Les véhicules autonomes, tels que les drones, sont utilisés dans différents domaines d'application pour exécuter des missions simples ou complexes. D’un côté, ils opèrent généralement dans des conditions environnementales incertaines, pouvant conduire à des conséquences désastreuses pour l'humain et l'environnement. Il est donc nécessaire de surveiller continuellement l’état de santé du système afin de pouvoir détecter et localiser les défaillances, et prendre la décision en temps réel. Cette décision doit maximiser les capacités à répondre aux objectifs de la mission, tout en maintenant les exigences de sécurité. D’un autre côté, ils sont amenés à exécuter des tâches avec des demandes de calcul important sous contraintes de performance. Il est donc nécessaire de penser aux accélérateurs matériels dédiés pour décharger le processeur et répondre aux exigences de la rapidité de calcul.C’est ce que nous cherchons à démontrer dans cette thèse à double objectif. Le premier objectif consiste à définir un modèle pour l’état de santé et la décision. Pour cela, nous utilisons les réseaux Bayésiens, qui sont des modèles graphiques probabilistes efficaces pour le diagnostic et la décision sous incertitude. Nous avons proposé un modèle générique en nous basant sur une analyse de défaillance de type FMEA (Analyse des Modes de Défaillance et de leurs Effets). Cette analyse prend en compte les différentes observations sur les capteurs moniteurs et contextes d’apparition des erreurs. Le deuxième objectif était la conception et la réalisation d’accélérateurs matériels des réseaux Bayésiens d’une manière générale et plus particulièrement de nos modèles d’état de santé et de décision. N’ayant pas d’outil pour l’implémentation embarqué du calcul par réseaux Bayésiens, nous proposons tout un atelier logiciel, allant d’un réseau Bayésien graphique ou textuel jusqu’à la génération du bitstream prêt pour l’implémentation logicielle ou matérielle sur FPGA. Finalement, nous testons et validons nos implémentations sur la ZedBoard de Xilinx, incorporant un processeur ARM Cortex-A9 et un FPGA. / Autonomous vehicles, such as drones, are used in different application areas to perform simple or complex missions. On one hand, they generally operate in uncertain environmental conditions, which can lead to disastrous consequences for humans and the environment. Therefore, it is necessary to continuously monitor the health of the system in order to detect and locate failures and to be able to make the decision in real time. This decision must maximize the ability to meet the mission objectives while maintaining the security requirements. On the other hand, they are required to perform tasks with large computation demands and performance requirements. Therefore, it is necessary to think of dedicated hardware accelerators to unload the processor and to meet the requirements of a computational speed-up.This is what we tried to demonstrate in this dual objective thesis. The first objective is to define a model for the health management and decision making. To this end, we used Bayesian networks, which are efficient probabilistic graphical models for diagnosis and decision-making under uncertainty. We propose a generic model based on an FMEA (Failure Modes and Effects Analysis). This analysis takes into account the different observations on the monitors and the appearance contexts. The second objective is the design and realization of hardware accelerators for Bayesian networks in general and more particularly for our models of health management and decision-making. Having no tool for the embedded implementation of computation by Bayesian networks, we propose a software workbench covering graphical or textual Bayesian networks up to the generation of the bitstream ready for the software or hardware implementation on FPGA. Finally, we test and validate our implementations on the Xilinx ZedBoard, incorporating an ARM Cortex-A9 processor and an FPGA.