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Métodos de seleção para otimizar o ganho e a diversidade genética em pomares de sementes por muda de Pinus caribaea var. caribaea / Selection methods to optimize the gain and genetic diversity in Pinus caribaea var. caribaea seedling seed orchards

Zulian, Daniele Fernanda [UNESP] 09 February 2017 (has links)
Submitted by DANIELE FERNANDA ZULIAN (danizullian@gmail.com) on 2017-04-09T00:57:36Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Zulian.pdf: 2057371 bytes, checksum: 7e5c31c1b77ca9a02ec7d98c0e5335b9 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-17T16:19:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 zulian_df_me_ilha.pdf: 2057371 bytes, checksum: 7e5c31c1b77ca9a02ec7d98c0e5335b9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-17T16:19:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 zulian_df_me_ilha.pdf: 2057371 bytes, checksum: 7e5c31c1b77ca9a02ec7d98c0e5335b9 (MD5) Previous issue date: 2017-02-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Pinus caribaea var caribaea, é uma espécie de importância para regiões tropicais do Brasil, pouco exigente em solo e com boa produção de madeira. A proposta desse trabalho foi estimar a variabilidade genética em pomares de pinus caribaea var. caribaea e analisar qual melhor método de seleção. O estudo foi conduzido em dois Pomares de Sementes por Mudas de Pinus caribaea var. caribaea, o primeiro com 76 progênies e 4 testemunhas (área 1) e o segundo com 99 progênies e uma testemunha (área 2), ambos de polinização aberta. Foram avaliados os caracteres quantitativos: altura total de plantas (m); diâmetro à altura do peito - DAP (cm) e calculado o volume (m³/arv-1). A análise de deviance e as estimativas dos parâmetros genéticos foram realizadas pelo procedimento REML/BLUP. Foram propostas oitenta estratégias de seleção: quatro métodos e dez intensidades de seleção para a área 1 e quatro métodos e dez intensidades para a área 2 com base nos valores de BLUP’s individuais. Para determinar a intensidade de seleção que maximiza tanto o Ganho de seleção (GS) quanto a diversidade genética (D), foi utilizado os valores de GS e D usando uma escala relativa de 0,0 – 0,1. Equações quadráticas foram utilizadas para estimar as linhas de regressão a partir dos pontos de dados, e determinar o ponto de intersecção das linhas, o qual foi considerado como o número ideal de indivíduos para cada método de seleção nas duas áreas. Os efeitos de progênies não foram significativos para nenhum dos caracteres. Variação significativa foi observada somente entre plantas dentro de parcelas para altura na área 1 e todos caracteres na área 2. As maiores estimativas de variação genética e herdabilidade foram obtidas para a área 1. Sem a otimização da seleção, o maior ganho obtido (4,8%) foi na seleção entre e dentro com uma intensidade de seleção de 52%, para a área 1. Na área 2 o maior ganho (2,86%) foi na seleção individual, porém ambas apresentaram a menor diversidade genética, a área 1 com 0,08 e área 2 com 0,07. Em ambas as áreas, foi possível otimizar ganho de seleção e a diversidade genética em apenas três métodos de seleção. Concluímos que existe baixa variabilidade genética nos Pomares de Sementes por Mudas de Pinus caribaea var caribaea a ser explorada. O método de seleção que maximiza o ganho e a diversidade genética para a área 1 foi a seleção entre e dentro de progênies na intensidade de seleção de 30%. E para a área 2 é o método de seleção individual com uma intensidade de seleção de 8,1%. Recomenda-se a infusão de novos materiais genéticos para prosseguir com um programa de melhoramento florestal, visto que foi encontrado baixa variabilidade e baixos ganhos na seleção de Pinus caribaea var. caribaea. / Pinus caribaea var. caribaea, is a species of particular importance for tropical regions of Brazil. It is not very demanding on soil and is a good wood for production and manufacturing. The proposal of this work was to estimate the genetic variability in orchards of P. caribaea var. caribaea and to analyze the best methods of selection. This study was conducted in two Seed Orchards of P. caribaea var. caribaea. The first (area 1) consisted of 76 progenies and 4 controls and the second (area 2) was comprised of 99 progenies and one control. Both test orchards were open pollinated. Quantitative traits were evaluated: total plant height (m); Diameter at breast height - DAP (cm) and calculated volume (m³ / arv-1). Deviance analysis and estimates of genetic parameters were performed using the REML / BLUP procedure. Eighty selection strategies were proposed; four methods and ten selection intensities for area 1 and four methods and ten intensities for area 2 each based on individual BLUP values. To determine the selection intensity that maximizes both the Gain (GS) and the genetic diversity (D), GS and D values were analyzed using a relative scale of 0.0 - 0.1. Quadratic equations were analyzed to estimate the regression lines from the data points. Additionally, applying the same SigmaPlot computational methods, we were able to determine the point of intersection of the lines, which were considered as the ideal number of individuals for each selection method in the two respective areas. Progeny effects were not significant for any of the traits. Significant variation was observed only between plants within the plots for height in area 1 and all traits in area 2. The highest estimates of genetic variation and heritability were obtained for area 1. Without selection optimization, the highest gain (4.8%) was in the selection between and within with a selection intensity of 52%, for area 1. In area 2 the highest gain (2.86%) was in individual selection. But both each area showed low genetic diversity, area 1 with 0.08 and area 2 with 0.07. In both areas, it was possible to optimize selection gain and genetic diversity utilizing only three selection methods. The selection method that maximized gain and genetic diversity for area 1 was the selection between and within progenies at the selection intensity of 30%. And for area 2 is the individual selection method with a selection intensity of 8.1%. It is recommended the infusion of new genetic material to proceed with a forest improvement program, since it was found to have low variability and low gains in the selection of Pinus caribaea var. caribaea. We concluded low genetic variability exists in seed orchards by seedlings of Pinus caribaea var. caribaea; thereby identifying the need for further exploration.
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Métodos de seleção para otimizar o ganho e a diversidade genética em pomares de sementes por muda de Pinus caribaea var. caribaea /

Zulian, Daniele Fernanda January 2017 (has links)
Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: Pinus caribaea var caribaea, é uma espécie de importância para regiões tropicais do Brasil, pouco exigente em solo e com boa produção de madeira. A proposta desse trabalho foi estimar a variabilidade genética em pomares de pinus caribaea var. caribaea e analisar qual melhor método de seleção. O estudo foi conduzido em dois Pomares de Sementes por Mudas de Pinus caribaea var. caribaea, o primeiro com 76 progênies e 4 testemunhas (área 1) e o segundo com 99 progênies e uma testemunha (área 2), ambos de polinização aberta. Foram avaliados os caracteres quantitativos: altura total de plantas (m); diâmetro à altura do peito - DAP (cm) e calculado o volume (m³/arv-1). A análise de deviance e as estimativas dos parâmetros genéticos foram realizadas pelo procedimento REML/BLUP. Foram propostas oitenta estratégias de seleção: quatro métodos e dez intensidades de seleção para a área 1 e quatro métodos e dez intensidades para a área 2 com base nos valores de BLUP’s individuais. Para determinar a intensidade de seleção que maximiza tanto o Ganho de seleção (GS) quanto a diversidade genética (D), foi utilizado os valores de GS e D usando uma escala relativa de 0,0 – 0,1. Equações quadráticas foram utilizadas para estimar as linhas de regressão a partir dos pontos de dados, e determinar o ponto de intersecção das linhas, o qual foi considerado como o número ideal de indivíduos para cada método de seleção nas duas áreas. Os efeitos de progênies não foram significativos para nenhum dos carac... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre
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Aspectos Computacionais da Estimação e Predição em Modelos Lineares Mistos para Seleção de Híbridos de Milho em Ensaios Premilinares.

MARCAL, T. S. 30 June 2016 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-01T22:57:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10029_Dissertação Final Tiago de Souza Marçal.pdf: 1829947 bytes, checksum: 97df059fea5ce8331745b5840ac8d15c (MD5) Previous issue date: 2016-06-30 / O milho (Zea mays L.) é uma espécie da família Poaceae, diplóide e alógama. Para esta cultura verifica-se o aumento do vigor com o acúmulo de loci heterozigotos, justificando assim a produção dos híbridos. Com o advento das drásticas previsões de mudanças climáticas e aumento populacional para os próximos anos é necessária à adoção, desenvolvimento e aprimoração de métodos que permitam maior eficiência na seleção e alcance de maior progresso genético em programas de melhoramento de culturas de importância agrícola poderão auxiliar na mitigação dos desafios para sustentar a segurança alimentar ainda neste século. Diante do exposto, este trabalho teve por objetivo implementar os algoritmos de primeira e segunda derivadas para o método REML (máxima verossimilhança restrita) em R, generalizáveis para diferentes modelos lineares mistos e capazes de incorporar matrizes de parentesco. Além de avaliar o impacto de simplificações matemáticas, matrizes esparsas, e diferentes taxas de erro de convergência na eficiência computacional destes algoritmos, visando a minimização do custo computacional para viabilizar o REML, em estudos com grande número de híbridos de milho e modelos complexos, em computadores de configuração simples. Os dados experimentais utilizados neste trabalho foram obtidos na safra 2013/14 em ensaio conduzido no delineamento de blocos aumentados com cinco testemunhas e 3352 híbridos simples de milho na Embrapa (Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária) Milho e Sorgo situada em Sete Lagoas - MG. A variável analisada foi o rendimento de grãos, sendo esta submetida a análise através de modelos mistos com e sem a incorporação do pedigree utilizando-se diferentes algoritmos REML, em R, e a resposta computacional foi avaliada quanto aos critérios de convergência, taxas de erro de convergência, matrizes esparsas, computadores com diferentes capacidades de processamento, diferentes estimativas iniciais dos componentes de variância e número crescente de passos EM (Expectation Maximization) nos algoritmos combinados. Os algoritmos propostos foram equivalentes aos softwares testados (ASReml, Selegen e lme4) quanto as estimativas dos componentes de variância, indicando a coerência dos mesmos. Além disso, o uso de matrizes esparsas em associação com as otimizações propostas diminuíram o custo computacional dos algoritmos utilizando os coeficientes de determinação como critério de convergência e taxa de erro de convergência igual a 10-5. A combinação híbrida do algoritmo EM, em dez passos, com o NR (Newton Raphson) reduziu o custo computacional e aumentou o percentual de convergência médio. Ainda observou-se que pesos uniformes para as estimativas iniciais dos componentes de variância devem ser evitados.
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Modelos de sobrevivência com fração de cura e efeitos aleatórios / Cure rate models with random effects

Lopes, Célia Mendes Carvalho 29 April 2008 (has links)
Neste trabalho são apresentados dois modelos de sobrevivência com fração de cura e efeitos aleatórios, um baseado no modelo de Chen-Ibrahim-Sinha para fração de cura e o outro, no modelo de mistura. São estudadas abordagens clássica e bayesiana. Na inferência clássica são utilizados estimadores REML. Para a bayesiana foi utilizado Metropolis-Hastings. Estudos de simulação são feitos para avaliar a acurácia das estimativas dos parâmetros e seus respectivos desvios-padrão. O uso dos modelos é ilustrado com uma análise de dados de câncer na orofaringe. / In this work, it is shown two survival models with long term survivors and random effects, one based on Chen-Ibrahim-Sinha model for models with surviving fraction and the other, on mixture model. We present bayesian and classical approaches. In the first one, we use Metropolis-Hastings. For the second one, we use the REML estimators. A simulation study is done to evaluate the accuracy of the applied techniques for the estimatives and their standard deviations. An example on orofaringe cancer is used to illustrate the models considered in the study.
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Tamanho de parcelas experimentais e seleção simultânea de caracteres em progênies de Eucalyptus camaldulensis Dehnh / Size of experimental plots and simultaneous selecticon of characters in Eucalyptus camaldulensis Dehnh progenies

Silva, William de Medeiros [UNESP] 26 February 2016 (has links)
Submitted by WILLIAM DE MEDEIROS SILVA null (wil_medeiros@hotmail.com) on 2016-04-25T23:25:09Z No. of bitstreams: 1 William de Medeiros Silva2.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-04-26T17:08:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_wm_me_ilha.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-26T17:08:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_wm_me_ilha.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Para aumentar a eficiência da seleção de indivíduos superiores, o uso de delineamentos experimentais e de métodos adequados de seleção são fundamentais. Este trabalho teve como objetivo verificar a influência de dois tamanhos de parcelas experimentais e comparar os ganhos obtidos com três índices de seleção e seleção direta e indireta aplicados aos valores genotípicos individuais em testes de progênies de E. camaldulensis, para os caracteres forma de fuste, DAP e altura total das árvores. O EXP 1 e EXP 2 foram implantados em delineamento de blocos casualizados, com 133 progênies e espaçamento de 3,0 m x 1,8 m. O EXP 1 foi composto por parcelas experimentais de 5 plantas e quatro repetições e no EXP 2 utilizou-se uma planta por parcela e 20 repetições. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas utilizando o método REML/BLUP. Os indivíduos foram selecionados com base nos valores genéticos aditivos individuais, por meio de seleção direta e indireta dos caracteres e por meio dos índices de seleção da soma de postos, dos ganhos genéticos esperados e do somatório Z. O experimento com uma planta por parcela se mostrou mais eficiente na seleção, proporcionando ganhos superiores para caracteres de crescimento e similares para forma de fuste, sendo recomendado para testes de progênies do gênero Eucalyptus. O EXP 2 proporcionou maiores ganhos genéticos com a seleção devido à maior herdabilidade estimada. Os índices de seleção da soma de postos e do somatório Z foram os mais eficientes com ligeira superioridade do índice da soma de postos em função da maior facilidade da seleção. / In order to increase the efficiency of selection of superior individuals, the use of experimental design and appropriate selection methods are crucial. This study aimed to investigate the influence of two sizes of plots and compare the gains made with three levels of selection, direct and indirect selection applied to individual genotypic values in E. camaldulensis progeny tests for the variables stem shape, DAP and total height of the trees. The EXP 1 and EXP 2 were established in a randomized complete block design with 133 progenies and spacing of 3.0 m x 1.8 m. The EXP 1 consisted of plots of 5 plants and four replications, and EXP 2 used a plant per plot and 20 replications. Estimates of variance components and genetic parameters were obtained using the REML / BLUP method. Those individuals were selected based on individual genetic additive values, through direct and indirect selection of characters and through the selection indexes of rank, the expected genetic gains and the sum Z. The experiment with one plant per plot was more efficient in the selection, providing superior gains for growth traits and similar to stem shape, being the right one for Eucalyptus progeny tests. In EXP 2 larger genetic gains were obtained with selection due to higher estimated heritability. The selection index of the rank and the sum Z were the most effective with slight superiority index of rank, due to the greater ease of selection by this index.
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Tamanho de parcelas experimentais e seleção simultânea de caracteres em progênies de Eucalyptus camaldulensis Dehnh /

Silva, William de Medeiros January 2016 (has links)
Orientador: Bruno Ettore Pavan / Resumo: Para aumentar a eficiência da seleção de indivíduos superiores, o uso de delineamentos experimentais e de métodos adequados de seleção são fundamentais. Este trabalho teve como objetivo verificar a influência de dois tamanhos de parcelas experimentais e comparar os ganhos obtidos com três índices de seleção e seleção direta e indireta aplicados aos valores genotípicos individuais em testes de progênies de E. camaldulensis, para os caracteres forma de fuste, DAP e altura total das árvores. O EXP 1 e EXP 2 foram implantados em delineamento de blocos casualizados, com 133 progênies e espaçamento de 3,0 m x 1,8 m. O EXP 1 foi composto por parcelas experimentais de 5 plantas e quatro repetições e no EXP 2 utilizou-se uma planta por parcela e 20 repetições. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas utilizando o método REML/BLUP. Os indivíduos foram selecionados com base nos valores genéticos aditivos individuais, por meio de seleção direta e indireta dos caracteres e por meio dos índices de seleção da soma de postos, dos ganhos genéticos esperados e do somatório Z. O experimento com uma planta por parcela se mostrou mais eficiente na seleção, proporcionando ganhos superiores para caracteres de crescimento e similares para forma de fuste, sendo recomendado para testes de progênies do gênero Eucalyptus. O EXP 2 proporcionou maiores ganhos genéticos com a seleção devido à maior herdabilidade estimada. Os índices de seleção da soma de postos e do ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In order to increase the efficiency of selection of superior individuals, the use of experimental design and appropriate selection methods are crucial. This study aimed to investigate the influence of two sizes of plots and compare the gains made with three levels of selection, direct and indirect selection applied to individual genotypic values in E. camaldulensis progeny tests for the variables stem shape, DAP and total height of the trees. The EXP 1 and EXP 2 were established in a randomized complete block design with 133 progenies and spacing of 3.0 m x 1.8 m. The EXP 1 consisted of plots of 5 plants and four replications, and EXP 2 used a plant per plot and 20 replications. Estimates of variance components and genetic parameters were obtained using the REML / BLUP method. Those individuals were selected based on individual genetic additive values, through direct and indirect selection of characters and through the selection indexes of rank, the expected genetic gains and the sum Z. The experiment with one plant per plot was more efficient in the selection, providing superior gains for growth traits and similar to stem shape, being the right one for Eucalyptus progeny tests. In EXP 2 larger genetic gains were obtained with selection due to higher estimated heritability. The selection index of the rank and the sum Z were the most effective with slight superiority index of rank, due to the greater ease of selection by this index. / Mestre
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Efeito do delineamento experimental na estimaÃÃo da variabilidade e seleÃÃo de genÃtipos extraprecoces de feijÃo-caupi / Effect of experimental design in pet variability and genotypes selection extraprecoces bean-cowpea

AntÃnio Moreira Barroso Neto 18 February 2016 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / The precocity has come to be one of the new goals of improving cowpea, because it is an important feature, as is the possibility of carrying out up to three crops a year. The objective was to select individual materials cowpea, from F3 progeny: 6, to obtain extraprecoces lines, and determine the efficiency of selection. The experiments were conducted in the irrigated perimeter Baixo AcaraÃ, in the municipality of Marco, CE; located at a latitude of 3Â04'60 '' S, longitude 40Â04'51''W to 52 meters. Were evaluated 15 progenies in F3: 6 in two selection cycles in consecutive years. For both selection cycles, the traits were: number of days to flowering (NDF), number of days to maturity (NDM), plant height (ALT), pod length (CPV), number of seeds per pod (NGV), number of grains per plant (NGP), weight of 100 grains (M100G) and total weight (MTOT). The data for the characteristics were analyzed according to the procedures established for a mixed model, by using the likelihood ratio test (LRT), with the REML/BLUP ethodology. Was performed,analysis deviance to determine the genetic variability among progenies. There were significant differences among the progenies, showing that there is variability between them. It was found that all the characters presented heritability of high magnitude and high accuracy, for all traits showing the stability of the material and the accuracy of selection. It is noticed that all 62 subjects had higher behavior witnesses BRS Tumucumaque and always green, as the NDF and NDM, these results show that all these materials can compose basis for future breeding programs. Individuals who had distinguished himself as the precocity (NDF and NDM) were 12, 15, 16, 19, 21, 30, 33, 37 and 52, with days to flowering and maturity below witnesses. / A precocidade tem passado a ser um dos novos objetivos do melhoramento do feijÃo-caupi, por ser uma importante caracterÃstica, pois representa a possibilidade da realizaÃÃo de atà trÃs cultivos por ano. Objetivou-se selecionar materiais individuais de feijÃo-caupi, a partir de progÃnies F3:6, para obtenÃÃo de linhagens extraprecoces, e determinar a eficiÃncia da seleÃÃo. Os experimentos foram realizados, no perÃmetro irrigado do Baixo AcaraÃ, localizado no municÃpio de Marco, CE; situado a uma latitude de 3Â04â60ââ S, longitude 40Â04â51ââW a 52 metros de altitude. Foram avaliadas 15 progÃnies em F3:6, em dois ciclos de seleÃÃo, em anos consecutivos. Para ambos os ciclos de seleÃÃo, os caracteres avaliados foram os seguintes: nÃmero de dias para o florescimento (NDF), nÃmero de dias para a maturaÃÃo (NDM), altura de planta (ALT), comprimento de vagem (CPV), nÃmero de grÃos por vagem (NGV), nÃmero de grÃos por planta (NGP), massa de 100 grÃos (M100G) e massa total (MTOT). Os dados obtidos para as caracterÃsticas avaliadas foram analisados de acordo com os procedimentos estabelecidos para um modelo misto, sendo utilizado o teste da razÃo de verossimilhanÃa (LRT), com a metodologia REML/BLUP. Foi realizada anÃlise de deviance para a determinaÃÃo da variabilidade genÃtica entre as progÃnies avaliadas. Houve diferenÃa significativa entre as progÃnies, mostrando que hà variabilidade entre as mesmas. Verificou-se que todos os caracteres apresentaram herdabilidade de alta magnitude e elevada acurÃcia, para todos os caracteres, mostrando a estabilidade dos materiais e a precisÃo da seleÃÃo. Percebe-se que todos os 62 indivÃduos apresentaram comportamento superior as testemunhas BRS Tumucumaque e Sempre verde, quanto ao NDF e NDM, estes resultados mostram que todos estes materiais podem compor base para futuros programas de melhoramento. Os indivÃduos que se destacara quanto a precocidade (NDF e NDM) foram 12, 15, 16, 19, 21, 30, 33, 37 e 52, com dias para o florescimento e maturaÃÃo abaixo das testemunhas.
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ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS GENÉTICOS E ÍNDICE DE SELEÇÃO EM GENÓTIPOS DE Brachiaria brizantha / Genetic parameters and selection index estimation in Brachiaria brizanta genotypes

Basso, Kelen Cristina 23 February 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-02-26T12:59:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KelenCristinaBasso.pdf: 235667 bytes, checksum: 19390a163d2b87efdecef0a77487fced (MD5) Previous issue date: 2006-02-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Nowadays, the Brachiaria brizantha is the tropical grass with greatest cultivated area in Brazil, being responsible by a major part of the seeds market and by the increase in animal production. Many are the superior genotypes in relation to commercial genotypes available in the germoplasm banks, that were collected in the African Continent and need evaluations. The selection of these genotypes must be based on predicted genotype values of the individuals in function of being perennial plants and of unsexed propagation The standard procedure for the prediction of genetic values is theindividual BLUP (Best Linear Unbiased Predictor), using estimates of variance components achieved by the restricted maximum likelihood (REML) under individual model. With the aim of selecting B. brizantha materials superior to the commercial Cultivars in relation to the agronomic traits, 213 genotypes were evaluated in four experimental fields in the Embrapa Gado de Corte in Campo Grande, MS. The fields were conducted in different times, being that field one was evaluated through three years, and the others through two years. The agronomic traits evaluated were: vigor, growth, total dry matter (MST), green dry matter (MSV) leaves percentage (PF), leaf dry mater (MSF). The utilized experimental design was that of randomized blocks in three replications, being the cultivars Marandu and Xaraés the witnesses. The best repeatability and heritability coefficients were found to leaves percentage (0.51 and 0.51) and growth (0.44 and 0.41), respectively, indicating that these estimates are good selection parameters. The genotypes with greater predicted genetic value by the additive selection index were: B72, B188, and B252, with a performance 24, 20, and 21% superior to the Marandu cv., respectively, to the fields one, two, and four. Yet the results attained in in field three in relation to the index indicated superiority (26%) of the Xaraés cv. In relation to the Marandu cv.. Through the results of the evaluation of the predicted genetic effects it was possible to organize a ranking of the most promising genotypes, being that B72 and B178 were the best for leaf dry matter in the wet and dry seasons , and B252 and B172 for leaves percentage, and B252 and B71 for growth / Atualmente, a Brachiaria brizantha é a gramínea forrageira tropical com maior área cultivada no Brasil e é responsável por grande parte do mercado de sementes e pelo incremento na produtividade animal. São muitos os genótipos superiores que estão contidos nos bancos de germoplasma originários do continente africano foram avaliados em parcelas no campo. A seleção dos genótipos mais promissores deve ser realizada com base nos valores genotípicos preditos dos indivíduos a fim de conferir maior confiabilidade e minimizar o efeito ambiental de múltiplos campos de avaliação num período de 10 anos. O procedimento padrão para predição de valores genéticos foi o BLUP (melhor predição linear não viciada) individual, usando estimativas de componentes de variância obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML) em um modelo individual. Com o objetivo de selecionar os materiais superiores para características agronômicas foram avaliados 218 genótipos de B. brizantha distribuídos em quatro campos experimentais na Embrapa Gado de Corte em Campo Grande, MS e avaliados por um período mínimo de dois anos. O elineamento utilizado foi o de blocos ao acaso com três repetições e as testemunhas foram as cvs. Marandu e Xaraés. Os melhores valores para o coeficiente de Repetibilidade e herdabilidade foram encontrados para porcentagem de folhas e rebrota indicando-os como bons parâmetros para seleção. Os genótipos com maior valor genotípico predito pelo índice de seleção aditivo foram B72, B188, e B252 tendo um desempenho de 24, 20 e 21% superior à testemunha cv Marandu, respectivamente para os campos um, dois e quatro. Para o campo três a cv Xaraés apresentou melhores resultados, sendo superior cv Marandu em 26%. Pelo resultado da avaliação dos efeitos genotípicos preditos foi possível realizar um ranking dos materiais mais promissores e B72 e B178 destacaramse para matéria seca foliar nas águas e secas, B252 e B172 para porcentagem de folhas e B252 e B71 para rebrota
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ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS GENÉTICOS E ÍNDICE DE SELEÇÃO EM GENÓTIPOS DE Brachiaria brizantha / Genetic parameters and selection index estimation in Brachiaria brizanta genotypes

Basso, Kelen Cristina 23 February 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-02-26T12:59:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KelenCristinaBasso.pdf: 235667 bytes, checksum: 19390a163d2b87efdecef0a77487fced (MD5) Previous issue date: 2006-02-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Nowadays, the Brachiaria brizantha is the tropical grass with greatest cultivated area in Brazil, being responsible by a major part of the seeds market and by the increase in animal production. Many are the superior genotypes in relation to commercial genotypes available in the germoplasm banks, that were collected in the African Continent and need evaluations. The selection of these genotypes must be based on predicted genotype values of the individuals in function of being perennial plants and of unsexed propagation The standard procedure for the prediction of genetic values is theindividual BLUP (Best Linear Unbiased Predictor), using estimates of variance components achieved by the restricted maximum likelihood (REML) under individual model. With the aim of selecting B. brizantha materials superior to the commercial Cultivars in relation to the agronomic traits, 213 genotypes were evaluated in four experimental fields in the Embrapa Gado de Corte in Campo Grande, MS. The fields were conducted in different times, being that field one was evaluated through three years, and the others through two years. The agronomic traits evaluated were: vigor, growth, total dry matter (MST), green dry matter (MSV) leaves percentage (PF), leaf dry mater (MSF). The utilized experimental design was that of randomized blocks in three replications, being the cultivars Marandu and Xaraés the witnesses. The best repeatability and heritability coefficients were found to leaves percentage (0.51 and 0.51) and growth (0.44 and 0.41), respectively, indicating that these estimates are good selection parameters. The genotypes with greater predicted genetic value by the additive selection index were: B72, B188, and B252, with a performance 24, 20, and 21% superior to the Marandu cv., respectively, to the fields one, two, and four. Yet the results attained in in field three in relation to the index indicated superiority (26%) of the Xaraés cv. In relation to the Marandu cv.. Through the results of the evaluation of the predicted genetic effects it was possible to organize a ranking of the most promising genotypes, being that B72 and B178 were the best for leaf dry matter in the wet and dry seasons , and B252 and B172 for leaves percentage, and B252 and B71 for growth / Atualmente, a Brachiaria brizantha é a gramínea forrageira tropical com maior área cultivada no Brasil e é responsável por grande parte do mercado de sementes e pelo incremento na produtividade animal. São muitos os genótipos superiores que estão contidos nos bancos de germoplasma originários do continente africano foram avaliados em parcelas no campo. A seleção dos genótipos mais promissores deve ser realizada com base nos valores genotípicos preditos dos indivíduos a fim de conferir maior confiabilidade e minimizar o efeito ambiental de múltiplos campos de avaliação num período de 10 anos. O procedimento padrão para predição de valores genéticos foi o BLUP (melhor predição linear não viciada) individual, usando estimativas de componentes de variância obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML) em um modelo individual. Com o objetivo de selecionar os materiais superiores para características agronômicas foram avaliados 218 genótipos de B. brizantha distribuídos em quatro campos experimentais na Embrapa Gado de Corte em Campo Grande, MS e avaliados por um período mínimo de dois anos. O elineamento utilizado foi o de blocos ao acaso com três repetições e as testemunhas foram as cvs. Marandu e Xaraés. Os melhores valores para o coeficiente de Repetibilidade e herdabilidade foram encontrados para porcentagem de folhas e rebrota indicando-os como bons parâmetros para seleção. Os genótipos com maior valor genotípico predito pelo índice de seleção aditivo foram B72, B188, e B252 tendo um desempenho de 24, 20 e 21% superior à testemunha cv Marandu, respectivamente para os campos um, dois e quatro. Para o campo três a cv Xaraés apresentou melhores resultados, sendo superior cv Marandu em 26%. Pelo resultado da avaliação dos efeitos genotípicos preditos foi possível realizar um ranking dos materiais mais promissores e B72 e B178 destacaramse para matéria seca foliar nas águas e secas, B252 e B172 para porcentagem de folhas e B252 e B71 para rebrota
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Modelos de sobrevivência com fração de cura e efeitos aleatórios / Cure rate models with random effects

Célia Mendes Carvalho Lopes 29 April 2008 (has links)
Neste trabalho são apresentados dois modelos de sobrevivência com fração de cura e efeitos aleatórios, um baseado no modelo de Chen-Ibrahim-Sinha para fração de cura e o outro, no modelo de mistura. São estudadas abordagens clássica e bayesiana. Na inferência clássica são utilizados estimadores REML. Para a bayesiana foi utilizado Metropolis-Hastings. Estudos de simulação são feitos para avaliar a acurácia das estimativas dos parâmetros e seus respectivos desvios-padrão. O uso dos modelos é ilustrado com uma análise de dados de câncer na orofaringe. / In this work, it is shown two survival models with long term survivors and random effects, one based on Chen-Ibrahim-Sinha model for models with surviving fraction and the other, on mixture model. We present bayesian and classical approaches. In the first one, we use Metropolis-Hastings. For the second one, we use the REML estimators. A simulation study is done to evaluate the accuracy of the applied techniques for the estimatives and their standard deviations. An example on orofaringe cancer is used to illustrate the models considered in the study.

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