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Uso de modelos de regressão aleatória na análise de dados longitudinais no melhoramento genético vegetal / Use of random regression models in longitudinal analysis data in genetic plant breedingAraújo, Simone Inoe 20 May 2005 (has links)
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Previous issue date: 2005-05-20 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os objetivos deste estudo foram analisar, via simulação de dados, o efeito de diferentes pressuposições quanto à variância dos efeitos ambientais, frente a dados com determinada estrutura de variâncias, e verificar o comportamento de diferentes estratégias de análise frente ao desbalanceamento dos dados. Foram simulados dados referentes a um teste de progênie, do cruzamento de 30 progenitores masculinos com três genitores femininos diferentes cada um, onde cada cruzamento deu origem a dez indivíduos, distribuídos em três locais diferentes. O efeito fixo de local foi gerado de forma a não apresentar diferenças estatísticas significativas. Para cada indivíduo da prole foram geradas informações fenotípicas em cinco idades diferentes. Portanto, o arquivo de dados consistiu de 1020 indivíduos no total, sendo que 900 indivíduos apresentaram registros nas cinco idades, totalizando 4500 registros de produção. Para estudar o efeito da heterogeneidade das variâncias ambientais, em modelos de regressão aleatória adotou-se, modelos que ajustaram uma função polinomial de segundo grau para o efeito genético aditivo e de ambiente permanente e que ajustaram uma função polinomial apenas para o efeito genético aditivo foram analisados, considerando-se ou não a heterogeneidade da variância do efeito de ambiente temporário, gerando-se assim, quatro diferentes modelos de regressão aleatória. Além disso, os modelos de regressão aleatória, repetibilidade e multi-característica foram avaliados sob diferentes níveis de desbalanceamento dos dados. O modelo de regressão aleatória mais adequado foi aquele que considerou a heterogeneidade de variâncias dos efeitos de ambiente permanente e temporário. Assumir pressuposições incorretas sobre a estrutura de covariância dos efeitos aleatórios do modelo conduziu à alterações nas estimativas de componentes de covariância e nas estimativas dos parâmetros genéticos. Sob desbalanceamento sem seleção, todos os modelos apresentaram estimativas de herdabilidade bastante semelhantes aos resultados obtidos quando se considerou o conjunto de dados completos. Entretanto, quando se considerou o efeito da seleção, modelos de regressão aleatória com até 10% de desbalanceamento não promoveram alterações nas estimativas de componentes de variância. / The aim of this study was to analyze the effect of assuming different assumptions about environmental variance effects to data with certain variance structure, and verify genetic parameters estimates in different analysis strategies behind unbalanced data. A progeny test data was simulated, by crossing 30 male with three different female, where each crossing originated ten individuals, distributed in three different places. The fixed effect of place was generated in order not to present significant statistical difference. For each individual offspring, phenotypic information were generated in five different ages. Then, the data consisted in a total of 1020 individuals, in what 900 of them presented information in the five ages, computing 4500 observations of production. To verify the importance of consider or not the environmental heterogeneity of variance, in random regression models, models that adjusted a second polynomial function both for the additive genetic as for the permanent environmental effect and adjusted a polynomial function only for the additive genetic effect were analyzed, considering or not the variance heterogeneity of the temporary environmental effect, then generating four different random regression models. Moreover, the single-trait random regression model, the repeatability model and the multiple-trait model were analyzed on different lost of information levels. The most adequate random regression model was the one who considered both, the variance heterogeneity of permanent environmental effect, and the temporary environmental effect. Assuming the incorrect assumptions about the covariance structure of random effects of the model, conducted to change in the covariance components estimates and in the genetic ixparameters estimates. With incomplete data, without selection, all the models presented heritability estimates very similar to the results when complete data were considered. However, when effect of selection was considered, random regression models with less or equal to 10% of lost of information didn’t conduct to change in the covariance components estimates.
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Avaliação de híbridos simples braquíticos de milho super doce (Zea mays L.) portadores do gene shrunken-2 (sh2sh2) utilizando o esquema dialélico parcial /Aragão, Carlos Alberto, 1970- January 2002 (has links)
Orientador: Norberto da Silva / Resumo: Visando avaliar o potencial produtivo de híbridos simples de milho super doce, bem como, a capacidade de combinação de vinte e cinco linhagens que lhes deram origem, através de um cruzamento dialélico parcial, foram avaliados cento e vinte híbridos, em São Manuel (SP) local 1, SAKATA/Sudameris (SP) local 2 e Arisco (GO) local 3, usando-se látice simples 11x11 com duas repetições por local. Foram tomados os dados de Produção total de espigas com palha corrigida para o estande; Produção comercial corrigida para o estande, Peso de cinco espigas comerciais com palha; Peso de cinco espigas comerciais sem palha; Produção espigas com. Sem palha, corrigida para estande e 76% de água, Comprimento de espigas; Diâmetro de espiga; Atura da planta e Altura de inserção espiga. As análises estatísticas e genéticas mostraram alta significância das interações de híbridos e capacidade geral e específica de combinação com os locais. De maneira geral observou-se maior produção para os caracteres avaliados no local 2 SAKATA/Sudameris. Comparando-se os híbridos testados com o híbrido comercial DO- 04, para todos os locais, observou-se que foi possível o desenvolvimento de híbridos simples (HS) superiores para a maioria dos caracteres avaliados. De maneira geral obteve-se uma boa combinação entre uma bom número de linhagens, sendo que para o caráter PC5Esp (76%), as melhores linhagens quanto à CGC, do grupo 1, foram 657; 750 e 656, do grupo 2, 636; 628 e 333. Foi possível indicar os seguintes híbridos específicos: (44)421x320 e (68)657x320, mostrando grande potencial para programas de melhoramento de milho doce. / Abstract: One hundred and twenty simple hybrids of super sweet corn were evaluated at São Manuel, SP (site 1), SAKATA/Sudameris, SP (site 2) and at Arisco, GO (site 3), using simple lattice 11x11 with two replications aiming to estimate the producing potential of the hybrids, as well as the combination capacity of 25 inbreds that originated them, by a partial diallel crossing. The data assessed were total husked ear production corrected for stand; commercial production corrected for stand; weight of five commercial husked ears; weight of five commercial dehusked ears; dehusked ears production corrected for stand and 76% humidity; ear length; ear diameter; plant height and height of ear insertion. The statistical and genetic analysis showed high significance of hybrids interactions and general and specific combine ability with the sites. In general, an improved production was observed for the evaluated characters at site 2 SAKATA/Sudameris. Comparing the tested hybrids with the commercial hybrid DO-04, at all the sites superior simple hybrids were developed for every evaluated character. In general, there was a good combination between a great number of inbred. For the dehusked ears production corrected for stand and 76% humidity character, the best CGC inbreds of group1 were 657; 750 e 656, and of group 2 were, 636; 628 e 333. It was possible to indicate the specific hybrids: (44)421 x 320 and (68)657 x 320, which have great potential for sweet corn breeding programs. / Doutor
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Descrição morfológica e análise da variabilidade genética para caracteres de frutos, sementes e processo germinativo associado à produtividade de óleo em matrizes de Carapa guianensis Aublet., uma meliaceae da Amazônia /Pantoja, Tammya de Figueiredo. January 2007 (has links)
Resumo: O objetivo do presente trabalho foi caracterizar a morfologia de frutos, sementes e desenvolvimento pós-seminal e estudar a divergência genética entre árvores matrizes de Carapa guianensis Aublet., em duas populações naturais no Amapá, uma em Mazagão e outra em Macapá, por meio de caracteres biométricos de frutos e sementes, processo germinativo, desenvolvimento inicial de plântulas e teor de óleo. Na descrição morfológica utilizou-se estereomicroscópio para observação das características externas dos frutos, sementes e plântulas nas diversas fases de desenvolvimento pós-seminal. A divergência genética foi avaliada pela análise de agrupamento, através do algoritmo de Tocher e do método UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtido a partir da matriz de dissimilaridade pela Distância Euclidiana. Para verificação da importância relativa de cada variável para a divergência genética utilizou-se a análise de Componentes Principais. Os frutos de C. guianensis são cápsulas septífragas, secas, deiscentes, pluriloculares, polispérmicas e subglobosas. As sementes são grandes, angulosas e convexas na região dorsal. A germinação é do tipo hipógea-criptocotiledonar e as plântulas apresentam metáfilos paripinados, hipocótilo pequeno, epicótilo glabro, sublenhoso, com duas a seis gemas axilares protegidas por catáfilos. Nos dois métodos de agrupamento as 25 árvores matrizes foram distribuídas em cinco e seis grupos, respectivamente, em Mazagão e Macapá. Oito (50%) e 12 (75%) dos 16 caracteres avaliados, repectivamente, em Mazagão e Macapá, foram considerados de pequena importância para a divergência. Dos caracteres mais importantes para a divergência, a massa de sementes, a largura de frutos e o teor de óleo foram comuns nas duas localidades. Há grande variabilidade entre as árvores matrizes de C. guianensis ...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of the work was the morphological characterization of the fruits, the seeds, the post-seminal development and to evaluate the genetic divergence among mothers trees of Carapa guianensis of two natural populations located in Amapá, one in Mazagão and another in Macapá, through biometric traits of fruits and seeds, oil production, germination process and formation of the seedlings. To morphological description, the external characteristics of the fruits, the seeds and the seedlings in various stages of postseminal development were observed in a stereomicroscopy. The genetic divergence was evaluated using clusters analysis, by the algorithm of Tocher and method of UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtained by the Euclidian Distance. To verify the relative importance of each variable for divergence was applied the analysis of Principal Components. The fruit of C. guianensis is a septicidal capsule, drought, dehiscent, plurilocular, polyspermic and subglobose. The seeds are large, angulate and convex in the back. The germination is hypogeal cryptocotilar and the seedlings have pinnate metaphylls, small hipocotyl, glabrous epicotyl, subwoody, with two or six axillary buds protected by cataphylls. In clusters analysis the 25 mother trees were distributed in five and six groups, respectively, in Mazagão and Macapá. Eight (50%) in Mazagão and 12 (50%) in Macapá of 16 characters evaluated were considered of presented lower importance for genetic divergence. The more important characters to the study of genetic divergence were the fresh mass of the seeds, fruit width and oil content, common in both locations. The great variability among mother trees of C. guianensis and the genetic divergence studies can xvii possibility the identification of mother trees to seed collection for use in conservation and improvement programs. / Orientador: Rinaldo Cesar de Paula / Coorientadora: Fabíola Vitti Môro / Coorientador: Fabiano Cesarino / Banca: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Mestre
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Identificação de SNPs (Single Nucleiotide Polymorphisms) no gene colina monooxigenase relacionado ao metabolismo da glicina betaína em Eucalyptus /Martin, Leonardo Curi. January 2010 (has links)
Orientador: Celso Luís Marino / Banca: Rinaldo César de Paula / Banca: Ivan de Godoy Maia / Resumo: Estresses abióticos, como a seca, podem reduzir significativamente os rendimentos no cultivo de espécies comercialmente importantes, tais como o eucalipto na produção de celulose e papel. Quando submetidas às condições de déficit hídrico, as plantas desenvolvem alguns mecanismos de defesa. As betaínas participam destes mecanismos, sendo seu soluto mais comum a glicina betaína. Esta é uma amina quaternária distribuída extensamente em diversas espécies de plantas superiores, sintetizada em elevadas taxas, tendo como função, manter a turgescência celular. A identificação e estudo de genes relacionados à tolerância à seca são importantes para os programas de melhoramento florestal. Este estudo teve por objetivo identificar SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) no gene colina monooxigenase relacionado ao metabolismo da glicina betaína em Eucalyptus. A sequência do gene em estudo foi encontrada em genomas de plantas modelos através do banco de dados GenBank, sendo as mesmas, utilizadas para a procura de similaridades no banco de dados de ESTs de eucalipto FORESTs - FAPESP. Após a constatação de homologia no banco de dados de eucalipto, foram confeccionados oito pares de "primers" para flanquear essas regiões, sendo estes, avaliados, amplificando fragmentos únicos. Depois de realizado o seqüenciamento do gene colina monooxigenase, foi utilizado a ferramenta BLAST no GenBank, confirmando com sucesso a identidade da sequência. Em seguida, as sequências foram alinhadas e os SNPs encontrados. No total, foram identificados 49 SNPs, sendo 12 em regiões codificantes e 37 em regiões UTRs e íntrons. Somente os SNPs localizados nas regiões codificantes foram utilizados neste trabalho, sendo 83,3% deles possuindo mutações sinônimas e 16,7% não-sinônimas. Em seguida, foi utilizada uma população mais abrangente composta de E. grandis... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Abiotic stress, such as drought, can reduce significantly the yield in the important commercially species crop, such as the eucalyptus in the cellulose and paper. When submitted to the water stress conditions, the plants develop some defense mechanisms. The betaines are part of these mechanisms , being their solute more common to the glycine betaine. This is a quaternary amine extensively distributed in several species of higher plants synthesized in high taxes with the function of maintaining the cellular turgescence. Identifying and studying the genes related to the drought tolerance are important for the forest improvement programs. This work aimed at identifying SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) in choline monooxygenase related to the glycine betaine in Eucalyptus. The gene sequence was found in model plants genomes through the databank GenBank, being used for searching similarities in the databank ESTs of eucalyptus FORESTs - FAPESP. After noticing homology in the eucalyptus databank, eight pairs of primers were made to amplify these regions, being evaluated, amplifying unique fragments. After the choline monooxygenase sequencing was performed, it was used the BLAST in the GenBank, confirming successfully the sequence identity. Then, the sequences were aligned and the SNPs were found. In the total, 49 SNPs were identified, being 12 in coding regions and 37 in UTRs and intron regions. Only the SNPs located in coding regions were used in this work, being 83.3% of the SNPs with synonymous mutation and 16.7% non-synonymous. Following, it was used a wider population made up of de E. grandis, E. Urophylla and the hybrid "Urograndis" to perform the SNPs genotyping, establishing the formation of 18 haplotypes and 16 possible haplotypical combinations which revealed that some genotypes were exclusive for the species E. grandis and E. urophylla. With the objective of decreasing costs... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Diversidade genética com base em dados fenotípicos avaliada em diferentes populações e linhagens avançadas de soja /Ferreira Júnior, José Arantes. January 2013 (has links)
Orientador: Antônio OrlandoDi Mauro / Coorientador: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Banca: Everton Luis Finotto / Banca: Gustavo Vitti Moro / Resumo: Atualmente, a soja destaca-se como a mais importante oleaginosa cultivada no mundo, sendo que o Brasil e os EUA se destacam como os maiores produtores mundiais. O Brasil nas últimas três décadas, apresentou aumento significativo tanto no volume de produção, quanto na produtividade desta cultura. Esta evolução é justificada pela melhoria das condições de cultivo nas diversas regiões brasileiras, mas principalmente pela obtenção de novas cultivares merolhadas. O sistema produtivo de soja do país tem exigido dos programas de melhoramento genético o desenvolvimento de cultivares precoces, com altas produtividades e resistentes as diversas doenças que ocorrem na cultura, sendo que a ferrugem asiática, destacou-se na última década como a mais importante. Dentre as várias fases de um programa de melhoramento merece destaque o planejamento e a síntese dos cruzamentos, onde informações referentes à divergência genética são fundamentais, pois estes estudos norteiam a tomada de decisão, na obtenção de populações segregantes superiores e promissoras. Apenas informações referentes à divergência genética não são suficientes para escolha de parentais para hibridação, a mesma deve vir acompanhada de informações referente ao desempenho do genótipo, quanto a algumas características desejáveis. Os capítulos seguintes apresentarão estudos sobre a divergência genética e o desempenho agronômico em genótipos de soja superiores, através da caracterização fenotípica dos mesmos. / Abstract: Today, soybean is the most important oil seed crop in the world, where Brazil and USA are the world's largest producers. In the last three decades, the Brazilian production and yield of soybean increased significantly. This evolution is justified by the improvement of growing conditions in different regions of Brazil, but mainly for the crop breeding programs. The Brazilian soybean production system has required early soybean varieties from the breeding programs with high yield and resistant to many diseases, especially the Asian rust, one of the most important disease in the last decade. Among the several steps of a breeding program, the two steps that deserve attention are the planning and synthesis of crossings, where information about genetic divergence is critical, because these studies guide the decision making to get higher and promising segregating populations. Only information regarding divergence genetic is not enough for choosing parental for hybridization, because the information must be accompanied by information about genotype performance of for some desirable characteristics. The following chapters will present studies on divergence genetic and agronomic performance in higher soybean genotypes by phenotypic characterization. / Mestre
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Estudo genético e influência de caracteres na seleção de genótipos superiores de soja /Vianna, Viviane Formice. January 2013 (has links)
Orientador: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Coorientador: Janete Apparecida Desidério / Co-orientador: Antonio Orlando Di Mauro / Banca: Ana Cristina Pinto Juhász / Banca: José Baldin Pinheiro / Banca: Ricardo Machado da Silva / Banca: Gustavo Vitti Moro / Resumo: Os programas de melhoramento de soja visam principalmente o incremento na produtividade aliado a resistência a estresses bióticos e abióticos. O objetivo deste trabalho foi a seleção de progênies portadoras de genes de resistência à ferrugem asiática da soja, com caracteres agronômicos de interesse, através de análises univariadas e multivariadas, e definir quais os principais caracteres que influenciaram no processo de seleção destes genótipos. Os experimentos foram realizados com as gerações F4 e F5 de soja conduzidos através do delineamento de blocos aumentados com testemunhas intercalares e a geração F6 por blocos casualizados com duas repetições. Foram avaliadas as principais características de interesse agronômico. Os resultados obtidos com os parâmetros genéticos identificaram maior variabilidade entre os genótipos do que dentro deles. A herdabilidade no sentido amplo e restrito entre genótipos também foi superior à herdabilidade dentro deles. A partir do índice de seleção foi possível realizar seleção entre os genótipos com ganhos principalmente nos componentes primários de produção da soja. Na análise de componentes principais na geração F4 e F5 três autovalores explicaram 85,17% e 83,82%, respectivamente, da variância contida nas informações originais, sendo caracterizados pelas variáveis número de vagens, número de sementes, produção por planta, altura da inserção da primeira vagem... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The soybean breeding programs mainly target the increase in yield coupled with resistance to biotic and abiotic stresses. The objective of this work was the selection of progenies carrying resistance genes to soybean rust with agronomic traits of interest, using univariate and multivariate analyzes, and define what the main characters that influenced the selection process of these genotypes. The experiments were performed with generations F4 and F5 soybean conducted through augmented block with check interim F6 generation and block design with two replications. We evaluated the main characteristics of agronomic interest. The results obtained with the parameters identified greater genetic variability among genotypes than within them. The broad-sense heritability and narrow between genotypes was also higher than the heritability within them. From the index selection was possible selection among genotypes with gains mostly in primary components of soybean production. In principal components analysis to generate F4 and F5 three eigenvalues explained 85.17% and 83.82%, respectively, of the variance contained in the original information, which are characterized by variable number of pods, number of seeds produced per plant, height first pod, plant height at maturity and weight of hundred seeds that allowed ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Avaliação de progênies interespecíficas de maracujazeiro e estaquia de espécies potenciais como porta-enxerto /Sabião, Rafael Roveri. January 2013 (has links)
Orientador: Antonio Baldo Geraldo Martins / Banca: Carlos Ruggiero / Banca: Simone Rodrigues da Silva / Resumo: O maracujá (Passiflora sp) é uma frutífera originária das Américas Tropical e Subtropical, incluindo o Brasil, que possui grande banco de variabilidade genética. Existe um potencial de crescimento do consumo de suco de maracujá, em detrimento da baixa de suco de laranja nos últimos anos, bem como a perspectiva de crescimento das indústrias processadoras do maracujá. A cultura apresenta muitos problemas fitossanitários, doenças que afetam a parte aérea e sistema radicular estão diminuindo a vida útil dos pomares, tornando-se uma cultura praticamente anual, e migrando de regiões, em busca de ambientes livres destes patógenos. Diante disso, o presente trabalho tem como objetivo avaliar progênies de cruzamentos com a espécie de maior interesse comercial (P. edulis) e a capacidade de enraizamento de sete espécies de Passiflora potenciais como porta-enxerto. No presente trabalho foram avaliados o florescimento e o crescimento de frutos de Passiflora setacea e das progênies resultantes de cruzamentos com P. edulis, e a capacidade de enraizamento de estacas de sete espécies potenciais como porta-enxertos (Passiflora alata, P. cincinnata, P. coccinea, P. gibertii, P. laurifolia, P. nitida, P. setacea), com 1 ou 2 gemas na estaca, nas concentrações de 0, 1000, 3000 e 5000 mg.L-1 em solução alcoólica de AIB. Observou-se que o híbrido RC-ed3 possui características agronômicas favoráveis, com bom florescimento e frutos de qualidade. O P. nitida mostrou superioridade de enraizamento em relação as outras espécies e com isso maior potencial de utilização como porta-enxerto / Abstract: Passion fruit (Passiflora sp) is a native fruit to the Americas Tropical and Subtropical, including Brazil, which has a large database of genetic variability. There is a potential for increase in consumption of passion fruit juice, to the detriment of orange juice low in recent years and the growth prospects of passion fruit processing industries. The culture presents many phytosanitary problems, diseases that affect the aerial part and root system are decreasing the life of orchards, making it an almost annual crop, and migrating from regions in search of free environments of these pathogens. Thus, the present study aims to evaluate progenies from crosses with the species of greatest commercial interest (P. edulis) and rooting capacity of seven potential species of Passiflora as rootstock. In the present study were evaluated flowering and fruit growth of Passiflora setacea and the progenies resulting from crosses with P. edulis, and the capacity of rooting of seven potential species as rootstocks (Passiflora alata, P. cincinnata, P. coccinea, P. gibertii, P. laurifolia, P. nitida, P. setacea), with 1 or 2 buds per cutting, at concentrations of 0, 1000, 3000 and 5000 mg.L-1 in alcoholic solution of IBA. It was observed that the hybrid RC-ed3 has favorable agronomic characteristics, good flowering and fruit quality. The P. nitida showed superiority of rooting over the other species and thus greater potential for use as rootstock / Mestre
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Estudo de variáveis ecológicas de Pratylenchus brachyurus em soja e elaboração de uma escala de notas para seleção de genótipos a campo /Figueiredo, Adriana. January 2013 (has links)
Orientador: Jaime Maia dos Santos / Banca: Arlindo Leal Boiça Júnior / Banca: Jadir Borges Pinheiro / Banca: Maria Amelia dos Santos / Banca: Pedro Luiz Martins Soares / Resumo: Nos últimos anos, as perdas causadas por Pratylenchus brachyurus em soja, no Brasil, são alarmantes, e reduções de produtividades de até 21% já foram assinaladas. A utilização de variedades resistentes de alto potencial produtivo seria a alternativa mais eficaz e mais vantajosa de manejo dessa praga. Nas avaliações usuais de resistência de genótipos, o sistema radicular das plantas é processado individualmente em laboratório para a determinação do fator de reprodução, tornando-se uma prática inviável para os programas de melhoramento das grandes empresas em função do elevado número de genótipos avaliados anualmente. Uma escala de notas para avaliação da resistência de genótipos a campo foi desenvolvida no presente estudo e adapta-se a esses casos. A escala contém seis graus de infecção variando de 0 (zero) a 5 com base na percentagem da área do sistema radicular lesionada. Também foram conduzidos ensaios com o objetivo de se estudar a influência da textura do substrato, densidade inicial do inóculo, duração do ensaio e fases do ano na reprodução de P. brachyurus em soja, tendo em vista a escolha das condições adequadas para a avaliação da resistência de genótipos a este nematoide. Este estudo foi conduzido em casa de vegetação da Estação Experimental da Monsanto do Brasil, em Morrinhos-GO, durante a safra de 2010/2011. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, seguindo o esquema fatorial 4 x 4 x 3 x 3 x 2 (4 texturas do substrato x 4 densidades iniciais do inóculo x 3 períodos...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In recent years the losses caused by Pratylenchus brachyurus on soybean in Brazil are alarming and yield reductions of up to 21% have been reported. The appropriate management of this pest using resistant materials is a relevant tool. For the evaluation of resistance root system genotypes of individual plants, samples are processed individually in laboratory for determining the reproduction factor, making it a very laborious and unviable practice improvement for large companies programs due to the high number of genotypes evaluated annually. A rating scale for assessing the strength of the field was developed for genotypes in this study and to suit these cases. The scale has six degrees of infection, ranging from 0 (zero) to 5 based on the percentage of the area of damaged root system. Also, tests were conducted with the objective of studying the influence of the texture of the substrate, the initial inoculum density, and duration of the test phase of the year in the reproduction of P. brachyurus in soybean in order to choose the conditions suitable for assessing the genotype resistance to this nematode. This study was conducted in a greenhouse at the Experimental Station of Monsanto Brazil in Morrinhos-GO, during the 2010/2011 season. The experimental design was completely randomized factorial following the 4 x 4 x 3 x 3 x 2 (4 x 4 textures substrate initial inoculum densities x 3 periods of the trial x 3 x 2 hosts stages of the year) with five replicates...(Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Crescimento e qualidade da madeira de plantas jovens de híbridos de Eucalyptus grandis x E. urophylla /Hsing, Tseng Yao. January 2013 (has links)
Orientador: Rinaldo César de Paula / Coorientador: Nadia Figueiredo de Paula / Banca: Sérgio Valiengo Valeri / Banca: Bruno Ettore Pavan / Resumo: O presente trabalho visou avaliar a produção e caracterizar a madeira de cinco híbridos de Eucalyptus grandisx E. urophylla (C1, C2, C3, C4 e C5), com 2,25 anos de idade,como subsídios ao desenvolvimento de programas de melhoramento de eucalipto. Oexperimento foi implantando no espaçamento 3,5 x 2 m, no delineamento em blocos casualizados, com 35 repetições de uma planta ("single tree plot"). Foi avaliado o diâmetro à altura do peito (DAP) de todas as plantas do experimento e a partir desta avaliação foram abatidas quatro repetições de cada clone, com DAP em torno da média. Essas árvores foram seccionadas de metro em metro para a cubagem rigorosa (determinação do volume com e sem casca) e obtidos discos de 5 cm de espessura ao longo do fuste (DAP, e a 0, 25, 50, 75 e 100% do comprimento do fuste) para determinação da densidade básica da madeira, da biomassa de madeira e de casca e para caracterização química da madeira (teor de extrativos, teor de lignina e celulose total, holocelulose e teor de cinzas). Também foi quantificada a biomassa de galhos e folhas. Os dados foram submetidos à análise de variância e comparação de médias pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Os clones de E. grandis x E. urophylla diferem entre si, com destaque para o C5 com maior produção. A densidade básica da madeira é maior na base da árvore, com valores semelhantes nas demais posições do tronco. Dentre os clones, o C5 apresenta densidade básica superior ao C3 e C4, e o C2 também tem densidade superior ao C3. As características químicas da madeira variam pouco entre os clones. O clone 5 é promissor para continuidade em programas de melhoramento por apresentar tendência de superioridade aos demais clones avaliados. Apesar da idade jovem de avaliação do experimento, 2,25 anos, os clones demonstram bom potencial produtivo em Jaboticabal, SP / Abstract: The present study aimed to evaluate the production and to characterization of wood from five hybrids of Eucalyptusgrandisx E. urophylla(2.25 years old) with application in development of eucalypt improvement program. The experiment was implemented in 3.5 x 2 meters spacing in a randomized block design with 35 replications of a plant (single tree plot). We evaluated all plants with a diameter at breast height (DBH) in the experiment. From this evaluation four replicates of each clone were sampled in the average DBH. These trees were cut on each meter to guarantee rigorous cubage (volume wascalculated with and without bark). Besides it was obtained discs along the stem (DBH, and 0, 25, 50, 75 and 100% of stem length) for the determination of wood density, biomass and wood bark and chemical characterization of wood (percentage of extractives, lignin and total cellulose, holocellulose and ash content). Was also quantified the biomass of branches and leaves. Data were subjected to analysis of variance and comparison of means by Tukey's test at 5% probability. Clones of E. grandis x E. urophylla exhibited different growth highlighting the C5 with greater production. The wood density was higher in the base of tree, but it was verified similar values in other positions of the stem. Among the clones, the basic density of C5 was higher than C3 e C4 and the C2 was higher than C3. The chemical wood characteristics has showed little variation among the clones. The C5 is promising to continue in breeding programs by presenting trend of superiority to the other clones. Despite the evaluation have been performed on young plants, 2.25 years, the clones have demonstrated satisfactory reproductive potential in Jaboticabal, São Paulo state, Brazil. / Mestre
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Comparação de modelos mistos, AMMI e Eberhart-Russel via simulação no estudo da interação genótipo x ambiente em cana-de-açúcar /Ferraudo, Guilherme Moraes. January 2013 (has links)
Orientador: Dilermando Perecin / Banca: Michael Keith Butterfield / Banca: Antonio Augusto Franco Garcia / Banca: Andreia da Silva Meyer / Banca: Euclides Braga Malheiros / Resumo: O Brasil é líder mundial na produção de cana-de-açúcar e o maior exportador mundial de açúcar. O aumento da produtividade da cana-deaçúcar se deve a vários fatores sendo um dos principais a obtenção de novas cultivares e a interpretação da interação genótipo por ambiente (GEI), realizado nos estágios finais de seleção dos programas de melhoramento genético de cana-de-açúcar, torna-se essencial durante o processo de obtenção de novos cultivares. Para poder selecionar os melhores genótipos frente à GEI, os genótipos são avaliados em diversos ambientes (locais e anos) e há o interesse em saber qual o melhor genótipo, baseado no desempenho fenotípico de caracteres de interesse, como, por exemplo, a tonelada de cana por hectare (TCH), que é a principal medida de produtividade de cana-de-açúcar. Sendo a GEI um complicador para o melhorista durante a seleção de genótipos superiores, faz-se necessário a utilização de modelos matemáticos ou estatísticos que consigam identificar de maneira eficiente tais genótipos superiores. Geneticistas e biometristas tem utilizado diversos métodos, porém, não existe um consenso. Assim, neste trabalho, a partir de um estudo de simulação realizado no ambiente computacional R, apresenta-se uma comparação entre três métodos: (i) Eberhart-Russel; (ii) AMMI; (iii) e modelo misto (REML / BLUP). Verificou-se a eficiência de cada método na detecção da GEI e discutiu-se as particularidades de cada um deles do ponto de vista estatístico. No total, simularam-se sessenta e três casos os quais consideraram as mais diversas condições para a introdução da GEI, sendo que, cada um dos três métodos, avaliaram mais do que trinta e quatro milhões e vinte mil dados. Assim, a partir dos resultados encontrados neste trabalho pode-se concluir que cada método detecta a GEI de uma maneira diferente e possui suas limitações ... / Abstract: Brazil is the world leader in sugarcane production, and the largest sugar exporter. Developing new varieties is one of the main factors that contribute to yield increase, and the interpretation of genotype-by-environment interaction (GEI) at the final selection stage is an important consideration in yield estimation. In order to select the best genotypes, varieties are tested in different environments (locations and years), and breeders need to estimate the phenotypic performance for principle traits such as tons of cane yield per hectare (TCH). Since GEI affects breeder selection of superior genotypes it is necessary to use mathematical or statistical models that account for GEI and are able to efficiently identify such genotypes. Geneticists and biometricians have used different methods and there is no clear consensus of the best method. In this paper we present a comparison of three methods, viz. (i) Eberhart-Russel; (ii) AMMI; (iii) and mixed model (REML / BLUP), in a simulation study performed in the R computing environment to verify the effectiveness of each method in detecting GEI, and assess the particularities of each method from a statistical standpoint. In total, 63 cases representing different conditions were simulated, generating more than 34 million data points for analysis by each of the three methods. The results illustrated that each method detects GEI in a different way, and each has some limitations. All three methods detected GEI effectively, but the mixed model showed higher sensitivity. When applying GEI analysis in practice it is important to first verify the assumptions inherent in each model, and respect these limitations in choosing the method to be used / Doutor
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