In single-case research, multiple-baseline (MB) design is the most widely used design in practical settings. It provides the opportunity to estimate the treatment effect based on not only within-series comparisons of treatment phase to baseline phase observations, but also time-specific between-series comparisons of observations from those that have started treatment to those that are still in the baseline. In MB studies, the average treatment effect and the variation of these effects across multiple participants can be estimated using various statistical modeling methods. Recently, two types of statistical modeling methods were proposed for analyzing MB studies: a) within-series model and b) between-series model. The within-series model is a typical two-level multilevel modeling approach analyzing the measurement occasions within a participant, whereas the between-series model is an alternative modeling approach analyzing participants’ measurement occasions at certain time points, where some participants are in the baseline phase and others are in the treatment phase. Parameters of both within- and between-series models are generally estimated with restricted maximum likelihood (ReML) estimation and ReML is developed based on the assumption of normality (Hox, et al., 2010; Raudenbush & Bryk, 2002). However, in practical educational and psychological settings, observed data may not be easily assumed to be normal. Therefore, the purpose of this study is to investigate the robustness of analyzing MB studies with the within- and between-series models when level-1 errors are non-normal. A Monte Carlo study was conducted under the conditions where level-1 errors were generated from non-normal distributions in which skewness and kurtosis of the distribution were manipulated. Four statistical approaches were considered for comparison based on theoretical and/or empirical rationales. The approaches were defined by the crossing of two analytic decisions: a) whether to use a within- or between-series estimate of effect and b) whether to use REML estimation with Kenward-Roger adjustment for inferences or Bayesian estimation and inference. The accuracy of parameter estimation and statistical power and Type I error were systematically analyzed. The results of the study showed the within- and between-series models are robust to the non-normality of the level-1 error variance. Both within- and between-series models estimated the treatment effect accurately and statistical inferences were acceptable. ReML and Bayesian estimations also showed similar results in the current study. Applications and implications for applied and methodology researchers are discussed based on the findings of the study.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-01-12T12:04:49Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1183163 bytes, checksum: 0b6d8fdf81146ee021d2a73b3c9b3898 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-12T12:04:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1183163 bytes, checksum: 0b6d8fdf81146ee021d2a73b3c9b3898 (MD5) Previous issue date: 2004-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Ensino Superior / Avaliou-se cinco testes de Progênies de Eucalyptus urophylla com 363 progênies, com uso do procedimento REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita / melhor predição linear não viesada) e um teste de Eucalyptus grandis com 265 progênies de treze procedências, visando a seleção com base no DAP (diâmetro à altura do peito), dos indivíduos portadores dos maiores valores genéticos preditos. Os testes de Eucalyptus urophylla foram instalados separados por procedência, em blocos ao acaso com cinco repetições e parcelas lineares de oito plantas, no espaçamento 3 x 2 metros e avaliados aos 48 meses de idade. Nas populações de melhoramento, Pomar de Sementes por Mudas (PSM), de Eucalyptus urophylla o ganho genético variou de 9,5 a 25,3 % e tamanho efetivo populacional de 58 a 224. Para a população de produção, Pomar de Sementes Clonal, o ganho genético estimado variou de 15,2 a 26,8 % com a seleção de 21 indivíduos para a recombinação. O teste de progênies Eucalyptus grandis foi instalado em delineamento de blocos ao acaso com cinco repetições e parcelas lineares de seis plantas, no espaçamento 3 x 2 metros, com as progênies aleatorizadas dentro de cada bloco independentemente das procedências. A seleção com base no DAP (diâmetro à altura do peito) propiciou um ganho genético de 16,1 % e tamanho efetivo populacional de 897 no estabelecimento do Pomar de Sementes por Mudas (PSM) e variou de 12,7 a 22,3 % para o Pomar de Sementes Clonal estabelecido com 29 indivíduos na recombinação. Visando a produção de híbridos interespecíficos foram selecionados 100 genitores de Eucalyptus urophylla e 100 de Eucalyptus grandis para cruzamentos em dialelos circulantes. Os cruzamentos entre os pares de indivíduos portadores das maiores distâncias genéticas conduzirão a um ganho genético estimado variando entre 35,7 a 38,5 %. / Five tests were carried out with 363 Eucalyptus urophylla progenies from Indonesia, and one a test with 265 Eucalyptus grandis progenies from thirteen provenances in Guanhães- MG, in order to estimate the genetic values and parent selection for the production of interspecific hybrids in controlled crosses. A complete randomized block design was used, with five replications and row plots of six Eucalyptus urophylla and eight Eucalyptus grandis plants, in a spacing of 3.0 x 2.0 m. The genetic parameters were estimated with mixed models, using the REML/BLUP procedure (restricted maximum likelihood / best linear unbiased prediction) and minimum squares, for the diameter at breast height (DAP), total height (ALT) and individual volume (VOL) characteristics. The genetic values were predicted only for the iameter at breast height (DAP) characteristics, which was aim of the selection. Heritability estimates in the restricted sense of 0.28 and accuracy in a range of 61% in Eucalyptus urophylla and of 0.23 and accuracy of 53% in Eucalyptus grandis. Were obtained the election of the 100 parents of each species individually indicates genetic gains of 20.6 % in Eucalyptus urophylla and 16.4 % in Eucalyptus grandis. The genetic gain for the diameter at breast height characteristics around 35.0% can be obtained after crosses among the first 10 plants selected from each species that are carriers of the greatest genetic divergences. / Não foi localizado o currículo lattes do autor.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-13T11:23:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1310330 bytes, checksum: 0b1fb40f1985db830fa723ed7b82aec9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-13T11:23:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1310330 bytes, checksum: 0b1fb40f1985db830fa723ed7b82aec9 (MD5) Previous issue date: 2001-11-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of the first study was to obtain genetic parameters for sequential weights of beef cattle using RRM on data sets with missing and no missing traits, and to compare these estimates with those obtained by MTM. Growth curves of Nellore cattle were analyzed using body weights measured at ages ranging from 1 day (birth weight) to 733 days. Two data samples were created: one with 71,867 records from herds with missing traits and the other with 74,601 records from herds with no missing traits. Records preadjusted to a fixed age were analyzed by a multiple trait model (MTM), which included the effects of contemporary group, age of dam class, additive direct, additive maternal, and maternal permanent environment. Analyses were by restricted maximum likelihood (REML) with 5 traits at a time. The random regression model (RRM) included the effects of age of animal, contemporary group, age of dam class, additive direct, additive maternal, permanent environment, and maternal permanent environment. Legendre cubic polynomials were used to describe the random effects. Estimates of covariances by MTM were similar for both data sets, although those from the missing data set showed more variability from age to age. The estimates from RRM were similar to those from MTM only for the complete -trait case and showed large artifacts for the case of missing traits. Estimates of additive direct-maternal correlations under RRM for some ages approached -1.0, and most likely contained artifacts. If many traits are missing, the best approach to obtaining parameters for RRM would be conversion from smoothed MTM estimates. The purpose of the second study was estimation of parameters of models and data sets as in the first study by a Bayesian methodology – Gibbs sampling, and to make comparisons with their estimates by REML. Analyses were by a Bayesian method for all 9 traits. MTM estimated covariance components and genetic parameters for birth weight and sequential weights and RRM for all ages. Estimates of additive direct variance from herds with missing traits increased from birth weight through weight at 551 to 651 days with MTM. However, this component also increased for the sample with no missing traits after this age. Additive direct and residual estimated variance with RRM increased over all ages for both samples. For MTM, additive direct and maternal heritabilities were greater from the sample with herds with missing traits than those values from herds with no missing traits. The estimates from RRM were slightly lower than those from MTM for the sample with no missing traits; however, additive maternal heritabilities from MTM were greater than those using RRM. The estimated additive direct genetic correlations for each pair of traits were slightly higher for the first age (birth weight) using MTM than RRM. The range of additive maternal genetic correlations was lower than that for additive direct genetic correlations with MTM and RRM. Due to the fact that covariance components based on RRM were inflated for herds with missing traits, MTM should be used and converted to covariance functions. As well, for analyses with standard models where inferences on shapes of parameters are not important, analyses by REML may be more robust. The first goal of the third study was to implement the genetic evaluation of weights for a large population of beef cattle using the random regression model. The second goal was to compare these evaluations with those obtained from a multitrait evaluation. Expected progeny differences (EPD) were computed by two methods: a finite method using sparse factorization (SF) and interating (IT) by preconditioned conjugate gradient (PCG). The correlations between EPDs from MTM and RRM by SF and IT were ≤ .43 until the random regressions were orthogonalized. After orthogonalization high computing requirements of RRM were reduced by removing regressions corresponding to very low eigenvalues and by replacing the random error effects with weights. Correlations between EPDs from MTM and RRM for the additive direct effect were .87, .89, .89, .87, and .86 for W1 (weight at 60 days), W2 (weight at 252 days), W3 (weight at 243 days), W5 (weight at 426 days), and W7 (weight at 601 days), respectively. The corresponding correlations for the additive maternal effect were .85, .86, .88, .85 and .84, respectively. These low correlations were mostly due to differences in variances between the models and, to a lesser degree, due to better accounting for environmental effects and more data by RRM. The RRM applied to beef weights may be poorly conditioned numerically. / O objetivo do primeiro estudo foi estimar parâmetros para pesos seqüenciais de gado de corte, por meio de modelos de regressão aleatória (RRM), em características com informações perdidas e completas. Analisaram-se curvas de crescimento de gado Nelore mediante o uso de pesos corporais coletados, do nascer aos 733 dias de idade. Duas amostras foram geradas; a primeira era constituída de 71.867 medidas provenientes de rebanhos com informações perdidas, e a segunda, de 74.601 medidas oriundas de rebanhos com informações completas. Os pesos pré-ajustados a idades fixas foram analisados por meio de um modelo de características múltiplas (MTM), cinco características por vez, no qual foram incluídos efeitos de grupo contemporâneo, classe de idade da vaca, aditivo direto, aditivo materno e ambiente materno permanente. No modelo de regressão aleatória (RRM) foram incluídos efeitos de idade do animal, grupo contemporâneo, classe de idade da vaca, aditivo direto, ambiente permanente, aditivo materno e ambiente materno permanente. Polinômios cúbicos de Legendre foram utilizados na descrição dos efeitos aleatórios. Estimativas de covariâncias por meio de MTM foram similares em ambas as amostras, apesar de as obtidas da amostra com informações perdidas terem apresentado maior variabilidade entre as idades. As estimativas obtidas pelo RRM foram similares às obtidas pelo MTM somente para o caso de características completas e mostraram grande variabilidade para o caso de características com informações perdidas. Estimativas de correlações entre os efeitos aditivos direto e materno, por meio de RRM, foram iguais a -1.0, em algumas idades. Se várias informações forem perdidas, a melhor aproximação para obter parâmetros por meio de RRM seria a conversão das estimativas obtidas por meio de MTM. O segundo estudo objetivou estimar parâmetros por meio de modelos e características com informações perdidas e completas, à semelhança do primeiro estudo, mediante metodologia Bayesiana – Gibbs sampling, e efetivar comparações com as estimativas obtidas por meio da metodologia REML. As análises por meio do MTM foram para nove características. Estimaram-se componentes de covariâncias e parâmetros genéticos para específicos pontos seqüenciais, por meio do MTM; entretanto, por meio do RRM, tais estimativas foram obtidas para todas as idades. Estimativas de variâncias aditivas diretas para a amostra com informações perdidas aumentaram, do nascer à idade de 551 a 651 dias, pelo MTM, e em todas as idades, na amostra com informações completas. Estimativas de variâncias aditiva direta e residual, mediante RRM, aumentaram ao longo de todas as idades, em ambas as amostras. Pelo MTM, heritabilidades aditivas direta e materna foram maiores na amostra de rebanhos com informações perdidas do que na de rebanhos com informações completas. As estimativas obtidas pelo RRM foram ligeiramente menores do que aquelas obtidas pelo MTM na amostra com informações completas. Heritabilidades aditivas maternas pelo MTM foram maiores do que aquelas obtidas pelo RRM. As estimativas de correlações genéticas aditivas diretas foram levemente maiores para peso ao nascer, quando se utilizou MTM do que quando se empregou RRM. A amplitude das correlações genéticas aditivas maternas foi menor do que a do efeito genético aditivo direto, pelo MTM e pelo RRM. Tendo em vista que os componentes de covariância baseados em RRM são influenciados por informações perdidas, recomendam-se o MTM e a conversão destes componentes em funções de covariância. Além disso, nas análises com modelos-padrão em que inferências dos parâmetros não são importantes, o REML deve ser escolhido. Um terceiro trabalho objetivou a implementação de avaliação genética em bovinos de corte, utilizando modelo de regressão aleatória. Além disso, as avaliações foram comparadas com aquelas estimadas por meio de um modelo de características múltiplas. Dois métodos foram considerados nas análises: um método finito, FSPAKF90 (Factorization sparse matrix package), e o de iteração nos dados, PCG ( Preconditioned conjugate gradient). As correlações entre as diferenças esperadas nas progênies (DEP), estimadas pelo MTM e pelo RRM, foram muito baixas antes de se terem as regressões aleatórias ortogonais. Grande demanda computacional dos RRM foi reduzida pela remoção das regressões correspondentes a pequenas variâncias e também pela substituição dos efeitos aleatórios do erro por específica ponderação. Correlações entre DEPs, estimadas pelo MTM e pelo RRM para efeito aditivo direto, foram .87, .89, .89, .87 e .86 para W1 (peso aos 60 dias), W2 (peso aos 152 dias), W3 (peso aos 243 dias), W5 (peso aos 426 dias) e W7 (peso aos 601 dias), respectivamente. As correlações correspondentes, para efeito aditivo materno, foram .85, .86, .88, .85 e .84, respectivamente. Estimativas obtidas pelos RRM em informações ponderais de gado de corte podem não ser adequadas, em virtude das propriedades numéricas desses modelos. Em geral, baixas correlações são devidas a diferenças em variâncias entre modelos, número insuficiente de graus de liberdade para estimar os efeitos de ambiente e informações perdidas nos RRM.

O presente estudo objetivou estimar parâmetros genéticos visando quantificar a variabilidade genética de uma população de café robusta (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) introduzida da Costa Rica e analisar o seu potencial genético para o desenvolvimento de futuras cultivares clonais para o estado de São Paulo. Outro intuito foi verificar a possibilidade de submeter essa população à seleção recorrente, tornando-a, assim, fonte de alimentação e sustentação de programas de melhoramento genético do café robusta. O experimento foi composto por 25 tratamentos, sendo 21 progênies de C. canephora e quatro cultivares de C. arabica, plantados em Mococa (SP). O delineamento experimental utilizado foi em látice balanceado 5x5 quadruplicado, com seis repetições e uma planta por parcela. Foram realizadas doze colheitas e após a sexta colheita as plantas foram podadas. Em 2004, foi realizada uma seleção fenotípica dessa população a fim de clonar os melhores indivíduos. Essa seleção resultou em novo experimento, instalado em Campinas, seguindo o delineamento de blocos ao acaso, com três repetições, 28 clones e quatro plantas por parcela, sendo realizadas cinco colheitas consecutivas. As análises estatísticas e biométricas foram realizadas considerando os modelos lineares mistos (procedimento REML/BLUP), por meio do software Selegen, cujos componentes de variância são estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML) e os valores genotípicos preditos pela melhor predição linear não viesado (BLUP). As análises mostraram que, na população em estudo, observou-se elevada variabilidade genética, passível de ser explorada tanto para a extração de clones quanto para a seleção recorrente. As adversidades climáticas severas fizeram com que a seleção fosse prejudicada. Nessa situação é preferível não considerar o período afetado e analisar os dados após a recuperação das plantas. A seleção baseada em seis colheitas forneceu estimativas de parâmetros e ganhos genéticos similares aos obtidos na seleção baseada em duas colheitas de alta produção. Os ganhos genéticos esperados nas duas formas de propagações foram elevados e a seleção clonal proporcionou maiores ganhos do que a sexual. No experimento clonal foi possível identificar materiais com potencial produtivo e que poderão vir a ser recomendados para o cultivo no estado de São Paulo. Apesar de a interação genótipos x colheitas ter sido do tipo complexa, devido ao veranico ocorrido, esta não afetou significativamente o ordenamento dos melhores clones e nem comprometeu as estimativas dos parâmetros genéticos. Os coeficientes de variação experimental e genético bem como seu valor relativo deverão ser analisados conjuntamente com o número de repetições e a acurácia seletiva. A seleção recorrente deverá ser conduzida concomitantemente com o programa de seleção clonal, a fim de evitar o esgotamento da variabilidade genética e o comprometimento do programa de melhoramento genético visando o desenvolvimento de cultivares clonais. Tendo em vista que a população inicial foi constituída por um pequeno número de progênies, é aconselhável o monitoramento do tamanho efetivo populacional e do grau de endogamia ao longo dos ciclos de seleção recorrente. / The objective of this research was to estimate genetic parameters to quantify the variability of a population of robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) introduced into Brazil from Costa Rica in 1974 aiming at determining its genetic potential for the development of clonal or seedling cultivars for the state of São Paulo, Brazil. The feasibility has also been studied to submit this population to recurrent selection, making it a continuous source of improved base material in support of varietal improvement of robusta. An experiment consisting of 21 open pollinated seedling progenies of robusta and four cultivars of arabica was established in Mococa (SP) in 1975. Yield was observed for twelve harvests and after the sixth harvest the plants were pruned. The experimental lay out was a balanced 5x5 quadruple lattice design, with six replicates and one plant per plot. In 2004 a phenotypic selection of this population for yield was carried out aiming at cloning the best individuals. These 28 clones were planted in an experiment in Campinas in 2005, following a completely randomized block design, with 28 treatments (clones), three replications and four plants per plot. In total, yields were collected over five harvests. Statistical and biometrical analyzes were performed considering the linear mixed models (REML/BLUP), through software Selegen, where the variance components are estimated by restricted maximum likelihood (REML) and genotypic values predicted by best linear unbiased prediction (BLUP). The analyzes showed that the population had high genetic variability, which can be exploited for the extraction of both clones and seedling progenies, used for recurrent selection. Selection was impaired by severe adverse weather conditions. In such situations it is preferable not to consider the affected period and analyze the data after recovery of the plants. Due to the moisture stress that occurred in the clonal trial, genotype x environment interaction was complex. However this did not affect the ranking of superior clones nor compromised the genetic parameter estimates. Selection for yield based on six yield resulted in genetic parameters and genetic gains similar to those obtained by selection based on two high yielding harvesting periods. The expected genetic gains both for clones as for open pollinated progenies were high. However, clonal selection resulted in higher genetic gains for yield than the seedling selection. In the clonal experiment it was possible to identify materials with high yield potential that may become to be recommended for cultivation in São Paulo State. The experimental, genetics and relative coefficients of variation, should be analyzed together with the number of replications and selective accuracy. Recurrent selection should be conducted concurrently with the clonal selection program in order to avoid depletion of genetic variability and to impairthe breeding program aiming at the development of clonal cultivars. Considering that the initial population was composed of a small number of progeny, it will be important monitoring adequately the effective size and the inbreeding coefficient during recurrent selection cycles.

Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2016-11-28T15:31:27Z No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-03-21T14:38:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-03-21T15:04:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T15:04:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ChristianeNGSO_DISSERT.pdf: 1139473 bytes, checksum: 48a32aaf5ee4fdeb90ab8e38a6495a3c (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / This work aims to select cowpea genotypes, green grain, which they must have characteristics that meet local consumer demands, as their agronomic performance, quality and genetic diversity. Two trials using cowpea genotypes were conducted in two seasons of 2014 at the Federal Rural University of Semi-Arid (UFERSA) in the city of Mossoro-RN. The experimental was arranged in a randomized block design with 23 genotypes e 4 replications, being twenty genotypes from Embrapa Meio-Norte and three local witnesses. The characteristics evaluated were: lodging, Number of Grains per Pod, Length of Green Pods, Mass of Green Pods, Plant Size, Number of Days to start Flowering, Number of Days for the Maturing of green pod, Green Grain Mass, Green Pod Productivity, Green Grain productivity, Grain Index; as well as the physical and chemical analysis: Soluble Solids, hydrogen potential, Chlorophyll Total, Carotenoids and Total Protein. From the mixed model methodology (REML / BLUP), by which it was made the joint analysis of the two seasons could be estimated the variance components and genetic parameters, in addition to the contribution to the genetic diversity of each feature evaluated. The MNC05-835B-15 genotypes, MNC05-841B-49 and to cultivate BRS Chiquichique had better values for the yield of green pods at both times of the experiment. For the Green Grain Productivity, the genotypes that had better performances were MNC00-595F-2, MNC-595F-27 MNC05-835B-15 and BRS Chiquichique. The MNC99-510F-16-1 and MNC02-701F-2 genotypes have better averages for the quality of Total Protein, and the best average to cultivate the EverGreen-EC-1. The MNC02-701F-2 genotypes, MNC05-841B-49, MNC05-847B-123, BRS-Aracê showed the best results in relation to the characters Soluble Solids, Total Chlorophyll and Carotenoids Total. Through UPGMA it was generated four distinct groups among the 23 genotypes of genetic dissimilarity. The variables Grain Number, Mass of Green Pods, Grains Index and Soluble Solids were those that most contributed to the diversity of genotypes / O trabalho visa selecionar genótipos de feijão-caupi, para grãos verdes, que tenham características que atendam às exigências do consumidor local, quanto ao seu desempenho agronômico, qualidade e diversidade genética. Foram conduzidos dois ensaios utilizando genótipos de feijão-caupi em duas épocas do ano de 2014 na Horta Experimental do Departamento de Ciências Vegetais da Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA), na cidade de Mossoró-RN. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso com 23 genótipos e 4 repetições, sendo vinte genótipos provenientes da Embrapa Meio-Norte e três testemunhas locais. As características avaliadas foram: Acamamento, Número de Grãos por Vagem, Comprimento de Vagens Verdes, Massa de Vagens Verdes, Porte de Planta, Número de Dias para início de Floração, Número de Dias para a Maturação da vagem verde, Massa de Grãos Verdes, Produtividade de Vagem Verde, Produtividade de Grãos Verdes, Índice de Grãos; bem como as análises físico-químicas: Sólidos Solúveis, potencial Hidrogeniônico, Clorofila Total, Carotenoides e Proteína Total. A partir da metodologia modelos mistos (REML/BLUP), através da qual foi feita a análise conjunta das duas épocas, puderam ser estimados os componentes de variância e os parâmetros genéticos, além da contribuição relativa para a diversidade genética de cada caráter avaliado. Os genótipos MNC05-835B-15, MNC05-841B-49 e a cultivar BRS Xiquexique tiveram melhores valores para a produtividade de vagens verdes nas duas épocas do experimento. Para a Produtividade de Grãos Verdes, os genótipos que obtiveram melhores desempenhos foram MNC00-595F-2, MNC-595F-27, MNC05-835B-15 e a cultivar BRS Xiquexique. Os genótipos MNC99-510F-16-1 e MNC02-701F-2 deram melhores médias para o caráter de qualidade Proteína Total, sendo a cultivar de melhor média a Sempre-Verde-CE-1. Os genótipos MNC02-701F-2, MNC05-841B-49, MNC05-847B-123, BRS-Aracê apresentaram os melhores resultados em relação aos caracteres Sólidos Solúveis, Clorofila Total e Carotenoides Totais. Através do agrupamento UPGMA, foram gerados quatro grupos distintos entre os 23 genótipos avaliados de dissimilaridade genética. As variáveis Número de Grãos, Massa de Vagens Verdes, Índice de Grãos e Sólidos Solúveis foram as que mais contribuíram para a diversidade dos genótipos avaliados / 2016-11-28

O presente estudo objetivou estimar parâmetros genéticos visando quantificar a variabilidade genética de uma população de café robusta (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) introduzida da Costa Rica e analisar o seu potencial genético para o desenvolvimento de futuras cultivares clonais para o estado de São Paulo. Outro intuito foi verificar a possibilidade de submeter essa população à seleção recorrente, tornando-a, assim, fonte de alimentação e sustentação de programas de melhoramento genético do café robusta. O experimento foi composto por 25 tratamentos, sendo 21 progênies de C. canephora e quatro cultivares de C. arabica, plantados em Mococa (SP). O delineamento experimental utilizado foi em látice balanceado 5x5 quadruplicado, com seis repetições e uma planta por parcela. Foram realizadas doze colheitas e após a sexta colheita as plantas foram podadas. Em 2004, foi realizada uma seleção fenotípica dessa população a fim de clonar os melhores indivíduos. Essa seleção resultou em novo experimento, instalado em Campinas, seguindo o delineamento de blocos ao acaso, com três repetições, 28 clones e quatro plantas por parcela, sendo realizadas cinco colheitas consecutivas. As análises estatísticas e biométricas foram realizadas considerando os modelos lineares mistos (procedimento REML/BLUP), por meio do software Selegen, cujos componentes de variância são estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML) e os valores genotípicos preditos pela melhor predição linear não viesado (BLUP). As análises mostraram que, na população em estudo, observou-se elevada variabilidade genética, passível de ser explorada tanto para a extração de clones quanto para a seleção recorrente. As adversidades climáticas severas fizeram com que a seleção fosse prejudicada. Nessa situação é preferível não considerar o período afetado e analisar os dados após a recuperação das plantas. A seleção baseada em seis colheitas forneceu estimativas de parâmetros e ganhos genéticos similares aos obtidos na seleção baseada em duas colheitas de alta produção. Os ganhos genéticos esperados nas duas formas de propagações foram elevados e a seleção clonal proporcionou maiores ganhos do que a sexual. No experimento clonal foi possível identificar materiais com potencial produtivo e que poderão vir a ser recomendados para o cultivo no estado de São Paulo. Apesar de a interação genótipos x colheitas ter sido do tipo complexa, devido ao veranico ocorrido, esta não afetou significativamente o ordenamento dos melhores clones e nem comprometeu as estimativas dos parâmetros genéticos. Os coeficientes de variação experimental e genético bem como seu valor relativo deverão ser analisados conjuntamente com o número de repetições e a acurácia seletiva. A seleção recorrente deverá ser conduzida concomitantemente com o programa de seleção clonal, a fim de evitar o esgotamento da variabilidade genética e o comprometimento do programa de melhoramento genético visando o desenvolvimento de cultivares clonais. Tendo em vista que a população inicial foi constituída por um pequeno número de progênies, é aconselhável o monitoramento do tamanho efetivo populacional e do grau de endogamia ao longo dos ciclos de seleção recorrente. / The objective of this research was to estimate genetic parameters to quantify the variability of a population of robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) introduced into Brazil from Costa Rica in 1974 aiming at determining its genetic potential for the development of clonal or seedling cultivars for the state of São Paulo, Brazil. The feasibility has also been studied to submit this population to recurrent selection, making it a continuous source of improved base material in support of varietal improvement of robusta. An experiment consisting of 21 open pollinated seedling progenies of robusta and four cultivars of arabica was established in Mococa (SP) in 1975. Yield was observed for twelve harvests and after the sixth harvest the plants were pruned. The experimental lay out was a balanced 5x5 quadruple lattice design, with six replicates and one plant per plot. In 2004 a phenotypic selection of this population for yield was carried out aiming at cloning the best individuals. These 28 clones were planted in an experiment in Campinas in 2005, following a completely randomized block design, with 28 treatments (clones), three replications and four plants per plot. In total, yields were collected over five harvests. Statistical and biometrical analyzes were performed considering the linear mixed models (REML/BLUP), through software Selegen, where the variance components are estimated by restricted maximum likelihood (REML) and genotypic values predicted by best linear unbiased prediction (BLUP). The analyzes showed that the population had high genetic variability, which can be exploited for the extraction of both clones and seedling progenies, used for recurrent selection. Selection was impaired by severe adverse weather conditions. In such situations it is preferable not to consider the affected period and analyze the data after recovery of the plants. Due to the moisture stress that occurred in the clonal trial, genotype x environment interaction was complex. However this did not affect the ranking of superior clones nor compromised the genetic parameter estimates. Selection for yield based on six yield resulted in genetic parameters and genetic gains similar to those obtained by selection based on two high yielding harvesting periods. The expected genetic gains both for clones as for open pollinated progenies were high. However, clonal selection resulted in higher genetic gains for yield than the seedling selection. In the clonal experiment it was possible to identify materials with high yield potential that may become to be recommended for cultivation in São Paulo State. The experimental, genetics and relative coefficients of variation, should be analyzed together with the number of replications and selective accuracy. Recurrent selection should be conducted concurrently with the clonal selection program in order to avoid depletion of genetic variability and to impairthe breeding program aiming at the development of clonal cultivars. Considering that the initial population was composed of a small number of progeny, it will be important monitoring adequately the effective size and the inbreeding coefficient during recurrent selection cycles.

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:15:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JarinaIAD_DISSER.pdf: 514833 bytes, checksum: 641caa6d8e62a6f321b602c8088bf35f (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Gherkin (Cucumis anguria L.) is a very common cucurbit but still underutilized in the Brazilian north-northeast. This study aimed to evaluate the genetic potential of two populations of gherkin with germplasm obtained from small farms. Hundred families half-sibs of MCE-20 (fruit with spikes) and MSE-03 (fruit without spikes) populations were evaluated in design in randomized blocks with three replications for the traits fruit weight, number of fruits per plant, longitudinal diameter, transverse diameter, format index, and soluble solids. Both populations have the potential for breeding programs to obtain plants with large fruit (> 90 g) and prolific plants. Indirect selection based on the selection of plants with higher number of fruits per plant is efficient for the selection of families with large fruit, long fruit (IF> 1.3) and prolific plants / O maxixe (Cucumis anguria L.) é uma cucurbitácea muito comum no norte-nordeste brasileiro mas ainda subutilizada. O presente trabalho teve o objetivo de avaliar o potencial genético de duas populações de maxixe obtidas com germoplasma provenientes de pequenas propriedades. Foram avaliadas cem famílias de meio-irmãos das populações MCE-20 (frutos com espículos) e MSE-03 (frutos sem espículos) em delineamento em blocos casualizado com três repetições para os caracteres peso médio do fruto, número de frutos por planta, diâmetros longitudinal e transversal, índice de formato e sólidos solúveis. As populações MCE-20 e MSE-03 têm potencial para programas de melhoramento visando obter plantas com frutos grandes (> 90 g) e prolíficas. A seleção indireta com base na seleção de plantas com maior número de frutos por plantas é eficiente para a seleção de famílias com frutos grandes, compridos (IF > 1,3) e plantas prolíficas. Palavras-chave: Cucumis anguria, parâmetros genéticos, REML-BLUP, ganho genético

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JarinaIAD_DISSER.pdf: 514833 bytes, checksum: 641caa6d8e62a6f321b602c8088bf35f (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Gherkin (Cucumis anguria L.) is a very common cucurbit but still underutilized in the Brazilian north-northeast. This study aimed to evaluate the genetic potential of two populations of gherkin with germplasm obtained from small farms. Hundred families half-sibs of MCE-20 (fruit with spikes) and MSE-03 (fruit without spikes) populations were evaluated in design in randomized blocks with three replications for the traits fruit weight, number of fruits per plant, longitudinal diameter, transverse diameter, format index, and soluble solids. Both populations have the potential for breeding programs to obtain plants with large fruit (> 90 g) and prolific plants. Indirect selection based on the selection of plants with higher number of fruits per plant is efficient for the selection of families with large fruit, long fruit (IF> 1.3) and prolific plants / O maxixe (Cucumis anguria L.) é uma cucurbitácea muito comum no norte-nordeste brasileiro mas ainda subutilizada. O presente trabalho teve o objetivo de avaliar o potencial genético de duas populações de maxixe obtidas com germoplasma provenientes de pequenas propriedades. Foram avaliadas cem famílias de meio-irmãos das populações MCE-20 (frutos com espículos) e MSE-03 (frutos sem espículos) em delineamento em blocos casualizado com três repetições para os caracteres peso médio do fruto, número de frutos por planta, diâmetros longitudinal e transversal, índice de formato e sólidos solúveis. As populações MCE-20 e MSE-03 têm potencial para programas de melhoramento visando obter plantas com frutos grandes (> 90 g) e prolíficas. A seleção indireta com base na seleção de plantas com maior número de frutos por plantas é eficiente para a seleção de famílias com frutos grandes, compridos (IF > 1,3) e plantas prolíficas. Palavras-chave: Cucumis anguria, parâmetros genéticos, REML-BLUP, ganho genético

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:40:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1030707 bytes, checksum: 38a98872217f0816409997c5432b9b0f (MD5) Previous issue date: 2013-07-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Every year, at trials called as value for cultivation and use (VCU s), new rice lines, which have potential to be recommended for the rice farmers, are inserted and evaluated, joining the remaining ones from the last year. Therefore, it is possible to evaluate the genetic progress of the important characters for the crop. This estimative indicates the effectiveness of the selection and the necessity of using new selection methods and strategy. Thus, the objective was estimating the genetic progress of agronomic characters of the irrigated rice breeding program at the state of Minas Gerais between 1998 and 2012. For this, it were evaluated the characters: productivity of grains (Kg.ha-1), 100-grain weight (g), plant height (cm), days until flowering (days), tillering(notes) andlodging (notes) of 108 rice lines of ACT s conduced at randomized block design, with three to four repetitions, at four different regions of Minas Gerais between the years of 1998 and 2012. Not all the sites were included in all crop years, according to their selective accuracy. To obtain true estimates of the genetic values it was used the technic REML/BLUP. The genotypes were evaluated at the sites in every year and between the years through the deviance analyses. After, it was estimated the environmental and genetic progress. There was a significant effect for genotype effect and of the interaction genotype x site and genotype x year. The genetic progress observed during the period was: 195,91 kg.ha-1; 0,10 g; 1,50 cm; 3,17 day; -0,01 points; and, -0,18 points, for productivity, 100-grain weight, plant height, days until flowering, tillering and lodging, respectively. Even though the results were satisfactory, new strategies should be employed, such as increase the genetic base of the program, increase of the repetition number, latice design, use of selection indexes, increase of the substitution rate and reduction of the maintaining rate of the rice lines of the program. / A cada ano, nos ensaios de valor de cultivo e uso (VCU s), são inseridas e avaliadas novas linhagens com potencial para serem recomendadas aos orizicultores, juntando-se àquelas remanescentes do ano anterior. Desta forma, é possível avaliar o progresso genético dos caracteres importantes para a cultura. Esta estimativa indica a eficácia da seleção e a necessidade do emprego de novos métodos e estratégias de seleção. Diante disso, o objetivo foi estimar o progresso genético de caracteres agronômicos no programa de melhoramento de arroz irrigado do estado de Minas Gerais entre 1998 e 2012. Para isso, foram avaliados os caracteres: produtividade de grãos (Kg.ha-1), peso de 100 grãos (g), altura de plantas (cm), dias para floração (dias), perfilhamento (nota) e acamamento (nota) de 108 linhagens dos ECA s conduzidos em delineamento de blocos casualizados, com três a quatro repetições, em quatro regiões de Minas Gerais entre os anos de 1998 e 2012. Nem todos os locais foram contemplados em todos os anos agrícolas, de acordo com a acurácia seletiva nos mesmos. Para a obtenção de estimativas fiéis dos valores genéticos foi utilizada a técnica REML/BLUP. Os genótipos foram avaliados nos locais dentro de cada ano e entre os anos pela análise de deviance. Posteriormente, foi estimado o progresso genético e ambiental. Houve efeito significativo para efeito de genótipos e das interações genótipos x locais e genótipos x anos. O progresso genético observado no período foi de foi de 195,91 kg.ha-1; 0,10 g; 1,50 cm; 3,17 dias; 0,01 pontos; e, -0,18 pontos para: produtividade de grãos, peso de 100 grãos, altura de plantas, dias para floração, acamamento e perfilhamento, respectivamente. Apesar de satisfatórios, novas estratégias devem ser empregadas, como: aumento da base genética do programa, aumento no número de repetições, delineamento em látice, utilização de índices de seleção, elevação da taxa de substituição e redução da taxa de manutenção das linhagens do programa.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-23Bitstream added on 2014-06-13T20:39:10Z : No. of bitstreams: 1 arantes_fc_me_ilha.pdf: 1168321 bytes, checksum: ea63f91d3265eeb7fda8cc1c3380e584 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Clones com alta produtividade, adaptabilidade e estabilidade a vários ambientes são imprescindíveis para o desenvolvimento da heveicultura no Brasil. O objetivo do trabalho foi selecionar progênies com maior adaptabilidade e estabilidade a partir do diâmetro da planta a 50 cm do solo (DA50) e a produção de borracha seca (PBS, a partir do teste Hamaker Morris Mann modificado), de uma população de seringueira, aos três anos de idade, plantada em três ambientes distintos (Selvíria-MS, Votuporanga-SP e Colina-SP), utilizando-se do método MHPRVG (média harmônica da performance relativa dos valores genéticos) preditos por BLUP e estimar a variabilidade genética a partir de caracteres quantitativos, tais como: altura da planta (ATP), DA50, forma da planta (FOP), sobrevivência das progênies (SOP) e PBS dos três locais, aos dois e três anos de idade, pelo procedimento REML/BLUP visando a conservação dos recursos genéticos da espécie. As sementes utilizadas na produção das mudas dos testes de progênies foram, na sua maioria, coletadas de clones de origem Asiática provenientes da coleção de clones instalada na área experimental da Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios – APTA - Polo Regional de Votuporanga, Estado de São Paulo. As progênies foram instaladas nos três locais sob o delineamento de blocos ao acaso, compostos por 30 tratamentos (progênies), três repetições e parcelas lineares de 10 plantas, no espaçamento de 3,00 x 3,00 metros, totalizando 900 plantas úteis em cada local. O método da MHPRVG propiciou um ganho genético de 12,03 a 45,65% entre 10 progênies selecionadas a partir da PBS e permitiu a seleção de progênies com alto potencial produtivo predito. As 10 melhores progênies foram oriundas dos clones GT1, PB 28/59, PR 261, RRIM 606, PB 217, IAC 41, IAC 35, PR 255, RRIM 701 e IAC 301. Os caracteres ATP, DA50, FOP, SOP e a PBS... / Clones with high yield, adaptability and stability for many environments are indispensables to the development of the rubber tree crop in Brasil. The paper objective was to select progenies with high adaptability and stability from the diameter gauges from 50 cm of height of soil (DA50) and dry rubber yield (PBS, from the Hamaker Morris Mann modified test), of genotypes from a rubber tree population, two and three years old, installed in three different locations (Selvíria-MS, Votuporanga-SP e Colina-SP), by the MHPRVG (Harmonic Average Performance Relative breeding values) method predicted by BLUP and to estimate the genetic variability from quantitative characters: total height of the plant (ATP), DA50, plant form (FOP), survival of progeny (SOP) and PBS of three locations, two and three years old, by REML/BLUP procedure, intending the genetic resources conservation of the specie. The seeds used on seedlings production of progenies tests were in majority collected on Asiatic clones origin from the clones installed in the experimental area of Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios – APTA – Votuporanga regional pole, State of São Paulo. The progenies were installed in a randomized block design of 30 treatments (progenies), three replications and 10 plants per plot, with spacing of 3,00 x 3,00 m, a total of 900 useful plants in each location. The method of MHPRVG provided a genetic gain ranging from 12,03 to 45,65% in 10 progenies to the PBS and allowed the selection of progenies with high yield potential predicted. The 10 best progenies were derived from clones GT1, CR 28/59, PR 261, RRIM 606, PB 217, IAC 41, IAC 35, PR 255, RRIM 701 and IAC 301. The characters ATP, DA50, FOP, SOP and PBS presented considerable coefficients of genetic variation, ranging from 1,25% for the ATP to 21,33% for PBS and medium heritability for DA50 and PBS being 0,23 and 0,80, respectively... (Complete abstract click electronic access below)