Orientador: Antonio Leão Castilho / Resumo: Ermitões dependem de conchas de gastrópodes vazias como forma de abrigo e proteção por não possuírem o abdômen calcificado. Embora o recurso concha seja imprescindível para estes animais, nem sempre estão disponíveis para a comunidade toda. O presente trabalho tem como objetivo comparar as comunidades de ermitões no sublitoral consolidado de ilhas continentais do estado de São Paulo por meio de índices ecológicos. Quatro ilhas foram investigadas padronizando-se a metodologia de amostragem no uso de coleta manual por mergulho autônomo. Para a Laje de Santos e 64 Ilha da Vitória, as coletas foram realizadas entre 2015 e 2016, enquanto os dados de Ilha Anchieta e do Ilhote das Couves foram retirados da literatura. Os índices ecológicos foram diversidade, dominância, equidade e riqueza, como também, foram aplicadas curvas de rarefação. Um total de 4327 indivíduos foi analisado, pertencentes a cinco espécies das quatro comunidades estudadas, sendo Paguristes tortugae e Pagurus brevidactylus somando mais de 80% da abundância das quatro ilhas analisadas. Em geral, as ilhas foram caracterizadas por apresentarem alta dominância (≥0,6) e baixa equidade (≤0,5). As curvas de rarefação mostraram que não há diferença na riqueza nas regiões estudadas. A alta dominância destas duas espécies pode indicar uma competição pelo recurso concha na região. As outras três espécies estão restritas a região superior do sublitoral consolidado próximo à área entre-maré ou a interface entre a região conso... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Orientador: William Ricardo Amancio Santana / Resumo: Desde as primeiras classificações sistemáticas do gênero Pagurus Fabricius, 1775, grupos informais têm sido propostos com base em características morfológicas de adultos, larvas ou ainda de ambos. Atualmente 11 grupos com base na morfologia externa dos adultos são reconhecidos e o grupo provenzanoi se destaca pelo grande número de espécies. Este estudo tem como objetivo principal realizar uma revisão taxonômica das espécies de Pagurus atribuídas ao grupo provenzanoi com distribuição no Atlântico ocidental. Foram analisados espécimes provenientes de diferentes coleções carcinológicas presentes nas Américas do Sul e do Norte. Tradicionalmente o grupo provenzanoi contava com 12 espécies, sendo aqui descrita uma nova espécie para o gênero. Com as análises das coleções, muitas informações sobre a distribuição, coloração e habitat foram adicionadas às descrições preexistentes. Ilustrações de cada espécie também foram providenciadas, assim como observações sobre as relações existentes entre as espécies do grupo e uma chave para identificação das espécies do Atlântico ocidental. A diferenciação entre Pagurus brevidactylus e P. provenzanoi, a validade de P. trichocerus e as variações intraespecíficas de importância taxonômica foram discutidas em detalhe. Além disso, uma revisão dos demais grupos atribuídos ao gênero Pagurus foi realizada com base em informações da literatura, com destaque para a definição de cada grupo e quais espécies estão atualmente incluídas em ca... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Since the first systematics classifications of the genus Pagurus Fabricius, 1775, some informal groups has been proposed based on morphological characters of adults, larvae or both. Currently, 11 informal groups are recognized through the adult’s external morphology, with the provenzanoi having the greater species richness. The aim of this study is to provide a taxonomic review of Pagurus species attributed to the provenzanoi group in the western Atlantic. Specimens of different collections from the South and North America were analyzed. Traditionally, the provenzanoi group comprises 12 species found in the western Atlantic, and here a new species of the genus is described. Through the analysis of the collections, several data about distribution, color and habitat were described. Illustrations of each species were provided, with remarks about the relationships among provenzanoi species. In addition, a key to the species of the provenzanoi group in the Western Atlantic is provided. Differentiation between Pagurus brevidactylus and P. provenzanoi, the taxonomic status of P. trichocerus and the intraspecific variations with taxonomic importance were commented in detail. Moreover, a review about the Pagurus informal group of species was provided based on literature review, highlighting the definition and the currently attributed species of each group. / Doutor

Os gêneros Isocheles e Loxopagurus são endêmicos da América e ocorrem em águas tropicais e subtropicais. Isocheles é composto por cinco espécies, duas encontradas no Atlântico oeste (I. sawayai e I. wurdemanni) e três no Pacífico leste (I. pilosus, I. pacificus, e I. aequimanus). Loxopagurus é um gênero monotípico e ocorre apenas na costa sudeste da América do Sul. Estes dois gêneros são morfologicamente semelhantes, tendo como principal diferença a heteroquelia em Loxopagurus em contraste com a isoquelia de Isocheles. Há poucas informações na literatura sobre estes gêneros, e dúvidas quanto a seu status taxonômico foram recentemente ressuscitadas. Dessa forma este estudo visa elucidar as relações filogenéticas de Isocheles e Loxopagurus e avaliar a sua validade taxonômica. Para isso, foram realizadas análises moleculares utilizando os genes 16S rRNA, COI e H3, e análises morfológicas, buscando caracteres que facilitem a identificação destas espécies, bem como a contextualização de ambos os gêneros dentro da Família. Os tipos de I. aequimanus e I. pilosus foram perdidos e erros de identificação entre as espécies de Isocheles são bem comuns. Assim, foram propostos caracteres que delimitam de maneira clara estas espécies, como ornamentação e formato dos quelípodos e o número de dentes presentes no segundo segmento da antena. A proposição de neótipos não foi necessária, uma vez que não há problemas taxonômicos entre estas espécies que não puderam ser resolvidos com base nas descrições originais e desenhos. Um dos lotes de I. wurdemanni do Museum of Comparative Zoology foi identificado pelo presente estudo como o holótipo da espécie. Isocheles e vii Loxopagurus se mostraram gêneros monofiléticos distintos, com base nos 3 marcadores utilizados, e grupos irmãos dentro de Diogenidae. Além disso, constatou-se que as espécies de Isocheles também formam grupos monofiléticos e uma nova espécie foi encontrada, divergindo tanto morfológica quanto molecularmente das demais. Assim, com base na morfologia, na topologia das árvores geradas e nas distâncias genéticas, conclui-se que, não somente os dois gêneros, mas também as espécies englobadas, são unidades taxonômicas distintas válidas. / The genera Isocheles and Loxopagurus are endemic to America and occur in tropical and subtropical waters. There are five species of Isocheles, two of them are found in West Atlantic (I. sawayai and I. wurdemanni) and three are found in East Pacific (I. pilosus, I. pacificus and I. aequimanus). Loxopagurus is a monotypic genus and occurs only in southeast coast of South America. These two genera are morphologically similar, but the main difference between them is the heterochelia of Loxopagurus, while the chelipeds of Isocheles are similar in shape and size. There are few published information about these genera, and some doubts about their taxonomic status arised recently. Thus, this study aims to elucidate the phylogenetic relationship of Isocheles and Loxopagurus and evaluate their taxonomic validity. For that, molecular analyses were performed based on the genes 16S rRNA, COI and H3, as well as morphological analysis, seeking characters that facilitate the identification of these species, and that contextualize both genera in the family. The type specimens of I. aequimanus and I. pilosus were lost and identification errors are common between Isocheles species. Therefore, characters that clearly delimit these species were stated, as the ornamentation and shape of the chelipeds and the number of teeth in the second segment of the antenna. There was no need to designate neotypes, once there are no taxonomic problems between the species that could not be solved based on the original descriptions and illustrations. Also, we identified that one of the lots of I. wurdemanni from the Museum of Comparative Zoology is the holotype of the species. The analysis based on the three ix molecular markers showed that Isocheles and Loxopagurus are two different monophyletic genera, and sister taxa among Diogenidae. We also verified that each one of the species of Isocheles are monophyletic, and found a new species that differs both molecular and morphologically from the others. Thus, based on the morphology, on the tree topology and on genetic divergences, we concluded that not only the two genera, but also the species that they encompass, are valid taxonomic units.

Hermit crabs form an important component of the marine benthos and globally more than 1,200 species have been described. In the unique bioregion of South Africa, hermit crabs are poorly known, and the last taxonomic revision of the group was that of K. H. Barnard in 1950, who recorded only 32 species. This study combines morphological taxonomy, threedimensional (3D) micro-computed tomography (µCT) visualisations, and molecular barcoding to add to, revise, and provide an updated listing of, the regional fauna. The first section of the thesis comprises four chapters, each giving a detailed account of a species either new to science, or to the region. The pagurid hermit crab Goreopagurus poorei, a new species and genus record to the country, is reported and described from deep sea habitats along the Agulhas Shelf, extending the distribution by >10,000 km across the Indian Ocean. Furthermore, three species are described as new to science, one each from the three most common families. The first of these, a deep-water species from a genus of the family Parapaguridae that was previously unknown to South Africa, Paragiopagurus atkinsonae n. sp., is fully described and illustrated, and compared with two other parapagurids that each play a dominant role in the regional benthic offshore invertebrate community. The other two species new to science, Diogenes n. sp. from the family Diogenidae, and Pagurus n. sp. from the family Paguridae, inhabit coastal reefs in subtidal waters off southern KwaZulu-Natal. For the first time in crustacean taxonomy, species descriptions, particularly the one of Pagurus n. sp., are informed by, or based on, µCT imagery of calcified body parts. Following on this technique, Chapter 6 is a short presentation of the 3D raw dataset of seven µCT scans of types and rare museum specimens used in this thesis, which is made publicly available for download. The taxonomic use of the scanning method, with disseminating volumetric data of hermit crabs, is discussed briefly. The final section investigates the fauna as a whole. In Chapter 7, 194 cytochrome c oxidase subunit I gene segments (COI ‘barcodes’) of 43 nominal species plus 12 additional putative species (n = 55 species-like units) were used to validate morphological identifications. Testing this dataset revealed high barcoding efficacy, with nearly 99% identification success rates, and with the best Kimura 2-parameter distance to safely delimit species of hermit crabs of about 3.5%. Chapter 8 updates the regional fauna and provides taxonomic accounts for 62 nominal species which have either been added subsequent to the previous monographic review, or which have undergone taxonomic revision since that time. Of these, 12 are added for the first time here, increasing the number of known South African hermit crab species to 72, an expansion of 56% since Barnard, and about 20% since a recent species list published by W. Emmerson in 2016. Because colour images are provided for 51 out of 72 species, Chapter 8 can also be used as a preliminary guide. However, this study has shown that the hermit crabs of South Africa are by far more diverse than originally thought, and the summary, which includes only the 72 nominal taxa and none of the additional 10 putative species included in the barcoding dataset, is speculated to be only 60–70% complete. Future taxonomic work, especially in the genera Diogenes and Paguristes, will most likely result in many more species descriptions. Therefore, this current study is to be seen as important step towards a fully illustrated taxonomic catalogue on the South African hermit crabs to be produced in the near future.

Orientador: Adilson Fransozo / Resumo: Padrões espaço-temporais de organismos que habitam regiões costeiras são essenciais para entender quais fatores controlam e mantêm a diversidade local de espécies. O presente estudo investiga as (1) alterações da comunidade de caranguejos ermitões (Crustacea: Anomura: Paguroidea), (2) a influência dos fatores ambientais nas comunidades de ermitões e (3) interações com as conchas de gastrópodes na Enseada de Ubatuba-SP, Brasil. Por meio de coletas mensais sistematizadas em dois períodos distintos separados por 20 anos (1995-1996 & 2016-2017) os ermitões foram coletados utilizando um barco de arrasto equipado com redes double-rig. Para entender a variação espacial dentro da Enseada foi estabelecido cinco pontos amostrais: três pontos paralelos a linha da praia em profundidades de 5m, 10m e 15m; e dois locais perpendiculares a linha da praia (exposto e abrigado a ação de ondas). Foi encontrada diferenças nas comunidades de ermitões espacialmente e temporalmente. Embora que a maioria dos índices de diversidade alfa não tenham diferido quando comparados os períodos amostras, a diversidade beta particionada indicou mudanças consistentes. Em relação a rede estudada de ermitões e conchas, a mesma possui um padrão modular e especializada. Assim, essas informações fornecem perspectivas interessantes para ações que visam a conservação da diversidade local de caranguejos ermitões. / Mestre