Paired box (PAX) gener kodar för en familj av nio stycken PAX transkriptionsfaktorer. PAX transkriptionsfaktorer är uppbyggda av en N-terminal DNA-bindande domän som utgörs av 128 aminosyror, en oktapeptid, och en C-terminal DNA-bindande domän. Studier har visat att PAX8 har en betydande roll vid utvecklingen av olika typer av tumörer. MRQ-50 är en antikropp som används inom Region Skåne för att påvisa PAX8 uttryck vid histopatologisk diagnostik. MRQ-50 riktas mot N-terminalen av PAX8 som är homolog med N-terminalen av PAX5. Detta kan leda till en korsreaktion i B-lymfocyter samt neoplasier, vilket inte är optimalt för diagnostik. Av den anledningen fortsätter forskning för att hitta en ny klon som kan ersätta MRQ-50. EP331 är en antikropp som är anpassad för detektion av det nukleära antigenet PAX8 och korresponderar till C-terminalen av human PAX8 protein. Syftet med arbetet är att optimera ett immunhistokemiskt färgningsprotokoll för detektion av PAX8 med hjälp av anti-PAX8 antikroppen EP331 och undersöka om godkända resultat kan erhållas. Detta gjordes för att ta reda på om det går att optimera ett protokoll med EP331, och om det erhålls lämpligare resultat än MRQ-50. Optimeringen gjordes på kontrollvävnader njure, tuba/äggledare och appendix och testades slutligen på patientprov med tumörvävnad. För protokolloptimering testades heat induced epitope retrieval, inkuberings tid av EP331, amplifiering, Ultra Wash i olika testomgångar. Resultatet visade att kärnor i epitelceller i proximala-, distala-njurtubuli och parietala epitelceller som klär Bowmans kapsel infärgades måttligt till starkt. De sekretoriska epitelen i tuba infärgades med stark intensitet och cilierade epitel måttligt. Infärgningen på patientprover visar godkänd specificitet, med en generell måttlig till stark intensitet. Med fler forskningsstudier av EP331 är det möjligt att primärantikroppen kan ersätta MRQ-50.