Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3847.pdf: 8121609 bytes, checksum: d085371b9ccbfe0c2017a1ee27231b28 (MD5) Previous issue date: 2011-09-02 / Financiadora de Estudos e Projetos / Conventional and molecular cytogenetic analysis were performed on 15 species of the subfamily Hypostominae, comprising 12 species of the Hypostomini tribe, genus Hypostomus, and three of the Ancistrini tribe, genera Ancistrus and Hemiancistrus. The chromosome number of 2n=52 was observed for Ancistrus multispinis (14m+14sm+24st-a), A. brevipinnis (14m+14sm+24st-a) and Hemiancistrus punctulatus (14m+26sm+12st-a). The nucleolar organizer regions (Ag-NORs) and 18S rDNA sites are simple and terminal for species, A. brevipinnis, A. multispinis and H. punctulatus. In these species, it can be seen that the NORs are also CMA3+/DAPI-. As for the heterochromatin, H. punctulatus showed a small amount of this chromosome component, while A. multispinis and A. brevipinnis showed a larger amount, with large blocks on the long arm of some st-a pairs. In turn, the different species of Hypostomus showed a variation from 64 to 82 chromosomes, exhibiting differences in the karyotype formula between species. The NORs were multiple for most species analyzed, with different phenotypes observed in the number and position, which was also confirmed by FISH analysis, showing an interindividual and interspecific variability. In all species, the NORs were also CMA3+/DAPI _. The heterochromatin pattern distribution was different in each species, being another important chromosome marker. Cytogenetic, molecular, and morphometry analysis were performed in the species Hypostomus albopunctatus (Piracicaba river, SP) and H. heraldoi (Pirapitinga river, GO), including those morphologically similar samples present in the Mogi Guaçu river (SP). All individuals had 2n=74, whereas H. albopunctatus showed 10m+20sm+44st-a and H. heraldoi 8m+20sm+46st-a. These two karyotype formulae were found in the Mogi Guaçu river population. Distinct Ag-NOR phenotypes were observed among the three populations and confirmed by FISH. Regarding the heterochromatin pattern, H. albopunctatus presented terminal bands and an interstitial block. In H. heraldoi, the heterochromatin was found widely distributed in the terminal and interstitial regions of some st-a chromosomes. In these species, the NORs were also CMA3+/DAPI _. RAPD analysis and sequencing of the cytochrome oxidase subunit I (COI) gene were carried out in these two species, in the Mogi Guaçu population and in three more species, H. regani, H. margaritifer, and H. hermanni, obtaining the same dendrogram pattern. All species could be differentiated by their COI sequences, resulting in a total of 16 haplotypes. These analyses, combined with the morphometric data, showed that H. heraldoi and H. albopunctatus are two valid species and the specimens from the Mogi Guaçu river still retain some characteristics of H. albopunctatus, and were provisionally designated as Hypostomus aff. albopunctatus. Due to the large number of species currently included in the Hypostomus genus, along with both the intra and interspecific variability in morphology and color pattern, there are often problems in the taxonomy of this group, which can be assisted by cytogenetic data. This study provided new chromosomal data for Loricariidae, being a valuable cytotaxonomic tool for the Hypostomini tribe. The joint analysis of different characters, such as cytogenetic, molecular, and morphometric, allowed a more precise characterization of different populations of Hypostomus species, helping to clarify their validity as distinct evolutionary units. / Análises citogenéticas convencionais e moleculares foram realizadas em 15 espécies da subfamília Hypostominae, compreendendo 12 espécies da tribo Hypostomini, gênero Hypostomus e três da tribo Ancistrini, gêneros Ancistrus e Hemiancistrus. Foi observado 2n=52 para Ancistrus multispinis (14m+14sm+24st-a), A. brevipinnis (14m+14sm+24st-a) e Hemiancistrus punctulatus (14m+26sm+12st-a). As regiões organizadoras de nucléolos (Ag- RONs) e sítios de DNAr 18S são simples e terminais para as espécies A. brevipinnis, A. multispinis e H. punctulatus. Nestas epécies pode-se constatar que as RONs são também CMA3 +/DAPI-. Quanto à heterocromatina, H. punctulatus apresentou pouca quantidade desse componente cromossômico, enquanto que A. multispinis e A. brevipinnis evidenciaram uma maior quantidade, com grandes blocos no braço longo de alguns pares st-a. Por sua vez, as diferentes espécies de Hypostomus mostraram uma variação de 64 a 82 cromossomos, com diferença na fórmula cariotípica entre as espécies. As RONs foram múltiplas para a maioria das espécies analisadas, sendo observados diferentes fenótipos quanto ao número e posição, o que foi também confirmado pela análise de FISH, evidenciando uma variabilidade interindividual e interespecífica. Em todas as espécies as RONs mostraram-se também CMA3 +/DAPI _. O padrão de distribuição da heterocromatina foi diferente em cada espécie, sendo outro importante marcador cromossômico. Análises citogenéticas, moleculares e de morfometria foram realizadas nas espécies Hypostomus albopunctatus (rio Piracicaba, SP) e H. heraldoi (rio Pirapitinga, GO), assim como em exemplares morfologicamente semelhantes presentes no rio Mogi Guaçu (SP). Todos os indivíduos apresentaram 2n=74, sendo que, H. albopunctatus apresentou 10m+20sm+44st-a e H. heraldoi 8m+20sm+46st-a. As duas fórmulas cariotípicas foram encontradas na população do rio Mogi Guaçu. Fenótipos distintos de Ag-RONs foram observados entre as três populações, confirmadas pela FISH. Quanto ao padrão heterocromático, H. albopunctatus apresentou bandas terminais e um bloco intersticial. Em H. heraldoi, a heterocromatina encontrou-se mais amplamente distribuída, nas regiões terminais e intersticiais de alguns cromossomos st-a. Nessas espécies as RONs mostraram-se também CMA3 +/DAPI _. Análises de RAPD e sequenciamento do gene de Citocromo Oxidase subunidade I (COI) foram realizadas nessas duas espécies, na população do rio Mogi Guacu e em mais três espécies, H. regani, H. margaritifer e H. hermanni, obtendo-se o mesmo padrão de dendrograma. Todas as espécies puderam ser diferenciadas por suas sequências COI, resultando num total de 16 haplótipos. Estas análises, aliadas aos dados de morfometria, evidenciaram que H. heraldoi e H. albopunctatus são duas espécies válidas e que os exemplares do rio Mogi Guaçu ainda conservam algumas características de H. albopunctatus, sendo provisoriamente denominados como Hypostomus aff. albopunctatus. Devido ao elevado número de espécies atualmente incluídas no gênero Hypostomus, juntamente com a variabilidade na morfologia e padrão de coloração tanto intra quanto interespecífica, muitas vezes ocorrem problemas na taxonomia desse grupo, a qual pode ser auxiliada pelos dados citogenéticos. Este estudo forneceu novos dados cromossômicos para os Loricariidae, mostrando-se uma boa ferramenta citotaxonômica para a tribo Hypostomini. A análise conjunta de diferentes caracteres, como citogenéticos, moleculares e morfométricos, possibilitou uma caracterização mais precisa de diferentes populações de espécies de Hypostomus, contribuindo para esclarecer sua validade como unidades evolutivas distintas.

Submitted by LAIS REIA (laisreia@gmail.com) on 2018-04-20T21:29:11Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_final_Lais_Reia.pdf: 4674736 bytes, checksum: 69672dd10107f4fd1f1aff5c70f53999 (MD5) / Rejected by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: problema 1: folha de rosto e folha de aprovação juntas A folha de aprovação deve constar (no arquivo eletrônico) logo após a ficha catalográfica. Assim que tiver efetuado a correção submeta o arquivo em PDF novamente. Agradecemos a compreensão. on 2018-04-23T14:20:44Z (GMT) / Submitted by LAIS REIA (laisreia@gmail.com) on 2018-04-23T18:12:42Z No. of bitstreams: 1 Dissertação final_Lais Reia.pdf: 4768132 bytes, checksum: a8c44d20771fb4cab7e4966f267a94a0 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Pizzani null (luciana@btu.unesp.br) on 2018-04-23T19:33:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 reia_l_me_bot.pdf: 4768132 bytes, checksum: a8c44d20771fb4cab7e4966f267a94a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-23T19:33:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 reia_l_me_bot.pdf: 4768132 bytes, checksum: a8c44d20771fb4cab7e4966f267a94a0 (MD5) Previous issue date: 2018-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O gênero Moenkhausia ainda se encontra alocado como incertae sedis na família Characidae, com 88 espécies válidas. Moenkhausia oligolepis foi investigada com o intuito de verificar se esta representa uma única espécie ou um complexo de espécies, buscando assim esclarecer questões taxonômicas sobre o gênero. Além de M. oligolepis analisamos as espécies M. sanctaefilomenae, M. forestii e M. australe, pois observamos que estas são mais similares entre si quando comparadas as outras espécies do grupo “complexo Moenkhausia oligolepis/M. sanctaefilomenae”. Sendo assim, estamos considerando essas quatro espécies como o grupo “Moenkhausia oligolepis”. Foram analisados, através de dados morfométricos e merísticos, 321 lotes, totalizando 1522 espécimes disponíveis em coleções ictiológicas brasileiras e estrangeiras. A partir de nossas analises, foram identificadas e propostas duas novas espécies, distribuídas nas bacias dos rios Tapajós (Moenkhausia sp. n.1) e Guaporé (Moenkhausia sp. n.2). Nossos resultados não suportam a hipótese proposta por Benine et al. (2009), de que Moenkhausia oligolepis represente um complexo de espécies, uma vez que não foram detectados caracteres morfológicos diagnósticos justificando a separação e descrição tradicional entre os táxons dos rios Amazonas, Araguaia e Paraguai. Aqui, apontamos as variações morfológicas populacionais de M. oligolepis, como também discussões sobre sua distribuição e a sua relação com algumas espécies do complexo Moenkhausia oligolepis/M. sanctaefilomenae. As redescrições de M. australe e M. sanctaefilomenae são apresentadas com comentários, e ampliamos a distribuição de M. forestii para o rio Mamoré. / The genus Moenkhausia remaining as incertae sedis in the Characidae, with 88 valid species. Moenkhausia oligolepis was investigated in order to verify if it represents a single species or a complex, with the intention to illuminate taxonomic issues about the genus. Beside to M. oligolepis we analyzed the species M. sanctaefilomenae, M. forestii and M. australe, because we observed that these species are more similar to each other when compared to the other species of the group "Moenkhausia oligolepis / M. sanctaefilomenae complex ". Therefore, we are considering these four species as the group "Moenkhausia oligolepis". 321 lots were analyzed through morphometric and meristic data, totaling 1522 specimens available in Brazilian and foreign ichthyological collections. From our analyzes, two new species were identified and proposed, distributed in the rivers Tapajós (Moenkhausia sp. n.1) and Guaporé (Moenkhausia sp. n.2) basins. Our results do not support the hypothesis that Moenkhausia oligolepis is a species complex as proposed by Benine et al. (2009), since no morphological diagnostic characters were observed justifying the separation and traditional description among the taxa of the rivers Amazonas, Araguaia and Paraguay basins. Here we point out the population morphological variations of M. oligolepis, as well as discussions about their distribution and their relationship with some species of the Moenkhausia oligolepis / M. sanctaefilomenae complex. The redescriptions of M. australe and M. sanctaefilomenae are presented with comments and we have extended a distribution of M. forestii to the Mamoré River.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Luciano Lajovic Carneiro.pdf: 507309 bytes, checksum: b58c6af9d894c2d90f75adfed8ebd925 (MD5) Previous issue date: 2011-04-18 / This research aims to assess the fish biodiversity of the streams of the Tocantins and Araguaia basin and test the relative influence of local and regional processes in determining local species richness by examining the relationship between local species richness and regional species richness. For this purpose were sampled 18 streams in the basin of the Araguaia River and 16 streams in the basin of the Tocantins River in the state of Goiás using trawls. For analysis of richness observed was used and linear regression to assess the relationship of local and regional richness. The average value of diversity index of Shannon-Wiener were similar (p> 0.098) to the streams of the Tocantins (H`= 1.784) and Araguaia (H` = 2.254), uniformity also showed similar values (p> 0.962), but the average richness values were different (p = 0.039) for the basin of Tocantins S = 7.12 and S = 11.38 for Araguaia basin. Species richness of the Araguaia streams was strongly related to regional richness (r² = 0.826, p <0.0001) indicating a linear relationship and suggesting that local assemblies are unsaturated. For Tocantins streams was obtained a weak relationship (r²= 0.251, p = 0.047) and it was not possible to infer the shape of the relationship, several factors may be involved in the result. The diversity index was not an efficient descriptor of biodiversity, the test of the relationship between local and regional richness is a good predictor of ecological processes that influence species richness, has the disadvantage of the need to obtain a large amount of data. / Este trabalho objetiva avaliar a biodiversidade de peixes de riachos da bacia Tocantins e Araguaia e testar a influência relativa dos processos locais e regionais na determinação da riqueza de espécies locais através da análise da relação entre a riqueza de espécies local e a riqueza de espécies regional. Para isso, foram amostrados 18 riachos na bacia do Araguaia e 16 riachos na bacia do Tocantins no estado de Goiás utilizando redes de arrasto. Para análise da biodiversidade foi utilizada a riqueza observada e a regressão linear para avaliar a relação entre a riqueza local e regional. Foram capturados 2919 peixes (1833 da bacia do rio Araguaia e 1082 da bacia do rio Tocantins) distribuídos em cinco ordens, 20 famílias e 85 espécies. Os valores médio do índice de diversidade de Shannon-Wiener foram semelhantes (p>0,098) para os riachos da bacia do Tocantins (H`= 1,784) e Araguaia (H`= 2,254), a uniformidade também apresentou valores semelhantes (p>0,962), no entanto, a riqueza média apresentou valores distintos (p=0,039) para as bacias do Tocantins S= 7,12 e do Araguaia S= 11,38. A riqueza de espécies dos riachos do Araguaia esteve fortemente relacionada a riqueza regional (r² = 0,826; p<0,0001) indicando relação linear e sugerindo que as assembléias locais estão insaturadas. Para os riachos do Tocantins obteve-se uma relação fraca (r²= 0,251; p= 0,047), de forma que não foi possível inferir sobre a forma da relação, pois diversos fatores podem estar envolvidos no resultado obtido. O índice de diversidade não foi um descritor eficiente da biodiversidade, por outro lado, o teste da relação entre a riqueza local e regional é um bom preditor dos processos ecológicos que influenciaram a riqueza de espécies, mas tem como desvantagem a necessidade de se obter grande quantidade de dados.

Analyses of the evolution and function of voltage-gated sodium channel proteins (Navs) have largely been limited to mutations from individual people with diagnosed neuromuscular disease. This project investigates the carboxyl-terminus of the Nav paralog (locus scn4aa 3’) that is preferentially expressed in electric organs of Neotropical weakly-electric fishes (Order Gymnotiformes). As a model system, I used the genus Gymnotus, a diverse clade of fishes that produce species-specific electric organ discharges (EODs). I clarified evolutionary relationships among Gymnotus species using mitochondrial (cytochrome b, and 16S ribosome) and nuclear (rag2, and scn4aa) gene sequences (3739 nucleotide positions from 28 Gymnotus species). I analyzed the molecular evolution of scn4aa 3’, and detected evidence for positive selection at eight amino acid sites in seven Gymnotus lineages. These eight amino acid sites are located in motifs that may be important for modulation of EOD frequencies.

Analyses of the evolution and function of voltage-gated sodium channel proteins (Navs) have largely been limited to mutations from individual people with diagnosed neuromuscular disease. This project investigates the carboxyl-terminus of the Nav paralog (locus scn4aa 3’) that is preferentially expressed in electric organs of Neotropical weakly-electric fishes (Order Gymnotiformes). As a model system, I used the genus Gymnotus, a diverse clade of fishes that produce species-specific electric organ discharges (EODs). I clarified evolutionary relationships among Gymnotus species using mitochondrial (cytochrome b, and 16S ribosome) and nuclear (rag2, and scn4aa) gene sequences (3739 nucleotide positions from 28 Gymnotus species). I analyzed the molecular evolution of scn4aa 3’, and detected evidence for positive selection at eight amino acid sites in seven Gymnotus lineages. These eight amino acid sites are located in motifs that may be important for modulation of EOD frequencies.