Made available in DSpace on 2015-11-11T12:13:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 caroline_passaes_ioc_dout_2012.pdf: 6197462 bytes, checksum: 60b931e8b71d31d134ea1576e4b43737 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-05-21 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A integrase (IN) é uma enzima chave para o ciclo de replicação do HIV, sendo responsável por catalisar a integração do genoma do HIV no cromossomo hospedeiro. Devido ao papel essencial desta enzima para a patogênese da infecção pelo HIV, a recente introdução dos inibidores de IN (INI) na prática clínica e em vista da escassez de informação sobre a diversidade genética da IN do HIV no Brasil, o presente estudo tem como objetivos a) investigar a diversidade genética da IN e os níveis de resistência primária nos subtipos B, C e F do HIV que são prevalentes no Brasil; b) acompanhar pacientes sob terapia antirretroviral em esquemas contendo raltegravir (RAL) a fim de monitorar a emergência de mutações de resistência aos INI; c) desenvolver um método de genotipagem da IN do HIV para ser usado na pratica clínica no Brasil; e d) investigar o envolvimento do processo de integração no controle da replicação do HIV. Não foram detectadas mutações principais associadas aos INI entre os indivíduos virgens de tratamento infectados com diferentes subtipos de HIV-1 O nível de mutações acessórias observadas foi bem baixo, e algumas posições foram polimórficas nas amostras brasileiras dos subtipos B, C e F. Esses resultados encorajam o uso de INI no Brasil. Analisando as coortes de pacientes que trocaram a enfuvirtida por RAL ou sob terapia de resgate com RAL, nós observamos um aumento nas contagens de células T CD4+ e uma rápida diminuição da carga viral no grupo sob terapia de resgate. Três pacientes não atingiram supressão virológica e as mutações Q148H+G140S foram detectadas em dois deles. A fim de monitorar o crescente número de pacientes sob terapia com RAL no Brasil, nós desenvolvemos um método de genotipagem in-house que está atualmente em teste pela rede de Genotipagem do Ministério da Saúde do Brasil para futura incorporação no monitoramento de pacientes falhando INI. Sobre o papel da IN no controle da infecção pelo HIV, não observamos mutações nos resíduos importantes para a atividade catalítica nas sequências de IN obtidas de pacientes controladores da infecção pelo HIV, nem acúmulo de DNA 2-LTR, sugerindo que não há um mecanismo bloqueando a integração nestes pacientes. Juntos, os resultados apresentados trazem informações importantes sobre a diversidade genética da IN, resistência aos INI e sobre o papel da IN na patogênese da infecção pelo HIV / I ntegrase ( IN) is a key enzyme for the HIV - 1 replication cycle, being responsible for catalyz ing the integration of HIV genome into the host chromat in. Due to the essential role of this enzyme for HIV pathogenesis , the recent introduction of IN inhibitors in the clinical practice and in view of the paucity of information about the genetic diversity of HIV IN in Brazil, the present study aims to a) inv estigate the genetic diversity of IN and the levels of primary resistance in HIV subtypes B, C and F that are prevalent in Brazil; b) follow - up patients under antirretroviral therapy schemes containing raltegravir (RAL) in order to monitor the emergence of resistance mutations to IN inhibitor (INI) ; c) develop a method to genotype HIV IN to be used in c linical practice in Brazil; and d) investigate the involvement of the integration process in the control of HIV replication. No major resistance mutations as sociated to IN I w ere detected among drug - naïve individuals infected with distinct HIV - 1 subtypes . The level of accessory mutations was very low, and some positions were polymorphic in Brazilian samples of HIV subtypes B, C and F. These results encourage th e use of IN I in Brazil. By a nalyzing cohorts of patients that switched from enfuvirtide to RAL or under salvage therapy with RAL we observed an increase in T CD4+ cell counts and a rapid decay of viral load in this salvage therapy group. For three patients , virological suppression was not achieved and the mutations Q148H+G140S were detected for two of them . In order to monitor the increasing number of patients under therapy with RAL in Brazil, we developed a n in - house genotyping method that is currently und er test by the Brazilian Ministry of Health Genotyping N etwork for further incorporation for the management of HIV patients failing INI . Concerning the role of the IN in the control of HIV infection, we did not observe mutations at residues important for c atalytic activity in the integrase sequences obtaine d from HIV controller patients or an accumulation of 2 - LTR DNA, suggesting that there is not a mechanism blocking HIV integration in these patients. Taken together, the results here presented bring import ant insights about HIV IN diversity, resistance to INI and the role of IN in HIV pathogenesis

Submitted by Biblioteca da Faculdade de Farmácia (bff@ndc.uff.br) on 2017-03-27T16:53:12Z No. of bitstreams: 1 Santos, Monique Luiza Aguiar dos [Dissertação, 2014].pdf: 5528413 bytes, checksum: ee7fde929572abea4d1a8749c2310571 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T16:53:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos, Monique Luiza Aguiar dos [Dissertação, 2014].pdf: 5528413 bytes, checksum: ee7fde929572abea4d1a8749c2310571 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A síndrome da imunodeficiência humana adquirida (AIDS, acquired immunodeficiency syndrome) é causada pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV, human immunodeficiency virus) que infecta as células do sistema imune, destruindo-as ou causando prejuízos ao seu funcionamento. Dentre as enzimas do HIV, a integrase é responsável pela inserção do DNA viral no DNA do hospedeiro. Atualmente, existem apenas três fármacos em uso clínico pertencentes à classe dos inibidores de integrase: raltegravir (um derivado pirimidinona carboxamida), elvitegravir (um derivado quinolina) e dolutegravir (um derivado diazatriciclo carboxamida). Entretanto, diversos casos de resistência a estes fármacos são descritos na literatura e as mutações da enzima responsáveis por este perfil são conhecidas. Neste trabalho foram empregados estudos de relação entre a estrutura química e atividade biológica (SAR) e docking molecular, aplicados a uma série de 68 derivados azaindóis do ácido hidroxâmico sintetizados e avaliados farmacologicamente como inibidores de integrase do HIV (PLEWE et al., 2009; TANIS et al., 2010; JOHNSON et al., 2011). Entre os resultados obtidos, no estudo da relação entre a estrutura química e a atividade biológica foi observado que a ausência do hidrogênio ligado ao oxigênio da porção ácido hidroxâmico leva a perda de atividade biológica. E as simulações de docking molecular revelaram que este oxigênio deve possuir carga parcial -1 para realizar interação iônica com os íons Mg²+ presentes no sítio ativo da enzima integrase que funcionam como cofatores. A complexação dos derivados azaindóis com estes íons leva a inibição enzimática. Os compostos mais ativos, 1c e 21c, foram os que apresentaram melhor perfil de interação com a enzima / The acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) is caused by the human immunodeficiency virus (HIV) that infects cells of the immune system, destroying them or causing damage to its operation. Among all the HIV enzymes, integrase is responsible for the insertion of viral DNA in the host DNA. Currently, there are only three drugs in clinical use that belong to the class of integrase inhibitors: raltegravir (a pirimidinone carboxamide derivative, elvitegravir (a quinoline derivative) and dolutegravir (a diazatricyclo carboxamide derivative). However, several cases of resistance to drugs of this class are described in the literature, and the mutations of the enzyme responsible for this profile are known. In this work were employed studies of structure activity relationship (SAR) and molecular docking, applied to a series of 68 derivatives of azaindole hydroxamic acid synthesized and pharmacologically evaluated as HIV-1 Integrase inhibitors (PLEWE et al., 2009; TANIS et al., 2010; JOHNSON et al., 2011). Among the results obtained in the study of the relationship between the chemical structure and the biological activity was observed that the absence of hydrogen bound to oxygen of the hidroxamic acid takes to loss of biological activity. And molecular docking simulations showed that this oxygen must have partial charge -1 to perform ionic interaction with Mg²+ ions present in the active site of the integrase enzyme, which act as cofactors. The complexation of azaindole derivatives with these ions takes to enzymatic inhibition. The most active compounds, 1c and 21c, were the ones who presented best profile of interaction with the enzyme