Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:33:35Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Bruna Alicia Rafael de Paiva - 2014.pdf: 5696996 bytes, checksum: 7e1928a13da15787585830bd9a4f4ae1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:34:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Bruna Alicia Rafael de Paiva - 2014.pdf: 5696996 bytes, checksum: 7e1928a13da15787585830bd9a4f4ae1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T13:34:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Bruna Alicia Rafael de Paiva - 2014.pdf: 5696996 bytes, checksum: 7e1928a13da15787585830bd9a4f4ae1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Common bacterial blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) and Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), is one of most important bacterial etiology diseases from the common bean plant. This pathogen causes a great loss in the production, mainly in the “water” harvest, when the environmental conditions are helpful to the development of this disease and to its dissemination. Among the strategies about integrated handling of diseases, the genetic resistance is the main measure of control and, for obtaining some cultivate with lasting resistance and of notorious specter, it is important to the know the genetic pathogen diversity. The present work has the goal of studying the diversity and the genetic structure around and inside the population of Xap and Xff using the markers rep-PCR; to connect the genetic pathogen diversity with its geographical distribution inside Brazilian producing common bean plant regions. There were obtained 42 Xap and Xff isolated and four Xanthomonas isolated not pathogens of to the bean plant, originated in the States of São Paulo, Goiás, Paraná and Rio Grande do Sul. The genetic profiles obtained by primers BOX, ERIC and REP produced 12 haplotipes matched (HC), where the HC 3, specific xff, was more frequent in PR and GO, and was not found in RS. The dendrogram produced through the analysis showed that Xap, Xff and isolated not pathogens are genetically different. In the analysis of genetic structure, the total genetic diversity (Ht), among three populations was 0,2385 revealing that there was variability from a population to the other one. Higher values of the Shannon rate (0,3648) show that Xap population is more different genetically. From a total of 51 locos, 94,12 % are polymorphic, inside Xap population they are all polymorphicand inside Xff, only 18,18 % are polymorphic. The genetic differentiation coefficient (Gst = 0,5194) revealed diversity inside and among the patogenic populations, confirming AMOVA’s result, where 51,98 % of the diversity was among the populations and 48,06 % inside them. Then, the technique helped how to find differences between Xap and Xff and measure the values of genetic diversity among and inside populations. The results of this study give us much information about the pathogens diversity, which is considered useful to identify and to characterize the resistant germoplasm in a more efficient way. / O crestamento bacteriano comum, causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), é uma das doenças de etiologia bacteriana mais importantes do feijoeiro-comum. Este patógeno provoca grandes perdas na produção, principalmente na safra das “águas”, quando as condições ambientais são favoráveis ao desenvolvimento da doença e à disseminação do patógeno. Dentro das estratégias do manejo integrado de doenças, a resistência genética é a principal medida de controle, e para a obtenção de cultivares com resistência duradoura e de amplo espectro é necessário o conhecimento da diversidade genética do patógeno. O presente trabalho teve como objetivos, estudar a diversidade e a estrutura genética entre e dentro das populações de Xap e Xff usando marcadores rep-PCR; relacionar a diversidade genética do patógeno com sua distribuição geográfica dentro das regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil. Foram obtidos 42 isolados de Xap e Xff, e quatro isolados de Xanthomonas não patogênicas ao feijoeiro, oriundos dos estados de São Paulo, Goiás, Paraná e Rio Grande do Sul. Os perfis genéticos obtidos pelos primers BOX, ERIC e REP geraram 12 haplótipos combinados (HC), em que o HC 3, específico de Xff, foi mais frequente nos estados do PR e GO , porém não foi identificado no RS. O dendrograma gerado através da análise conjunta mostrou que Xap, Xff e isolados não patogênicos foram geneticamente distintos. Na análise de estruturação genética, a diversidade genética total (Ht) entre as populações foi de 0,2385, mostrando que houve variabilidade entre as populações. Valores mais altos do índice de Shannon (0,3648) revelam que a população de Xap é mais diversa geneticamente. De um total de 51 locos em todas populações, 94,12% foram polimórficos, sendo que, dentro de Xap todos foram polimórficos, e dentro de Xff apenas 18,18% foram polimórficos. O coeficiente de diferenciação genética (GST = 0,5194) revelou diversidade tanto dentro como entre as populações patogênicas, confirmando o resultado obtido pela AMOVA, em que 51,98% da diversidade está distribuída entre as populações e 48,06% dentro destas. Portanto, o uso da técnica rep-PCR permitiu diferenciar Xap e Xff e mensurar os valores de diversidade genética entre e dentro de populações. Os resultados deste estudo fornecem informações sobre a diversidade dos patógenos, o que auxiliará para melhor identificar e caracterizar o germoplasma resistente.

A Cryptomeria japonica D. Don. "elegans" é uma conífera pertencente à família Taxodiaceae, que apresenta crescimento rápido e boas respostas à fertilização. Dez variações nas concentrações de nitrato e amônio presentes no meio de cultura MS foram realizadas no cultivo 'in vitro' de brotações obtidas a partir de explantes primários de ápices caulinares durante 90 dias. A cada 30 dias foram avaliados, a taxa de crescimento relativo e o incremento em massa vegetal seca. Ao final de 90 dias, foram realizadas análises dos teores de proteínas solúveis totais, aminoácidos solúveis totais, carboidratos não-estruturais totais e eletroforese de proteínas totais em gel de poliacrilamida. Os tratamentos que exibiram resultados mais satisfatórios foram utilizados em um experimento com diferentes relações auxina/citocinina, onde foram avaliadas a produção de brotações e a altura média das mesmas aos 30, 60 e 90 dias de cultivo. As concentrações de nitrato e amônio entre 25 e 31mmol.L -1 e até 5mmol.L -1, respectivamente, foram as mais efetivas para o crescimento e desenvolvimento do material vegetal cultivado 'in vitro'. Durante o experimento com diferentes concentrações de ANA e BAP, foi possível observar que a produção de brotações, etapa essecial para um processo de micropropagação eficiente, foi superior quando as combinações entre nitrato e amônio foram 22,5 + 2,5mmol.L -1 e 25,0 + 5,0mmol.L -1. / Cryptomeria japonica D. Don. "elegans" is a fast-growing tree belonging to the Taxodiaceae and it is considered a responsive species 'in vitro'. The aim of this work was to evaluate the effect of ten different concentrations of nitrate and ammonium in morphogenesis 'in vitro' of Cryptomeria japonica D. Don. "elegans" explants. Analysis of relative growth rate, total soluble proteins, total soluble aminoacids, total non structural carbohydrates and electrophoresis of total proteins was performed in order to observe the role of different nitrogen sources on the growth and development of the explants cultivated 'in vitro'. The concentratios of nitrate and ammonium that showed the best results were selected and used in an experiment with different concentrations of NAA and BAP to observe the shoot production. Each experiment was analised at the 30 th , 60 th and 90 th days of culture. The biochemical analysis was performed only at 90 th day of cultive. Concentrations from 26 to 31mmol.L -1 of NO3 - and lower than 5mmol.L -1 of NH4 + were the most effective for growth and development of the explants. However, the experiment with different concentrations of NNA and BAP showed that the best shoot production was achieved on 22,5mmol.L -1 of NO3- + 2,5mmol.L -1 of NH4 + and on 25,0mmol.L -1 of NO3 - + 5,0mmol.L -1 of NH4 + and with 2,0mg.L -1 of BAP + 1,0mg.L -1 of NNA.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_luciana_nogueira_machado.pdf: 513011 bytes, checksum: 7c2764a3f1c5001fdbbcf496c8d8702f (MD5) Previous issue date: 2011-04-15 / The peach (Prunus persica (L) Batsch) is the predominant stone fruit around the world, but in Brazil, due to factors such as incidence of pests in orchards, low quality plant propagation material and the lack of suitable rootstocks culture, the productivity is still considered low. In this context, is necessary to develop new rootstocks of Prunus, more adapted to the ecological conditions of the Southern region of Brazil and carrying genes for pests resistance such as nematodes. In this study, microsatellite loci (SSR) were used to verify the hybrid offspring of genotypes and makers segregation in an F2 population of peach rootstocks, obtained from controlled crosses, generating data to marker-assisted selection (MAS) of new genotypes carrying genes for nematode resistance. This work was divided in two articles; the first was a paternity test to verify the paternal and maternal offspring of 13 hybrids from controlled crosses between several rootstocks and scion with desirable agronomic traits. We obtained confirmation of paternity for 11 of the 13 hybrids analyzed. Two genotypes, presumably descendants of Prunus mume as male parent, were confirmed as being generated by selfing of genotipe Aldrighi P1. In the second article, a linkage map was constructed for a population of 50 F2 plants obtained by selfing of F1 hybrid, derived from a cross between the peaches Capdeboscq‟ x Flordaguard'. The segregation of 37 SSR loci was evaluated and 11 markers showed a link, allowing us to build a map with two groups. It was found that the markers BPPCT004, CPDCT044, BPPCT034 and BPPCT002 were grouped in a manner similar to that found in the GL2 Prunus reference map. With the data obtained suggests that these SSR loci are associated with genes for resistance to Meloidogyne spp. in different mapping populations, in which case inherited from the rootstock 'Flordaguard', and may be used directly in SAM and improvement genetic peach rootstocks derived from a cross between Capdeboscq‟ x Flordaguard‟. / O pessegueiro (Prunus persica (L) Batsch) é a frutífera de caroço mais predominante em todo mundo, porém, no Brasil, devido a fatores como incidência de pragas nos pomares, baixa qualidade fitossanitária do material propagativo e falta de porta-enxertos adequados para a cultura, a produção ainda é considerada baixa. Neste contexto, existe a grande necessidade de desenvolver novos porta-enxertos de Prunus, mais adaptados as condições edafoclimáticas da Região Sul do Brasil e portadores de genes de resistência a pragas, dentre as quais os fitonematóides. No presente trabalho, locos de microssatélites (SSR) foram utilizados com o objetivo de verificar a descendência e a segregação de marcadores em genótipos híbridos da população F2 de porta-enxertos de pessegueiro, obtida a partir de cruzamento controlado, gerando dados para auxiliar na seleção assistida por marcadores (SAM) de novos genótipos portadores de genes de resistência a nematóides das galhas. Esta dissertação foi dividida em dois artigos, no primeiro, foi realizado um teste de paternidade, para verificar a descendência de 13 híbridos provenientes de diversos cruzamentos controlados entre diversos porta-enxertos e copas com características agronômicas desejáveis. Obteve-se confirmação da paternidade para 11 dos 13 híbridos analisados. Dois genótipos, supostamente descendentes de Prunus mume como parental masculino, foram confirmados como sendo gerados por autofecundação da cultivar Aldrighi. No segundo artigo, foi construído um mapa de ligação para uma população de 50 plantas F2 obtidas por autofecundação de um híbrido F1, proveniente do cruzamento entre os pessegueiros cv. Capdeboscq‟ x Flordaguard‟, onde a segregação de 37 locos SSR foi avaliada e 11 marcadores apresentaram ligação, permitindo a elaboração de um mapa com dois grupos. Verificou-se que os marcadores BPPCT004, CPDCT044, BPPCT034 e BPPCT002 foram agrupados de forma similar ao encontrado no GL2 do mapa de referência de Prunus. Com os dados obtidos, sugere-se que estes locos SSR, estejam associados a genes de resistência a Meloidogyne spp., em diferentes populações de mapeamento, sendo neste caso herdados do porta-enxerto Flordaguard‟ e poderão ser utilizados diretamente em SAM e melhoramento genético de porta-enxertos do cruzamento entre os pessegueiros cv. Capdeboscq‟ x Flordaguard‟.