Orientadora : Profª Drª Iris Hass / Coorientadora : Profª Drª Roberto Ferreira Artoni / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba,20/03/2017 / Inclui referências : f. 44-48 / Resumo: Cromossomos B, ou cromossomos extranumerários, são elementos extras ao complemento padrão de uma espécie. Eles apresentam comportamento distinto ao complemento A e não obedecem às frequências Mendelianas, resultado de uma gametogênese desbalanceada. Em mamíferos, aproximadamente 70% dos cromossomos B descritos ocorrem na ordem Rodentia. Akodon montensis é a única espécie do gênero a apresentar cromossomos B, cuja origem ainda é desconhecida. Este trabalho teve como objetivo analisar variações morfológicas, numéricas e possíveis homologias entre os cromossomos extranumerários e o complemento A, encontrados em uma população de Akodon montensis na ilha de São Francisco do Sul, Santa Catarina. Sondas de cromossomos B inteiros para pintura cromossômica foram desenvolvidas utilizando microdissecção cromossômica, sondas de DNA repetitivo 18S, 5S e sequencia telomérica também foram utilizadas. Análises morfológicas dos cromossomos permitiram a identificação de quatro tipos de cromossomos B na população: na população. As hibridações com as sondas de cromossomos inteiros revelaram homologia entre todos os cromossomos B, mas não mostraram sinal cromossomos A. Os resultados indicam que os cromossomos B dessa população podem ter uma origem comum antiga, que resultou na variação de tamanho e morfologia observados. Palavras-chave: Rodentia, Akodon montensis, cromossomo B, DOP-PCR, FISH, pintura cromossômica. / Abstract: B chromosomes are extra chromosomes to the standard complement that occur in about 15% of eukaryotes. They present parasite behavior and do not follow Mendelain heritage patterns, resulting in an unbalanced gametogenesis. In mammals, about 70% of reported B chromosomes occur in Rodentia. Akodon montensis is a South American rodent known to host B chromosomes. The purpose of this work was to analyze morphology, frequency, and possible homologies amongst various B chromosomes found in an isolated population in São Francisco do Sul Island, Brazil. Morphological analysis identified four different B euchromatic chromosomes types. Whole chromosome probes were manufactured through microdissection of all B types singly. The rDNA 18S, 5S and telomeric probes were also employed in addition of the nucleolar organizing regions by Ag-NORs. The larger rDNA had polymorphic labeling, except for B chromosomes, whereas the 5S rDNA was located exclusively in the interstitial position of the long arm of the chromosomes 5. Whole chromosome painting with B probes by fluorescent in situ hybridization revealed homologous composition for all four types of B chromosomes in this population, but no occurrence of homologous regions in autosomal chromosomes or the sex chromosomes. These results indicate that B chromosomes in this population may have a common origin, with posterior size and morphology diversification. Key words: Rodentia, Akodon montensis, B chromosome, DOP-PCR, FISH, chromosome painting

Orientador: Sergio de Freitas / Coorientador: Sérgio Antonio de Bortoli / Banca: Nilza Maria Martinelli / Banca: Marielle Cristina Schneider / Resumo: A família Chrysopidae, pertencente à ordem Neuroptera, é a mais numerosa, compreendendo mais de 1200 espécies válidas, distribuídas em várias regiões do mundo, principalmente na Neotropical. A classificação desta família em gêneros e espécies é baseada em estudos da morfologia externa e da genitália de machos e fêmeas adultos. No entanto tem-se buscado novas metodologias para auxiliar tanto na taxonomia, quanto no conhecimento da evolução. A citogenética é uma ferramenta bastante importante para o conhecimento da extensão da biodiversidade, pois a partir de diferenças presentes nos cromossomos podem-se distinguir grupos, bem como padrões de evolução. Assim, o objetivo deste estudo foi caracterizar citogeneticamente 18 espécies de crisopídeos de ocorrência em Jaboticabal - SP., quanto ao número diplóide, morfologia e tamanho dos cromossomos, sistema cromossômico sexual, e quando possível, analisar o comportamento meiótico. Os cromossomos foram obtidos a partir de preparações gonadais masculinas e femininas de indivíduos adultos e de embriões, submetidos à coloração convencional e fotografados com câmara MOTICAM acoplada a microscópio e software IMAGE da Motic. Das 18 espécies analisadas, somente em Chrysoperla defreitasi não foi possível observar o par heteromórfico, no entanto as demais espécies exibiram sistema sexual do tipo XY/XX. O número diplóide variou entre 2n=16 nas espécies do gênero Leucochrysa a 2n=6 em Chrysopodes delicata, e esta diferença refletiu na morfologia cromossômica e permitiu diferenciar algumas das espécies. Nas espécies em que foram obtidas células meióticas observou-se a formação de bivalentes autossômicos com quiasmas terminais e univalentes sexuais assinápticos e aquiasmáticos / Abstract: The family Chrysopidae, belonging to the Neuropteran order, is the most numerous, comprising more than 1200 valid species, distributed in various regions of the world, mainly in the Neotropical. The classification of this family into genera and species is based on the study of external morphology and male and female adults genitalia. However, new methods to assist the taxonomy and the evolution have been studied. The cytogenetic is a very important tool for to understand the extent of biodiversity, because the differences in the chromosomes can be distinguished group, and pattern of evolution. The objective of this study was to perform cytogenetic analysis of 18 species of green lacewings of occurrence in the city of Jaboticabal - SP, characterizing them as to the diploid number, shape and size of chromosomes, and when was possible, analyzed the meiotic behavior. The chromosomes preparations were obtained from adults male and female gonodals and embryos that were conventional stained and photographed with a MOTIC camera coupled in a microscope and software IMAGE from Motic. Of the 18 species analyzed, only Chrysoperla defreitasi was not possible to observe the heteromorphic pair, however the other species exhibited sexual system of the type XY / XX. The diploid number varied from 2n = 16 in the genus Leucochrysa to 2n = 6 in Chrysopodes delicata, and this difference reflected in chromosome morphology and allowed to differentiate some of the species. In the species in which meiotic cells had obtained it was possible observed the formation of autosomal bivalents with terminal chiasmata and univalents sex without chiasmata and synaptic / Mestre

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:50Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-06-27Bitstream added on 2014-11-10T11:57:54Z : No. of bitstreams: 1 000789729_20180608.pdf: 380717 bytes, checksum: 81a76f2394aacd694f3ae1e83a381c2f (MD5) Bitstreams deleted on 2018-06-11T13:00:35Z: 000789729_20180608.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-06-11T13:01:28Z : No. of bitstreams: 1 000789729.pdf: 380675 bytes, checksum: 6fd0d0d5bc0128ca33bf68fd3ce8bb05 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A doença de Chagas é uma enfermidade de natureza endêmica, com pronunciada relevância na América do Sul. Um dos principais vetores do Trypanosoma cruzi, causador desta enfermidade, é o triatomíneo Triatoma infestans. Apesar de ter sua incidência reduzida, novos casos de reinfestação apontam a dificuldade do controle vetorial sobre esta espécie devido às suas características biológicas e genéticas, indicando, assim, a importância de se compreender a variabilidade genética neste inseto. No presente trabalho, foi elaborada uma revisão com o objetivo de reunir e organizar os dados disponíveis relacionados à variabilidade genética em T. infestans, permitindo eleger os principais e mais informativos genes, assim como evidenciar os índices de variabilidade intra-populacional e inter-populacional. Complementarmente, foi estudada a variação das regiões heterocromáticas, por meio da citogenética clássica e molecular. A aplicação da técnica de bandamento-C convencional e o uso de fluorocromos em nove linhagens e a técnica de hibridização in situ fluorescente (FISH), com sondas específicas para regiões de DNA satélite em oito linhagens, permitiram observar a grande variação existente na quantidade e distribuição dessas regiões. Os resultados confirmaram a existência de dois grupos com notáveis diferenças genômicas, diferenciadas, principalmente, pela perda de material genético nas linhagens nãoandinas. A variabilidade intraespecífica observada pelas análises citogenéticas revelou uma extraordinária dinâmica genômica que ocorreu durante a dispersão desta espécie / Chagas disease is an endemic illness of great relevance in South America. Within the triatomines, Triatoma infestans is one of the most important vectors of Trypanosoma cruzi, the causative protozoan of this disease. Its incidence is controlled, but new cases of reinfestation still occur, and they indicate the difficulties of vector control for this species due to its biological and genetic characteristics. Thus, it is important to understand the genetic variability of this species of insect. In this study, we present a review of the literature in order to gather and organize the data available on genetic variability of T. infestans. This review made it possible for us to elect the most appropriate genes and highlight the rates of intra-population and inter-population variability. The variation in the heterochromatic regions was also studied using classical and molecular cytogenetics. The application of the conventional C-banding technique combined with the use of fluorochromes in nine strains, as well as the application of the fluorescent in situ hybridization technique (FISH) with specific probes for regions of DNA satellite in eight strains, all together revealed the existence of noteworthy variation in the amount and distribution of these regions. The results confirmed the existence of two groups with remarkable genomic differences, which are distinguished mainly by the loss of genetic material in non-Andean lineages. The intraspecific variability observed through cytogenetic analysis revealed the extraordinary genomic dynamics that occurred during the dispersion of T. infestans

Orientador: Maria Tercília Vilela de Azeredo Oliveira / Banca: Selma Maria Almeida Santos / Banca: Alba Regina de Abreu Lima Catelani / Banca: Débora Aparecida Pires de Campos Zuccari / Banca: Lílian Madi Ravazzi / Resumo: Os répteis sofreram redução do número de espécies desde a época em que dominavam a Terra até os dias atuais. Os quelônios são poucos estudados, principalmente quanto à sua caracterização citogenética. O presente trabalho objetivou estudar, por meio das técnicas de citogenética clássica e molecular, os cromossomos de Chelonoidis carbonaria, espécie terrestre e Phrynops geoffroanus, espécie ameaçada de extinção que vive nas margens dos rios no continente Sul Americano. As amostras de sangue foram coletadas de animais do criatório, "Reginaldo Uvo Leone", em Tabapuã-SP. Todos os procedimentos foram aprovados pelo Comitê de Ética Animal (nº 50/07-CEEA - Botucatu - SP) e pelo IBAMA/RAN (nº 14729-1). Para obter as metáfases, o sangue foi inoculado em meio de cultura de linfócitos que foram estimulados a se dividirem pela adição de fito-hemaglutina. Após esse procedimento, a colchicina foi adicionada para inibir a formação das fibras do fuso, mantendo as células em metáfase. Foram avaliados machos e fêmeas de Chelonoidis carbonaria, que apresentaram número de cromossomos igual a 2n = 52, e de Phrynops geoffroanus, descrito pela primeira vez, cujas fêmeas apresentaram 2n = 58 e os machos com 2n = 57 cromossomos. Pela metodologia de bandamento G, foi possível identificar os pares de cromossomos homólogos, e pela técnica de bandamento C, a presença de regiões de heterocromatina constitutiva em macrocromossomos e em microcromossomos. Pela impregnação com íons prata, foram detectadas Regiões Organizadoras Nucleolares (RONs) em dois microcromossomos nos machos e em apenas um microcromossomo nas fêmeas de Chelonoidis carbonaria. O mesmo padrão foi encontrado em Phrynops geoffroanus. A técnica de FISH revelou a presença dos sítios de RNAr marcados na Região Organizadora Nucleolar. O presente estudo permitiu, pelas técnicas de citogenética... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The reptiles were reduced in number of species since the time that they ruled the Earth until the present day. The turtles have been little studied, particularly regarding its cytogenetics. The present study investigated, using the techniques of classical cytogenetics and molecular chromosomes of Chelonoidis carbonaria terrestrial species and Phrynops geoffroanus, endangered species that lives along the rivers in the South American continent. Blood samples were collected from animals in the breeding Reginaldo Uvo Leone in Tabapuã-SP. All procedures were approved by the Animal Ethics Committee (nº 50/07-CEEA - Botucatu - SP) and IBAMA/RAN (nº. 14729-1). For the metaphases, the blood was inoculated into the culture medium of lymphocytes that were stimulated to divide by the addition of phyto-hemagglutinin. After this procedure, colchicine was added to inhibit the formation of spindle fibers, maintaining the cells in metaphase. We assessed male and female Chelonoidis carbonaria, which had the same number of chromosomes 2n = 52 and specimens of Phrynops geoffroanus, first described, whose females had 2n = 58 and males with 2n = 57 chromosomes. By G-banding methodology, it was possible to identify pairs of homologous chromosomes and the C banding technique, the presence of regions of constitutive heterochromatic in macrochromosomes and microchromosomes. By impregnation with silver ions were detected Nucleolar Organizer Regions (NORs) in two microchromosomes in males and females in only one of microchromosomes Chelonoidis carbonaria.The same pattern was found in Phrynops geoffroanus. The FISH technique revealed the presence of sites of rRNA marked Nucleolar Organizing Region. This study allowed for the techniques of classical and molecular cytogenetics to identify the chromosomes of males and females of Chelonoidis carbonaria and Phrynops geoffroanus, terrestrial and aquatic... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:11:54Z : No. of bitstreams: 1 lopes_at_me_jabo.pdf: 1243839 bytes, checksum: 8708fa8a3a2a924bf7100eb2b3992e01 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A família Chrysopidae, pertencente à ordem Neuroptera, é a mais numerosa, compreendendo mais de 1200 espécies válidas, distribuídas em várias regiões do mundo, principalmente na Neotropical. A classificação desta família em gêneros e espécies é baseada em estudos da morfologia externa e da genitália de machos e fêmeas adultos. No entanto tem-se buscado novas metodologias para auxiliar tanto na taxonomia, quanto no conhecimento da evolução. A citogenética é uma ferramenta bastante importante para o conhecimento da extensão da biodiversidade, pois a partir de diferenças presentes nos cromossomos podem-se distinguir grupos, bem como padrões de evolução. Assim, o objetivo deste estudo foi caracterizar citogeneticamente 18 espécies de crisopídeos de ocorrência em Jaboticabal – SP., quanto ao número diplóide, morfologia e tamanho dos cromossomos, sistema cromossômico sexual, e quando possível, analisar o comportamento meiótico. Os cromossomos foram obtidos a partir de preparações gonadais masculinas e femininas de indivíduos adultos e de embriões, submetidos à coloração convencional e fotografados com câmara MOTICAM acoplada a microscópio e software IMAGE da Motic. Das 18 espécies analisadas, somente em Chrysoperla defreitasi não foi possível observar o par heteromórfico, no entanto as demais espécies exibiram sistema sexual do tipo XY/XX. O número diplóide variou entre 2n=16 nas espécies do gênero Leucochrysa a 2n=6 em Chrysopodes delicata, e esta diferença refletiu na morfologia cromossômica e permitiu diferenciar algumas das espécies. Nas espécies em que foram obtidas células meióticas observou-se a formação de bivalentes autossômicos com quiasmas terminais e univalentes sexuais assinápticos e aquiasmáticos / The family Chrysopidae, belonging to the Neuropteran order, is the most numerous, comprising more than 1200 valid species, distributed in various regions of the world, mainly in the Neotropical. The classification of this family into genera and species is based on the study of external morphology and male and female adults genitalia. However, new methods to assist the taxonomy and the evolution have been studied. The cytogenetic is a very important tool for to understand the extent of biodiversity, because the differences in the chromosomes can be distinguished group, and pattern of evolution. The objective of this study was to perform cytogenetic analysis of 18 species of green lacewings of occurrence in the city of Jaboticabal – SP, characterizing them as to the diploid number, shape and size of chromosomes, and when was possible, analyzed the meiotic behavior. The chromosomes preparations were obtained from adults male and female gonodals and embryos that were conventional stained and photographed with a MOTIC camera coupled in a microscope and software IMAGE from Motic. Of the 18 species analyzed, only Chrysoperla defreitasi was not possible to observe the heteromorphic pair, however the other species exhibited sexual system of the type XY / XX. The diploid number varied from 2n = 16 in the genus Leucochrysa to 2n = 6 in Chrysopodes delicata, and this difference reflected in chromosome morphology and allowed to differentiate some of the species. In the species in which meiotic cells had obtained it was possible observed the formation of autosomal bivalents with terminal chiasmata and univalents sex without chiasmata and synaptic

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-18Bitstream added on 2014-06-13T20:03:23Z : No. of bitstreams: 1 cabraldemello_d_dr_botib.pdf: 1654082 bytes, checksum: 7e6b12e5a0a939210a7949c8a83f729c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O mapeamento cromossômico de seqüências repetitivas de DNA tem se mostrado uma eficiente ferramenta nos estudos comparativos e evolutivos em diversos organismos. Estudos cromossômicos com besouros da subfamília Scarabaeinae têm revelado ampla variabilidade, entretanto a análise da organização cromossômica de DNAs repetitivos neste grupo é escassa e direcionada unicamente ao mapeamento do DNA ribossomal (DNAr) 18S. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar cromossomicamente DNAs repetitivos em espécies de Scarabaeinae, utilizando bandeamentos cromossômicos e mapeamento físico cromossômico de seqüências repetitivas, incluindo famílias multigênicas de RNAr 18S, RNAr 5S e histona H3 e a fração de DNA C0t-1. Ampla variabilidade foi observada relacionada ao número/localização dos sítios de DNAr 18S, aparentemente associada a diversificação da heterocromatina. Por outro lado, os genes de RNAr 5S e histona H3, mostraram-se amplamente conservados e co-localizados em um par cromossômico, com aparente intercalação. Análises em representantes de Dichotomius revelaram conservação dos blocos de heterocromatina, entretanto com aparente compartimentalização dos mesmos. O uso da fração DNA C0t-1 confirmou o enriquecimento em DNAs repetitivos da heterocromatina, que se apresentou diversificada entre as espécies, utilizando como referência D. geminatus. Por outro lado, regiões terminais dos cromossomos apresentaram-se amplamente conservadas entre as seis espécies. Além disso, a análise da fração de DNAs repetitivos em D. geminatus indicou origem intraespecífica do cromossomo B desta espécie que possivelmente pode estar sofrendo homogeneização com seqüências encontradas no complemento A. Os resultados indicam distintos padrões de diversificação para o DNA repetitivo nos representantes de Scarabaeinae, sugerindo extensiva reorganizaçãomicrogenômica ao longo / The chromosomal mapping of repeated DNAs has been used as an efficient tool in comparative and evolutionary studies in some organism. The chromosomal studies in beetles belonging to the subfamily Scarabaeinae have revealed wide variability, although the analysis of chromosomal organization of repeated DNAs in this group is scarce and directed solely for 18S rDNA mapping. The present study aimed in chromosomal characterization of repeated DNAs in Scarabaeinae species using chromosomal banding and physical chromosome mapping of repeated sequences, including the multigene families for 18S and 5S rRNAs and H3 histone genes and the C0t-1 DNA fraction. Wide variability was observed concerning the number and location of 18S rDNA sites, apparently associated to the heterochromatin diversification. On the other hand, the 5S rRNA and H3 histone genes were widely conserved and co-located in one chromosomal pair, showing apparently interspersion. Analysis in Dichotomius representatives revealed conservation for heterochromatic blocks, although an apparent compartmentalization was observed. The use of C0t-1 DNA fraction confirmed the heterochromatin repeated DNAs enrichment, which is diversified among the species, using as reference D. geminatus. On the other hand, the terminal regions of the chromosomes were highly conserved among the six species. Moreover, the analysis of repeated DNA fraction from D. geminatus indicated intraspecific origin of a B chromosome in this species that possibly could be suffering homogenization with A complement sequences. The results indicate distinct diversification patterns for repeated DNAs in Scarabaeinae representatives, suggesting extensive microgenomic reorganization along the cladogenesis of the group

Resumo: O gênero Astyanax é um dos maiores, mais complexo e bem distribuído entre os gêneros de peixes de água doce da região Neotropical. Sua amplitude ocorrendo desde o sul da América do Norte até a região central da Argentina, faz com que ele se encontre em uma grande quantidade de ambientes diferenciados impossibilitando, muitas vezes, o fluxo genético, isolando populações e espécies. Dados morfológicos, citogenéticos e moleculares estão sendo levantados, entretanto a taxonomia do gênero continua confusa e incerta, reforçando a necessidade de um amplo estudo de sistemática molecular. Nesse sentido caracterizamos parte das espécies de Astyanax existentes para estabelecer as relações filogenéticas entre os grupos, utilizando os genes mitocondriais Citocromo B (CitB) e ATP sintetase 6 e 8 (ATPase 6/8), completamente seqüenciados apresentando 1090bp e 846pb respectivamente. Foram analisados 57 indivíduos pertencentes a 30 espécies de Astyanax, sendo oito provenientes da América Central e 22 da América do Sul, mais 7 indivíduos de 5 gêneros utilizados como grupo externo, para os genes ATPase 6/8. Obteve-se um numero menor de indivíduos para o gene CitB, 47 pertencentes a 25 espécies de Astyanax, mais 6 gêneros próximos representados cada por 1 individuo. Utilizamos os métodos de Parcimônia, Distancia, Verossimilhança e Analise Bayesiana para inferir as relações filogenéticas entre as espécies. Encontramos uma profunda diferenciação entre as da América Central e do Sul, assim como das espécies costeiras com as demais, sendo que essas são basais para todo o grupo. O alto valor de divergência das seqüências das espécies costeiras com as demais (acima de 30%) é similar a encontrada entre diferentes gêneros de Characidae, utilizando a taxa de evolução de 1,3%/ma para os genes... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The genus Astyanax is one of the largest and well distributed among the freshwater fishes from the Neotropical region. It's found since south of North America until the central region of Argentina, being founded in a lot of different environments, many times, which difficulties in maintaining the gene flux, isolating populations and species. Morphological, cytogenetically and molecular data has been arise, but the taxonomy of the genus is still confuse and uncertain, reinforcing the necessity of a broad molecular systematic study. As so, we characterized part of the existent species of Astyanax with the proposal of establish the phylogenetic relationship among the groups; we utilize the mitochondrial genes Cytocromo B (CitB) and ATP synthetase 6 and 8 (ATPase6/8), completely sequenced presenting 1090 pb and 846 pb respectively. Has been analyzed 57 individuals belonging to 30 Astyanax species, being eight from Central America and 22 from South America; plus seven individuals from five genera utilized as out-groups, this for the ATPase6/8 genes. We have a small number of individuals for the CitB gene, 47 individuals belonging to 25 Astyanax species, plus six close genera, each one witch one individual. The methods of Parcimony, Distance, Likelihood and Baysiaen analyses have been conducted to infer the phylogenetic relationship among the species. We found a significant differentiation between Central and South America species, as so between costal species and the others, being those one's basils for the all group. The high divergence found between sequences of costal species and the others (above 30%) is close to the one's founded among different genus of Characidae, utilizing the mutation rate of 1,3%/ma for the ATPase6/8 and 0,8%/ma for CitB, we reach a value around 25 ma for the separation of costal species of the... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Anderson Luis Alves / Coorientador: Patrícia P. Parise-Maltempi / Banca: Maria Rita de Cascia Barreto Netto / Banca: Marcio Cesar Chiachio / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-01Bitstream added on 2014-06-13T20:10:17Z : No. of bitstreams: 1 pozzobon_apb_me_rcla_parcial.pdf: 119339 bytes, checksum: fe941057be22a48506e9aadf4e29a203 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-25T13:01:01Z: pozzobon_apb_me_rcla_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-25T13:03:22Z : No. of bitstreams: 1 000696223_20151201.pdf: 110718 bytes, checksum: b3b89d8dbba0c78747e056094b37dc3b (MD5) Bitstreams deleted on 2015-12-01T09:08:29Z: 000696223_20151201.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-01T09:09:23Z : No. of bitstreams: 1 000696223.pdf: 670357 bytes, checksum: 9fe4afa1ab1e4b8d59d3963a7f677962 (MD5) / Agência Nacional do Petróleo, Gás Natural e Biocombustíveis (ANP) / O gênero Astyanax é um dos maiores, mais complexo e bem distribuído entre os gêneros de peixes de água doce da região Neotropical. Sua amplitude ocorrendo desde o sul da América do Norte até a região central da Argentina, faz com que ele se encontre em uma grande quantidade de ambientes diferenciados impossibilitando, muitas vezes, o fluxo genético, isolando populações e espécies. Dados morfológicos, citogenéticos e moleculares estão sendo levantados, entretanto a taxonomia do gênero continua confusa e incerta, reforçando a necessidade de um amplo estudo de sistemática molecular. Nesse sentido caracterizamos parte das espécies de Astyanax existentes para estabelecer as relações filogenéticas entre os grupos, utilizando os genes mitocondriais Citocromo B (CitB) e ATP sintetase 6 e 8 (ATPase 6/8), completamente seqüenciados apresentando 1090bp e 846pb respectivamente. Foram analisados 57 indivíduos pertencentes a 30 espécies de Astyanax, sendo oito provenientes da América Central e 22 da América do Sul, mais 7 indivíduos de 5 gêneros utilizados como grupo externo, para os genes ATPase 6/8. Obteve-se um numero menor de indivíduos para o gene CitB, 47 pertencentes a 25 espécies de Astyanax, mais 6 gêneros próximos representados cada por 1 individuo. Utilizamos os métodos de Parcimônia, Distancia, Verossimilhança e Analise Bayesiana para inferir as relações filogenéticas entre as espécies. Encontramos uma profunda diferenciação entre as da América Central e do Sul, assim como das espécies costeiras com as demais, sendo que essas são basais para todo o grupo. O alto valor de divergência das seqüências das espécies costeiras com as demais (acima de 30%) é similar a encontrada entre diferentes gêneros de Characidae, utilizando a taxa de evolução de 1,3%/ma para os genes... / The genus Astyanax is one of the largest and well distributed among the freshwater fishes from the Neotropical region. It’s found since south of North America until the central region of Argentina, being founded in a lot of different environments, many times, which difficulties in maintaining the gene flux, isolating populations and species. Morphological, cytogenetically and molecular data has been arise, but the taxonomy of the genus is still confuse and uncertain, reinforcing the necessity of a broad molecular systematic study. As so, we characterized part of the existent species of Astyanax with the proposal of establish the phylogenetic relationship among the groups; we utilize the mitochondrial genes Cytocromo B (CitB) and ATP synthetase 6 and 8 (ATPase6/8), completely sequenced presenting 1090 pb and 846 pb respectively. Has been analyzed 57 individuals belonging to 30 Astyanax species, being eight from Central America and 22 from South America; plus seven individuals from five genera utilized as out-groups, this for the ATPase6/8 genes. We have a small number of individuals for the CitB gene, 47 individuals belonging to 25 Astyanax species, plus six close genera, each one witch one individual. The methods of Parcimony, Distance, Likelihood and Baysiaen analyses have been conducted to infer the phylogenetic relationship among the species. We found a significant differentiation between Central and South America species, as so between costal species and the others, being those one’s basils for the all group. The high divergence found between sequences of costal species and the others (above 30%) is close to the one’s founded among different genus of Characidae, utilizing the mutation rate of 1,3%/ma for the ATPase6/8 and 0,8%/ma for CitB, we reach a value around 25 ma for the separation of costal species of the... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Fausto Foresti / Banca: Cláudio de Oliveira / Banca: Luis Antonio Carlos Bertollo / Banca: Artur Antonio Andreata / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Resumo: Foram analisadas onze espécies de peixes do gênero Characidium, Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2 e Characidium sp3 de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e moleculares (marcação por fluorocromos base-específicos, hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 18S e 5S, com sondas teloméricas (TTAGGG)n e com sondas para histona H1 e também microdissecção, amplificação e hibridação in situ fluorescente com sondas produzidas a partir do cromossomo sexual W e dos cromossomos B). Todas as espécies apresentaram número diplóide de 2n=50 cromossomos, com predominância dos cromossomos dos tipos meta e submetacêntricos, além da ocorrência de cromossomos supranumerários em C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi e Characidium sp3. Foi observada também a ocorrência de um sistema ZZ-ZW de cromossomos sexuais representado pelo par heteromórfico número 2 em todas as espécies, com exceção apenas de Characidium cf. zebra, que não apresentou cromossomos sexuais diferenciados. O DNAr 5S foi localizado em diferentes cromossomos entre estas espécies, mas sempre em posição intersticial dos cromossomos, reforçando a idéia de que esta localização cromossômica poderia representar alguma vantagem relacionada à organização destes genes no genoma. As RONs, identificadas pela prata, pela CMA3 e pela sonda de DNAr 18S, foram sempre localizadas em compartimentos cromossômicos distintos do DNAr 5S e estão diretamente relacionadas ao processo de diferenciação dos cromossomos Z e W,... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Eleven species of fish of the genus Characidium comprised by Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2, and Characidium sp3 from different Brazilian hydrographic basins were analyzed using basic cytogenetic (coloration with Giemsa, localization of NORs for silver nitrate marking and C-banding) and molecular techniques (for base-specific fluorochrome markings, fluorescent in situ hybridization with 18S and 5S rDNA probes, telomere probes (TTAGGG)n, and H1 histone, as well as microdissection, amplification and in situ fluorescent hybridization using probes prepared from both sex W and B chromosome). All the species presented a diploid number of 2n=50 chromosomes, with a predominance of the meta- and submetacentric types, besides the occurrence of supranumerary chromosomes in C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi, and Characidium sp3. The occurrence of a ZZ-ZW sex chromosome system represented by the heteromorphic pair number 2 in all species was observed, with the exception of Characidium cf. zebra, which did not presented differentiated sex chromosomes. The 5S rDNA marks were observed in different chromosomes among these species, but always located in an interstitial position, strengthening the idea that this chromosome location might represent some advantage related to the organization of these genes in the genome. NORs identified using Silver and CMA3, staining and 18S rDNA probe have always been located in distinct chromosome compartments when compared to 5S rDNA, showed to be directly related to the Z and W chromosome differentiation process, and is considered to play an important role in their evolution, considering that they could... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-25Bitstream added on 2014-06-13T20:20:30Z : No. of bitstreams: 1 scacchetti_pc_me_botib.pdf: 611456 bytes, checksum: 9da86fc13407eb38ca4617dc47ac3e9d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Foram analisadas citogeneticamente quatro espécies de peixes do gênero Gymnotus, G. sylvius, G. pantherinus, G. inaequilabiatus e G. cf. carapo de componentes de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e citomoleculares (coloração com os fluorocromos base-específicos CMA3 e DAPI, hibridação in fluorescente situ (FISH) com sondas de DNAr 18S e 5S, sonda teloméricas (TTAGGG)n e sonda obtida do cromossomo portador das RONs de G. carapo da bacia Amazônica por Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS) e caracterização e organização genômica do DNAr 5S). G. sylvius apresentou número diplóide de 40 cromossomos (22m+12sm+6st); G. pantherinus apresentou número diplóide de 52 cromossomos (32m+18sm+2st) e G. inaequilabiatus (42m+10sm+2a) e G. cf. carapo (38m+12sm+4st) apresentaram 54 cromossomos. O bandamento C evidenciou a marcação de pequenos blocos centroméricos em todos os cromossomos de todas as espécies, sendo, porém, detectadas algumas marcações intersticiais em G. sylvius e grandes blocos intersticiais nos cromossomos de G. inaequilabiatus, G. cf. carapo e G. pantherinus. As RONs foram identificadas em apenas um par cromossômico nas quatro espécies e foram coincidentes com a hibridação fluorescente in situ realizada com a sonda para DNAr 18S e a coloração com o fluorocromo CMA3. A hibridação com a sonda para DNAr 5S revelou marcações em até dezessete pares de cromossomos em G. inaequilabiatus e em até quinze pares em G. cf. carapo; dois pares cromossômicos em G. pantherinus e um par em G. sylvius. A hibridação com a sonda para a sequência telomérica (TTAGGG)n revelou marcações nos telômeros de todos os cromossomos dos representantes destas quatro espécies, além de blocos intersticiais no primeiro... / Four fish species of the genus Gymnotus comprised by G. sylvius, G. pantherinus, G. inaequilabiatus and G. cf. carapo from different Brazilian hydrographic basins were analyzed using classic cytogenetic (coloration with Giemsa, localization of NORs for silver nitrate marking and C-banding) and molecular cytogenetic techniques with base-specific fluorochrome DAPI and CMA3, fluorescence in situ hybridization (FISH) with probes consisting of 18S and 5S rDNA, telomeric sequences (TTAGGG)n and whole chromosome prepared by Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS) of the NOR chromosome, obtained of G. carapo from Amazon basin, as well as a characterization and genomic organization of 5S rDNA. G. sylvius presented a diploid number of 40 chromosomes (22m+12sm+6st); G. pantherinus presented a karyotype with 52 chromosomes (32m+18sm+2st) and G. inaequilabiatus (42m+10sm+2a) and G. cf. carapo (38m+12sm+4st) presented 54 chromosomes. All the species presented the constitutive heterochromatin located in the centromeric region of all chromosomes. Besides that, some interstitial marks were detected in G. sylvius and large interstitial blocks were identified at the chromosomes of G. inaequilabiatus, G. cf. carapo and G. pantherinus. NORs were identified in only one chromosome pair in all species and were coincident with the in situ hybridization using probes of 18S rDNA and the fluorochrome CMA3. FISH using the probes of 5S rDNA revealed marks up to seventeen chromosome pairs in G. inaequilabiatus and up to fifteen pairs in G. cf. carapo, two chromosome pairs in G. pantherinus and one pair in G. sylvius. The telomeric probes were localized at the telomeres of all chromosomes in the four species, as well as interstitial telomeric sequence in the first metacentric pair in G. sylvius and along the NORs in G. inaequilabiatus and G. cf. carapo. The amplification, cloning, sequencing and in situ hybridization... (Complete abstract click electronic access below)