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DNA Barcoding na identificação de espécies de tubarões exploradas comercialmente no litoral de São Paulo

Ramos, Maíce Giovanini January 2016 (has links)
Orientador: Fábio Porto Foresti / Resumo: Atualmente estamos em uma corrida entre a descrição da biodiversidade da Terra e sua extinção. Estima-se que a maior parte dessa biodiversidade está sendo extinta antes mesmo de ser descrita. Dentre essa grande diversidade, os peixes são os vertebrados de maior sucesso evolutivo, caracterizando uma diversidade impressionante. Os tubarões, por exemplo, caracterizam em predadores do topo de cadeia alimentar, sendo descritas atualmente aproximadamente 500 espécies, e cada vez mais novas descobertas são feitas com relação a novas espécies. Porém as populações de tubarões estão em declínio devido ao consumo desenfreado de suas nadadeiras pelo mercado e comércio asiático. Soma-se a isso a grande dificuldade na identificação morfológica que é associada à prática de remoção da cabeça e de partes do corpo. A descaracterização pode dificultar, ou no caso de algumas espécies, até mesmo impossibilitar sua identificação. Portanto a necessidade de identificar as espécies de forma mais rápida e eficiente levou ao desenvolvimento de marcadores moleculares, que pudessem servir de respaldo para o monitoramento e controle do comércio desses animais. Uma dessas ferramentas é o DNA Barcode, o qual foi utilizado nesse trabalho para a identificação de nadadeiras coletadas no mercado de peixe de algumas cidades como Santos, Ubatuba e Cananéia do estado de São Paulo. O sequenciamento do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I foi realizado. Posteriormente foram analisadas as sequências no si... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre
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Extração de DNA de ossos humanos, sem pulverização, para uso em identificação forense

Geovânia de Araújo Carvalho, Hérika 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1563_1.pdf: 981921 bytes, checksum: 6dbb35cbfc792ecdfea9f1605456633b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / O uso de tecido ósseo como substrato na obtenção de DNA para estudo de loci STR (Repetições Curtas em Tandem) é bastante útil em ciência forense, especialmente na identificação de restos mortais e de vítimas de desastres em massa. Algumas técnicas de extração de DNA de material ósseo incluem uma incubação prévia do material pulverizado em EDTA (Ácido Etilenodiamino Tetra- Acético) como etapa de descalcificação. Nosso trabalho apresenta um protocolo de obtenção de DNA de ossos bastante eficiente, no qual é feita uma descalcificação da matriz óssea com o auxílio do quelante EDTA, não sendo necessária a pulverização da amostra por moinhos mineralógicos ou criogênicos. Nesse sentido, alíquotas de amostras de osso foram submetidas à extração de DNA pelo método orgânico tradicional com pré-tratamento de descalcificação em EDTA, seguidas por uma amplificação com um sistema multiloci e seqüenciadas através de eletroforese capilar. Os resultados mostraram quantidades de DNA compatíveis com a obtenção de perfis genéticos completos, com amplificação simultânea de 16 regiões (loci) STR. Portanto, foi visto que este novo protocolo de extração de DNA de amostras ósseas é adequado para emprego na identificação humana com finalidades forenses
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Identificação biométrica de pessoas via características dos seios paranasais obtidas de tomografias computadorizadas / Biometric human identification by means of paranasal sinuses features obtained from computed tomographys

Souza Júnior, Luis Antonio [UNESP] 05 August 2016 (has links)
Submitted by Luís Antonio de Souza Júnior null (lu.playon@gmail.com) on 2016-09-12T15:53:45Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Luis_Souza_2016_final.pdf: 13262847 bytes, checksum: 14720c149fae5d6dcaceedbc097f8aed (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-09-14T19:26:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souzajunior_la_me_sjrp.pdf: 13262847 bytes, checksum: 14720c149fae5d6dcaceedbc097f8aed (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-14T19:26:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souzajunior_la_me_sjrp.pdf: 13262847 bytes, checksum: 14720c149fae5d6dcaceedbc097f8aed (MD5) Previous issue date: 2016-08-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A identificação biométrica de pessoas na área forense está em constante estudo para facilitar e melhorar as maneiras de identificação mediante a avaliação de diversas estruturas que podem ser utilizadas como características biométricas. Os seios paranasais, cavidades ósseas presentes no crânio, apresentam alta individualidade e permanência, podendo ser utilizados em sistemas biométricos forenses. As maneiras de representação digital dos seios paranasais são modalidades de exames médicos, conhecidos como raios-X e tomografia computadorizada. As imagens de raios-X como ferramentas para obtenção de características dos seios paranasais apresentam alta aplicação nos trabalhos correlatos, entretanto, nesta modalidade de imagem, algumas desvantagens, como a baixa qualidade de resolução dificultam a identificação dos seios paranasais. Com a tomografia computadorizada, uma nova avaliação pode ser realizada para a obtenção das características dos seios paranasais, visto que esta modalidade de exame gera uma sequência de imagens com qualidade superior, tornando a segmentação e extração de características dos seios paranasais mais simples, intuitiva e precisa, facilitando seu uso em sistemas de reconhecimento biométrico. O objetivo desta dissertação foi desenvolver um novo método de identificação humana utilizando estruturas dos seios paranasais, obtidas de imagens de tomografia computadorizada, como características biométricas. Este método propõe avanços significativos principalmente nas etapas de segmentação e extração de características, uma vez que a segmentação das estruturas dos seios paranasais é realizada de forma automática. As características propostas como descritores são baseadas nas regiões e nas formas das estruturas dos seios paranasais. Resultados experimentais obtidos sobre uma base de dados contendo 310 imagens de tomografia computadorizada mostraram que o método automático proposto nesta dissertação obteve taxa de segmentação medida pelo Coeficiente KAPPA igual a 88,52% na segmentação dos seios frontais e 79,30% na segmentação dos seios maxilares. Com relação à identificação de pessoas, o método proposto obteve, no melhor caso, 8,99% de taxa de erro igual (EER). Assim, nesta dissertação de mestrado concluiu-se que: os seios da face podem ser utilizados com êxito para a identificação forense de pessoas, em particular os seios frontais; que os descritores de forma para os seios frontais são mais efetivos do que os descritores de região para a identificação de pessoas, enquanto que para os seios maxilares, os descritores de forma não apresentam alto valor de discriminação entre os indivíduos e; que é possível automatizar o processo de segmentação dos seios frontais e maxilares utilizando-se imagens de tomografia computadorizada. / Biometric identification of people in the forensic field is constantly being studied to facilitate and improve the identification methods through the evaluation of several structures that can be used as biometric features. The paranasal sinuses, bone cavities present in the skull, have high individuality and permanence and can be used in forensic biometric systems. The X-rays and Computed Tomography are modalities of medical examinations used for the digital representation of the paranasal sinuses. X-rays images as a tool to obtain characteristics of the paranasal sinuses are highly applicable in the related works, however, in this imaging modality, some disadvantages, such as low quality resolution, make these structures harder to acquire. With computed tomography representation, a new evaluation can be performed to obtain the paranasal sinuses features, knowing that this exam modality generates an image sequence with higher quality, making the paranasal sinuses segmentation and feature extraction simpler, intuitive and precise, facilitating its use in biometric recognition systems. The objective of this master’s dissertation was the development of a new human identification method that uses paranasal sinuses structures as biometric features, obtained from computed tomography images. This method proposes significant advances, specially on the segmentation and features extraction stages, once the segmentation of the paranasal sinuses structures is performed automatically. The characteristics proposed for the feature descriptors are based on the region and shape of the paranasal structures. The experimental results obtained from a database composed by 310 computed tomography images presented that the automatic method proposed in this dissertation showed 88.52% of frontal sinuses segmentation and 79.30% of correct maxillary sinuses segmentation using the KAPPA coefficient. Relative to the persons identification, the proposed method presented in the best case 8.99% of EER. Therefore, in this master’s dissertation, it was concluded that: the face sinuses, and in particular the frontal sinuses, can be used with success for the forensic human identification; for the human identification based on the frontal sinuses the shape descriptors are more efficient than the region descriptors, while that for the human identification based on maxillary sinuses, the shape descriptors do not presented high discrimination performance and; it is possible to automate the frontal and maxillary sinuses segmentation process using computed tomography images.

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