomes, allowing differentiation of species S. scabra of S. seabrana with interphase nucleus of semirreticulado type, symmetrical karyotype with chromosome morphology ranging from the metacentric submetac?ntrica and size Average chromosomal around 2,5 microns. Differences were observed in the average length of the chromosomes and the total length of the genome. The analysis with double staining CMA3/DAPI enabled visualization of four CMA+ blocks, two CMA + blocks in subterminal region of the short arm of a chromosome pair submetacentric, and two blocks located in the proximal region of another metacentric pair in S. scabra, and still two blocks in the subterminal region of a metacentric pair in S. seabrana access. It was also possible to visualize DAPI and CMA+ bands in access CPAC 1261 and CPAC 5205. The accessions in this study were, in general, plants with semiereto growth habit, leaves with dark green color and hairiness, stem mostly quite branched. The differential staining of chromosomes, together with other cytogenetic markers, assists in characterizing germplasm collections access Stylosanthes spp. It was observed that there is genetic variability among the accessions studied the collection of Stylosanthes Embrapa Semi-Arid. / Pesquisas relacionadas a avalia??o e sele??o de forrageiras nativas podem contribuir para melhoria na alimenta??o dos rebanhos do Semi?rido brasileiro, destacando-se o g?nero Stylosanthes como uma importante fonte de esp?cies com grande potencial forrageiro. O presente trabalho teve por objetivo realizar caracteriza??o morfoagron?mica e citogen?tica de acessos de Stylosanthes, visando contribuir com estudos que promovam a inser??o desta leguminosa na alimenta??o animal, buscando caracterizar e selecionar gen?tipos superiores, e tamb?m selecionar descritores de import?ncia na caracteriza??o de germoplasma da esp?cie. Para caracteriza??o morfoagron?mica, foram avaliados 19 descritores e destes, quatro foram descartados imediatamente por n?o apresentarem variabilidade entre os acessos, sendo a an?lise estat?stica realizada nos 15 descritores restantes.Os dados foram submetidos ? an?lisesunivariadas e multivariadas. Foi realizada a an?lise de vari?ncia apenas nos descritores quantitativos NRP, CHP, Lfo, Cfo, ECAA, ECAS e CP, j? para os descritores qualitativos CC, AC, PC, HC, CF, AF, PF e FF, foi realizada analise descritiva. Para a caracteriza??o citogen?tica foram utilizadas pontas de ra?zes obtidas de sementes de 17 acessos de Stylosanthes, seguindo a metodologia descrita por Guerra e Souza (2002). O teste de Scott e Knott foi realizado para o agrupamento de m?dias, os descritores foram significativos a (p ? 0,01) o que possibilitou a forma??o de dois grupos, tamb?m foi realizada analise multivariadas pelo c?lculo da dist?ncia de Mahalanobis,utilizando o m?todo de Tocheroriginal,observa-se a forma??o de dois grupos.O grupo 1foi formado por 42 acessos e o grupo 2 apenas pelo acesso CPAC 4955. Observou-se a forma??o de quatro grupos onde no dendogramaobservar-se tamb?m que apenas o acesso CPAC 4955n?o agrupou com nenhum outro acesso.Este acesso apresentou folhas mais compridas que os demais, caule muito espesso e falta de pilosidade nas folhas. Dos descritores avaliados pelo teste de Singh observa-se que os que mais contribu?ram para a diversidade dos gen?tipos foram CP (11,64%) e NRP (10,98%) seguidos por HC (8,62%) e FF (8,44%). Atrav?s da an?lise citogen?tica observaram-se acessos com 2n=20 e 2n=40 cromossomos, permitindo a diferencia??o das esp?cies S. scabra da S. seabrana, com n?cleo interf?sico do tipo semirreticulado, cari?tipo sim?trico com morfologia cromoss?mica variando de metac?ntrica a submetac?ntrica e tamanho cromoss?mico m?dio em torno de 2,5 ?m.Foram observadas diferen?as no comprimento m?dio dos cromossomos e no comprimento total do genoma. A an?lise com dupla colora??o CMA3/DAPI permitiu a visualiza??o de quatro blocos CMA+, sendo dois blocos CMA+ localizados na regi?o subterminal do bra?o curto de um par cromoss?mico submetac?ntrico, e dois blocos localizados na regi?o proximal de outro par metac?ntrico em S. scabra, e ainda dois blocos na regi?o subterminal de um par metac?ntrico nos acessos de S. seabrana.Tamb?m foi poss?vel a visualiza??o de bandas DAPI+ e CMA- nos acessos CPAC 1261 e CPAC 5205.Os acessos avaliados neste estudo apresentaram,em geral,plantas com h?bito de crescimento semiereto, folhas com colora??o verde escura e com pilosidade, caule em sua maioria bastante ramificado. A colora??o diferencial de cromossomos, associados a outros marcadores citogen?ticos, auxilia na caracteriza??o de acessos de cole??es de germoplasma de Stylosanthes spp.Observou-se que h? variabilidade gen?tica entre os acessos estudados da cole??o de Stylosanthes da Embrapa Semi?rido.
8

Identifica??o de plantas utilizadas como medicinais e levantamento flor?stico e fitossociol?gico e em ?reas de fundo de pasto no munic?pio de Cura?? - Bahia

Jesus, Camila Gonzaga de 25 April 2013 (has links)
Submitted by Verena Bastos (verena@uefs.br) on 2015-08-06T14:15:43Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o Camila Gonzaga de Jesus.pdf: 1491997 bytes, checksum: 7a4237d1223b1f93947c5ada8a9defc1 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-06T14:15:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o Camila Gonzaga de Jesus.pdf: 1491997 bytes, checksum: 7a4237d1223b1f93947c5ada8a9defc1 (MD5) Previous issue date: 2013-04-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / This study aimed to characterize the structure of plant communities, the impact caused by human action in these species and identify areas in which the fund pasture medicinal plants used by the people, through forms previously prepared and subsequent collection of plants cited in two Communities Fundo de Pasto in Village of S?o Bento and Patamut?, Cura??-Bahia. To phytosociological analysis method was used to point quadrant in 10 transects of 200 m with points spaced 20 to 20 m. We sampled all individuals shrubs and trees that had greater than 1.30 m height and diameter at ground height greater than or equal to 0.3 cm. The analysis was performed using the program Fitpoac1. We carried out a comparative analysis of floristic similarity and evaluation of the diameter distribution was calculated where the quotient ?q? to verify that the study area is balanced. The interviews were conducted in a semi-structured, for location and collection of plants was performed non-probability sampling intentional, which can be used to describe phenomena, data and generate hypotheses, using the technique ?snowball?. The analysis revealed a set phytosociological floristic represented by 11 families, 24 genera and 28 species. In S?o BentoSt. Benedict (SB) were recorded 07 families and 16 species. In Patamut? (PT) enrolled 10 families and 22 species. The Shannon diversity index was 1.62 and 2.1 in SB PT. The most abundant species common to both fragments of study is Poincianella laxiflora (Tul.) L. P. Queiroz. Cluster analysis showed that the factor of geographical proximity and human action defined the separation of the three groups formed the similarity dendrogram. For the identification of the species as medicinal interviewed 25 people, 14 men and 11 women. The Community of S?o Bento were interviewed 12 people, aged between 30 and 87 years, with 50% of respondents had more than 60 years, the Community of Patamut? 13 people were interviewed between 35 and 96 years. Informants identified uses for 38 species and 25 SB in PT, belonging to 15 plant families. The maximum use values obtained were 1.33 and 0.77 Myracrodruon. urundeuva Allem?o (aroeira) in SB, Libidibia ferrea (Mart. Ex Tul.) LP Queiroz (pau-ferro) in PT. Both species have medicinal use for inflammatory conditions. The use value average 0.38 and 0.23 in Sb and PT respectively. Regarding the frequency of citation of the use of the species in the SB Aroeira was the species most frequently mentioned by informants. In PT the ironwood was the most cited (13%). Regarding the various uses mentioned by informants communities study, treatments of conditions such as abdominal pain, flu, inflammation, kidney pain and healing were the most frequent. The study area has not provided a reason absolutely balanced, having mortality rates and growth variables, confirming the result of the strong anthropic generated by communities of bottom grazing. The results demonstrate that traditional knowledge of communities of bottom grazing areas studied might contribute significantly to the bioprospecting research to be conducted with plants of the caatinga serving as the basis for future pharmacological research and that species of lesser importance value, (Spondias tuberosa Arruda, Anadenanthera colubrina (Vell.) Brenan, Ziziphus joazeiro Mart., Myracrodruon urundeuva, Schinopsis brasiliensis Engl., Commiphora leptophloeos (Mart.) J.B.Gillett, Pseudobombax simplicifolium A. Robyns, Aspidosperma pyrifolium Mart., Jatropha multabilis (Pohl) Baill., Melochia tomentosa L., Sideroxylon obtusifolium (Roem. & Schult) e Mimosa tenuiflora (Willd.) Poir.) should be used for seedling production and recovery of bottom grazing areas studied. / O presente trabalho objetivou caracterizar a estrutura das comunidades vegetais, avaliando o impacto causado pela a??o antr?pica sob essas esp?cies identificando em ?reas de fundo de pasto quais as plantas medicinais utilizadas pela popula??o em duas Comunidades de Fundo de Pasto no Povoado de S?o Bento e Patamut?, Cura??-Bahia. Para an?lise fitossociol?gica foi utilizado o m?todo do ponto quadrante em 10 transectos de 200 m com pontos espa?ados de 20 em 20 m. Foram amostrados todos os indiv?duos arbustivos e arb?reos que apresentaram altura superior a 1,30m e di?metro ? altura do solo maior ou igual a 0,3cm. A an?lise foi realizada atrav?s do programa Fitopac1. Realizou-se a an?lise comparativa por similaridade flor?stica e a avalia??o da distribui??o diam?trica onde se calculou o quociente ?q?, para verificar se a ?rea de estudo estava balanceada. As entrevistas foram realizadas de forma semiestruturadas. Para localiza??o e coleta das plantas foi realizada a amostragem intencional n?o-probabil?stica, com uso da t?cnica ?bola de neve?. A an?lise fitossociol?gica revelou um conjunto flor?stico representado por 11 fam?lias, 24 g?neros e 28 esp?cies. Em S?o Bento (SB) foram registradas 07 fam?lias e 16 esp?cies. Em Patamut? (PT) registrou-se 10 fam?lias e 22 esp?cies. O ?ndice de diversidade de Shannon foi de 1,62 nats/ind em SB e 2,1 nats/ind em PT. A esp?cie mais abundante comum aos dois fragmentos de estudo ? Poincianella laxiflora (Tul.) L. P. Queiroz (catingueira). A an?lise de agrupamento mostrou que o fator proximidade geogr?fica e a??o antr?pica definiu a separa??o dos tr?s grupos formados no dendrograma de similaridade. Para a identifica??o das esp?cies como medicinais foram entrevistadas 25 pessoas, sendo14 homens e 11 mulheres. Na Comunidade de S?o Bento foram entrevistadas 12 pessoas com idade entre 30 e 87 anos, sendo que 50% dos entrevistados possu?am mais de 60 anos, na Comunidade de Patamut? foram entrevistadas 13 pessoas entre 35 e 96 anos. Os informantes identificaram usos para 38 esp?cies em SB e 25 em PT, pertencentes a 15 fam?lias bot?nicas. Os valores de uso m?ximos para a Myracrodruon urundeuva Allem?o (aroeira) em SB foi 1,33 e para a Libidibia ferrea (Mart. Ex Tul.) L.P. Queiroz (pau-ferro) em PT foi de 0,77. Ambas as esp?cies possui utiliza??o medicinal para problemas inflamat?rios. O valor de uso m?dio 0,38 e 0,23 em Sb e PT respectivamente. Em rela??o ? frequ?ncia de cita??o do uso das esp?cies, em SB a aroeira foi a esp?cie mais citada pelos informantes (9%). Em PT o pau-ferro foi o mais citado (13%). Em rela??o aos diversos usos citados pelos informantes das comunidades de estudo, os tratamentos de afec??es como dor de barriga, gripe, inflama??o, dor nos rins e cicatrizante foram os mais frequentes. A ?rea estudada n?o apresentou uma raz?o absolutamente balanceada, possuindo taxas de mortalidade e crescimento vari?veis, comprovando a forte conseq??ncia da a??o antr?pica gerada pelas comunidades de fundo de pasto. Os resultados demonstraram que o conhecimento tradicional das comunidades de ?reas de fundo de pasto estudadas pode vir a contribuir com as pesquisas de bioprospec??o a serem realizadas com plantas da caatinga servindo de base para futuras pesquisas farmacol?gicas e que as esp?cies de menor valor de import?ncia (Spondias tuberosa Arruda, Anadenanthera colubrina (Vell.) Brenan, Ziziphus joazeiro Mart., Myracrodruon urundeuva, Schinopsis brasiliensis Engl., Commiphora leptophloeos (Mart.) J.B.Gillett, Pseudobombax simplicifolium A. Robyns, Aspidosperma pyrifolium Mart., Jatropha multabilis (Pohl) Baill., Melochia tomentosa L., Sideroxylon obtusifolium (Roem. & Schult) e Mimosa tenuiflora (Willd.) Poir.) devem ser utilizadas para produ??o de mudas e recupera??o das ?reas de fundo de pasto estudadas.
9

Busca e classificação sistemática das proteínas oxigenases com ferro não hêmico em plantas

SOUSA, Kellen Rayanne Matos de 06 March 2015 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2015-06-02T16:56:36Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_BuscaClassificacaoSistematica.pdf: 3387140 bytes, checksum: f1b3bbc5ae2a1bc53b8ea2de4c8d5bb0 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2015-06-18T13:45:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_BuscaClassificacaoSistematica.pdf: 3387140 bytes, checksum: f1b3bbc5ae2a1bc53b8ea2de4c8d5bb0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-18T13:45:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_BuscaClassificacaoSistematica.pdf: 3387140 bytes, checksum: f1b3bbc5ae2a1bc53b8ea2de4c8d5bb0 (MD5) Previous issue date: 2015 / UFPA - Universidade Federal do Pará / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As proteínas oxigenases com ferro não hêmico compartilham um domínio conservado composto por oito histidinas, podem ser encontradas em organismos eucariotos e procariotos, e participam de importantes vias de biossíntese lipídica. Para compreender a relação evolutiva existente entre essas proteínas, foram realizadas análises comparativa e filogenética em procariotos e eucariotos que permitiram uma classificação dessa família, até então inexistente. A busca de seqüências resultou, após a curadoria, em uma coleção de 448 proteínas, pertencentes a 58 organismos previamente selecionados dentro dos principais taxa. O alinhamento múltiplo de seqüências gerado com a ferramenta MAFFT (BLOSUM 62; L-INS-i) mostrou a presença do domínio de histidinas com espaçamento conservado entre os motivos. A classificação das proteínas feita com o software CLANS gerou 28 grupos a partir da similaridade entre pares de seqüências. Dentre esses, 2 contêm seqüências que não tiveram similaridade com proteínas já caracterizadas e 48 seqüências não foram atribuídas a quaisquer dos grupos formados. As seqüências de plantas, representadas por 119 seqüências da coleção, foram distribuídas em 7 grupos correspondentes às funções C4 metilesterol monoxigenase, C5 esterol desaturase, ácido graxo hidroxilase, esfingolipídeo C4 monooxigenase, aldeído decarbonilase, β-caroteno hidroxilase e Acil-ACP desaturase. A análise filogenética, utilizando o método de máxima verossimilhança com a ferramenta PhyML, mostrou a formação de grupos bem definidos e que foram similares aos gerados por CLANS. Esses resultados começam a preencher a lacuna existente até o momento acerca da relação evolutiva e da classificação das oxigenases com ferro não hêmico. Além disso, sugerem que dentro dessa família ainda há proteínas com funções desconhecidas, reforçando a necessidade de realizar mais estudos de caracterização funcional das mesmas. / Nonheme iron oxygenase proteins shares a conserved domain consisting of eight histidines, and they can be found in eukaryotes and prokaryotes organisms and participate in important pathways of lipid biosynthesis. To understand the evolutionary relationship among these proteins, we performed comparative and phylogenetic analyzes in prokaryotes and eukaryotes that allowed a classification of this family, nonexistent until now. The search of sequences resulted in a collection of 448 proteins, belonging to 58 organisms previously selected. The multiple alignment made with MAFFT (BLOSUM 62; L-INS-i) showed the presence of three histidine-rich motifs, with conserved spacing among them. The classification made with CLANS software has generated 28 clusters through of similarity among sequences. Two clusters contain sequences that had no similarity to proteins already characterized, and 48 sequences were not assigned to any of the 28 clusters. In the collection, 119 sequences are derived from plants, distributed in 7 clusters corresponding to C4 methysterol monooxygenase, C5 sterol desaturase, fatty acid hydroxylase, sphingolipid C4 monooxygenase, aldehyde decarbonylase, β-carotene hydroxylase and Acyl-ACP desaturase functions. Phylogenetic analysis using maximum likelihood method with PhyML tool showed the formation of well-defined groups that were similar to generated by CLANS. These results start to fill a gap existing so far about the evolutionary relationship and classification of nonheme iron oxygenases. Also, suggest that within this family there are still proteins with unknown functions, reinforcing the need for more studies of functional characterization.
10

Cruzamentos dialélicos visando a escolha de genitores no melhoramento de feijão preto / Diallel aimed at improving parental choice in black bean

Moura, Lisandra Magna 26 July 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 581223 bytes, checksum: 48f92fffa70cb8c813c4cf6aea635f38 (MD5) Previous issue date: 2013-07-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This objective of this work was to evaluate the potential of 12 lines of beans in order to obtain segregating populations with potential for extracting lines with high grain yield, resistance to major pathogens that attack the culture, erect plant architecture and black grains accepted commercially. Thus, these 12 lines were placed into two groups (G1 and G2 ) to compose a partial diallel in a 5 x7 design. Group 1 was composed of black grain and erect plant architecture while the second group was composed of Carioca bean lines and resistant to the main fungal diseases that occur in beans crop. The thirtyfive F1 hybrids and 12 parents were assessed in the 2012 winter harvest. A randomized block design with three replications and three 1-metter row plot were used. Severity of angular leaf spot (in the field), the plant architecture and grain yield were all evaluated. Data were analyzed according to the partial diallel model proposed by Geraldi and Miranda Filho (1988) using parents and F1's. Regarding severity of angular leaf spot, significant effects were observed in both overall combining ability of groups 1 (OCA1) and 2 (OCA2) and specific combining ability (SCA) of hybrids between the groups. Three lines of Group 1 and three lines of Group 2 stood out for frequency of angular spot resistant alleles: Xamego , BRS Valente and TB 94-01 and BRS Estilo, VC 20 and CNFC 10720, respectively. Considering the architecture of plants, only CGC of Group 1 had a significant effect, especially TB 94-01, L 20 and BRS Valente. As for grain yield, significant effects of overall combining ability of group 2 (OCA2) and specific combining ability (SCA) were found. Lines BRS Estilo and CNFC 10720 stood out for frequency of favorable alleles. Additive effects were predominant in the genetic control of three characters. The crossings BRS Valente / BRS Estilo and BRS Valente / CNFC 10720 stand out in obtaining potential populations for extracting of promising lines for resistance to angular leaf spot, erect plant architecture and grain yield. / Este trabalho teve como objetivo avaliar o potencial de 12 linhagens de feijão visando a obtenção de populações segregantes com potencial para a extração de linhagens que associem alta produtividade de grãos, resistência aos principais patógenos que assolam a cultura, arquitetura ereta de planta e grãos tipo preto aceitos comercialmente. Para tal, essas 12 linhagens foram dispostas em dois grupos (G1 e G2) para compor um dialelo parcial num esquema (5 x 7). O grupo 1 foi composto por linhagens de grãos preto e arquitetura ereta de planta enquanto o grupo 2 de linhagens de grãos carioca e resistentes às principais doenças fúngicas que ocorrem na cultura do feijoeiro. Os 35 híbridos F1 s e os 12 genitores foram avaliados na safra do inverno de 2012. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados com três repetições e parcelas de três linhas de um metro. Foram avaliadas a severidade de mancha-angular (no campo), a arquitetura de plantas e a produtividade de grãos. Os dados foram analisados de acordo com o modelo de dialelo parcial proposto por Geraldi e Miranda Filho (1988) utilizando pais e F1 s. Para a severidade de mancha-angular foram observados efeitos significativos tanto para a capacidade geral de combinação dos grupos 1 (CGC1) e 2 (CGC2) quanto para a capacidade específica de combinação (CEC) dos híbridos entre os grupos. Em relação à freqüência de alelos de resistência à mancha-angular destacaram-se três linhagens do grupo 1 (Xamego, BRS Valente e TB 94-01) e três do grupo 2 (BRS Estilo, VC 20 e CNFC 10720). Considerando a arquitetura de plantas, apenas a CGC do grupo 1 apresentou efeito significativo, com destaque para as linhagens TB 94-01, L 20 e BRS Valente. Já para produtividade de grãos, foram observados efeitos significativos da capacidade geral de combinação do grupo 2 (CGC2) e específica de combinação (CEC). Neste grupo destacaram-se as linhagens BRS Estilo e CNFC 10720 quanto à freqüência de alelos favoráveis. Houve predominância de efeitos aditivos no controle genético dos três caracteres. Os cruzamentos BRS Valente / BRS Estilo e BRS Valente / CNFC 10720 se destacam na obtenção de potenciais populações para a extração de linhagens promissoras quanto à resistência à mancha-angular, arquitetura ereta de plantas e produtividade de grãos.

Page generated in 0.4032 seconds