Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karol. inst., 2002. / Härtill 4 uppsatser.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 1997. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 97-110).

Thesis (Ph.D.)--University of Alabama at Birmingham, 2008. / Title from PDF title page (viewed on Sept. 17, 2009). Includes bibliographical references.

Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karolinska institutet, 2010.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2000. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 106-140).

O câncer colorretal (CCR) pode ocorrer em qualquer parte do cólon ou do reto e representa o terceiro câncer mais comum no mundo em ambos os sexos. As células Natural Killer (NK) fazem parte do sistema imune inato reconhecendo moléculas de HLA de classe I em células alvo, através de seus receptores de membrana killer cell immunoglobulin-like receptors (KIR). O objetivo deste estudo foi avaliar a associação entre os genes KIR e os ligantes HLA em pacientes com câncer colorretal e controles saudáveis. Examinamos o polimorfismo de 16 genes KIR e seus ligantes HLA em 154 pacientes caucasóides com CCR e 216 controles saudáveis pela técnica de PCR-SSO e PCR-SSP. Quando comparamos os dois grupos, não foram encontradas diferenças significativas para os ligantes HLA e os genes KIR após correção de Bonferroni. Entretanto, o grupo de genótipos Bx (heterozigoto e homozigoto para o haplótipo B) foi mais frequente nos controles, quando comparados com os pacientes. Estes achados sugerem que altos níveis de ativação de sinais KIR aparecem como proteção para o câncer colorretal. / Colorectal cancer (CRC) can occur anywhere in the colon or rectum and represents the third most common cancer in the world in both sexes. Natural killer cells (NK) are part of the innate immune system recognizing class I HLA molecules on target cells through their membrane receptors, called killer cell immunoglobulin-like receptors (KIR). The aim of our study was to evaluate the association between the KIR genes and HLA ligands in patients with colorectal cancer and healthy controls. We examined the polymorphism of 16 KIR genes and their HLA ligands in 154 caucasoid CRC patients and 216 healthy controls by PCR-SSO and PCR-SSP. When both groups were compared, no significant differences were found for HLA ligands and KIR genes after Bonferroni correction. However, the Bx group genotypes (heterozygous and homozygous for the haplotype B) were more frequent in controls, when compared with patients. These findings suggest that individuals with Bx genotypes could have some protection to colorectal cancer. These findings suggest that higher levels of activating KIR signals appear as protective to colorectal cancer.

O câncer colorretal (CCR) pode ocorrer em qualquer parte do cólon ou do reto e representa o terceiro câncer mais comum no mundo em ambos os sexos. As células Natural Killer (NK) fazem parte do sistema imune inato reconhecendo moléculas de HLA de classe I em células alvo, através de seus receptores de membrana killer cell immunoglobulin-like receptors (KIR). O objetivo deste estudo foi avaliar a associação entre os genes KIR e os ligantes HLA em pacientes com câncer colorretal e controles saudáveis. Examinamos o polimorfismo de 16 genes KIR e seus ligantes HLA em 154 pacientes caucasóides com CCR e 216 controles saudáveis pela técnica de PCR-SSO e PCR-SSP. Quando comparamos os dois grupos, não foram encontradas diferenças significativas para os ligantes HLA e os genes KIR após correção de Bonferroni. Entretanto, o grupo de genótipos Bx (heterozigoto e homozigoto para o haplótipo B) foi mais frequente nos controles, quando comparados com os pacientes. Estes achados sugerem que altos níveis de ativação de sinais KIR aparecem como proteção para o câncer colorretal. / Colorectal cancer (CRC) can occur anywhere in the colon or rectum and represents the third most common cancer in the world in both sexes. Natural killer cells (NK) are part of the innate immune system recognizing class I HLA molecules on target cells through their membrane receptors, called killer cell immunoglobulin-like receptors (KIR). The aim of our study was to evaluate the association between the KIR genes and HLA ligands in patients with colorectal cancer and healthy controls. We examined the polymorphism of 16 KIR genes and their HLA ligands in 154 caucasoid CRC patients and 216 healthy controls by PCR-SSO and PCR-SSP. When both groups were compared, no significant differences were found for HLA ligands and KIR genes after Bonferroni correction. However, the Bx group genotypes (heterozygous and homozygous for the haplotype B) were more frequent in controls, when compared with patients. These findings suggest that individuals with Bx genotypes could have some protection to colorectal cancer. These findings suggest that higher levels of activating KIR signals appear as protective to colorectal cancer.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:03:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissNDHV.pdf: 2131970 bytes, checksum: c7f6510e36c70fc8b4fd05d431744457 (MD5) Previous issue date: 2006-05-26 / Financiadora de Estudos e Projetos / In Large Scale Collaborative Virtual Environments LSCVEs, extensive synthetic 3D environments are shared among a large number of users that collaborate towards the same objective. As all users in these environments need immediate answer for their actions and these actions must be sent to all participating users, the application success depends not only on a strong graphic processing but also in the capacity of the network to deliver information in time. Data distribution management algorithms in conformity with the High Level Architecture / Run Time Infrastructure (HLA/RTI) pattern for parallel and distributed simulations have been used to reduce latency and to limit and control the data amount exchanged during simulations. The data distribution of LSCVEs is generally made by one of these communication models: client/server or Peer-to-peer. Differently of the client/server where the server can be a bottleneck of the network, in Peer-to-peer solutions the tasks are distributed and consequently applications are scalable, i.e., support a crescent client number. Motivated by these largely studied and commonly used technologies, a fault tolerant and low latency solution was searched, addressing the strict requirements of large scale collaborative virtual environments simulations. This was made in conformity with the HLA pattern, which users, using their own computer connected at Gnutella network, can participate in simulation sessions without the limitations found in kits that support distributed simulations like the RTI-Kit existent. For this reason an architecture was proposed with data distribution management in conformity with the HLA/RTI and that use the Gnutella Peer-to-peer communication model to make available and to share these environments over Mobile Ad-Hoc Networks (MANETs). Towards this propose simulations were made comparing the RTI-Kit developed by Georgia Tech with one speed objects and the RTI-Kit Adapted with varied speed objects in a cluster. The evaluation of the total time of the federation execution, the total number of the multicast messages generated and the total number of messages exchanged by the grid originated graphics that show up considerable increasing in the time and the number of messages exchanged by the grid mainly. In the same way the fault tolerant technique was evaluated. / Em Ambientes Virtuais Colaborativos de Larga Escala (AVCs-LE), ambientes 3D sintéticos extensos são compartilhados entre um número muito grande de usuários que colaboram entre si para atingir um objetivo comum. Nesses ambientes, os usuários precisam ter uma resposta imediata às suas ações, e estas devem ser refletidas nos ambientes de todos os usuários participantes. Assim, o sucesso da aplicação depende não apenas de processamento gráfico poderoso, mas também, da capacidade da rede na entrega das informações a tempo. Algoritmos de gerenciamento de distribuição de dados, em conformidade com o padrão High Level Architecture / Run Time Infrastructure (HLA/RTI) para simulações paralelas e distribuídas, vêm sendo utilizados na redução da latência e como limitantes e controladores do volume de dados trocados durante simulações. A distribuição de dados de AVCs-LE é realizada normalmente por um destes modelos de comunicação: cliente/servidor ou Peer-to-peer. Diferentemente do modelo cliente/servidor no qual a figura do servidor pode caracterizar um gargalo na rede, nas soluções Peer-to-peer as atividades estão distribuídas e conseqüentemente, suas aplicações são escaláveis, ou seja, suportam uma quantidade crescente de usuários. Motivados por essas tecnologias amplamente estudadas e comumente utilizadas, procurou-se criar uma solução tolerante a falhas e de baixa latência, dentro dos requisitos de simulações de ambientes virtuais colaborativos de larga escala. Isso foi feito em conformidade com o padrão HLA, em que usuários, utilizando seu próprio computador conectado a uma rede Gnutella, possam participar de sessões de simulações sem as limitações encontradas em kits de suporte à simulação distribuída, como o Kit RTI existente. Em razão disso, foi proposta uma arquitetura com gerenciamento de distribuição de dados em conformidade com o HLA, padrão comumente utilizado em simulações paralelas e distribuídas e que utiliza o modelo de comunicação Peer-to-peer da rede Gnutella para disponibilização e compartilhamento de tais ambientes, sobre redes móveis Ad-Hoc (Mobile Ad-Hoc Networks - MANETs). Para tanto, realizaram-se simulações comparativas entre o Kit RTI desenvolvido pela Georgia Tech, com objetos de apenas uma velocidade, contra o Kit RTI Adaptado, com objetos de velocidade variada, em um cluster. A avaliação do tempo total de execução da federação, o número total de mensagens multicast geradas e o número total de mensagens trocadas pela grade deu origem a gráficos que mostraram aumentos consideráveis, principalmente, no tempo e no número de mensagens trocadas pela grade. Da mesma forma, foi avaliada a técnica proposta, tolerante a falhas.

Introduction: Virus-specific CD8+ T cells are crucial to suppress the viral replication in HIV infection. Their functional status is important as well. Also, the chronic nonspecific immune activation of T and B lymphocytes plays an important role in the immunopathogenesis of HIV infection. Aim of the study: To analyze the frequency and functional status of HIV-specific CD8+ T cells and the expression of nonspecific activation markers on B and T cells in HIV+ patients and to assess the effect of combined antiretroviral therapy (cART) on these parameters. Patients and methods: Our cohort included 80 HIV+ patients: 36 HIV+ patients on cART, 18 patients without therapy, in whom cART was introduced during our study, 9 patients without therapy, 10 patients with primary HIV infection, 3 long-term non-progressors and 4 patients initially on cART, in whom the therapy was discontinued. Control group consisted of 34 HIV- healthy individuals. We examined CD4+ a CD8+ T cell counts, viral load, expression of nonspecific activation markers on T cells and the frequency of HIV-specific CD8+ T cells by ELISpot method and flow cytometry using MHC tetramers and intracellular cytokine detection. Results: No significant differences in HIV-specific CD8+ T cells were found between treated and untreated HIV+ patients. The frequency...

Orientador: Manoel Barros Bertolo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-21T17:57:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DelRio_AnaPaulaToledo_M.pdf: 1151549 bytes, checksum: 2407595c8d19b5531c6d084bba4d3238 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Introdução: A esclerose sistêmica (ES) é uma doença autoimune caracterizada por disfunção endotelial, vasculopatia obliterativa, fibrose cutânea e visceral. Trata-se de doença poligênica complexa que se manifesta em indivíduos geneticamente predispostos com exposição a fator ambiental ou outro precipitante e seu desenvolvimento depende da interação entre processos imunológicos, vasculares e fibróticos. Estudos genéticos prévios procuram correlacionar os alelos HLA classe I e II e as manifestações clínicas da doença. A fibrose pulmonar (FP) e a hipertensão arterial pulmonar (HAP) são, atualmente, os acometimentos com maior impacto prognóstico e as principais causas de óbito nos pacientes com ES. A expressão do autoanticorpo antitopoisomerase I (anti-Scl70) é um forte preditor de FP, associada à forma difusa e a HAP está relacionada ao anticorpo anticentrômero e à forma limitada da doença. Objetivos: O objetivo deste estudo foi avaliar a participação do HLA na expressão da doença e suas manifestações clínicas de pior prognóstico (FP e HAP) em pacientes com ES em uma população miscigenada. Métodos: Foram incluídos os pacientes com ES seguidos no ambulatório de Reumatologia da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) de 2008 a 2011. Os dados clínicos foram obtidos através da análise dos prontuários. A genotipagem dos alelos Classe I e II foi realizada através da técnica de amplificação pela reação em cadeia da polimerase, utilizando seqüências específicas de primers. A análise estatística incluiu o teste exato de Fisher e o teste do qui-quadrado de Pearson. Foram considerados significativos valores de p ? 0,05. A razão de prevalência foi estimada pelo método delta. Resultados Cento e quarenta e um pacientes (120 mulheres e 21 homens) foram estudados, sendo 33,3% ES difusa, 62,4% ES limitada e 4,3% ES sine scleroderma. A FP foi considerada em 61 pacientes (43,3%), os alelos HLA-A*30 e DQB1*04 foram relacionados à suscetibilidade. No entanto, os alelos HLA-DRB1*01 e DQB1*05 foram relacionados à ausência desta manifestação. A HAP foi diagnosticada em 19 pacientes (13,5%) e teve associação com HLA-B*35 e C*04, enquanto o alelo C*03 pareceu ser protetor. Conclusões: Este estudo aponta para associação de alguns alelos do HLA classe I e II às manifestações clínicas de maior morbimortalidade na ES nesta série de casos. Estes achados não foram semelhantes aos encontrados previamente em outras populações, o que evidencia múltiplos padrões genéticos na ES / Abstract: Introduction: Systemic sclerosis (SSc) is an autoimmune disease characterized by endothelial dysfunction, occlusive vasculopathy, cutaneous and visceral fibrosis. This is a complex polygenic disease that manifests in genetically predisposed individuals with environmental or other precipitating factor exposure and its development depends on the interaction between immunological, vascular and fibrotic processes. Previous genetic studies aimed to correlate class I and II HLA and the clinical manifestations of the disease. Pulmonary fibrosis (PF) and pulmonary arterial hypertension (PAH) are currently the worse prognostic features and the main causes of death in patients with SSc. The presence of anti-topoisomerase I antibody (anti-Scl70) is a strong predictor of FP, associated with diffuse SSc and PAH is related to anticentromere and the limited form of the disease. Objectives: The aim of this study was to evaluate the HLA involvement in disease expression and poor prognostic clinical features, pulmonary fibrosis (PF) and pulmonary arterial hypertension (PAH), in patients diagnosed with systemic sclerosis (SSc) in a multiethnic population. Methods: SSc patients followed 2008-2011 were included and clinical data were obtained through records review. Molecular HLA typing was performed (PCR amplification technique using sequence of specific primers). Statistical analysis included Fisher's exact test and Pearson's corrected chi-square test. P values ? 0.05 were considered significant. The prevalence ratio was estimated by delta method. Results: One hundred forty-one patients (120 women and 21 men) were studied, 33,3% dcSSc, 62,4% lcSSc and 4,3% sine scleroderma. PF was present in 61 patients (43,3%), HLA-A*30 and DQB1*04 were related to susceptibility. However, HLA-DRB1*01 and DQB1*05 alleles were protective. PAH was diagnosed in 19 (13,5%) and had association with HLA-B*35 and C*04, whereas C*03 seemed to be protective. Conclusions: Our current study documents the association of some class I and II HLA alleles with the most severe clinical manifestations in a multiethnic case series. Our findings were not absolutely similar to the previous data in other populations / Mestrado / Clinica Medica / Mestra em Clínica Médica