Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-26T13:40:10Z No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T13:40:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The pacamã (Lophiosilurus alexandri) is a species of endemic catfish São Francisco river belonging to the order Siluriformes. It is a species very appreciated in the regions of the São Francisco River by the absence of intramuscular bones and quality of their steak, also highlighting the great potential for aquaculture. The pacamã among the most endangered species and restocking programs in the various regions of this basin have been developed. The aim of this study was to develop novel microsatellite markers for pacamã that can be used for genetic studies of this species and their populations. Tissue samples were collected from adult fish caught by artisanal fishing between the reservoirs of Sobradinho and Itaparica-BA-PE. First, a genomic DNA library was performed and a set of microsatellite was obtained. After genotyping, the number of alleles ranged from two to nine, and the average heterozygosity were 0659 (He) and 0.603 (Ho), respectively. Only one marker showed deviation from HWE and presence of null alleles. The overall coefficient of inbreeding (FIS) was 0.091, suggesting the presence of homozygous, which may be due to species characteristics. Polymorphic information content is, in most cases, greater than 0.5, confirming the efficiency of these markers for genetic studies / O pacamã (Lophiosilurus alexandri) é uma espécie de bagre endêmico do rio São Francisco pertencente a ordem dos Siluriformes. Trata-se de uma espécie muito apreciada nas regiões do rio São Francisco pela ausência de espinhos intramusculares e qualidade de seu filé, se destacando também pelo grande potencial para a aquicultura. O pacamã figura entre as espécies mais ameaçadas e programas de repovoamento nas diversas regiões desta bacia vêm sendo desenvolvidos. O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores microssatélites inéditos para o pacamã que possam servir para estudos genéticos sobre essa espécie e suas populações. Amostras de tecido foram coletadas de peixes adultos capturados pela pesca artesanal entre os reservatórios de Sobradinho-BA e Itaparica-PE. Inicialmente, uma biblioteca genômica de DNA foi realizada e um conjunto de microssatélites foi obtido. Após a genotipagem, o número de alelos variou de dois a nove e as heterozigosidades médias foram de 0,659 (He) e de 0,603 (Ho), respectivamente. Apenas um marcador apresentou desvio do EHW e presença de alelos nulos. O coeficiente de endocruzamento total (FIS) foi de 0.091, sugerindo a presença de homozigotos, que pode ser em decorrência de características da espécie. O conteúdo de informação polimórfica foi, na maioria dos casos, superior a 0,5, atestando a eficiência desses marcadores para estudos genéticos futuros.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Aeglidae are Decapoda crustaceans endemic from the neotropical region of South America. They are the only anomuran family entirely restricted to freshwater, occurring mainly in streams. Requirement for well conserved habitat has restricted the populations to springs, as an effect of the constant degradation of continental aquatic ecosystems. In the central region of Rio Grande do Sul state, the species Aegla longirostri, besides suffering the effects of habitat fragmentation, is subjected to a mountainous geographic barrier, which has been separating the basins of River Guaíba and River Uruguay for about 11 my. Microsatellite loci are molecular markers with high levels of heterozigosity which have been widely used in population genetics studies. Microsatellite markers previously isolated from A. longirostri genome were characterized and the levels of heterozigosity and allelic diversity were calculated for each locus. A total of seven polymorphic microsatellite loci were used to verify genetic variability among four different populations from central region of Rio Grande do Sul state concerned the two basins described above. Results show a great genetic differentiation among all populations and not only between populations isolated by the geographic barrier. Factors as lack of larval stage and low dispersion capacity are possibly contributing to such differentiation level. Anthropic actions, resulting in alteration of aquatic environments, can also be a more recent factor contributing to the genetic diversity among the populations studied, since aeglids are very strict in relation to the water quality. / Os aeglídeos são crustáceos decápodos endêmicos da região Neotropical da América do Sul. São os únicos anomuros de água doce, habitantes principalmente de cursos d água. A exigência por um habitat conservado tem restringido as populações de Aegla às nascentes, como efeito da constante degradação ambiental dos ecossistemas aquáticos continentais. Na região central do estado do Rio Grande do Sul destacamos a ocorrência de populações de Aegla longirostri, que além dos efeitos de fragmentação de habitat, estão expostas a uma barreira geográfica de formação montanhosa, que há cerca de 11 milhões de anos separa as bacias dos Rios Uruguai e Guaíba. Locos de microssatélites são marcadores que apresentam altos níveis de heterozigosidade e têm sido amplamente utilizados em estudos de genética de populações. Marcadores microssatélites previamente isolados do genoma de A. longirostri foram caracterizados determinando-se os níveis de heterozigosidade e a diversidade alélica para cada loco. Dos oito locos de microssatélites analisados, sete se mostraram polimórficos e foram empregados em indivíduos de quatro diferentes populações da região central do estado do Rio Grande do Sul para analisar a variabilidade genética entre as populações de A. longirostri em ambas as bacias. Os resultados mostram uma grande diferenciação genética entre todas as populações e não somente entre as populações isoladas pela barreira geográfica. Possivelmente, fatores como ausência de fase larval durante o desenvolvimento destes crustáceos, aliada a uma baixa capacidade de dispersão, podem estar contribuindo para esta diferenciação. A ação antrópica, resultando em degradação do ambiente aquático, também pode ser um fator recente a contribuir para a diferenciação genética entre as populações estudadas, visto que os aeglídeos são bem exigentes em relação à qualidade da água onde vivem.

Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) tem sido uma das pragas mais importantes da cultura do milho no Paraguai e Brasil. Este trabalho foi realizado para subsidiar programas de manejo de resistência no Paraguai, reconhecendo-se a proximidade das fronteiras agrícolas desse país com Brasil e a alta capacidade de dispersão de S. frugiperda. Para tanto, foram realizados estudos de caracterização da suscetibilidade aos inseticidas lufenuron e flubendiamide e de diversidade genética e o fluxo gênico em populações de S. frugiperda coletadas nas principais regiões produtoras de milho do Paraguai e de dois Estados fronteiriços do Brasil (Mato Grosso do Sul e Paraná). O método de bioensaio para a caracterização das linhas-básica de suscetibilidade foi o de tratamento superficial da dieta artificial com o inseticida. As variações na suscetibilidade a lufenuron e flubendiamide entre as populações de S. frugiperda testadas foram baixas (< 4 vezes), comparando-se as populações das regiões Oriental e Ocidental do Paraguai que apresentam caraterísticas climáticas distintas ou entre as populações do Paraguai e do Brasil. Para o monitoramento da suscetibilidade de populações de S. frugiperda no Paraguai foram definidas as doses diagnósticas, baseada na DL99, de 0,16 &mu;g de lufenuron.cm-2 (equivalente a 10 &mu;g de lufenuron.mL-1 de água) e 2,84 &mu;g de flubendiamide.cm-2 (180 &mu;g de flubendiamide.mL-1 de água). Mediante o uso de 12 loci microssatélites, foram verificadas maior diversidade genética dentro das populações (87,70%) quando comparada entre as populações de cada país (9,91%) e entre países (2,39%). Sendo assim, não foi constatada alta estruturação genética entre as populações de S. frugiperda coletadas no Paraguai e Brasil. As populações do Paraguai mostraram-se mais distintas entre si quando comparadas com as populações do Brasil. Nossos resultados apontam baixa estruturação genética e moderado/alto fluxo gênico entre as localidades de coleta de populações de S. frugiperda e entre as populações do Paraguai e Brasil. Os resultados obtidos na presente pesquisa servirão para a implementação de um programa de manejo da resistência de S. frugiperda a inseticidas no Paraguai, com ênfase na necessidade de ações no âmbito regional considerando os estados fronteiriços do Brasil. / Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) has been one of the most important corn pests in Paraguay and Brazil. This research was conducted to collect information to insect resistance management programs in Paraguay considering the proximity of agricultural borders of this country with Brazil and the high dispersal capacity of S. frugiperda. We conducted studies to characterize the susceptibility to the insecticides lufenuron e flubendiamide and to evaluate the genetic diversity and gene flow among S. frugiperda populations collected from major corn-producing regions in Paraguay and two frontier States of Brazil (Mato Grosso do Sul and Paraná). The bioassay method to characterize the baseline susceptibility was the diet surface treatment with the insecticide. The variation in the susceptibility to lufenuron and flubendiamide among S. frugiperda populations tested was low (< 4-fold) by comparing populations from Estearn and Western regions of Paraguay with distinct climatic conditions or populations from Paraguay and Brazil. For susceptibility monitoring to lufenuron and flubendiamide in S. frugiperda populations in Paraguay, we defined the diagnostic doses based on LD99 of 0.16 &mu;g of lufenuron.cm-2 (equivalent to 10 &mu;g of lufenuron.mL-1 of water) and 2,84 &mu;g of flubendiamide.cm-2 (180 &mu;g of flubendiamide.mL-1 of water). Using 12 microsatellite loci, higher genetic diversity within populations (87.70%) than among populations within each country (9.91%) and between countries (2.39%). Thus, there was no high genetic structure between S. frugiperda populations collected in Paraguay and Brazil. The populations of S. frugiperda from Paraguay were more distinct among themselves when compared with the populations from Brazil. Our results suggest low genetic structure and moderate/high gene flow among different sampling locations of S. frugiperda populations as well as between populations from Paraguay and Brazil. The results obtained in this research will support the implementation of resistance management programs of S. frugiperda to inseticides in Paraguay with focus on the need of plan of actions at regional level considering the border States of Brazil.

Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) tem sido uma das pragas mais importantes da cultura do milho no Paraguai e Brasil. Este trabalho foi realizado para subsidiar programas de manejo de resistência no Paraguai, reconhecendo-se a proximidade das fronteiras agrícolas desse país com Brasil e a alta capacidade de dispersão de S. frugiperda. Para tanto, foram realizados estudos de caracterização da suscetibilidade aos inseticidas lufenuron e flubendiamide e de diversidade genética e o fluxo gênico em populações de S. frugiperda coletadas nas principais regiões produtoras de milho do Paraguai e de dois Estados fronteiriços do Brasil (Mato Grosso do Sul e Paraná). O método de bioensaio para a caracterização das linhas-básica de suscetibilidade foi o de tratamento superficial da dieta artificial com o inseticida. As variações na suscetibilidade a lufenuron e flubendiamide entre as populações de S. frugiperda testadas foram baixas (< 4 vezes), comparando-se as populações das regiões Oriental e Ocidental do Paraguai que apresentam caraterísticas climáticas distintas ou entre as populações do Paraguai e do Brasil. Para o monitoramento da suscetibilidade de populações de S. frugiperda no Paraguai foram definidas as doses diagnósticas, baseada na DL99, de 0,16 &mu;g de lufenuron.cm-2 (equivalente a 10 &mu;g de lufenuron.mL-1 de água) e 2,84 &mu;g de flubendiamide.cm-2 (180 &mu;g de flubendiamide.mL-1 de água). Mediante o uso de 12 loci microssatélites, foram verificadas maior diversidade genética dentro das populações (87,70%) quando comparada entre as populações de cada país (9,91%) e entre países (2,39%). Sendo assim, não foi constatada alta estruturação genética entre as populações de S. frugiperda coletadas no Paraguai e Brasil. As populações do Paraguai mostraram-se mais distintas entre si quando comparadas com as populações do Brasil. Nossos resultados apontam baixa estruturação genética e moderado/alto fluxo gênico entre as localidades de coleta de populações de S. frugiperda e entre as populações do Paraguai e Brasil. Os resultados obtidos na presente pesquisa servirão para a implementação de um programa de manejo da resistência de S. frugiperda a inseticidas no Paraguai, com ênfase na necessidade de ações no âmbito regional considerando os estados fronteiriços do Brasil. / Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) has been one of the most important corn pests in Paraguay and Brazil. This research was conducted to collect information to insect resistance management programs in Paraguay considering the proximity of agricultural borders of this country with Brazil and the high dispersal capacity of S. frugiperda. We conducted studies to characterize the susceptibility to the insecticides lufenuron e flubendiamide and to evaluate the genetic diversity and gene flow among S. frugiperda populations collected from major corn-producing regions in Paraguay and two frontier States of Brazil (Mato Grosso do Sul and Paraná). The bioassay method to characterize the baseline susceptibility was the diet surface treatment with the insecticide. The variation in the susceptibility to lufenuron and flubendiamide among S. frugiperda populations tested was low (< 4-fold) by comparing populations from Estearn and Western regions of Paraguay with distinct climatic conditions or populations from Paraguay and Brazil. For susceptibility monitoring to lufenuron and flubendiamide in S. frugiperda populations in Paraguay, we defined the diagnostic doses based on LD99 of 0.16 &mu;g of lufenuron.cm-2 (equivalent to 10 &mu;g of lufenuron.mL-1 of water) and 2,84 &mu;g of flubendiamide.cm-2 (180 &mu;g of flubendiamide.mL-1 of water). Using 12 microsatellite loci, higher genetic diversity within populations (87.70%) than among populations within each country (9.91%) and between countries (2.39%). Thus, there was no high genetic structure between S. frugiperda populations collected in Paraguay and Brazil. The populations of S. frugiperda from Paraguay were more distinct among themselves when compared with the populations from Brazil. Our results suggest low genetic structure and moderate/high gene flow among different sampling locations of S. frugiperda populations as well as between populations from Paraguay and Brazil. The results obtained in this research will support the implementation of resistance management programs of S. frugiperda to inseticides in Paraguay with focus on the need of plan of actions at regional level considering the border States of Brazil.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Leticia da Silveira Pinheiro.pdf: 1061417 bytes, checksum: d3b6dccd4e5c363bd8b7c9da2c672cc0 (MD5) Previous issue date: 2008-03-07 / Recurrent Selection is a population inbreed method that is not traditionally used in autogamous species as rice. However, it is still an interesting methodology to the implementation of recurrent selection populations, due to the possibility of obtaining genotypes with wide genetic base and adequate agronomical traits. It is even more attractive when a great genetic variability is easily available, as it is for rice and could be largely used in the development of more productive elite cultivars and with a better production stability even under low input agricultural systems. Two recurrent selection irrigated rice populations, developed by Embrapa Arroz e Feijão, were synthetized using different recombination methods. The CNA-IRAT 4 population was developed in field conditions using male-sterelity, while the CNA 12 population originated from manual crosses in a circulant partial diallel scheme. The aim of this work was the evaluation of the genetic variability among cycles of the two recurrent selection populations using fourteen SSR markers. Hundred and eighty genotypes of the cycles 1, 2 and 5 of CNA-IRAT 4 population and cycles 1 and 2 of CNA 12, were evaluated. The AMOVA did not indicate any genetic structure among the cycles of selection, meaning that the greater variation was attributed between individuals within cycles, in both studied populations. Unexpected alleles, which means alleles that not belong to the genetic pool of the genitors, were identified in both populations and in all cycles evaluated, mostly of these alleles were observed on CNA-IRAT 4 population. These alleles were probably a result of undesired crosses of genotypes which did not belong to both populations. Parameters Fis and Fit of Wright s statistics indicated that the genetic variability of the manually conducted population (CNA 12) were increased while the population using male-sterelity recombination (CNA-IRAT 4) were reduced. The mean reason for this particular situation was due to the directionally crosses that promoted a greater combination between the alleles of all genitors, while male-sterelity methodology pollination the alleles from plants with major height and more capable of producing more pollen were privileged. To avoid the genetic drift in CNA-IRAT 4, genotypes genetically divergent, with more General Capacity of Combination and with good agronomic attributes, should be introduced on this population. / Seleção recorrente é um método de melhoramento populacional ainda pouco empregado em espécies autógamas, como o arroz. Contudo, a possibilidade de obter genótipos de ampla base genética e com bons atributos agronômicos, é um atrativo interessante para a implementação de populações de seleção recorrente, sobretudo pela necessidade de utilizar a grande variabilidade genética disponível para enfrentar o desafio de desenvolver cultivares elite mais produtivas e capazes de manter a estabilidade de produção. Foram utilizadas, neste estudo, duas populações de seleção recorrente de arroz irrigado, desenvolvidas pelo programa de melhoramento genético da Embrapa Arroz e Feijão. A população CNA-IRAT 4 portadora do gene da macho-esterilidade genética, permitindo assim que a sua recombinação seja feita à campo, e a população CNA 12 recombinada manualmente através do esquema de cruzamento em dialelo ciculante por não possuir este gene. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética entre os ciclos de seleção das duas populações por meio de 14 marcadores SSR. Foram avaliados 180 indivíduos dos ciclos 1, 2 e 5 na CNA-IRAT 4, e ciclos 1 e 2 na CNA 12. O estudo da análise de variância molecular (AMOVA) não indicou nenhum tipo de estruturação entre os ciclos de seleção definindo que a maior parte da variação foi encontrada entre os indivíduos dentro dos ciclos do que entre os ciclos em ambas as populações. Foram identificados alelos não provenientes dos genitores nas duas populações, e em todos os ciclos, principalmente para a CNA-IRAT 4. Estes alelos foram provavelmente resultantes da fecundação indesejada a partir de genótipos que não faziam parte das populações. Os parâmetros Fis e Fit da estatística F de Wright indicaram que a recombinação manual está ampliando a variabilidade genética da população CNA 12, enquanto que a recombinação via gene da macho-esterilidade está reduzindo a variabilidade genética da CNA-IRAT 4, e o principal motivo é que os cruzamentos dirigidos estão promovendo uma maior combinação entre os alelos de todos os genitores, enquanto que a polinização via macho-esterilidade vêm privilegiando os alelos dos genótipos com maior porte e capacidade de produção de pólen e do macho-estéril. Para evitar a deriva genética na CNA-IRAT 4, genótipos de arroz geneticamente divergentes das progênies, com maior Capacidade Geral de Combinação e com bons atributos agronômicos, deverão ser introduzidos nesta população.