Submitted by Osvaldo Araujo (osvaldo.araujo.agro@gmail.com) on 2018-03-27T18:26:29Z No. of bitstreams: 1 Arauj Junior_o_ilha (3).pdf: 1043962 bytes, checksum: dce6e72d8aff0d848771cdd45f1576d6 (MD5) / Approved for entry into archive by Cristina Alexandra de Godoy null (cristina@adm.feis.unesp.br) on 2018-03-27T19:27:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 araujojunior_o_me_ilha.pdf: 1043962 bytes, checksum: dce6e72d8aff0d848771cdd45f1576d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-27T19:27:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 araujojunior_o_me_ilha.pdf: 1043962 bytes, checksum: dce6e72d8aff0d848771cdd45f1576d6 (MD5) Previous issue date: 2018-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os sistemas integrados de produção agropecuária são alternativas viáveis para recuperação de áreas degradadas, rotação de culturas e produção de palhada com efeitos sobre as propriedades físicas, químicas e biológicas do solo. Esta pesquisa objetivou, em um LATOSSOLO VERMELHO distrófico, avaliar o desempenho produtivo da soja em sucessão ao capim Marandu, que foi submetido à três manejos: adubado com 50 kg ha-1 de N (Ureia) a cada corte antecessor, simulando o pastejo (0,30 m de altura), totalizando 4 cortes com intervalo de um para o outro de aproximadamente 30 dias, ou com pulverização foliar a cada corte com Azospirillum brasilense, e numa condição sem adubação nitrogenada e sem pulverização com Azospirillum após cada corte (controle), e em duas condições de semeadura da soja, com sementes inoculadas apenas com Bradyrhizobium japonicum ou co-inoculada com Azospirillum brasilense. A pesquisa constituiu-se de dois experimentos (um em área de sequeiro e outro em área irrigada por aspersão – pivô central) e foi realizada no ano agrícola 2016/2017 na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), localizada no município de Selvíria-MS. A cultura anterior ao experimento, em ambas as áreas, foi a Urochloa brizantha cv Marandu advinda do consórcio com milho, onde após a colheita do milho, o capim permaneceu na área até a semeadura da soja BMX POTÊNCIA RR. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados, com quatro repetições, em esquema fatorial 3 x 2, constituídos do cultivo da soja em sucessão ao capim-marandu submetido à três manejos e em duas condições de semeadura da soja, inoculada apenas com Bradyrhizobium ou co-inoculada com A. brasilense. A co-inoculação via semente de Bradyrhizobium e Azospirillum não incrementou o crescimento, os componentes da produção e produtividade da soja sob Sistema Plantio Direto (SPD), independentemente se em área de sequeiro ou irrigada. Em ambos os manejos, sequeiro e irrigado, a pulverização foliar de A. brasilense no capim Marandu é viável para o SIPA promovendo produção de forragem satisfatória em relação à adubação nitrogenada, bem como este residual de A. brasilense no solo, resultante da aplicação foliar no capim Marandu antecessor à soja, aumentou a massa de nódulos da soja, mostrando ser uma alternativa viável para potencializar a fixação biológica de N2, principalmente em condições de sequeiro. / Crop livestock are viable alternatives for the recovery of degraded areas, crop rotation and straw production with effects on the physical, chemical and biological properties of the soil. The aim of the research in a dystrophic RED LATOSOLO, was to evaluate the productive performance of soybean in succession to the Marandu grass, which was submitted to three treatments: fertilized with 50 kg ha-1 of N (Urea) to each predecessor cut, simulating grazing (0,30 m high), totaling 4 cuts with interval from one to another of approximately 30 days, or with leaf spraying at each cut with Azospirillum brasilense, and in a condition without nitrogen fertilization and without spraying with Azospirillum after each cut (control), and under two conditions of soybean sowing, inoculated only with Bradyrhizobium or co-inoculated with Azospirillum brasilense. The research consisted of two experiments (one in the dry area and the other in a overhead irrigation area - central pivot) and was carried out in the agricultural year 2016/2017 at the Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), located in the municipality of Selvíria-MS. The culture before the experiment, in both areas, was Urochloa brizantha cv. Marandu from the maize consortium, and after maize harvesting, the grass remained in the area until sowing of soybean BMX POTÊNCIA RR. The experimental design was a randomized complete block design, with four replications, in a 3 x 2 factorial scheme, consisting of the soybean crop in succession to the Marandu grass submitted to three treatments and in two sowing conditions of soybean, inoculated only with Bradyrhizobium or co-inoculated with A.brasilense. The co-inoculation of Bradyrhizobium and Azospirillum in the seeds did not increase the growth, the components of the production and productivity of the soybeans under no-tillage system, irrespective of dry or irrigated areas. In both dry and irrigated managements, the A. brasilense leaf spray in the Marandu grass is viable for the SIPA promoting satisfactory forage production in relation to the nitrogen fertilization, as well as this residual of A. brasilense in the soil, resulting from the foliar application in the Marandu grass predecessor to soybean, increased the nodule mass of the soybean, proving to be a viable alternative to potentiate the biological N2 fixation, mainly in dry conditions.

O presente trabalho consiste na investigação das características da imagem mamográfica digitalizada para definir automaticamente parâmetros de processamento em um esquema de diagnóstico auxiliado por computador (CAD) para mamografia, com o objetivo de se obter o melhor desempenho possível. Além disso, com base na aplicação dos resultados dessa primeira investigação, propõe-se também uma técnica de redução dos índices de falso-positivo em esquemas CAD visando à redução do número de biópsias desnecessárias. Para a definição automática dos parâmetros de processamento nas técnicas de detecção de microcalcificações e nódulos, foram extraídas algumas características das imagens, como desvio padrão, terceiro momento e o limiar de binarização. Utilizando o método de automatização proposto, observou-se um aumento de 20% no desempenho do esquema CAD (Az da curva ROC) em relação ao método não automatizado com parâmetro fixo. Para que fosse possível o processamento da imagem mamográfica inteira pelo esquema CAD e as técnicas desenvolvidas, foi desenvolvida também uma técnica para seleção automática de regiões de interesses, que recorta partes relevantes da mama para a segmentação. O índice de falsos positivos foi tratado por técnica específica desenvolvida com base na comparação das duas incidências típicas do exame mamográfico que, juntamente com a avaliação automática da imagem no pré-processamento para detecção de microcalcificações produziu uma redução significativa de 86% daquela taxa em relação ao procedimento de parâmetro fixo. / This present work consists on the investigation of mammographic image characteristics for automatic determination of image processing parameters for a mammography computer aided diagnosis scheme (CAD) in order to get optimal performance. Additionally, using the results obtained on this first investigation, it was also developed a new technique for the reduction of false-positive rates on CAD projects, which can result on the reduction of the number of unnecessary biopsies. For the automatic definition of the image processing parameters for the techniques of detection of microcalcifications and nodules, some image characteristics had been extracted, as standard deviation, third momentum and the thresholding value. Using the proposed automatization method it was reported an increase of 20% in the CAD performance (evaluated determining the ROC curve) in comparison to the non-automatic method (fixed parameter). Besides, for CAD schemes it is necessary to process the entire mammographic image. Thus, it was also developed a technique for automatic selection of regions of interests in the mammogram, which extracts better regions from breast image for further segmentation. False-positives rates was treated by a specific technique based on the comparison of the two typical incidences of mammographic examination that together with the automatic parameter determination method for microcalcification detection produced a significant reduction of 86% of that rate in relation to the procedure that uses fixed parameter.

Orientador: Macelo Zanchetta do Nascimento. / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Engenharia da Informação, 2009.

Os nódulos de tireoide são frequentemente encontrados na prática clínica e, com o auxílio de ultrassonografia de alta resolução, podem ser identificados em 17 a 67% da população. A alta prevalência desses nódulos causa preocupação frequente aos pacientes e aos clínicos devido ao risco de malignidade, o que, por sua vez, leva a investigações laboratoriais de alto custo, invasivas e, eventualmente, a cirurgias desnecessárias. A punção aspirativa com agulha fina (PAAF) é o método diagnóstico pré-operatório mais preciso para identificação de um nódulo maligno de tireoide, mas não consegue excluir malignidade nos casos de citologia inadequada, nódulos com diagnóstico citológico de lesão folicular ou atipia de significado indeterminado e nas citologias sugestivas de neoplasia folicular. O objetivo deste estudo foi analisar as características clínicas, laboratoriais, ultrassonográficas e citológicas de uma população de pacientes com nódulos de tireoide submetidos a tireoidectomia e a relação entre estes achados e o risco de malignidade. Além disto, em relação aos nódulos malignos, verificar se o valor de TSH esteve associado a um estadiamento mais avançado da doença. Foram avaliados prontuários de 353 pacientes submetidos a tireoidectomia, acompanhados no Hospital das Clínicas da FMUSP de São Paulo, no período de fevereiro de 2002 a abril de 2010. O número total de nódulos nestes pacientes foi 392. As características clínicas e laboratoriais analisadas em cada paciente foram idade, sexo, valores séricos de TSH e T4 livre, presença de anticorpo anti-tireoperoxidase (anti- TPO) e anti-tireoglobulina (anti-TG). Foram avaliadas a presença de características ultrassonográficas sugestivas de benignidade (presença de halo periférico hipoecoico, aparência espongiforme, aspecto isoecóico ou hiperecoico) e de malignidade (nódulo sólido hipoecoico, contornos irregulares, presença de microcalcificações). Baseados nestas características, os nódulos foram classificados em benignos, indeterminados e suspeitos para malignidade. O diagnóstico citológico foi classificado em benigno, indeterminado, suspeito e maligno, e a análise combinada das características ultrassonográficas e citológicas também foi avaliada. Ao exame histopatológico, 200 nódulos eram malignos e 192 nódulos eram benignos. Os nossos resultados mostraram que sexo, idade, valores séricos de TSH e T4 livre e presença de anticorpo anti-TPO e anti-TG não estiveram associados a uma maior chance de malignidade. O valor de TSH sérico também não esteve associado a maior risco de recorrência ou estadiamento mais avançado nos pacientes com câncer Os nódulos maiores estiveram mais associados a benignidade quando avaliamos toda amostra. Na análise multivariada de toda amostra, após regressão logística, apenas a citologia maligna, hipoecogenicidade e presença de microcalcificações foram associados a malignidade. Já, a classificação ultrassonográfica que não se baseia em apenas uma característica mas em um conjunto de características, apresentou um alto valor preditivo de benignidade e foi útil na identificação de nódulos com citologia indeterminada. A classificação ultrassonográfica tem o potencial de reduzir o número de cirurgias para nódulos com citologia indeterminada / Thyroid nodules are often encountered in clinical practice, and with the use of high-resolution ultrasound may be identified in 17 to 67% of the population. The high prevalence of these nodules cause frequent concern to patients and clinicians due to the risk of malignancy, wich in turn leads on costly investigations, use of invasive diagnostic methods and sometimes unnecessary surgeries. Fine needle aspiration biopsy (FNAB) is the most accurate preoperative diagnostic method to identify a malignant thyroid nodule. However, FNAB cannot rule out malignancy in cases of inadequate cytology, follicular lesions, atypia of undetermined significance, and in cytology suggestive of follicular neoplasm. The aim of this study was to analyze clinical, laboratory, ultrasound and cytopathologic characteristics of a group of patients with thyroid nodules undergoing thyroidectomy and the relationship between serum levels of TSH and the risk of malignancy. In nodules found to be malignant in this cohort, we analyzed the association of TSH levels with advanced disease stage and risk of recurrence. We analyzed the records of 353 patients who were followed at Hospital das Clínicas - São Paulo Medical School, between February 2002 and April 2010, and who subsequently underwent thyroidectomy. The total number of nodules in these patients was 392. The clinical and laboratory characteristics included in the analysis were age, gender, serum levels of TSH and free T4, and presence of serum thyroid anti-peroxidase (anti-TPO) and anti-thyroglobulin (anti-TG) antibodies. We evaluated the presence of ultrasonographic features suggestive of benignity (isoechoic or hyperechoic appearance, presence of hypoechoic peripheral halo, spongiform appearance) and malignancy (hypoechoic appearance, irregular border, presence of microcalcifications). Based on these ultrasonographic characteristics, we classified the nodules as benign, indeterminate or suspicious for malignancy. According to the FNAB cytology, we also subdivided the nodules into benign, indeterminate, suspicious and malignant. The combined analysis of ultrasonographic features and cytopathology was also evaluated. On histopathology, 200 nodules were malignant and 192 were benign. Our results showed that gender, age, serum levels of TSH and free T4, as well as the presence of anti-TPO and anti-TG were not associated with increased risk of malignancy. Similarly, serum TSH value was not associated with increased risk of recurrence or more advanced stage in patients with thyroid cancer. A large nodule size was associated with benignity. In multivariate analysis, after logistic regression, only malignant cytology, hypoechoic appearance and presence of microcalcifications were associated with malignancy. Furthermore, the ultrasonographic classification, wich was not based in only one feature but in a set of characteristics, showed a high predictive value for benignity and seems to be useful in identifying nodules with indeterminate cytology at risk for malignancy. The use of ultrassonographic classification has the potential to reduce the number of surgeries for nodules with indeterminate cytology

Os nódulos de tireoide são frequentemente encontrados na prática clínica e, com o auxílio de ultrassonografia de alta resolução, podem ser identificados em 17 a 67% da população. A alta prevalência desses nódulos causa preocupação frequente aos pacientes e aos clínicos devido ao risco de malignidade, o que, por sua vez, leva a investigações laboratoriais de alto custo, invasivas e, eventualmente, a cirurgias desnecessárias. A punção aspirativa com agulha fina (PAAF) é o método diagnóstico pré-operatório mais preciso para identificação de um nódulo maligno de tireoide, mas não consegue excluir malignidade nos casos de citologia inadequada, nódulos com diagnóstico citológico de lesão folicular ou atipia de significado indeterminado e nas citologias sugestivas de neoplasia folicular. O objetivo deste estudo foi analisar as características clínicas, laboratoriais, ultrassonográficas e citológicas de uma população de pacientes com nódulos de tireoide submetidos a tireoidectomia e a relação entre estes achados e o risco de malignidade. Além disto, em relação aos nódulos malignos, verificar se o valor de TSH esteve associado a um estadiamento mais avançado da doença. Foram avaliados prontuários de 353 pacientes submetidos a tireoidectomia, acompanhados no Hospital das Clínicas da FMUSP de São Paulo, no período de fevereiro de 2002 a abril de 2010. O número total de nódulos nestes pacientes foi 392. As características clínicas e laboratoriais analisadas em cada paciente foram idade, sexo, valores séricos de TSH e T4 livre, presença de anticorpo anti-tireoperoxidase (anti- TPO) e anti-tireoglobulina (anti-TG). Foram avaliadas a presença de características ultrassonográficas sugestivas de benignidade (presença de halo periférico hipoecoico, aparência espongiforme, aspecto isoecóico ou hiperecoico) e de malignidade (nódulo sólido hipoecoico, contornos irregulares, presença de microcalcificações). Baseados nestas características, os nódulos foram classificados em benignos, indeterminados e suspeitos para malignidade. O diagnóstico citológico foi classificado em benigno, indeterminado, suspeito e maligno, e a análise combinada das características ultrassonográficas e citológicas também foi avaliada. Ao exame histopatológico, 200 nódulos eram malignos e 192 nódulos eram benignos. Os nossos resultados mostraram que sexo, idade, valores séricos de TSH e T4 livre e presença de anticorpo anti-TPO e anti-TG não estiveram associados a uma maior chance de malignidade. O valor de TSH sérico também não esteve associado a maior risco de recorrência ou estadiamento mais avançado nos pacientes com câncer Os nódulos maiores estiveram mais associados a benignidade quando avaliamos toda amostra. Na análise multivariada de toda amostra, após regressão logística, apenas a citologia maligna, hipoecogenicidade e presença de microcalcificações foram associados a malignidade. Já, a classificação ultrassonográfica que não se baseia em apenas uma característica mas em um conjunto de características, apresentou um alto valor preditivo de benignidade e foi útil na identificação de nódulos com citologia indeterminada. A classificação ultrassonográfica tem o potencial de reduzir o número de cirurgias para nódulos com citologia indeterminada / Thyroid nodules are often encountered in clinical practice, and with the use of high-resolution ultrasound may be identified in 17 to 67% of the population. The high prevalence of these nodules cause frequent concern to patients and clinicians due to the risk of malignancy, wich in turn leads on costly investigations, use of invasive diagnostic methods and sometimes unnecessary surgeries. Fine needle aspiration biopsy (FNAB) is the most accurate preoperative diagnostic method to identify a malignant thyroid nodule. However, FNAB cannot rule out malignancy in cases of inadequate cytology, follicular lesions, atypia of undetermined significance, and in cytology suggestive of follicular neoplasm. The aim of this study was to analyze clinical, laboratory, ultrasound and cytopathologic characteristics of a group of patients with thyroid nodules undergoing thyroidectomy and the relationship between serum levels of TSH and the risk of malignancy. In nodules found to be malignant in this cohort, we analyzed the association of TSH levels with advanced disease stage and risk of recurrence. We analyzed the records of 353 patients who were followed at Hospital das Clínicas - São Paulo Medical School, between February 2002 and April 2010, and who subsequently underwent thyroidectomy. The total number of nodules in these patients was 392. The clinical and laboratory characteristics included in the analysis were age, gender, serum levels of TSH and free T4, and presence of serum thyroid anti-peroxidase (anti-TPO) and anti-thyroglobulin (anti-TG) antibodies. We evaluated the presence of ultrasonographic features suggestive of benignity (isoechoic or hyperechoic appearance, presence of hypoechoic peripheral halo, spongiform appearance) and malignancy (hypoechoic appearance, irregular border, presence of microcalcifications). Based on these ultrasonographic characteristics, we classified the nodules as benign, indeterminate or suspicious for malignancy. According to the FNAB cytology, we also subdivided the nodules into benign, indeterminate, suspicious and malignant. The combined analysis of ultrasonographic features and cytopathology was also evaluated. On histopathology, 200 nodules were malignant and 192 were benign. Our results showed that gender, age, serum levels of TSH and free T4, as well as the presence of anti-TPO and anti-TG were not associated with increased risk of malignancy. Similarly, serum TSH value was not associated with increased risk of recurrence or more advanced stage in patients with thyroid cancer. A large nodule size was associated with benignity. In multivariate analysis, after logistic regression, only malignant cytology, hypoechoic appearance and presence of microcalcifications were associated with malignancy. Furthermore, the ultrasonographic classification, wich was not based in only one feature but in a set of characteristics, showed a high predictive value for benignity and seems to be useful in identifying nodules with indeterminate cytology at risk for malignancy. The use of ultrassonographic classification has the potential to reduce the number of surgeries for nodules with indeterminate cytology

O presente trabalho consiste na investigação das características da imagem mamográfica digitalizada para definir automaticamente parâmetros de processamento em um esquema de diagnóstico auxiliado por computador (CAD) para mamografia, com o objetivo de se obter o melhor desempenho possível. Além disso, com base na aplicação dos resultados dessa primeira investigação, propõe-se também uma técnica de redução dos índices de falso-positivo em esquemas CAD visando à redução do número de biópsias desnecessárias. Para a definição automática dos parâmetros de processamento nas técnicas de detecção de microcalcificações e nódulos, foram extraídas algumas características das imagens, como desvio padrão, terceiro momento e o limiar de binarização. Utilizando o método de automatização proposto, observou-se um aumento de 20% no desempenho do esquema CAD (Az da curva ROC) em relação ao método não automatizado com parâmetro fixo. Para que fosse possível o processamento da imagem mamográfica inteira pelo esquema CAD e as técnicas desenvolvidas, foi desenvolvida também uma técnica para seleção automática de regiões de interesses, que recorta partes relevantes da mama para a segmentação. O índice de falsos positivos foi tratado por técnica específica desenvolvida com base na comparação das duas incidências típicas do exame mamográfico que, juntamente com a avaliação automática da imagem no pré-processamento para detecção de microcalcificações produziu uma redução significativa de 86% daquela taxa em relação ao procedimento de parâmetro fixo. / This present work consists on the investigation of mammographic image characteristics for automatic determination of image processing parameters for a mammography computer aided diagnosis scheme (CAD) in order to get optimal performance. Additionally, using the results obtained on this first investigation, it was also developed a new technique for the reduction of false-positive rates on CAD projects, which can result on the reduction of the number of unnecessary biopsies. For the automatic definition of the image processing parameters for the techniques of detection of microcalcifications and nodules, some image characteristics had been extracted, as standard deviation, third momentum and the thresholding value. Using the proposed automatization method it was reported an increase of 20% in the CAD performance (evaluated determining the ROC curve) in comparison to the non-automatic method (fixed parameter). Besides, for CAD schemes it is necessary to process the entire mammographic image. Thus, it was also developed a technique for automatic selection of regions of interests in the mammogram, which extracts better regions from breast image for further segmentation. False-positives rates was treated by a specific technique based on the comparison of the two typical incidences of mammographic examination that together with the automatic parameter determination method for microcalcification detection produced a significant reduction of 86% of that rate in relation to the procedure that uses fixed parameter.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-11-17T20:09:17Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Michel de Paula Andraus - 2014.pdf: 1344502 bytes, checksum: b7ad8a869c8c9927345fb69bceb34d58 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-11-17T20:20:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Michel de Paula Andraus - 2014.pdf: 1344502 bytes, checksum: b7ad8a869c8c9927345fb69bceb34d58 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-17T20:20:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Michel de Paula Andraus - 2014.pdf: 1344502 bytes, checksum: b7ad8a869c8c9927345fb69bceb34d58 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Compared to other producing grain legumes, the common bean has short cycle, with high demand for nitrogen (N), which is the most mined and exported element by crops. N is a scarce element in tropical soils and the main sources, nitrate and ammonia, which may be available to the plant, are obtained from the decomposition of soil organic matter, mineral fertilization with nitrogen fertilizers and biological nitrogen fixation (BNF) held by pulses nodulating bacteria. This study aimed to identify characteristics related to FBN in common bean cultivars with different growth cycles, which reflect in higher productivity. The experiments were conducted under field conditions for two consecutive years (2012 and 2013) in the winter crop, in the experimental area of Embrapa Rice and Beans, in Santo Antônio de Goiás, Goiás. In both experiments installed in nearby areas were used as treatments 22 cultivars of common bean, two of the early growth cycle, eight semi-early growth cycle, ten normal cycle and two late- cycle treated with inoculant prepared in the Laboratory of Soil Microbiology, Embrapa Rice and Beans, compound by strains of Rhizobium tropici (SEMIA 4077, SEMIA 4080 and SEMIA 4088) recommended by the Ministry of Agriculture, Livestock and Food Supply as inoculants for the common bean cultivation. The design was randomized blocks . In the first year the collections were performed from V4 to R8 stage and were assessed at each stage the number, activity and dry weight of nodules, leaf area, dry weight and total nitrogen of aerial part (the R6 stage only), grain yield and its components (R9 stage) . In the second experiment the same evaluations were made, but only in R6 and R7 stages. Data were subjected to analysis of variance and the means compared by Skott-Knott test at 5% probability, graphs of Pearson correlation between variables were developed. The percentage of active nodules, leaf area, aerial part dry mass and total nitrogen were affected by cultivars. The number of nodules and dry weight of nodules were not affected. In stages of flowering and pod yield, nodule number, leaf area and dry weight of shoots were influenced by cultivars. The dry mass of nodules in flowering stage was influenced by the growth cycles and the regular and late cycles showed higher values. Grain yield was affected by cycles of cultivars and in the first experiment, early cultivars showed lower values than the other. Normal and late cycle cultivars arrived to total senescence of nodules on the phenological stage R7, while the early and semi-early cycles arrived to senescence of nodules in the R8 phase, however, there was minimal difference in days without active nodules between these. / Comparado a outras leguminosas produtoras de grãos, o feijoeiro-comum apresenta ciclo curto, com alta demanda pelo nitrogênio (N), sendo este o elemento mais extraído e exportado pela cultura. O N é um elemento escasso nos solos tropicais e as principais fontes, nítrica e amoniacal, as quais podem estar disponíveis à planta, são obtidas a partir da decomposição da matéria orgânica do solo, da adubação mineral com fertilizantes nitrogenados e da fixação biológica do nitrogênio (FBN), realizada por bactérias nodulíferas de leguminosas. O objetivo deste trabalho foi avaliar características relacionadas à FBN em cultivares de feijoeiro-comum com diferentes ciclos de crescimento, que refletem em maior produtividade. Os experimentos foram conduzidos sob condição de campo, por dois anos consecutivos (2012 e 2013), em safra de inverno, na área experimental da Embrapa Arroz e Feijão, em Santo Antônio de Goiás, Goiás. Nos dois experimentos instalados em áreas próximas foram utilizadas como tratamentos 22 cultivares de feijoeiro-comum, sendo duas de ciclo de crescimento precoce, oito de ciclo semi-precoce, dez de ciclo normal e duas de ciclo tardio tratadas com inoculante preparado no Laboratório de Microbiologia do Solo da Embrapa Arroz e Feijão, composto pelas estirpes de Rhizobium tropici (SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088) recomendadas pelo Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento como inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro-comum. O delineamento foi em blocos casualizados. No primeiro ano as coletas foram realizadas da fase V4 até R8, e foram avaliados em cada fase o número, atividade e massa seca de nódulos; área foliar; massa seca e Nitrogênio total da parte aérea (somente na fase R6), e rendimento de grãos e seus componentes (fase R9). No segundo experimento foram feitas as mesmas avaliações, porém somente nas fases R6 e R7. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Skott-Knott a 5% de probabilidade, e foram elaborados gráficos de correlação de Pearson entre as variáveis. O percentual de nódulos ativos, área foliar, massa seca da parte aérea e Nitrogênio total foram afetados pelas cultivares. Já o número de nódulos e massa seca de nódulos não foram influenciados. Nas fases de florescimento e produção de vagens, o número de nódulos, área foliar e massa seca da parte aérea tiveram influência das cultivares. A massa seca de nódulos da fase de florescimento foi influenciada pelos ciclos de crescimento e os ciclos normal e tardio apresentaram maiores valores. A produção de grãos foi afetada pelos ciclos das cultivares e, no primeiro experimento, as cultivares precoces apresentaram menores valores do que as demais. Cultivares de ciclo normal e tardio chegaram à senescência total de nódulos na fase fenológica R7, enquanto as de ciclo precoce e semi-precoce atingiram a senescência dos nódulos na fase R8, contudo, houve uma diferença mínima de dias sem nódulos ativos entre estas.

Made available in DSpace on 2016-08-17T14:53:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao Alex Martins Santos.pdf: 5806595 bytes, checksum: 431584590b26aa21a56d684cd9c7f282 (MD5) Previous issue date: 2011-08-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Lung cancer stands out by pointing the highest incidence and higher mortality rate of all other types of cancer. It has one of the lower survival rates of after diagnosis, which is mainly due to late detection and therefore delayed treatment. Computer-aided detection systems (CAD) are developed to assist the specialist in the search and identification of nodules and changes in CT. These systems respectively aim to automate the identification and classification of these structures. This work aims to study and develop a methodology for automatic detection of small lung nodules (bigger than 2 mm and smaller than 10 mm in diameter). The proposed methodology is based on techniques of image processing and pattern recognition. Similar applications use widely some of these techniques. The proposed methodology also uses other techniques from different areas and applications, such as measures of the Tsallis and Shannon entropy used in this study to describe suspected structures. These measures are respectively provided from statistical mechanics and information theory, however lately they have been successfully applied in image processing. It was also used the Gaussian mixture model (GMM) and the Hessian matrix calculation to separate the internal structures of the remaining lung parenchyma. Promising results were found in tests with 140 exams divided in of 80% for training and 20% for testing. It was achieved a 79% of sensitivity rate and a total of 1.17 false positives per slice. / Dentre os outros tipos de câncer, o câncer de pulmão se destaca por apresentar a maior incidência e a maior taxa de mortalidade de todos, além de uma das menores taxas de sobrevida após o diagnóstico (cinco anos em média), fato este decorrido principalmente pela detecção e, conseqüentemente, tratamento tardio. Para auxiliar o especialista na busca e identificação de nódulos e alterações em imagens tomográficas são desenvolvidos sistemas de detecção auxiliados por computador (CAD) que visam automatizar os trabalhos de identificação e classificação de dessas estruturas. O presente trabalho tem por objetivo o estudo e desenvolvimento de uma metodologia para detecção automática de nódulos pulmonares pequenos (maiores que dois milímetros e menores que 10 milímetros de diâmetro). A metodologia proposta se baseia em técnicas de processamento de imagens e reconhecimento de padrões. Algumas dessas técnicas são amplamente utilizadas em aplicações similares, já outras técnicas utilizadas provêm de outras áreas e aplicações, como é o caso das medidas de entropia de Tsallis e Shannon, utilizados neste trabalho para descrever estruturas suspeitas. Estas medidas provém respectivamente da mecânica estatística e da Teoria da Informação, porém ultimamente tem sido aplicadas com sucesso no processamento de imagens. Também foi empregado o Modelo de Misturas Gaussianas (GMM) e o cálculo da matriz Hessiana para separar as estruturas internas do pulmão do restante do parênquima. Resultados promissores foram encontrados, em teste com 140 exames divididos em 80% para treino e 20% para testes, alcançou-se uma sensibilidade de 79% e um total de 1,17 falsos positivos por fatia.

Made available in DSpace on 2016-08-17T14:53:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joao Rodrigo Ferreira.pdf: 1547613 bytes, checksum: a9c7e73154b7e9a72733f9f2e20a55fe (MD5) Previous issue date: 2007-12-07 / The lung cancer is a disorder with significant prevalence in several countries worldwide. The hard treatment and the fast progress of the disease increase the mortality rates. The main factor contributing to a successful treatment is an early diagnosis. However possible omissions in the scan analysis can lead to late diagnosis, compromising all the treatment. In order to present a computational tool aimed at nodules detection, that can be used as a second opinion to the specialist, this master thesis proposes a methodology for nodules detection that is totally automatic, robust and consistent. The methodology is based on successive refinements for the segmentation of computed tomography images using morphologic techniques to obtain nodule candidates. The false positive reduction is achieved by SVM based on geometric and texture features. The tests, performed with real scans, indicate the feasibility of the proposed method. In automatic detection performed on 33 cases the methodology reached 95.21% of correctness with 0.42 false positives and 0.15 false negative per scan. / O câncer de pulmão é uma enfermidade com prevalência significativa em diversos países no mundo todo. O difícil tratamento e a progressão rápida da doença fazem com que os índices de mortalidade das pessoas acometidas por este mal sejam muito altos. O principal fator contribuinte para um tratamento de sucesso, entretanto, é o diagnóstico precoce. Contudo possíveis omissões na análise dos exames podem levar a um diagnóstico tardio, comprometendo todo o tratamento. Com o intuito de oferecer uma alternativa computacional de auxílio à detecção de nódulos, servindo como uma segunda opinião para o médico, este trabalho propõe uma metodologia totalmente automática, robusta e consistente. A metodologia é fundamentada em refinamentos sucessivos da segmentação sobre imagens de tomografia computadorizada utilizando técnicas morfológicas para a obtenção de candidatos a nódulo. A redução de falsos positivos é efetivada pelo SVM com base em características geométricas e de textura. Os testes realizados com exames reais indicam a viabilidade da solução proposta. Na detecção automática realizada sobre 33 casos a metodologia atingiu 95,21% de acerto com uma média de 0,42 falsos positivos e 0,15 falsos negativos por exame.

As alterações pulpares e periapicais decorrentes de sobrecarga oclusal são problemas que acometem considerável parcela da população. Geralmente causadas por contato prematuro de restaurações com material em excesso, provocam um trauma de baixa intensidade, porém de alta frequência. Objetivo: Avaliar as alterações pulpares e periapicais, induzidas por esta sobrecarga oclusal associada ou não à doença periodontal induzida em dentes de ratas. Método: Foram utilizadas vinte ratas (Wistar) com noventa dias de idade e peso aproximado de 250g divididas em quatro grupos (n=5): GC (controle), GT (trauma), GL (ligadura) e GLT (ligadura e trauma), com sobrecarga oclusal e periodontite induzida restritas aos primeiros molares inferiores, que receberam a ligadura. As superfícies oclusais dos segundos e terceiros molares superiores receberam desgastes, sem que houvesse exposição pulpar e os animais foram observados por um período de quatro semanas. Depois de anestesiados, estes foram decapitados com uma guilhotina e, após a eutanásia, as hemi-mandíbulas foram enviadas para a análise histológica do tecido pulpar e periapical, com coloração por hematoxicilina-eosina, para avaliação da presença de nódulos pulpares, lacunas de reabsorção e células inflamatórias, além de submetidos à análise histoquímica pela Fosfatase Ácida Tartarato Resistente (TRAP) para avaliação da presença de células clásticas e pré-clásticas. Resultados: Histologicamente, os dentes submetidos à ligadura apresentaram presença moderada de fibras e vasos, enquanto os submetidos ao trauma e ao conjunto trauma-ligadura apresentaram grande aumento de vasos e fibras além de infiltrado neutrofílico e, por vezes, nódulos. Histoquimicamente, notou-se certa normalidade no GC, uma irregularidade na região cervical externa no GL e maior presença de lacunas dentinárias e células multinucleadas no GT e GLT. Conclusão: A sobrecarga oclusal provoca alterações pulpares e periapicais assim como a doença periodontal induzida. Mas a associação da doença periodontal e da sobrecarga é mais lesiva aos tecidos pulpares e radiculares. / Pulp and periapical changes resulting from occlusal overload are problems that affect a considerable portion of the population. Generally caused by premature contact of restorations with material in excess, cause a trauma of low intensity, however high frequency. Objective: To evaluate the changes of pulpal and periapical induced by this overload occlusal associated or not to the induced periodontal disease in teeth of rats. Method: Used twenty rats (Wistar) with ninety days old and weighing approximately 250g divided into four groups (n = 5): GC (control), GT (overload), GL (ligature) and GLT (ligature and overload) with occlusal overload and induced periodontitis restricted to lower first molars, which received the ligature. The occlusal surfaces of upper second and third molars were worn away, with no pulp exposure and the animals were observed for a period of four weeks. Once anesthetized, they were beheaded with a guillotine and, after euthanasia, the hemi-mandibles were sent for histological analysis of pulp and periapical with hematoxylin-eosin staining for evaluation of nodules pulp, resorption gaps and inflammatory cells, and analyzed by immunohistochemistry Tartrate Resistant Acid Phosphatase (TRAP) for assessing the presence of clastic cells and pre-clastic. Results: Histologically, the teeth underwent to ligature showed the presence of fibers and vessels, while the other submitted to overload and overload-ligature group showed a large increase in vessels and fibers as well as neutrophil infiltration and sometimes nodules. Histochemically, it was noted some degree of normality in the GC, an irregularity in the external cervical region in the GL and greater presence of dentinal gaps and multinucleated cells in the GT and GLT. Conclusion: The occlusal overload causes changes pulp and periapical as well as induced periodontal disease. But the association between periodontal disease and the overload occusal is more damage to pulp and root tissues.