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Genética da reintrodução : o caso do cervo-do-pantanal (Blastocerus dichotomus) na Estação Ecológica de Jataí /

Ferreira, Paula Ribas Soares. January 2011 (has links)
Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Susana Ganzález / Banca: Kelly R. Zamúdio / Resumo: O Projeto de Reintrodução do Cervo-do-pantanal de Porto Primavera foi implementado pelos pesquisadores do Núcleo de Pesquisa e Conservação de Cervídeos (NUPECCE) da Universidade Estadual Paulista, na Estação Ecológica de Jataí (E.E.J.), a fim de conservar a espécie no estado de São Paulo. Para que o sucesso de um programa de reintrodução seja atingido, vários fatores devem ser levados em consideração, entre eles possíveis problemas genéticos decorrentes do pequeno número de indivíduos fundadores, como a perda da diversidade genética devido à deriva genética e a perda do vigor devido à endogamia. Assim, a partir de 6 locos microssatélites nós estimamos os níveis de variabilidade genética dessa população e, juntamente com dados de campo foi possível reconstruir a genealogia da mesma. Foram analisados no total 42 indivíduos: 8 fundadores, 14 nascidos no local e 20 indivíduos da população original. O número total de alelos encontrados na população original foi de 30, perfazendo uma média de 5 alelos por loco, com locos variando de 4 a 7 alelos. Já, na população reintroduzida, o número total de alelos encontrados foi 21, com média de 3,5 alelos por loco, e locos variando de 1 a 4 alelos. A grande perda alélica observada aqui indica que a população reintroduzida passou por um forte gargalo genético em decorrência do efeito fundador sofrido durante sua formação. Em contrapartida, a partir da geração fundadora até a segunda geração da E.E.J., a perda de alelos foi visivelmente menor, apenas 4 alelos foram perdidos. Em acréscimo, dados de heterozigosidade mostram que a população esta mantendo os níveis de diversidade genética (geração fundadora H=0,5; segunda geração H=0,625). A endogamia é um mecanismo inevitável... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Reintroduced Project of marsh deer was implemented by the researchers from the Deer Research and Conservation Center (NUPECCE) of Unesp, in Jataí's Ecological Station (E.E.J.), to understand the process of colonization of small marshes patches that remain in the São Paulo state. In order to make a reintroduction project successful, several factors must be taken into account; among those, possible genetic problems arising from the small number of founding individuals, such as the loss of genetic diversity due to genetic drift and the loss of fitness due to inbreeding. Hence, from 6 microsatellite loci, we estimated the genetic variability levels of this population and, together with the field data, we were able to reconstruct the genealogy of the members. We analyzed 42 individuals: 8 founders, 14 individuals born into the reintroduced population and 20 individuals from the source population. The total number of alleles found in the original population was 30 (5 alleles per locus), with loci ranging from 4 to 7 alleles. In the reintroduced population, the total number of alleles found was 21 (3.5 alleles per locus) and loci ranging from 1 to 4 alleles. The major allelic loss observed indicates that the reintroduced population went through a strong genetic bottleneck resulting from the founding effect suffered during its establishment. On the other hand, in the generations of the reintroduced population of the E.E.J., the loss of alleles was noticeably smaller. Furthermore, heterozygosity data show that the population has been maintaining the levels of genetic diversity (Founder generation H=0.5; second generation H=0.625). Inbreeding is an inevitable mechanism in small populations; however, the indexes that... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Determinação dos perfis de estrógenos e progestinas fecais durante o ciclo estral, gestação e período pós-parto em cervos-do-pantanal (Blastocerus dichotomus) em cativeiro /

Polegato, Bruna Furlan. January 2008 (has links)
Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Paulo Henrique Franceschini / Banca: Claudio Alvarenga de Oliveira / Resumo: Atualmente, o conhecimento sobre a fisiologia e a biologia reprodutiva de cervos-do-pantanal (Blastocerus dichotomus) é escasso e as lacunas existentes aumentam a vulnerabilidade da espécie à extinção. Neste contexto, os objetivos deste trabalho foram: (1) caracterizar alguns parâmetros relacionados à fisiologia reprodutiva de fêmeas de cervos-do-pantanal e (2) fornecer métodos adequados para o acesso às diferentes fases do ciclo reprodutivo. Para isso, seis fêmeas da espécie foram utilizadas para a caracterização hormonal do ciclo estral, da gestação e do período pós-parto. Amostras fecais foram colhidas diariamente para o monitoramento do ciclo estral, duas vezes por semana durante a gestação e em dias alternados no período pós-parto. As dosagens das progestinas fecais foram feitas por EIA. Foram monitorados 16 ciclos estrais completos, cuja duração média foi de 21,3±1,3 dias (6,4±1,2d fase inter-luteal e 14,8±1,3d fase luteal). As concentrações médias de progestinas fecais para as fases inter-luteal e luteal do ciclo estral foram 834±311ng g-1 e 3979±1611ng g-1, respectivamente, e o valor limite entre elas foi de 1457ng g-1. Quatro fêmeas levaram a gestação a termo, determinando um período de gestação médio de 253±4 dias. Houve um aumento significativo (p<0,05) na concentração de progestinas fecais a partir do quarto mês de gestação, o que pôde direcionar o diagnóstico presuntivo de gestação na espécie. Assim, concentrações de progestinas fecais 15250ng g-1 foram indicativas de gestação. No período de 60 dias pós-parto em que as fêmeas foram monitoradas, 75% (3/4) delas apresentaram estro e/ou retomaram a atividade ovariana. / Abstract: The scarce knowledge about reproductive physiology and biology in marsh deer (Blastocerus dichotomus) increases the vulnerability of this species to the extinction. Thus, the aims of this study were: (1) to characterize some parameters related to the reproductive physiology of females marsh deer and (2) to turn available adequate tools for the assessment of the reproductive cycle's phases. Six females and one male were used to the hormonal characterization of the estrous cycle, pregnancy and post parturition period. Fecal samples were collected daily during the estrous cycle, twice a week during the pregnancy and in alternated days during the post parturition period of monitoring and the amount of fecal progestins was evaluated by enzyme immunoassay. The mean length of the estrous cycle was 21.3±1.3 days (6.4±1.2d interluteal and 14.8±1.3d luteal phase) and the fecal progestins concentrations were 834±311ng g-1 and 3979±1611ng g-1, respectively for the inter-luteal and luteal phase. The limit value between these phases was 1457ng g-1. Four females became pregnant and exposed a mean pregnancy period of 253±4 days. There was a significant increase (p<0,0001) in the fecal progestins excretion since the fourth month of pregnancy, that could provide guidelines for the pregnancy diagnosis in the species. Thus, fecal progestins concentrations 15250ng g-1 were indicative of pregnancy. Seventy five percent (3/4) of the females exhibit estrous and/or restarted the ovarian function during the post parturition period of monitoring. / Mestre
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Identificação e Prevalência de Agentes Rickettsiais (Rickettsiales: Anaplasmataceae) em Cervo-do-pantanal (Blastocerus dichotomus) utilizando métodos sorológico e molecular /

Sacchi, Ana Beatriz Vieira. January 2009 (has links)
Orientador: Rosangela Zacarias Machado / Banca: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Natalino Hajime Yoshinari / Resumo: O presente trabalho teve por objetivo pesquisar no sangue de cervos-do-pantanal (B. dichotomus), a presença de DNA de agentes rickettsiais, tais como Ehrlichia chaffeensis, E. ewingiii, E. canis, Anaplasma phagocytophilum, A. marginale e Neorickettsia risticii, pela Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR), além de estudar a prevalência de anticorpos anti-E. chaffeensis e anti-A. phagocytophilum utilizando-se a Reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI). Os 143 animais utilizados foram capturados durante o desenvolvimento do Projeto Cervo-do-Pantanal (1998 a 2002) na área de inundação da Usina Hidrelétrica de Porto Primavera, no Rio Paraná, e divididos em quatro sub-populações de acordo com o local e momento da captura, em áreas denominadas MS01, MS02 (Mato Grosso do Sul, antes e após a inundação, respectivamente), PX (Rio do Peixe, depois da primeira cota de inundação) e AGUA (Rio Aguapeí, depois da inundação). Na avaliação sorológica, as freqüências de animais positivos para anticorpos anti-E. chaffeensis e anti-A. phagocytophilum foram de 76,76% e 20,20% em MS01, 88,88% e 22,22% em PX, 88,88% e 5,55% em MS02, e 94,12% e 5,88% em AGUA, respectivamente. Na pesquisa de DNA, dos 143 animais testados, 61 (42,65%) foram positivos para E. chaffeensis, sendo 38 (38,38%) de MS01, 4 (44,44%) de PX, 12 de MS02 (66,66%) e 7 (41,18%) de AGUA. Amostras positivas enviadas para seqüenciamento revelaram 100% de similaridade com amostras de Ehrlichia chaffeensis da Argentina e dos Estados Unidos (números de acesso no Genbank EU826516.2 e AF416764.1, respectivamente). Já para o genogrupo de A. phagocytophilum, 70 cervos (48,95%) foram considerados positivos. Destes, 51 (51,51%) são provenientes de MS01, 12 (66,66%) de MS02 e 7 (41,18%) de AGUA. Animais provenientes de PX foram todos negativos. Amostras positivas enviadas para seqüenciamento... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present work had as objective to research in the blood of marsh deer (B. dichotomus), the presence of rickettsial agents DNA such as Ehrlichia chaffeensis, E. ewingii, E. canis, Anaplasma phagocytophilum, A. marginale e Neorickettsia risticii, by the Polimerase Chain Reaction (PCR), as well as studying the prevalence of anti-E. chaffeensis and anti-A. phagocytophilum antibodies using Indirect Imunofluorescence Reaction (IFA). The 143 animals that were used were captured during the development of the Marsh Deer Project (1998 to 2002) in the flood area of the Porto Primavera Hydroelectric Power Station, in Parana River, and divided in four sub-populations according to the local and moment of the capture, in areas denominated MS01, MS02 (Mato Grosso do Sul, before and after flood respectively), PX (Peixe's River, after the first flood quota) and AGUA (Aguapeí River, after flood). In the serological avaliation, the frequency of positive animals for anti-E. chaffeensis and anti-A. phagocytophilum antibodies were 76,76% and 20,20% in MS01, 88,88% and 22,22% in PX, 88,88% and 5,55% in MS02, and 94,12% and 5,88% in AGUA, respectively. In the DNA research, from the 143 tested animals, 61 (42,65%) were positive for E. chaffeensis, 38 (38,38%) from MS01, 4 (44,44%) from PX, 12 from MS02 (66,66% and 7 (41,18%) from AGUA. Positive samples send to sequency demonstrate 100% of similarity with samples of Ehrlichia chaffeensis from Argentina and United States (numbers of access in Genbank EU826516.2 and AF416764.1, respectively). For the A. phagocytophilum genogroup, 70 deers (48,95%) were considered positive. Of these, 51 (51,51%) come from MS01, 12 (66,66%) from MS02 and 7 (41,18%) from AGUA. The animals that come from PX were all negative. Positive samples send to sequencing demonstrated 99% of similarity with a sample of Anaplasma... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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