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Ocorrência de patógenos de origem bacteriana e viral e marcadores de virulência de Escherichia coli e Rhodococcus equi isolados das fezes de aves silvestres de cativiero da fauna brasileira

Morais, Amanda Bonalume Cordeiro de [UNESP] 27 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2014-08-13T17:59:58Z : No. of bitstreams: 1 000768326.pdf: 417220 bytes, checksum: f010ef190b0548a2bbadaa27034a0255 (MD5) / O presente estudo investigou a ocorrência de Escherichia coli, Rhodococcus equi, Salmonella sp., Coronavírus e Rotavírus nas fezes de Passeriformes e Psitaciformes pertencentes à fauna nacional, de 29 diferentes espécies, sem sinais entéricos. Foram investigados também marcadores de virulência nas linhagens de E. coli (cnf1, hly, papC, papGI, papGII, papGIII, fimH, afa, sfa, iucD, usp, vt1, vt2, eae, k88) e R. equi (genes vapA e vapB). As aves utilizadas no estudo foram provenientes do Centro de Medicina e Pesquisa em Animais Silvestres (CEMPAS) FMVZ - UNESP/ Botucatu, SP, do Parque Zoológico Municipal “Quinzinho de Barros” (PZMQB) de Sorocaba, SP e de criadores particulares com aves registradas no Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Renováveis (IBAMA) da região de Botucatu, SP. Do total de 152 amostras avaliadas foram isoladas 46 (30,26%) linhagens de E. coli das quais 37 (80%) foram provenientes de amostras de Psitaciformes e 9 (20%) de Passeriformes. Houve diferença significante (p<0,05) entre os grupos para o maior isolamento de E. coli nos Psitaciformes. Dentre os marcadores de virulência de E. coli foram detectados os genes fim H (58,69%) e eae (4,34%). Foram isoladas 2 (1,32%) linhagens de R. equi, todas de Psitaciformes. Nestes isolados de R. equi não foram identificados os genes vapA e vapB associados à virulência. Foi encontrado material genético de Rotavírus bovino em três (1,97%) amostras de Psitaciformes. Salmonella sp. e Coronavírus não foram identificados nas aves amostradas. A presença de E. coli, R. equi e Rotavírus em amostras de fezes de aves silvestres, sem sinais entéricos, reforça o potencial destas espécies de servirem como reservatórios de patógenos de eliminação entérica para os humanos, devido à presença destes animais no ambiente domiciliar e peridomiciliar / The present study investigated the occurrence of Escherichia coli, Rhodococcus equi, Salmonella sp., Coronavirus and Rotavirus in the feces of Passeriformes and psittaciformes belonging to Brazilian wildlife, from 29 different species, without enteric signs. Virulence markers were also investigated in strains of E. coli (cnf1, hlyA, papC, papGI, papGII, papGIII, fimH, afa, sfa, iucD, usp, vt1, vt2, eae, k88) and R. equi (vapA and vapB genes). The birds used in the study came from the Centro de Medicina e Pesquisa em Animais Silvestres (CEMPAS) FMVZ - UNESP / Botucatu, SP, Parque Zoológico Municipal Quinzinho de Barros (PZMQB) Sorocaba, SP and private breeders with birds recorded in Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Renováveis (IBAMA) from Botucatu region, SP. Of the total 152 fecal samples evaluated were isolated 46 (30.26%) strains of E. coli. From these, 37 (80%) were from psittaciformes samples and 9 (20%) of Passeriformes. There was a statistical difference (p <0.05) between groups with greater isolation of E. coli in psittaciformes. Among the virulence markers of E. coli were detected the genes fimH (58,69%) and eae (4,34%). Were isolated 2 (1.32%) R. equi strains, all from psittaciformes. Among these R. equi isolates any vapA and vapB genes associated with virulence were founded. Genetic material of bovine Rotavirus was found in three (1.97%) psittaciformes samples. Salmonella sp. and Coronavírus weren’t identified in any of the sampled birds. The presence of E. coli, R. equi and Rotavirus in fecal samples of wild birds without enteric signs from Brazil wildlife, reinforces the potential of these birds as a reservoirs of pathogens of enteric elimination for humans, due to the presence of these animals in the domestic and peridomestic, environment of human
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Variação do canto de Thamnophilus Doliatus (Linnaeus, 1764) (Aves: Thamnophilidae) em diferentes regiões da América Latina

Catalano, Ana Luiza Camargo [UNESP] 03 March 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-08-20T17:10:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-03. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:02Z : No. of bitstreams: 1 000840982.pdf: 1252667 bytes, checksum: 7069bb98ea402999ba81d7d978408194 (MD5) / Este trabalho teve como objetivo analisar e comparar as vocalizações entre indivíduos e subespécies de Thamnophilus doliatus de diferentes localizações da América Latina. Foram analisados 280 cantos de 140 indivíduos diferentes, e as variáveis levadas em consideração foram: número de notas, duração do trecho em sequência, taxa de notas por segundo, frequência de pico total do trecho, duração da nota terminal e frequência de pico da mesma. Os cantos também foram divididos em porções para se calcular a variação de velocidade e de tonalidade (frequência) ao longo dos trechos. As características do canto foram correlacionadas com dados geográficos como latitude, longitude e altitude a fim de se conferir se existe alguma padronização com a localização, e a amostra também foi agrupada em subespécies de acordo com suas localizações para comparações. As variáveis analisadas foram fortemente correlacionadas com a latitude, indicando que indivíduos de localização equatorial emitem cantos com mais notas, mais longos, mais rápidos e com uma nota terminal mais grave do que aqueles localizados ao sul da distribuição. As variáveis também foram correlacionadas com a longitude, incluindo também a frequência de pico. Foram identificadas sete subespécies de acordo com as localidades em que foram gravadas, porém apenas cinco foram utilizadas para comparações. Resultados mostraram uma separação das subespécies intermedius e radiatus pelas significativas diferenças no número de notas, duração do trecho, taxa de notas por segundo e frequência de pico. Também foram feitas comparações com a recém-separada espécie Thamnophilus capistratus, e só foram encontradas diferenças significativas na nota terminal e na variação de frequência ao longo do trecho. Devido às características do canto se mostrarem mais próximas entre diferentes espécies (T. doliatus e T. capistratus), que entre as subespécies de... / The aim of this study was to analyze and to compare vocalizations of individuals of the species Thamnophilus doliatus from different locations of Latin America. 280 loudsongs from 140 individuals were analyzed and the variables taken into account were the following: number of notes, duration of the sequenced patch, note rate (notes per second), overall peak frequency, duration of the terminal note, and peak frequency of the terminal note. The loudsongs were also divided into portions in order to measure the variation of note rate (speed) and pitch (frequency) along the patch. The loudsong characteristics were correlated with geographic factors such as latitude, longitude and altitude to check if there is any acoustic pattern with the location. Also, the sample was clustered into subspecies for comparisons. The analyzed variables were strongly correlated with latitude, where individuals from equatorial locations had loudsongs with more notes, longer in duration, faster in note rate and a terminal note lower in peak frequency. The variables also appeared to be significantly correlated with longitude, including as well the overall peak frequency. Seven subspecies were identified according to their locations, however, only five of them were used for comparisons. Results showed a separation of the intermedius and radiatus subspecies due to their significant divergence in number of notes, patch duration, note rate and peak frequency. Comparisons with the recently separated species Thamnophilus capistratus were also made and no significant variation were found in the number of notes and total duration, but there were differences in note rate, overall peak frequency, peak frequency and duration of the terminal note. Because song characteristics between the different species (T. doliatus and T. capistratus) presented to be more similar than among the subspecies of T. doliatus, raises the question of the existence of more than one species within ...

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