Submitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-03-06T18:50:40Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Natácia Evangelista de Lima - 2012.pdf: 3869033 bytes, checksum: 96f52253e73097c6dac8f15c5acf311c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-03-06T19:07:20Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Natácia Evangelista de Lima - 2012.pdf: 3869033 bytes, checksum: 96f52253e73097c6dac8f15c5acf311c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-06T19:07:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Natácia Evangelista de Lima - 2012.pdf: 3869033 bytes, checksum: 96f52253e73097c6dac8f15c5acf311c (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-04-23 / Mauritia flexuosa, popularly known as buriti, is a large palm that occurs especially in association with wetlands (veredas) in South America. It is distinguished because of its economic importance for local populations from Central Brazil, and as source of food, breeding site and haven for the terrestrial and aquatic fauna. The effect of historical demographic events and climatic fluctuations in the current distribution of buriti can provide clues about the responses of this species to anthropic pressures and to future climatic changes. For this purpose we studied the phylogeography of M. flexuosa. The results were based on the differences of sequences from the following chloroplast intergenic regions: psbA-trnH, trnC-ycf6 and trnS-trnG. We sampled 170 individuals from 14 localities throughout Central Brazil, including populations in the Amazon, Araguaia/Tocantins, Paraná and São Francisco Basins. Since the distribution of M. flexuosa is restricted to wetlands, which are surrounded by large areas of dry lands that may act as barriers to gene flow, we hypothesized that populations are highly differentiated and that River Basins act as phylogeographic breaks. The combined data from the three sequence regions generated a fragment of 1205bp, with 11 haplotypes. Nucleotide diversity was low (π = 0.005314 +/- 0.002800) and haplotipic diversity was high (h =0,791) for the combined data. The population parameter θ, and nucleotide and haplotype diversity per population, shows a pattern where populations from different geographic regions have a relative genetic uniformity, separated by steep losses on the diversity; what characterizes colonization by sectors. Differentiation among populations was significant (P< 0.001), but no sign of recent bottleneck on population size followed by expansion was found (D Tajima=-1.955 p = 0.00210; Mismatch Distribution=0.034 p=0.7467 and growth parameter g=402. 402, 95% = -334.961 ICredi, ICreds 95% = 999.91). We could group populations by location in the phylogenetic analysis (Network software), but they do not support the initial hypothesis that the major basins act as important phylogeographic breaks for the distribution of maternal lineages of M. flexuosa. The studied populations showed ancient time of coalescence. This research provided more details on the dynamics and genetic structure of the remnant of buriti populations, helping to elucidate the evolutionary history of this neotropical palm. / Mauritia flexuosa, popularmente conhecida como buriti, é uma grande palmeira que ocorre especialmente em associação com áreas alagadas (veredas) na América do Sul. Destaca-se pela importância econômica para as populações locais do Brasil Central e como fonte de alimento, local de reprodução e refúgio para fauna terrestre e aquática. O efeito de eventos históricos, demográficos e das flutuações climáticas sobre a distribuição do buriti pode gerar pistas sobre as possíveis respostas desta espécie à pressão antrópica e a mudanças climáticas. Para tanto foi estudada a filogeografia de M. flexuosa. Os resultados foram baseados no polimorfismo das seguintes regiões cloroplastidiais intergênicas: psbA-trnH, trnC-ycf6 e trnS-trnG. Foram amostrados 170 indivíduos de 14 localidades distribuídas pelo Brasil Central, incluindo populações nas Bacias: Amazônica, do Araguaia-Tocantins, do Paraná e do São Francisco. Como a distribuição de M. flexuosa é restrita a regiões alagáveis rodeadas por grandes áreas de terras secas, que podem atuar como barreiras ao fluxo gênico, hipotetiza-se que as populações de buriti de cada bacia hidrográfica sejam altamente diferenciadas, uma vez que estas bacias devem se comportar como quebras filogeográficas. Os dados combinados para as três regiões cloroplastidiais geraram um fragmento de 1205 pb com 11 haplótipos. A diversidade nucleotídica foi baixa (π = 0,005314 +/- 0,002800) e a diversidade haplotípica foi elevada (h =0, 791) para os dados combinados. O padrão encontrado para o parâmetro demográfico θ e para as diversidades nucleotídica e haplotípica por população mostra regiões geográficas com uma relativa uniformidade genética, separadas por quebras abruptas nas diversidades caracterizando uma colonização por setores. A diferenciação entre populações foi significativa (P<0,001) e não há sinal de retração recente no tamanho das populações seguido por expansão (D de Tajima= -1,955 p=0,00210; Distribuição de mismatch=0,034 p=0,7467 e parâmetro de crescimento g = 402, 402, ICredi 95% = -334,961, ICreds 95%= 999,91). Foram encontrados agrupamentos distintos por localidade na análise filogenética (programa )etwork), porém eles não suportam a hipótese inicial de que as principais bacias hidrográficas formam quebras filogeográficas importantes para distribuição das linhagens maternas de M. flexuosa. As populações estudadas apresentaram tempos de coalescência antigos. Essa pesquisa gerou mais detalhes sobre a dinâmica e estrutura genética nos remanescentes das populações de buriti, auxiliando a entender melhor a história evolutiva para esta palmeira neotropical.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-04-23T11:22:49Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jacqueline Campos Borba de Carvalho - 2013.pdf: 2453380 bytes, checksum: 04cd0ef2d26879895e9dfc3e3f757f13 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-04-23T11:34:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jacqueline Campos Borba de Carvalho - 2013.pdf: 2453380 bytes, checksum: 04cd0ef2d26879895e9dfc3e3f757f13 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-23T11:34:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Jacqueline Campos Borba de Carvalho - 2013.pdf: 2453380 bytes, checksum: 04cd0ef2d26879895e9dfc3e3f757f13 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-03-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Rice blast caused by the fungus Magnaporthe oryzae B. Couch [anamorfo - Pyricularia oryzae Cav.] occurs in all rice growing regions of the world. The sustainable agriculture requires the introduction of biological control as one of the components in the integrated disease management. The microorganisms associated to plants are capable of producing secondary metabolites such as alkaloids which may have a role in biological control. The objective of the present study consists, isolation and identification of secondary metabolites of the micorrhizal fungus Rhizoctonia sp. obtained from Epidendrum nocturnum and evaluate in vitro and in vivo antagonism to M. oryzae. Ten fungal isolates were used to test the antibiosis against M. oryzae. The isolate En07 of Rhizoctonia sp. exhibited a greater halo of inhibition and consequently was considered the best in vitro antagonist to M. oryzae. Crude, mycelial and lyophilized extracts of micorrhizal isolate were obtained. The analysis by CCD of these three extracts showed positive results in relation to Dragendorff, indicating the presence of phenolics. The analysis of RMN 1H and masses showed the presence of aromatic hydrogens and phenolics. Five concentrations of each extract were prepared and utilized in the studies on in vitro mycelial inhibition of M. oryzae and observed 77.86% of pathogen reduction by crude extract (700 μg/mL). Two crude extract treatments (520 μg/ml and 120 μg/ml) significantly reduced the radial growth of the pathogen compared to control. The crude extract showed best results for mycelia inhibition of the pathogen, followed by lyophilized and mycelial extracts. In two trials, the crude extract at 0.52 μg.μL-1 also reduced the formation of appressoria of M. oryzae by 100%. Two greenhouse experiments were conducted on leaf blast suppression with the cultivar Primavera, using completely randomized design with three replications. In both these trials, the mycelial extract (1860 μg/ml and M.o 3x105) showed marked reduction of leaf blast severity in relation to control by 59.27% and 77.58% respectively. In the second trial, the second treatment (1040 μg/mL and M.o3x105) of crude extract reduced AUDPC by 64.63% compared to control. The results showed that the metabolites of Rhizoctonia sp. posses great potential for biological control of rice blast. / A brusone ocorre em todas as áreas produtoras de arroz do mundo, e é causada pelo fungo Magnaporthe oryzae B. Couch [anamorfo - Pyricularia oryzae Cav.]. Seu controle, realizado pelo manejo que integra resistência genética, práticas culturais e controle químico, requer a inserção de agentes biológicos, além de assegurar uma agricultura mais sustentável. Os microrganismos associados às plantas são capazes de produzir metabólitos secundários como os alcaloides que podem atuar no controle biológico. O presente trabalho objetivou isolar os metabólitos secundários do fungo micorrízico Rhizoctonia sp. obtido de Epidendrum nocturnum, e avaliar o antagonismo in vitro e in vivo com M. oryzae. Todos os ensaios foram conduzidos em delineamento inteiramente casualizado. Um ensaio de antagonismo foi avaliado, pareando-se, 10 isolados fúngicos e M. oryzae, e identificou-se que o isolado En07 foi o que apresentou o maior halo de inibição e consequentemente o melhor antagonismo in vitro sobre M. oryzae. Foram obtidos três extratos do isolado micorrízico (bruto, micelial e liofilizado) que foram analisados por quatro métodos diferentes e complementares. A análise por Cromatografia em Camada Delgada dos três extratos mostrou-se positiva frente ao reativo de Dragendorf, sugerindo a presença de compostos fenólicos. Na análise dos espectros de Ressonância Magnética Nuclear e de massas verificou-se a presença de hidrogênios aromáticos e de compostos fenólicos. Cinco concentrações de cada extrato foram preparadas e utilizadas nos ensaios de inibição micelial de M. oryzae in vitro e observou-se 77,86% de redução do patógeno pelo extrato bruto (700 μg/mL). Dois tratamentos do extrato bruto (520 μg/ml e 120 μg/ml) reduziram o crescimento radial do patógeno de forma significativa quando comparado com a testemunha. Verificou-se que o extrato bruto apresentou os melhores resultados para a inibição micelial do patógeno, seguido dos extratos liofilizado e do micélio. Em dois ensaios o extrato bruto a 0,52 μg.μL-1 também reduziu o número de apressórios formados de M. oryzae em 100%. Foram conduzidos dois ensaios de supressão de brusone foliar em arroz, in vivo, com a cultivar Primavera em três repetições. Nos dois ensaios destacou-se o extrato micelial (1860 μg/ml e M.o 3x105) que proporcionou maiores reduções da severidade de brusone nas folhas em relação ao controle com 59,27% e 64,63%, respectivamente. No segundo ensaio o tratamento 2 (1040 μg/mL e M.o3x105) do extrato bruto reduziu a AACPD em 24,93% em relação à testemunha. Os resultados mostraram que o metabólito de Rhizoctonia sp. possui grande potencial para o controle biológico da brusone.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_daiane_benemann.pdf: 778748 bytes, checksum: 5f3a1eba7b00cb2cf702e1d46bc5e43b (MD5) Previous issue date: 2008-08-18 / The objective of this work is to seek a protocol for regeneration of the melon (Cucumis melo L.) cv. Gaucho and subsequent genetic transformation of this fruit. To this end were conducted three experiments. In the first, the cotyledons were divided into 2, 3, 4 and 5 equal parts, and inoculated with MS medium containing 30 g L sucrose, 0.9 mg L-1 BAP, 0.3 mg L-1 ABA and 2.2 g L-1 CaCl2. It was observed that the number of cuts not influenced the percentage of explants regenerated. In the second experiment, using the same means of cultivation of the previous experiment, the cotyledons were submitted to different densities of flow of photons. It was found that the regenerative process was not affected by the absence or presence of light (2 and 21 μmol m-2 s-1), but when the explants remained in the dark had greater formation of callus. In the third experiment sought to establish conditions for seed germination and its effect on the regeneration under different concentrations of BAP. It was the highest rate of explants regenerated lower when the period of germination in the middle and lower the concentration of BAP in the regenerative. After obtaining the protocol for regeneration, was conducted test of sensitivity of explants the selection of antibiotic, setting up the concentration of 75 mg L-1, kanamycin as ideal to select the cells transformed. For the regeneration of the shoots explants were cultivated in MS medium containing 0.9 mg L-1 BAB, 0.3 mg L-1 ABA, 2.2 g L-1 CaCl2, 75 mg L-1 kanamycin and 250 mg L-1 cefotaxime. For the genetic transformation was used Agrobacterium tumefaciens LBA 4404, with a clone of ACC oxidase in antisense orientation, called pAP4as. However, it was not confirmed by inserting the sequence, the PCR test, the tissue analyzed. It was found that these studies were not described with Agrobacterium efficient to obtain seedlings containing the antisense gene of ACC oxidase. It was found that these studies were not described with Agrobacterium efficient to obtain seedlings containing the antisense gene of ACC oxidase. / O presente trabalho teve como objetivo desenvolver um protocolo eficiente de regeneração para o melão (Cucumis melo L.), cv. Gaúcho, visando posterior transformação genética do mesmo. Para tal fim foram realizados três experimentos. No primeiro, os cotilédones foram divididos em 2, 3, 4 e 5 partes iguais e, inoculados em meio MS contendo 30 g L-1 de sacarose, 0,9 mg L-1 BAP, 0,3 mg L-1 ABA e 2,2 g L-1 CaCl2. No segundo experimento, utilizando o mesmo meio de cultura do experimento anterior, os cotilédones foram submetidos a diferentes densidades de fluxo de fótons. No terceiro procurou-se estabelecer as condições para germinação das sementes e sua influência na regeneração cotiledonar sob diferentes concentrações de BAP. Observou-se que cotilédones seccionados em 5 partes apresentaram maior média de explantes regenerantes. Já os cotilédones que permaneceram sob intensidade luminosa de 2 μmol m-2 s-1 apresentaram maior média de explantes regenerantes e os que ficaram no escuro apresentaram maior média de explantes com calos e raiz. Observou-se também que quanto maior o período germinativo e maiores concentrações de BAP no meio regenerativo, menor é a taxa de explantes regenerantes. Após a obtenção do protocolo de regeneração, foi realizado teste de sensibilidade dos explantes ao antibiótico de seleção, determinando-se a concentração de 75 mg L-1 de canamicina como ideal para selecionar as células transformadas. Para a regeneração de brotações os explantes foram cultivados em meio MS contendo 0,9 mg L-1 BAP, 0,3 mg L-1 ABA, 2,2 g L-1 CaCl2, 75 mg L-1 canamicina e 250 mg L-1 cefotaxima. Para a transformação genética, foi utilizado Agrobacterium tumefaciens LBA 4404, com um clone da ACC oxidase em orientação antisense, denominado pAP4as. Entretanto, não foi confirmada a inserção da seqüência, pelo teste de PCR, nos tecidos analisados. Verificou-se que estes estudos descritos com Agrobacterium não foram eficientes para a obtenção de plântulas contendo o gene antisense da ACC oxidase.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:32:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_fabiana_fonseca_santos.PDF: 358501 bytes, checksum: 566ce94854cb74cc7a2d26d876462a45 (MD5) Previous issue date: 2010-08-17 / The understanding of the genetic structure of the oat species can be obtained with the use of microsatellite molecular markers which represent powerful tools in the investigation of genetic parameters. This study aimed to search the identification and characterization of microsatellite markers occurrence in oat through bioinformatics, describing the possible role of individual genes based on the genome of rice and Arabidopsis thaliana. For the development and validation of EST (Expressed Sequence Tags) primers, sequences were obtained from a public database. A total of 7632 oat contigs were obtained after eliminating the redundancy. To characterize SSR (simple sequence repeats) loci, the SSRLocator program was used. For the design of primers, the module containing the program Primer3 was used. A total of 58 primers were found, from which ten were selected for validation by polymerase chain reaction. Ten genotypes were used to assess polymorphism detection ability of primers. Polymorphism was observed in 80% of primers, whereas the rest showed monomorphic bands. The high genetic diversity revealed by microsatellite markers in this study may reflect a high genetic diversity within the germplasm of Avena sativa. / O conhecimento da estrutura genética de diversas espécies de aveia pode ser obtido com o uso de marcadores moleculares microssatélites, os quais representam poderosa ferramenta na averiguação de parâmetros genéticos. Este trabalho teve como objetivo buscar a identificação e a caracterização da ocorrência de marcadores microssatélites em aveia através da bioinformática, descrevendo a possível função de cada um dos genes, com base no genoma do arroz e da Arabidopsis thaliana. Visando o desenvolvimento e a validação de primers, foram obtidos a partir de um banco de dados público de EST (Expressed Sequence Tag) de aveia um total de 7.632 contigs que tiveram eliminada sua redundância, e para caracterização de locos SSR (Simple Sequence Repeat) foi utilizado o programa SSRLocator. Para o desenho de iniciadores foi utilizado no SSRLocator o módulo contendo o programa Primer3 sendo encontrados 58 primers, dos quais dez foram selecionados para a validação através da reação em cadeia da polimerase. Dez genótipos de aveia foram avaliados quanto ao nível de polimorfismo. Foi verificado polimorfismo em 80% dos primers, sendo que, o restante apresentou bandas monomórficas. A alta diversidade gênica revelada pelos marcadores microssatélites neste estudo possivelmente reflete uma alta diversidade genética dentro do germoplasma de Avena sativa.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_raquel_rosa_costa.pdf: 808388 bytes, checksum: 18bdb94a8d12b8f7a746b7ee2613012a (MD5) Previous issue date: 2011-06-27 / he main objective of this work was to introduce the gene bvlI with confirmed potential antifungal of lectin from Bauhinia variegata, Apple Tree (Malus domestica Borkh) cv. Gala, to establish resistance to fungus Coletotrichum gloeosporioides, causing Leaf Spot. Multiplication experiments were performed in vitro regeneration of leaf explant culture and two protocols via Agrobacterium tumefaciens transformation aimed at inserting the gene bvll. The multiplication of shoots the medium that has best results was MS supplemented with 0.1 mg L-1 ANA and 8.3 mg L-1 2iP and, for the regeneration of the best responses were obtained with using MS, supplemented with 30 g L-1 sorbitol, 0.5 mg L-1 ANA and 5 mg L-1 TDZ, reaching a rate of 94.5% of regenerations. As regards the processing protocols, which showed best results was the P1 Protocol, which through analysis of PCR were obtained 15% shoots containing the gene bv/l. However, the expression of BVLI protein was not detected by Dot Blot, indicating the need for further procedure, such as refinement of protein extraction protocol, as well as utilization other techniques of analyses, such as Real Time. / O objetivo principal do presente trabalho foi introduzir o gene bvlI com potencial antifúngíco confirmado da lectina de Bauhinia variegata, em macieira (Malus domestica Borkh), cv. Gala, para estabelecer resistência ao fungo Coletotrichum gloeosporioides, causador da Mancha Foliar. Foram realizados experimentos de multiplicação in vitro, regeneração de explantes foliares e, dois protocolos de transformação via Agrobacterium tumefaciens visando a inserção do gene bvll. Na multiplicação de brotações o meio que apresentou melhores resultados foi o MS suplementado com 0,1 mg L-1 ANA e 8,3 mg L-1 de 2iP e, para a regeneração as melhores respostas foram obtidas com meio MS, suplementado com 30 g L-1 de sorbitol, 0,5 mg L-1 ANA e 5 mg L1 de TDZ, atingindo um percentual de 94,5% de regenerações. Quanto aos protocolos de transformação, o que apresentou melhores resultados foi o protocolo P1, no qual através da análise de PCR foram obtidas 15% de brotações contendo o gene bv/l. No entanto, a expressão da proteína BVLI não foi detectada através de Dot Blot, indicando a necessidade de novos procedimentos, como refinamento do protocolo de extração de proteínas, bem como utulização de outras técnicas de análises, como Real Time.

Submitted by Jadson Francisco de Jesus SILVA (jadson@uefs.br) on 2018-01-23T00:22:49Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o vers?o biblioteca FINAL II Teresa_versao WORD (1) (1).pdf: 2399848 bytes, checksum: a72bd616ac1f702167982548cd4418bb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-23T00:22:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o vers?o biblioteca FINAL II Teresa_versao WORD (1) (1).pdf: 2399848 bytes, checksum: a72bd616ac1f702167982548cd4418bb (MD5) Previous issue date: 2017-08-29 / Corymbia torelliana (F. Muell.) K.D. Hill & L.A.S. Johnson (Myrtaceae) is a pollinated species, easy to adapt, high resistance and therapeutic potential. Considering that pollen has demonstrated medicinal potential, this study aimed to evaluate the chemical composition and biological activity of the pollen of this species. The material was collected at Bahia Specialty Cellulose / Copener. The chemical composition (phenolic content, total flavonoids and phytochemical screening) was evaluated from the raw ethanolic pollen extract (EEP) and the biological tests of antioxidant activity, 2,2-diphenyl-1-picryl-hydrazila (DPPH) (Rota rod), analgesic activity (tests of abdominal contortions induced by acetic acid, formalin and hot plate) and anti-inflammatory (carrageenan-induced paw edema test) were analyzed using mice. The presence of terpenes, steroids and phenolic compounds was identified and the EEP presented 116.21 ? 7.80 mgEAG / g of phenolic compounds and 35.81 ? 8.37 mgEQ / g of flavonoids. In the antioxidant activity test, pollen was able to sequester DPPH with EC50 of 60.85 ? 4.70 ?g / mL. As for the acute toxicity, no change was observed in the test used, nor was there any alteration in motor coordination in the Rota rod test. It was verified the presence of analgesic and anti-inflammatory activity of the EEP in the doses used (75, 150 and 300 mg / kg), and the dose of 75 mg / kg presented the best result. The results indicate an antioxidant, analgesic and anti-inflammatory potential for the EEP of this species, besides a possible peripheral and central activity. / Corymbia torelliana (F. Muell.) K.D. Hill & L.A.S. Johnson (Myrtaceae) ? uma esp?cie polin?fera, de f?cil adapta??o, grande resist?ncia e poss?veis potencialidades terap?uticas. Considerando que o p?len tem demonstrado potencial medicinal, este estudo teve como objetivo avaliar a composi??o qu?mica e atividade biol?gica do p?len dessa esp?cie. A coleta do material foi realizada na empresa Bahia Specialty Cellulose/Copener. A partir do extrato bruto etan?lico do p?len (EEP) foi avaliada a composi??o qu?mica (teor de fen?licos, flavonoides totais e triagem fitoqu?mica) e realizado testes biol?gicos de atividade antioxidante, m?todo 2,2?Difenil?1?picril?hidrazila (DPPH), utilizando camundongos analisou-se toxidade aguda, coordena??o motora (Rota rod), atividade analg?sica (testes das contor??es abdominal induzido pelo ?cido ac?tico, da formalina e da placa quente) e anti-inflamat?ria (teste do edema da pata induzido por carragenina). Foi identificada a presen?a de terpenos, esteroides e compostos fen?licos e o EEP apresentou 116,21?7,80 mgEAG/g de compostos fen?licos e 35,81?8,37 mgEQ/g de flavonoides. No teste de atividade antioxidante o p?len foi capaz de sequestrar o DPPH com CE50 de 60,85?4,70 ?g/mL. Quanto ? toxidade aguda n?o foi observada nenhuma altera??o no teste utilizado, bem como n?o foi verificada altera??es da coordena??o motora no teste do Rota rod. Foi verificada a presen?a de atividade analg?sica e anti-inflamat?ria do EEP nas doses utilizadas (75, 150 e 300 mg/kg), sendo que a dose de 75 mg/kg apresentou o melhor resultado. Os resultados obtidos apontam um potencial antioxidante, analg?sico e anti-inflamat?rio para o EEP dessa esp?cie, al?m de uma poss?vel atividade perif?rica e central.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-26T13:52:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_MetodoIdentificacaoGenes.pdf: 963765 bytes, checksum: 9cb1e27661c2b5e611915be85e11786d (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-01-27T13:31:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_MetodoIdentificacaoGenes.pdf: 963765 bytes, checksum: 9cb1e27661c2b5e611915be85e11786d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-27T13:31:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_MetodoIdentificacaoGenes.pdf: 963765 bytes, checksum: 9cb1e27661c2b5e611915be85e11786d (MD5) Previous issue date: 2015-09-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A pimenta do reino (Piper nigrum) é uma planta de alto interesse biotecnológico, alvo de pesquisas tanto para a exploração do metabolismo quanto para o melhoramento relacionado a problemas fitopatológicos, além do entendimento da evolução das angiospermas basais, grupo ancestral ao qual ela pertence. O avanço nos métodos de sequenciamento de nova geração proporcionou o acesso ao patrimônio genético de plantas não modelo possibilitando a abertura de novas perspectivas biotecnológicas. A identificação de genes não homólogos restritos a certas espécies, denominados genes taxonomicamente restritos (GTRs), é um alvo biotecnológico prioritário, especialmente em espécies e grupos divergentes e ancestrais. Este trabalho tem por objetivo estabelecer um método de identificação de GTRs a partir de dados de RNA-seq e de validar a abordagem num conjunto de dados de pimenta do reino. O método consiste na filtragem de transcritos em várias etapas, de forma que os transcritos anotados e os falsos positivos são retirados, e os dados restantes sem informações moleculares são classificados como potenciais GTRs. A aplicação da abordagem em dados de transcriptoma de pimenta do reino (35.631 transcritos) resultou em 22.661 transcritos anotados por similaridade. Os transcritos não anotados nessa primeira análise foram processados na ferramenta TRAPID, obtendo 12.895 transcritos não anotados. A avaliação dos transcritos para detecção de falsos positivos resultou em 245 transcritos verdadeiros, que foram analisados quando a presença de RNA não codificante, sendo encontrados 204 transcritos sem identificação. Ao final da aplicação do método restaram 71 transcritos não anotados com regiões codificantes de proteínas, assinalados como potenciais GTRs. A caracterização desses potenciais GTRs em pimenta do reino pode fornecer novas informações sobre o mecanismo molecular dessa espécie e talvez elucidar vias para o estabelecimento de cultivares tolerantes a doenças. / Black pepper (Piper nigrum) is a biotechnologically interesting plant, research target for both metabolism exploration and improvement related to phytopathological problems, in addition to understanding the evolution of basal angiosperms, ancestral group to which it belongs. With the technological revolution, the next generation sequencing offered access to genetic heritage of non model plants enabling the opening of new biotechnological perspective. The identification of non homologous genes restricted to certain species, called taxonomically restricted genes (TRGs), is a primary biotechnological target, especially in species and groups that are divergent and ancestral. This study aims to establish a method for TRGs identification from RNA-seq data and to validate the approach a dataset for black pepper. The method consists in filtering the transcripts in several stages, so that the annotated transcripts and false positives are removed, and the remaining data without molecular information are classified as potential TRGs. The application of this approach to a black pepper transcriptome dataset (35,631 transcripts) resulted in 22,661 transcripts annotated by similarity. The transcripts that were not annotated in this first analysis were processed in the TRAPID tool, resulting in 12,895 transcripts not annotated. The evaluation of transcripts for false positive detection resulted in 245 true transcripts that were analyzed for the presence of non-coding RNA, resulting in 204 unidentified transcripts. At the end of the method application 71 non annotated transcripts remained with coding regions of protein, indicating potential TRGs. The characterization of these potential TRGs in black pepper can provide new information about the molecular mechanism of this specie and perhaps elucidate pathways for the establishment of cultivars tolerant to disease.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 559821 bytes, checksum: 5797c4fb6631839d7cef0e75351e4e02 (MD5) Previous issue date: 2011-10-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum is currently one of the most important bacterial diseases in eucalyptus. The use of healthy eucalyptus cuttings is the most effective method to prevent the introduction and spread of the pathogen in disease free areas. Infected plants can be identified visually bybacterial cell exudation from the host tissue and confirmed by analysis of PCR. However, in asymptomatic minicuttings with latent infections, in which the xylem shows low concentrations of bacterial cellsit is not possible to visualize wilting symptoms bacterial exudation. Thus, for certification thateucalyptus cuttings are pathogen free, it is necessary to employ a sensitive method able to detect the bacteria, even when present in low concentrations in the host tissue.This study aimed to evaluate the real-time PCR for detection of bacteria in the latent period of infection. Among six primers previously tested, only the oligo224R/224F was specific to R. solanancearum, that amplifies the r16S ribosomal gene region. Subsequently,it was developed a protocol to extract bacterial DNA from infected plant tissue consisting of tissue maceration in liquid nitrogen, addition of saline solution, centrifugation, discard of the supernatant and DNA extraction. Real-time PCR of fourinfected eucalyptus cuttings with R. solanacearum(UFV32)evaluated at 20 days after inoculationshowed 105 to 106 colony forming units (cfu) of R. solanacearum / g of host tissue. The detection limit of real-time PCR was 103cfu / g, copared with 107cfu / mL for the conventional PCR. The method proved to be efficient for detection and quantification of R. solanacearum directly from infected eucalyptus plant tissue. / A murcha bacteriana causada por Ralstonia solanacearum é, atualmente uma das mais importantes doenças bacterianas na eucaliptocultura. O uso de mudas clonais sadias é ométodo mais efetivo para evitar a introdução e disseminação do patógeno em áreas livres da doença. Plantas infectadas podem ser identificadas visualmente ou pela exsudação de pus, porém, em minicepas assintomáticas, mas com infecções latentes, nas quais o xilema apresenta baixas concentrações de células bacterianas, não é possível a visualização de sintomas de murcha ou sinais da doença como a exsudação bacteriana. Assim, para certificação de que as mudas para o plantio estão livres do patógeno, é necessário empregar um método capaz de detectar a bactéria, mesmo quando presente em baixas concentrações.Assim, o presente trabalho objetivou avaliar a PCR em tempo real para detecção da bactéria no período latente de infecção. Primeiramente, dentre seis oligonucleotídeos testados, o oligo 224R/224F, que amplifica a região do gene ribossomal 16S, foi o único específico para R. solanacearum. Subsequentemente desenvolveu-se um protocolo de extração de DNA bacteriano a partir do tecido vegetal infectado que consiste da maceração com nitrogênio líquido, adição de solução salina, centrifugação, descarte do sobrenadante e extração com o kit (Promega) de extração. Para avaliar o método da PCR em tempo real, mudas de eucalipto de quatro clones foram inoculadas com o isolado UFV32 de R. solanacearume o DNA do patógeno foi quantificado aos 20 dias da inoculação. Aproximadamente 105 a 106 unidades formadoras de colônia (ufc)/g de R. solanacearum foram detectadas.. O limite de detecção da PCR em tempo real foi de 103ufc/g contra 107ufc/mL da PCR convencional, ou seja 10.000 vezes maior.. O método mostrou-se eficiente na detecção e quantificação de R. solanacearum diretamente do tecido vegetal de eucalipto.

Submitted by Maria de Lourdes Mariano (lmariano@ufscar.br) on 2017-01-10T13:10:23Z No. of bitstreams: 1 RIBEIRO_Paulianny de Moura_2015.pdf: 5411404 bytes, checksum: 0c49e97d507d656d40daf77bf7d00c91 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria de Lourdes Mariano (lmariano@ufscar.br) on 2017-01-10T13:10:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RIBEIRO_Paulianny de Moura_2015.pdf: 5411404 bytes, checksum: 0c49e97d507d656d40daf77bf7d00c91 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria de Lourdes Mariano (lmariano@ufscar.br) on 2017-01-10T13:10:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RIBEIRO_Paulianny de Moura_2015.pdf: 5411404 bytes, checksum: 0c49e97d507d656d40daf77bf7d00c91 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-10T13:10:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RIBEIRO_Paulianny de Moura_2015.pdf: 5411404 bytes, checksum: 0c49e97d507d656d40daf77bf7d00c91 (MD5) Previous issue date: 2015-06-12 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Pilosocereus aureispinus (Buining & Brederoo) F. Ritter is a narrow endemic columnar cactus of eastern Brazil, occurring at Ibotirama and Oliveira dos Brejinhos, Bahia. In this work the genetic diversity and population structure were assessed for eight microsatellite loci in four P. aureispinus localities of occurrence, covering its known distribution. Genetic diversity levels were relatively high (A = 4,2 e HE = 0,451) comparing with closely related species and other narrowly distributed plant species. Significant Hardy-Weinberg Equilibrium departures and linkage disequilibrium were not detected. Private alleles in low frequencies and low levels of genetic structure (FST =0,071 e G”ST = 0,132) were detected. STRUCTURE software analysis did not identified structure, showing that samples from four analyzed localities represent a unique genetic group (K=1). These results pointed to high level of ongoing gene flow among sampled localities, which may counteract differentiation effects and genetic diversity loss. Despite P. aureispinus is not suffering genetic variability erosion due its narrow distribution, the species should be classified as endangered (EN) at IUCN Red List of Threatened Species due existent anthropogenic disturbs in regions where it occurs. / Pilosocereus aureispinus (Buining & Brederoo) F. Ritter é um cacto colunar microendêmico e com distribuição restrita na porção do leste do Brasil, na região dos municípios de Ibotirama e Oliveira dos Brejinhos, Bahia. Nesse trabalho foram estimados os níveis de diversidade genética e estruturação populacional a partir de oito locos de DNA microssatélite em quatro localidades de ocorrência de P. aureispinus, abrangendo sua distribuição conhecida. Os níveis de diversidade genética foram relativamente altos (A = 4,2 e HE = 0,451) quando comparados com outras espécies proximamente relacionadas e com espécies de distribuição restrita. Não foram detectados locos com desvios significativos em relação às proporções do Equilíbrio de Hardy-Weinberg e desequilíbrio de ligação. Alelos exclusivos foram detectados em baixa frequência, assim como baixos níveis de estruturação genética (FST = 0,071 e G”ST = 0,132). A análise no programa STRUCTURE não identificou estruturação, indicando que as amostras das quatro localidades analisadas representam apenas um grupo genético (K=1). Esses resultados permitem inferir que há acentuado fluxo gênico recente entre as localidades amostradas, o qual pode neutralizar os efeitos de diferenciação e a perda de diversidade genética. Embora nossos resultados indiquem que P. aureispinus não esteja sofrendo perda de variabilidade genética devido à sua distribuição restrita, a espécie deveria ser classificada como ameaçada (EN) na Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas da IUCN devido aos distúrbios antrópicos existentes nas regiões onde ocorre.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1117940 bytes, checksum: 956e311566e3418979f2e1c2c4e72cd2 (MD5) Previous issue date: 2006-02-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objective of this work was to investigate the gene flow from the Roundup Ready soybean to a conventional in two sites of Minas Gerais: Viçosa and Florestal. Cross-pollination rate was observed between CD219RR® and CD211, both of property of COODETEC (Central Cooperative of Agricultural Research). It was also objective of this research to study five methodologies to identify tolerant soybean seeds to the herbicide, and one of them was chosen for the detection of the occurrence of gene flow in this work. The first experiment was installed in the field in an outline of concentric squares delineated especially for the objectives of this study. The first five squares, from the center to the border, formed the pollen source, where seeds were sowed of gliphosate tolerant cultivar. The remaing squares were sowed susceptible cultivar seeds. In the maturation stage, stage R8, were harvested in the four directions starting from the center, rows corresponding to the sides of the squares, in varied distances of the pollen source: 0,5; 1,0; 2,0; 4,0 and 8,0 meters. Of the harvested rows, samples of 900 seeds per row were evaluated through the bioassay of germination in substrate moistened with 0,06% glifosato solution. In this analysis, seedling endowed with indicative trace of tolerance to the gliphosate indicated occurrence of cross-pollination. The obtained data were analyzed statistically through linear regression with plateau. Results indicated cross-pollination rates different for the two locations showing that this trait can vary in function of the environment. The largest natural hybridization rates (1,27% in Florestal and 0,25% in Viçosa) happened at the smallest distances. The cross-pollination rates approached zero at the distances of 2,26 and 1,16m from the source, for Florestal and Viçosa, respectively. / O objetivo deste trabalho foi investigar o fluxo gênico da soja Roundup Ready para uma convencional em duas localidades no Estado de Minas Gerais: Viçosa e Florestal. Foi observada a taxa de fecundação cruzada entre CD219RR® e CD211, ambas de propriedade da COODETEC (Cooperativa Central de Pesquisa Agrícola). Foi também objetivo dessa pesquisa estudar cinco metodologias para identificar sementes de soja tolerante ao herbicida. Uma delas foi escolhida para detecção do fluxo gênico neste trabalho. O primeiro experimento foi instalado em campo num esquema constituído de quadrados concêntricos, delineado especialmente para os objetivos deste estudo. Os cinco primeiros quadrados, do centro para borda, formaram a fonte de pólen, onde sementes do cultivar tolerante ao glifosato foram semeadas. À sua volta, foi semeado o cultivar sensível. Na fase de maturação, estágio R8, foram colhidas nas quatro direções a partir do centro, fileiras correspondentes aos lados dos quadrados, em distâncias variadas da fonte de pólen: 0,5; 1,0; 2,0; 4,0 e 8,0 metros. Das fileiras colhidas, amostras de 900 sementes por fileira foram avaliadas por meio do bioensaio de germinação de sementes em substrato umedecido com solução 0,06% de glifosato, metodologia adotada a partir dos estudos realizados sobre os bioensaios. Nesta análise, plântulas dotadas de traços indicativos de tolerância ao glifosato indicaram ocorrência de fecundação cruzada. Os dados obtidos foram analisados estatisticamente por meio de regressão linear com platô. Os resultados indicaram taxas de fecundação cruzada diferentes para as duas localidades mostrando que esta característica varia em função do ambiente. As maiores taxas de hibridação natural (1,27% em Florestal e 0,25% em Viçosa) ocorreram às menores distâncias. As taxas de fecundação cruzada aproximaram-se de zero às distâncias de 2,26 e 1,16m da fonte, para Florestal e Viçosa, respectivamente.