Orientador: Armando Zaupa Remacre / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecanica e Instituto de Geociencias / Made available in DSpace on 2018-08-04T20:29:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Normando_MarcioNunes_M.pdf: 6396462 bytes, checksum: e46bc675633da7ffe8a15163b4b2656b (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Uma modelagem geológica consistente é necessária para que se possa avaliar os reservatórios de petróleo. No caso de campos maduros, existe uma expressiva quantidade de óleo remanescente e, muitas vezes, com boa capacidade de ser recuperado. Para tanto, faz-se uso de técnicas geoestatísticas para construção de modelos sólidos que permitam localizar e quantificar essas acumulações de óleo. Sabe-se que no estudo de caracterização de reservatórios a modelagem litológica é uma etapa essencial, pois ela servirá de base e guiará a modelagem das propriedades petrofisicas. Neste trabalho, propõe-se verificar o impacto na modelagem litológica, mais especificamente no volume de fácies reservatórios, utilizando-se determinados algoritmos de simulação estocástica, como: simulação seqüencial indicatriz, simulação gaussiana truncada e simulação plurigaussiana. O estudo englobou desde a etapa de tratamento de dados, com o processo de mudança de suporte, até o estudo de conectividade das fácies reservatório, por meio do algoritmo de Hoshen-Kopelman. Como resultado, foi possível observar que o algoritmo de simulação plurigaussiana mostrou-se com melhor capacidade de reproduzir as características iniciais do reservatório pelo fato de condicionar os resultados à proporção dos litotipos, matriz de proporção da área e regra de litologia, diferente do algoritmo de simulação seqüencial indicatriz que leva em consideração somente a proporção de fácies, igualmente distribuída para toda a zona do reservatório. Observou-se ainda que o algoritmo de simulação Gaussiano truncado, da maneira que foi implementado no programa utilizado, não traria resultados condizentes com os dados originais / Abstract: A consistent geologic modeling is necessary to evaluate the petroleum reservoirs. In mature field, a large amount of remaining oil exists and, many times, with good capacity of being recovered. For this, geostatistical techniques are used for construction of solid models that allow to locate and to quantify this remaining oil. In a reservoir characterization study, the lithologic modeling is an essential stage because it will be the basis to the petrophysical properties modeling. This thesis proposes evaluate the proportionate impact for the algorithms of stochastic simulation (sequential indicator simulation, truncated gaussian simulation and plurigaussian simulation) in the reservoirs characterization, more specifically, in the volume of reservoir facies. The study passed through the handling data stage, with the upscaling process, until the connectivity study ofthe reservoir facies with the Hoshen-Kopelman algorithm. As results, it was possible to note that the plurigaussian simulation algorithm presented better capacity to reproduce the initial reservoir characteristics because it respect the lithofacies proportion, proportion matrix and the lithotype rule, different of sequential indicator simulation algorithm that takes in consideration only the facies proportion, equally distributed for all reservoir zones. It was still observed that the truncated gaussian simulation algorithm, in the way that it was implemented in the used software, wouldn't bring suitable results with the analyzed data / Mestrado / Reservatórios e Gestão / Mestre em Ciências e Engenharia de Petróleo

Orientador: Armando Zaupa Remacre / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Geociencias / Made available in DSpace on 2018-08-09T03:37:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sancevero_SergioSacani_D.pdf: 13993022 bytes, checksum: beb2507aee5ca130897dad57c706b2a9 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: O processo de caracterização de reservatórios é atualmente uma das etapas mais importantes na exploração, desenvolvimento e produção de um campo. Porém, para que esse processo seja realizado da melhor forma possível é preciso se ter o conhecimento de determinados métodos, que integram as diferentes informações disponíveis. Desse modo, o objetivo principal dessa tese é estudar de forma criteriosa e quantitativa o processo de caracterização de reservatórios do ponto de vista dos dados sísmicos, avaliando antigos e novos métodos, e definindo novas metodologias que possam ser aplicadas de maneira decisiva neste processo. Para que esses métodos pudessem ser avaliados de maneira conclusiva foi utilizado nesta tese um modelo sintético que reproduzisse minimamente algumas características cruciais de determinados reservatórios como a complexa distribuição dos corpos de areia e a presença de corpos com espessura subsísmica que levassem ao limite as técnicas de modelagem tradicionais, proporcionando avaliar novos métodos. Assim, para caracterizar essas complexas feições, foram utilizados nesta tese dois meios principais de interpretação, primeiro a inversão sísmica dando um caráter preditivo ao dado sísmico e por fim a análise multiatributos, dando um caráter classificatório. No caso da inversão sísmica foram utilizados três métodos de obtenção da impedância acústica. Entre eles, foi a inversão geoestatística que demonstrou ser a mais eficiente das técnicas no que diz respeito à caracterização de reservatórios com espessura subsísmica e complexa distribuição dos corpos de areia. No caso dos atributos, pôde-se demonstrar que é necessário que sejam tratados com uma abordagem multivariada para que seja aproveitada a correlação entre eles e que por meio de técnicas de classificação e modelagem possa se decidir os mais relevantes para o processo. Neste caso 3 métodos de análise multivariada foram apresentados e testados, sendo que dois deles (ICA e MAF) de maneira inédita e que produziram resultados superiores àqueles alcançados quando a tradicional técnica de PCA é aplicada. Assim, com o que foi apresentado, pode-se concluir que o processo de caracterização é um estágio crucial para o desenvolvimento dos campos, mas não é fácil de ser realizado, a menos que os métodos e as técnicas envolvidas sejam conhecidas de maneira profunda. Só assim, é possível extrair o máximo de informações do dado sísmico, caracterizando o reservatório de forma quantitativa e integrada, otimizando sua produção e reduzindo os riscos e custos com a sua explotação / Abstract: The reservoir characterization process can be considered curretly the most important stage in the exploration, development and production of the oil field. However, this process is only carried out in the best way if the geologists, geophisicist and engineering has the knowledge of some definitive methods and techniques that integrated all information available about the field. Thus, the aim of this thesis is to study in a criterious and quantitative way the reservoirscharacterization process, analyzing the seismic data,by the evaluation of classic and novel methods, to defining new methodlogies that can be applied in decisive way into this process. So, for these methods could be evaluated in a conclusive way, were used in this thesis asynthetic reference model that reproduced some critical features of determined reservoirs, as the complex distribution of sand bodies and the subseismic thickness. These characteristics pushing to the limit the traditional modelling techniques. In this thesis to characterizze the complex features present in the reference model we used two interpretation techniques, first we analyze the seismic inversion that give a preditive character to the seismic data and after we study the multiattribute analysis that give a classificatory caracter to the seismic interpretation. For the seismic inversion, the stochastic or geostatistical inversion, that demonstrated to be the most efficient technique to characterized the complex and the subseismic features present in the model. About the seismic attributes it could be demonstrated that even so in some cases they represent the features of the model, are necessary that they are dealt with a multivariate approach, to used the advantage of the correlation between them. For the seismic attribute analysis, 3 methods of multivariate statistics analysis were used, two of them (ICA and MAF) for the first time in the reservoir characterization processo With the results we can proved that these 2 new methods improved the process of multiattribute anlysis prducing superior results when compare with the results obtained by the application of traditional PCA technique. With it was presented, can be concluded that the reservoir characterization process is a crucial stage and have some difficults to be accomplishment, unless the methods and the involved techniques are known deeply. Thus it is possible to extract the maximum informations from the datasets, characterizing the reservoir in a quantitative and integrated environmental, optimizing its production and reducing the risks and the costs with its explotation / Doutorado / Administração e Politica de Recursos Minerais / Doutor em Ciências

Orientadores: Zigomar Menezes de Souza, Reginaldo Barbosa da Silva / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agrícola / Made available in DSpace on 2018-08-23T03:01:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Castioni_GuilhermeAdalbertoFerreira_M.pdf: 7918974 bytes, checksum: db6b566f58c4c70fe9c016e48a618074 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O emprego de irrigação tem promovido alterações na função do tipo de íons e sua valência presentes na solução do solo, forma variável de pH do solo no grau de floculação crítica de partículas. O desequilíbrio e interação destes fatores podem causar alteração na dispersão da fração argila, alterando a estrutura do solo. O objetivo deste trabalho foi verificar o Delta pH do solo e sua relação com o grau de floculação e dispersão de argila no solo e então avaliar o efeito da migração de argila no adensamento do solo, bem como o aumento da compactação do solo no desenvolvimento de raízes no solo e a produtividade alcançada do feijoeiro. O experimento foi realizado na região de Cristalina-GO, em área irrigada sob pivô central, com coordenadas geográficas de 16°53'35,59" de latitude sul e 47°32'16,75" de longitude oeste, 1.021 m de altitude, o solo foi classificado como Argissolo Vermelho-Amarelo. Os atributos físicos do solo foram coletados nos pontos de cruzamento de uma malha com intervalos regulares de 10 m entre pontos em três posições ao longo do declive da área com 1,8 ha nas profundidades de 0,00-0,10, 0,10-0,20 e 0,20-0,30 m, sob um pivô central, em cada posição da encosta, ou seja, terço superior, médio e inferior foram coletados 60 pontos perfazendo o total de 180 pontos. Os dados foram submetidos à estatística descritiva, bem como a geoestatística considerando os modelos esféricos, o exponencial, o linear e o gaussiano, posteriormente, tais modelos foram usados no desenvolvimento de mapas de isolinhas (krigagem). Os resultados confirmam a predominância de carga líquida negativa pelos valores de delta pH alcançados, que provocou o elevado grau de floculação e dispersão do solo causando a movimentação de argila na vertente, contribuindo para o aumento da densidade do solo e a resistência do solo à penetração, a compactação do solo limitou o alcance do sistema radicular do feijoeiro as camadas mais profundas implicando em perdas significativas de produtividade do feijoeiro / Abstract: The use of irrigation has promoted changes in the type of ions and their valence present in the soil solution, so variable soil pH in critical flocculation of particles. The imbalance and interaction factors can cause this change in dispersion of clay, changing the soil structure. The objective of this work was to verify the Delta soil pH and its relationship to the degree of flocculation and dispersion of clay in the soil and then assess the effect of the migration of clay in soil compaction and increased soil compaction in the development of roots in the soil and the productivity achieved bean. The experiment was carried out in the region of Crystalline-GO in irrigated area under central pivot, with geographic coordinates of 16 ° 53'35, 59 "south latitude and 47 ° 32'16, 75" W, 1021 m altitude the soil was classified as Ultisol. The physical attributes of soil were collected at the intersections of a grid with intervals of 10 m between points in three positions along the slope area with 1.8 ha at depths of 0.00-0.10, 0.10 -0.20 and 0.20-0.30 m, under a center pivot at each position of the slope, ie the upper, middle and bottom were collected 60 points totaling 180 points. Data were subjected to descriptive statistics and geostatistics models considering spherical, exponential, linear, and Gaussian, then such models were used in the development of maps (kriging). The results confirm the predominance of net negative charge by the values of delta pH achieved, which caused the high degree of flocculation and dispersion of the soil causing the movement of clay in part, contributing to the increase of soil density and soil resistance to penetration soil compaction limited the scope of the root bean deeper layers resulting in significant losses in grain yield / Mestrado / Agua e Solo / Mestre em Engenharia Agrícola

Orientador: Alexandre Campane Vidal / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecânica e Instituto de Geociências / Made available in DSpace on 2018-08-21T21:03:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Passarella_CamilaAndrade_M.pdf: 16521657 bytes, checksum: aab7953ccc8c81c5bbe65ebc4282e561 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O presente trabalho foi direcionado para a caracterização e modelagem geológica do reservatório turbidítico do Campo de Namorado. Visto que os depósitos de hidrocarbonetos formaram-se a partir de processos sedimentares e tectônicos complexos que atuaram durante milhões de anos nas bacias e que as informações obtidas destes depósitos são bastante restritas, tornou-se consensual a idéia de que a integração de metodologias e ferramentas possibilita a melhor compreensão dos reservatórios e de suas heterogeneidades. Neste trabalho optou-se por integrar os dados oriundos da geofísica de perfis de poços e dos testemunhos, através dos métodos geoestatísticos de modelagem estocástica com o intuito de gerar modelos equiprováveis do Campo de Namorado que auxiliarão no entendimento da distribuição das principais unidades do reservatório que influenciam na estimativa do volume de óleo. A análise faciológica teve como enfoque os métodos qualitativo, apoiado na descrição das 29 litofácies descritas nos testemunhos, e quantitativo, baseado nas análises dos perfis geofísicos de 54 poços. Com base nesta correlação rocha-perfil, as fácies arenito, arenito argiloso, carbonato e folhelho foram definidos como sendo os prováveis litotipos presentes no reservatório. Para a modelagem geológica e estrutural do Campo de Namorado todos os dados disponíveis foram tratados com o auxílio de um software de modelagem de reservatórios. As etapas de trabalho foram: delimitação de topo e base dos 54 poços do reservatório; interpretação dos três ciclos deposicionais; identificação das falhas; e, por fim, geração de um grid 3D que servirá como base para a realização das modelagens estocásticas subseqüentes. Com a aplicação do método estocástico de simulação seqüencial de indicatriz, foi definida a distribuição espacial das fácies. As propriedades de porosidade efetiva e saturação de água, relacionadas a cada litotipo, foram modeladas a partir da técnica de simulação gaussiana seqüencial. A definição destes parâmetros possibilitou a obtenção do volume de óleo in situ do Campo de Namorado. Como resultados finais foram obtidos vários modelos equiprováveis que representam toda a estrutura do reservatório e possibilitam a quantificação da incerteza associada à estimativa do volume de óleo / Abstract: This work focused the geologic characterization and modeling of the Namorado Oil Field. Sedimentary and tectonic complex processes formed the hydrocarbon deposits for millions of years in the basins, but the information obtained from these deposits is very narrow. In this matter, the opportunity to study the integration of methodologies and tools enables a better understanding of the reservoirs and their heterogeneity. This work integrates the data derived from well logs and cores by the geostatistical methods of stochastic modeling to generate equiprobable models of the Namorado Oil Field, which will assist in the understanding of the distribution of the main reservoir units that influence in the oil volume estimation. The faces analysis used the qualitative method, based on the description of 29 lithofacies described in the cores, and the quantitative method, supported by the well log analysis of 54 wells. Based on this correlation between logs and rocks, was defined as probable reservoir litotypes the faces sandstone, shaly sandstone, carbonate and shale. For the geologic and structural modeling of the Namorado Oil Field all the available data were processed with the aid of a reservoir modeling software. The steps of the work were: delimitation of the top and bottom of the 54 reservoir wells; the interpretation of the three depositional cycles; the identification of failures; and, finally, the generation of a 3D grid for the base of the stochastic modeling. The application of the stochastic method of sequential indicator simulation defined the spatial distribution of the faces. In the other hand, the properties of effective porosity and water saturation related to each lithotype were modeled using the technique of sequential Gaussian simulation. The definition of these parameters allowed the oil volume estimation of the Namorado Oil Field. As a final result, several equiprobable models were obtained representing the entire structure of the reservoir and allowing the uncertainty quantification associated with oil volume computation / Mestrado / Reservatórios e Gestão / Mestre em Ciências e Engenharia de Petróleo

Orientador: João Bertoldo de Oliveira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-08-03T18:08:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bertolani_FernandoCesar_D.pdf: 2517863 bytes, checksum: 8353b0c57a52903f982471df6d495f25 (MD5) Previous issue date: 2003 / Doutorado

Orientador: Marcelo Andreotti / Banca: Morel dos Passos e Carvalho / Banca: Rafael Montanari / Banca: Zigomar Menezes de Souza / Banca: Cassiano Garcia Roque / Resumo: Conhecer a variabilidade espacial dos atributos do solo que influenciam na produtividade do feijoeiro, num sistema plantio direto, é interessante, pois esta informação poderá auxiliar no manejo do mesmo. Portanto, o conhecimento da variabilidade do solo pode aperfeiçoar as aplicações de fertilizantes, reduzindo custos e a degradação ambiental. Assim, avaliar a produtividade vegetal de sistemas de integração lavoura pecuária, em função de atributos do solo, via uso da geoestatística, pode auxiliar na definição de quais atributos físico-químicos do solo mais interferem nesta produtividade e quais podem ser utilizados para determinar a qualidade do solo. O trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade e caracterizar a dependência espacial e temporal entre alguns atributos físicos e químicos do solo e a produção de forragem do capim-Marandu (Urochloa brizantha cv. Marandu), sobre a população de plantas e a produtividade do feijoeiro de inverno, bem como estudar as correlações lineares e espaciais entre tais atributos, visando identificar quais destes interferiram na produtividade da cultura do feijão, em um LATOSSOLO VERMELHO Distroférrico do Cerrado. A pesquisa foi desenvolvida na Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira (FE/UNESP), localizada no município de Selvíria (MS). Foi realizada a análise estatística descritiva e geoestatística para os atributos, gerando semivariogramas, mapas de krigagem e cokrigagem. A quantidade de palhada remanescente do capim Marandu antecessor apresentou correlação linear inversa com a população e produtividade do feijoeiro de inverno. Entretanto, sem correlação espacial e temporal sobre tais atributos. A produtividade de feijão teve correlação linear direta com o pH e inversa com a macroporosidade na camada superficial do solo. Contudo, o ponto de vista... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Knowing the spatial variability of soil attributes that influence the common bean yield in a no-tillage system is interesting because this information may assist in the management of the soil. Therefore, knowledge of soil variability can optimize fertilizer applications, reducing costs and environmental degradation. Thus, to evaluate the productivity of vegetable integrated crop livestock due to soil attributes via the use of geostatistics, can help define which physical and chemical attributes of the soil affect this more productivity and which can be used to determine the quality soil. The study aimed to evaluate the variability and characterize the spatial and temporal dependence between some physical and chemical soil properties and forage production of grass marandu (Urochloa brizantha cv Marandu) on plant population and grain common bean yield of winter and study the linear and spatial correlations between these attributes, to identify which of these interfere with the yield of the common bean in an Oxisol of the Brazilian Savannah. The research was conducted at the Faculdade de Engenharia of Ilha Solteira (FE / UNESP), located in Selvíria (MS). We performed a descriptive statistical analysis and geostatistics for attributes, generating semivariograms, kriging and cokriging maps. The amount of trash remaining palisadegrass predecessor correlated inversely related to population and common bean yield of winter. However, no correlation of such spatial and temporal attributes. The common bean yield of irrigated winter in the Brazilian Savannah had direct linear correlation with soil pH in the 0 to 0,10 m positive spatial correlation with the pH of the soil layer from 0,10 to 0,20 m. / Doutor

Orientador: Alan Rodrigo Panosso / Resumo: A cultura do eucalipto fornece insumos para a indústria madeireira, siderúrgica e de celulose e papel, tendo um enorme potencial para estocar carbono atmosférico na biomassa aérea e no solo ajudando a mitigar o efeito estufa. Porém, poucos trabalhos têm estudado como as emissões de CO2 do solo (FCO2) em áreas de plantio de eucalipto variam no espaço. Sendo assim objetivou-se caracterizar os padrões de variabilidade espaço temporal da FCO2 em área de floresta plantada de eucalipto no baixo cerrado no estado do Mato Grosso do Sul, por meio de técnicas geoestatísticas. O estudo foi conduzido em área de Eucalipto na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira (UNESP), localizada no município de Selvíria-MS, durante os meses de outubro e novembro de 2015. A FCO2 foi registrada por meio do sistema LI-COR (LI-8100), a temperatura do solo (Ts) foi registrada por meio de termômetro de haste e a umidade do solo (Us) foi determinada por meio de um equipamento de TDR. O experimento foi conduzido em uma malha amostral de 100  100 m contendo 102 pontos amostrais. Os resultados indicaram diferença significativa (p<0,05) entre as médias de FCO2 do mês de outubro (4,21 mol m-2 s-1) e novembro (6,16 mol m-2 s-1), devido maior condição de umidade do solo proporcionado pelas precipitações pluviais mais frequentes durante o mês de novembro. Aproximadamente 73% da variação temporal da FCO2 foi explicada pelo modelo: FCO2= 13,23 ˗ 0,48Ts ˗ 0,039 Us2 + 0,037... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The eucalyptus crop provides inputs for the timber, steel and pulp and paper industries, and has an enormous potential to store atmospheric carbon in the aerial biomass and soil, helping to mitigate the greenhouse effect. However few works have studied how soil CO2 emissions vary in space in areas of eucalyptus plantations. The objective of this work was to characterize spatiotemporal variability patterns of soil CO2 emission in eucalyptus plantation forest in cerrado in the state of Mato Grosso do Sul, using geostatistical techniques. The experiment was conducted in the Fazenda de Ensino e Pesquisa, da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira (UNESP), located in the Selvíria city -MS. The soil CO2 emission was measured by the LI-COR system (LI-8100), the soil temperature was recorded using a stem thermometer and the soil moisture was determined using a TDR equipment. The experiment was conducted in a 100  100 m grid containing 102 sample points. The results indicate a significant difference (p<0.05) between the mean of FCO2 of the month of October (4.21 mol m-2 s-1) and November (6.16 mol m-2 s-1), due to the greater soil moisture condition provided by the more frequent precipitations during the month of november. Approximately 73% of the temporal variability of FCO2 was explained by the model: FCO2= 13.23 ˗ 0.48Ts ˗ 0.039 Us2 + 0.037 Ts×Us (F=5.40; p=0.039). The fitted models to the variograms for FCO2 were predominant spherical and Gaussian. Range values ranged from 18.... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Maurício Lacerda Nogueira / Coorientador: Danila Vedovello de Jesus / Banca: Erna Geessien Kroon / Banca: Fátima Pereira de Souza / Banca: Aripuanã Sakurada Aranha Watanabe / Banca: Sergio Moraes Aoki / Resumo: Dengue é a infecção por arbovírus mais comum em todo o mundo e é causada por quatro sorotipos distintos (DENV 1-4). No presente trabalho analisamos a transmissão do Dengue virus (DENV) em São José do Rio Preto (SP) no período entre 2011 e 2014. Foram utilizadas amostras de sangue de pacientes febris que procuraram o serviço de saúde do município. A pesquisa do DENV foi realizada através da técnica Multiplex RT-PCR utilizando primers que se ligam a regiões do gene da proteína não estrutural NS5 e da proteína estrutural C, seguido por Nested-PCR com iniciadores espécie-específicos. Foram analisadas 1.098 amostras no período entre agosto de 2011 a junho de 2014. Setecentos e noventa e oito amostras (798/1098, 72%) foram confirmadas como positivas por Multiplex-Nested-PCR. Os sorotipos de DENV encontrados foram: 65,41% (522/798) DENV-4, 22,56% (180/798) DENV-1, 11,28% (90/798) DENV-2 e 0,75% (6/798) co-infecção (DENV-1/DENV-4, DENV- 1/DENV-2), mostrando um padrão complexo de circulação dos sorotipos. Com a utilização de técnicas de geoestatística dos casos de dengue foi possível a detecção de áreas (zona Norte de São José do Rio Preto) com risco relativo elevado de ocorrência de DENV-4, áreas estas que foram priorizadas com relação ao emprego de medidas de vigilância e controle. Trinta e três amostras de DENV-4 foram submetidas ao sequenciamento do gene do envelope, assim como, à reconstrução filogenética. Dentre as 33 amostras, dez tiveram o genoma completo sequenciado, sendo filogeneticamente classificadas. As análises filogenéticas mostram que as amostras identificadas neste estudo foram agrupadas no genótipo Americano, que circula no Brasil. O genótipo Americano demonstrou apenas um clado agrupando todas as amostras de SJRP, indicando a circulação de uma única linhagem. A análise filogenética do genoma completo de DENV-4 mostra relação entre os isolados... / Abstract: Dengue is the most common arboviral infection worldwide and is caused by four distinct serotypes. In the present study we assessed the Dengue virus (DENV) transmission in São José do Rio Preto (SP) from 2011 to 2014. We analyzed blood samples from febrile patients who where attended at health care services in São José do Rio Preto. The DENV detection was performed with Multiplex RT-PCR using Flavivirus generic primers based on nonstructural protein (NS5) and structural protein (C), followed by Nested-PCR assay with species-specific primers. We analyzed 1098 samples from August 2011 to June 2014. Seventy two samples (798/1098, 72%) were confirmed as positive by multiplex RT-PCR. The DENV serotypes distribution were: 65.41% (522/798) DENV-4, 22.56% (180/798) DENV-1, 11.28% (90/798) DENV-2 and 0.75% (6/798) coinfection (DENV-1/DENV-4, DENV-1/DENV-2), showing a complex serotypes circulation pattern a of serotypes circulation. With the use of geostatistical techniques of dengue cases it was possible to detect areas (northern zone of São José do Rio Preto) with high relative risk of DENV-4 occurrence, these areas should be prioritized regarding the employment of surveillance and control measures. Thirty-three DENV-4 have been subjected to sequencing of the entire envelope gene and were used for phylogenetic reconstruction. Among the 33 samples ten had the full genome sequenced and were classified phylogenetically. The phylogenetic analyses showed that the samples identified in this study were grouped with American genotype that circulating in Brazil. The American genotype showed only one clade grouped with all SJRP samples, indicating the circulation of a single lineage. Phylogenetic analysis of DENV-4 complete genome shows a relationship between isolates from São José do Rio Preto with isolates found in northern region of south America. Amino acid substitutions were observed in the structural proteins (21%) and non-structural proteins... / Doutor

Orientador: Morel de Passos e Carvalho / Banca: Rafael Montanari / Banca: Marcelo Andreotti / Resumo: A cana-de-açúcar tem importância incontestável no Brasil, tanto por ser matéria-prima para a produção de etanol e açúcar, como para o seqüestro de carbono atmosférico mundial. A correta intervenção espacial na administração da lavoura, decorrente das zonas específicas de manejo do solo, aumenta sua produtividade e a lucratividade agrícola. No ano de 2010, em Suzanapólis, estado de São Paulo, Brasil (20°27' lat. S; 51°08' lon. W) foram empregadas correlações, de Pearson e espaciais, entre atributos da cana-de-açúcar e alguns atributos físico-químicos do solo, visando encontrar aquele que pudesse definir zonas específicas de manejo do solo. Para tanto, instalou-se a malha irregular para a coleta de dados do solo e da planta, numa área 10,5 ha, num talhão contendo a variedade de cana-de-açúcar RB 85 5453, no terceiro corte e bisada. Nela foram alocados aleatoriamente 118 pontos amostrais georreferenciados, de forma a cobri-la amplamente, num ARGISSOLO VERMELHO Distrófico (Typic Tropudult). Os atributos da planta foram a produtividade de plantas, a população de plantas, os açúcares totais recuperáveis e o percentual de sólidos solúveis, de sacarose, de pureza e de fibras. Enquanto que os do solo foram o teor e o estoque de carbono orgânico, a densidade global, a resistência à penetração, a umidade gravimétrica e volumétrica, a macroporosidade, a microporosidade e a porosidade total do solo. Dessa forma, para obtenção de máxima produtividade, para a variedade pesquisada, a população de plantas ideal é 16 plantas por metro. O teor de carbono orgânico e o seu estoque, por terem apresentado apreciáveis correlações lineares e espaciais de forma direta com a produtividade da cana-de-açúcar, revelaram-se como atributos potencialmente aptos para a definição de duas zonas específicas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugar cane is nowadays very important for Brazil as it is the raw material for the ethanol and sugar production, and also because it contributes to the sequestration of the world atmospheric carbon. The correct spatial intervention in the crop management, as a consequence of specific management zones of the soil, increases both soil productivity and yields. In 2010, Pearson and spatial correlations for sugar cane attributes and for some physical and chemical soil attributes were used, in Suzanápolis, São Paulo state, Brazil (20°27' S; 51°08' W), aiming at finding the one that would allow the definition of specific management zones of the soil. In order to achieve that, an irregular grid for collecting soil and plant data was installed in an area 10.5 ha, in a lot where the sugar cane variety RB 85 5453 had been growing, at the third cut and 24th month. 118 georeferenced sampling spots were randomly determined in order to cover all the area in a Typic Tropudult. The plant attributes were stems productivity, plants population, recoverable total sugars and soluble solids percentage, of sucrose, of purity and of fibers. Whereas the soil attributes were organic carbon level and stock, bulk density, penetration resistance, gravimetric and volumetric water contents, macroporosity, microporosity and total porosity. Therefore, in order to achieve maximum productivity, for the studied variety, the ideal plants population is of 16 plants per meter. The organic carbon level and stock proved to be potentially efficient attributes when it comes to defining two specific management zones of the soil, as some remarkable linear and spatial correlations were observed to be strongly linked to sugar cane productivity. In these zones, the sugar cane productivity varied from... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: César Gustavo da Rocha Lima / Resumo: A água exerce influência direta no desenvolvimento de sociedades. Por sua vez, as águas subterrâneas apresentam um papel fundamental para o abastecimento humano por constituírem aproximadamente dois terços da fonte de água doce no mundo. A Companhia Ambiental do Estado de São Paulo (CETESB) controla e monitora atividades que possam ser fontes de poluição e avalia periodicamente os parâmetros de qualidade das águas. Sua rede conta com 75 pontos de monitoramento até 2012, dificultando um panorama amplo da qualidade das águas no Sistema Aquífero Bauru. O objetivo do trabalho foi estudar a variabilidade espacial e temporal dos parâmetros de qualidade das águas subterrâneas do SAB no Estado de São Paulo. Foram avaliados os parâmetros: Alcalinidade Bicarbonato, Bário, Cálcio, Condutividade Elétrica, Dureza, Magnésio, Nitrato, Potássio, pH, Sódio, Sólidos Totais Dissolvidos e Temperatura. Para tanto foi realizada a análise descritiva, de correlação e a análise geoestatística por meio do cálculo de variogramas experimentais para avaliação da dependência espacial e interpolações por krigagem ordinária. Os resultados indicaram que à exceção do pH e da Temperatura, todos os parâmetros possuíam elevada variabilidade dos dados, com Coeficientes de Variação (CV) elevados, em sua maior parte. As correlações significativas do ponto de vista prático de determinação laboratorial foram de Sólido Total Dissolvido com Cálcio (r = 0,770) e com Magnésio (r = 0,700), além da Dureza com Cálcio (r = 0... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Water is essential for the life maintenance. It influences directly the society development over the centuries. Currently, groundwater resources have a crucial role for supply. These resources constitute around two thirds of the global freshwater sources. The Sao Paulo Environmental Company (CETESB) is responsible for manage activities which can be source of contamination and periodically assess water parameters. However, the CETESB system had 75 monitoring points until 2012, hindering area overview. This study aims evaluate variability and temporal-spatial dependency of water parameters for groundwater quality in the Bauru Aquifer System (BAS), in the State of Sao Paulo, using geostatistical techniques. The parameters were: Bicarbonate Alkalinity, Barium, Hardness, Calcium, Magnesium, Nitrate, Potassium, pH, Sodium, Total Dissolved Solids and Temperature. It has been done at first descriptive analysis and then spatial dependency for which parameter by semivariogram analyzes. The results showed that the parameters have a high variability, except by pH and Temperature, the coefficient variation were very high for the parameters. The significant correlations were Total Dissolved Solids with Calcium (r = 0.770) and Magnesium (r = 0.700) on a laboratorial practice. Besides Hardness and Calcium with r = 0.910. All parameters showed spatial dependency with appreciable semivariographic adjustments and kriging maps defined. The pH values were allowed for human consumption, except by ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre