Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Saúde Coletiva, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T00:43:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 286755.pdf: 1045367 bytes, checksum: f62c8186cdd68695cd97f4247187b6c5 (MD5) / Objetivos: Traçar o perfil das mulheres com câncer de colo de útero usuárias do Hospital Agostinho Neto - Cabo Verde. Método: Trata-se de um estudo epidemiológico descritivo, baseado na análise de 100 registros de casos notificados de câncer de colo de útero pelo banco estatístico do hospital Agostinho Neto. Utilizou-se o programa Epi Info 9.0 para digitação, análise e criação do banco de dados, através de apresentação de percentagens, e intervalos de confiança (95%). Resultados: Os resultados revelam que 85% (IC 95% 4,7-11,7) das mulheres foram atendidas na secção de ginecologia, logo tiveram um tratamento adequado. A maioria das ocorrências de câncer cervical observou-se nas mulheres de naturalidade da Cidade da Praia (74%); ilha de Santiago (97%); residentes também na Praia (74%). Pacientes compreendida entre 38 a 59 anos de idade com 51% de prevalencia de câncer cervical, casadas (45%), tendo a ocupação de domestica (39%) sem salário remunerado e vivem com um parceiro (67%). O nivel de escolaridade é baixo quando comparada com as analfabetas (22%). Dentre elas de 17-20 anos iniciaram a atividade sexual tardia (50%), o inicio da menarca deu-se entre 14-16 anos, destaca-se pacientes com 1 a 3 filhos (66%). Das 100 mulheres praticamente todas teve presença de HPV menos 3%, também elas não usam preservativo que é o primeiro método de prevenção já que não há vendas de vacinas anti-HPV em Cabo Verde. Conclusão: Ressalta-se a necessidade de estudos mais aprofundados para avaliar a associação entre câncer de colo uterino com outros fatores em Cabo Verde e um estudo que extrapole para a população. O perfil oncologico descreve que são mulheres com um parceiro, não têm o hábito de fazer consultas ginecológicas periodicamente, vivem na Capital (Praia), ilha de Santiago e muitas residem em bairros periféricos com posto de saude sem ginecologista de acompanhamento, analfabetas ou com um grau razoável de escolaridade, domésticas, com bastantes filhos. É importante a questão da sensibilização da população, em saber onde procurar assistência médica e também consultas de ginecologia sempre, pelo menos duas vezes por ano. A educação sexual, ainda é outro factor importante da prevenção do carcinoma cervical, através de uma orientação do uso correcto de preservativos, de modo a desmotivar a promiscuidade sexual e o início precoce da actividade sexual. Há uma necessidade de programas voltados para as mulheres com pouco acesso as informações e incentivo na procura de consultas ginecológicas nem só para as mulheres das zonas rurais como também para as da Cidade da Praia que vivem em bairros periféricos.

OBJETIVO: Investigar a presença do papiloma vírus humano no adenocarcinoma de cólon e reto. MÉTODOS: Setenta e dois pacientes com adenocarcinoma de cólon e reto foram analisados. Foram coletadas duas amostras de cada paciente: uma amostra do tumor e outra de mucosa não neoplásica distante 15 cm do tumor. Como grupo de controle, também foram estudadas amostras de mucosa de quinze pacientes sem câncer colorretal. Os tecidos foram analisados por “auto nested” PCR usando o primer consensus GP5+/GP6+. Dois primers específicos para região E6 dos HPV 16 e HPV 18 também foram utilizados. RESULTADOS: O DNA do HPV foi detectado em tecidos de cólon e reto de 60 pacientes com câncer ( 83 por cento), enquanto que este não foi encontrado em nenhum dos pacientes controles sem tumor ( p<0,001). Em vinte e três pacientes, o DNA do HPV estava presente tanto no tecido tumoral como na mucosa não neoplásica adjacente. Em vinte e três pacientes o DNA do HPV foi encontrado apenas no tumor, enquanto que em quatorze, só foram encontrados nos tecidos normais coletados próximos ao tumor de cólon e reto. Em setenta e cinco por cento dos casos positivos foram identificados os HPV tipo 16 ou 18 por PCR com primers E6 específicos. Os achados positivos obtidos por PCR foram confirmados por seqüenciamento viral. CONCLUSÃO: O HPV está presente no cólon e reto da maioria dos pacientes com carcinoma de cólon e reto estudados, sugerindo que este vírus pode estar relacionado à patogênese do câncer colorretal. Serão necessários mais estudos para determinar o papel do HPV na carcinogênese colorretal.

OBJETIVO: Investigar a presença do papiloma vírus humano no adenocarcinoma de cólon e reto. MÉTODOS: Setenta e dois pacientes com adenocarcinoma de cólon e reto foram analisados. Foram coletadas duas amostras de cada paciente: uma amostra do tumor e outra de mucosa não neoplásica distante 15 cm do tumor. Como grupo de controle, também foram estudadas amostras de mucosa de quinze pacientes sem câncer colorretal. Os tecidos foram analisados por “auto nested” PCR usando o primer consensus GP5+/GP6+. Dois primers específicos para região E6 dos HPV 16 e HPV 18 também foram utilizados. RESULTADOS: O DNA do HPV foi detectado em tecidos de cólon e reto de 60 pacientes com câncer ( 83 por cento), enquanto que este não foi encontrado em nenhum dos pacientes controles sem tumor ( p<0,001). Em vinte e três pacientes, o DNA do HPV estava presente tanto no tecido tumoral como na mucosa não neoplásica adjacente. Em vinte e três pacientes o DNA do HPV foi encontrado apenas no tumor, enquanto que em quatorze, só foram encontrados nos tecidos normais coletados próximos ao tumor de cólon e reto. Em setenta e cinco por cento dos casos positivos foram identificados os HPV tipo 16 ou 18 por PCR com primers E6 específicos. Os achados positivos obtidos por PCR foram confirmados por seqüenciamento viral. CONCLUSÃO: O HPV está presente no cólon e reto da maioria dos pacientes com carcinoma de cólon e reto estudados, sugerindo que este vírus pode estar relacionado à patogênese do câncer colorretal. Serão necessários mais estudos para determinar o papel do HPV na carcinogênese colorretal.

Orientadora: Profª. Drª. Neiva Isabel Rodrigues Magdalena / Coorientadores: Profª. Drª. Melissa Rodrigues de Araújo, Prof. Dr. Cassius Torres, Profª. Drª. Sônia Raboni / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Saúde da Criança e do Adolescente. Defesa: Curitiba, 05/12/2014 / Inclui referências : f. 88-98 / Área de concentração: hemato-Oncologia e Genética pediátrica / Resumo: A anemia de Fanconi (AF) é uma doença geneticamente herdada de maneira autossômica recessiva caracterizada por fragilidade cromossômica e distúrbios hematológicos associados às malformações congênitas. A doença pode evoluir para anemia aplástica severa em decorrência de falência da medula óssea. Pacientes com AF têm susceptibilidade aumentada para neoplasias de cabeça e pescoço - Carcinoma Espinocelular (CEC), do trato anogenital e da cavidade bucal. Embora o tratamento eficaz para AF seja o transplante de células tronco hematopoiéicas (TCTH), é sabido que o risco de desenvolvimento de neoplasias aumenta progressivamente após o mesmo. Recentemente, o papilomavírus humano (HPV) tem sido considerado como um agente co-carcinogênico e propõe-se a participação do mesmo na carcinogênese em AF. No presente estudo foram realizados anamnese, exame físico da boca e coleta de amostras de células epiteliais bucais por meio de bochechos com solução salina para detecção do HPV por meio da técnica de Polimerase Chain Reaction (PCR) em tempo real. A amostra do estudo (n = 150) foi dividida em três grupos: indivíduos com AF não transplantados (n = 50) e transplantados (n = 50) e indivíduos saudáveis (controle) (n = 50). Houve semelhança entre os grupos em relação à idade, sexo e escolaridade. Os pacientes com AF foram provenientes de 21 estados brasileiros, sendo os de maior frequência: SC (17%), PR e SP (15%) e BA (10%). A doença do enxerto contra hospedeiro (DECH) foi encontrada apenas em pacientes com AF transplantados (6%, p = 0,04). Lesões leucoplásicas foram mais encontradas em pacientes transplantados (10%) do que em pacientes não-transplantados (2%) (p = 0,02) e lesões aftosas apareceram apenas em pacientes não-transplantados (6%) (p = 0,02). Observou-se apenas um caso de HPV de alto risco com genótipo não especificado. Em análise pareada para HPV de alto e baixo risco, selecionou-se 12 pacientes de cada grupo e todos os resultados foram negativos para HPV. Em conclusão, verificou-se maior frequência de lesões bucais nos pacientes com AF, mas não se observou diferença entre pacientes com AF transplantados, não transplantados e controles em relação à frequência de HPV. Palavras-Chave: Anemia de Fanconi; Papilomavírus Humano; Reação em Cadeia da Polimerase; Boca. / Abstract: Fanconi anemia (FA) is usually inherited as an autosomal recessive disorder characterized by progressive pancytopenia, congenital abnormalities and a predisposition to the development of hematological malignancies as well as squamous cell carcinoma of head and neck and anogenital region. Whereas effective treatment for the hematological complications of FA is hematopoietic stem cell transplantation (HSCT), it is also known that the risk of developing cancer increases progressively thereafter. Recently, the human papillomavirus (HPV) has been considered as a co-carcinogen agent and could be involved in the carcinogenesis of FA. In the present study we performed anamnesis and physical examination of the mouth and we also collected samples of oral epithelial cells by gargling with saline for HPV detection by the polymerase chain reaction technique (PCR) in real time. The study sample (n = 150) were divided into three groups: nontransplanted patients with FA (n = 50) and transplanted patients with FA (n = 50) and healthy individuals (controls) (n = 50). There was no difference between the groups regarding age, sex and levels of education. Patients with FA were from 21 Brazilian states, with the highest frequency as follows: States of Santa Catarina (17%), Parana and Sao Paulo (15%) and Bahia (10%). There was no difference in the frequency of caries and gingivitis among study groups (p > 0.05). The identification of Graft versus host disease (GVHD) was found only in transplanted FA patients. Leukoplakic lesions (p = 0.02) were found more frequently in transplanted patients (10%) than non-transplanted patients (2%) and aphthous lesions appeared only in non-transplant patients (6%) (p = 0.02). It was found only one case of high-risk HPV genotype unspecified. In paired analysis for HPV high and low risk, we selected 12 patients in each group and all results were negative for HPV. In conclusion, A higher frequency of oral lesions were identified in patients with FA but no difference was observed between transplanted , non transplanted patients and healthy controls regarding the presence of HPV. Keywords: Fanconi Anemia; Human Papillomavirus; Polymerase Chain Reaction; Mouth.

Thesis (MTech (Biomedical Technology))--Cape Technikon, Cape Town, 2002 / Infection \\'ith specific high risk human papilloma"iruses (HPV) has been shown to play a causal role in the development of ceJVical intraepithelial neoplasia (CIN) and cenical cancer in women. The development of a prophylactic vaccine to immull.ize women against HPV infection would play a \'ita! role in protecting women against HPV infection and ultimately ceMcal cancer. Despite cancer of the cer\'ix being the second most common cancer in South African women, a literature search reveals that few studies have been performed in South Africa on the types of HPV prevalent in women with CIN or cancer ofthe ceMx. HPVs that infect the anogenital tract have also been shown to infect the oral ca\'ity. However, the HPV prevalence rates vary greatly between studies and the significance of the presence ofHPV in the oral ca\'ity is still not understood. The primary objectives of this study were to establish the HPV prevalence rate infecting women with CIN lesions using a sensitive nested polymerase chain reaction (PCR) and to develop a novel restriction fragment length polymorphism (RFLP) method to type the high risk mucosal HPVs detected in these women. The secondary objective of this study was to establish the prevalence rate and HPV types infecting the oral mucosa of women with CIN lesions and to compare these HPV types with those detected in the ceMx. Cemcal punch biopsies were taken from 163 women with CIN lesions and buccal cells were collected from 33 of these participants. DNAwas extracted from the biopsies and buccal samples and PCR using CCRS primers performed to ensure sample adequacy. Nested PCR usmg consensus degenerate primers for HPV was performed on all samples sho\\'wg sufficient amplifiable DNA A novel restriction fragment length pol)morphism (RFLP) method was developed to identify the 10 high risk mucosal HPVs considered human carcinogens of group 1 by the International Agency for Research on Cancer (lARC) as well as HPV 11 which is commonly found in the oral cavity.

OBJETIVO: Investigar a presença do papiloma vírus humano no adenocarcinoma de cólon e reto. MÉTODOS: Setenta e dois pacientes com adenocarcinoma de cólon e reto foram analisados. Foram coletadas duas amostras de cada paciente: uma amostra do tumor e outra de mucosa não neoplásica distante 15 cm do tumor. Como grupo de controle, também foram estudadas amostras de mucosa de quinze pacientes sem câncer colorretal. Os tecidos foram analisados por “auto nested” PCR usando o primer consensus GP5+/GP6+. Dois primers específicos para região E6 dos HPV 16 e HPV 18 também foram utilizados. RESULTADOS: O DNA do HPV foi detectado em tecidos de cólon e reto de 60 pacientes com câncer ( 83 por cento), enquanto que este não foi encontrado em nenhum dos pacientes controles sem tumor ( p<0,001). Em vinte e três pacientes, o DNA do HPV estava presente tanto no tecido tumoral como na mucosa não neoplásica adjacente. Em vinte e três pacientes o DNA do HPV foi encontrado apenas no tumor, enquanto que em quatorze, só foram encontrados nos tecidos normais coletados próximos ao tumor de cólon e reto. Em setenta e cinco por cento dos casos positivos foram identificados os HPV tipo 16 ou 18 por PCR com primers E6 específicos. Os achados positivos obtidos por PCR foram confirmados por seqüenciamento viral. CONCLUSÃO: O HPV está presente no cólon e reto da maioria dos pacientes com carcinoma de cólon e reto estudados, sugerindo que este vírus pode estar relacionado à patogênese do câncer colorretal. Serão necessários mais estudos para determinar o papel do HPV na carcinogênese colorretal.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:53:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5241_1.pdf: 1391958 bytes, checksum: 9f7ccf6aa1b11b65906eaff7ba2deb15 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / O câncer do colo do útero é o segundo câncer em número de casos entre as mulheres e o sétimo de maior incidência no mundo com 493 mil novos casos por ano, com uma taxa de mortalidade de 50 a 55%. A estimativa para o Brasil é de 19.260 novos casos para 2006, com um risco estimado de 20,31 casos a cada 100 mil mulheres. No Brasil, assim como nos outros países em desenvolvimento, a freqüência do teste de Papanicolau é baixa e os casos são normalmente diagnosticados em fase avançada. Em todo o mundo o Papillomavirus Humano (HPV), diretamente associado ao câncer do colo do útero, é um problema de saúde pública. A análise do genoma, através da genômica comparativa, dos HPVs de alto e baixo risco pode indicar regiões de grande importância associadas à sua patogenicidade. O presente trabalho propõe uma metodologia capaz de classificar o risco à carcinogenicidade utilizando as seqüências de cinco proteínas, E6, E7, E1, L1 e L2 que estão presente em 78 genomas de HPV disponíveis nos bancos de dados públicos. Utilizando-se dos Modelos Ocultos de Markov (HMM) foram selecionadas 24 regiões nas cinco proteínas. Destas 24 regiões, oito foram escolhidas após aplicação de modelo discriminativo baseado em Máquinas de Vetores de Suporte (SVM) acoplado a um algoritmo genético. Diferentes combinações destas oito regiões produziram um conjunto de classificadores capazes de predizer com 100% de eficiência o tipo de risco do HPV. Esta técnica permitiu determinar regiões de potencial importância na carcinogenicidade do HPV. Tais resultados sugerem regiões gênicas de interesse para o desenvolvimento de um método de diagnóstico da presença do DNA viral, contribuindo na prevenção do câncer do colo do útero

The family Papillomaviridae contains more than 320 papillomavirus types, with most having been identified as infecting skin and mucosal epithelium in mammalian hosts. To date, only nine non-mammalian papillomaviruses have been described from birds (n = 5), a fish (n = 1), a snake (n = 1), and turtles (n = 2). The identification of papillomaviruses in sauropsids and a sparid fish suggests that early ancestors of papillomaviruses were already infecting the earliest Euteleostomi. The Euteleostomi clade includes more than 90 per cent of the living vertebrate species, and progeny virus could have been passed on to all members of this clade, inhabiting virtually every habitat on the planet. As part of this study, we isolated a novel papillomavirus from a 16-year-old female Adelie penguin (Pygoscelis adeliae) from Cape Crozier, Ross Island (Antarctica). The new papillomavirus shares similar to 64 per cent genome-wide identity to a previously described Adelie penguin papillomavirus. Phylogenetic analyses show that the non-mammalian viruses (expect the python, Morelia spilota, associated papillomavirus) cluster near the base of the papillomavirus evolutionary tree. A papillomavirus isolated from an avian host (Northern fulmar; Fulmarus glacialis), like the two turtle papillomaviruses, lacks a putative E9 protein that is found in all other avian papillomaviruses. Furthermore, the Northern fulmar papillomavirus has an E7 more similar to the mammalian viruses than the other avian papillomaviruses. Typical E6 proteins of mammalian papillomaviruses have two Zinc finger motifs, whereas the sauropsid papillomaviruses only have one such motif. Furthermore, this motif is absent in the fish papillomavirus. Thus, it is highly likely that the most recent common ancestor of the mammalian and sauropsid papillomaviruses had a single motif E6. It appears that a motif duplication resulted in mammalian papillomaviruses having a double Zinc finger motif in E6. We estimated the divergence time between Northern fulmar-associated papillomavirus and the other Sauropsid papillomaviruses be to around 250 million years ago, during the Paleozoic-Mesozoic transition and our analysis dates the root of the papillomavirus tree between 400 and 600 million years ago. Our analysis shows evidence for niche adaptation and that these non-mammalian viruses have highly divergent E6 and E7 proteins, providing insights into the evolution of the early viral (onco-)proteins.

Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2016-2017 / Introduction: En 2015, 65 pays avaient des programmes de vaccination contre les VPH. La modélisation mathématique a joué un rôle crucial dans leur implantation. Objectifs: Nous avons réalisé une revue systématique et analysé les prédictions de modèles mathématiques de l’efficacité populationnelle de la vaccination sur la prévalence des VPH-16/18/6/11 chez les femmes et les hommes, afin d’évaluer la robustesse/variabilité des prédictions concernant l’immunité de groupe, le bénéfice ajouté par la vaccination des garçons et l’élimination potentielle des VPH-16/18/6/11. Méthodes: Nous avons cherché dans Medline/Embase afin d’identifier les modèles dynamiques simulant l’impact populationnel de la vaccination sur les infections par les VPH-16/18/6/11 chez les femmes et les hommes. Les équipes participantes ont réalisé des prédictions pour 19 simulations standardisées. Nous avons calculé la réduction relative de la prévalence (RRprev) 70 ans après l’introduction de la vaccination. Les résultats présentés correspondent à la médiane(10ème; 90èmeperccentiles) des prédictions. Les cibles de la vaccination étaient les filles seulement ou les filles &amp; garçons. Résultats: 16/19 équipes éligibles ont transmis leurs prédictions. Lorsque 40% des filles sont vaccinées, la RRprev du VPH-16 est 53%(46%; 68%) chez les femmes et 36%(28%; 61%) chez les hommes. Lorsque 80% des filles sont vaccinées, la RRprev est 93%(90%; 100%) chez les femmes et 83%(75%; 100%) chez les hommes. Vacciner aussi les garçons augmente la RRprev de 18%(13%; 32%) chez les femmes et 35%(27%; 39%) chez les hommes à 40% de couverture, et 7%(0%; 10%) et 16%(1%; 25%) à 80% de couverture. Les RRprev étaient plus élevées pour les VPH-18/6/11 (vs. VPH-16). Si 80% des filles &amp; garçons sont vaccinés, les VPH-16/18/6/11 pourraient être éliminés. Interprétation: Même si les modèles diffèrent entre eux, les prédictions s’accordent sur: 1)immunité de groupe élevée même à basse couverture, 2)RRprev supérieures pour les VPH-18/6/11 (vs. VPH-16), 3)augmenter la couverture chez les filles a un meilleur impact qu’ajouter les garçons, 4)vacciner 80% des filles &amp; garçons pourraient éliminer les VPH-16/18/6/11. / Background: As of 2015, 65 countries have introduced HPV vaccination programmes. Mathematical models have played a key role in the implementation of these programmes. Objectives: We conducted a systematic review and pooled-analysis of model predictions of population-level effectiveness of HPV vaccination against HPV-16/18/6/11 infection in women and men, to examine the robustness/variability of predicted populationnal effects, incremental benefit of vaccinating boys, and potential for HPV vaccine-type elimination. Methods: We searched Medline and Embase (2009-2015) for transmission-dynamic modeling studies predicting the population-level impact of vaccination on HPV-16/18/6/11 infections among women and men in high-income countries. Participating modeling teams produced predictions for 19 standardized scenarios. We derived pooled relative reduction in HPV prevalence (RRprev) 70 years after vaccination, using the median (10th; 90thpercentile) of model predictions. Strategies investigated were Girls-Only and Girls &amp; Boys vaccination at 12 years of age. Findings: 16/19 eligible models, from ten high-income countries provided predictions. With 40% Girls-Only vaccination coverage, HPV-16 RRprev among women and men was 53%(46%; 68%) and 36%(28%; 61%), respectively. With 80% Girls-Only vaccination coverage, HPV-16 RRprev among women and men was 93%(90%; 100%) and 83%(75%; 100%), respectively. Vaccinating boys in addition to girls increased HPV-16 RRprev among women and men by 18%(13%; 32%) and 35%(27%; 39%) for 40% coverage, and 7%(0%; 10%) and 16%(1%; 25%) for 80% coverage, respectively. RRprev were greater for HPV-18/6/11 than HPV-16 for all scenarios. Finally at 80% coverage, most models predicted that Girls &amp; Boys vaccination would eliminate HPV-16/18/6/11, with a median RRprev of 100% for women and men for all types. Interpretation: Although HPV models differ in structure, data used for calibration and setting, population-level predictions were generally concordant: 1) strong herd effects from vaccinating Girls-Only, even with low coverage, 2) greater post-vaccination reductions in HPV-18/6/11 infection (vs. HPV-16), 3) increasing coverage in girls provides greater impact than including boys, and 4) reaching 80% coverage in Girls would eliminate HPV-16/18/6/11, with a median RRprev of 100% for women and men for all types. Interpretation: Although HPV models differ in structure, data used for calibration and setting, population-level predictions were generally concordant: 1) strong herd effects from vaccinating Girls-Only, even with low coverage, 2) greater post-vaccination reductions in HPV-18/6/11 infection (vs. HPV-16), 3) increasing coverage in girls provides greater impact than including boys, and 4) reaching 80% coverage in Girls would eliminate HPV-16/18/6/11, with a median RRprev of 100% for women and men for all types. Interpretation: Although HPV models differ in structure, data used for calibration and setting, population-level predictions were generally concordant: 1) strong herd effects from vaccinating Girls-Only, even with low coverage, 2) greater post-vaccination reductions in HPV-18/6/11 infection (vs. HPV-16), 3) increasing coverage in girls provides greater impact than including boys, and 4) reaching 80% coverage in Girls &amp; Boys could eliminate HPV-16/18/6/11.

Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karolinska institutet, 2009.