Orientador: Fábio Porto Foresti / Resumo: Atualmente estamos em uma corrida entre a descrição da biodiversidade da Terra e sua extinção. Estima-se que a maior parte dessa biodiversidade está sendo extinta antes mesmo de ser descrita. Dentre essa grande diversidade, os peixes são os vertebrados de maior sucesso evolutivo, caracterizando uma diversidade impressionante. Os tubarões, por exemplo, caracterizam em predadores do topo de cadeia alimentar, sendo descritas atualmente aproximadamente 500 espécies, e cada vez mais novas descobertas são feitas com relação a novas espécies. Porém as populações de tubarões estão em declínio devido ao consumo desenfreado de suas nadadeiras pelo mercado e comércio asiático. Soma-se a isso a grande dificuldade na identificação morfológica que é associada à prática de remoção da cabeça e de partes do corpo. A descaracterização pode dificultar, ou no caso de algumas espécies, até mesmo impossibilitar sua identificação. Portanto a necessidade de identificar as espécies de forma mais rápida e eficiente levou ao desenvolvimento de marcadores moleculares, que pudessem servir de respaldo para o monitoramento e controle do comércio desses animais. Uma dessas ferramentas é o DNA Barcode, o qual foi utilizado nesse trabalho para a identificação de nadadeiras coletadas no mercado de peixe de algumas cidades como Santos, Ubatuba e Cananéia do estado de São Paulo. O sequenciamento do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I foi realizado. Posteriormente foram analisadas as sequências no si... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-12T22:56:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1305_1.pdf: 3126267 bytes, checksum: e8a5e32ac8107ccff1b4cbd2fbf9c06e (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Universidade do Estado da Bahia / O presente trabalho relata a biologia de 3 espécies de tubarões, o Carcharhinus falciformis, Carcharhinus plumbeus e o Pseudocarcharias kamoharai, além da ecologia da raia prego, Dasyatis americana. Primeiramente foi estudada a biologia reprodutiva do C. falciformis, sendo examinado um total de 96 indivíduos, sendo 48 machos e 48 fêmeas, capturados na região Equatorial do Oceano Atlântico, nas proximidades do Arquipélago de São Pedro e São e São Paulo (0°55 10 N;29°20 33 W). O comprimento total (CT) dos indivíduos variou entre 83,0 e 272,0cm, para as fêmeas e entre 75,0 e 295,0 para os machos. Estes dados sugerem um tamanho de primeira maturação sexual para o tubarão lombo-preto, em águas equatoriais, de aproximadamente 230,0cm, para as fêmeas e de 210,0 a 230,0cm para os machos. A distribuição mensal das fases sexuais ao longo do ano das fêmeas, não apresentaram uma tendência clara, sugerindo que pelo menos, na área estudada, esta espécie, não apresenta um ciclo gestacional anual claro. A proporção sexual dos embriões foi igual a 1:1,4 (macho:fêmea), com uma fecundidade de 4 a 15 embriões por período gestacional. Outra espécie que também teve os aspectos da sua biologia reprodutiva investigados foi o C. plumbeus, que durante o período de dezembro de 1994 a janeiro de 1996, teve, um total de 28 tubarões, sendo 11 machos e 17 fêmeas, capturados na região Nordeste do Brasil, na área de talude continental, em frente à costa do Estado de Pernambuco. O CT variou entre 154,0 e 196,0cm para os machos e entre 108,5 e 208,0cm para as fêmeas. A distribuição mensal dos estágios sexuais demonstraram que o parto e a ovulação ocorrem nos mesmos meses, sugerindo um ciclo de gestacional de 12 meses, em anos alternados. O número de embriões por fêmea grávida, variou entre 7 e 10 indivíduos, com um valor médio de 8,6, apresentando os mesmos uma proporção sexual de 1:1,4(macho:fêmea). Uma terceira e ultima espécie ainda teve a biologia reprodutiva investigada, no período de fevereiro de 2005 a setembro de 2007 foram capturados, por barcos da frota comercial arrendada, 490 exemplares de tubarão cachorro, Pseudocarcharias kamoharai, no Atlântico Tropical (06º 45 N e 23º 36 S e 018º 44 W e 053º 13 W). Em laboratório, os indivíduos capturados foram identificados e tiveram seus principais comprimentos aferidos, e seus aparelhos reprodutores coletados e fixados em formol a 10%. Dos 490 espécimes de tubarão cachorro analisados, 313 (63,9%) eram fêmeas, com CT variando de 75,0 a 122,0 cm, e 177(36,1%) eram machos, com CT entre 65,5 e 109,0 cm. As fêmeas apresentaram 6 classes de estágios maturacionais, enquanto que os machos apenas 2 classes. A distribuição de freqüência de comprimento apresentou uma moda para as fêmeas de entre 90,1 e 100,0 cm, sendo igual para os machos. O peso médio da glândula oviducal nos jovens apresentou diferença estatisticamente significantes em relação aos outros estágios (Kruskal-Wallis, F=2.34; P = 0.004). As fêmeas classificadas como adultas, exibiam todo o aparelho reprodutor desenvolvido, contudo, sempre, com peso do ovário e largura dos úteros menores que os outros estágios, excetuando-se as juvenis. As fêmeas prenhes, cujo CT variou entre 87,5 e 118,6 cm, foram classificadas em quatro estágios distintos, prenhe I, II, III e IV (a termo), pois, embora estivessem na mesma condição, exibiam características particulares, principalmente no que tange as condições dos úteros e ovários. As fêmeas classificadas como prenhe II apresentavam os ovários com características semelhantes aos da prenhe I, contudo com um peso médio um pouco maior e com intensa atividade vitelogênica. Os espécimes classificados como prenhe III, continham em seus úteros apenas embriões, com comprimento total sempre inferior a 30 cm. Os espécimes classificados no estágio de prenhes IV (a termo) exibiam os ovários nitidamente em processo de reabsorção, não se encontrando mais em ovulação, o que pode ser verificado pela diminuição de seu peso. Apresentavam ainda em ambos os úteros embriões com CT superior a 30,0 cm. As relações entre o comprimento total e a largura dos úteros e o peso das glândulas oviducais apontam para um tamanho de 1º maturação sexual em torno de 90,0 cm de CT. Entre os 177 machos examinados 37 (20,9%) encontravam-se juvenis, com CT variando entre 65,5 94,0 cm e 140 (70,1%), eram adultos, exibindo CT entre 80,0 109,0 cm. As relações entre CT e a largura, comprimento e peso do aparelho reprodutor da espécie, apontam para um tamanho de primeira maturação sexual entre 80,0 e 94,0 cm de CT. Também foi realizado um estudo de ocorrência do Rynchodon typus no Arquipélago de São Pedro e São Paulo, por se tratar de um importante local de concentração de tubarões-baleia. Os animais foram vistos ao longo de todo ano, próximos às embarcações de pesca nas adjacências das ilhas. Em avistagens registradas entre fevereiro de 2000 e novembro de 2005, os comprimentos dos indivíduos variaram entre 1,8 m e 14 m. As causas destas concentrações no arquipélago ainda não são claras, uma vez que não há há ressurgências e grandes concentrações de plâncton no arquipélago, e também não foram observadas atividades reprodutivas. No entanto, podem estar associadas ao período de desova dos peixes-voadores, marcadamente no primeiro semestre, quando as aparições são mais freqüentes. Finalizando, foi realizado na Reserva Biológica do Atol das Rocas o trabalho de ecologia populacional e uso do habitat da Dasyatis americana, sendo avistadas 184 raias, durante as incursões subaquáticas, no período de agosto de 2003 a dezembro de 2005. O tamanho dos indivíduos variou entre 29,0 e 113,0 cm de largura de disco (LD). A maioria dos espécimes observados encontravam-se na faixa de 80,0 a 89,0 cm de LD, representando cerca de 25% do total. As fêmeas foram mais abundantes que os machos, com uma proporção sexual de 5,7♀:1♂ (fêmea:macho). O tamanho da população foi estimada em 99,2±17,1 e 94,4±10,3 indivíduos, utilizando Petersen-Bayley e Jolly-Saber, como estimadores probabilísticos, respectivamente. Os espécimes observados apresentaram comportamentos de alimentação e movimentação altamente relacionados com o severo ciclo de mares imposto pelo Atol

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-08-31Bitstream added on 2014-06-13T19:46:41Z : No. of bitstreams: 1 motta_fs_dr_rcla.pdf: 2587305 bytes, checksum: 0ff789362fdf8eb0461ea7ed5c963eeb (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No âmbito de um estudo sobre a ecologia e a pesca de tubarões costeiros no litoral centro-sul de São Paulo, foram feitas amostragens semanais junto aos desembarques da frota artesanal sediada na Praia dos Pescadores, no município de Itanhaém. Os barcos operam a uma distância de 2 a 12 milhas náuticas (20 km) da costa, em profundidades de 5 a 30 m, utilizando redes de emalhe. Entre julho de 1996 e dezembro de 2003, foram examinados 14730 exemplares, compreendendo sete famílias, nove gêneros e 18 espécies. A acumulação de espécies em função do número de amostragens apresentou tendência de estabilização a partir de 90 amostragens. Em geral, a diversidade foi menor no outono-inverno e maior na primavera-verão. A captura por unidade de esforço (CPUE) dos tubarões apresentou picos nos meses de início (janeiro e fevereiro), meio (julho e agosto) e final de ano (novembro e dezembro). Essas flutuações estiveram associadas aos padrões de recrutamento, distribuição e ocorrência das espécies mais abundantes. Cinco espécies de Carcharhiniformes utilizam o litoral centro-sul de São Paulo como área de berçário entre o inverno e verão. O tempo de permanência dos neonatos e jovens na área de estudo esteve inversamente relacionado com o tamanho de nascimento das espécies, indicando maior dependência dos filhotes menores por águas mais rasas e, supostamente mais protegidas de predadores. Foi observada uma assincronia seqüencial na atividade de parto das espécies, sugerindo que o estabelecimento de berçários coletivos aumenta as chances de competição e predação entre os filhotes. Pressões seletivas neste sentido parecem levar ao desenvolvimento de táticas reprodutivas que amenizam esses efeitos, reduzindo a mortalidade natural dos filhotes durante os primeiros meses de vida. / Ecological aspects of the coastal sharks caught by artisanal fisheries from southeastern Brazil were studied between July 1996 and December 2003. The fishing fleet comprised 12 small motorized boats (4 - 10 m long), using monofilament gill nets with 1500 m length and stretched mesh sizes of 7, 12 and 14 cm on average. The nets are set within an area of 2 - 12 nautical miles from the shore, in waters between 5 and 30 m deep. During the study period, 14730 sharks of seven families, nine genera and 18 species were examined. In general, diversity was highest in spring-summer and lowest in autumn-winter. Catch per unit of effort (CPUE) showed peak in outset (Jan-Feb), middle (Jul- Aug) and, end (Nov-Dec) of the years. Both diversity and CPUE fluctuations were associated with recruitment, distribution and occurrence of the five most abundant species (Rhizoprionodon lalandii, R. porosus, Sphyrna lewini, Carcharhinus brevipinna and C. limbatus), that represented 96% of the total catch. These species use the study area as nursery between winter and summer with a sequence of parturition progressing from the smallest (R. lalandii, 35 cm birth size) to the largest species (C. limbatus, 70 cm birth size). Such pattern was associated with reproductive tactics that may minimize both inter-specific predation and competition among newborns, thereby reducing natural mortality during their first few months of life.

Existem muitos estudos sobre a ocorrência de poluentes orgânicos persistentes (POPs) no ambiente marinho utilizando bioindicadores como os tubarões. Entretanto, no Brasil, ainda há carência de dados de POPs nesses organismos. O objetivo desta pesquisa foi investigar a ocorrência e o comportamento dos PCBs, pesticidas organoclorados e PBDEs no ambiente marinho, a partir da utilização dos tubarões como indicadores. Musculatura e fígado de vinte tubarões-azul (Prionace glauca) foram coletados em agostosetembro de 2008. Os PCBs foram os poluentes predominantes, presentes em 80% das amostras, com concentrações variando de <n.d. a 427,28 ng.g-1 de peso úmido. Os diclorodifeniletanos apresentaram concentrações variando de 0,43 a 202,42 ng.g-1 de peso úmido, no qual o 4,4´-DDE foi o composto mais significativo, com 77,6% de contribuição para os DDTs totais. As concentrações no fígado foram 1-2 ordens de grandeza mais elevadas, em relação às de musculatura. Houve um padrão de distribuição dos poluentes com níveis equivalentes entre indivíduos imaturos. Os machos maduros apresentaram concentrações de POPs sensivelmente maiores que as fêmeas maduras, indicando a transferência dos POPs para os filhotes. Os resultados demonstraram a ampla distribuição desses poluentes no ambiente marinho. / There are many studies about the occurrence of persistent organic pollutants (POPs) in the marine environment using sharks as bioindicators. However, there is still a lack of data of POPs in those organisms in Brazil. The goal of this research was to investigate the occurrence and behavior of PCBs, organochlorine pesticides and PBDEs in the marine environment, using sharks as indicators. Muscle and liver of twenty blue-sharks (Prionace glauca) were collected in august-september 2008. The PCBs were the predominant pollutants and being present in 80% of samples, with concentrations ranging from <n.d. to 427.28 ng.g-1 wet weight. The dichlorodiphenylethanes present concentrations ranging from 0.43 to 202.42 ng.g-1 wet weight, where the 4,4´-DDE was the most significative compound, with contributions of 77,6% of the total DDTs. The concentrations in the liver were 1-2 orders of magnitude higher than in the muscle. There was a distribution pattern of the pollutants, with equivalent levels among the immature specimens. The concentration of POP was significantly higher in the mature males and relatively lower in the mature female, showing the maternal transference of POPs to the pups. The results have demonstrated a wide distribution of these pollutants in the marine environment.

Squalidae compreende dois gêneros de tubarões, Squalus e Cirrhigaleus cujas espécies apresentam taxonomia complexa devido à dificuldade de distinção morfológica entre elas, associado a uma incerteza à aplicação de várias espécies nominais. A revisão taxonômica e morfológica dos representantes da família foi conduzida para delimitar globalmente as espécies válidas e fornecer caracteres diagnósticos eficientes através de análises detalhada da morfologia externa e esquelética. Foram reconhecidas 30 espécies válidas para a família, classificadas em dois gêneros. Squalus compreende um gênero menor com três espécies de tubarões com manchas brancas no corpo. Um segundo gênero, separado de Squalus, é reconhecido para abrigar 27 espécies de tubarões sem manchas. Assim, a hipótese de subdivisão do gênero Squalus em &ldquo;grupos/complexos de espécies&rdquo; (grupos S. acanthias, S. mitsukurii e S. megalops) foi refutada. Sete espécies novas são descritas para os Oceanos Atlântico Sul e Índico Ocidental, e duas espécies nominais são ressuscitadas como válidas. Cinco espécies são propostas como novos sinônimos de outras espécies dentro deste contexto. Cirrhigaleus é um gênero válido e menos diverso, incluindo três espécies com barbilhão nasal. A alocação genérica da espécie nominal &ldquo;asper&rdquo;, antes em constantes discussões na literatura, é finalmente esclarecida para Cirrhigaleus. A classificação taxonômica de Cirrhigaleus dentro de Squalidae, contudo, é questionada e uma nova família para Squaliformes é proposta para abrigar este gênero. Características do esqueleto em Squalidae exibem complexidade e variação maior do que antes descrito. Caracteres esqueléticos são também apresentados para serem integrados em análise filogenética futura / Squalidae comprises two genera of sharks, Cirrhigaleus Squalus, whose species have complex taxonomy due to difficulty of morphological distinction between them, associated to an uncertainty to the application of its available nominal species. A taxonomic and morphological revision of the family was conducted in order to globally delimitate the valid species and provide efficient diagnostic characters through detailed analyses of external and skeletal morphology. Squalus is herein recognized as a smaller group, which comprises three species of spotted-dogfish. A second genus is raised as separated from Squalus with 27 species of non-spotted dogsharks. Thus, the hypothesis of subdivision of Squalus into three groups/complexes of species (S. acanthias, S. mitsukurii and S. megalops groups) is refuted. Seven new species are described for the South Atlantic and West Indian Oceans, and two nominal species are resurrected as valid for the family. Five species are proposed as new synonyms from other species within this context. Cirrhigaleus is a valid and less diverse genus, comprising three species of barbel-bearing dogfish. Generic allocation of the nominal species &ldquo;asper&rdquo;, beforehand under constant discussions on literature, is elucidated for Cirrhigaleus. However, taxonomic classification of Cirrhigaleus within Squalidae is questioned and a new family for Squaliformes is proposed to incorporate the genus. Characteristics of the skeleton in Squalidae reveal to be more complex than previously thought. Morphological characters are also provided for integrating future phylogenetic analysis

Orientador: Fausto Foresti / Resumo: Populações de elasmobrânquios têm sofrido declínios severos nas últimas décadas devido à massiva pressão pesqueira. Com características de vida que tornam a espécie mais suscetível à pesca, o tubarão-raposa Alopias superciliosus está classificado atualmente como vulnerável na lista vermelha de espécies ameaçadas da IUCN. A espécie apresenta maturação sexual tardia e somente dois (raramente quatro) filhotes a cada gestação, que dura aproximadamente 12 meses. Estas características evidenciam a necessidade de sistemas de manejo pesqueiro adequados à estruturação populacional da espécie, que se apresenta como um instrumento fundamental para sua conservação. Com o advento de novas tecnologias atualmente é viável utilizar ferramentas moleculares para elucidar questões evolutivas e genético-populacionais em organismos não modelos, gerando informações que podem auxiliar na elaboração de planos de manejo. Tendo em vista à escassez de informações sobre a dinâmica populacional do tubarão-raposa, o presente estudo teve como objetivo o desenvolvimento e aplicação de marcadores moleculares em amostras de A. superciliosus provenientes de diferentes localidades dos oceanos Atlântico e Índico. Um total de 12 marcadores moleculares do tipo microssatélite, sendo 11 polimórficos e 1 monomórfico, foram identificados e, a partir desta identificação, primers espécie-específicos foram desenvolvidos e padronizados. Para acessar a diversidade genética e populacional de A. superciliosus foram genotipad... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Existem muitos estudos sobre a ocorrência de poluentes orgânicos persistentes (POPs) no ambiente marinho utilizando bioindicadores como os tubarões. Entretanto, no Brasil, ainda há carência de dados de POPs nesses organismos. O objetivo desta pesquisa foi investigar a ocorrência e o comportamento dos PCBs, pesticidas organoclorados e PBDEs no ambiente marinho, a partir da utilização dos tubarões como indicadores. Musculatura e fígado de vinte tubarões-azul (Prionace glauca) foram coletados em agostosetembro de 2008. Os PCBs foram os poluentes predominantes, presentes em 80% das amostras, com concentrações variando de <n.d. a 427,28 ng.g-1 de peso úmido. Os diclorodifeniletanos apresentaram concentrações variando de 0,43 a 202,42 ng.g-1 de peso úmido, no qual o 4,4´-DDE foi o composto mais significativo, com 77,6% de contribuição para os DDTs totais. As concentrações no fígado foram 1-2 ordens de grandeza mais elevadas, em relação às de musculatura. Houve um padrão de distribuição dos poluentes com níveis equivalentes entre indivíduos imaturos. Os machos maduros apresentaram concentrações de POPs sensivelmente maiores que as fêmeas maduras, indicando a transferência dos POPs para os filhotes. Os resultados demonstraram a ampla distribuição desses poluentes no ambiente marinho. / There are many studies about the occurrence of persistent organic pollutants (POPs) in the marine environment using sharks as bioindicators. However, there is still a lack of data of POPs in those organisms in Brazil. The goal of this research was to investigate the occurrence and behavior of PCBs, organochlorine pesticides and PBDEs in the marine environment, using sharks as indicators. Muscle and liver of twenty blue-sharks (Prionace glauca) were collected in august-september 2008. The PCBs were the predominant pollutants and being present in 80% of samples, with concentrations ranging from <n.d. to 427.28 ng.g-1 wet weight. The dichlorodiphenylethanes present concentrations ranging from 0.43 to 202.42 ng.g-1 wet weight, where the 4,4´-DDE was the most significative compound, with contributions of 77,6% of the total DDTs. The concentrations in the liver were 1-2 orders of magnitude higher than in the muscle. There was a distribution pattern of the pollutants, with equivalent levels among the immature specimens. The concentration of POP was significantly higher in the mature males and relatively lower in the mature female, showing the maternal transference of POPs to the pups. The results have demonstrated a wide distribution of these pollutants in the marine environment.