Orientadores: Flavio Antonio Maës dos Santos, José Luís Campana Camargo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-17T21:49:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Brum_HeloisaDantas_M.pdf: 1800057 bytes, checksum: e78dd6cce97739c55589c8fa04d0c622 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: As espécies do gênero Oenocarpus que ocorrem na Amazônia Central são O. bacaba, O. bataua e O. minor e apresentam distribuição espacial diferente ao longo do gradiente topográfico da região, caracterizado pelos habitats de baixio, vertente e platô. As plântulas das três espécies são encontradas em todos os habitats. Entretanto, os adultos de O. bataua só ocorrem nos habitats de baixio, e os de O. bacaba e O. minor só são encontrados nas vertentes e platôs. O objetivo geral deste estudo foi descrever a distribuição espacial dos estádios ontogenéticos dos indivíduos de três espécies do gênero Oenocarpus e entender como estes indivíduos são afetados pelos fatores abióticos que caracterizam os habitats de baixio, vertente e platô na Amazônia Central. Em campo foram instaladas 72 parcelas de 5x50 m nos baixios, vertentes e platôs em três reservas de floresta contínua pertencentes à Área de Relevante Interesse Ecológico do Projeto Dinâmica Biológica de Fragmentos Florestas (PDBFF), a cerca de 80 Km de Manaus, AM. Os habitat se diferenciam pelas características edáficas, principalmente textura e teor de água do solo. A abertura de dossel variou pouco entre os habitats. Foram determinados cinco estádios ontogenéticos para as três espéceis: plântula, infante, juvenil, adulto imaturo e adulto reprodutivo. A distribuição espacial das espécies não foi correlacionada com nenhuma das variáveis edáficas, exceto O. bataua, que apresentou correlação positiva com o teor de água do solo a partir do estádio de juvenil. Este estudo permite afirmar que diferenças no ambiente físico da Amazônia Central podem ser importantes em escala local para a distribuição de palmeiras. Embora somente alguns estádios ontogenéticos das três espécies tenham respondido às características edáficas, a segregação espacial entre os habitats é evidente e a relação entre cada espécie e o ambiente varia com o desenvolvimento ontogenético, como uma forma de segregação de nichos em escala local, visível nos indivíduos adultos destas espécies co-genéricas / Abstract: The species of the genus Oenocarpus occurring in Central Amazon are O. bacaba, O. bataua and O. minor. They present a distinct spatial distribution along the topographic gradient of the region, characterized by lowlands, slopes and plateaus. Seedlings of this species are found in all habitats. However, adults of O. bataua only occur in lowland habitats and, by instane, O. bacaba and O. minor are found only in the slopes and plateaus. The aim of this study was to describe the spatial distribution of individuals' ontogenetic stages of three species of the genus Oenocarpus and to understand how these individuals are affected by environmental factors that typify the habitats of lowland, slope and plateau in the Central Amazon region. A total of 72 plots of 50x5 m were set up at the three habitats of three continuous forest reserves of the Biological Dynamics of Forest Fragments Project (BDFFP), located about 80 km from Manaus, AM. The three habitats can be distinguished by some soil characteristics, especially texture and water content. The canopy cover of the trhee habitats were similar. Five ontogenetic stages were determined for the three species: seedling, infant, juvenile, immature adult and reproductive adult. The patterns of spatial distribution for the three species was not correlated with any of the soil variables, except for juveniles of O. bataua, which showed a positive correlated with water content. This study allows us to assert that differences in the physical environment of Central Amazonia may be important on a local scale for the distribution of palms trees. Although only some ontogenetic stages of three species have responded to the soil characteristics, spatial segregation amongst habitats was evident and the relationship between each species and the environment varies accordantly to the ontogenetic development, as a niche segregation form on a local scale, visible in adults of this co-generic species / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Ana Maria Goulart de Azevedo Tozzi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T02:24:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigues_RodrigoSchutz_D.pdf: 9627986 bytes, checksum: e68b50bb26b5736a6c9fa737052136b6 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Acosmium Schott (Leguminosae, Papilionoideae, Sophoreae) é um gênero neotropical, constituído de 18 espécies. Em sua última revisão, o gênero foi organizado por Yakovlev em quatro seções, baseadas na relação entre o comprimento dos lacínios e o tubo do cálice, curvatura da radícula e número de estames. O objetivo geral desta tese foi avaliar a circunscrição das seções de Acosmium por meio de uma análise cladística do gênero e revisar a taxonomia das espécies reconhecidas para Acosmium. Além disso, dois trabalhos biossistemáticos foram realizados para subsidiar estes estudos. A tese foi organizada em seis capítulos: 1. Análise cladística de Acosmium para testar a monofilia do gênero e evidenciar suas relações inter e infragenéricas, comparando os resultados com os de sua última classificação. Foram avaliados 60 caracteres morfológicos, incluindo dados de morfologia de plântulas e pólen para 33 táxons pertencentes a 11 gêneros de Papilionoideae. Acosmium, conforme delimitado em sua última revisão taxonômica, se revelou um táxon não monofilético e suas espécies se distribuíram em três clados separados, os quais foram considerados como gêneros distintos: Acosmium s. str., Leptolobium V ogel e Guianodendron Schütz Rodr. & A.M.G. Azevedo. 2. Revisão taxonômica de Acosmium, abrangendo delimitação específica, nomenclatura, descrição, ilustração e chave de identificação dos táxons, além de informações sobre similaridade fenotipica, distribuição geográfica e ambientes preferenciais. Foram propostas duas mudanças de categorias taxonômicas e uma sinonimização taxonômica. Assim, para o gênero, somente uma espécie foi reconhecida, Acosmium lentiscifolium Schott, com três subespécies, que têm distribuição alopátrica provavelmente associada com eventos vicariantes na extensão de matas secas estacionais na América do Sul. 3. Revisão taxonômica de Leptolobium. O gênero é neotropical, com 11 espécies, uma das quais nova para a ciência. Foram propostas cinco combinações novas, duas sinonimizações taxonômicas e duas exclusões. 4. Descrição do gênero novo Guianodendron, constituído somente por G. praeclarum (Sandwith) Schütz Rodr. & A.M.G. Azevedo, comb. novo Este gênero é caracterizado pelas flores com pétalas auriculadas, cinco estames livres, ovário com 1(-2) óvulos e estipulas ovais. Guianodendron praeclarum ocorre na Guiana e no Brasil, onde foi registrada pela primeira vez, no estado do Amazonas. 5. Estudo da morfologia de plântulas de Acosmium, Leptolobium e Guianodendron, com o intuito de descrever e ilustrar a morfologia 2de plãntulas de alguns de seus representantes e avaliar seu potencial sistemático. Os resultados subsidiaram o reconhecimento destes três gêneros. Guianodendron destaca-se por possuir plãntulas criptohipógeas com cotilédones de reserva, enquanto que Acosmium e Leptolobium apresentam plãntulas faneroepígeas com cotilédones foliáceos, podendo ser distintos pela forma do hipocótilo, nictinastia de folíolos e cotilédones e glãndulas intercotiledonares. 6. Determinação dos números cromossômicos para alguns táxons de Acosmium e Leptolobium, com o objetivo de ampliar o conhecimento cito lógico destes gêneros. Em Acosmium, foram encontrados números cromossômicos 2n=18 (24 e 32), enquanto que, em Leptolobium, o número cromossômico foi uniformemente 2n=18. Os resultados apresentados para Acosmium e para quatro espécies de Leptolobium são as suas primeiras contagens cromossômicas / Abstract: Acosmium Schott (Leguminosae, Papilionoideae, Sophoreae) is a neotropical genus comprising 18 species. In the last revision of the genus four sections were recognized by Yakovlev, distinguished by the ratio between the length ofthe calyx teeth with the length of the calyx tube, curvature of radic1e and stamens number. The general aim of this thesis was to evaluate the circumscription of the sections of Acosmium based on a cladistic ana1ysis and to revise the taxonomy of the Acosmium species. Besides, two biosystematic surveys were carried out to achieve supplementary data. The thesis consists of six chapters: 1. Cladistic ana1ysis of Acosmium with the aim of testing the monophyly of the genus and clarifying their infrageneric relationships, comparing the results with the most recent classification of Acosmium. We investigated 60 morphological characters, including seedling morphology and pollen data for 33 taxa belonging to 11 genera of Papilionoideae. The results showed that Acosmium was not monophyletic as currently delimitated, and their species grouped into three separated clades, which were considered as distinct genera: Acosmium s. str., Leptolobium Vogel and Guianodendron Schütz Rodr. & A.M.G. Azevedo. 2. Taxonomic revision of Acosmium, inc1uding specific delimitation, nomenclature, descriptions, illustrations. and ana1ytical key, as well as information on phenotypic similarity, geographical distribution and preferred habit for the taxa. Two changes in taxonomic rank and a new synonymization were proposed. Therefore, Acosmium was reduced to a single species, Acosmium lentiscifolium, with three subspecies, which have an allopatric occurrence probably associated with vicariance of seasonally dry tropical forests in South America. 3. Taxonomic revision of Leptolobium. The genus is neotropical and comprises 11 species, one of them new. Five new combinations, two new synonymizations and two new exc1usions were proposed. 4. Description of Guianodendron, a new genus comprising a single species, G. praeclarum (Sandwith) Schütz Ródr. & A.M.G. Azevedo, comb. novo Guianodendron is characterized by its tlowers with auriculate petals, five ftee stamens, reduced ovule number, and oval or ovalelliptic marked1y nerved stipules. Guianodendron praeclarum occurs in Guyana and this work is the first record for Brazil, in Amazonas state. 5. Seedling morphology of Acosmium, Leptolobium and Guianodendron, with the aim of describing and illustrating the seedlings of these three genera and evaluating their systematic value. The results corroborated the 4recognition of three distinct genera. Guianodendron has cripto-hipogeal seedlings, while Acosmium and Leptolobium have phanero-epigeal seedlings with foliaceous cotyledons, which are distinguishable from each other by hypocotyl form, nictinasty of leaflets and cotyledons and intercotyledonary glands 6. Chromosome numbers are presented for some Acosmium and Leptolobium taxa, in order to increase the cytologicallmowledge ofboth genera. In Acosmium were found 2n=18 (24 and 32), while in Leptolobium the chromosome numbers were uniformly 2n=18. The mitotic counts presented to Acosmium and to four Leptolobium species constituted their first chromosomal counts / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Orientadores: Marcos Silveira Buckeridge, Michel Georges Albert Vincentz / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T04:13:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Brandao_AlineDias_D.pdf: 19907287 bytes, checksum: dc16cfd53b17ed55d8ab52957dcdadae (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Os jatobás (espécies pertencentes ao gênero Hymenaea, família Leguminosae) apresentam grande plasticidade fisiológica. Diferentes espécies e variedades de jatobás se adaptaram a praticamente todos os biomas tropicais brasileiros, incluindo a Floresta Amazônica, e o complexo de ecossistemas que é formado pela Mata Atlântica, Cerrado e Caatinga. Espécies do gênero possuem como principal reserva de carbono do embrião o xiloglucano, um polissacarídeo similar à celulose, mas solúvel em água devido a ramificações com xilose e galactose. Após a germinação, o xiloglucano dos cotilédones é completamente degradado, produzindo monossacarídeos livres que são rapidamente metabolizados à sacarose. A produção das enzimas de hidrólise do xiloglucano nos cotilédones é controlada pela auxina proveniente da parte aérea da planta, porém, não se sabe exatamente como esse mecanismo é controlado. O objetivo deste trabalho foi isolar cDNAs (DNA complementar) parciais dos genes da bgalactosidase - BGAL e xiloglucano endotransglicosilase ou endo-b-1,4-glucanase ¿ XET, relacionados com a degradação do xiloglucano e duas enzimas envolvidas no metabolismo da sacarose, a invertase neutra/alcalina - IN/IA e a sacarose sintase ¿ SUS, para tentar avaliar possíveis formas de controle da expressão gênica envolvidas nos mecanismos do catabolismo do xiloglucano em cotilédones de plântulas de Hymenaea courbaril. Primeiramente, foram desenhados primers com base em seqüências de espécies da família Leguminosae existentes em banco de dados para os respectivos genes. A partir daí foi possível clonar seqüências parciais de todos os genes. Utilizando a técnica de RT-PCR semi-quantitativa (semi-quantitative reverse transcription-polimerase chain reaction) foram realizadas análises da expressão nos cotilédones, folhas, hipocótilos e raízes no 45º dia após a embebição (quando ocorre a taxa máxima de mobilização do xiloglucano) a cada 6 horas em um período de 24 horas. As plântulas foram analisadas sob as seguintes condições: I) plântulas crescidas em condições naturais; II) excisão da parte aérea; III) aplicação do inibidor do transporte polar de auxina (NPA ¿ ácido naftil ftalâmico); IV) crescimento em luz contínua e V) crescimento em escuro contínuo. Observou-se que existem, basicamente, três formas de controle em resposta a auxina. Nos cotilédones, os genes responsáveis pela degradação do xiloglucano BGAL1 e XTH1, possivelmente são regulados em resposta a auxina endógena e a variação de luz, enquanto que os genes responsáveis pelo metabolismo da sacarose, AlkIN1 e SUS1 possivelmente são regulados pela disponibilidade de carbono. Nas folhas, hipocótilos e raízes o padrão de expressão variou de acordo com a disponibilidade de carbono proveniente da degradação do xiloglucano de reserva nos cotilédones. Os resultados apresentados relatam a primeira descrição do isolamento dos cDNAs, permitiram a caracterização do padrão de expressão de genes chave, envolvidos no estabelecimento de uma espécie arbórea nativa do Brasil e em conjuto com os dados de atividade enzimática possibilitaram observar que a mobilização de reserva no jatobá ocorre a nível transcricional. Através do seqüênciamento, também foi possível observar que a invertase neutra clonada da raiz do jatobá apresentou resíduos de aminoácidos que a caracterizam como invertase alcalina (AlkIN1). Diante do padrão de expressão observado para a ß-galactosidase, XTH, invertase alcalina e sacarose sintase no presente trabalho, é possível sugerir um modelo para o controle da degradação e mobilização do xiloglucano de reserva nos cotilédones sob influência da auxina endógena e da variação de luz, durante o desenvolvimento inicial nas plântulas de Hymenaea courbaril / Abstract: The jatobas (species belonging to the genus Hymenaea, family Leguminosae) display large physiological plasticity and as a consequence they have great adaptive capacity to several habitats. Different species and varieties of jatobas have adapted practically to all Brazilian tropical biomes, including the Amazon Forest and the complex of ecosystems that is formed by the Atlantic Forest, the Savannah and the Caatinga. Species of this genus contain xyloglucan as the main storage of carbon in their seeds. Xyloglucan is a polysaccharide similar to cellulose, but water soluble due to the branching with xylose and galactose. After germination, xyloglucan is completely degraded, producing free monosaccharides that are quickly metabolized to sucrose. The production of xyloglucan hydrolytic enzymes in the cotyledons is known to be controlled by auxin that comes from the shoot. However, it is not known how the mecanism is controlled. The aim of the present work was isolate partial cDNAs of the genes b-galactosidase (BGAL) and xyloglucan endo-transglycosylase or endo-b-1,4-glucanase (XET) xyloglucan degradation genes and two other genes related to sucrose metabolism (neutral/alkaline invertase - NI/AI and sucrose synthase - SUS) in order to try to evaluate possible forms of control of gene expression involved in the catabolism of xyloglucan in cotyledons of Hymenaea courbaril . Primers were designed on the basis of extant sequences obtained from databases for all genes. We guided the search by sequences obtained from species of the Leguminosae. We cloned partial sequences of genes coding BGAL, XTH, NI and SUS. Semi-quantitative RT-PCR (semi-quantitative reverse transcription-polimerase chain reaction) was used to analyze expression at the 45th day after imbibition (when the rate of mobilization is maximal) in cotyledons, leaves, hypocotyls and roots every 6 hours during 24 hours. The experimental treatments were 1) seedlings grown under natural conditions; II) seedlings with top shoot excised; III) seedlings treated with auxin transport inhibitor (NPA ¿ naphtyl phtalamic acid); IV) seedilings grown in continous light and V) seedilings grown in darkness. We observed that there are three mechanisms of response to auxin. In cotyledons the genes related to xyloglucan degradation, BGAL1 and XTH1, showed responses by auxin and light in the plant. The genes related to sucrose metabolism, AlkIN1 and SUS1, have shown responses to carbon flux. In leaves, hypocotyls and roots the gene pattern change according carbon source comes from product of storage xyloglucan degradation in cotyledons. Our results revealed the first description of cDNA isolation and allow characterize pattern of genes involved native Brazilian tree species establishment. Our results and enzymatic data obtained by other researchers suggest a transcriptional control of storage mobilization in jatoba. From the sequencing data, it was also possible to observe that neutral invertase (NI) gene cloned from roots of jatoba contains aminoacid residues that characterise the NI as an alkaline invertase (AlkIN1) instead. Based in degradation and mobilization of xyloglucan storage in cotyledons we propose an expression control model for ß-galactosidase, XTH, alkaline invertase and sucrose synthase in all analyzed tissues during early development in seedilings of Hymenaea courbaril by endogenous auxin influence and light alternance / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Fernando Roberto Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-16T17:11:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Iguatemy_MarianadeAndrade_M.pdf: 2722177 bytes, checksum: 71fd77f89fecb80cd377713f0b2887fc (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A fragmentação florestal tem como principal origem o desmatamento. Dentre suas conseqüências, os efeitos de borda se destacam. Na Mata Atlântica essa situação é grave, pois este domínio, reduzido a 7% de sua cobertura original, vem sofrendo grande pressão antrópica. Nesse cenário, esteestudo avaliou os efeitos de borda sobre a dinâmica da estrutura da comunidade de plântulas na Mata Atlântica da Reserva Biológica União-RJ. Foram realizadas comparações entre as comunidades de plântulas localizadas em bordas artificiais, formadas por dois corredores desmatados, Rede Elétrica e Gasoduto, em contraste com o Interior a mais de 400 m de qualquer borda. Plots permanentes 2x1 m foram alocados, de forma aleatória estratificada dentro de cada parcela de 20x 50 m, sendo que em cada localidade foram estabelecidas 4 parcelas em distintos sítios. Nos plots todas as plântulas foram etiquetadas e medidas (altura, diâmetro a altura do solo) a partir do ano 2000 e nos anos subseqüentes (2001, 2004, 2005). Foi observada sazonalidade de alguns eventos no banco de plântulas nas diferentes estações do ano (seca e chuvosa) em todas as localidades. Interior apresentou maior densidade e dinâmica, marcada pelos altos valores de mortalidade e recrutamento durante todo o intervalo de estudo. As bordas florestais foram mais susceptíveis a danos marcadas por altos valores de rebrotos e a ocorrência de espécies exóticas (Artocarpus heterophyllus Lam.). Além disso, foram encontradas maiores taxas de crescimento e alta heterogeneidade das variáveis e parâmetros estudados nestes locais. Gasoduto influenciou mais a comunidade de plântulas, pois apresentou redução de densidade ao longo de todo estudo. Portanto, os resultados observados sugerem que a comunidade está submetida a efeitos de borda, em que intensidade e forma podem variar ao longo do tempo. Uma vez que não houve um tamponamento destes efeitos, isto pode indicar que a manutenção dos limites artificiais perpetua localmente os efeitos de borda sobre plântulas na Reserva Biológica União / Abstract: The forest fragmentation has as main cause the deforestation. Among its consequences, the edge effects are the most prominent ones. In the Atlantic Rain forest, this situation is even more serious since this Ecosystem is reduced to 7% of its original coverage, and it has been suffering from intense human pressure. In this scenery, this study evaluated the edge effects on the dynamics of the seedling community structure at a Biological Reserve called: Reserva Biológica União-RJ. Comparisons were made between seedling communities located in artificial edges formed by two deforested corridors: power line and gas duct, in contrast with the interior of the forest, located at 400m from any edge. Permanent plots having 2x1m were placed in a stratified random manner within each 20x50m parcel. These parcels where evenly distributed between the localities, which had four parcels in each. Within the plots, all seedlings were tagged and measured (tall and stem diameter in base), from year 2000 to subsequent years (2001, 2004, 2005). It was observed seasonality of some events in the seedling bank on different seasons of the year (dry and rainy) in all localities. Interior presented higher seedling density and dynamics, due to high values of mortality and recruitment during the whole interval of the study. The forest edges were more susceptive to damage, due to high values of resprouting and the invasion of exotic species (Artocarpus heterophyllus Lam.). Moreover, it was found a major seedling growth and a high heterogeneity of the variables and parameters studied in these locations. Gas duct influenced the seedlings community more, because it presented a density reduction during all the study. Therefore, all observed results suggest that the seedling community is subjected to the edge effects, so that intensity and form can present a variation over time. Since there wasn¿t a neutralization of these effects, the results also indicate that the maintenance of artificial limits (GA and RE) locally perpetuate the edge effects on the seedlings of the Biological Reserve / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestre em Biologia Vegetal