Uma estratégia bem reconhecida para aumentar o pool gênico do trigo consiste na introdução de genes de espécies selvagens afins. Aegilops tauschii Coss. possui muitas características agronomicamente desejáveis, não facilmente encontradas em trigo (Triticum aestivum L. em Thell), tal como a resistência a patógenos. Com o objetivo de aumentar a resistência do trigo cultivado à ferrugem da folha, quatro hexaplóides sintéticos (PF844005, PF964001, PF964004 e PF964009), desenvolvidos a partir do cruzamento de T. durum L. (AABB) X Ae. tauschii (DD), foram cruzados com quatro cultivares brasileiras de trigo (AABBDD - BRSAngico, RS120, BRS209 e CD104). Foram realizadas análises citogenéticas visando avaliar a estabilidade meiótica dos hexaplóides sintéticos, cultivares e suas progênies F1, F2 e RC1F1. Nas cultivares, os índices meióticos variaram de 85,1 a 94,1 indicando uma estabilidade citológica relativamente alta. Três formas sintéticas apresentaram índices meióticos variando de 78,2 a 80,6, o que indica um comportamento meiótico razoavelmente regular. A quarta forma sintética apresentou um índice meiótico estatisticamente mais baixo (40,4). A meiose foi estudada em algumas plantas, mostrando que univalentes e retardatários são as causas da formação de micronúcleos. A freqüência de grãos de pólen viáveis variou de 90,4 a 94,0% para as cultivares, enquanto as formas sintéticas exibiram viabilidade polínica variando de 79,9 a 92,0%. Assim como para o índice meiótico, a comparação das médias gerais mostrou que as freqüências de grãos de pólen viáveis das cultivares são estatisticamente superiores às das formas sintéticas. O efeito da combinação de cruzamento bem como das gerações no índice meiótico e na viabilidade do pólen foi estatisticamente significante. Entretanto, na viabilidade do pólen, houve uma interação significativa entre combinação de cruzamento X geração. Embora a análise estatística não tenha discriminado claramente as combinações genotípicas, uma tendência foi evidenciada nos dados de viabilidade do pólen e índice meiótico, sendo que os cruzamentos envolvendo a cultivar CD104 apresentaram repetidamente médias mais elevadas. Por outro lado, as combinações incluindo a cultivar BRS120 apareceram com as médias mais baixas. A resposta à raça SPJ-RS de Puccinia triticina foi avaliada ao longo das gerações. Oito combinações genotípicas exibiram resistência à ferrugem da folha em todas as gerações. Estes resultados confirmam que Ae. tauschii pode ser usado como fonte de recursos genéticos para aumentar a resistência à ferrugem da folha em cultivares comerciais, usando linhas hexaplóides sintéticas como ponte. O tamanho do grão de pólen foi avaliado nos níveis diplóide (2n=2X=14, Ae. tauschii = T. tauschii, um acesso), tetraplóide (2n=4X=28, T. durum, quatro cultivares) e hexaplóide (2n=6X=42, T. aestivum, quatro cultivares brasileiras e quatro formas sintéticas). Grãos de pólen com o menor diâmetro (39,14 μm) foram encontrados na espécie diplóide Ae. tauschii. Os grãos maiores (55,82 a 59,87 μm) foram observados nas cultivares e sintéticos hexaplóides. Valores intermediários foram apresentados pelas cultivares tetraplóides de T. durum (46,57 a 47,64 μm). Além da associação entre tamanho de pólen e nível de ploidia, foi verificado em todos os genótipos que o diâmetro dos grãos de pólen viáveis foi significativamente maior do que aquele observado para os grãos inviáveis. A detecção de diferenças significativas no diâmetro dos grãos de pólen permitiria o uso de citômetro de fluxo para obter uma estimativa rápida tanto do nível de ploidia como da viabilidade do pólen em Triticum. / One well-recognized means to increase the wheat gene pool is to introduce genes from wild relatives. Aegilops tauschii Coss. posses many agronomically identified desirable characteristics not readily found in wheat (Triticum aestivum L. em Thell), such as resistance to pathogens. Aiming to improve the resistance of cultivated wheat to leaf rust, four synthetic hexaploids (PF844005, PF964001, PF964004 and PF964009), developed from T. durum L. (AABB) and Ae. tauschii (DD), were crossed with four Brazilian commercial wheat cultivars (AABBDD - BRSAngico, RS120, BRS209 and CD104). Cytogenetical analyses were performed aiming to evaluate the meiotic stability of the synthetic hexaploids, cultivars and their F1, F2 and BC1F1 progenies. Meiotic indices varied from 85.1 to 94.1, indicating a relatively high cytological stability of the cultivars. Three synthetic forms presented meiotic indices that varied from 78.2 to 80.6, indicating a quite regular meiotic behavior. The fourth synthetic form presented a statistically lower meiotic index (40.4). Meiosis was studied in some plants, showing that univalents and laggards were the causes of micronuclei formation. The frequency of viable pollen grains varied from 90.4 to 94.0% for T. aestivum cultivars and from 79.9 to 92.0% for synthetic forms. As well as for meiotic index, the comparison between general means showed that the frequencies of viable pollen grains are statistically higher in cultivars than in synthetic forms. The effect of cross combinations as well as generations on the meiotic index and pollen viability was highly significant. However, in pollen viability, statistical analysis showed that interaction between cross combinations and generations, as well as their simple effects were significant. Although the statistical analysis had not clearly discriminated the genotype combinations, there was a clear tendency in pollen viability and meiotic index data, with crosses involving CD104 cultivar showing up repeatedly with higher means. On the other hand, combinations including BRS120 cultivar appeared with the lowest means. The responses to the Puccinia triticina SPJ-RS race were evaluated over generations. Eight genotype combinations exhibited leaf rust resistance in all generations. These results confirm that Ae. tauschii can be used as a good genetic source for improving leaf rust resistance in commercial cultivars, using synthetic hexaploid lines as a bridge. Pollen grain size was evaluated in diploid (2n=2X=14, Aegilops tauschii = T. tauschii, one accession), tetraploid (2n=4X=28, T. durum, four commercial cultivars), and hexaploid (2n=6X=42, T. aestivum, four Brazilian cultivars, and four synthetic forms) levels. The pollen grains with the smallest diameter (39.14 μm) were found in Ae. tauschii, the diploid species. The largest pollen grains (55.82 to 59.87 μm) were observed in the hexaploids T. aestivum and synthetic forms. Intermediate values were presented by tetraploid cultivars of T. durum (46.57 to 47.64 μm). In addition to an association between pollen size and ploidy level, it was found that the mean diameter of viable grains was significantly larger than that of inviable grains for all the genotypes studied. The significant differences detected in pollen diameter could allow the use of particle counters to obtain a rapid estimation of ploidy level as well as pollen viability in Triticum.

Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-08-28T13:51:23Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1340634 bytes, checksum: 6d5684b6c3fbe29e2fe74a363c40243c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-28T13:51:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1340634 bytes, checksum: 6d5684b6c3fbe29e2fe74a363c40243c (MD5) Previous issue date: 2018-02-27 / No norte do estado de Minas Gerais, existe um ecótono formado pela união de três formações vegetais, a Mata Atlântica, o Cerrado e a Caatinga. Esta região está ameaçada pela extração excessiva de madeira e destruição de habitat. Várias espécies de árvores tropicais nativas desta área de ecótono estão em perigo de extinção devido à sobre-exploração e perda de habitat. Cedrela fissilis é uma espécie de árvore nativa do Brasil e distribuída em florestas sazonais e matas ciliares no norte de Minas Gerais. Neste estudo, analisou-se a localização genealógica de uma população do Norte de Minas (PAN) em relação com as duas linhagens conhecidos (leste e oeste) de C.fissilis e, o estudo da estrutura genética e estimativas do sistema reprodutivo. Para obter tecido germinativo de sementes, adequado para extração de DNA, foram testados três métodos de desinfecção, quatro meios de cultura e um substrato comercial para plantas. Os resultados mostraram que a aplicação de técnicas in vitro com desinfecção aumentou germinação por um fator de 3 a 5 vezes, com respeito a não utilização de técnicas in vitro e a dupla desinfecção aumentou o fator de germinação 1,7 no que diz respeito à desinfecção simples. Encontramos altos valores de diversidade genética que diferenciaram a PAN das linhagens Leste e Oeste; assim, pode ser considerado como uma nova fonte de variabilidade dentro de C. fissilis. Os resultados confirmaram C. fissilis como espécie de reprodução cruzada com pequena proporção de autofecundação. PAN apresentou acasalamento entre parentes e população estruturada entre progênies como consequência de desvios do acasalamento ao acaso. Concluímos que as restrições no fluxo genético entre árvores reprodutivas levaram aos altos níveis de diferenciação genéticas observadas na população de PAN. / In northern Minas Gerais state, there is an ecotone formed by the junction of three vegetation formations, Atlantic dry forest, Cerrado, and Caatinga. This region is threatened by over-logging and habitat destruction. Several tropical tree species native to this ecotone are endangered by extinction, subject to overexploitation and habitat loss. Cedrela fissilis is a tropical tree species native to Brazil and distributed in seasonal forests and gallery forests of northern Minas Gerais. In this study, we analyzed the genealogical placement of a population from northern Minas Gerais (PAN) related to the two known lineages (East and West) of C. fissilis and carry out genetic structure and mating system analyses of its offspring. To obtain tissue from seedling suitable for DNA extraction we tested three disinfection methods, four culture media and a commercial substrate for plants. The results showed that the application of in- vitro techniques jointly with disinfection increased the germination by a factor from 3 to 5 with respect to the non-use of in-vitro techniques, and the double disinfection increased the germination by a factor of 1.7 respect of the simple disinfection. We found high values of genetic diversity that differentiate from both the East and West lineages; thus, PAN can be considered as a new source of variability within C. fissilis. The results confirmed that C. fissilis is as an outcrossed species with some proportion of selfing. PAN presented mating among relatives, and population structure among offspring as a consequence of deviations from random mating. We concluded that restrictions to gene-flow among reproductive trees lead to the high levels of genetic differentiation observed in PAN.

One hundred and twenty eight genotypes of common bean (Phaseolus vulgaris L.) divided into local varieties, cultivars and lines both from meso-america and andean gene pool, were evaluated in 2003 and 2004. Several experiments were conducted at Universidade Federal de Santa Maria, State of Rio Grande do Sul, Brazil. Host genetic structure was studied based on reaction on juvenile resistance (V1/V2) to 12 physiological races of Colletotrichum lindemuthianum. Also, the relation among three phonological stages (V1/V2; R4/R5 and R5/R6) of 26 germplasm and the reaction to four races of Colletotrichum lindemuthianum was characterized. The plant reaction, virulence and resistance index were obtained from a 1 to 9 scale. The phenetic analysis was generated from virulence data considering incompatible reaction (0) and compatible reaction (1). Common bean germplasm variability was not coherent to decade of release, origin and gene pool. Higher diversity was observed among local genotypes than commercial ones. Variability of common bean lines was not related to population structure of the pathogen. The absence of Mexican genes (Co-4 and Co-5) was observed in genotypes with resistance index higher that 80%. Higher frequency of resistant genotypes was observed from 1980 to 1990. However, such result was not applied to the wide spread virulence genes. Phenetic data analysis showed that intrinsic diversity was observed among local genotypes of common bean. Specific interactions between genotypes and races were observed as growth stage evolved. / Nos anos de 2003 e 2004, na Universidade Federal de Santa Maria, foram avaliados cento e vinte e oito genótipos de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) locais, cultivares comerciais e linhagens de origem meso-americana e andina, com o objetivo de caracterizar sua estrutura genética quanto à resistência a 12 raças fisiológicas de Colletotrichum lindemuthianum, no estádio juvenil (V1/V2). Destes genótipos, vinte e seis foram selecionados e inoculados em 3 estádios fenológicos (V1/V2; R4/R5 e R5/R6), com 4 raças fisiológicas de C. lindemuthianum, sendo avaliada a proporção de reações resistentes de acordo com a idade da planta. Reações caracterizadas com base em uma escala de notas de severidade de 1 a 9, permitiram calcular os índices de resistência dos genótipos e da virulência das raças. A análise fenética dos dados de virulência foi obtida a partir da construção de uma matriz, considerando as reações incompatíveis (0) e as reações compatíveis (1). A variabilidade em germoplasma de feijão não se mostrou coerente com a década de lançamento, local origem e pool gênico. Não foi observado aumento significativo na proporção de genótipos resistentes entre as décadas de 80 e 90, assim como não houve incremento de alguns genes de virulência especialmente dispersos e abundantes. Genótipos que apresentaram índice de resistência superior a 80% não continham genes Mexicanos (Co-4 e Co-5). Variabilidade em linhagens não se mostrou ligada à estrutura populacional de C. lindemuthianum. A análise fenética mostrou que maior diversidade intrínseca foi observada entre os genótipos locais de feijoeiro comum. Para interações específicas entre genótipos e raças, foi observada variação na resistência relacionada com o envelhecimento da planta.

Submitted by Jadson Francisco de Jesus SILVA (jadson@uefs.br) on 2017-02-15T01:08:04Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o DANIEL DA SILVA DE JESUS - PDF.pdf: 3083183 bytes, checksum: bd6b14e2cc2a38ab54b674866d480292 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T01:08:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o DANIEL DA SILVA DE JESUS - PDF.pdf: 3083183 bytes, checksum: bd6b14e2cc2a38ab54b674866d480292 (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Lamiaceae species have been widely studied due to their antioxidant, antimicrobial and antiviral properties. There is scientific interest in developing technologies for the enhancement of production systems of medicinal plants, given that the low concentration of bioactive compounds is a major obstacle to their economic exploitation. Works with some species have shown that traces metals such as Cd, Cu and Zn, act as abiotic elicitors, directly influencing in the production of bioactive substances. Martianthus leucocephalus (Mart. Ex Benth.) J.F.B. Pastore produces rich essential oil in isobornyl formate with high antimicrobial activity. This work aimed to evaluate the effect of Cd, Cu and Zn stress, on the species through growth, minerals accumulation, essential oil content and its major components, phenolic content and antioxidant enzymes. Furthermore, the phytoremediation potential of this species was observed in the presence of the tested metals. When applied in high concentrations all metals caused sharp reduction in the M. leucocephalus growth, however, was observed that Zn stress caused an increase in the content of volatile compounds. Plant exposure of to milder metals concentrations caused less growth reduction and nutritional unbalance M. leucocephalus. In this case, Cd stress stimulate higher production of volatile compounds. No metal treatment alters the essential oils quality. Cd, Cu and Zn was accumulated in higher concentration in the roots, demonstrating the potential of this species to phytostabilization in contaminated environments. The Cd stress caused an increase in total phenolics concentration, while the peroxidases activity and lipid peroxidation was higher in metals stressed plants. / Esp?cies da fam?lia Lamiaceae t?m sido amplamente estudadas, devido as suas propriedades antioxidantes, antimicrobianas e antivirais. Existe interesse cientifico no desenvolvimento de tecnologias para a potencializa??o de sistemas de produ??o das plantas medicinais, tendo em vista que a baixa concentra??o dos compostos bioativos representa um dos maiores obst?culos para a sua explora??o econ?mica. Trabalhos com algumas esp?cies t?m demonstrado que os metais tra?os, como o Cd, Cu e Zn, atuam como eliciadores abi?ticos, influenciando de forma direta na produ??o de subst?ncias bioativas. Martianthus leucocephalus (Mart. ex Benth.) J.F.B. Pastore ? uma esp?cie que produz ?leo essencial rico em formiato de isobornila, com elevada atividade antimicrobiana. Neste trabalho objetivou-se avaliar o efeito do estresse por Cd, Cu e Zn, sobre a esp?cie, quantificando-se o crescimento, ac?mulo de minerais nas diversas partes da planta, teor de ?leo essencial e de seus componentes majorit?rios, teor de compostos fen?licos e de enzimas antioxidantes. Al?m disso, foi verificado o potencial fitorremediador desta esp?cie, na presen?a dos metais testados. Quando aplicados em elevadas concentra??es todos os metais provocaram forte redu??o no crescimento de M. leucocephalus, entretanto, nestas condi??es apenas o Zn provocou incremento no teor dos compostos vol?teis. A exposi??o das plantas desta esp?cie a concentra??es mais amenas dos metais provocou menor redu??o no crescimento e desbalan?o nutricional de M. leucocephalus. Neste caso, apenas o Cd estimulou maior produ??o de compostos vol?teis, mas nenhum tratamento com metal alterou a qualidade dos ?leos essenciais obtidos. As plantas acumularam Cd, Cu e Zn em maior concentra??o nas ra?zes, demonstrando o potencial da esp?cie para a fitoestabiliza??o desses metais em ambientes contaminados. O estresse por Cd provocou aumento da concentra??o de fen?licos totais, enquanto que a atividade das peroxidases e a peroxida??o lip?dica foi maior nas plantas submetidas aos tr?s metais.

Submitted by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-09-06T17:33:41Z No. of bitstreams: 1 AnneKarenSantosTrindadeDissertacao2017.pdf: 2108662 bytes, checksum: 9f0699c1cd7da128bfec9a40cb258496 (MD5) / Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2017-09-06T17:33:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AnneKarenSantosTrindadeDissertacao2017.pdf: 2108662 bytes, checksum: 9f0699c1cd7da128bfec9a40cb258496 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-06T17:33:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnneKarenSantosTrindadeDissertacao2017.pdf: 2108662 bytes, checksum: 9f0699c1cd7da128bfec9a40cb258496 (MD5) Previous issue date: 2017-03-10 / The bees give a great contribution in maintaining genetic variability of plants from the Cerrado. Tabebuia aurea is a species of the family Bignoniaceae typical of the Cerrado, having large sized bees as its main pollinator. The dispersal of pollen by bees has been well-studied and genomic techniques can facilitate this type of study. This work aimed to develop strategies for the extraction and amplification of DNA from pollen grains of Tabebuia aurea. For this purpose, we collected pollen grains of bee legs caught in Parque Nacional de Bras??lia ??? DF, which subsequently underwent two different techniques of WGA (Whole Genome Amplification). The WGA amplification products were used to amplify 15 microsatellite loci, which were used for characterization of the genetic diversity of the pollen grains. The amplified fragments were separated by capillary electrophoresis in an automatic sequencer and the results were analyzed using the program Geneious. Twenty-two trees were evaluated and the characterization of the allelic diversity was held for groups of pollen grains, each containing 20 grains, from 31 bees; single pollen grains were also evaluated. The WGA technique OmnPlex was the one that produced the largest amount of genomic DNA allowing the amplification of different microsatellite loci. Using the DNA obtained by this technique as a template, all groups of pollen grains showed high rate of polymorphism with 10 or more alleles per locus. In addition, it was observed that most of the bees carry pollen from only one donor, indicating that bees remain for a long time in the same tree. / As abelhas d??o uma grande contribui????o na manuten????o da variabilidade gen??tica de plantas do Cerrado. Tabebuia aurea ?? uma esp??cie da fam??lia Bignoniaceae, t??pica do Cerrado, tendo as abelhas de grande porte como seu principal polinizador. A dispers??o de gr??os de p??len por abelhas vem sendo bastante estudada e as t??cnicas da gen??mica podem facilitar esse tipo de estudo. Este trabalho teve como objetivo desenvolver estrat??gias para a extra????o e amplifica????o de DNA de gr??os de p??len de Tabebuia aurea. Para isto, foram coletados gr??os de p??len das patas de abelhas capturadas no Parque Nacional de Bras??lia ??? DF, que posteriormente foram submetidos a duas t??cnicas diferentes de WGA (Whole Genome Amplification). Os produtos da amplifica????o WGA foram utilizados para amplificar 15 locos microssat??lites, os quais foram usados para caracteriza????o da diversidade al??lica dos gr??os de p??len. Os fragmentos amplificados foram separados por eletroforese capilar em um sequenciador autom??tico e os resultados foram analisados utilizando o programa Geneious. Foram avaliadas 22 ??rvores e a caracteriza????o da diversidade al??lica foi realizada para conjuntos de gr??os de p??len, cada um contendo 20 gr??os, provenientes de 31 abelhas; foram avaliados tamb??m gr??os de p??len ??nicos. A t??cnica WGA OmnPlex foi aquela que produziu a maior quantidade de DNA gen??mico permitindo a amplifica????o espec??fica dos diferentes locos microssat??lites. Utilizando o DNA obtido por essa t??cnica como molde, todos os grupos de gr??os de p??len apresentaram alta taxa de polimorfismo com 10 ou mais alelos por loco, al??m disso, observou-se que a maioria das abelhas carregavam gr??os de p??len de apenas um doador, indicando que as abelhas permanecem por muito tempo em uma mesma ??rvore.

Made available in DSpace on 2017-03-14T14:10:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-30. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-14T14:42:52Z : No. of bitstreams: 1 000878431.pdf: 1090904 bytes, checksum: 9ac29a02b8e1f613702baf21dcc23948 (MD5) / É sabido que a utilização de marcadores moleculares em programas de melhoramento constitui uma ferramenta importante, pois permite identificar indivíduos superiores em fases juvenis, acelerando o processo de desenvolvimento de cultivares. A ferrugem marrom é uma doença causada pelo fungo Puccinia melancephala responsável por grandes prejuízos no setor canavieiro. Recentemente foram desenvolvidos marcadores moleculares, 9020-F4 e R12H16, os quais flanqueiam o maior gene de resistência à ferrugem marrom, conhecido como Bru1. O presente trabalho objetivou determinar a frequência do gene Bru1 em acessos exóticos de cana-de-açúcar, cultivares brasileiras e clones do Programa IAC bem como avaliar a sua eficiência na identificação de genótipos resistentes. Através da reação de PCR utilizando os marcadores, foi possível inferir a frequência do gene Bru1, e comparar esses resultados com a classificação fenotípica das cultivares brasileiras e clones IAC (IAC, CTC, SP e RB), quanto à suscetibilidade a doença. Além disso, foi conduzido um experimento em casa de vegetação, utilizando acessos de Saccharum spontaneum, Saccharum sinense e Saccharum robustum, os quais foram inoculados artificialmente com o fungo Puccinia melanocephala e avaliados semanalmente visando determinar o grau de suscetibilidade à ferrugem marrom. Posteriormente, os resultados obtidos foram comparados com a presença ou ausência do gene Bru1. Nas cultivares brasileiras a frequência do gene Bru1 foi alta, 75,21%, porém nos acessos exóticos foi de apenas 18 %. Verificou-se que grande parte das cultivares que possuem o gene Bru1 é classificada como resistente. Nos acessos exóticos inoculados artificialmente, a correlação entre a presença dos marcadores indicativos do gene Bru1 com as notas de severidade foi baixa e não significativa, provavelmente devido à presença de outra fonte de resistência... / It is known that the use of molecular markers is an important tool which allows the identification of superior individuals in juvenile stages speeding up the cultivar development process. Sugarcane brown rust caused by the fungus Puccinia melanocephala is among the most important sugarcane diseases. Recently, two diagnostic molecular markers (R12H16, 9O20-F4) flanking the Bru1 gene, which is pointed as the major gene conferring brown rust resistance reported for sugarcane today were publish in the literature. The present study aimed to determine the frequency of the Bru1 gene in sugarcane exotic accessions, Brazilian varieties and elite clones from IAC program as well as to evaluate the efficiency of these markers to identify resistant genotypes. By using the Bru1 markers, it was possible to infer the frequency of Bru1 gene, and compare the results with the phenotypic classification of sugarcane Brazilian varieties and IAC clones (IAC, CTC, SP and RB) for susceptibility to the disease. Moreover, S. spontaneum, S. sinense and S. robustum accessions were artificially inoculated with the fungus P. melanocephala and weekly evaluated in greenhouse conditions. The degree of brown rust susceptibility of the accessions was compared with the presence or absence of Bru1 gene markers. The frequency of the Bru1 gene in the Brazilian varieties was high (75.21%) while only 18% of the sugarcane exotic accessions showed the Bru1 gene. Most of the varieties that presented the gene were classified as resistant. Low marker-phenotypic correlation was observed for the artificially inoculated sugarcane exotic accessions, probably due to the presence of other sources of resistance or failure of the sequence complementarity of the primers in the genome of these accesses. Generally these markers proved to be efficient in the selection of genotypes resistant to brown-rust

Submitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-02-06T20:08:28Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Natalice de Siqueira - 2014..pdf: 2279133 bytes, checksum: 6e154dbf06fec9fd7fd142269ced0028 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-02-19T14:38:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Natalice de Siqueira - 2014..pdf: 2279133 bytes, checksum: 6e154dbf06fec9fd7fd142269ced0028 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-19T14:38:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Natalice de Siqueira - 2014..pdf: 2279133 bytes, checksum: 6e154dbf06fec9fd7fd142269ced0028 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-08-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Eugenia klotzschiana Berg is a species of Myrtaceae with restricted distribution in the Cerrado. Its fruits present nutritional potential and can be used in extractive way, as raw material for production of jams, jellies and juices. In this context, it is necessary to evaluate population-genetic aspects in order to provide information to assist in targeting strategies for management and conservation. To assess the genetic variability in a population context microsatellite markers have been used in recent years. The sequences flanking the microsatellite regions of the genome are highly conserved between related species, enabling the portability of these markers, reducing thereby the costs of developing the same for each species under study. In this context, the aim of this study was to test the potential for transferability to the genome of E. klotzschiana of genic microsatellite markers developed for Eucalyptus, as well as to characterize the genetic variability in their populations. For this purpose, DNA was extracted from leaf tissue of E. klotzschiana individuals and used to test the cross 120 pairs of amplification primers. Samples from seven locations were used to characterize the population genetic variability. The amplification products were analyzed on agarose and polyacrylamide capillary electrophoresis gel in different stages. Of total primers tested, 67 (55.83%) did not amplify, 42 (35%) had many nonspecific amplification products and 11 (9.2%) were successfully transferred. Of the 11 transferred eight showed polymorphism. For the eight polymorphic markers, the probability of identity was high (2.02 x10-3) and the power of paternity exclusion was moderated (0.74). In this population the average value of expected heterozygosity (He) was 0.28 and observed heterozygosity (Ho) was 0.44, as in subpopulations of He mean values ranged from 0.18 to 0.27 and the mean values Ho ranged from 0.36 to 0.53, respectively. No significant for the fixation index (f) were observed in the populations values indicating allele frequencies below the expected Hardy-Weinberg proportions.The extent of genetic divergence among subpopulations showed relatively high genetic differentiation, with a value of θ equal to 0.20, and peerto- peer values ranging between 0.00 and 0.34. The strategy of transferability of microsatellite markers was efficient to generate a panel of polymorphic microsatellite markers and learn a little of the genetic variability of the species. It was possible to verify that there is a low genetic variability within subpopulations for biomarkers. However, this work is a starting point for future studies to better understand the reproductive biology of the species Eugenia klotzschiana. / Eugenia klotzschiana Bergé uma espécie da família Myrtaceae com distribuição restrita no Cerrado. Seus frutos apresentam potencial alimentício e podem ser utilizados de forma extrativista,como matéria-primapara produção de doces, geleias e sucos. Neste contexto, torna-se necessário a avaliação de aspectos genético-populacionais a fim de disponibilizar informações que auxiliem no direcionamento de estratégias de manejo e conservação. Marcadores microssatélites têm sido utilizados nos últimos anospara avaliar a variabilidade genética em um contexto populacional. As sequências que flanqueiam as regiões microssatélites no genoma encontram-se altamente conservadas entre espécies relacionadas, o que possibilita a transferibilidade destes marcadores, reduzindo, desta forma, os custos de desenvolvimento dos mesmos para cada uma das espécies que se pretende estudar. Nesse contexto, o objetivo do presente estudo foi testar o potencial de transferibilidade para o genoma de Eugenia klotzschiana, de marcadores microssatélites gênicos desenvolvidos para Eucalyptus, assim como caracterizar a variabilidade genética existente em suas populações. Para tanto, o DNA foi extraído a partir de tecido foliar de indivíduos de E. klotzschianae utilizado para testar a amplificação cruzada de 120 pares de primers. Amostras oriundas de sete localidades foram utilizadas para a caracterização da variabilidade genética populacional. Os produtos de amplificação foram analisados em gel de agarose, poliacrilamida e emeletroforese capilar, em diferentes etapas. Do total deprimers testados, 67 (55,83%) não amplificaram, 42 (35%) apresentaram muitos produtos de amplificação inespecíficos e 11 (9,2%) foram considerados transferidos com sucesso. Dos 11 transferidos, oito apresentaram polimorfismo. Para os oito marcadores polimórficos, a probabilidade de identidade foi alta (2,02x10-3) e o poder de exclusão de paternidade foi moderado (0,74). Na população, o valor médio da heterozigosidade esperada (He) foi de 0,28 e a heterozigosidade observada (Ho) foi de 0,44, já nas subpopulações os valores médios de He variaram de 0,18 a 0,27 e os valores médios de Ho variaram de 0,36 a 0,53.Não foram observados valores significativos para o índice de fixação (f) nas subpopulações, indicando que as frequências alélicas seguem as proporções esperadas pelo equilíbrio de Hardy-Weinberg. A medida de divergência genéticaentre as subpopulações apresentou diferenciação genética relativamente alta,com valor de θigual a0,20, e com valores par-a-par variando entre 0,00 e 0,34. A estratégia de transferibilidade de marcadores microssatélites foi eficiente para gerar um painel de marcadores microssatélites polimórficos e conhecer um pouco da variabilidade genética da espécie. Foi possível verificar que existe uma baixa variabilidade genética dentro das subpopulações para os marcadores avaliados. Todavia, esse trabalho é um ponto de partida para futuros estudos que permitam conhecer melhor a biologia reprodutiva da espécie Eugenia klotzschiana.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-18T13:55:45Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexandre Lopes Pimentel - 2001.pdf: 2600476 bytes, checksum: 34c037bb591d8dbf3b4ea3bf4da41be6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-18T13:56:01Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexandre Lopes Pimentel - 2001.pdf: 2600476 bytes, checksum: 34c037bb591d8dbf3b4ea3bf4da41be6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-18T13:56:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexandre Lopes Pimentel - 2001.pdf: 2600476 bytes, checksum: 34c037bb591d8dbf3b4ea3bf4da41be6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2001-08-30 / The main objective of this work is to compare different testes to evaluate for combining ability a group of unselected lines. Twenty eight lines from the CMS 04C population and six testers were used. The testers were the BR105 population, three imbreed lines from the BR105, one single cross proceeding from crossing of two of the used lines as testers and the EMGOPA 501 population. Because of the limited amounts of seeds, the topcrosses of the 20 from the 28 lines were evaluated in two places. The incomplete block design with two common treatments and three replicates were used for the topcrosses evaluation. The trials were installed in 2000/01 season, in the experimental stations of the Planagri company, in Goianésia-Goiás, and at the Escola de Agronomia of Universidade Federal de Goiás, in Goiânia-Goiás.The diallel analysis followed the model of Griffing (1956), adapted by Geraldi & Miranda Filho (1988). The correlations of Spearman, percentage of coincidence based in selection intensity and the variances between topcrosses were used, to compare the testers. It wasn’t observed consistency of the lines rank among the testers and not even for each tester between the two places. The results were different for each place. In Goianésia, the BR105 population, that got greater estimative of General Combining Ability, was the most convenient tester to discriminate the lines. However, in Goiânia, the EMGOPA 501 population, that got the lowest estimative of General Combining Ability, was the most convenient tester to evaluate the lines. In the combined analysis of the two places, the EMGOPA was only able to discriminate the lines. Some lines were superior in hybrid combining and some crossings will have to be evaluated in other environments to confirm its good performance. / Esse trabalho teve como objetivo principal comparar diferentes testadores para avaliar um grupo de linhagens não selecionadas. Foram utilizadas 28 linhagens provenientes da população CMS04C e seis testadores. Os testadores utilizados foram a população BR105, três linhagens endogâmicas provenientes da população BR105, um híbrido simples obtido pelo cruzamento de duas das linhagens usadas como testadores e a população EMGOPA 501. Devido às quantidades de sementes obtidas, somente os “topcrosses” de 20 das 28 linhagens puderam ser avaliados em dois locai. Foi utilizado o delineamento de blocos incompletos com dois tratamentos comuns e três repetições para as avaliações dos “topcrosses”. Os ensaios foram instalados na safra 2000/01, nas estações experimentais da empresa Planagri S.A., em Goianésia-GO, e da Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás, em Goiânia-GO. A análise dialélica seguiu o modelo de Griffing (1956), adaptado por Geraldi & Miranda Filho (1988). Foram utilizadas as correlações de Spearman, porcentagem de coincidência em função da intensidade de seleção e as variâncias entre “topcrosses”, para comparar os testadores. Em geral, não houve consistência das classificações das linhagens entre os testadores e nem mesmo para cada testador entre os dois locais. Os resultados obtidos foram diferentes para os dois locais. Em Goianésia, a população BR105, que obteve a maior estimativa de CGC, foi o testador mais adequado para discriminar as linhagens. Já em Goiânia, foi a população EMGOPA 501, que obteve a menor estimativa de CGC, o testador mais indicado para avalia-las. Na análise conjunta dos dois locais, somente a população EMGOPA 501 foi capaz de discriminar as linhagens. Algumas linhagens que se destacaram em combinações híbridas e alguns cruzamentos deverão ser avaliados em outros ambientes para confirmar o seu bom desempenho.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-05T17:35:36Z No. of bitstreams: 2 Moçambique, Pedro Antonio - 2010.pdf: 1847856 bytes, checksum: 913aad73e5dbc897fff5c2698ba75f38 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-05T17:35:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Moçambique, Pedro Antonio - 2010.pdf: 1847856 bytes, checksum: 913aad73e5dbc897fff5c2698ba75f38 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2010-08-31 / Common beans (Phaseolus vulgaris L.) are widely cropped in Brazil, the largest world consumer. P. Vulgaris species is an important source of proteins in the human diet in developing countries in tropical and sub tropical regions, especially in the Americas and West Africa. To know the genetic diversity among commercial and Creole cultivars is very useful to breeders because it allows an adequate organization of the genetic resources and a better exploitation of the available genetic diversity. The objective of this work was to identify the genetic diversity among and into Carioca type common bean accesses stored in the Active Germplasm Bank at Embrapa Arroz e Feijão. The experimental design was a completely randomized bloc with three replicates and carried out at the same institution in the municipality of Santo Antônio de Goiás with the following geographical coordinates: 16.30´S; 49.17´W at 814 m altitude. The evaluation was performed based on fifteen morphoagronomic qualitative descriptors and fifteen quantitative descriptors as well. Nine out of fifteen descriptors were uniform in all accesses. The quantitative descriptors were analyzed using canonical variate analysis; the agglomerative clustering method of Ward, and the univariate variance analysis associated with the Tukey test to evaluate the effect of clustering on the variables and to compare the means of the groups among them. Through the canonical variate analysis it was possible to discard three variables with little contribution to the total phonotypical variability among the accesses. Taking in account the twelve variables left, it was necessary to consider the first five canonical variables to explain 68% of the total variance. Even though the dispersion plot of the accesses related to the two first canonical variables (57%) evidenced phonotypical variability in the accesses studied. Variables flowering days, number of locules per pods and pod beak length were considered the most discriminatory. Accesses CF870015 and CF 830128 were identified as the most diverging between themselves. Through cluster analysis, using the fifteen quantitative descriptors, six similar groups were established. Observing the average of the phenotypic characteristics of each group and the dispersion of the accessions, it was observed concordance between the canonical variate analysis and clustering. Based on the analysis of variance of the quantitative descriptors, the variables leaf width, number of pods per plant, pod beak length and number of locules per pods indicate non significant difference, while the other variables presented highly significant differences at the 5% level. / O feijão (Phaseolus vulgaris L.) é uma cultura amplamente difundida no Brasil, que é o maior produtor e consumidor mundial. A espécie P.vulgaris representa uma importante fonte protéica na dieta humana dos países em desenvolvimento das regiões tropicais e subtropicais, particularmente nas Américas e no leste e sul da África. O conhecimento da diversidade genética entre as cultivares comerciais e crioulas é útil aos melhoristas, por permitir melhor organização dos recursos genéticos e maior aproveitamento da diversidade genética disponível. O objetivo deste trabalho foi identificar a existência de diversidade entre e dentro dos acessos de feijão comum de tipo grão Carioca armazenados no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com três repetições, e foi realizado na área experimental da Embrapa Arroz e Feijão, localizada no município de Santo António de Goiás, com coordenadas geográficas 16,30´S, 49,17´W e 814 m. Os acessos foram avaliados com base em quinze descritores morfoagronômicos qualitativos e quinze quantitativos. Em nove, dos quinze descritores qualitativos foram uniformes em todos os acessos. Os descritores quantitativos foram analisados utilizando-se a análise de variáveis canônicas; o método de agrupamento aglomerativo de Ward; e a análise de variância univariada, associada ao teste de Tukey, para avaliar os efeitos dos grupos sobre as variáveis e comparar as médias dos grupos entre si. Pela análise de variáveis canônicas, foi possível descartar três variáveis que pouco contribuíram para a variabilidade fenotípica total entre os acessos. Considerando-se as doze variáveis restantes, foram necessários as três primeiras variáveis canônicas para explicar 68% da variância total. Mesmo assim, o gráfico de dispersão dos acessos em relação as duas primeiras variáveis canônicas (57%) evidenciou variabilidade fenotípica existente nos acessos. As variáveis dias de floração, número de lóculos por vagem e comprimento do dente apical, foram consideradas como os mais discriminantes. Os acessos CF870015 e CF830128 foram identificados como os mais divergentes entre si. Pela análise de agrupamento, utilizando-se os quinze descritores quantitativos, foram estabelecidos seis grupos de similaridade. Observando-se as médias das características fenotípicas de cada grupo, e a dispersão dos acessos, verificou-se concordância entre as análises de variáveis canônicas e de agrupamento. Pela análise de variância dos descritores quantitativos, os variáveis largura foliar, número de vagens por planta, largura da vagem, comprimento do dente apical, e número de lóculos por vagem, indicaram diferença não significativa, enquanto que as outras variáveis apresentaram diferença altamente significativa ao nível de significância 5%.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-05T17:48:20Z No. of bitstreams: 2 Chaves, Sivany Rodrigues - 2005.pdf: 4355157 bytes, checksum: b939ddc1c468c5979f9e561e5ea8bd22 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-05T17:48:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Chaves, Sivany Rodrigues - 2005.pdf: 4355157 bytes, checksum: b939ddc1c468c5979f9e561e5ea8bd22 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2005-08-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The species Caryocar brasiliense Camb. (pequizeiro) is a common tree fruitful in the Brazilian savannah (Cerrado) with great economic and social potential. The objective of this study goals the increase of information for an efficient breeding program for specie domestication and conservation. Eleven natural populations of “pequizeiro”, 30 individuals each, was sampled on five different regions of Goiás state. The genetics structure of these natural populations was analyzed based on variability at eight microsatellite loci in about 330 individuals. The number of alleles per locus it varied of 22 to 32 (mean = 28). The waited and observed heterozigosity varied of 0,843 to 0,920 and 0,546 to 0,758, respectively. Measures of genetic differentiation indicated significant differences between most populations (FST = 0,064 and RST = 0,439). RST values among samples were high and much higher than FST indicating a divergence between the model that consider alleles to be identical by descent, and the model of identity by state in these populations. Estimated number of migrants was high, Nm = 3,63 (mean), and the existence of private alleles indicated reduced gene flow and a consequently possible damage to the metapopulations structure. Significant correlation was not found between geographical distance and measure of genetic divergence, suggesting the intense gene flow in the past that joined the populations that are separated today. / O pequizeiro (Caryocar brasiliense Camb) é uma espécie frutífera do Cerrado brasileiro que possui grande potencial econômico e social. Este estudo visa o acúmulo de informações para um programa eficiente de domesticação da espécie e sua conservação. Onze populações naturais de pequizeiro, contendo 30 indivíduos cada, foram amostradas em cinco regiões diferentes do Estado de Goiás. A estrutura genética dessas populações foram avaliadas utilizando a variação de oito locos microssatélites, em cerca de 330 indivíduos. O número de alelos por loco variou de 22 a 32 (media de 28). As heterozigosidades esperada e observada variaram de 0,843 a 0,920 e de 0,546 a 0,758, respectivamente. Medidas da diferenciação genética indicaram diferenças significativas entre as populações (FST = 0,064 e RST = 0,439). Os valores de RST entre as amostras foram altos e muito maiores que FST indicando uma divergência entre o modelo que considera os alelos serem idênticos por descendência e o modelo de identidade por estado nestas populações. O número estimado de migrantes foi elevado, Nm = 3,63 na média. Não foi encontrada correlação significativa entre as distâncias geográficas e as medidas de diversidade genética, sugerindo que provavelmente ocorreu um intenso fluxo no passado unindo as populações hoje separadas.