Thèse (M.Sc. )--Université Laval, 2007. / Titre de l'écran-titre (visionné le 5 mai 2008). Bibliogr.

Thèse (M.Sc.)--Université Laval, 2004. / Bibliogr.: f. 44-51. Publié aussi en version électronique.

CroBas-PipeQual a été élaboré pour étudier les effets de croissance des arbres sur la qualité du bois. Ainsi, il s’agit d’un modèle d’intérêt pour maximiser la valeur des produits extraits des forêts. Nous avons évalué qualitativement une version de CroBas-PipeQual calibrée pour le pin gris (Pinus banksiana Lamb.) de façon à vérifier l’intérêt de l’utiliser comme outil de planification forestière. Par la suite, nous avons fait une analyse de sensibilité et une calibration bayesienne à partir d’une table de production utilisée au Québec. Les principales conclusions sont: 1. Les prédictions de hauteur sont les plus sensibles aux intrants et aux paramètres liés à la photosynthèse; 2. La performance de CroBas est améliorée en tenant compte de la relation observée entre deux paramètres utilisés pour estimer la productivité nette et l'indice de qualité de station; et 3. CroBas requiert d’autres améliorations avant de pouvoir être utilisé comme outil de planification. / CroBas-PipeQual is a process-based forest growth model designed to study foliage development and how growth processes relate to changes in wood quality. As such, CroBas-PipeQual is of interest as a component model in a forest level decision support model for value assessment. In this thesis, the version of CroBas-PipeQual calibrated for jack pine (Pinus banksiana Lamb.) in Québec, Canada was qualitatively evaluated for use in forest management decision-making. Then, sensitivity analyses and Bayesian melding were used to create and calibrate a stand-level version of CroBas-PipeQual to local empirical height yield models in a hybrid-modelling approach. Key findings included: 1. Height predictions were most sensitive to input values and to parameters related to net photosynthesis; 2. Model performance was improved by varying two net-productivity parameters with site quality; and 3. Model performance needs further improvement before CroBas-PipeQual can be used as a component of a forest-management decision tool.

Les ganglions de la base (GB) sont un ensemble de structures sous-corticales qui régulent le comportement psychomoteur. Le striatum (STR) constitue la principale structure intégratrice des ganglions de la base. Il contient des neurones de projection (MSN), dont une moitié exprime le récepteur dopaminergique D₁ et l'autre moitié exprime D₂. Le modèle anatomique des GB repose sur la ségrégation des projections axonales efférentes du striatum en voie directe et en voie indirecte. Selon ce schème organisationnel, la voie directe est constituée de MSN D₁ exprimant substance P (SP) et dynorphine (DYN) dont l'axone cible le noyau entopédonculaire (ENT) et la substance noire réticulée (SNr). Les MSN D₂ sont à l'origine de la voie indirecte, expriment l'enképhaline (ENK) et ciblent le globus pallidus(GP). Des reconstructions axonales unitaires ont toutefois démontré qu'un même axone de MSN puisse projeter dans toutes les structures cibles du STR. Ces résultats vont à l'encontre du modèle binaire et suggèrent que les voies directe et indirecte ne soient pas aussi ségréguées que ce que le modèle laisse présager. Les travaux de recherche présentés dans ce mémoire visent à quantifier le degré de collatéralisation axonale des MSN D₁ et D₂ dans les différentes cibles du STR, ainsi qu'à élucider la distribution neuropeptidique au sein de ces axones striatofuges, et ce, chez la souris. L'hypothèse proposée implique que l'axone d'un même MSN D₁ ou D₂ puisse se projeter dans les trois cibles du STR via un jeu complexe de collatérales axonales, mais que son contenu neuropeptidique puisse être libéré différentiellement dans ces structures cibles. Les résultats obtenus indiquent que, bien que la grande majorité des MSN D₁ ou D₂ possèdent des collatérales axonales dans toutes les cibles, les axones D₁ ne libèrent de la DYN que dans l'ENT et la SNr, alors que les axones D₂ ne libèrent leur ENK que dans le GP. Ces résultats mettent en doute la validité du modèle binaire de l'organisation anatomique et fonctionnelle des GB et exposent un substratum morphologique pouvant expliquer la neuroplasticité adaptative qui caractérise ces structures sous-corticales. / The basal ganglia (BG) consist of a set of subcortical structures that regulate psychomotor behaviour. The striatum (STR) constitutes the main integrative structure of the BG. It is mostly composed of GABAergic medium spiny projection neurons (MSNs), of which one half expresses the dopamine receptor D₁ and the other half expresses D₂. The anatomical model of the BG, commonly used to explain the functioning of these subcortical structures, is based on the segregation of efferent axon projections from the STR into a direct pathway and an indirect pathway. According to this organizational scheme, the direct pathway is composed of D₁ MSNs expressing the neuropeptides substance P (SP) and dynorphin (DYN) whose axon directly targets the outputs of the BG - the entopeduncular nucleus (ENT) and the substantia nigra pars reticulata (SNr). D₂ MSNs give rise to the indirect pathway, express enkephalin (ENK) and target the globus pallidus (GP). Single-cell axon reconstructions have however shown that single MSN striatofugal axons project to all target structures of the STR (GP, ENT, SNr). These results are at odds with the binary model and rather suggest that the direct and indirect pathways are not as segregated as this model lets on. The research works presented in this thesis aim to quantify the degree of axonal collateralization of D₁ and D₂ MSNs projecting to the different target structures of the STR, and to elucidate the neuropeptide distribution within these striatofugal axons, in mice. The proposed hypothesis implies that the axon of a single D₁ or D₂ MSN projects to all STR targets through a complex set of axon collaterals, while its neuropeptide contents are released differentially into these target structures. Our data indicate that, while the vast majority of D₁ or D₂ MSNs possess axon collaterals that innervate all targets, D₁ axons release DYN only in the ENT and SNr, and D₂ axons release ENK only in the GP. These results challenge the validity of the binary model of the anatomical and functional organization of the BG and expose a morphological substratum that may explain the adaptive neuroplasticity that characterizes these subcortical structures.

La population de phoque gris (Halichoerus grypus) du nord-ouest de l'Atlantique a augmenté de manière exponentielle au cours des quatre dernières décennies, passant de 20 000 bêtes en 1970 à 250 000 en 2000. Les premiers signes attendus d'une régulation dépendante de la densité sont des changements dans la condition physique et dans la croissance des individus, ainsi que des changements dans les paramètres de reproduction. La condition physique et la croissance ont été examinées sur 3 302 phoques gris échantillonnés dans l'Atlantique canadien de 1954 à 2004 en utilisant des courbes de croissance non linéaires. La condition physique n'a pas changé de 1954 à 2004 mais la taille corporelle a diminué depuis les années 50. Les paramètres de reproduction de la population, dont les taux de reproduction selon l'âge et l'âge à la première naissance ont été examinés avec un échantillon de 208 femelles récoltées entre 1993 et 2004 et l'âge à maturité sexuelle a été examiné à partir de mâles récoltés en 2004. Les taux de reproduction ont diminué comparativement aux taux obtenus dans les années 70 et 80 et l'âge moyen des mâles à maturité sexuelle a augmenté, par contre, l'échantillon ne comptait que 15 individus. Ces diminutions de la croissance corporelle et des taux de reproduction suggèrent que des changements dépendants de la densité dans la population du phoque gris du nord-ouest de l'Atlantique se produisent. / The Northwest Atlantic grey seal (Halichoerus grypus) population has been growing exponentially over the last four decades, increasing from 20, 000 animals in 1970 to 250, 000 in 2000. Early indications of density-dependent regulation are expected to be reflected as changes in physical condition, individual growth and changes among reproductive parameters. Changes in body size and condition were examined in a sample of 3 302 grey seals collected from Atlantic Canada from 1954 to 2004 using nonlinear growth curves. Condition did not change since the 1950s, but body size declined. Reproductive parameters, such as age specific reproductive rates and age at first birth were examined from 208 females collected from 1993 to 2004 and age at sexual maturity was examined from males collected in 2004. Reproductive rates declined compared to the rates obtained in the 1970s and 1980s, and the mean age of male sexual maturity increased, but only 15 males were sampled. The decline in body size and changes among reproductive parameters suggest that density-dependent changes in the Northwest grey seal population are occurring.

Thèse (Ph. D.)--Université Laval, 2005. / Titre de l'écran-titre (visionné le 23 février 2006). Bibliogr.

Memoria para optar al título profesional de: Ingeniero Agrónomo / Botrytis cinerea Pers., hongo fitopatógeno de más de doscientas especies vegetales, es el causante de la “Pudrición Gris” que es la enfermedad más importante que afecta a la uva de mesa en Chile. El control de esta enfermedad, se basa principalmente en el uso de fungicidas botryticidas. Sin embargo, año a año, se incrementan las poblaciones resistentes a estos productos logrando infectar las estructuras florales, para luego permanecer en estado latente hasta la madurez de la baya, desarrollando, finalmente, pudriciones durante el periodo de pre y poscosecha. Con objeto de llevar a cabo estudios epidemiológicos en uva de mesa, se marcaron nueve aislados de Botrytis cinerea (Wild-type-WT), de los cuales tres eran resistentes a fenhexamid (HydR3+, CE 50 9,64 µg/ml) y dos sensibles (HydS, CE 50 0,09 µg/ml), siendo uno de estos últimos del tipo multidroga MDR1; y otros dos eran resistentes a iprodione (Ip+, CE 50 5,48 µg/ml) y dos sensibles a esta molécula (Ip-, CE 50 0,71 µg/ml). Mediante la estandarización del protocolo para la transformación genética con la bacteria Rhizobium radiobacter (=Agrobacterium tumefaciens) cepa GV3101 con el vector pCAMgfp se logró la transformación de todos los aislados analizados. Los aislados transformados (mutantes) expresaron el gen de la proteína fluorescente verde (Green Fluorescent Protein, GFP-sgfp) y el de resistencia a higromicina (hph) incluso tras pruebas de estabilidad mitótica. Una vez transformados se evaluó el comportamiento morfofisiológico de los aislados mutantes. Para ello, se analizaron los aspectos de conidiogénesis, desarrollo miceliar, formación de esclerocios, nivel de agresividad/virulencia, expresión de la fluorescencia y mantención de las características de resistencia y/o sensibilidad a las moléculas fungicidas evaluadas. El análisis microscópico de la fluorescencia reveló la expresión constitutiva de la proteína y mediante PCR, con partidores específicos, se determinó la presencia del gen sgfp en todos los aislados analizados. Se mantuvo la correspondencia genotípica en todos los aislados y hubo escasas variaciones en los aspectos morfológicos y fenotípicos de los mutantes respecto sus WT. Finalmente, ocho aislados mantuvieron las mismas características morfofisiológicas que sus WT por lo que podrían ser empleados en estudios de interacción hongo-hospedero así como epidemiológicos, fundamentalmente en relación al estado de latencia. / Botrytis cinerea Pers., plant pathogen fungus over two hundred plant species, is the causal agent of the "gray mold", which is the most important disease that affects the table grapes in Chile. The control of this disease on grapevine, is mainly based on the use of fungicides botryticidas. Nevertheless, year after year, the resistant populations increase to this products, this will achieve the infection of floral structures, in order to remain in latent status until grape berry ripening, finally developing rots during pre and postharvest. To accomplish epidemiological studies in grapevines, were marked nine isolates of Botrytis cinerea (Wild type-WT), three of them were fenhexamid resistant (HydR3+, EC 50 9,64 µg/ml), two sensitive (HydS, EC 50 0,09 µg/ml), being one of those who was multidrug type MDR1; others two were resistant to iprodione (Ip+, EC 50 5,48 µg/ml) and two sensitive (Ip- EC 50 0,71 µg/ml). By standardizing of the protocol for genetic transformation with the bacterium Rhizobium radiobacter (=Agrobacterium tumefaciens) strain GV3101 with vector pCAMgfp the transformation of all isolates tested were achieved. The transformed isolates (mutants) expressed the gene for green fluorescent protein (Green Fluorescent Protein, GFP-sgfp) and hygromycin resistance (hph) even after mitotic stability test. Once transformed the morphophysiological behavior of mutant isolates were evaluated. For this, the aspects of conidiogenesis, mycelial growth, the formation of sclerotia, aggressiveness level/virulence, expression and maintenance characteristics of the fluorescence, of resistance and/or sensitivity to molecules fungicides tested were evaluated. Microscopic analysis of fluorescence revealed the constitutive expression of the protein and by PCR with specific primers, the presence of the sgfp gene in all isolates tested were determined. Genotypic correspondence in all isolates were maintained and there were few variations in morphological and phenotypic aspects of the mutants compared with their WT. Finally, eight isolates maintained the same morphophysiological characteristics, that their WT, consequently they could be used in studies of fungus-host interaction as well as epidemiological, mainly in relation to latency.

Tesis para optar al título profesional de Ingeniera Agrónoma y al grado de Magíster en Ciencias Agropecuarias con mención Sanidad Vegetal / La base del control de Botrytis cinerea radica en el uso de fungicidas aplicados en los periodos críticos de infección (floración y envero a precosecha). Las estrobilurinas (QoIs) por tener efecto sobre Oídio y también sobre Botrytis son alternativas de control en pre y post-floración. Recientemente, en ciertas regiones de Europa, Norteamérica y Chile se ha detectado el inicio de pérdida de sensibilidad de botrytis a QoIs. La resistencia a este grupo de fungicidas en hongos fitopatógenos estaría asociada a tres tipos de mutaciones en el citocromo b, siendo la principal la mutación G143A (reemplazo de Glicina por Alanina en el codón 143). El objetivo del presente estudio fue determinar la posible relación entre pérdida de sensibilidad a QoIs, comportamiento del patógeno y presencia de algunas de las 3 mutaciones asociadas. Con este propósito 20 aislados de B. cinerea recuperados desde vid y seleccionados según antecedentes previos de sensibilidad a azoxystrobin, fueron caracterizados genéticamente, mediante PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa) alelo-específico, para detectar la presencia de las mutaciones asociadas a resistencia a QoIs y mediante PCR-duplex para detectar la presencia de los transposones Boty y Flipper. La caracterización fenotípica consideró los siguientes parámetros: aspecto miceliar, esporulación, capacidad formadora de esclerocios (medio Agar- Malta (AM) a 20ºC), crecimiento miceliar (medio AM a 15, 20 y 25ºC), y virulencia sobre bayas cv. Thompson Seedless, con y sin herida a 0 y 20ºC.

Memoria para optar al título profesional de: Ingeniero Agrónomo Mención: Sanidad Vegetal / En el presente estudio, se evaluó la efectividad de distintos fungicidas en el control de Botrytis cinerea, aplicados antes y con posterioridad a un periodo de infección en uva de mesa cv. Thompson seedless. Para ello se realizaron ensayos durante la temporada 2006 – 2007, en época de floración y pre cosecha en dos parronales de vid, ubicados en la región de Valparaíso y región Metropolitana, donde los racimos de uva fueron asperjados con suspensiones conidiales de B. cinerea. El ensayo evaluó 9 fungicidas, en dos épocas de aplicación. En floración se utilizó: boscalid + pyraclostrobin, tebuconazole, iprodione, pyrimethanil, kresoxim-methyl, cyprodinil + fludioxonil, fenexamid, testigo inoculado y un testigo absoluto y en pre cosecha se usó: boscalid + pyraclostrobin, citrex (11% p/p) + caolín, iprodione, iprodione + azufre, cyprodinil + fludioxonil, fenhexamid, fenhexamid + azufre, un testigo inoculado y un testigo absoluto. Para ambas épocas de aplicación se consideraron 5 periodos de aplicación. Floración: 24 horas antes de la inoculación, 1, 24, 36 y 48 horas después de la inoculación. Pre cosecha: 24 horas antes de la inoculación, 1, 12, 24 y 36 horas después de la inoculación. La fruta fue almacenada en frigorífico comercial y todos los tratamientos fueron evaluados en postcosecha. En época de Floración los fungicidas cyprodinil + fludioxonil (Switch 62,5 WP), kresoxim-methyl (Stroby SC), iprodione (Rovral 4 Flo), pyrimethanil (Scala 40 SC) y tebuconazole (Horizon 25% WP) fueron los que mejor controlaron la pudrición gris respecto al testigo inoculado, no existiendo diferencias significativas entre ellos. En cuanto al periodo de aplicación no existieron diferencias significativas para ninguno de los tratamientos después de un almacenamiento a 0°C. Los fungicidas aplicados en pre cosecha que mejor controlaron la enfermedad después de ser almacenada a 0°C fueron cyprodinil + fludioxonil (Switch 62,5 WG), fenhexamid (Teldor 50 WP), fenhexamid + azufre (Teldor Dust-s) e iprodione (Rovral 4 Flo) para ambos campos. Los periodos de aplicación fueron irrelevantes en este ensayo, para ambas épocas de aplicación, ya que no existieron diferencias significativas en los porcentajes de inhibición en los tratamientos. En cuanto a la inoculación con Botrytis cinerea esta no fue efectiva en ninguna época de aplicación. / The efficiency of different fungicides in the control of gray mold of grapes, applied before or after a simulated infection period, was evaluated on Thompson Seedlees grapes. The trials were conducted in the 2006 – 2007 season, in two commercial table grape vineyards located in Valparaiso and Metropolitan regions, where the grapes were sprayed with a conidial suspension of Botrytis cinerea. The study evaluated nine fungicides applied at bloom or before harvest: In bloom the fungicides boscalid + pyraclostrobin, tebuconazole, iprodione, pyrimethanil, kresoxim-methyl, cyprodinil + fludioxonil, fenexamid, were used and compared with an inoculated control and absolute control treatments; Before harvest the fungicides boscalid + pyraclostrobin, citrex (11% w/w) + kaolin, iprodione, iprodione + sulfur, cyprodinil + fludioxonil, fenhexamid, fenhexamid + sulfur were compared with an inoculated control and an absolute control. At both phenological stages, five fungicide application times were tested. At flowering, the fungicides were sprayed 24 hours before inoculation and 1, 24, 36 and 48 hours after inoculation. Pre harvest fungicide applications were made 24 hours before inoculation and 1, 12, 24 and 36 hours after inoculation. The fruit was harvested and stored in commercial cold storage facilities and all treatments were evaluated in postharvest. At bloom the fungicides cyprodinil + fludioxonil (Switch 62.5 WP), Kresoxim-methyl (Stroby SC), iprodione (Rovral 4 Flo), pyrimethanil (Scala 40 SC) and tebuconazole (Horizon 25% WP), reduced postharvest gray rot compared to the control treatments, without differences between them. The time of application did not affect the development of gray rot after cold storage. Fungicides sprayed at pre harvest with the highest efficacy were cyprodinil + fludioxonil (Switch 62.5 WG), fenhexamid (Teldor 50 WP), fenhexamid + sulfur (Teldor Dust) and iprodione (Rovral 4 Flo) in both vineyards. Application times were irrelevant in this trial, The inoculation with a conidial suspension of Botrytis cinerea was not effective at any time of application.

Memoria para optar al título profesional de Ingeniera Agrónoma / Se estudió la dinámica poblacional de Botrytis cinerea (Bc) en el cultivo del kiwi en Chile, caracterizando genética y fenotípicamente un número representativo de aislados recuperados desde flores y frutos sintomáticos colectados en pre y poscosecha en un huerto del Valle Central. En total se seleccionaron completamente al azar 276 aislados monospóricos, determinándose la correspondencia genotípica mediante PCR-dúplex y el uso de partidores específicos (amplificación de secuencias transponibles Boty y Flipper). Posteriormente, 10 aislados de cada genotipo identificado se caracterizaron fenotípicamente con respecto a: 1) aspecto morfológico (miceliar/esclerocial), 2) capacidad formadora de esclerocios, 3) nivel de esporulación a 20ºC (Agar Malta) y 4) crecimiento miceliar a 15, 20 y 25ºC (agar malta); evaluándose además la virulencia de éstos mismos aislados en: a) bayas de vid cv. Thompson Seedless de 16,5º Brix de madurez, inoculadas con y sin herida y mantenidas en incubación a 20ºC por 96 horas (nº de bayas = 150/genotipo; 25 por repetición y condición) y b) en frutos de kiwi cv. Hayward (7-8º Brix) inoculados solo con heridas (nº de frutos = 100/genotipo; 25 por repetición), incubados a 20ºC y 0ºC por 17 y 60 días, respectivamente. Los resultados obtenidos señalan a vacuma como el genotipo predominante en floración (36%) y poscosecha (69.2%); transposa se presenta en menor proporción durante floración (20%), aumenta en cosecha (84%), y en poscosecha solo corresponde a un 7,7%. Los aislados tipo flipper, se presentaron en una baja a moderada frecuencia en todos los estadios fenológicos o periodos analizados, con excepción de fruto recién formado (24%); finalmente los aislados tipo boty solo se recuperaron en una alta proporción durante floración (32%), no detectándose en poscosecha. Estos resultados señalan que la composición de la población de Bc en kiwi difiere notoriamente de la descrita en uva de mesa de Chile, en la cual transposa predomina en todos los estadios fenológicos, y vacuma sólo se presenta en una muy baja proporción y casi exclusivamente en floración. Fenotípicamente, los aislados se comportaron de manera similar independientemente de la correspondencia genotípica (p > 0,05). En general, al evaluar la virulencia en bayas de vid a 20°C, los mayores diámetros de lesión en la condición con herida, fueron presentados por los aislados flipper (p < 0,05), pero sin diferencias con los demás genotipos en la modalidad sin herida (p > 0,05). En kiwis incubados a 20°C, aunque no se detectaron diferencias significativas entre aislados Bc de los distintos genotipos, vacuma fue el más virulento; en cambio a 0ºC, los aislados vacuma y boty fueron más agresivos diferenciándose significativamente de los aislados transposa y flipper (p < 0,05). Los resultados obtenidos permiten concluir la existencia de una posible asociación entre la composición genotípica de las poblaciones de Bc presentes en kiwi y el nivel de daño por pudriciones del patógeno en poscosecha. / The population dynamics of Botrytis cinerea (Bc) on a kiwifruit crop in Chile was studied by genetic and phenotypic characterization of a representative number of isolates from symptomatic flowers and fruits collected at pre- and postharvest in an orchard located in the Central Valley. In total, 279 randomly selected monosporic isolates were used, with the genotypic correspondence being determined by the duplex PCR reaction and the use of specific primers (amplification of transposable sequences Boty and Flipper). Later, 10 isolates of each identified genotype were phenotypically characterized with respect to: 1) morphological aspect (mycelial/sclerotical); 2) sclerotium-forming ability; 3) sporulation level at 20°C (malt agar); and 4) mycelial growth at 15, 20 and 25°C (malt agar). In addition, the virulence of the same isolates was evaluated in: a) ‘Thompson Seedless’ grape berries having 16,5°Brix of maturity, inoculated with and without wound and kept under incubation at 20°C for 96 hours (N° of berries = 150/genotype; 25 per replication and condition); and b) ‘Hayward’ kiwifruits (7-8°Brix) inoculated just with wounds (N° of fruits = 100/genotype; 25 per replication), incubated at 20 and 0°C for 17 and 60 days, respectively. The results obtained show vacuma as the predominat genotype (69.2%); transposa occured in a smaller proportion during bloom (20%), it increased at harvest time (84%), and at postharvest it only reached 7.7%. Flipper-type isolates occurred in a low-to-moderate frequency at all the phonological stages or periods analyzed, excepting newly-formed fruit (24%), while boty-type isolates were recovered in high proportion only during bloom (32%), not being detected at postharvest. These results indicate that B. cinerea population make-up differs markedly from that described in table grapes in Chile where transposa prevails at all the phenological stages, and vacuma occurs just in a very low proportion and almost exclusively at bloom. Phenotypically, the isolates behaved similarly irrespective of the genotypic correspondence (p >0.05). When evaluating the virulence, the greatest lesion diameters in wounded grape berries were shown by flipper isolates (p <0.05), but with no differences with the other genotypes in the unwounded group (p >0.05). In kiwifruit incubated at 20°C, although no significant differences were detected among Bc isolates of the different genotypes, vacuma was always the most virulent; conversely, at 0°C vacuma and boty isolate were more aggressive and differentiated significantly from the transposa and flipper isolates (p< 0.05). The results obtained suggest the existence of a possible association between the genotypic composition of Bc populations occurring in kiwifruit and the level of damage from rots caused by the pathogen at postharvest.