Submitted by FLAVIA MARCORIN DE OLIVEIRA null (flaviamarcorindeoliveira@gmail.com) on 2016-06-30T18:11:11Z No. of bitstreams: 1 Flávia Marcorin versão final.pdf: 2914788 bytes, checksum: da4eb36add8e9d52d25649b86df175e1 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-04T18:08:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 oliveira_fm_me_rcla.pdf: 2914788 bytes, checksum: da4eb36add8e9d52d25649b86df175e1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-04T18:08:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 oliveira_fm_me_rcla.pdf: 2914788 bytes, checksum: da4eb36add8e9d52d25649b86df175e1 (MD5) Previous issue date: 2016-06-16 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A família Loricariidae é uma das mais diversificadas da ordem Siluriformes, com espécies distribuídas entre sete subfamílias: Hypoptopomatinae, Loricariinae, Hypostominae, Neoplecostominae, Lithogeninae, Delturinae e Ancistrinae. As espécies do gênero Ancistrus Kner, 1854, pertencem à subfamília Ancistrinae, têm mostrado grande variação cariotípica, além de características interessantes do ponto de vista citogenético como a presença de cromossomos sexuais e polimorfismos cromossômicos. Desta forma o objetivo do presente trabalho foi caracterizar os cromossomos de quatro espécies do gênero Ancistrus (Ancistrus sp. 1 “cupim”, Ancistrus sp. 2 “cupim”, Ancistrus sp. “mutuca” e Ancistrus sp. “soberbo”) pertencentes à bacia do Paraguai utilizando técnicas de citogenética clássica e molecular para melhor compreensão da evolução cariotípica dessas espécies. As espécies estudadas apresentaram número diploide variando de 2n=42 a 2n=54, NOR localizadas em regiões pericentroméricas e terminais, além de heteromorfismo de tamanho dessas regiões (NOR) em um dos homólogos nas quatro espécies estudadas. O bandamento C mostrou presença de pouca heterocromatina com exceção das espécies Ancistrus sp. 2 “cupim” e Ancistrus sp. “soberbo” que apresentaram dois blocos grandes de heterocromatina em um par de cromossomos, tanto nos machos quanto nas fêmeas. Um exemplar fêmea da espécie Ancistrus sp. 1 “cupim” também apresentou um bloco grande de heterocromatina em um dos homólogos do par 7, sendo esses resultados indicativos de provável relação entre esses blocos de heterocromatina e a diferenciação de cromossomos sexuais. Os resultados obtidos pela técnica de FISH utilizando sondas de DNAr 18S e 5S mostraram que o DNAr 18S está localizado na mesma região da NOR, o DNAr 5S está distribuído em quatro e cinco pares cromossômicos e o double FISH não mostrou co-localização desses genes. No entanto as espécies Ancistrus sp. 2 “cupim” e Ancistrus sp. “soberbo” mostraram variação nos resultados com marcações de DNAr em blocos de heterocromatina. O uso de sonda telomérica mostrou marcações nos telômeros dos cromossomos das quatro espécies estudadas e marcação pericentromérica em um par de cromossomos da espécie Ancistrus sp. 2 “cupim”. Nossos resultados evidenciam possíveis rearranjos cromossômicos do tipo fusão cêntrica, contribuindo com a redução do número diploide e inversões pericêntricas e paracêntricas resultando na localização dos sítios de DNAr. / The Loricariidae family is one of the most diversified of the Siluriformes order, with species distributed in seven subfamilies: Hypoptopomatinae, Loricariinae, Hypostominae, Neoplecostominae, Lithogeninae, Delturinae and Ancistrinae. The species of the genus Ancistrus Kner, 1854, belong to the subfamily Ancistrinae, have shown great karyotype variation, and interesting features of the cytogenetic point of view as the presence of sex chromosomes and chromosome polymorphisms. Thus the aim of this study was to characterize the chromosomes of four species of Ancistrus genus (Ancistrus sp. 1 "cupim", Ancistrus sp. 2 "cupim", Ancistrus sp. "mutuca" and Ancistrus sp. "soberbo") belonging to Paraguay basin using techniques of classical and molecular cytogenetics to better understand the karyotype evolution of these species. The species showed diploid number ranging from 2n = 42 to 2n = 54, NOR located in pericentomeric and terminal regions, and these regions size heteromorphism (NOR) in one of the homologous in the four species. The C-banding showed the presence of few heterochromatin with the exception of species Ancistrus sp. 2 "cupim" and Ancistrus sp. "soberbo" that had two large blocks of heterochromatin in a pair of chromosomes in both males and females. An exemplary female of the species Ancistrus sp. 1 "cupim" also presented a large block of heterochromatin in one of the pair of 7 homologous, and these results indicating probable relationship between these heterochromatin blocks and differentiation of sex chromosomes. The results obtained by FISH technique using probes 18S rDNA and 5S showed that the 18S rDNA is located in the same region of NOR, the 5S rDNA is distributed in four and five chromosome pairs and double FISH showed colocalization of these genes. However of Ancistrus species sp. 2 "cupim" and Ancistrus sp. "soberbo" showed variation in results with rDNA markings in heterochromatin blocks. The use of telomeric probe showed markings on the telomeres of the chromosomes of four species studied and pericentromeric marking on a pair of chromosomes of the species Ancistrus sp. 2 "cupim". Our results indicate possible chromosomal rearrangements type fusion centric, contributing to the reduction of the diploid number and pericentric inversions and paracentric resulting in the location of rDNA sites. / FAPESP: 2015/05993-3

Estudo comparando a dieta de três espécies de loricarídeos Eurycheilichthys limulus, Ancistrus brevipinnis e Hemiancistrus punctulatus, em diferentes riachos, com os objetivos de verificar a ocorrência ou não de sobreposição alimentar entre as espécies e entre as classe de tamanho de cada espécie. As coletas foram realizadas bimestralmente, pela técnica de pesca elétrica, a partir de junho / 2012 a junho / 2013, em riachos da bacia do alto Jacuí, Rio Grande do Sul, Brasil. Por meio da análise do conteúdo alimentar, foram identificados 26 itens alimentares. De modo geral, as três espécies apresentaram quatro itens que se destacaram: Detrito orgânico, Bacillariophyta, Sedimento e Material vegetal. Além disso, a espécie Eurycheilichthys limulus consumiu uma elevada proporção de larvas de Simuliidae e Chironomidae, e as espécies Ancistrus brevipinnis e Hemiancistrus punctulatus apresentaram uma composição da dieta semelhante. Ancistrus brevipinnis apresentou como principais itens alimentares consumidos alga Oedogoniophyceae, larva de Chironomidae, Tecameba, alga Zygnemaphyceae e Rotífera, enquanto Hemiancistrus punctulatus apresentou como principais itens alimentares consumidos alga Oedogoniophyceae, alga Zygnemaphyceae, Tecameba, larva de Chironomidae e alga Cyanophyceae. Foram identificados os itens responsáveis por essa diferença. Todas as espécies e classes de tamanho apresentaram um alto valor de amplitude de nicho e, na maioria das interações, um baixo valor de sobreposição alimentar. Algumas interações entre as espécies Eurycheilichthys limulus versus Hemiancistrus punctulatus e Ancistrus brevipinnis versus H. punctulatus apresentaram valores altos de sobreposição alimentar, o que poderia indicar uma competição, porém o modelo nulo mostrou o compartilhamento de recursos entre as espécies e classes de tamanho/espécies. Por fim, constatou-se que há segregação alimentar entre as três espécies de Siluriformes estudadas e que a partilha de recursos entre as espécies está relacionada à utilização diferencial de itens em diferentes fases da vida. / Study comparing the diet of three species of loricariids Eurycheilichthys limulus, Ancistrus brevipinnis, and Hemiancistrus punctulatus in different streams aiming to verify the presence or absence of food overlap between the species and between each species of size. Samples were conducted bimonthly by electrofishing technique from June / 2012 to June / 2013 In streams of high Jacuí basin, Rio Grande do Sul, Brazil. Through the content analysis feeds were identified 26 food items. In general, the three species showed the presence of four items that stood out: Detritus Organic, Bacillariophyta, Sediment, and Plant Material. In addition to these items, other items were representatively consumed differently for each species. The species Eurycheilichthys limulus consumed a high proportion of Simuliidae larvae and Chironomidae larvae, the species A. punctulatus and H. brevipinnis had a similar composition of the diet, Ancistrus brevipinnis presented as the main food items consumed: algae Oedogoniophyceae, larvae Chironomidae, Tecameba, algae Zygnemaphyceae, and Rotifers, while Hemiancistrus punctulatus presented as the main food items consumed algae Oedogoniophyceae, algae Zygnemaphyceae, Tecameba, larvae Chironomidae, and algae Cyanophycea. Species segregation can be observed by Analysis Coordinates Principal (PCoA). The items identified were responsible for this difference. All species and all size classes showed a high value of niche breadth. In general, these species have a low feeding overlap values. Some interactions between the species Eurycheilichthys limulus versus Hemiancistrus punctulatus and between Ancistrus brevipinnis versus Hemiancistrus punctulatus showed the presence of high values of food overlap indicating a competition, but the null model confirmed the niche partitioning between the species and classes size / species. Finally, it was found that there are food segregation between the three species of Siluriformes studied and that the sharing of resources between species is related to differential use of items in different stages of life.

Estudo comparando a dieta de três espécies de loricarídeos Eurycheilichthys limulus, Ancistrus brevipinnis e Hemiancistrus punctulatus, em diferentes riachos, com os objetivos de verificar a ocorrência ou não de sobreposição alimentar entre as espécies e entre as classe de tamanho de cada espécie. As coletas foram realizadas bimestralmente, pela técnica de pesca elétrica, a partir de junho / 2012 a junho / 2013, em riachos da bacia do alto Jacuí, Rio Grande do Sul, Brasil. Por meio da análise do conteúdo alimentar, foram identificados 26 itens alimentares. De modo geral, as três espécies apresentaram quatro itens que se destacaram: Detrito orgânico, Bacillariophyta, Sedimento e Material vegetal. Além disso, a espécie Eurycheilichthys limulus consumiu uma elevada proporção de larvas de Simuliidae e Chironomidae, e as espécies Ancistrus brevipinnis e Hemiancistrus punctulatus apresentaram uma composição da dieta semelhante. Ancistrus brevipinnis apresentou como principais itens alimentares consumidos alga Oedogoniophyceae, larva de Chironomidae, Tecameba, alga Zygnemaphyceae e Rotífera, enquanto Hemiancistrus punctulatus apresentou como principais itens alimentares consumidos alga Oedogoniophyceae, alga Zygnemaphyceae, Tecameba, larva de Chironomidae e alga Cyanophyceae. Foram identificados os itens responsáveis por essa diferença. Todas as espécies e classes de tamanho apresentaram um alto valor de amplitude de nicho e, na maioria das interações, um baixo valor de sobreposição alimentar. Algumas interações entre as espécies Eurycheilichthys limulus versus Hemiancistrus punctulatus e Ancistrus brevipinnis versus H. punctulatus apresentaram valores altos de sobreposição alimentar, o que poderia indicar uma competição, porém o modelo nulo mostrou o compartilhamento de recursos entre as espécies e classes de tamanho/espécies. Por fim, constatou-se que há segregação alimentar entre as três espécies de Siluriformes estudadas e que a partilha de recursos entre as espécies está relacionada à utilização diferencial de itens em diferentes fases da vida. / Study comparing the diet of three species of loricariids Eurycheilichthys limulus, Ancistrus brevipinnis, and Hemiancistrus punctulatus in different streams aiming to verify the presence or absence of food overlap between the species and between each species of size. Samples were conducted bimonthly by electrofishing technique from June / 2012 to June / 2013 In streams of high Jacuí basin, Rio Grande do Sul, Brazil. Through the content analysis feeds were identified 26 food items. In general, the three species showed the presence of four items that stood out: Detritus Organic, Bacillariophyta, Sediment, and Plant Material. In addition to these items, other items were representatively consumed differently for each species. The species Eurycheilichthys limulus consumed a high proportion of Simuliidae larvae and Chironomidae larvae, the species A. punctulatus and H. brevipinnis had a similar composition of the diet, Ancistrus brevipinnis presented as the main food items consumed: algae Oedogoniophyceae, larvae Chironomidae, Tecameba, algae Zygnemaphyceae, and Rotifers, while Hemiancistrus punctulatus presented as the main food items consumed algae Oedogoniophyceae, algae Zygnemaphyceae, Tecameba, larvae Chironomidae, and algae Cyanophycea. Species segregation can be observed by Analysis Coordinates Principal (PCoA). The items identified were responsible for this difference. All species and all size classes showed a high value of niche breadth. In general, these species have a low feeding overlap values. Some interactions between the species Eurycheilichthys limulus versus Hemiancistrus punctulatus and between Ancistrus brevipinnis versus Hemiancistrus punctulatus showed the presence of high values of food overlap indicating a competition, but the null model confirmed the niche partitioning between the species and classes size / species. Finally, it was found that there are food segregation between the three species of Siluriformes studied and that the sharing of resources between species is related to differential use of items in different stages of life.

Estudo comparando a dieta de três espécies de loricarídeos Eurycheilichthys limulus, Ancistrus brevipinnis e Hemiancistrus punctulatus, em diferentes riachos, com os objetivos de verificar a ocorrência ou não de sobreposição alimentar entre as espécies e entre as classe de tamanho de cada espécie. As coletas foram realizadas bimestralmente, pela técnica de pesca elétrica, a partir de junho / 2012 a junho / 2013, em riachos da bacia do alto Jacuí, Rio Grande do Sul, Brasil. Por meio da análise do conteúdo alimentar, foram identificados 26 itens alimentares. De modo geral, as três espécies apresentaram quatro itens que se destacaram: Detrito orgânico, Bacillariophyta, Sedimento e Material vegetal. Além disso, a espécie Eurycheilichthys limulus consumiu uma elevada proporção de larvas de Simuliidae e Chironomidae, e as espécies Ancistrus brevipinnis e Hemiancistrus punctulatus apresentaram uma composição da dieta semelhante. Ancistrus brevipinnis apresentou como principais itens alimentares consumidos alga Oedogoniophyceae, larva de Chironomidae, Tecameba, alga Zygnemaphyceae e Rotífera, enquanto Hemiancistrus punctulatus apresentou como principais itens alimentares consumidos alga Oedogoniophyceae, alga Zygnemaphyceae, Tecameba, larva de Chironomidae e alga Cyanophyceae. Foram identificados os itens responsáveis por essa diferença. Todas as espécies e classes de tamanho apresentaram um alto valor de amplitude de nicho e, na maioria das interações, um baixo valor de sobreposição alimentar. Algumas interações entre as espécies Eurycheilichthys limulus versus Hemiancistrus punctulatus e Ancistrus brevipinnis versus H. punctulatus apresentaram valores altos de sobreposição alimentar, o que poderia indicar uma competição, porém o modelo nulo mostrou o compartilhamento de recursos entre as espécies e classes de tamanho/espécies. Por fim, constatou-se que há segregação alimentar entre as três espécies de Siluriformes estudadas e que a partilha de recursos entre as espécies está relacionada à utilização diferencial de itens em diferentes fases da vida. / Study comparing the diet of three species of loricariids Eurycheilichthys limulus, Ancistrus brevipinnis, and Hemiancistrus punctulatus in different streams aiming to verify the presence or absence of food overlap between the species and between each species of size. Samples were conducted bimonthly by electrofishing technique from June / 2012 to June / 2013 In streams of high Jacuí basin, Rio Grande do Sul, Brazil. Through the content analysis feeds were identified 26 food items. In general, the three species showed the presence of four items that stood out: Detritus Organic, Bacillariophyta, Sediment, and Plant Material. In addition to these items, other items were representatively consumed differently for each species. The species Eurycheilichthys limulus consumed a high proportion of Simuliidae larvae and Chironomidae larvae, the species A. punctulatus and H. brevipinnis had a similar composition of the diet, Ancistrus brevipinnis presented as the main food items consumed: algae Oedogoniophyceae, larvae Chironomidae, Tecameba, algae Zygnemaphyceae, and Rotifers, while Hemiancistrus punctulatus presented as the main food items consumed algae Oedogoniophyceae, algae Zygnemaphyceae, Tecameba, larvae Chironomidae, and algae Cyanophycea. Species segregation can be observed by Analysis Coordinates Principal (PCoA). The items identified were responsible for this difference. All species and all size classes showed a high value of niche breadth. In general, these species have a low feeding overlap values. Some interactions between the species Eurycheilichthys limulus versus Hemiancistrus punctulatus and between Ancistrus brevipinnis versus Hemiancistrus punctulatus showed the presence of high values of food overlap indicating a competition, but the null model confirmed the niche partitioning between the species and classes size / species. Finally, it was found that there are food segregation between the three species of Siluriformes studied and that the sharing of resources between species is related to differential use of items in different stages of life.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3847.pdf: 8121609 bytes, checksum: d085371b9ccbfe0c2017a1ee27231b28 (MD5) Previous issue date: 2011-09-02 / Financiadora de Estudos e Projetos / Conventional and molecular cytogenetic analysis were performed on 15 species of the subfamily Hypostominae, comprising 12 species of the Hypostomini tribe, genus Hypostomus, and three of the Ancistrini tribe, genera Ancistrus and Hemiancistrus. The chromosome number of 2n=52 was observed for Ancistrus multispinis (14m+14sm+24st-a), A. brevipinnis (14m+14sm+24st-a) and Hemiancistrus punctulatus (14m+26sm+12st-a). The nucleolar organizer regions (Ag-NORs) and 18S rDNA sites are simple and terminal for species, A. brevipinnis, A. multispinis and H. punctulatus. In these species, it can be seen that the NORs are also CMA3+/DAPI-. As for the heterochromatin, H. punctulatus showed a small amount of this chromosome component, while A. multispinis and A. brevipinnis showed a larger amount, with large blocks on the long arm of some st-a pairs. In turn, the different species of Hypostomus showed a variation from 64 to 82 chromosomes, exhibiting differences in the karyotype formula between species. The NORs were multiple for most species analyzed, with different phenotypes observed in the number and position, which was also confirmed by FISH analysis, showing an interindividual and interspecific variability. In all species, the NORs were also CMA3+/DAPI _. The heterochromatin pattern distribution was different in each species, being another important chromosome marker. Cytogenetic, molecular, and morphometry analysis were performed in the species Hypostomus albopunctatus (Piracicaba river, SP) and H. heraldoi (Pirapitinga river, GO), including those morphologically similar samples present in the Mogi Guaçu river (SP). All individuals had 2n=74, whereas H. albopunctatus showed 10m+20sm+44st-a and H. heraldoi 8m+20sm+46st-a. These two karyotype formulae were found in the Mogi Guaçu river population. Distinct Ag-NOR phenotypes were observed among the three populations and confirmed by FISH. Regarding the heterochromatin pattern, H. albopunctatus presented terminal bands and an interstitial block. In H. heraldoi, the heterochromatin was found widely distributed in the terminal and interstitial regions of some st-a chromosomes. In these species, the NORs were also CMA3+/DAPI _. RAPD analysis and sequencing of the cytochrome oxidase subunit I (COI) gene were carried out in these two species, in the Mogi Guaçu population and in three more species, H. regani, H. margaritifer, and H. hermanni, obtaining the same dendrogram pattern. All species could be differentiated by their COI sequences, resulting in a total of 16 haplotypes. These analyses, combined with the morphometric data, showed that H. heraldoi and H. albopunctatus are two valid species and the specimens from the Mogi Guaçu river still retain some characteristics of H. albopunctatus, and were provisionally designated as Hypostomus aff. albopunctatus. Due to the large number of species currently included in the Hypostomus genus, along with both the intra and interspecific variability in morphology and color pattern, there are often problems in the taxonomy of this group, which can be assisted by cytogenetic data. This study provided new chromosomal data for Loricariidae, being a valuable cytotaxonomic tool for the Hypostomini tribe. The joint analysis of different characters, such as cytogenetic, molecular, and morphometric, allowed a more precise characterization of different populations of Hypostomus species, helping to clarify their validity as distinct evolutionary units. / Análises citogenéticas convencionais e moleculares foram realizadas em 15 espécies da subfamília Hypostominae, compreendendo 12 espécies da tribo Hypostomini, gênero Hypostomus e três da tribo Ancistrini, gêneros Ancistrus e Hemiancistrus. Foi observado 2n=52 para Ancistrus multispinis (14m+14sm+24st-a), A. brevipinnis (14m+14sm+24st-a) e Hemiancistrus punctulatus (14m+26sm+12st-a). As regiões organizadoras de nucléolos (Ag- RONs) e sítios de DNAr 18S são simples e terminais para as espécies A. brevipinnis, A. multispinis e H. punctulatus. Nestas epécies pode-se constatar que as RONs são também CMA3 +/DAPI-. Quanto à heterocromatina, H. punctulatus apresentou pouca quantidade desse componente cromossômico, enquanto que A. multispinis e A. brevipinnis evidenciaram uma maior quantidade, com grandes blocos no braço longo de alguns pares st-a. Por sua vez, as diferentes espécies de Hypostomus mostraram uma variação de 64 a 82 cromossomos, com diferença na fórmula cariotípica entre as espécies. As RONs foram múltiplas para a maioria das espécies analisadas, sendo observados diferentes fenótipos quanto ao número e posição, o que foi também confirmado pela análise de FISH, evidenciando uma variabilidade interindividual e interespecífica. Em todas as espécies as RONs mostraram-se também CMA3 +/DAPI _. O padrão de distribuição da heterocromatina foi diferente em cada espécie, sendo outro importante marcador cromossômico. Análises citogenéticas, moleculares e de morfometria foram realizadas nas espécies Hypostomus albopunctatus (rio Piracicaba, SP) e H. heraldoi (rio Pirapitinga, GO), assim como em exemplares morfologicamente semelhantes presentes no rio Mogi Guaçu (SP). Todos os indivíduos apresentaram 2n=74, sendo que, H. albopunctatus apresentou 10m+20sm+44st-a e H. heraldoi 8m+20sm+46st-a. As duas fórmulas cariotípicas foram encontradas na população do rio Mogi Guaçu. Fenótipos distintos de Ag-RONs foram observados entre as três populações, confirmadas pela FISH. Quanto ao padrão heterocromático, H. albopunctatus apresentou bandas terminais e um bloco intersticial. Em H. heraldoi, a heterocromatina encontrou-se mais amplamente distribuída, nas regiões terminais e intersticiais de alguns cromossomos st-a. Nessas espécies as RONs mostraram-se também CMA3 +/DAPI _. Análises de RAPD e sequenciamento do gene de Citocromo Oxidase subunidade I (COI) foram realizadas nessas duas espécies, na população do rio Mogi Guacu e em mais três espécies, H. regani, H. margaritifer e H. hermanni, obtendo-se o mesmo padrão de dendrograma. Todas as espécies puderam ser diferenciadas por suas sequências COI, resultando num total de 16 haplótipos. Estas análises, aliadas aos dados de morfometria, evidenciaram que H. heraldoi e H. albopunctatus são duas espécies válidas e que os exemplares do rio Mogi Guaçu ainda conservam algumas características de H. albopunctatus, sendo provisoriamente denominados como Hypostomus aff. albopunctatus. Devido ao elevado número de espécies atualmente incluídas no gênero Hypostomus, juntamente com a variabilidade na morfologia e padrão de coloração tanto intra quanto interespecífica, muitas vezes ocorrem problemas na taxonomia desse grupo, a qual pode ser auxiliada pelos dados citogenéticos. Este estudo forneceu novos dados cromossômicos para os Loricariidae, mostrando-se uma boa ferramenta citotaxonômica para a tribo Hypostomini. A análise conjunta de diferentes caracteres, como citogenéticos, moleculares e morfométricos, possibilitou uma caracterização mais precisa de diferentes populações de espécies de Hypostomus, contribuindo para esclarecer sua validade como unidades evolutivas distintas.