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Análise das relações filogenéticas entre os gêneros de Cheirodontinae (Ostariophysi: Characiformes: Charasidae) utilizando sequências de DNA mitocondrial e nuclear /

Mariguela, Tatiane Casagrande. January 2010 (has links)
Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Guaracy Tadeu Rocha / Banca: Daniela Calcagnotto / Banca: Anderson Luis Alves / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Resumo: Os Characiformes são peixes exclusivamente de água doce e encontram-se distribuídos nas Américas e na África, atingindo maior diversidade nas principais drenagens neotropicais. A família Characidae é o grupo mais especioso entre os Characiformes, porém, a relação dessa família com outras famílias é ainda incerta. São conhecidas cerca de 1000 espécies de Characidae das quais cerca de um terço estão distribuídas em 14 subfamílias, e as demais não tem uma posição filogenética clara, sendo incluídas em um grande grupo considerado incertae sedis em Characidae. A subfamília Cheirodontinae compreende cerca de 60 espécies, sendo um grupo de characídeos amplamente distribuídos nas bacias hidrográficas da América do Sul e Central, incluindo espécies trans-andinas. Os gêneros de Cheirodontinae atualmente estão divididos e, três tribos: Cheirodontini, Compsurini e Odontostilbini. No presente estudo, o principal objetivo foi investigar as relações de Cheirodontinae com as subfamílias de Characidae e as relações internas dos membros de Cheirodontinae através da análise de sequências de DNA mitocondrial (16S e Citocromo b) e nuclear (RAG1, RAG2 e Myh6). As análises mostraram que Spintherobolus não pertence à subfamília e Cheirodon stenodon, que era considerado incertae sedis em Characidae, deve fazer parte da mesma. Diversos gêneros apareceram polifiléticos, principalmente Odontostilbe. As espécies trans-andinas e andinas, são as espécies mais antigas da subfamília. As relações observadas nas análises são bastante diferentes das correntemente aceitas para Cheirodontinae e assim é proposta uma nova classificação para o grupo. O gênero Holoshesthes é considerado válido e pertencente a um clado juntamente com o gênero Aphyocheirodon e Acinocheirodon. Odontostilbe forma um clado monofilético com as espécies antes pertencentes à Serrapinnus... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Characiformes are exclusively freshwater fishes and they are found distributed in Americas and Africa, reaching more diversity in the major Neotropical drainages. The family Characidae is the most specious group among characiforms, but the relationships among this family and other families remains unclear. It is known about 1,000 species belonging to Characidae, one third distributed in 14 subfamilies, and the remaining does not have a clear phylogenetic position, and currently are included in a large group considered incertae sedis in Characidae. The subfamily Cheirodontinae comprises about 60 species, being a characid group widely distributed in the South and Central America hydrographic basins, including trans-Andean species. The genera of Cheirodontinae are currently divided in three tribes: Cheirodontini, Compsurini, and Odontostilbini. In the present work, the main goal was investigate the internal relationships of the members of Cheirodontinae through sequencing and analysis of mitochondrial (16S rRNA and Cytochrome b) and nuclear (RAG1, RAG2, and Myh6) genes. These analyses shown that Spintherobolus does not belong to the subfamily and Cheirodon stenodon, which was considered incertae sedis in Characidae, belongs to the same. Several genera are polyphyletic, mainly Odontostilbe. The trans-Andean and Andean species are the older species of the subfamily. The relationships observed in the analyses are very different of the currently accepted to Cheirodontinae and thereby it is suggested a new classification to the group. The genus Holoshesthes is considered valid and belonging to a clade jointly with the genus Aphyocheirodon and Acinocheirodon. Odontostilbe form a monophyletic clade with the species currently belonging to Serrapinnus, a new species, and Compsura heterura. The tribes Cheirodontini, Compsurini and Odontostilbini are preserved, with different compositions and a new tribe is suggested (Pseudocheirodontini) / Doutor
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Taxonomia e filogenia de algumas espécies de Mazama (Mammalia; Cervidae) da Colômbia /

Sarria Perea, Javier Adolfo. January 2012 (has links)
Orientador: Jose Mauricio Barbanti Duarte / Banca: Jeffrey Frederico Lui / Banca: Maurício Bacci Júnior / Banca: Vera Cristina Silva / Banca: Pedro Manoel Galetti Junior / Resumo: Foi feita uma revisão da taxonomia e filogenia de algumas espécies de Mazama da Colômbia. 15 animais provenientes da região caribe e da região andina colombiana foram analisados por técnicas morfométricas, citogenéticas e moleculares. Para definir morfotipos foram feitas a descrição detalhada dos padrões cromatogênicos do rosto e corpo e análises de componentes principais das medidas morfométricas. Para as analises cromossômicas, foi feita biometria cromossômica e cariotipagem de metáfases obtidas a partir de cultivos de fibroblastos. Para as análises moleculares foram construídas árvores filogenéticas pelos métodos de máxima verossimilhança e inferência bayesiana, a partir de um fragmento de 979 nucleotídeos do marcador mitocondrial citocromo b (Cytb). Os resultados mostraram que Mazama bricenii pertence a uma linhagem que divergiu precoce na evolução do grupo, confirmaram a validade taxonômica da subespécie M. cita sanctaemartae na região Caribe e de M. zetta na região entre as cordilheiras Central e Oriental, e revelaram a existência de duas espécies de Mazama novas para ciência, uma filogeneticamente relacionada a M. gouazoubira, ao norte da região andina central e outra filogeneticamente próxima de M. zetta, no maciço colombiano. Os resultados confirmam a enorme diversidade da fauna colombiana, e a necessidade de estudos visando à conservação destas espécies / Abstract: A review of the taxonomy and phylogeny of some species of Mazama from Colombia was made. 15 animals from the Caribbean region and the Colombian Andean region were analyzed by morphometric, cytogenetic and molecular techniques. Morphotypes were defined by the detailed description of facial and body chromatogenic patterns and by principal components analysis of morphometric measurements. Chromosome analyses were made by biometrics and karyotyping of metaphases from cultures of fibroblasts. For molecular analyzes, phylogenetic trees were constructed by maximum likelihood methods and Bayesian inference, from a fragment of 979 nucleotides of the mitochondrial marker cytochrome b (Cytb). The results revealed that Mazama bricenii belongs to a lineage that early diverged in evolution of the group, confirmed the taxonomic validity of M. cita sanctaemartae in the Caribbean region and M. zetta the region between the Central and Eastern cordilleras, and revealed the presence of two Mazama species new to science, the first one from the north of the central Andean region phylogenetically related to M. gouazoubira, and second from the Colombian Massif phylogenetically close to M. zetta. The results confirm the enormous diversity of the Colombian fauna and the need of studies focusing the conservation of the aforementioned species / Doutor
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Divergência genética e relacionamento filogenético em espécies de morcegos das famílias Molossidae, Phyllostamidae, Vespertilionidae e Emballonuridae baseado em análise de PCR-RFLP /

Marchesin, Sandra Regina de Carvalho. January 2006 (has links)
Orientador: Eliana Morielle-Versute / Banca: Fernando de Camargo Passos / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Guaracy Tadeu Rocha / Banca: Wagner André Pedro / Resumo: A proposta do presente trabalho foi analisar as relações de proximidade genética e evolutiva entre espécies de Chiroptera, a partir da utilização da técnica PCR-RFLP para a obtenção de dados moleculares para os genes mitocondrial 12/16S e nuclear RAG2. A variabilidade detectada no presente estudo para as diferentes espécies é extremamente importante e poderá orientar ou subsidiar estudos com diferentes finalidades. A complexidade dos táxons de Chiroptera observada em outras análises, como citogenética e morfológica também foi revelada pela análise de RFLP, reforçando a importância dessa metodologia nos estudos evolutivos do grupo. / Abstract: The aim of this study was to assess the relationships of genetic and evolutive proximity among Chiroptera species, through the obtention of molecular data through mitochondrial (12/16S) and nuclear (RAG2) genes by PCR-RFLP technique. The variability detected by this study to the different species is extremely important and can direct or subsidize studies with different purposes. The complexity of Chiroptera taxa observed in cytogenetic and morphologic analyses was also revealed by the RFLP technique, reinforcing the importance of this methodology in evolutive studies of the group. / Doutor

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