Perilipin-2 (PLIN2) is a gene that codes for the protein adipophilin, which is responsible for lipid storage in tissues and is associated with obesity and other metabolic diseases including fatty liver. It is generally conserved among primates, including humans. Recent studies show that savanna monkeys (Chlorocebus spp.) in South Africa, which moved to a colder climate, have both increased body mass and a duplication of the PLIN2 gene, presumably in response to colder temperatures. This project investigates variation and selection in the PLIN2 gene in silico among 73 wild savanna monkeys using an established bioinformatics pipeline consisting of command line tools, R packages, and Linux-based programs. We found significant genetic differentiation in the PLIN2 gene region at the taxonomic and population level. There are 45 SNPs outside of Hardy-Weinberg equilibrium, one being a missense variant. Our Tajima’s D results suggest balancing selection in two 1kb regions (12:60604000-60605000, D ~ 2.2, Intron 7-8 and 12:60606000-60607000, D ~ 2.4, 3’UTR). While we did not see clear evidence of any positive selective sweeps, we found 11 SNPs with integrated haplotype scores (iHS) that reach the p<0.05 threshold. Out of these, five are also out of Hardy-Weinberg equilibrium, and eight show an association with ecological variables like insolation and temperature. Humans and savanna monkeys develop obesity and other fatty diseases similarly, and the PLIN2 gene may, in part, be implicated in these diseases. A better understanding of the variation in the PLIN2 gene could provide better insights into metabolic disorders in humans.

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The present study examines the concept of peripheralization and spatial structure in the Arashiyama West troop of Japanese macaques (Macaca fuscata) , and employs an objective method to assess the existence of a central-peripheral tendency in the spatial organization of this Japanese macaque troop. By calculating each adult male's mean distance in meters from the 'alpha' male of the troop, it was possible to rank males according to their distances from the alpha male. The resultant linear gradation of males illustrates the troop's spatial organization. This study did not find evidence supporting the notion that a rigid central-peripheral structure exists in the Arashiyama West troop. Indeed, there appears to be no objective criterion whereby some males can be labelled "central" and others "peripheral", for the linear gradation of distances that defines the spatial organization of adult males can be bisected arbitrarily at any point along its continuum. In this thesis "spatial status" is defined as a gradation of the distance between each male and the alpha male, where the shortest mean distance corresponds to the highest spatial status. The predictors age, dominance rank and maternal lineage are examined for their influence in determining a male's spatial status within the troop. The isolated and cumulative effects of the aforementioned variables are also examined to explain variations in male sexual behavior. Results from this study indicate that a male's spatial status is directly influenced by the combined effects of age, rank and lineage, as well as by the isolated effects of any one of the previously mentioned variables. Furthermore, the results indicate that a male's age and spatial status explain the most variability in male mating behavior. Whether the process of peripheralization and the existence of adult male spatial status are "exaptations", that is, traits which probably were NOT selected for during the course of evolution of Macaca fuscata, cannot be proved by the data in this thesis. However, the available evidence does suggest that spatial status in particular is more likely to be an "exaptation" rather than an "adaptation", and accordingly it probably does not contribute to male fitness. / Thesis / Master of Arts (MA)

An attempt to reproduce tendon sheaths using autologous venous grafts has been undertaken in Cercopithecus aethiops (Blue Vervet Monkey). Ten venous grafts were tested. Five were placed around sutured tendons in paratenon, and the remainder around tendons in sheath formation. In no instance did synovial-like sheaths form. In the latter series, the experiment was controlled, and the results obtained expressed in terms of function. The functional results of the venous ensheathed tendons were worse than those of the controlled tendons.The controlled experiment was confined to the digital sheath, an area notoriously liable to adhesion formation, and the one which offered the most critical test of operative technique.A method for the evaluation of function, following the repair of divided tendons in the experimental animal has been presented. Voluntary movement of joints in the experimental animal was obviously impossible, but the method employed in this experiment, namely, the electrical stimulation of muscles, and the photographic recording of the range of joint movement, presented no disadvantages.The experimental animal used in this study was ideal, in that anatomical studies of the hand of this species, revealed features both structurally and functionally comparable to those in man.The anatomical and physiological aspects of tendon action, the mechanics of tendon gliding, and the healing processes in divided tendons have been studied.The fate of human autologous venous grafts has been investigated.A review of previous methods employed to prevent peritendinous adhesions has been presented.

Primates are known for being highly social species, living in groups of various compositions with different social structures. The study of social or observational learning has largely focussed on investigating non-human primates' abilities to imitate, with a more recent shift towards examining the social context of social learning. This shift has presented opportunities to investigate how the social context of different species affects the diffusion of socially learnt behaviours. In this thesis, I set out to monitor the spread of different experimentally seeded and naturally occurring socially learned behaviours in brown (tufted) capuchin monkeys (Sapajus sp.) and common squirrel monkeys (Saimiri sciureus).These species were selected as they form mixed species groups in the wild, and display marked differences in their social tolerances, thus presenting the opportunity to investigate conspecific and heterospecific social learning in related but differently bonded social groups. My results show evidence of social learning from conspecifics in capuchin and squirrel monkeys, attesting to that already documented in capuchin monkeys and indicating for the first time, that common squirrel monkeys can learn socially. Additionally, I demonstrate that capuchin monkeys are influenced by squirrel monkeys when foraging for food in mixed species groups. Furthermore, although squirrel monkeys are not as socially tolerant as capuchin monkeys, individuals who were better connected within the foraging test area learned experimentally-seeded techniques of models faster and more faithfully. When performing socially contagious anointing behaviours, regardless of tufted capuchin monkeys being influenced by the amount of resources provided for them to anoint with, they still performed more socially anointing than has been previously documented in other captive species, corroborating the levels of social anointing demonstrated in semi-free ranging groups. Further support was found for anointing demonstrating a social bonding and medicinal function in tufted capuchin monkeys.

Positional behavior is the measurable and observable link between the biology and behavior of an animal in its environment. In this dissertation, I examine ontogenetic patterns of positional behavior in infant, juvenile, and adult white-faced capuchins (Cebus capucinus) and mantled howling monkeys (Alouatta palliata) inhabiting the same tropical forest in Costa Rica. During growth and development ontogenetic changes in body size, limb proportions, and motor skills are likely to influence locomotion and posture through the arboreal canopy. I collected data on positional behavior, activity, prehensile-tail use, branch size, branch angle, and crown location during a 12 month period at Estación Biológica La Suerte in northeastern Costa Rica. The data set is comprised of 401.3 hours of data on Cebus capucinus and 554.3 hours of data on Alouatta palliata totaling 955.7 hours of data or 57,344 individual activity records.Life history timing and differences in rates of growth did not predictably influence the development of adult-like positional behaviors in Cebus and Alouatta. In both species, infancy was characterized by high proportions of dorsal, ventral, and side riding on the mother with smaller proportions of independent positional modes observed during play, explore, active posture, and feed/forage. Young Cebus resembled the adult pattern of positional behavior by six months of age while howlers exhibited significant differences in several positional behavior categories through 24 months of age. The positional repertoire of both species revealed similarities in the types of modes used during feed/forage and travel in juveniles and adults. For example, in juvenile and adult age categories of Cebus, feeding and foraging included high proportions of quadrupedal walk, sit, and squat in conjunction with climbing, leaping, and suspensory behaviors. In howlers, the degree to which coordination and increases in body mass during ontogeny as limiting factors in the development of adult-like positional competence is unclear. Data presented here suggest that the environment exerts different pressures on growing Cebus and Alouatta that may relate to diet, energy expenditure, foraging skill, and/or social learning.

Die Evolution der heutigen globalen Diversität wurde in den letzten Millionen Jahren insbesondere durch klimatische Schwankungen und entsprechende Veränderungen biologischer Lebensräume beeinflusst. Besonders deutlich ist der Einfluss von Glazialen und Interglazialen auf die Evolution von Organismen der Nördlichen Hemisphäre. Weniger klar hingegen ist, inwiefern sich diese klimatischen Verhältnisse auf (sub-) tropische Regionen ausgewirkt haben, insbesondere auf das Afrikanische Savannen Biom. Unabhängig davon, haben Umweltveränderungen in tropischen und nicht-tropischen Gebieten zur Entstehung vieler der gegenwärtigen Hybridzonen geführt, in denen zuvor geographisch separierte Populationen in sekundären Kontakt gekommen sind. Obwohl Hybridisierung im Tierreich inzwischen nicht mehr als ein rares Phänomen betrachtet wird, ist das tatsächliche Ausmaß und die Bedeutung von Hybridisierung in der Evolution von Tieren noch lange nicht vollständig geklärt. Die Verbreitung Grüner Meerkatzen der Gattung Chlorocebus reflektiert nahezu die Ausdehnung Afrikanischer Savannengebiete und basierend auf Beobachtungen im Freiland sowie auf morphologischen Merkmalen von Museumsexemplaren, hybridisieren die meisten der sechs anerkannten parapatrischen Arten in ihren jeweiligen Kontaktzonen. Aufgrund dieser Eigenschaften habe ich in meiner Doktorarbeit Grüne Meerkatzen als Modellsystem genutzt, um zum einen die Bedeutung von Hybridisierung in der Evolution von Primaten und Tieren im Allgemeinen zu untersuchen, und zum anderen, um wesentliche Trends in der Evolution von Savannensäugetieren zu analysieren. Um in einem ersten Schritt grundlegende Informationen über die mitochondriale Diversität und Verbreitung der Grünen Meerkatzen zu erlangen, generierte ich vollständige Cytochrom b Sequenzen von Proben, die alle sechs Arten der Gattung und große Teile der gesamten Verbreitung Grüner Meerkatzen repräsentierten. Des Weiteren nutzte ich Sequenz-Informationen zweier Y-chromosomaler Loci, ein Fragment der sex determining region (SRY) und das letzte Intron des Zinc finger (ZFY), um eventuell zeitlich zurückliegende Hybridisierungsereignisse nachzuweisen. Um räumliche sowie zeitliche phylogeographische Muster zu rekonstruieren, habe ich basierend auf den bisher gewonnen Daten weitere mitochondriale Marker von selektiven Proben aller mitochondrialer Kladen sequenziert. Abschließend habe ich die Phylogeographie Grüner Meerkatzen mit den Phylogeographien dreier anderer weit verbreiteter Savannensäugetier-Gattungen verglichen, mit Pavianen (Papio), Warzenschweinen (Phacochoerus), und Kuhantilopen (Alcelaphus). Meine Analysen der mitochondrialen Daten lassen neun klar abgegrenzte Kladen erkennen, die keiner bisher vorgeschlagenen Taxonomie entsprechen. Zahlreiche para- und polyphyletische Beziehungen, verursacht durch nicht übereinstimmende Verbreitungsmuster mitochondrialer Kladen und morphologischer Merkmale, liefern Hinweise auf anhaltende introgressive Hybridisierung in den Kontaktzonen aller Arten, mit Ausnahme der beiden westafrikanischen Arten. Darüber hinaus weisen die Ergebnisse der mitochondrialen Analysen auf potentiell vergangene introgressive Hybridisierungsereignisse hin, die geographisch nicht in Gebiete gegenwärtiger Kontaktzonen fallen. Dies kann im Falle von C. pygerythrus in Ostafrika anhand der Y-chromosomalen Daten bestätigt werden. Männchen basierte Introgression und nuclear swamping haben hier offensichtlich zu dem zytonukleären Aussterben eines historischen Taxons geführt. Aber nicht alle diskordante Muster in der mitochondrialen Phylogenie sind Anzeichen für zurückliegende introgressive Hybridisierung. Innerhalb der Verbreitung von C. tantalus weisen sowohl mitochondriale als auch Y-chromsomale Daten auf zwei klar separierte und morphologisch kryptische Taxa hin (ein westliches und ein östliches Taxon), ein Befund der möglicherweise auf das Vorhandensein einer neuen Grünen Meerkatzenart hindeutet. In Übereinstimmung mit mitochondrialen Ergebnissen weisen Y-chromosomale Daten ebenfalls keine Anzeichen für Hybridisierung zwischen C. sabaeus und der westlichen C. tantalus-Form in Westafrika auf. Entgegen früherer Annahmen stellt der Volta Fluss und seine nördlicheren Zuflüsse offenbar auf gesamter Länge eine geographische Barriere dar und nicht wie vorher angenommen nur im südlicheren Teil des Flussverlaufs. Die Phylogeographie Grüner Meerkatzen weist somit auf eine komplexe evolutionäre Geschichte hin. Aufgrund der phylogenetischen Rekonstruktionen und Datierungen gehe ich von einem Westafrikanischen Ursprung der Gattung vor ca. 2,46 Millionen Jahren aus. Des Weiteren liefert die Phylogenie Hinweise auf eine erst später folgende Ausbreitung bis nach Südafrika und auf zwei zeitlich getrennte Besiedelungen nordöstlicher Regionen, eine vom Westen und eine von eher südlicheren Regionen aus. Im Vergleich zu den anderen Savannensäugetieren können keine zeitlichen Übereinstimmungen in Aufspaltungsmustern gefunden werden, weder im Vergleich zwischen den Primaten noch zwischen den Ungulaten. Zudem fallen Aufspaltungen innerhalb der Gattungen zeitlich sowohl mit kalt-ariden als auch mit warm-humiden Perioden zusammen. Veränderungen in Populationsgrößen innerhalb der letzten 500.000 Jahre zeigen unterschiedliche Muster zwischen Primaten und Ungulaten, die wahrscheinlich mit verschiedenen ökologischen Anpassungen und Habitat Präferenzen zu erklären sind. Da außerdem keine klaren Zusammenhänge zwischen dem zeitlichen Auftreten von Populationsschwankungen und dem letzten Interglazialem bzw. Glazialen Maximum gefunden werden können, scheint ein Einfluss von regional geprägtem Klima in Afrika wahrscheinlicher. Zusammengefasst hat die Evolution Grüner Meerkatzen im frühen Pleistozän begonnen und klimatische Schwankungen im Quartär haben vermutlich zu wiederkehrenden Veränderungen in der Ausbreitung geführt. Diese begünstigte die Entstehung von sekundären Kontaktzonen und führte zu weit verbreiteter introgressiver Hybridisierung innerhalb der Gattung. Das zytonukleäre Aussterben ehemaliger Taxa oder Populationen als Ergebnis lang anhaltender introgressiver Hybridisierung und darauffolgendem nuclear swamping machen zudem den potentiellen Einfluss von Hybridisierung in der Evolution von Primaten und Tieren im Allgemeinen deutlich. Die Phylogeographien der Savannensäugetiere zeigen, dass Aufspaltungen innerhalb der Gattungen sehr wahrscheinlich durch ausgeprägt humide wie auch aride Bedingungen begünstigt wurden, die eher durch regionale Klimatische Veränderungen in Afrika zu erklären sind als durch Glaziale Zyklen und Klimaschwankungen der Nördlichen Hemisphäre. Die Ergebnisse meiner Doktorarbeit betonen die Notwendigkeit der Analyse von sowohl mütterlich als auch väterlich vererbten Markern in phylogeographischen Studien, um ein möglichst vollständiges Bild von evolutionären Prozessen, Hybridisierung, sowie von genetischer und taxonomischer Vielfalt zu erlangen.

Thesis (Ph. D. (Dept. of Medical Biosciences)--University of the Western Cape, 2007. / Includes bibliographical references (leaves 215-239).

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Six squirrel monkeys were tested on short-term memory tasks assessing ability to suppress perseverative responses that had been previously reinforced. Each trial was divided into three parts: Initial Preference Assay (IPA), Bias-Conditioning (BC), and Reversal Conditioning (RC), and alternated between two conditions: experimental and control. Strength of response bias (based on choices of response during IPA) exceeded chance levels for each monkey. Eighty-four percent of responses to BC of the experimental trials were made to the response loci chosen in IPA even though that response was not rewarded. Monkeys made 38% correct responses during RC but shifted from making most errors during control trials in the beginning of the experiment to making most errors during experimental trials by the end of the experiment. Monkeys had developed a strategy of persevering from IPA to BC and then shifting to the other, not previously chosen window on RC, which led to correct responses in the experimental trials. (Abstract shortened with permission of author.)