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Isolamento, caracterização e expressão em sistema bacteriano de um gene que codifica uma proteína transportadora de lipídeos de Piper nigrumBRITO, Wendell Upton de 11 May 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-05 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / A pimenteira-do-reino (Piper nigrum L.) constitui uma das espécies de pimenta mais amplamente utilizadas no mundo, pertencendo à família Piperaceae, a qual compreende cerca de 1400 espécies distribuídas principalmente no continente americano e sudeste da Ásia, onde esta cultura originou. A pimenteira-do-reino foi introduzida no Brasil no século XVII, e tornou-se uma cultura de importância econômica desde 1933. O Estado do Pará é o principal produto brasileiro de pimenta-do-reino, contudo sua produção vem sendo afetada pela doença fusariose causada pelo fungo Fusarium solani f. sp. piperis. Estudos prévios revelaram a identificação de sequencias de cDNA diferencialmente expressas durante a interação da pimenteira-do-reino com o F. solani f. sp. piperis. Entre elas, uma sequencia de cDNA parcial que codifica para uma proteína transportadora de lipídeos (LTP), a qual é conhecida por seu importante papel na defesa de plantas contra patógenos e insetos. Desta forma, o objetivo principal deste trabalho foi isolar e caracterizar as sequencias de cDNA e genômica de uma LTP de pimenteira-do-reino, denominada PnLTP. O cDNA completo da PnLTP isolado por meio de experimentos de RACE apresentou 621 bp com 32 pb and 235 bp nas regiões não traduzidas 5‘ e 3‘, respectivamente. Este cDNA contem uma ORF de 354 bp codificando uma proteína deduzida de 117 resíduos de aminoácidos que apresentou alta identidade com LTPs de outras espécies vegetais. Análises das sequencias revelou que a PnLTP contem um potencial peptídeo sinal na extremidade amino-terminal e oito resíduos de cisteína preditos por formar quatro pontes de dissulfeto, as quais poderiam contribuir para a estabilidade desta proteína. O alinhamento entre as sequencias de cDNA e genômica revelou a ausência de introns na região codificante do gene PnLTP, o que está de acordo ao encontrado em outros genes de LTPs de plantas. Por último, a PnLTP madura foi expressa em sistema bacteriano. Experimentos adicionais serão realizados com o objetivo de avaliar a habilidade da PnLTP recombinante em inibir o crescimento do F. solani f. sp. piperis. / Black pepper (Piper nigrum L.) is one of the most widely used spices in the world belonging to the Piperaceae family, which comprises about 1400 species distributed mainly in the American tropics and Southern Asia, where this crop originated. Black pepper was introduced in Brazil in the 17th century and has been a nationally important crop since 1933. The Pará State is the main Brazilian producer of black pepper; however, the spice‘s production has been damaged by the root rot disease caused by Fusarium solani f. sp. piperis. Previous studies have revealed the identification of some cDNA sequences differentially expressed during compatible black pepper - F. solani f. sp. piperis interaction. Among them, a partial cDNA sequence coding for a putative Lipid transfer protein (LTP), which is know to play important roles in plant defense against insects and pathogens. Therefore, the aim of this work was to isolate and characterize the full-length cDNA and genomic sequences of black pepper LTP, named PnLTP. The PnLTP full-length cDNA isolated by RACE assays showed 621 bp with 32 bp and 235 bp non-coding sequences at the 5‘ and 3‘ ends, respectively. This cDNA contains a 354-bp ORF coding for a deduced protein with 117 amino acid residues that showed high identity with LTPs from different crops. Sequence analysis revealed that PnLTP contains a putative peptide signal at amino-terminal and eight cysteine residues predicted to form four disulfide bridges, which could contribute to protein stability. Alignment between genomic and cDNA sequences revealed no introns within PnLTP coding region, that is in accordance with other LTP plant genes. Finally, the mature PnLTP was expressed in bacteria system. Additional experiments will be performed in order to evaluate the ability of recombinant PnLTP in inhibit the F. solani f. sp. piperis growth.
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METODOLOGIAS PARA AVALIAÇÃO DA DISTRIBUIÇÃO ESPACIAL DA FUSARIOSE EM PIMENTA-DO-REINOBRUMAT, A. C. L. 16 February 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-02-16 / O estudo espaço-temporal de doença de plantas analisa a interação entre o patógeno, ambiente e o hospedeiro, no qual existem diversas metodologias que podem ser utilizadas para esse fim. A fusariose é considerada a principal doença fúngica na cultura da pimenta-do-reino, no entanto ainda são poucos os estudos epidemiológicos da doença. Visto isso, objetivou-se com o trabalho estudar a distribuição espacial da fusariose em pimenta-do-reino utilizando diferentes metodologias de estudo. Foram monitoradas quatro áreas homogêneas de pimenta-do-reino, no município de São Mateus-ES, no período de dez/2015 a dez/2016. A presença ou ausência de sintomas, bem como a posição de cada planta, foram anotadas em planilhas obtendo-se o mapeamento da evolução da doença dentro das áreas. Para o estudo espacial analisou-se os dados por diferentes metodologias: Índice de Dispersão (ID), Lei de Taylor modificada, análise de dinâmica e estrutura de focos (ADEF), e a krigagem. A análise dos dados por meio Lei de Taylor modificada indicou distribuição agregada somente para a área quatro. A ADEF mostrou que, com a evolução da doença no campo, os focos se tornavam maiores e em menor número. Com a utilização de geoestatística foi possível observar que a fusariose é disseminada a curta distância, e que os focos obedecem a um padrão de alongamento. Comparando os resultados obtidos pelos diferentes métodos observa-se que a geoestatística corroborou com os resultados apresentados pelas metodologias convencionais (Lei de Taylor modificada e a ADEF), e que a mesma tem potencial para ser utilizada no estudo espacial de doença de plantas.
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Supressão de estímulo nociceptivo na articulação temporomandibular de ratos fêmeas usando piperina / Experimental model for suppression of nociceptive stimuli in the TMJ of rats with piperineMartins, Ana Paula Varela Brown, 1979- 09 September 2011 (has links)
Orientador: Célia Marisa Rizzatti-Barbosa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-18T23:42:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2011 / Resumo: As articulações temporomandibulares (ATM) podem ser afetadas por alterações articulares e/ou musculares que podem progredir e iniciar mudanças degenerativas, culminando em osteoartrite (OA). A liberação de mediadores químicos, durante processo inflamatório na ATM, pode modular a condução dos estímulos nociceptivos e promover a expansão e agravamento do campo neuroinflamatório na sensibilização central. Portanto, para melhor compreender e investigar o processo inflamatório e suas vias de condução da dor na disfunção temporomandibular (DTM), este estudo teve como objetivo desenvolver um modelo experimental para supressão da condução de estímulo nociceptivo gerado na região da ATM de ratos fêmeas Wistar usando piperina (Piper nigrum), bem como determinar a concentração necessária de piperina para produzir tal efeito. Para isso, foram utilizados 20 ratos fêmeas, divididos em 4 grupos (n=5), que tiveram injetadas na sua ATM direita 25?l de uma das seguintes soluções: salina fisiológica, 4, 6 ou 8?g de piperina diluídas, individualmente, em 100ml de solução de 10% de álcool etílico, 10% de Tween 80 e 80% de solução fisiológica estéril. Após 8 a 12 dias, todas as ratas, na fase estro do ciclo hormonal receberam, na mesma ATM, a aplicação de 25?l de nova solução de 2?g piperina, que agiu como agente irritante, diluída como previamente citado, e foram imediatamente avaliadas quanto aos comportamentos nociceptivos de coçar a região orofacial com uma das patas e/ou de deslocar repetida e descoordenadamente a cabeça. Estes dados foram quantificados sob a forma de tempo gasto pelo animal coçando a região orofacial, de número de vezes em que deslocou a cabeça, e da soma destes comportamentos, considerando que o comportamento de deslocamento da cabeça seguiu um padrão uniforme de 1 segundo de duração, cada deslocamento foi expresso com 1 segundo. Os dados coletados foram submetidos à análise de variância (ANOVA, um critério) e teste de Bonferroni (post-hoc, ?=0.05). Para os animais que receberam injeção prévia de solução fisiológica estéril, 4, 6 ou 8?g/100ml de piperina, a média (± desvio padrão) do tempo gasto (em segundos) coçando a cabeça foi de 54.2 (±7.29), 63.4 (±12.82), 55.4 (±9.95), e 30.8 (±4.2), respectivamente; a média do número de vezes em que houve deslocamento da cabeça foi de 39 (±7.17), 47.6 (±4.91), 38.8 (±3.76), e 25.6 (±2.8), respectivamente; por fim, a média da soma dos comportamentos foi de 93.2 (± 8.45), 111 (± 10.79), 94.2 (± 9.4), e 56.4 (± 4.18), respectivamente. A injeção prévia de 8 x 10 -3 ?g/ml de piperina da ATM provou reduzir, significativamente, os comportamentos nociceptivos avaliados, quando associados, em comparação ao grupo injetado com solução fisiológica estéril. Portanto, a injeção de solução de piperina na concentração 8 x10-3 ?g/ml na ATM de ratos mostrou-se eficaz na redução da condução de estímulos nociceptivos em comparação à solução salina fisiológica / Abstract: Temporomandibular joints (TMJ) may be affected by articular and/or muscle alterations that can progress and initiate degenerative changes, culminating in osteoarthritis (OA). The release of chemical mediators, during inflammation in the TMJ, can modulate the conduction of nociceptive stimuli and promote the expansion and aggravation of the neuroinflammatory field in central sensitization, which in turn, seems to contribute to the impairment of sites other than the origin of the inflammatory process. So, to better understand and investigate the inflammatory process and its pain pathways in temporomandibular disorders (TMD), this study aimed to develop a model for suppression of the nociceptive stimulus generated in the TMJ region of Wistar rats using piperine (Piper nigrum), and to determine the necessary concentration of piperine to produce such effect. For that, 20 female rats were divided into 4 groups (n=5), and they had their right TMJ injected with 25?l of one of the following solutions: saline, 4, 6 or 08?g/100ml of piperine. After 8 to 12 days, rats in the estrous phase of the hormonal cycle had the same TMJ injected with a new piperine solution (25?l, 2?g/100ml) which acted as irritant, and were immediately evaluated for the nociceptive behaviors of rubbing the orofacial region with one the paws and/or of flinching the head repetitively and uncoordinatedly and the sum of this behaviors, considering that the flinching of the head behavior followed a uniform pattern of 1 second in duration, each flinching was expresses as 1 second. These data were quantified in terms of time spent rubbing the orofacial region, of number of times of head flinches, and of the sum of both behaviors. Data collected were submitted to analysis of variance (ANOVA, one-way) and Bonferroni's test (post-hoc, ?=0.05). For the animals that received previous injection of saline, 4, 6 or 8?g/100ml of piperine solutions, the means (± standard deviations) for time (in seconds) spent rubbing the orofacial region were 54.2 (±7.29), 63.4 (±12.82), 55.4 (±9.95), e 30.8 (±4.2), respectively; for the number of head flinches, the means were 39 (±7.17), 47.6 (±4.91), 38.8 (±3.76), e 25.6 (±2.8), respectively; finally, the means for the sum of both behavior were 93.2 (± 8.45), 111 (± 10.79), 94.2 (± 9.4), e 56.4 (± 4.18), respectively. Previous injection of the TMJ with8x10-3 ?g/ml of piperine solution has proved to reduce the sum of the nociceptive behaviors, compared to injection of saline solution. Therefore, the injection of piperine solution at concentration of 8 x 10-3 ?g/ml in the TMJ of rats has shown to be effective in the reduction of the conduction of nociceptive stimuli compared to saline solution / Mestrado / Protese Dental / Mestre em Clínica Odontológica
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Atividade antioxidante, anticolinesterásica e perfil metabolômico de diferentes tipos de pimentas: Implicações na doença de Alzheimer / Antioxidant, anticholinesterase activity and metabolomic profile of different types of peppers: implications in Alzheimer\'s diseaseBiazotto, Fuvia de Oliveira 06 October 2014 (has links)
A principal forma de tratamento da doença de Alzheimer é através de inibidores sintéticos de acetilcolinesterase. Os inibidores existentes no mercado além, de terem um custo elevado e apresentarem efeitos colaterais não previnem ou curam a doença de Alzheimer, apenas retardam o seu desenvolvimento. A baixa efetividade dos tratamentos existentes e a ausência de prognóstico positivo impulsionaram no mercado uma demanda por novas formas de tratamento e/ou prevenção da doença. Neste cenário, investigar a atividade anticolinesterásica em pimentas do reino e pimenta rosa, bem como seu potencial antioxidante e composição fitoquímica são maneiras de promover tanto o conhecimento sobre estas especiarias como beneficiar o panorama de saúde pública, seja no combate a doença de Alzheimer e/ou outras pandemias existentes. Com o objetivo de avaliar o potencial destas especiarias, extratos metanólicos de pimenta preta, verde, branca e rosa foram avaliados segundo o teor de fenólicos totais, atividade antioxidante pelo método DPPH, ABTS e FRAP e atividade anticolinesterásica. Posteriormente o perfil metabolômico dos grãos e extratos de pimenta foi analisado por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massa. As amostras foram ionizadas por -eletrospray? operando em modo negativo e positivo. O extrato de pimenta rosa apresentou o maior teor de compostos fenólicos totais e a melhor atividade antioxidante e anticolinesterásica em comparação aos demais extratos. Dentre as pimentas do reino, a pimenta verde destacou-se com os maiores teores de compostos fenólicos e atividade antioxidante pelo método DPPH e ABTS. Já a pimenta preta mostrou os melhores resultados para as análises de atividade anticolinesterásica e atividade antioxidante pelo método FRAP. Quanto ao perfil metabolômico as amostras de pimenta foram significativamente distintas entre si. Os espectros obtidos para as amostras de grãos de pimenta foram mais ricos em metabólitos em relação às amostras de extrato em ambos os modos operacionais. O processamento das pimentas do reino induziu modificações quantitativas e qualitativas sobre a composição fitoquímica deste condimento. A pimenta rosa não apresentou nenhum possível metabólito com alto potencial discriminatório, dentre os 15 íons investigados. Em modo operacional negativo, os metabólitos presentes no extrato de pimenta verde, exceto íon de m/z 329,2081, foram responsáveis por todas as contribuições mais significativas entre os perfis metabolômicos gerados. A partir dos resultados obtidos no presente trabalho é possível afirmar que a pimenta rosa apresenta o maior potencial na redução de risco da doença de Alzheimer, dentre as pimentas investigadas. / Synthetic inhibitors of cholinesterase are the main drugs used in the treatment for Alzheimer\'s disease and besides the high cost and side effects, the current drugs available in the market do not prevent or cure Alzheimer, only retard its development. The absence of positive prognosis and limited effectiveness of existing drugs enhance the demand for new forms of the disease\'s treatment and/or prevention. In this scenario, investigating Piper nigrum and Schinus terebinthifolius peppercorns for its acetylcholinesterase and antioxidant activity, as well as its phytochemical composition, are ways to promote both knowledge about these spices and the perspective of health, either in combat of Alzheimer\'s disease and/or other existing pandemics. In order to evaluate the potential of these spices, black, green, white and pink peppers methanolic extracts were evaluated according to the total phenolic content, antioxidant activity by DPPH, ABTS and FRAP assay and anticholinesterase activity. Subsequently the metabolomic profile of the extracts and peppercorns were analyzed by mass spectrometry coupled to liquid chromatography. Samples were ionized by electrospray operating in negative and positive modes. The pink pepper (Schinus terebinthifolius) extract showed the highest content of total phenolic compounds and the best antioxidant and anticholinesterase activity compared to the other extracts. Among Piper nigrum peppercorns, green pepper stood out as the highest levels of phenolic compounds and antioxidant activity by DPPH and ABTS methods. Black pepper obtained the best results for the analysis of acetylcholinesterase activity and antioxidant activity by FRAP method. Regarding the metabolomic profiles, pepper samples are significantly different from each other. The spectrum obtained for peppercorn\'s samples were richer in metabolites compared to extract\'s samples in both operating modes. The processing induced quantitative and qualitative changes on the phytochemical composition of the peppercorns. The pink pepper did not show any possible metabolite with high discriminatory potential, of the 15 ions investigated. In the negative operating mode, the metabolites present in the extracts of green pepper, excluding m/z 329.2081 ion, were responsible for all of the most significant contributions between metabolomic profiles generated. From the results obtained in this study it is possible to affirm that pink pepper has the greatest potential to reduce Alzheimer\'s disease risk, among peppers investigated.
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Atividade antioxidante, anticolinesterásica e perfil metabolômico de diferentes tipos de pimentas: Implicações na doença de Alzheimer / Antioxidant, anticholinesterase activity and metabolomic profile of different types of peppers: implications in Alzheimer\'s diseaseFuvia de Oliveira Biazotto 06 October 2014 (has links)
A principal forma de tratamento da doença de Alzheimer é através de inibidores sintéticos de acetilcolinesterase. Os inibidores existentes no mercado além, de terem um custo elevado e apresentarem efeitos colaterais não previnem ou curam a doença de Alzheimer, apenas retardam o seu desenvolvimento. A baixa efetividade dos tratamentos existentes e a ausência de prognóstico positivo impulsionaram no mercado uma demanda por novas formas de tratamento e/ou prevenção da doença. Neste cenário, investigar a atividade anticolinesterásica em pimentas do reino e pimenta rosa, bem como seu potencial antioxidante e composição fitoquímica são maneiras de promover tanto o conhecimento sobre estas especiarias como beneficiar o panorama de saúde pública, seja no combate a doença de Alzheimer e/ou outras pandemias existentes. Com o objetivo de avaliar o potencial destas especiarias, extratos metanólicos de pimenta preta, verde, branca e rosa foram avaliados segundo o teor de fenólicos totais, atividade antioxidante pelo método DPPH, ABTS e FRAP e atividade anticolinesterásica. Posteriormente o perfil metabolômico dos grãos e extratos de pimenta foi analisado por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massa. As amostras foram ionizadas por -eletrospray? operando em modo negativo e positivo. O extrato de pimenta rosa apresentou o maior teor de compostos fenólicos totais e a melhor atividade antioxidante e anticolinesterásica em comparação aos demais extratos. Dentre as pimentas do reino, a pimenta verde destacou-se com os maiores teores de compostos fenólicos e atividade antioxidante pelo método DPPH e ABTS. Já a pimenta preta mostrou os melhores resultados para as análises de atividade anticolinesterásica e atividade antioxidante pelo método FRAP. Quanto ao perfil metabolômico as amostras de pimenta foram significativamente distintas entre si. Os espectros obtidos para as amostras de grãos de pimenta foram mais ricos em metabólitos em relação às amostras de extrato em ambos os modos operacionais. O processamento das pimentas do reino induziu modificações quantitativas e qualitativas sobre a composição fitoquímica deste condimento. A pimenta rosa não apresentou nenhum possível metabólito com alto potencial discriminatório, dentre os 15 íons investigados. Em modo operacional negativo, os metabólitos presentes no extrato de pimenta verde, exceto íon de m/z 329,2081, foram responsáveis por todas as contribuições mais significativas entre os perfis metabolômicos gerados. A partir dos resultados obtidos no presente trabalho é possível afirmar que a pimenta rosa apresenta o maior potencial na redução de risco da doença de Alzheimer, dentre as pimentas investigadas. / Synthetic inhibitors of cholinesterase are the main drugs used in the treatment for Alzheimer\'s disease and besides the high cost and side effects, the current drugs available in the market do not prevent or cure Alzheimer, only retard its development. The absence of positive prognosis and limited effectiveness of existing drugs enhance the demand for new forms of the disease\'s treatment and/or prevention. In this scenario, investigating Piper nigrum and Schinus terebinthifolius peppercorns for its acetylcholinesterase and antioxidant activity, as well as its phytochemical composition, are ways to promote both knowledge about these spices and the perspective of health, either in combat of Alzheimer\'s disease and/or other existing pandemics. In order to evaluate the potential of these spices, black, green, white and pink peppers methanolic extracts were evaluated according to the total phenolic content, antioxidant activity by DPPH, ABTS and FRAP assay and anticholinesterase activity. Subsequently the metabolomic profile of the extracts and peppercorns were analyzed by mass spectrometry coupled to liquid chromatography. Samples were ionized by electrospray operating in negative and positive modes. The pink pepper (Schinus terebinthifolius) extract showed the highest content of total phenolic compounds and the best antioxidant and anticholinesterase activity compared to the other extracts. Among Piper nigrum peppercorns, green pepper stood out as the highest levels of phenolic compounds and antioxidant activity by DPPH and ABTS methods. Black pepper obtained the best results for the analysis of acetylcholinesterase activity and antioxidant activity by FRAP method. Regarding the metabolomic profiles, pepper samples are significantly different from each other. The spectrum obtained for peppercorn\'s samples were richer in metabolites compared to extract\'s samples in both operating modes. The processing induced quantitative and qualitative changes on the phytochemical composition of the peppercorns. The pink pepper did not show any possible metabolite with high discriminatory potential, of the 15 ions investigated. In the negative operating mode, the metabolites present in the extracts of green pepper, excluding m/z 329.2081 ion, were responsible for all of the most significant contributions between metabolomic profiles generated. From the results obtained in this study it is possible to affirm that pink pepper has the greatest potential to reduce Alzheimer\'s disease risk, among peppers investigated.
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Variabilidade espacial de atributos químicos e físicos de um latossolo cultivado com pimenta-do-reino no norte do Espírito SantoAmorim, Diego Dantas 17 May 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-05-17 / O conhecimento da variabilidade espacial de atributos químicos e físicos do solo pode ser uma ótima ferramenta para auxílio no manejo das culturas de importância agronômica. A partir de mapas de isocores pode-se traçar estratégias de manejo, adubação e calagem, podendo propiciar à planta um melhor desenvolvimento e rendimento. O experimento foi conduzido em uma lavoura de pimenta-do-reino da variedade Bragantina, plantada no espaçamento 3,0 x 1,8 m (1852 plantas ha-1), sob Latossolo Vermelho-Amarelo distrófico, localizada no município de São Mateus - ES. As análises de solo foram realizadas no Laboratório de Solos e Análise Foliar (LAGRO) e no Laboratório de Física do solo situados no Centro Universitário Norte do Espírito Santo da Universidade Federal do Espírito Santo (CEUNES-UFES). Instalou-se uma malha retangular de 100 x 120 m (12.000 m2) com 126 pontos georreferenciados com distâncias mínimas de 5 x 5 m, a malha amostral apresenta declividade variando de 3 a 10%. Em cada ponto amostral foram coletadas amostras de solo para análise química do solo onde foi determinado valores de pH, H+Al, Al3+, Ca2+, Mg2+, SB, V, t, T e m. Para cada ponto de amostragem coletou-se ainda uma amostra indeformada na profundidade de 0,00-0,20 m para a determinação da densidade do solo (Ds), volume total de poros (VTP), macroporos (Macro) e microporos (Micro). O estudo da resistência do solo à penetração (Rp1 e Rp2) foi realizado em cada ponto amostral, com sua respectiva umidade volumétrica (U1 e U2) do solo nas camadas de 0,00-0,20 e 0,020-0,40 m. Uma calagem foi realizada na área estudada, de acordo com mapa de Necessidade de Calagem (NC), a taxa diferenciada para a avaliação da influência da necessidade de calagem nos atributos químicos do solo. Objetivou-se descrever a variabilidade espacial de atributos químicos e físicos de uma lavouRA de pimenta-do-reino sob Latossolo Vermelho-Amarelo distrófico. Verificou-se dependência espacial moderada para as variáveis Macroporos, Microproros, densidade do solo, umidade nas duas camadas; forte para volume total de poros e resistência ao penetrômetro na camada de 0,00-0,20, se apresentando fraca para a mesma na camada de 0,20-0,40. Tais variáveis apresentaram alcances de 29,1, 33,81, 39,22, 99,59, 22,33, 25,44, 10,38 e 23,31 m para os atributos físicos, respectivamente. Evidenciou-se correlação espacial negativa entre a produtividade e a Ds. Com a calagem diferenciada, conseguiu-se distribuir melhor o calcário na área segundo a NC para cada zona de manejo / Knowledge of the spatial variability of chemical and physical properties of soil, can be a great tool to aid in the management of crops of agronomic importance. From Contour maps showed we can strategize management, fertilizatilizing and liming, the plant may provide a better growth and yield. The experiment was conducted in a field of black pepper variety Bragantina, planted at 3.0 x 1.8 m spacing (1852 plants ha-1), in Latossolo Vermelho-Amarelo distroférrico, located in City of São Mateus - ES. The soil analysis will be performed at the Laboratory of Soil and Foliar Analysis and the Soil Physics Laboratory at the Centro Universitário Norte do Espírito Santo, Universidade Federal do Espírito Santo (CEUNES-UFES). Installed a rectangular grid of 100 x 120 m (12.000 m2) with 126 georeferenced points, apart from each other at distances of 5 x 5 m, 10 x 10 m and 20 x 20 m with geo minimum distance of 5 x 5 m, the sampling grid has slope ranging from 3 to 10%. At each sampling point were collected soil samples for chemical analysis of soil chemical analysis shall consist of pH values, H + Al, Al3+, Ca2+, Mg2+, SB, V, T , and T m. For each sampling point was collected sample has a depth in the 0.10-0.20 deformed for the determination of bulk density, total pore volume, macropores and micropores. Study was conducted on the resistance to penetration was performed on each sample point, with their respective water content in the soil layers from 0.00-0.20 and 0.020-0.40 m. A liming was made in the study area, according to the statement of need for liming, the fees for the evaluation of the influence of lime requirement on soil chemical properties. The objective was to describe the spatial variability of chemical and physical attributes of a field of black pepper kingdom under Latossolo vermelho-amarelo distrófico. There was moderate spatial dependence for variables macropores, Microproros, bulk density, soil moisture in two layers; strong for total porosity and soil resistance in the layer of 0.00 to 0.20, appearing weak to the same layer from 0.20 to 0.40. These variables had ranges of 29.1, 33.81, 39.22, 99.59, 22.33, 25.44, 10.38 and 23.31 m for the physical attributes, respectively. It was proven negative spatial correlation between productivity and Ds. With the different liming, we were able to better distribute the limestone in the area under the need liming for each management area
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Controle da fusariose da pimenta-do-reino com aplicação de trichoderma harzianum / Control of fusarium wilt of black pepper with application of Trichoderma harzianumOliveira, Carmelita dos Santos 19 June 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-06-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A fusariose é um dos principais problemas fitossanitários na cultura da pimenta-do-reino, por causar a morte das plantas e, consequentemente, redução da produtivida-de, acarretando prejuízos econômicos à pipericultura. Considerando as dificuldades e limitações no controle desta doença, o controle biológico com o fungo Trichoderma spp. surge como alternativa a ser incorporada em seu manejo integrado. Objetivou-se neste trabalho avaliar a eficiência do produto Trichodermil® no controle da fusari-ose em lavouras de pimenta-do-reino localizadas na região Norte do Espírito Santo, no município de São Mateus. O uso do Trichodermil® reduziu a intensidade de doen-ça nas lavouras, proporcionando eficiência de controle de até 50%. A mistura de compostos fornecedores de matéria orgânica, com exceção da Polycana®, reduziu a eficiência do Trichodermil®. O intervalo entre aplicações de 90 e 120 dias foram os que apresentaram melhor controle, nas doses de 1 ou 2 mL por planta / The fusarium wil is a major disease of black pepper. Frequenttly it causes plant and, consequently, reduces yield, resulting in economic losses for black pepper produc-ers. Considering the difficulties and limitations in controlling this disease, biological with Trichoderma spp. could be an alternative strategy to be inculded in the integrat-ed disease management. The objective of this research was to evaluate the efficien-cy of Trichodermil® in controlling fusarium disease n crops of black pepper in the North of the Espírito Santo State in the city of São Mateus. The use of Trichodermil® reduced the disease in the field up to 50%. The mixture of organic matter suppliers compounds, with the exception of Polycana®, reduced the efficiency of Trichodermil®. The application intervals of 90 and 120 days were those with better control, at doses of 1 or 2 mL per plant
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Geoestatística no estudo da variabilidade espacial de atributos químicos e físicos do solo e da produtividade da pimenta-do-reino / Geostatistics in the study of the spatial variability of chemical and physical attributes of soil and productivity of the Piper nigrum L.Quartezani, Waylson Zancanella 29 February 2008 (has links)
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WAYLSON ZANCANELA QUARTEZANI.pdf: 1546721 bytes, checksum: ccf128143c8f389a26cd268610ba6253 (MD5)
Previous issue date: 2008-02-29 / The culture of Piper nigrum L. is one of the most profitable crops in the north of the Espírito Santo State. In view of the actual situation of nutritional management of culture adopted in the State, allied to the cultivation in regions of low
natural fertility and to the high nutritional requirement, new technologies have been aggregated to the production system in use, in order to be available to the productive segment. Based on that, the work had as main objective the use of geostatistics for the study of spatial variability of physical and chemical attributes of the soil and its effects on
productivity of the crop. The work was carried out in an experimental area located in commercial farming of Piper nigrum L. in the District of Nestor Gomes, Highway ES 381
km 28, in the Municipality of São Mateus, north of the Espírito Santo State. In the collection of data a regular grid of approximately 1.5 ha was used, totaling 94 sampling
points, spaced 18 x 12 m between them. To determine the attributes, the soil was collected in the projection of the canopy`s in the depth of 0 to 0.2 m. The productivity (kg
plant-1) was assessed through two harvests, in a year. For the evaluations, initially, was made a descriptive exploratory analysis without taking into consideration the spatial
position of the samples for the identification of measures of position, dispersion and discrepant points (outliers) and, after, an exploratory spatial analysis taking into consideration the position of samples in the area to identify possible tendencies. The analysis of the spatial variability of attributes studied was determined by standardized semivariograms. With the adjustment and choosing of the models were defined the
parameters required for the estimation of the values in positions not sampled in the field using the interpolation method for ordinary kriging for the preparation of maps which
allowed the distinction of regions with less and greater variability of the attributes evaluated. With the results we can conclude that the use of techniques of geostatistics
allow the identification of areas of the differentiated management of soil fertility through of the mapping of attributes studied. All attributes present structure of spatial
dependence with varying the degree of dependence between strong and moderate, except for the levels of P and Mg showing pure nugget effect and AG adjusted to the
linear model. A multiple linear regression identified the K, Ca and Mg, respectively, as the chemical attributes of greater influence in determining the productivity, and the map
of the productivity of Piper nigrum L. predicted by the multiple spatial regression show similar spatial behavior to the map of productivity of the crop estimated by kriging. / A cultura da pimenta-do-reino é um dos cultivos mais rentáveis na Região Norte do Estado do Espírito Santo. Tendo em vista a situação atual do manejo nutricional da cultura adotado no Estado, aliada ao seu cultivo em regiões de baixa
fertilidade natural e a sua elevada exigência nutricional, novas tecnologias vêm sendo agregadas ao sistema de produção em uso, para serem disponibilizadas ao setor produtivo. Baseado nisso, o presente trabalho teve como objetivo principal o uso da geoestatística para o estudo da variabilidade espacial dos atributos físicos e químicos do solo e suas influências na produtividade da cultura. O trabalho foi conduzido numa
área experimental localizada em lavoura comercial de pimenta-do-reino no Distrito de Nestor Gomes, Rodovia ES 381 km 28, no Município de São Mateus, Norte do Estado do Espírito Santo. Na coleta dos dados, utilizou-se uma malha regular de
aproximadamente 1,5 ha, totalizado 94 pontos amostrais, espaçados 18 x 12 m entre si. Para a determinação dos atributos, o solo foi coletado na projeção da copa na
profundidade de 0 - 0,2 m. A produtividade (kg planta-1) foi avaliada através de duas colheitas, compreendendo a uma safra. Para as avaliações, inicialmente, foi feita uma
análise exploratória descritiva sem levar em consideração a posição espacial das amostras para a identificação das medidas de posição, dispersão e de pontos discrepantes (outliers), e, posteriormente, uma análise exploratória espacial, levando em consideração a posição das amostras na área para identificação de possíveis tendências. A análise da variabilidade espacial dos atributos estudados foi determinada
pelos semivariogramas escalonados. Por meio do ajuste dos semivariogramas teóricos foram definidos os parâmetros necessários para a estimativa de valores em posições
não amostradas no campo, utilizando o método de interpolação por krigagem ordinária, para a confecção dos mapas que possibilitaram a distinção de regiões com menor e
maior variabilidade dos atributos avaliados. Com os resultados pode-se concluir que a utilização de técnicas da geoestatística possibilita a identificação de zonas diferenciadas do manejo da fertilidade do solo através do mapeamento dos atributos estudados. Todos os atributos apresentam estrutura de dependência espacial com grau
de dependência variando entre forte e moderado, com exceção para os teores de P e Mg que apresentam efeito pepita puro e AG que ajusta-se ao modelo linear. A
regressão múltipla linear identifica o K, Ca e Mg, respectivamente, como sendo os atributos químicos de maior influência na determinação da produtividade, e o mapa da
produtividade da pimenta-do-reino predito pela regressão múltipla espacial mostra comportamento espacial similar com o mapa da produtividade da cultura estimado por krigagem.
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Manejo de fusariose em pimenta-do-reino cv. BragantinaGomes Filho, José 29 September 2017 (has links)
The Black pepper (Piper nigrum L.) is a spice of great economic value, consumed worldwide. In Brazil, its production has been limited by the fusariosis, the main disease of the crop, caused by the fungus Fusarium solani f. sp. piperis, causing the reduction of the plantations in the field and until the plant death. Considering the difficulties and limitations in controlling this disease, the search for new alternative control methods has become quite promising in the country's producing areas. Thus, the objective of this work was to evaluate the effect of essential oils, plant extracts and organic matter in the control of fusariosis in black pepper. Two in vitro experiments were carried out at the Phytopathology Laboratory of the Agricultural Sciences Center of the Federal University of Alagoas (CECA / UFAL): the first evaluated the effect of essential oils of neem, spearmint, copaiba, eucalyptus, coconut and garlic in different (6 x 4) + 2. The second one, which evaluated the effect of the crude aqueous extracts (EBA) at the concentrations of 5, 10, 10, 15, 25 and 50 μL.mL-1, 15 and 20%, with a completely randomized experiment in a factorial scheme (5 x 4) + 2, both with six replicates, on the inhibition of mycelial growth of the pathogen in BDA medium. From the best "in vitro" results, an experiment was carried out with Pepper worm seedlings inoculated with F. solani mycelium discs, which were sprayed with 20 mL of the essential oils of mint and neem at doses of 50 and 75 μL.mL-1 and with the crude aqueous extracts of caetano-melon and cassava in concentrations of 10 and 15%. The fungicide was brushed in the stems of the pulp-shaped plants at a dose of 0.2 g. 100 mL-1. The design was completely randomized, with ten treatments and five replicates. In another experiment, organic residues of coconut husk, cassava husk, eucalyptus leaves, neem and black pepper were evaluated at a dose of 25, 50, 75 and 100 g.Kg-1 were incorporated into the soil for the control of fusariosis in pepper plants, being evaluated at 30, 60 and 90 days after inoculation of the pathogen with a suspension of 1.8 x 10-6 con/mL. The data were submitted to analysis of variance and regression and the means were compared by the Tukey test at the 5% probability level. Essential oils of peppermint and neem (50 and 75 μL.mL-1) and extracts of melon-de-cassetane and cassava (10 and 15%) provided the highest percentages of mycelial inhibition (91.61, 100, 41.74, 45.96, 61.01, 57.61, 51.53 and 55.48%), respectively. The EBA of caetano melon (15%) and the essential oil of mint (75 μL.mL-1), promoted the lowest disease rate, with 24 and 28% respectively. Organic residues of cassava husk and neem leaves were the most efficient in the control of fusariosis at 30, 60 and 90 days. / A cultura da pimenta-do-reino (Piper nigrum L.), é uma especiaria de grande valor econômico, consumida mundialmente. No Brasil sua produção vem sendo limitada pela fusariose, principal doença da cultura, provocada pelo fungo Fusarium solani f. sp. piperis, causando a redução dos plantios no campo e até a morte da planta. Considerando as dificuldades e limitações no controle desta doença, a busca por novos métodos de controle alternativos vem se tornando bastantes promissores nas áreas produtoras do país. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de óleos essenciais, extratos vegetais e matéria orgânica no controle da fusariose em pimentado-reino. Foram instalados dois experimentos “in vitro” no Laboratório de Fitopatologia do Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal de Alagoas (CECA/UFAL): o primeiro avaliou o efeito de óleos essenciais de nim, hortelã, copaíba, eucalipto, coco e alho em diferentes doses de 25, 50, 75 e 100 µL.mL-1, em delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial (6 x 4) + 2. O segundo, avaliou o efeito dos extratos brutos aquosos (EBA) nas concentrações de 5, 10, 15 e 20%, com experimento inteiramente casualizado em esquema fatorial (5 x 4) + 2, ambos com seis repetições, sobre a inibição do crescimento micelial do patógeno em meio BDA. A partir dos melhores resultados “in vitro” foi realizado um experimento com mudas de pimenta-do-reino inoculadas com discos de micélio de F. solani, que foram pulverizadas com 20 mL dos óleos essenciais de hortelã e nim, nas doses de 50 e 75 µL.mL-1 e com os extratos brutos aquosos de melão-de-são caetano e mandioca nas concentrações de 10 e 15%. O fungicida foi pincelado nos caules das plantas em forma de pasta na dose de 0,2 g.100 mL-1. O delineamento foi inteiramente casualizado, com dez tratamentos e cinco repetições. Em outro experimento, avaliou-se os resíduos orgânicos de casca de coco, casca de mandioca, folhas de eucalipto, nim e de pimenta-do-reino nas doses de 25, 50, 75 e 100 g.Kg-1 incorporadas ao solo para o controle da fusariose em mudas de pimenta-do-reino, sendo avaliadas aos 30, 60 e 90 dias após a inoculação do patógeno com uma suspensão de 1,8 x 10-6 con/mL. Os dados foram submetidos à análise de variância e de regressão e as médias comparadas pelo teste de Tukey ao nível de 5% de probabilidade. Os óleos essenciais de hortelã e nim (50 e 75 µL.mL-1) e os extratos de melão-de-são caetano e mandioca (10 e 15%) proporcionaram os maiores percentuais de inibição micelial (91,61, 100, 41,74, 45,96, 61,01, 57,61, 51,53 e 55,48%), respectivamente. O EBA de melão-de-são caetano (15%) e o óleo essencial de hortelã (75 µL.mL-1), promoveram os menores índice de doença, com 24 e 28% respectivamente. Os resíduos orgânicos de casca de mandioca e folhas de nim foram os mais eficientes no controle da fusariose aos 30, 60 e 90 dias.
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Método de identificação de genes taxonomicamente restritos em dados de RNA-seq em organismo não modeloOLIVEIRA, Lorena Silva de 28 September 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-09-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A pimenta do reino (Piper nigrum) é uma planta de alto interesse biotecnológico, alvo de pesquisas tanto para a exploração do metabolismo quanto para o melhoramento relacionado a problemas fitopatológicos, além do entendimento da evolução das angiospermas basais, grupo ancestral ao qual ela pertence. O avanço nos métodos de sequenciamento de nova geração proporcionou o acesso ao patrimônio genético de plantas não modelo possibilitando a abertura de novas perspectivas biotecnológicas. A identificação de genes não homólogos restritos a certas espécies, denominados genes taxonomicamente restritos (GTRs), é um alvo biotecnológico prioritário, especialmente em espécies e grupos divergentes e ancestrais. Este trabalho tem por objetivo estabelecer um método de identificação de GTRs a partir de dados de RNA-seq e de validar a abordagem num conjunto de dados de pimenta do reino. O método consiste na filtragem de transcritos em várias etapas, de forma que os transcritos anotados e os falsos positivos são retirados, e os dados restantes sem informações moleculares são classificados como potenciais GTRs. A aplicação da abordagem em dados de transcriptoma de pimenta do reino (35.631 transcritos) resultou em 22.661 transcritos anotados por similaridade. Os transcritos não anotados nessa primeira análise foram processados na ferramenta TRAPID, obtendo 12.895 transcritos não anotados. A avaliação dos transcritos para detecção de falsos positivos resultou em 245 transcritos verdadeiros, que foram analisados quando a presença de RNA não codificante, sendo encontrados 204 transcritos sem identificação. Ao final da aplicação do método restaram 71 transcritos não anotados com regiões codificantes de proteínas, assinalados como potenciais GTRs. A caracterização desses potenciais GTRs em pimenta do reino pode fornecer novas informações sobre o mecanismo molecular dessa espécie e talvez elucidar vias para o estabelecimento de cultivares tolerantes a doenças. / Black pepper (Piper nigrum) is a biotechnologically interesting plant, research target for both metabolism exploration and improvement related to phytopathological problems, in addition to understanding the evolution of basal angiosperms, ancestral group to which it belongs. With the technological revolution, the next generation sequencing offered access to genetic heritage of non model plants enabling the opening of new biotechnological perspective. The identification of non homologous genes restricted to certain species, called taxonomically restricted genes (TRGs), is a primary biotechnological target, especially in species and groups that are divergent and ancestral. This study aims to establish a method for TRGs identification from RNA-seq data and to validate the approach a dataset for black pepper. The method consists in filtering the transcripts in several stages, so that the annotated transcripts and false positives are removed, and the remaining data without molecular information are classified as potential TRGs. The application of this approach to a black pepper transcriptome dataset (35,631 transcripts) resulted in 22,661 transcripts annotated by similarity. The transcripts that were not annotated in this first analysis were processed in the TRAPID tool, resulting in 12,895 transcripts not annotated. The evaluation of transcripts for false positive detection resulted in 245 true transcripts that were analyzed for the presence of non-coding RNA, resulting in 204 unidentified transcripts. At the end of the method application 71 non annotated transcripts remained with coding regions of protein, indicating potential TRGs. The characterization of these potential TRGs in black pepper can provide new information about the molecular mechanism of this specie and perhaps elucidate pathways for the establishment of cultivars tolerant to disease.
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