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Genotipagem utilizando a sequencia de inserção IS6110 e "spoligotyping" de Mycobacterium tuberculosis isolados de pacientes infectados pelo HIV, em Moçambique, Africa

Panunto, Alessandra Costa 07 June 2007 (has links)
Orientador: Marcelo de Carvalho Ramos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-09T07:44:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Panunto_AlessandraCosta_D.pdf: 4929023 bytes, checksum: e09c1fb4f0b9ff64c05e8133763291d7 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: O M. Avium é um microrganismo oportunista e sua infecção é feeqüentemente encontrada em pacientes com aids no Brasil, apesar do largo uso da quimioterapia antiretroviral altamente efetiva. Este estudo documenta a relevância desse problema. Dentro de uni número significante de pacientes (n=39) infectados com o M. avium, os isolados puderam ser recuperados de uma variedade de espécimes clínicos. Todos os isolados (n=45) foram tipados pela técnica de RFLP usando a seqüência 1S1245. A maioria dos pacientes (n=35) eram infectados pelo HIV. Somente duas cepas não puderam ser tipadas por causa da ausência da seqüência detectável pela 1S1245. Nas 43 cepas restantes os "blots" apresentaram de 6 a 23 bandas. Uma média de 17 seqüências foram observadas para cada cepa. Para alguns pacientes, mais de um isolado pode ser recuperado. Em dois pacientes deste grupo com doença disseminada, o M. avium pode ser recuperado mais de uma vez. De cada paciente, pelo menos duas amostras com diferentes genótipos foram recuperadas de locais estéreis, indicando que eles tinham infecções policlonais. Esses achados têm sido relatados por outros autores. Em um estudo recente, SAAD et aI., 2000, demonstrou que isolados de infecções policlonais e diferentes "fmgerprints" podem apresentar diferentes suscetibilidade antimicrobiano. Quatro "clusters" de pacientes puderam ser identificados. O maior "cluster" foi composto de oito pacientes. Estes resultados indicam que um mecanismo de transmissão recente ocorreu. A fonte de contaminação desses microrganismos não pode ser determinada. Assim, a transmissão pessoa a pessoa não apresentou uma importância significativa na transmissão desse microrganismo. Nós supomos que esses pacientes adquiriram o microrganismo de fontes hospitalares como água, alimento ou mesmo do ambiente / Abstract: not informed. / Doutorado / Ciencias Basicas / Doutor em Clínica Médica
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Genotipagem , utilizando a sequencia de inserção IS6110, de cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas de pacientes portadores da infecção pelo HIV em Moçambique, Africa / IS6110 Polymorphism in Mycobacterium tuberculosis isolates from HIV infected patients living in Mozambique, Africa

Basso, Audrey Jordão 24 August 2006 (has links)
Orientador: Marcelo de Carvalho Ramos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-07T12:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Basso_AudreyJordao_M.pdf: 998979 bytes, checksum: 6b29af1ec17385aea2f4b4f550bb349e (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A técnica do estudo do polimorfismo de fragmentos de restrição, com a pesquisa da seqüência de inserção IS6110 (IS6110-RFLP), é o método de genotipagem mais empregado mundialmente para a caracterização de isolados de M. tuberculosis. Ela pode ser empregada para o estudo de surtos, epidemias ou para estudos de genética populacional. Em Moçambique, onde a tuberculose tem uma elevada prevalência, não há informação suficiente sobre os padrões genotípicos obtidos com a IS6110-RFLP de cepas locais de M. tuberculosis. A descrição dos padrões obtidos com essa metodologia pode ser útil localmente para propósitos epidemiológicos ou, internacionalmente, para descrever o relacionamento de cepas isoladas em Moçambique com outras áreas do mundo. Neste estudo, uma coleção de 158 isolados de M. tuberculosis, identificados com o emprego da análise de fragmentos de restrição após a amplificação de trecho do gene hsp65 (hsp65-PRA), recuperados de pacientes infectados pelo HIV com tuberculose pulmonar e que residiam em Maputo, Moçambique, foram genotipados. O número de seqüências IS6110 obtido variou de 1 to 18, com 21.5% dos isolados exibindo menos de seis cópias. Um total de 10 ¿clusters¿ foram caracterizados, um com três isolados e os demais com dois cada. Os isolados que exibiram menos de seis seqüências não foram incluídos na análise, dado o baixo poder discriminatório do método. Baseado no coeficiente de similaridade, 85% dos isolados tinham mais do que 65% de homologia. Esses dados mostram que, isolados de M. tuberculosis obtidos em Moçambique, África, podem ser analisados, para fins epidemiológicos com o auxílio dessa técnica de genotipagem. Entretanto, um considerável número de isolados exibiu um número pequeno de cópias da seqüência IS6110 e um segundo marcador genético, como a espoligotipagem, deve ser utilizado / Abstract: IS6110 RFLP has been the most widely used genetic subtyping method for M. tuberculosis strains, to characterize disease outbreaks or for evolutionary genetics studies. In Mozambique, where tuberculosis exhibits a high prevalence, there is not enough information about IS6110-RFLP patterns of local M. tuberculosis strains. The description of the fingerprinting patterns obtained with this methodology can be useful locally for epidemiological purposes, and internationally to investigate the relatedness of strains isolated in Mozambique to other areas of the world. In this study, a collection of 158 isolates of M. tuberculosis strains, as identified by using hsp65-PRA, recovered from HIV-infected patients with pulmonary tuberculosis residing in Maputo, Mozambique, was genotyped. The number of IS6110 copies ranged from 1 to 18, with 21.5% of strains exhibiting less than six copies. A total of 10 clusters were found, one consisting of three strains and all the others of two strains. Isolates showing less than six bands were not included in the cluster analyses due to low discriminatory power of the analysis. Based on similarity coefficients 85% of strains had more than 65% homology. This data show that M. tuberculosis strains obtained in Mozambique, Africa can be analyzed for epidemiological purposes with the use of this genotyping technique. However, a considerable number of strains exhibited a low number of IS6110 copies, and a second genetic marker as spoligotyping has to be used. / Mestrado / Clinica Medica / Mestre em Clinica Medica

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