Thesis (M.S.); Submitted to Iowa State Univ., Ames, IA (US); 12 Dec 2003. / Published through the Information Bridge: DOE Scientific and Technical Information. "IS-T 2547" Elizabeth M. Lenihan. 12/12/2003. Report is also available in paper and microfiche from NTIS.

Diss. (sammanfattning) Göteborg : Univ., 2009. / Härtill 4 uppsatser.

Thesis (M.P.H.)--University of Texas Health Science Center at Houston, School of Public Health, 2008. / Source: Masters Abstracts International, Volume: 46-05, page: 2641. Advisers: Jan Bressler; Raol Caetano. Includes bibliographical references.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 562430 bytes, checksum: 182da810cb5c6524a339ad2ea7c37142 (MD5) Previous issue date: 2014-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In plant breeding, when the objective is to select or recommend genotypes to be planted, the study of the interaction between genotype and environment plays a important role. However, this kind of study does not provide detailed information on the behavior of each cultivar due to environmental variations. Thus become necessary to perform analyzes of stability and adaptability for identification and recommendation superior materials in different environments. Although the literature presents several methods for performing analysis of adaptability and stability, none of them take account of the presence of non-normal phenotype, in other words, phenotypic values asymmetric distributions or heavy tails. Thus, if there is the presence of such phenotypic values, the methods can be influenced and the recommendation may be mistaken, that is, the use of such methods cause inadequate estimates that do not reflect the true relationship between the variation environmental and phenotypic response. An interesting solution for treating this problem in a unified way, that is, the presence of outliers or asymmetry is to use the quantile regression (QR). Such methodology, besides the usual regression methods, using the conditional mean to explain the functional relationship between environmental variation and phenotypic response, makes use of conditional quantile functions. This way the QR possible to choose the quantile which best represents the functional relationship of interest in order to naturally cover the lack of normality cited above. Thus, this paper aims to present the methodology of quantile regression, through a detailed discussion of its theorical foundations, demonstrating it by concrete applications, its use in analysis of adaptability and stability, thus providing a easily and accessible material for readers interested in that subject, contributing researchers and those interested in this area. To the technic evaluation symmetric distributions phenotypic values, symmetric with outliers, right asymmetric, right asymmetric with outliers, left asymmetric and left asymmetric with outliers were simulated. Furthermore, we used data from an experiment on dry matter yield of 92 genotypes of alfalfa (Medicago sativa) evaluated in 20 environments. It is suggested that, for symmetrical phenotypic values should be determined if it has outlier, if it has a QR ( τ = 0,50 ) should be used, if not, should be used either Eberhart and Russell methodology (1966) or QR ( τ = 0,50 ). Since the phenotype is asymmetric, with or without the presence of outlier, it uses QR ( τ = 0,25 ) to right asymmetry and QR ( τ = 0,75) to the left asymmetry. According to the results the QR method was efficient for classifying alfalfa genotypes. / No melhoramento genético de plantas, quando o objetivo é selecionar ou recomendar genótipos para o plantio, o estudo da interação entre genótipo x ambiente é de extrema importância. Entretanto, tal estudo não fornece informações pormenorizadas sobre o comportamento de cada cultivar diante das variações ambientais. Assim, tornam-se necessárias as análises de adaptabilidade e de estabilidade para a identificação e recomendação de materiais superiores em diferentes ambientes. Embora a literatura apresente diversos métodos, para realização da análise de adaptabilidade e estabilidade, nenhum leva em consideração a presença de fenótipos não normais, ou seja, distribuições de valores fenótipos assimétricos ou com caudas pesadas. Desta forma, caso haja a presença desse tipo de valores fenotípicos, os métodos podem sofrer a influência de modo que a recomendação pode ser errônea, ou seja, o uso de tais métodos ocasionam estimativas inadequadas, que não refletem a verdadeira relação existente entre a variação ambiental e a resposta fenotípica. Uma solução interessante para tratar este problema de maneira unificada, isto é, a presença de pontos discrepantes ou assimetria, é a utilização de regressão quantílica (RQ). Tal metodologia, diferentemente dos métodos de regressão usuais, que utilizam a média condicional para explicar a relação funcional entre a variação ambiental e a resposta fenotípica, faz uso de funções quantílicas condicionais. Desta forma, a RQ possibilita escolher o quantil que melhor representa a relação funcional de interesse com o intuito de contemplar naturalmente a mencionada falta de normalidade. Desta forma, o presente trabalho tem como objetivo apresentar a metodologia de regressão quantílica, através de uma discussão detalhada de seus fundamentos teóricos, evidenciando, com aplicações concretas, seu uso em análise de adaptabilidade e estabilidade, fornecendo assim um material de fácil acesso para leitores interessados no assunto, contribuindo com pesquisadores e interessados nesta área. Para avaliação da técnica foram simulados valores fenotípicos, com distribuições simétrica, simétrica com outliers, assimétrica à direita, assimétrica à direita com outliers, assimétrica à esquerda e assimétrica à esquerda com outliers. Além disso, foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produção de matéria seca de 92 genótipos de alfafa (Medicago sativa) avaliados em 20 ambientes. Sugere-se que, para valores fenotípicos simétricos deve-se averiguar se este possui outlier, se sim é utilizada ou a regressão não paramétrica ou a RQ (τ = 0,50) , se não, se utiliza ou a metodologia de Eberhart e Russell (1966) ou a RQ (τ = 0,50) . Já se o fenótipo for assimétrico, com ou sem a presença de outlier, utiliza-se RQ (τ = 0,25) para assimetria a direita e RQ (τ = 0,75) para assimetria à esquerda. De acordo com os resultados encontrados a RQ foi eficiente para classificação de genótipos de alfafa.

Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: As espécies nativas podem ser utilizadas para diversos usos em sistemas de produção, bem como para recuperação ambiental. Porém, poucas dessas espécies são exploradas economicamente devida à falta de oferta de sementes com qualidade genética no mercado. De maneira geral, a caracterização genética de populações e a seleção de indivíduos mais produtivos a partir de testes de progênies é a primeira etapa do processo para obtenção de indivíduos mais produtivos para sistemas de produção. Assim, os objetivos desse trabalho foram estimar a variação e a divergência genética, as relações genéticas e fenotípicas entre os caracteres quantitativos, bem como a interação genótipo x ambiente de testes de progênies de polinização aberta de Cordia trichotoma e Dalbergia nigra. As avaliações foram realizadas durante os quatro primeiros anos após o plantio. Os caracteres avaliados foram: diâmetro do coleto a 30 cm do solo, diâmetro a altura do peito 1,30 m do solo, altura total das plantas, altura do primeiro verticilo e sobrevivência. Para a estimativa dos componentes de variância e das análises multivariadas utilizou-se o método REML/BLUP (Melhor predição linear não viciada/máxima verossimilhança restrita). As análises foram realizadas entre as progênies da mesma espécie. Dois testes de progênies de C. trichotoma e D. nigra, em sistema de consórcio, foram instalados em 2012 na empresa Vale Rio Doce, em Linhares-ESpirito Santo, em duas áreas, em duas textura de solos. O delineamento experiment... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Native species can be used for various purposes in production systems, as well as for environmental recovery. However, few of these species are economically exploited due to the lack of genetic quality of seeds in the marketplace. In general, the genetic characterization of populations and the selection of more productive individuals from progeny tests are the first stage of the process to obtain more productive individuals for production systems. The objectives of this work were to estimate the variation and genetic divergence, identify the genetic and phenotypic relationships among the quantitative traits, as well as analyze the genotype x environment interaction of open pollinated progenies of Cordia trichotoma and Dalbergia nigra. The assessments were conducted during the first four years after planting. The evaluation traits were: collection diameter at 30 cm from the soil, diameter at 1.30 m from the soil, total height of the plants, height of first whorl and survival. To estimate the components of variance and multivariate analyzes, the REML/BLUP method (Restricted Maximum Likelihood/Best Linear Unbiased Prediction) was used. The analyses were carried out among the progenies of the same species. The two progenies of Cordia trichotoma and Dalbergia nigra, in a consortium system, were installed in 2012 at Vale Rio Doce, in the municipality of Linhares, Espirito Santo, in two areas, using two distinct soils. The experimental Randomized Complete Block design (RCB) were div... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Maurício Dutra Zanotto / Banca: Edson Seizo Mori / Banca: José Geraldo Carvalho do Amaral / Banca: João PauloTeixeira Whitaker / Banca: Juliana Parisotto Poletine / Resumo: Realizou-se o presente trabalho, com o objetivo de avaliar a produtividade média de grãos (kg.ha-1) de linhagens de mamona (Ricinus communis L.) e estimar os parâmetros para a adaptabilidade e estabilidade fenotípicas. As avaliações da época 1 foram realizadas entre novembro de 2006 à junho de 2007 e na época 2, de março à agosto de 2005 nos municípios de Araçatuba, Botucatu, Ilha Solteira, Penápolis e São Manuel - SP, sob delineamento de blocos ao acaso com três repetições e parcela útil de 10 m2. Foram realizadas análises de variância individuais para cada local, conjunta dos cinco locais para cada época e, posteriormente as médias foram comparadas pelo teste de Scott e Knott (1974) a 5% de probabilidade. Observou-se significância para a característica avaliada em todas as análises e, devido à interação significativa entre épocas, locais e linhagens foram realizadas análises de adaptabilidade e estabilidade fenotípicas considerando-se como ambiente as épocas de semeaduras segundo metodologia proposta por Finlay e Wilkinson (1963). Na época 1 com relação à produtividade destacaram-se as linhagens 1, 6, 8, 15, 16 e 18. Quanto aos parâmetros para a adaptabilidade e estabilidade fenotípicas as linhagens 3, 13 e 18 apresentaram adaptabilidade geral e estabilidade média. Na época 2, com relação aos mesmos parâmetros, as linhagens 1, 2, 4, 7, 10, 11, 12, 14, 15, 16, e 19 apresentaram maiores produtividades, predominância de adaptabilidade específica à ambientes favoráveis e estabilidade baixa. Para as duas épocas de semeaduras as linhagens 1, 6, 8, 15 e 16 apresentaram-se como superiores em produtividade. / Abstract: This work was carried out to evaluate average grains yield (kg ha-1) of castor bean (Ricinus communis L.) lines and to estimate the parameters for fenotypical adaptability and stability. The evaluations for period 1 were conducted between November, 2006 to June, 2007, and period 2, consisted of March to August, 2005 in Araçatuba, Botucatu, Ilha Solteira, São Manuel and Penápolis, Municipals Districts, in São Paulo State, by using randomized complete blocks scheme with three replicates and useful plots of 10 m2. Individual variance analysis for each site were calculated as well as joint variance analysis involving the five locations for each period and subsequently averages were compared by Scott and Knott test (1974) to 5% of probability. Significance was observed for the characteristic evaluated in all analysis and due to the significant interaction between periods, locations and lines, data were studied with analysis of fenotypical adaptability and stability considering the environment as the sowing crop periods according to the methodology proposed by Finlay and Wilkinson (1963). For period 1, in relation to grains yield, lines 1, 6, 8, 15, 16, 18 were outstanding. For adaptability and stability fenotypical parameters, lines 3, 13 and 18 showed general adaptability and medium stability. In period 2, compared with the same parameters, lines 1, 2, - 3 - 4, 7, 10, 11, 12, 14, 15, 16, and 19 presented higher grains yield, predominance of specific adaptability to favorable environments and inferior stability. For the two sowing crop periods, lines 1, 6, 8, 15 and 16 were superior in grains yield. / Doutor

Submitted by Ricardo Lozano Teixeira de Carvalho (rlcarvalho@dow.com) on 2018-08-04T19:38:47Z No. of bitstreams: 1 REPOSITÓRIO_Dissertacao_Ricardo_Carvalho.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-08-06T18:12:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carvalho_rlt_me_jabo.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-06T18:12:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carvalho_rlt_me_jabo.pdf: 1150964 bytes, checksum: 7ddb5d1e3d8cd21ff7542b90056a6f82 (MD5) Previous issue date: 2018-06-18 / Genótipos superiores têm alta capacidade de produção e resistência às principais doenças, porém o efeito do ambiente pode alterar essas características. Quando plantados em várias localidades, os genótipos podem se comportar de maneira diferente devido a sua adaptabilidade a cada região e a interação destes com o ambiente. O uso de sementes não adaptadas a região e o manejo inadequado são as principais causas de baixo rendimento nas lavouras de milho. Genótipos que respondem ao manejo utilizado, e que se comportam de maneira estável são fundamentais para obtenção de boa produtividade. Com base nisso este trabalho teve como objetivo avaliar a adaptabilidade, estabilidade e produtividade de grãos de híbridos experimentais e comerciais de milho para a segunda safra brasileira. Foram avaliados 33 híbridos, na segunda safra de 2016, em 39 locais, divididos em três macrorregiões (Tropical Sul, Tropical Centro Oeste e Tropical Centro Leste). Com as médias de produtividade de grãos obtidas após a realização da análise de variância, foram estimados os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade através de regressão linear bissegmentada. Os genótipos foram discriminados de acordo com sua adaptabilidade e estabilidade para cada região. Na região Tropical Sul o híbrido HC04 e HE16 são recomendados para ambientes favoráveis, pois respondem as melhorias de ambiente. Na região Tropical Centro Oeste o genótipo experimental HE16 também foi classificado como responsivo. E na tropical Centro Leste 85% dos genótipos foram estáveis. O genótipo HC07 é de adaptabilidade a ambientes desfavoráveis em todas as regiões. Os genótipos HC09 e HC10 são estáveis, de adaptabilidade ampla e com boa produtividade de grãos em todas as regiões. / Superior genotypes have a high production capacity and resistance to major diseases, but environment effect can alter these traits. When planted in multiple locations, genotypes may behave differently due to their adaptability to each region and interaction with the environment. The planting of seeds not adapted to a region and the management used is one of the main causes of low yields in corn crops. Genotypes that respond to the management and behave in a stable way are essential to obtain a good yield. Thus, the aim of this study was to assess the adaptability, stability, and grain yield of experimental and commercial corn hybrids in the second Brazilian crop. Thirty-three hybrids were assessed in the second crop of 2016 in 39 sites divided into three macro-regions (Tropical South, Tropical Central West, and Tropical Central East). Adaptability and stability parameters were estimated by means of bissegmented linear regression with the average grain yield obtained after performing the analysis of variance. Genotypes were discriminated considering their adaptability and stability for each region. In the Tropical South region, the hybrids HC04 and HE16 are recommended for favorable environments since they respond to environmental improvements. The genotype HE16 was also recommended for favorable environments in the Tropical Central West. In the Tropical Center East 85% of hybrids were stable. The genotype HC07 is adaptable to unfavorable environments in all regions. The genotypes HC09 and HC10 are stable, with broad adaptability and good grain yield in all regions.

Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-01-06T13:28:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) graziela_taroco.pdf: 2989194 bytes, checksum: a96e95e60ba666acde3399249ccd46f0 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2017-01-31T16:59:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) graziela_taroco.pdf: 2989194 bytes, checksum: a96e95e60ba666acde3399249ccd46f0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-31T16:59:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) graziela_taroco.pdf: 2989194 bytes, checksum: a96e95e60ba666acde3399249ccd46f0 (MD5) Previous issue date: 2016 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Em esp?cies de interesse zoot?cnico as caracter?sticas de import?ncia econ?mica, como o crescimento dos animais, podem apresentar diferen?as produtivas as quais s?o atribu?das ? influ?ncia dos efeitos gen?ticos e ambientais. Desta forma, a intera??o gen?tipo-ambiente pode ocasionar mudan?as nas vari?ncias dos valores gen?ticos e/ou na classifica??o destes animais. Objetivou-se com o presente trabalho estimar curvas de crescimento de codornas de corte, dos grupos gen?ticos LF1 e LF2, alimentadas com diferentes rela??es de treonina:lisina na dieta, por meio dos modelos Gompertz, Log?stico, Richards e von Bertalanffy, bem como predizer os par?metros gen?ticos da curva de crescimento para peso corporal aos 35 dias de idade, peso assint?tico, taxa de crescimento absoluto e ponto de inflex?o e avaliar a exist?ncia de intera??o gen?tipo ? ambiente para a express?o destas caracter?sticas. Na primeira fase do experimento, do nascimento aos 21 dias de idade, as codornas foram alimentadas com dietas contendo rela??es 0,66, 0,71, 0,76, 0,81 e 0,86% de treonina:lisina. Dos 22 aos 35 dias de idade, as codornas receberam dieta ?nica contendo 26,12% de prote?na bruta e 2.900 kcal EM/kg. Na segunda fase, as codornas foram alimentadas com dieta ?nica contendo 24,54% de prote?na bruta e 2.900 EM/Kg, do nascimento aos 21 dias de idade. Dos 22 aos 35 dias de idade as codornas foram alimentadas com dieta contendo rela??es de 0,71, 0,76, 0,81, 0,86 e 0,91% de treonina:lisina. Os diferentes modelos de curva de crescimento foram ajustados e as intera??es foram avaliadas por meio de modelos de regress?o aleat?ria, considerando-se os efeitos fixos de sexo e os efeitos aleat?rios gen?ticos aditivos diretos como fun??es dos n?veis da rela??o treonina:lisina da dieta. Os resultados demonstraram que o modelo Gompertz proporcionou melhor ajuste da curva de crescimento das codornas de corte. As estimativas de herdabilidade foram de moderadas a alta ao longo das rela??es treonina:lisina. As normas de rea??o demonstram a exist?ncia de intera??o gen?tipo ? ambiente para as rela??es treonina:lisina da dieta e, em decorr?ncia disto, ocorrem altera??es na dispers?o dos valores gen?ticos ou na ordem de classifica??o dos m?ritos gen?ticos das codornas. Desta forma, os programas de melhoramento de codornas devem considerar os n?veis de treonina:lisina na dieta das aves, uma vez que esta pode interferir no desempenho dos animais. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2016. / Traits of economic interest in livestock species, such as growth, may have productive differences which are attributed to the influence of genetic and environmental effects. Thus, the genotype-environment interaction may lead to changes in the genetic values variances and / or consequently in the ranking of animals. In this study, we aimed at estimating growth curves for quails from two genetic groups, LF1 and LF2, fed with different threonine: lysine ratios in the diet. The non-linear models tested were Gompertz, Logistic, Richards and von Bertalanffy. We also aimedt at predicting genetic parameters for the growth curve for body weight at 35 days of age, asymptotic weight, absolute growth rate and inflection point and assess the existence of genotype ? environment interaction for the expression of these traits. In the first phase of the experiment, from birth to 21 days of age, quails were fed with diets containing 0.66, 0.71, 0.76, 0.81 and 0.86% of threonine: lysine ratio. From 22 to 35 days of age, quails received a diet containing 26.12% of crude protein and 2,900 kcal / kg. In the second phase, the quails were fed only with a diet containing 24.54% of crude protein and 2,900 ME / kg, from birth to 21 days old. From 22 to 35 days old quails were fed with diets containing 0.71, 0.76, 0.81, 0.86 and 0.91% of threonine: lysine ratio. The different growth curve models were adjusted and interactions were assessed by random regression models, considering the fixed effect of sex and the random effect of direct genetic additive effect, both as functions of the threonine:lysine ratio. The results showed that the Gompertz model provided the best fit for the growth curve of these quails. The heritability estimates were moderate to high for all the threonine: lysine ratios. The reaction norms demonstrated the existence of genotype - environment for threonine:lysine diet and, as a result, changes may occur in the breeding values or sort ordering for the genetic merit of the quails. Therefore, breeding programs must consider the levels of threonine: lysine in the diet of the quails, since it may interfere with the performance of the animals.

The aim of this thesis was to analyze the polymorphism in position -371bp (related to ATG start codone) of MSTN gene, SNP in position 1984bp of MYF5 gene and influence of these polymorphisms on tenderness, water holding capacity, pH and color of meat. Samples (241) of bull meat of Czech pied cattle were used for analysis. PCR-RFLP method was applied to genotype MSTN and MYF5 genes. For polymorphisms detection was used restriction endonucleases DraI (for MSTN gene) and TaqI (for MYF5 gene). From established genotypes were computed their frequencies and alleles frequencies. The frequencies of genotypes in MSTN gene were AA=0,729, AB=0,258, BB=0,013 and alleles frequencies were A=0,858, B=0,142. The frequencies of genotypes in MYF5 gene were AA=0,181, AB=0,542, BB=0,278 and alleles frequencies were A=0,452 a B=0,548. Using statistical analysis, the influence of genotypes of MYF5 gene on the water holding capacity, pH and the color of meat was determined.

The purpouse of the thesis was compared the comparison in the yields of hulled and naked verifield varieties and new breeding genotypes of oats. The research was conducted in the breeding station Selgen Krukanice and and it was mainly focused on the main elements of yieĺd - number of plants, cuttings, and lat per m2, toatal grain yield, the number of grains per panicle, and the quality of grain - weight of thousand grains, density and share of fixed plugs. Results of the main elements of yield was average at all genotypes of oat, qualitative parametres wasslighty below average, the reason wast dry and warm weather. Also was found good health of oats, cause of weather, that was not favorable for disease development.