Orientador: Ivany Ferraz Marques Valio / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-10T03:19:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Abrao_MarluciMundin_D.pdf: 2033158 bytes, checksum: 02bd87759812f0f20bce7ff1ed06a9d8 (MD5) Previous issue date: 2007 / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Orientador: Flavio Antonio Maes dos Santos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-16T20:45:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Virillo_CarolinaBernucci_D.pdf: 2082404 bytes, checksum: 73a7c246ad5ac8eccbc8fcf39ee5364b (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Os mecanismos responsáveis pela alta diversidade de espécies arbóreas em florestas tropicais têm sido alvo de intenso debate na literatura, e dentre os inúmeros mecanismos propostos, dois deles têm encontrado relativo suporte empírico: a dependência de densidade e a diferenciação de nichos. O objetivo deste trabalho foi investigar a ocorrência destes mecanismos na Floresta Ombrófila Densa Atlântica, que apresenta uma enorme diversidade de espécies vegetais, que variam em abundância, e uma grande diversidade de habitats, o que faz deste bioma um local apropriado para buscar evidências da ocorrência desses mecanismos. Foi investigada a influência da densidade de coespecíficos, da vizinhança e do microhábitat na demografia de quatro espécies arbóreas, e esperava-se que estes fatores atuassem de maneira conjunta na determinação da demografia das espécies estudadas. Em cinco áreas de 0,25 ha, duas na Floresta Ombrófila Densa de Terras Baixas (TB) e três na Floresta Ombrófila Densa Submontana (SM), foram marcados e medidos os indivíduos destas espécies, e um recenso foi realizado após dois anos para obtenção de taxas de mortalidade e recrutamento. Indivíduos com PAP (perímetro a altura do peito) > 15 cm foram acompanhados mensalmente para a avaliação da fenologia reprodutiva e do incremento diamétrico. Foi avaliada a influência da densidade de indivíduos e da distância e número de vizinhos coespecíficos na demografia das espécies. Também foi avaliada a relação da demografia com habitats específicos, dados pela declividade e pela porcentagem de abertura de dossel, assim como da fenologia reprodutiva e do incremento diamétrico com a cota de altitude e com o índice de iluminação da copa (IC). Para nenhuma das espécies estudadas foi encontrada relação entre a densidade total de indivíduos e as taxas de mortalidade e de recrutamento. Entretanto, nas áreas de maior abundância, foram encontradas associações entre os indivíduos mortos e os demais indivíduos da população, assim como diminuição da agregação conforme se considera classes de tamanho maiores, que podem ser interpretadas como evidências dos processos dependentes de densidade, indicando que os processos dependentes de distância ou densidade só se mostram importantes em situações de densidade elevada. Houve relação do número de indivíduos com a declividade para a maioria das espécies, mas foram poucas as relações significativas com a abertura de dossel. A mortalidade, o recrutamento e o crescimento dos indivíduos com PAP < 15 cm apresentaram poucas relações significativas com as variáveis ambientais (IDP e abertura do dossel), provavelmente devido ao baixo número de eventos registrados. Para duas das espécies, a fenologia reprodutiva se relacionou com a cota de altitude, mas não com o IC, indicando um aspecto da preferência de hábitat. Já o incremento diamétrico variou muito dentro de uma mesma cota altitudinal, se relacionando, para duas das espécies, com o IC, mas para as outras duas espécies nem a altitude e nem a iluminação das suas copas explicou a variação observada no crescimento. Recomenda-se que um maior número de variáveis ambientais sejam utilizadas para caracterizar os microambientes quando se busca evidências de preferências de hábitat. É provável que os mecanismos estudados não sejam mutuamente exclusivos e que eles atuem em conjunto na determinação dos processos demográficos populacionais, e assim influenciando conjuntamente na manutenção da grande diversidade de espécies arbóreas em florestas tropicais. / Abstract: The mechanisms that are responsible for the high tree species diversity in tropical forests have been intensively debated on literature, and among the several proposed mechanisms, two of them have been relatively empirically supported: the density-dependence and the niche differentiation. The aim of this work was to investigate the occurrence of these mechanisms on the Atlantic Ombrophilous Dense Forest, that has a huge plant species diversity, that vary on their abundance, and a high diversity of habitats, what makes this biome an appropriate place to seek for the existence of these mechanisms. We investigated the influence of conspecific density, neighborhood and microhabitat on the demography of four tree species, and we expected these factors to act together on determining the demography of the studied species. On five 0.25 ha area, two on the Lowland Ombrophilous Dense Forest and three on the Lower-montane Ombrophilous Dense Forest, we tagged and measured all the plants of the studied species; the plants were re-censused after two years so we obtained the mortality and recruitment rates. Plants with perimeter at breast height (PBH) > 15 cm were monthly observed to evaluate their reproductive phenology and diameter increment. We evaluated the influence of the density of plants and the number and distance of conspecific neighbors on the demography of the studied species. We also evaluated the relationship of the demographic rates with specific habitats, given by canopy openness and declivity, and of the reproductive phenology and diameter increment with the altitude and the crown illumination index (IC). We found no relationship between the total density of individuals and the mortality or recruitment rates, but on the areas of high abundance we found associations between the dead plants and the other plants of the populations, as well as lower aggregation as we considered bigger size classes, which could be interpreted as evidences of the density dependent processes, indicating that the density or distance-dependent processes are important only on high density situations. We found significant relationships between the number of individuals and declivity for the majority of species, but there were few significant associations with the canopy openness. Mortality, growth and recruitment of plants PBH < 15 cm have few significant correlations with environmental variables (declivity and canopy openness), probably because of the low number of events registered. For two of the studied species, the reproductive phenology was related to the altitude but not with IC, indicating one aspect of the habitat preference. The diameter increment showed great variation on the same altitude, and for two species it was related with IC, but for the other two neither the altitude nor the IC explained the observed variation on growth. We recommend the use of more environmental variables to characterize the microenvironments when seeking for evidence of habitat preference. It's possible that the studied mechanisms are not mutually exclusive and that they act together on determining the demographic processes, and so, influencing together the maintenance of the high tree species diversity on tropical forests. / Doutorado / Mestre em Biologia Vegetal

While ocean acidification (OA) is predicted to inhibit calcification in marine macroalgae, species whose photosynthesis is limited by current dissolved inorganic carbon (DIC) levels may benefit. Furthermore, variations in macroalgal morphology will likely give rise to a range of OA tolerance in calcifying macroalgae. One genus of calcifying macroalgae that has shown varying species’ tolerance to OA is Halimeda, a major carbonate sediment producer on tropical reefs. Species within this genus occupy a range of habitats within tropical environments (reefs and lagoons), illustrating their ability to adapt to diverse environmental conditions (e.g. carbonate chemistry, irradiance). To date it is not clear if morphological and photophysiological diversity in Halimeda will translate to different tolerances to OA conditions (elevated pCO2 and lower pH). / Includes bibliography. / Dissertation (Ph.D.)--Florida Atlantic University, 2016. / FAU Electronic Theses and Dissertations Collection

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2542048 bytes, checksum: 3cd501c8888bc3e0615e6d266c9926f1 (MD5) Previous issue date: 2014-07-16 / Studies on the grazing of forage in full sun enabled management to set goals for input and output of animals in rotational stocking, but there is no information available in the literature for interruption of regrowth in silvopastoral systems. In the face of no related to the management of grazing forage in silvopastoral systems studies, we proposed this experiment in order to determine goals of pre-grazing based on the interception of photosynthetically active radiation in Brachiaria decumbens in a silvopastoral system and monoculture for define strategies for grazing management in rotational stocking method. The experiment was conducted at the Federal University of Viçosa in an area belonging to the Department of Animal Science, Viçosa, Minas Gerais, during the period October 2013 to March 2014. The treatments consisted of four combinations of grazing frequencies based on the interception of photosynthetically active radiation (85, 90, 95 and 100%) and two production systems (monoculture and silvopastoral) in a factorial arrangement 4x2. Experimental design used was randomized complete block design with two blocks and two replicates per block. The variables height, number of cycles and range grazing, light interception by the canopy, leaf area index, mass removal and accumulation of forage and morphological components in the pre and post- grazing tiller density were evaluated provided pre-grazing. The pre-grazing heights were higher in all the targets studied in a silvopastoral system. Treatments of 90% IL showed greater number of grazing cycles and lower range of grazing compared to 95% of IL and 100% in monoculture and silvopastoral system treatments. The greater accumulation of total dry matter (16.698,8 kg ha-1 DM) was observed in 95% target of IL monoculture, as observed for the accumulation of leaf blades. Silvopastoral system in the greater accumulation of total dry matter was observed in 95% target IL (12.482,6 kg ha-1 DM). The monoculture showed higher accumulation of leaf blades in relation to silvopastoral system. The accumulation of leaf blades was lower in the 100% IL in both systems due to the increased participation of stems of forage mass treatments. In treating 100% greater increase in IL senescent forage on targets of 90% and 95% IL occurred. The monoculture showed more senescent forage that the silvopastoral system. The goals of 90 and 95% IL enabled greater tiller density than the target of 100% of IL. However, the management goals did not influence tiller density in a silvopastoral system. Monoculture provided higher tiller density than the silvopastoral system. Due to the high accumulation of total dry matter, leaf blades and greater efficiency attributed to greater removal of grazing forage pastures of Brachiaria grass should be grazed at 95% of IL in a silvopastoral system (height 40 cm) and monoculture (height 20 cm) in pre-grazing on the method of blending intermittently during the growth of the grass. / Estudos sobre manejo do pastejo das forrageiras em pleno sol possibilitaram definir metas para entrada e saída dos animais, em lotação intermitente, mas ainda não há informações disponíveis na literatura para interrupção da rebrotação em sistemas silvipastoris. Em face de não haver estudos relacionados ao manejo de forrageiras sob pastejo em sistemas silvipastoris, foi proposto este experimento com objetivo de determinar metas de pré-pastejo com base na interceptação da radiação fotossinteticamente ativa em pastos de Brachiaria decumbens em sistema silvipastoril e monocultivo, para definir estratégias de manejo do pastejo no método de lotação intermitente. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Viçosa em uma área pertencente ao Departamento de Zootecnia, Viçosa, Minas Gerais, durante o período de outubro de 2013 a março de 2014. Os tratamentos foram constituídos combinações entre quatro frequências de pastejos com base na interceptação da radiação fotossinteticamente ativa (85, 90, 95 e 100%) e dois sistemas de produção (monocultivo e silvipastoril), constituindo um arranjo fatorial 4x2. Foi utilizado delineamento experimental em blocos completos ao acaso, com dois blocos e duas repetições por bloco. Foram avaliadas as variáveis altura, número de ciclos e intervalo de pastejos, interceptação de luz pelo dossel forrageiro, índice de área da folhagem, massa, remoção e acúmulo de forragem e componentes morfológicos nas condições de pré e pós-pastejo, densidade populacional de perfilhos na condição de pré-pastejo. As alturas pré- pastejo foram maiores em todas as metas estudadas em sistema silvipastoril. Os tratamentos de 90% de IL apresentaram maior número de ciclos de pastejo e menor intervalo de pastejos em relação aos tratamentos de 95% de IL e 100% em monocultivo e sistema silvipastoril. O maior acúmulo de matéria seca total (16.698,8 kg ha-1 MS) foi observado na meta de 95% de IL em monocultivo, assim como observado para o acúmulo de lâminas foliares. No sistema silvipastoril o maior acúmulo de matéria seca total foi observado na meta de 95% de IL (12.482,6 kg ha-1 MS). O monocultivo apresentou maior acúmulo de lâminas foliares em relação ao sistema silvipastoril. O acúmulo de lâminas foliares foi menor nos tratamentos de 100% de IL em ambos sistemas em virtude da maior participação de colmos na massa de forragem. No tratamento de 100% de IL ocorreu maior incremento de forragem senescente em relação às metas de 90% e 95% de IL. O monocultivo apresentou maior quantidade de forragem senescente que o sistema silvipastoril. As metas de 90 e 95% de IL possibilitaram maior densidade populacional de perfilhos que na meta de 100% de IL. Contudo, as metas de manejo não influenciaram a densidade populacional de perfilhos no sistema silvipastoril. O monocultivo proporcionou maior densidade populacional de perfilhos que o sistema silvipastoril. Em função dos elevados acúmulos de matéria seca total, lâminas foliares e maior eficiência de pastejo atribuída a maior remoção de forragem, os pastos de capim-braquiária devem ser manejados com 95% de IL em sistema silvipastoril (altura de 40 cm) e em monocultivo (altura de 20 cm) em pré- pastejo no método de lotação intermitente durante o período de crescimento da forrageira.

Indiana University-Purdue University Indianapolis (IUPUI) / The phototropin photoreceptors are important regulators of plant growth and development and can therefore affect the photosynthetic activity of plants. Phototropin1 and Phototropin2 are versatile protein kinases that become activated when exposed to blue light. Their photobiological actions are best understood in the model plant Arabidopsis thaliana, where they are known to trigger several responses to blue light, one of which is phototropism, the bending of plant organs towards light. Additionally, phot1 and phot2 drive stomatal opening, chloroplast arrangement in leaf cells, leaf expansion, and leaf orientation. The phot1-specific response is rapid inhibition of hypocotyl growth, leaf positioning and mRNA stability whereas phot2 mediates the chloroplast avoidance response to high light. These responses impact a plant’s ability to capture light for photosynthesis, therefore the phototropins play important roles in optimizing a plant’s photosynthetic activity. Soybean (Glycine max) is a very important crop plant in Indiana known for its nutritional versatility and is also utilized for biodiesel production.In spite of soybean being a key crop, there is currently no information about the functionality of soybean phototropins. Also, being a legume, soybean has many structural and functional features that are not present in Arabidopsis. Interestingly, PsPHOT1A (a photoreceptor from garden pea) was found to be a functional phototropin as it was able to complement the phot1 mutation in Arabidopsis. The roles of these proteins in soybean will be elucidated based on the hypothesis that soybean phototropins play essential roles in regulating photosynthetic activity as do the Arabidopsis phototropins. To date, five soybean phototropins, 3 PHOT1s and 2 PHOT2s, are believed to exist. These GmPHOT protein coding regions were amplified by RT-PCR and cloned into pCR8/TOPO or pENTR-D/TOPO vectors via TOPO cloning to utilize Gateway cloning technology to create plant transformation constructs subsequently. The cloned GmPHOT cDNAs from each of the 5 GmPHOTs were sequenced and compared to the GmPHOT sequences from the Phytozome database to assess the accuracy of the gene models. The gene models of all the GmPHOTs were found to be accurate except that of GmPHOT1B-2. The high level of sequence identity between the GmPHOTs and AtPHOTs and the conservation of LOV domains and catalytic domains indicate structural resemblance between them. This suggests that soybean phototropins should encode active photoreceptors. The cloned protein coding regions from soybean were then recombined into a plant expression vector via Gateway technology,which were then used for transformation of Agrobacterium tumefaciens. These plant expression constructs will be utilized in the future to determine the functionality of soybean phototropins in Arabidopsis.