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Élucidation des déterminants structuraux impliqués dans la reconnaissance moléculaire entre MXD1 et MAX et la liaison à l'ADN

Montagne, Martin January 2008 (has links)
Les facteurs de transcription du réseau c-Myc/Max/Mxd assurent le contrôle de la transcription de plus de 1600 gènes. L'hétérodimérisation compétitive entre les membres du réseau et la protéine Max permet des réponses cellulaires opposées. En effet, le complexe c-Myc/Max est associé à l'activation de la transcription de gènes sous l'influence de promoteurs contenant des sites E-Box, pendant que les complexes Mxd/Max permettent l'inhibition de la transcription à ces mêmes promoteurs. Cependant, l'activité oncogénique associée à la surexpression de c-Myc dans plusieurs cancers semble être assurée par l'inhibition de la transcription de gènes cytostatiques causée par l'association de Miz-1 au complexe c-Myc/Max. De manière encourageante, la réintroduction de Mxdl permet de réduire la prolifération et la croissance cellulaire et constitue une avenue thérapeutique intéressante. Cette thèse rapporte l'élucidation de l'identité de résidus spécifiques impliqués dans la reconnaissance moléculaire de Mxdl et de Max et la détermination de la structure hétérodimérique minimale requise afin de permettre une liaison stable à l'ADN. La reconnaissance moléculaire est dictée par des déterminants structuraux spécifiques contenus dans les régions HLH et LZ. L'hétérodimérisation spécifique nécessite 2 étapes essentielles : 1) la déstabilisation des homodimères, assurée par des répulsions électrostatiques à l'interface de dimérisation des 2 domaines, et 2) l'hétérodimérisation avec Max. Dans notre premier article, nous avons confirmé que l'unique résidu acide D112a, situé à l'interface de dimérisation du LZ, prévient la formation des homodimères. Nous avons démontré que le retrait de la charge acide par la mutation D112N ou par l'abaissement du pH permettait d'augmenter de façon équivalente la population homodimérique. De plus, nos résultats démontrent que l'augmentation de l'homodimérisation du LZ et/ou de la région HLH obtenue par la mutation D112N soutient efficacement la liaison à un site E-Box. Le deuxième article a permis l'identification des résidus impliqués dans l'hétérodimérisation spécifique des régions b-HLH-LZ des protéines Mxdl et Max. L'augmentation de l'hydrophobicité de l'interface dimérique de la protéine Max par les mutations N78VH81L (VL) avait ultérieurement permis d'augmenter considérablement l'homodimérisation et de stabiliser la liaison à l'ADN. Dans cette optique prometteuse, nous avons augmenté l'hydrophobicité de l'interface dimérisation du LZ de Mxdl par la mutation D112V. Des essais de digestions enzymatiques et de CD ont confirmés l'augmentation de la stabilité du LZ de Mxdl. Cependant, cette mutation permettant d'accroître le taux d'hélices [alpha] ne permet toutefois pas de stabiliser la liaison à l'ADN. Certaines répulsions électrostatiques, possiblement impliquées dans la déstabilisation des homodimères de Mxdl et obtenues par le rapprochement des régions HLH, ont été hypothétiquement identifiées par modélisation moléculaire. Nous avons ensuite utilisé des essais d'hétérodimérisation limites strictement à certaines régions dimériques pour démontrer que les régions HLH hétérodimérisent de manière favorable indépendamment de la présence de LZ homodimériques. Cependant, la liaison à l'ADN nécessite l'hétérodimérisation des régions LZ même si l'interaction des régions HLH est observée en absence d'ADN. L'hétérodimérisation complète des domaines HLH et LZ, essentielle à la liaison de l'ADN par l'hétérodimère, survient uniquement lorsque l'interaction favorable des régions HLH surpasse la stabilité des LZ homodimériques et soutient indirectement la formation des hétérodimères des régions LZ. Nous avons également fait la démonstration que l'hétérodimérisation précède la liaison à l'ADN tel que proposée par d'autres groupes et ne peut être décrite par le mécanisme d'hétérodimérisation empruntant le «monomer pathway» qui correspondrait à la liaison successive de l'ADN par les monomères de Mxdl et de Max avant l'hétérodimérisation.
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En uppdatering av årsringsvidd- och densitetskronologier vid Torneträsk till och med år 2017 och om att undvika fallgropar för divergens vid årsringsuppdatering / An update of tree-ring width and density chronology of the Torneträsk area, Northern Sweden, AD 2017 and about avoiding pitfalls for divergense in tree-ring updating

Åkerström, Lisa January 2018 (has links)
I arbetet har jag samlat in borrprovkärnor från 21st levande träd 218-27år gamla från en lokal nära Torneträsk, behandlat och analyserat borrprovkärnorna vad gäller ringvidd (TRW), eng. tree ring width, och densitet (MXD), eng. maximum density, samt studerat hur väl resulterande kronologier följer sommarmedeltemperaturerna från Abisko väderstation. I arbetet ges kort bakgrundsfakta om det valda geografiska områdets, Torneträsk, roll och betydelse i det aktuella forskningsområdet, dendroklimatologi, och beskrivningar av några för uppgiften viktiga aspekter och metoder och problematiken med fenomenet divergence phenomena (DP). Datat är förberett för att användas som en förlängning till den existerande kronologin. Dendrokronologin vid Torneträsk innehåller innan detta; TRW som sträcker sig över 7 400år (år 5704 f.kr. – år 2004) och MXD som sträcker sig över 1 563år (åren 441 – 2004). Vid insamlandet har unga träd inkluderats i proverna för att undvika DP vid skapandet av kronologin. / In this project I have sampled 21 living trees in the age range of 218-27years old in the Torneträsk area, northern Sweden. I have prepared and analysed the samples regarding ring width (TRW) and maximum density (MXD) and investigated the correlation to summertemperatures from the nearby wheather station in Abisko. The data has been prepared as an update for the now existing chronology from the area which up until this contains TRW data spanning over 7 400years (BC 5704 – AD 2004) and MXD data over 1 563years (AD 441 – 2004). Young trees as well as older were sampled in an attempt to avoid creating divergence phenomena (DP) from the update.

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