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Analise do polimorfismo genetico de cepas de Mycobacterium avium isoladas de pacientes atendidos no hospital de clinicas da Unicamp, utilizando a sequencia de inserção IS1245

Panunto, Alessandra Costa 16 May 2002 (has links)
Orientadores : Maria Cecilia Barisson Villares, Marcelo de Carvalho Ramos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-02T16:41:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Panunto_AlessandraCosta_M.pdf: 12920906 bytes, checksum: 263a29ecfa31e38c1f81b7326d7b06c5 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: A tuberculose é a principal causa de morte no mundo entre as doenças infecciosas, produzindo 2 milhões de óbitos ao ano. Estima-se que um terço da população mundial esteja infectada pelo Mycobacterium tuberculosis, ou seja, 1,7 bilhões de pessoas. Em países africanos, o problema da tuberculose e da aids adquiriu proporções de grande magnitude. Em Moçambique, o coeficiente de incidência é de 460 casos/100.000 habitantes/ano, com mortalidade de 129 casos/100.000 habitantes/ano. Este estudo documenta a relevância desse problema. Duzentos e trinta e sete isolados clínicos de Mycobacterium tuberculosis foram caracterizados por IS6110-RFLP e ¿Spoligotyping¿, com o objetivo de avaliar a biodiversidade do bacilo da tuberculose na cidade de Maputo, Moçambique, África, onde há uma elevada incidência de tuberculose. Os resultados obtidos com o uso da técnica IS6110-RFLP exibiram uma considerável variabilidade genotípica, ou seja, cerca de 70,5% dos exemplares analisados corresponderam a genótipos únicos. A interpretação desse achado deveria ser feita juntamente com o estudo epidemiológico clássico, bem como a ampliação do número de casos analisados. Porém, a grande variabilidade genotípica nesse cenário em que a transmissão da doença é intensa, dado o número elevado de casos, indica, provavelmente, a situação endêmica em si, bem como o tempo prolongado em que isso se dá. Além disso, a grande mobilidade interna, ocorrida depois das intensas guerras civis, trazendo para a cidade indivíduos de diversos outros locais, pode também ter contribuído para essa diversidade. Encontramos também uma alta freqüência de cepas com baixo número de cópias (20,2% da IS6110). Todos os isolados foram também submetidos ao ¿Spoligotyping¿. Essa técnica foi mais discriminatória para os isolados com menos de 6 cópias da IS6110 do que o RFLP e menos discriminatório para os isolados com mais de 6 cópias da IS6110. As famílias mais freqüentemente encontradas no conjunto das cepas foram: LAM, EAI, T e Beijing, distribuídas entre os 35 agrupamentos, com 193 isolados. Em ambos os agrupamentos, tanto os derivados da técnica ¿IS6110-RFLP¿, quanto o ¿Spoligotyping¿, não houve nenhuma correlação com a resistência à isoniazida, e mesmo com os isolados multirresistentes / Abstract: Tuberculosis is the leading cause of death among infectious diseases in the world, with approximately two million deaths each year. Among Sub-Saharan African countries, tuberculosis and AIDS represents an enormous problem. In Mozambique, the incidence of tuberculosis is as high as 460 cases/100,000 inhabitants/year, with a mortality rate of 129 people/100,000 inhabitants/year. The present study re-enforces the importance of this problem. A sample of 237 clinical strains of Mycobacterium tuberculosis isolated from HIV-infected patients, living in the city of Maputo, Mozambique, was genotipically characterized by IS6110-RFLP and Spoligotyping. IS6110-RFLP showed a considerable variability (70.5%) corresponding only to genotypes. Limitations in sampling, and scarce epidemiological data, may account for lack of definition of risk factors for TB transmission in this study. A high frequency of strains exhibiting low IS6110 copy number (n=20,2%) was observed. These strains were further genotyped by Spoligotyping. The most frequently found families, characterized with the use of this technique were: LAM, EAI, T and Beijing. These isolates (n=193) could be grouped in 35 clusters. Spoligotyping was more discriminatory for isolates exhibiting less than six IS6110 copies than RFLP. No correlation was found between resistance to INH, or even multidrug-resistance and clustering / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas

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