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Estudo da organização estrutural de elementos repetitivos isolados do genoma de Leporinus elongatus em diferentes espécies da família Anostomidae (Teleostei, Characiformes)

Silva, Edson Lourenço da [UNESP] 12 November 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-11-12Bitstream added on 2014-06-13T20:21:24Z : No. of bitstreams: 1 silva_el_dr_rcla_parcial.pdf: 615041 bytes, checksum: 1af1e3808561ee8274d10b82b1b2c954 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-01-16T10:37:55Z: silva_el_dr_rcla_parcial.pdf,Bitstream added on 2015-01-16T10:38:38Z : No. of bitstreams: 1 000707790.pdf: 4920207 bytes, checksum: 28d5b7e5ae05d8701bc77d0be2089300 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A família Anostomidae compreende um grupo com 12 gêneros que apresenta ampla distribuição pela América do Sul e Central. Estudos citogenéticos de várias espécies da família mostram uma estrutura cariotípica bastante conservada, com o número diplóide igual a 54 cromossomos, dos tipos meta e submetacêntricos e apenas um par de cromossomos portador de regiões organizadoras de nucléolos (NOR) localizadas em posições e pares distintos nas diferentes espécies do grupo. Através de estudos envolvendo técnicas de citogenética molecular têm se conseguido uma caracterização mais resolutiva dos cromossomos de algumas espécies da família. Estas metodologias forneceram evidências de polimorfismos de NOR, diferentes padrões de distribuição da heterocromatina constitutiva, presença de seqüências repetitivas sexo-específicas e novos sistemas de cromossomos sexuais heteromórficos do tipo ZZ/ZW bem como a diferenciação de híbridos interespecíficos. Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivo acrescentar novos dados que auxiliem no estabelecimento de padrões para esclarecer a história evolutiva dos cromossomos sexuais em espécies de Anostomidae, baseado no estudo da organização de seqüências repetitivas isoladas do genoma de Leporinus elongatus em diferentes espécies de Anostomidae. Para tanto, novos elementos repetitivos do genoma de Leporinus elongatus foram isolados através de restrição enzimática e usados em experimentos de hibridação fluorescente in situ (FISH) tanto em L. elongatus quanto nas espécies L. macrocephalus, L. obtusidens, L. friderici, L. lacustris, L. striatus, Schizodon borellii, S. isognathus e Abramites hypselonotus. Além disso, sondas de cromossomos inteiros obtidos por microdissecção também foram usadas nesses experimentos, a fim de buscar identificar... / The Anostomidae family comprises a group with 12 genera widely distributed throughout Central and South American Rivers. Cytogenetic studies carried out in several anostomids shows a karyotypic structure very conserved, with a diploid number equals to 54 chromosomes, metacentric and submetacentric, and only one chromosome pair carrier of nucleolar organizing regions (NOR), localized at distinct chromosome positions in the species of the family. The studies using molecular cytogenetic techniques have been providing a more accurate characterization of some species. These methods highlighted NOR polymorphisms, differential pattern of heterochromatin distribution, the presence of sex specific repetitive sequences, as well as new heteromorphic sex chromosomes and interspecific hybrids differentiation. Thus, the present study aimed to add new data to assist in to establish patterns to clarify the evolutionary history of sex chromosomes in Anostomidae species, based on the study of the organization of repetitive sequences isolated from Leporinus elongatus genome in different species of Anostomidae. For this, new repetitive elements were isolated from L. elongatus and used in Fluorescent in situ hybridisations experiments (FISH) in L. elongatus as well in the species L. macrocephalus, L. obtusidens, L. friderici, L. lacustris, L. striatus, Schizodon borellii, S. isognathus e Abramites hypselonotus. Indeed, probes of whole sex chromosomes obtained through microdissection were also used in order to identify similarities among the anostomids chromosomes and the presence of sex chromosomes in differentiation stages. The LeSmaI repetitive element has 378 bp and is exclusive to L. elongatus individuals. This is a satellite DNA localized near to the NOR in a highly heterochromatic region. The presence of this satellite DNA reinforces... (Complete abstract click electronic access below)
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Análise da dinâmica de fragmentos florestais : estudo de caso de Sorocaba-SP /

Bortoleto, Ludmila Araújo. January 2014 (has links)
Orientador: Alexandre Marco da Silva / Banca: Welber Senteio Smith / Banca: Cassio José Montagnani Figueira / Resumo: As mudanças na paisagem causadas por fatores antrópicos geram grandes impactos sobre os ecossistemas. Uma das principais alterações que vem acontecendo é a substituição da vegetação nativa por outros formas de cobertura, resultando num cenário de fragmentação da vegetação natural que resta. Neste trabalho, avaliou-se quantitativamente e qualitativamente os fragmentos florestais remanescentes no município de Sorocaba, utilizando mapas digitais de cobertura da terra de duas épocas (1988 e 2011) gerados a partir de imagens de satélite. As métricas da paisagem como tamanho dos fragmentos, distância entre eles e efeito de borda, foram calculadas. Analisou-se também a qualidade da cobertura da terra conforme a intensidade de uso humano e o potencial de percolação na matriz. Os resultados apresentaram que apesar da alta variação da paisagem, ocorreu um aumento da área de Vegetação Natural Remanescente/Reflorestamento. Houve também um grande aumento da área urbana em 18,1%. O número de fragmentos florestais diminuiu em 161 fragmentos no período. Contudo, notou-se que os fragmentos estão maiores em áreas. A distância entre os fragmentos teve sua maior variação na classe <100m, sugerindo haver uma maior conectividade entre eles. Apesar da proximidade entre os fragmentos, eles estão sob efeito de borda, e a tendência se manteve para o período de estudo. A qualidade da cobertura da terra mostrou que a paisagem do município passou por um processo de transformação induzido por atividades antrópicas. Além disso, o potencial de percolação da classe não habitat revelou dados tabulares que sugerem preocupação com as áreas onde há intensificação de uso humano e, ainda, mapas com regiões importantes que favorecem a recomposição da paisagem. De forma geral, o estudo se torna base para o conhecimento da paisagem local e dá sustentabilidade para a tomada de decisões quanto ao planejamento ambiental e urbano do... / Abstract: Changes in the landscape provoked by anthropogenic factors usually cause that threat for ecosystems. One important change that has occurring is the replacement of native vegetation by other kinds of land cover, resulting in a fragmentation process of the remaining vegetation. Here we investigated the dynamic of the land cover change, as well as the dynamic of patches of the natural remnant vegetation (NRV) in the Sorocaba municipality - Brazil for a period of 23 years (1988 and 2011) using digital land cover maps, which were generated from satellite images. Several landscape metrics as fragment size, distance between them and also edge effect were calculated. The quality of land use was also analyzed, according to the intensity of human use, and percolation potential in the matrix. The results showed that despite the high variation in the landscape, there was an increase in the area of remaining vegetation. There was also an expressive increase in the urban area 18.1%. The number of forest fragments declined in 161 fragments in the period. However, it was noted that the fragments are denser. The distance among the fragments had a greater variation in class < 100m, suggesting that there was greater connectivity among them. Despite the connectivity among the fragments, they are under edge effect, and the trend continued for the period of study. Through the quality of land use, it was verified that the landscape of the city experimented a process of transformation induced by anthropogenic activities. Moreover, the potential percolation of non habitat area revealed tabular data that suggest concern about areas where there intensification of human use and also with important regions that favor the restoration of the landscape. Overall, the study becomes the basis for knowledge of the local landscape and provides sustainability for making decisions about the environmental and urban planning of Sorocaba city / Mestre
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Mapeamento de atributos do solo para o planejamento da irrigação sob pivô central /

Pelá, Gláucia de Mello, 1974- January 2007 (has links)
Orientador: Célia Regina Lopes Zimback / Banca: Carlos Alberto Oliveira de Matos / Banca: Andrea Bogatti Guimarães Tomazella / Banca: Ivana Furio Batista / Banca: Leticia Colares Vilela / Resumo: O presente trabalho teve como objetivo determinar a variabilidade espacial da fertilidade e de propriedades físicas do solo, em área irrigada sob sistema de pivô central cultivado com culturas anuais em plantio direto, com o intuito de verificar as conseqüências do uso intensivo do solo com irrigação, buscar soluções para melhor utilização de insumos e da água de irrigação, e subsidiar o mapeamento em diferentes zonas de manejo. O estudo foi realizado no município de Colômbia (SP), num pivô central de 65ha, cujas coordenadas geográficas são: latitude 20º16’09-S e longitude 48º40’43-W, em LATOSSOLO VERMELHO Distrófico, textura média. As amostras de solos georreferenciadas foram coletadas em duas profundidades (0-0,2 e 0,2-0,4m) e analisadas quanto ao pH em CaCl2, H + Al, matéria orgânica, Presina, cálcio, magnésio e potássio, e micronutrientes: boro, cobre, ferro, enxofre, manganês e zinco; sendo calculados: soma de bases (SB), CTC, V%. Foram realizadas também análises de granulometria e densidade de partículas. Nas profundidades de 0-0,05 e 0,20-0,25m analisou-se: densidade do solo, porosidade total, micro e macroporosidade; sendo a umidade atual realizada somente na profundidade de 0-0,05m. A análise da dependência espacial foi realizada por meio do ajuste dos dados ao variograma experimental e da interpolação de dados através da krigagem ordinária, visando definir o padrão espacial das variáveis estudadas. Com base nos mapas obtidos foram estabelecidas zonas de manejo da fertilidade do solo e dos parâmetros físico-hídricos para manejo da irrigação. De acordo com os resultados obtidos, verificou-se que mesmo em área restrita como a do pivô central, ocorre variabilidade espacial tanto das características químicas quanto físicas. Os atributos químicos e físicos do solo apresentaram dependência espacial de média a forte.. (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this work was to determine the spatial variability of fertility and physical properties of the soil, in an irrigated area under central pivot system cultivated with annual cultures in no tillage system, to verify which are the possible influences that the intensive soil use with irrigation causes, to looking for solutions to improve the input and the irrigation water use, and to enhanced the plotting in different control zones. The study was accomplished in Colombia's Municipal district (SP), with geographical coordinates: latitude 20º16’09-S and longitude 48º40’43-W, in a loamy dystrophic Red Latosol. The georeferencing soil samples were collected at two depths (0- 0.20 and 0.20-0.40 m) and were analyzed by pH (CaCl2), H + Al, MO-organic matter, Presin, Ca, Mg, K, SB, CTC, V%, B, Cu, Fe, S, Mn, and Zn. Were determined granulometry, soil density and particles density, total porosity, micro and macroporosity. The spatial analysis dependence was realized through the data adjustment to experimental variogram and ordinary kriging interpolation, aiming to define the standard space of the studied variables. Based in this maps, were established soil fertility handling control zones and of the physics parameters for irrigation handling. Using obtained results, it is possible to conclude that: even in a restricted area as the central pivot occurs spatial variability as much the chemical how much the physical characteristics; the chemical and physical attributes of the soil presented strong spatial dependence; the spatial dependence of the chemical attributes varied from 86 to 700m superficially and from 113 to 533m subsuperficially, to concluding itself that in the fertility handling it should considering the distance from 86m; the spatial dependence of the physical attributes varied from 207 to 714m, concluding itself that in the soil physical variables handling... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Pra?a: lugar de lazer: rela??es entre caracter?sticas ambientais e comportamentais na Pra?a Kalina Maia Natal RN

Liberalino, Cintia Camila 19 April 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:38:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CintiaCL_DISSERT.pdf: 5640189 bytes, checksum: 9d7db9c4f86bd8ee59fb7cdcabf84e8f (MD5) Previous issue date: 2011-04-19 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Nowadays, the urban chaos brings some problems to the citizens such as mental fatigue, irritability and lack of attention, emphasizing the need for open urban spaces, capable to contribute to the restoration of physical and mental balance of people. By the variety of alternative uses available, many of them related to the stimulus of entertainment activities, the squares have been identified as restorative environments, especially by its potential as a place of leisure. In this context, the objective of this dissertation is to understand the use of the square as leisure environment, by a square in Natal RN, establishing the relationship between environmental and behavioral characteristics. More specifically, I attempt to identify the major activities that happen there, the people that develop them and the spatial and temporal configurations of this occupation. Among the 290 squares available in the city, the Kalina Maia Square was selected, which is located in the district of Lagoa Nova. The case study chosen was based on criteria relating to scale, shape, location on the urban environment, variability of uses and conservation status. In the study were used behavioral mapping place-centered and people-centered, behavior trace analysis and 14 interviews. The results show that the square is used by people from different ages and social classes, subdivided into groups with specific days and times. These users are usually engaged in activities related to various types of leisure, with sports predominance. The relationship between spatial configuration and behavior shows that there is a sectorization of uses, being possible to identify the environmental characteristics that most favor observed activities, especially in relation to shading and presence of furniture and equipment. Moreover, throughout the day it appears that the affordances inherent to the various fixed objects on the square are decoded differently by various categories of users, by giving them insights that help the development of leisure activities that characterize each group / Atualmente, o caos urbano traz aos moradores das cidades problemas como fadiga mental, irritabilidade e falta de aten??o, acentuando a necessidade de espa?os urbanos abertos, capazes de contribuir para a restaura??o do equil?brio f?sico e mental das pessoas. Pela variedade das alternativas de uso oferecidas, muitas das quais relacionadas ao est?mulo de atividades de entretenimento, as pra?as t?m sido apontadas como ambientes restauradores, principalmente pelo seu potencial enquanto lugar de lazer. Nesse contexto, o objetivo geral desta disserta??o ? a compreens?o do uso da pra?a como ambiente de lazer, tomando como refer?ncia o estudo de uma pra?a de Natal RN, estabelecendo a rela??o entre suas caracter?sticas ambientais e comportamentais. Mais especificamente, busco identificar as principais atividades que ali acontecem, as pessoas que as desempenham e as configura??es espaciais e temporais dessa ocupa??o. Dentre 290 pra?as existentes na cidade, foi selecionada a Pra?a Kalina Maia, localizada no bairro de Lagoa Nova. A escolha do estudo de caso recorreu a crit?rios relativos ? escala, forma, localiza??o na malha urbana, variabilidade de usos e estado de conserva??o. No estudo utilizei mapeamento comportamental centrado no lugar e centrado nas pessoas, an?lise de vest?gios de comportamento e 14 entrevistas. Os resultados revelam que a pra?a ? utilizada por pessoas de varias idades e classes sociais, subdivididas em grupos com dias e hor?rios espec?ficos. Estes usu?rios geralmente se envolvem em atividades ligadas a v?rios tipos de lazer, com predomin?ncia do esportivo. A rela??o entre configura??o espacial e comportamento mostra haver uma setoriza??o dos usos, sendo poss?vel identificar as caracter?sticas ambientais que mais favorecem algumas das atividades observadas, sobretudo relacionadas ao sombreamento e ? presen?a de mobili?rio e equipamentos. Al?m disso, ao longo do dia verifica-se que as affordances inerentes aos diversos objetos fixos presentes no local s?o decodificadas diferentemente pelas v?rias categorias de usu?rios, proporcionando a eles entendimentos que favorecem o desenvolvimento das atividades de lazer que caracterizam cada grupo
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Trajet?ria de carreira do profissional de recursos humanos

Ramos, Lucila Moura 07 June 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:39:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LucilaMR_DISSERT.pdf: 3768239 bytes, checksum: 1a928eea0bd29f1d8f32a56aa03733f1 (MD5) Previous issue date: 2013-06-07 / The idea that the career consists in a linear path throughout the individual s professional life structured by the company where he or she works has been changing to a new reality in which the career is seen as a journey, open to possibilities and uncertainties. Several models have come up as an attempt to comprehend and analyze this journey. Among them, there is the model of career narrative, which assumes that, while narrating, individuals give meaning to their own path, and at the same time they consider personal factors and the environment that act on their professional biography. This paper aimed to explore and articulate issues related to the environment and career paths of the human resource professionals working in the Greater Natal. For this purpose, the model of career narrative was used. From the methodological viewpoint, the project was divided in two stages. The first was characterized by conducting a survey with the intention of mapping professionals socio-occupational characteristics, through the application of a semi-structured questionnaire. The data was analyzed by descriptive statistical techniques and cluster analysis. The descriptive statistical analyses included 117 participants. The results indicated that HR professionals of Greater Natal have different functions, develop activities focused on different subsystems, have an increasing career path, and focus their professional formation in Business Administration and Psychology. The second stage of the study was characterized by the use of 17 narrative interviews, whose participants, in the process of nonprobabilistic sampling, were identified based on their belonging to the three clusters: Group 1, HR and public administration; Group 2, HR experts; and Group 3, HR beginners. Analyzing the results of the qualitative phase, it was found that the identification with the activity practiced is a deciding factor for choosing and remaining in the HR field. The lack of professional recognition appears as the main difficulty faced by professionals, as well as the lack of employment opportunity in the Greater Natal. The results analysis leads to a series of discussions on the career path in HR and reflections for this professional category, its representative bodies and educational institutions / A ideia de que a carreira consiste em uma trajet?ria linear estruturada pela empresa ao longo da vida profissional do individuo vem se alterando para uma nova realidade em que a carreira passa a ser vista como uma jornada, aberta a possibilidades e incertezas. V?rios modelos surgiram na tentativa de compreens?o e an?lise desta jornada. Dentre estes, o modelo da carreira narrativa, o qual parte do pressuposto de que, ao narrar, os indiv?duos d?o sentido ? pr?pria trajet?ria, ao mesmo tempo em que consideram os fatores pessoais e do ambiente que agem sobre sua biografia profissional. O presente estudo se prop?s a explorar e articular aspectos relacionados ao ambiente e ?s trajet?rias da carreira de profissionais de recursos humanos atuando na Grande Natal. Para tanto, utilizou o modelo de carreira narrativa. Do ponto de vista metodol?gico, o projeto dividiu-se em duas etapas. A primeira caracterizou-se pela realiza??o de um survey com o prop?sito de mapear caracter?sticas s?cio-ocupacionais dos profissionais, por meio da aplica??o de um question?rio semi-estruturado. Os dados foram analisados segundo t?cnicas estat?sticas descritivas e an?lise de clusters. As an?lises estat?sticas descritivas contemplaram 117 participantes. Os resultados indicaram que os profissionais de RH da Grande Natal ocupam cargos diversos, desenvolvem atividades concentradas em diferentes subsistemas, apresentam trajet?ria ascendente de carreira e concentram a forma??o profissional nos cursos de Administra??o e Psicologia. A segunda etapa do estudo caracterizou-se pela realiza??o de 17 entrevistas narrativas, cujos participantes, em processo de amostragem n?o probabil?stica, foram identificados com base em seu pertencimento aos tr?s clusters: o Grupo 1, RH e gest?o p?blica; o Grupo 2, RH especialista e o Grupo 3, RH iniciantes. Na an?lise dos resultados da fase qualitativa verificou-se que a identifica??o com a atividade ? um fator decisivo para a escolha e perman?ncia na ?rea de RH. A falta de reconhecimento aparece como principal dificuldade enfrentada pelos profissionais, assim como a falta de espa?o para atua??o no mercado da Grande Natal. A an?lise dos resultados leva a uma s?rie de discuss?es sobre a trajet?ria de carreira na ?rea de RH e reflex?es para a categoria, entidades representativas e institui??es formadoras
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Adaptação de um pulverizador convencional para a aplicação localizada de defensivos agrícolas. / Adaptation of a conventional sprayer for site-specific chemical application.

Julio Cesar Dalla Mora Esquerdo 07 March 2002 (has links)
Os defensivos constituem grande parte do custo total dos insumos utilizados na produção agrícola. O alto consumo de defensivos reduz a lucratividade e aumenta os riscos de contaminação ao ambiente. Uma das alternativas que vêm sendo propostas para a redução da quantidade de defensivos utilizada na produção agrícola é o chamado "gerenciamento localizado das culturas", através do uso dos conceitos da Agricultura de Precisão. Máquinas destinadas à aplicação localizada de defensivos líquidos em doses e produtos variáveis já estão presentes no mercado; entretanto, seu alto custo inicial e alta capacidade operacional inviabilizam sua aquisição em propriedades de menor porte. No presente trabalho, um pulverizador convencional foi adaptado com válvulas solenóides para promover a aplicação do defensivo na estratégia "liga-desliga", utilizando uma dose fixa. Um programa computacional foi desenvolvido para executar o controle independente sobre cada uma das válvulas solenóides presentes nas duas seções de barra do pulverizador, em função das informações de um mapa de prescrição, contendo as coordenadas dos locais onde a aplicação deveria ocorrer. Um DGPS foi conectado ao sistema para informar a localização do trator no campo. O sistema foi submetido a um teste em condições reais de controle de plantas daninhas, as quais foram previamente georreferenciadas através do caminhamento do contorno das infestações. Os resultados mostraram que a adaptação realizada, assim como o sistema de controle desenvolvido, permitiram o controle localizado das infestações, resultando na redução da quantidade de herbicida aplicada, em comparação ao tratamento convencional. / Agrochemicals constitute a great part of the total cost of inputs used in the crops production. The high consumption of agrochemicals reduces the profitability and increases the risks of environmental contaminations. One of the alternatives that have been proposed to reduce the amount of chemicals used in the crop production is the site-specific management, using the Precision Agriculture’s concepts. Machines used for site-specific application of liquid agrochemicals using variable rates and products are already in the market; however, its high initial cost and operational capacity make its acquisition unfeasible for small farms. In this work, a conventional sprayer was adapted with solenoid valves to allow the site-specific application using the "on/off" strategy, and a fixed rate. A computer program was developed to control each solenoid valve installed at the two sections of the boom, according to the information of a prescription map, containing the position of the points where the application should be done. A DGPS was connected to the system to inform the tractor’s position in the field. The system was tested in a real condition of weed control. The perimeter of the weed patches was previously georeferenced. The results showed that the developed system was able to achieve the patch application using fixed rates, resulting in a significant economy of herbicides, when compared with the conventional treatment, over the total area.
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Uma abordagem bayesiana para mapeamento de QTLs em populações experimentais / A Bayesian approach for mapping QTL in experimental populations

Andréia da Silva Meyer 03 April 2009 (has links)
Muitos caracteres em plantas e animais são de natureza quantitativa, influenciados por múltiplos genes. Com o advento de novas técnicas moleculares tem sido possível mapear os locos que controlam os caracteres quantitativos, denominados QTLs (Quantitative Trait Loci). Mapear um QTL significa identificar sua posição no genoma, bem como, estimar seus efeitos genéticos. A maior dificuldade para realizar o mapeamento de QTLs, se deve ao fato de que o número de QTLs é desconhecido. Métodos bayesianos juntamente com método Monte Carlo com Cadeias de Markov (MCMC), têm sido implementados para inferir conjuntamente o número de QTLs, suas posições no genoma e os efeitos genéticos . O desafio está em obter a amostra da distribuição conjunta a posteriori desses parâmetros, uma vez que o número de QTLs pode ser considerado desconhecido e a dimensão do espaço paramétrico muda de acordo com o número de QTLs presente no modelo. No presente trabalho foi implementado, utilizando-se o programa estatístico R uma abordagem bayesiana para mapear QTLs em que múltiplos QTLs e os efeitos de epistasia são considerados no modelo. Para tanto foram ajustados modelos com números crescentes de QTLs e o fator de Bayes foi utilizado para selecionar o modelo mais adequado e conseqüentemente, estimar o número de QTLs que controlam os fenótipos de interesse. Para investigar a eficiência da metodologia implementada foi feito um estudo de simulação em que foram considerados duas diferentes populações experimentais: retrocruzamento e F2, sendo que para ambas as populações foi feito o estudo de simulação considerando modelos com e sem epistasia. A abordagem implementada mostrou-se muito eficiente, sendo que para todas as situações consideradas o modelo selecionado foi o modelo contendo o número verdadeiro de QTLs considerado na simulação dos dados. Além disso, foi feito o mapeamento de QTLs de três fenótipos de milho tropical: altura da planta (AP), altura da espiga (AE) e produção de grãos utilizando a metodologia implementada e os resultados obtidos foram comparados com os resultados encontrados pelo método CIM. / Many traits in plants and animals have quantitative nature, influenced by multiple genes. With the new molecular techniques, it has been possible to map the loci, which control the quantitative traits, called QTL (Quantitative Trait Loci). Mapping a QTL means to identify its position in the genome, as well as to estimate its genetics effects. The great difficulty of mapping QTL relates to the fact that the number of QTL is unknown. Bayesian approaches used with Markov Chain Monte Carlo method (MCMC) have been applied to infer QTL number, their positions in the genome and their genetic effects. The challenge is to obtain the sample from the joined distribution posterior of these parameters, since the number of QTL may be considered unknown and hence the dimension of the parametric space changes according to the number of QTL in the model. In this study, a Bayesian approach was applied, using the statistical program R, in order to map QTL, considering multiples QTL and epistasis effects in the model. Models were adjusted with the crescent number of QTL and Bayes factor was used to select the most suitable model and, consequently, to estimate the number of QTL that control interesting phenotype. To evaluate the efficiency of the applied methodology, a simulation study was done, considering two different experimental populations: backcross and F2, accomplishing the simulation study for both populations, considering models with and without epistasis. The applied approach resulted to be very efficient, considering that for all the used situations, the selected model was the one containing the real number of QTL used in the data simulation. Moreover, the QTL mapping of three phenotypes of tropical corn was done: plant height, corn-cob height and grain production, using the applied methodology and the results were compared to the results found by the CIM method.
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Análise de associação aplicada ao mapeamento genético de doenças. / Analysis of association applied to the genetic diseases mapping.

Maria Jacqueline Batista 03 March 2006 (has links)
O mapeamento genético e a genética funcional de doenças são de grande importância na pesquisa médica e genômica. Para estas finalidades o estudo de associação entre fatores de risco genéticos e doença tem ganhado destaque na literatura. Neste trabalho disserta-se sobre a análise de associação aplicada ao mapeamento genético de doenças, caracterizando diferentes possibilidades de planejamentos experimentais e de utilização de modelos estatísticos de análise de dados. As formalizações estatísticas, como o tipo de delineamento experimental, a inclusão ou não de dados familiares, bem como a escolha do método estatístico de análise, que são decisivos na avaliação do poder dos testes obtidos e na sua aplicabilidade ao mapeamento genético, também são discutidas. Além disso, considera-se a análise de associação por meio de modelos de regressão logística em que, as análises de dados genéticos são abordadas via dados no nível genotípico e cromossômico. Finalmente, os conceitos supracitados são aplicados a conjuntos de dados reais, fornecidos pelo Laboratório de Cardiologia e Genética Molecular do InCor/USP, com o objetivo de ilustrar o problema teórico tratado e motivar a aplicação das metodologias estatísticas envolvidas. / The genetic mapping and functional genetics have great importance in the genomics research. In order to conduct these researches the study of the association between genetic risk factors and disease has been becoming an important role in the literature. In this work we consider the association analyses applied to the genetic diseases mapping, charactering different possibilities of experimental designs and the use of statistical models to analyze data sets. The statistical concepts, as the kind of experimental design, the inclusion of familiar records or not, as well as the choice of the statistical analyze method, which are very important to the evaluation of the power of the tests obtained and to their applicability in the genetic mapping, are also discussed. Furthermore, we consider the association analysis at person level and chromosome data set. Finally, the latter concepts are applied to a real data set, provided by the Molecular Genetic and Cardiology Laboratory of InCor/USP, in order to illustrate the theoretical problem treated in this work and to motive the use of the involved statistical methodologies.
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Análise da vulnerabilidade aos acidentes tecnológicos no entorno do distrito industrial do município de Paulínia / Analysis of vulnerability to accidents technological environment in the industrial district of the municipality of Paulinia

Rafael Alexandre Ferreira Luiz 06 September 2013 (has links)
Instalações industriais possuem uma ampla fonte de riscos. Por isso, o entendimento e gerenciamento destes adquirem grande importância para a garantia dos níveis de segurança. A temática vulnerabilidade é relevante na medida em que a relação do seu conceito ao de risco permite a contextualização deste último. A finalidade da avaliação da vulnerabilidade é descrever, dentro de um determinado contexto, a interação entre os riscos, a comunidade e o meio ambiente. Pesquisas deste tipo fornecem subsídios para o desenvolvimento de programas e estratégias de prevenção de riscos e promoção da saúde. Estudos que privilegiem a vulnerabilidade do entorno de plantas industriais ainda são escassos, porém de suma importância, pois os resultados visualizados na forma de mapas são úteis para a formulação de propostas e melhorias no gerenciamento dos riscos. Devido às características existentes nas áreas de entorno das plantas industriais no Brasil e, dada a gravidade e extensão dos danos que possíveis acidentes podem causar à saúde humana, a problemática da vulnerabilidade aos acidentes tecnológicos pode e deve ser encarada como um assunto pertinente para Saúde Pública, sendo esta área do conhecimento capaz de contribuir na formulação de estratégias de controle e prevenção de tais fatalidades. O objetivo dessa dissertação foi a aplicação do mapeamento da vulnerabilidade da área de entorno do distrito industrial do município de Paulínia e, então, a identificação dos alvos mais sensíveis à ocorrência de acidentes, a ponderação da viabilidade da aplicação deste para o contexto brasileiro e seu uso como instrumento de gestão de uso do solo no entorno de plantas industriais. A metodologia baseou-se em revisão da literatura, composição de base de dados e uso de um Sistema de Informação Geográfica. Os principais resultados indicaram valores elevados de vulnerabilidades para áreas que estão fora do limite destinado ao uso industrial, definido pelo zoneamento do município, principalmente no que diz respeito à vulnerabilidade humana. Por fim, concluiu-se que o planejamento territorial que leve em consideração a vulnerabilidade é fator primordial na redução dos danos ocasionados pelos acidentes tecnológicos, sobretudo no entorno de plantas industriais / Industrial facilities have a wide source of risk. Therefore, the understanding and management of them acquire great importance to guarantee the security levels. The vulnerability theme is relevant to the extent that its relationship with the risk concept allows the contextualization of the latter. The purpose of the vulnerability assessment is to describe, within a given context, the interaction between risks, the community and the environment. This kind of research provides subsidies for the development of programs and strategies for risk prevention and health promotion. Studies that emphasize the vulnerability of the surrounding areas of industrial plants are still scarce, but very important, because the results displayed in form of maps are useful to formulation of proposals and improvements in risk management. Due to the characteristics that are in the surrounding areas of industrial plants in Brazil and, considering the severity and extent of the damage that can cause possible injury to human health, the issue of vulnerability to technological accidents can and must be seen as a relevant subject to Public Health, and this area of knowledge can contribute to formulation of strategies for prevention and control of such fatalities. The purpose of this dissertation was the application of vulnerability mapping in the surrounding area of the industrial district at the Paulínia municipality and then, the identification of the more sensitivies targets to occurrence of accidents, the assessment of feasibility of applying this model to the Brazilian context and its use as a management tool in land use around plants. The methodology was based on a literature review, the composition of the database and the use of a Geographic Information System. The main results showed high vulnerability to areas outside limits for industrial use, defined by the municipality zoning, especially with regard to human vulnerability. Finally, it was concluded that territorial planning that takes into account the vulnerability is a key factor in reducing the damage caused by technological accidents, especially in surrounding areas of industrial plants
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Vulnerabilidade Social e ocorrência de doenças gastrointestinais associadas com inundações no Município de São Paulo / Social vulnerability and the occurrence of gastrointestinal diseases associated with floods in São Paulo, Brasil

Doris Jimena Roncancio Benitez 22 May 2015 (has links)
As inundações podem ter um grande impacto na saúde das populações. Doenças produzidas pela exposição direta ou indireta às águas, podem resultar em surtos de doenças gastrointestinais, infecções respiratórias, leptospirose entre outras. Já que os cenários de mudança climática predizem o aumento na frequência e severidade das inundações devido ao aquecimento global, é necessário ter claridade nos impactos gerados sobre a saúde humana como reflexo dos efeitos combinados das mudanças climáticas sobre os ecossistemas, o sistema econômico e o sistema social. A pesquisa visa analisar a vulnerabilidade da população do município de São Paulo às doenças infecciosas relacionadas com inundações. O processo tem como fio condutor o modelo de avaliação da vulnerabilidade conhecido como modelo de vulnerabilidade expandida. Dez variáveis consideradas como representativas para o município de São Paulo, foram escolhidas para a análise da vulnerabilidade social, correlacionadas e analisadas dentro da unidade espacial bacia hidrográfica para o ano 2010, mediante a análise de componentes principais. Bases de dados de precipitação da Rede Telemétrica de Pluviômetros de Superfície do Departamento de Águas e Energia Elétrica (DAAE), foram os dados usados para a avaliação dos níveis de precipitação. Adicionalmente, as estatísticas das bases de dados de Autorização de Internação Hospitalar do Sistema Universal de Saúde (AIH/SUS) foram usadas para a avaliação das variáveis epidemiológicas. Os resultados mostram que a vulnerabilidade social aumenta na direção centro-periferia e que as aglomerações de valores altos, evidentemente mais abundantes do que as aglomerações de valores baixos, aparecem nas bacias de vulnerabilidades sociais significativamente altas. / Floods can have an important impact on people\'s health. Diseases caused by direct or indirect exposure to flood water can result in outbreaks of gastrointestinal diseases, respiratory infections and leptospirosis among others. Since the climate change scenarios predict an increase in the frequency and severity of floods due to global warming, it is necessary to have clarity of the impacts on human health resulting by the combined effects of climate change on ecosystems and the economic and social systems. The study aims to analyze the vulnerability of the city of São Paulos population to infectious diseases related to floods. The process has the vulnerability assessment model known as expanded vulnerability model as its conducting wire. Ten variables considered as representative for the city of São Paulo, are the material for the analysis of social vulnerability. Their correlation and variance analysis is measure within the watershed spatial unit for the year 2010, by the principal component analysis methodology. The databases of precipitation made by the Telemetric Rain Gauges network of the Department of Water and Power (DAAE) are the values used to assess precipitation levels. In addition, the databases of Authorization for Hospitalization of the Brazilian Universal Health System (AIH/SUS) are use too for the evaluation of epidemiological variables. The results show that social vulnerability increases in downtown-periphery direction and that the clusters of high values, clearly more abundant than those of low levels, appear in the watersheds classified with significantly high social vulnerability.

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