Comprendre les processus par lesquels les activités humaines influent sur la diversité écologique, à des échelles spatiales et temporelles diverses, est une priorité en biologie de la conservation. La niche écologique constitue à cette fin une interface conceptuelle pertinente. Ma thèse traite de l'influence de la structure et des variations de cette interface, et de leur propension à affecter notre interprétation des conséquences des modifications des paysages, des habitats et du climat sur les communautés biotiques. A partir du modèle de l'avifaune commune, pour lequel de vastes bases de données permettent une quantification de la niche multivariée et multi-échelle, je développe un argumentaire en trois volets. Le premier propose qu'au-delà de la multiplicité des axes de la niche, leurs relations et leurs structures permettent d'inférer des processus qui conduisent à la ségrégation des espèces communes le long de gradients d'habitats. Deuxièmement, croiser la niche climatique et la niche d'habitat révèle des interactions entre des sources de vulnérabilité qui semblent de prime abord opérer à des échelles différentes. Enfin, la largeur de la niche d'habitat est non seulement une cause, mais aussi une conséquence de la réponse des espèces aux variations de leur environnement. J'explore les conséquences de ces trois résultats principaux sur notre compréhension des processus qui sous-tendent la diversité taxonomique et fonctionnelle des communautés. Je propose en conclusion de dépasser la vision classique de la niche comme un ensemble de filtres aux effets spatialement et temporellement hiérarchisés, pour prendre explicitement en compte les interactions entre ces filtres et leurs variations dans l'explication et la prédiction des effets écologiques des changements globaux. / Deciphering the processes by which human activities influence the diversity of ecological systems, at various temporal and spatial scales, is at the foreground of research in conservation biology. The ecological niche appears in that respect as a relevant conceptual interface. My work addresses the implications of the structure and variations of this interface for our interpretation of the consequences of changes in landscapes, habitats and climatic conditions on biotic communities. I examine this issue through the model of European common birds, for which large-scale data bases allow quantifying the niche in a multivariate and multiscale way. My reasoning holds with three main results. First, beyond the multiplicity of niche axes, exploring their relations and structures allow inferences on the processes that drive the segregation of species along environmental gradients. Second, crossing habitat and climatic niches reveal interactions between sources of vulnerability which seem at a first glance to operate at distinct scales. Last, the breadth of the habitat niche is not only a cause, but also a consequence of species' responses to environmental variations. I explore the consequences of these three major results on our understanding of processes that sustain the taxonomic and functional diversity of biotic communities. I suggest that, beyond the traditional view of the niche as a network of nested filters, accounting explicitly for interactions between these filters and their variations would sensibly improve our ability to explain and predict the ecological effects of global changes.

L'idée d'une nécessité de conservation de la nature littorale marine a émergé suite à la prise de conscience de sa vulnérabilité. Face au contexte actuel d'érosion de la biodiversité, ce sont les éléments riches, rares ou vulné-rables qui ont prioritairement bénéficié de mesures conservatoires. Mais ne s'agit-il pas d'une lutte contre la partie émergée de l'iceberg de la crise de la biodiversité ? Les habitats littoraux ordinaires, ne méritent t-ils pas, eux aussi, d'être conservés ? Pour répondre à cette question, les besoins de conservation des habitats intertidaux meubles de l'archipel de Chausey (Golfe Normand-Breton) ont été explorés. La mise en lumière de 180 années de témoignages naturalistes, formidable état de référence du patrimoine naturel du site et de sa perception, et le développement et l'application d'une nouvelle méthode permettant de cartographier, suivre et décrire précisé-ment chaque habitat, révèlent le caractère extraordinairement complexe et fragmenté de cet archipel qui rassem-ble presque tous les habitats intertidaux meubles de l'Europe du nord-ouest. Parmi ceux-ci, très peu bénéficient de mesures conservatoires. Pourtant, à travers l'exemple des banquettes à Lanice conchilega, nous soulignons l'importance des besoins de conservation d'un habitat ordinaire, a priori non vulnérable et presque impossible à conserver à large échelle tant il est répandu. A Chausey, cet habitat représente en effet un enjeu de conservation important, tant d'un point de vue socio-économique que biologique et il est en outre menacé par le développe-ment de la conchyliculture qui a des impacts négatifs sur son peuplement macrofaunique et son attractivité pour les limicoles. Les besoins conservatoires de chacun des habitats ont ensuite été évalués au travers d'enjeux (ce qui est susceptible d'être affecté si l'habitat disparaît), d'aléas (probabilité de disparition) et de possibilités de conservation, par une approche pluridisciplinaire alliant des méthodes issues de l'écologie, de la géographie mais aussi de l'histoire. La combinaison de ces critères fait apparaître une multiplicité de besoins de conservation généralisable à de nombreux habitats des littoraux tempérés.

Comprendre les processus par lesquels les activités humaines influent sur la diversité écologique, à des échelles spatiales et temporelles diverses, est une priorité en biologie de la conservation. La niche écologique constitue à cette fin une interface conceptuelle pertinente. Ma thèse traite de l'influence de la structure et des variations de cette interface, et de leur propension à affecter notre interprétation des conséquences des modifications des paysages, des habitats et du climat sur les communautés biotiques. A partir du modèle de l'avifaune commune, pour lequel de vastes bases de données permettent une quantification de la niche multivariée et multi-échelle, je développe un argumentaire en trois volets. Le premier propose qu'au-delà de la multiplicité des axes de la niche, leurs relations et leurs structures permettent d'inférer des processus qui conduisent à la ségrégation des espèces communes le long de gradients d'habitats. Deuxièmement, croiser la niche climatique et la niche d'habitat révèle des interactions entre des sources de vulnérabilité qui semblent de prime abord opérer à des échelles différentes. Enfin, la largeur de la niche d'habitat est non seulement une cause, mais aussi une conséquence de la réponse des espèces aux variations de leur environnement. J'explore les conséquences de ces trois résultats principaux sur notre compréhension des processus qui sous-tendent la diversité taxonomique et fonctionnelle des communautés. Je propose en conclusion de dépasser la vision classique de la niche comme un ensemble de filtres aux effets spatialement et temporellement hiérarchisés, pour prendre explicitement en compte les interactions entre ces filtres et leurs variations dans l'explication et la prédiction des effets écologiques des changements globaux.

Depuis les années 1970, les philosophies environnementales se sont essentiellement préoccupées de la question de la valeur morale de la nature rare et remarquable qui subsiste dans quelques régions de la planète. Héritant de la pensée américaine de la wilderness, les philosophes de l'environnement se sont efforcés de donner des fondations théoriques à la valeur intrinsèque d'une nature, dont l'homme se devait d'être absent. Ce faisant, Ils laissaient à penser que sur les terres habitées ou transformées par les hommes, qui couvrent la quasi-totalité de la surface de la planète, il fallait renoncer à penser la nature. A rebours de cette idée, nous soutenons qu'il y a de la nature dans les sociétés humaines, que nous faisons société avec la nature En suivant cette hypothèse, nous ferons apparaître, il partir d'un matériau descriptif varié, que nos activités productives et reproductives engagent, en effet, de nombreux acteurs naturels, mais aussi que, très souvent, nous nous conduisons mal avec ces derniers. C'est ce qui nous semble motiver l'élaboration d'une éthique de la nature ordinaire. / Since the 1970s, environmental philosophy has been mainly concerned with the intrinsic value of nature and with the preservation of some rare and remarkable forms of nature which stand in remote areas, Influenced by the American classical idea of wilderness, which excludes humans from nature, environmental philosophers worked to elaborate intrinsic value theories of nature. By doing so, they suggested that nature had disappeared from the hum an inhabited world, i.e. from almost the whole Earth. Against this idea, I argue for nature being part of our societies. Humans and nature share a living mutual interdependence. Following this hypothesis, we will see how natural beings could be considered partners in most of our productive and reproductive activities, while we often act wrongly with these natural members of our communities. That's why there is a need for an ethics of everyday nature.

L'outil « Trame Verte et Bleue », alliant biodiversité et aménagement du territoire, a aujourd’hui pleinement intégré la planification territoriale, sur les territoires national et ultramarin. Néanmoins, dans les DOM, la mise en place de cet outil s'est confrontée à de toutes autres réalités. C'est pourquoi ce projet doctoral a choisi d'étudier l’exemple de La Réunion, précurseur dans la transcription de cette politique d’aménagement. Depuis 2014, La Réunion possède des cartographies des réseaux écologiques régionaux, établies pour accompagner les acteurs locaux. Pour autant, seuls les espaces naturels protégés ont été considérés dans les projets de territoire, laissant ainsi pour compte les espaces de nature ordinaire. Pour comprendre ce manque d'adhésion, un travail de type sociologique a été mené pour cerner les réalités politiques et sociales inhérentes à la TVB. Si pour les professionnels de l'aménagement la planification de secteurs à enjeux pour préserver la biodiversité tombe sous le sens, pour les institutions cet outil est perçu comme un moyen de promouvoir le développement de l'île. Pour les autres usagers, la TVB reste un concept ignoré. Cependant, pour eux, la biodiversité est étroitement liée au paysage quotidien et ils la perçoivent principalement par les services écosystémiques. La traduction cartographique de ces résultats a permis d'identifier d'une part des secteurs d'intérêts écologiques porteurs d'une demande sociale collective, d'autre part des secteurs exclus de cette demande qui peuvent subir des dégradations. Ainsi, pour maintenir un bon fonctionnement des réseaux écologiques, il est aujourd'hui nécessaire d'agir sur les perceptions paysagères. / Today the green and blue belt network is a tool, which combines biodiversity and regional development policy and fully integrates territorial planning in national and overseas territories. Nevertheless, the implementation of this tool is confronted with other realities in the French overseas departments. That is the reason why this doctoral project aims to study the case of Reunion island as a forerunner in the transcribing of this spatial planning.Reunion island possesses mapping of regional ecological networks drawn up to accompany the local actors since 2014. However, only protected natural areas had been taken into account in regional projects while leaving behind ordinary nature areas. In order to understand this lack of acceptance, a sociological work was conducted to identify the political and social realities related to the green and blue belt network. If planning issue area to preserve the biodiversity is obvious for planning professionals, this tool is seen as a way to promote the development of the island for institutions. For the other users, the green and blue belt network keeps being pushed aside. However, to them biodiversity is closely tied to the daily lansdscape and they mainly perceive it through ecosystem services.A mapping plan of these results allowed to identify on the one hand areas of ecological interest holding a common social demand, and on the other hand areas excluded from this demand, which may undergo degradation. Therefore, it is now necessary to work on landscape perceptions so that ecological networks can remain functional.