Breeding objectives were developed for Targhee sheep at different levels of prolificacy and triplet survival. Economic weights (EW) were derived for estimated breeding values (BV) from National Sheep Improvement Program genetic evaluations for 120 d weaning weight (WW), maternal milk (MM), yearling weight (YW), fleece weight (FW), fiber diameter (FD), staple length (SL), and prolificacy (PLC; lambs born/100 ewes lambing). A commercial flock was simulated, accounting for nonlinear relationships between performance and profit. Ewes were assumed mated to sires of specified BV and profit was derived from lifetime performance of lambs and replacement females from that lamb crop. Economic weights were determined as change in profit from use of sires with BV that were one additive standard deviation above the mean for each trait [1.98 kg for WW, 1.62 kg for MM, 2.90 kg for YW, 0..36 kg for FW, 0.99 microns for FD, 0.74 cm for SL, and 17.58 lambs/100 ewes for LC], while holding all other BV at breed average. Separate breeding objectives were derived for different ways of meeting increased nutrient needs (P = purchase hay, R = rent pasture, and L= limited flock size) and for different market lamb values (D = discounting lamb value for heavy weights, ND = no discount for heavy lambs). Based on replicated simulations, relative EW did not vary with prolificacy or triplet survival (P > 0.15) but were affected by feed costs and lamb market values (P < 0.01). Selection indexes were derived within and across simulated scenarios, and correlation (r) among indexes of > 0.90 indicated that an index could be used across multiple scenarios with little loss of selection efficiency. Indexes derived within feed cost scenarios (P, R, and L) and lamb value scenarios (D, ND) were strongly intercorrelated (r > 0.97). Correlations among average indexes for feed cost scenarios (0.97 for R and P, 0.70 for R and L; 0.85 for P and L) indicated that two feed cost scenarios could be used depending on whether winter forage was limited (L) or not (NL). The correlation between average indexes for these two scenarios was 0.78. Indexes were presented for combinations of feed cost and lamb value scenarios. Two indexes were suggested, representing the scenarios that apply to a large portion of Targhee producers. These indexes were for discounting heavy lambs with limited winter forage (D-L: 1.0 WW + 0.14 MM __ 0.76 YW + 1.22 FW __ 0.36 FD - 0.09 SL + 0.25 LC) and discounting heavy lambs with additional available forage (D-NL: 1.0 WW + 0.24 MM __ 0.34 YW + 1.65 FW __ 0.41 FD - 0.14 SL + 0.33 LC). For a standardized selection differential of one for the index, the expected changes in mean index value were $2.17 and $1.92 per ewe per generation for D-L and D-NL, respectively. / Master of Science

Resumo: Objetivou-se avaliar a eficiência reprodutiva por meio de um índice denominado retorno maternal (RMat) (kg/vaca/ano), composto pelas características: precocidade sexual (PS), permanência produtiva (PP) e produtividade materna (PM), considerando o custo de mantença (CM) da fêmea. Para o estudo, utilizou-se o banco de dados da raça Nelore do programa PAINT®, da CRV Lagoa. Inicialmente, estudos específicos da PS e da PP foram conduzidos separadamente. A idade ao primeiro parto (IPP) e a inclusão no rebanho (IReb) foram utilizadas como expressões da PS. A PP foi avaliada pela habilidade de permanência (HP) no rebanho aos 48, 60 e 72 meses de idade. Os grupos de contemporâneos foram formados pela concatenação das variáveis rebanho, ano e estação de nascimento. Os parâmetros genéticos e ambientais foram estimados mediante metodologias frequentista e bayesiana. Os valores de herdabilidade da IPP (0,02), da IReb (0,00) e da HP nas três idades estudadas (0,00) permitiram concluir que para esses rebanhos, não seria eficaz a inclusão destas em um índice econômico de seleção, pelo fato de não se apresentarem herdáveis. Sendo assim, a combinação dessas características se deu de forma fenotípica mediante o emprego do RMat. Este índice bioeconômico apresentou valor médio de 48 kg/vaca/ano e se mostrou herdável (0,45 ± 0,02). Portanto, eficaz na identificação de touros cujas filhas tenderam a ser precoces, produziram dois bezerros até os quatro anos de idade e estes, de desempenho superior para a produção de carne, sem aumentar os custos de produção. A PP até os 53 meses foi o componente que resultou em maior variação do RMat, quando houve o aumento, em uma unidade, do número de partos da fêmea. A combinação da PS, PP e PM, considerando o CM das vacas, no índice RMat, foi eficaz na identificação de touros para eficiência reprodutiva / Abstract: The objective of this research was to evaluate the reproductive efficiency of Nelore female cattle, using the index maternal return (MatR, kg of live weight/cow/year), considering the maintenance costs (MC) of females and including the following traits; sexual precocity (SP), stayability (ST), maternal productivity (MP). For this research the data bank of the breeding program PAINT® of CRV Lagoa has been used. Initially, the specific studies of SP and ST were been done separately. The age of first calving (AFC) and inclusion in the herd (IH) were used as SP expressions. The ST was evaluated at an age of 48, 60 and 72 months. Genetics and environmental parameters were estimated based on the frequentist and bayesian methodology. With heritability values of AFC (0.02), IH (0.00) and ST (0.00) at the three different ages one could conclude that for these herds it would not be efficient to include those traits in an economic selection index, due to the fact that those would not show inheritable. Therefore the combination of these traits was done in a phenotype way through the use of MatR, which estimated an average of 48 kg/cow/year. MatR proved to be heritable (0.45 ± 0.02) and was efficient to identify sires which daughters started their reproductive life at an early age; had assiduity; daughters were calving twice until four years of age; and had offspring with higher performance for beef production without increasing the production costs. The ST until 53 months of age was the component that resulted into more MatR variation, when increasing one extra calving. The combination between SP, ST and MP, considering MC of cows, in the MatR index was efficient to indentify sires for reproductive efficiency / Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Roberto Carvalheiro / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Vânia Cardoso / Doutor

É inegável a importância do melhoramento genético. Na literatura reporta-se que na ausência do melhoramento a produtividade dos cultivos agrícolas poderia ter diminuído. Deste modo, é fundamental avaliar o progresso genético para otimizar a eficiência da seleção e avaliar as técnicas empregadas. O progresso genético foi estudado em várias culturas no Brasil e no mundo. Apesar de feitas interpretações do relacionamento entre caracteres, não foram encontrados na literatura métodos ou estimativas relacionadas ao progresso simultâneo quando mais de um caráter sofre seleção. Como os melhoristas se atém a seleção de mais de um caráter, ao estimar o progresso genético dever-se-ia considerar esse aspecto. Nesse sentido, vislumbrou-se a possibilidade de se reunir a informação de mais de um caráter, tal qual um índice em que restrições sobre o original de Smith representam os progressos individuais estimados. Isto posto, o objetivo deste trabalho foi estimar os progressos genéticos no melhoramento do tabaco para os caracteres de interesse e apresentar uma alternativa interpretativa de reunir os progressos individuais na estimativa do progresso simultâneo. Mensurou-se o progresso genético dos caracteres agronômicos e morfológicos ao longo de 40 anos de melhoramento de tabaco do grupo varietal Virginia pela avaliação de nove linhagens oriundas de quatro fases distintas no delineamento casualizado em blocos com quatro repetições em quatro locais representativos da cultura. Com base nas estimativas e no desenvolvimento teórico do índice com restrições apresentado, reuniram-se as estimativas referentes aos progressos individuais como uma forma de representar o progresso genético simultâneo. A análise de regressão mostrou ganhos significativos por era de 275,29kg há-1 para a produtividade de folhas curadas, o que representa um progresso de 10% da média do ciclo inicial. A altura de plantas, número de folhas expandidas, bem como a largura e comprimento das folhas também mostraram incrementos significativos. Devido à interação genótipos por ambientes, os progressos estimados na média dos quatro locais não são bons preditores dos progressos por local. O índice de qualidade geral e a remuneração do produtor não apresentaram os progressos esperados em razão de essas avaliações terem sido realizadas apenas nas fases finais da seleção. A estimativa do progresso simultâneo aferiu um incremento de 6% por era no cômputo dos caracteres avaliados e reflete o sucesso na seleção e melhoramento simultâneo desses caracteres. O índice desenvolvido não necessita arbitrar pesos econômicos, atende às restrições, e mostrou-se eficaz em reunir os progressos genéticos dos caracteres além de poder ser empregado com o propósito da seleção em níveis não independentes de seleção. / The importance of plant breeding is unquestionable. In the literature, it is reported that in the absence of crop improvement crop yield could have decreased. Therefore, it is crucial to evaluate the genetic progress in order to optimize the efficiency of the selection procedures and evaluate the employed techniques. Data on genetic progress were studied throughout the world as well as in Brazil. Besides the understanding of the underlying relationships between traits, there are no current methods or estimates regarding simultaneous progress, i.e., whenever more than one trait undergo selection. As the breeders generally carry out selection considering more than one trait, when estimating the genetic progress, this particular issue should be considered. In this context, it has become possible to summarize information from more than one trait, as an index, based on the classic Smith index with constraints which represent the estimates of individual traits progress. Thus, the objective of the present work was to estimate genetic progress in a tobacco breeding program and to present an interpretative and promising alternative to address the individual progress and hence estimate the simultaneous progress. The genetic progress of agronomic and morphological traits was estimated over a period of 40 years in which selection was carried out for obtaining superior inbred lines of the Virginia variety group. Nine inbred lines, derived from four distinct eras, were evaluated in randomized complete block designs with four replicates in four Brazilian representative sites of the tobacco crop. Based on both the results and theoretical developments of the constrained index, the estimates of individual progress were combined in order to represent the simultaneous genetic progress. The regression analysis showed a significant gain per era of 275.29kg ha-1 for cured leaf weight, corresponding to a progress of 10% relative to the estimated intercept. Traits such as plant height, expanded leaves, as well as width and length of leaves also showed a significant increase. Given the genotype by environment interaction, the estimated marginal progress of the four sites was not a good predictor of the progress at each site. On the other hand, the leaf quality index and the corresponding commercial value did not show the aimed trend due to the fact that both evaluations were performed at the final trials. The simultaneous progress increased the set of traits by 6% per era relative to the intercept. This reflects the sucess of selection and simultaneous improvement of traits. The proposed index does not require attributing economic weights, satisfies the restrictions, is effective in summarizing the genetic progress of multipletraits and can be applied considering multitrait selection through non independent culling levels.

O estresse hídrico afeta a produtividade das culturas, especialmente o milho, sendo de importância primordial os estudos de déficit hídrico aliados ao melhoramento genético, bem como o entendimento de mecanismos genéticos envolvidos com a tolerância à seca. Dessa forma o presente trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a divergência genética e o potencial da população de milho Pioneira Cerrado para a extração de linhagens e populações superiores. Além de estimar parâmetros genéticos das progênies de meios irmãos de milho, a fim de selecionar progênies de milhos adaptadas às condições edafoclimáticas doTocantins. O experimento foi conduzido em Gurupi -TO, na Fazenda Experimental da UFT, pertencente à Universidade Federal do Tocantins. Foram utilizadas 169 progênies de meios-irmãos da população de milho Cerrado (Grãos dentados), proveniente do programa de melhoramento da empresa Pioneira Ltda. As progênies foram avaliadas em experimento com duas repetições. O delineamento experimental utilizado foi o látice 13 x 13, com duas repetições. No primeiro capítulo foram consideradas as características altura deplanta, peso de espiga sem palha, peso de espiga com palha, comprimento de espiga e Produtividade de grãos para serem realizadas a análise de variância e teste de agrupamento de médias entre as progênies e posteriormente análise de seleção, utilizando índice baseados em ranks. Foram aplicadas intensidades de seleção de 22%, correspondendo ao número de trinta progênies. Observou-se efeito significativo das progênies de meios-irmãos de milho em todas as características. A média da população original foi de 1,80 m em altura de plantas, 0,183 kg em peso de espiga sem palha, 0,233 kg em peso de espiga com palha, 17,53 cm em comprimento de espiga e 6550,94 kg ha-1em produtividade. Enquanto na população selecionada o ganho de seleção nessas características foram de 12,49; 16,13; 11,96; 2,24 e 22,21%, respectivamente. No segundo capitulo foi utilizando as mesmas 169 progênies, contudo consideradas as características altura de plantas, altura de espiga, plantas quebradas, plantas acamadas, peso de espiga sem palha, peso de espiga com palha, comprimento de espiga, diâmetro de espiga, número de fileiras, número de grãos dor fileira e produtividade de grãos. No estudo da divergência genética entre às progênies foram realizadas as medidas de dissimilaridade, determinadas segundo o modelo de análise multivariada, o que permitiu a obtenção da matriz de dissimilaridade e covariância residual. Para tanto, foi utilizada a Distância Generalizada de Mahalanobis como medida de dissimilaridade e na obtenção dos grupos, utilizou-se o Método Hierárquico do Vizinho Mais Próximo e o Método de Otimização de Tocher. A análise de agrupamento pelo método de Tocher separou as progênies em sete grupos, sendo que no grupo I ficaram a maior parte das progênies geneticamente similares. Todas as características contribuíram na determinação da divergência genética, em maior ou menor proporção. No entanto, a produtividade de grãos foi a que mais contribuiu na dissimilaridade entre as progênies, devendo ser priorizada na seleção em programas de melhoramento. No agrupamento adotado pelo método hierárquico do vizinho mais próximo, mesmo estatisticamente similares observa-se pequenas distâncias entre as progênies. Essa informação é de suma importância dentro de programas de melhoramento e complementar aos resultados obtidos com a análise de Tocher. Com isso conclui-se que a população de milho Pioneira Cerrado demonstra divergência genética e potencial genético a ser utilizada em programas de melhoramento visando à obtenção de linhagens e populações superiores. As progênies de meios-irmãos de milho selecionadas no sul do Tocantins apresentam médias de ganhos satisfatórios em todas as características. / Water stress affects crop productivity, especially maize, with water deficit studies associated with genetic improvement as well as the understanding of genetic mechanisms involved in drought tolerance being of primary importance. Thus the present work was carried out with the objective of evaluating the genetic divergence and the potential of the PioneiraCerrado maize population for the extraction of superior strains and populations. In addition to estimating genetic parameters of progenies of half sibs of corn, in order to select progenies of maize adapted to the edaphoclimatic conditions of Tocantins. The experiment was conducted in Gurupi -TO, at the Experimental Farm of UFT, belonging to the Federal University of Tocantins. Sixty-six progenies of half-siblings of the PioneiraCerrado maize population (Serrated grains) were used, from the breeding program of the company Pioneira Ltda. Progenies were evaluated in two replicate experiments. The experimental design used was the 13 x 13 lattice, with two replicates. In thefirst chapter we considered the characteristics of plant height, spike weight without straw, spike weight with straw, ear length and grain yield to be performed the analysis of variance and test of grouping means between progenies and later analysis of Using indexes based on ranks. Selection intensities of 22% were applied, corresponding to the number of thirty progenies. Significant effect of corn half-sib progenies on all traits was observed. The mean of the original population was 1.80 m in height of plants, 0.183 kg in weight of spike without straw, 0.233 kg in weight of spike with straw, 17.53 cm in length of spike and 6550.94 kg ha-1 Productivity. While in the selected population the selection gain in these characteristics was 12.49; 16.13; 11.96; 2.24 and 22.21%, respectively. In the second chapter, the same 169 progenies were used, however, considering the height characteristics of plants, height of spike, broken plants, bedded plants, tang weight without straw, tang weight with straw, ear length, ear diameter, number of rows, number of grain row pain and grain yield. In the study of the genetic divergence between the progenies, the dissimilarity measures were determined, according to the multivariate analysis model, which allowed to obtain the matrixof dissimilarity and residual covariance. For this, the Generalized Distance of Mahalanobis was used as a measure of dissimilarity and in obtaining the groups, we used the Hierarchical Neighboring Neighbor Method and the Tocher Optimization Method. The cluster analysis by the Tocher method separated the progenies into seven groups, and in group I most of the genetically similar progenies remained. All characteristics contributed to the determination of genetic divergence, to a greater or lesser extent. However, grain yield was the one that contributed the most to the dissimilarity among the progenies, and should be prioritized in the selection in breeding programs. In the grouping adopted by the hierarchical method of the nearest neighbor, even statistically similar, small distances between the progenies are observed. This information is of utmost importance within breeding programs and to complement the results obtained with the Tocher analysis. With this, it can be concluded that the PioneiraCerrado maize population shows genetic divergence and genetic potential to be used in breeding programs aimed at obtaining superior strains and populations. The progenies of selected half-sibs of maize in southern Tocantins present satisfactory averages of all traits.

O milho-doce é um tipo especial de milho, de alto valor nutricional que acumula polissacarídeos solúveis de caráter adocicado no endosperma. O consumo deste vegetal está crescendo no Brasil. Sendo esse um dos maiores países produtores de milho do mundo, há também um enorme potencial de produção de milho-doce. Atualmente, existem 53 cultivares de milho-doce registradas no país, mas apenas uma predomina nas lavouras desta cultura. Nota-se uma demanda por novas cultivares de milho-doce adaptadas às condições tropicais, com altas produtividades e excelente qualidade dos grãos. Há também uma escassez de informações sobre a avaliação e obtenção de cultivares de milho-doce. Os objetivos deste trabalho compreenderam: (i) verificação da viabilidade da utilização de um testador com elevado nível de endogamia e mais selecionado, em relação aos testadores com menores níveis de endogamia e menos selecionados, para obtenção de testcrosses; (ii) verificação do progresso realizado nas médias dos testcrosses; (iii) estimação das correlações entre a produtividade de espigas e os componentes de produção; (iv) aplicação de um índice de seleção para caracterizar e selecionar os melhores testcrosses e (v) verificação da variância genética disponível após a seleção e autofecundação. Foram avaliadas duas populações de milho-doce, em que uma é testadora da outra. Os três tipos de testadores utilizados foram obtidos a partir de uma mistura de linhagens selecionadas da geração anterior, sendo assim eles possuíam duas etapas de seleção e três níveis de endogamia. Visando a seleção de linhagens, 176 testcrosses foram avaliados em duas épocas de plantio, em delineamento casualizado em blocos com três repetições. Foram avaliados os caracteres dias para florescimento masculino(FM), altura das plantas(AP), número de espigas comerciais(EC), produtividade das espigas comerciais(PE), comprimento das espigas(CE), diâmetro das espigas(DE) e enchimento de ponta(EP). Foram observadas diferenças significativas entre as médias dos testcrosses nas análises de variância individuais e conjuntas. As interações entre testcrosses e testadores, nas análises individuais, não apresentaram diferenças significativas, indicando que não houve mudança no ordenamento dos testcrosses quando se utilizaram diferentes testadores. Para a mesma interação, nas análises conjuntas foram estimadas as correlações de Spearman, que se mostraram, na grande maioria, significativas, ou seja, foi detectada correlação entre o ranqueamento dos testcrosses. Para todos os caracteres avaliados, os testcrosses exibiram médias iguais ou superiores à melhor testemunha. Não houve evidências claras da diminuição da variância genética dos testcrosses quando foram utilizados testadores mais endogâmicos e mais selecionados. O testador com endogamia equivalente à das linhagens testadas e mais selecionado mostrou-se tão eficiente quanto os testadores com endogamia menor e menos selecionado. Foram observados valores consideráveis para os progressos realizados nas médias dos testcrosses, na maioria superiores a 1%, quando a seleção se deu nos testadores e nas linhagens, destacando que a utilização de testadores selecionados maximiza as médias dos testcrosses. Observaram-se correlações genéticas positivas (rG&ge;0,556) entre a produtividade de espigas comerciais e os caracteres EC, CE, DE e EP. O índice utilizado classificou os testcrosses em relação a todos os caracteres avaliados simultaneamente e permitiu a seleção dos melhores. / Sweet corn is a special type of corn, with high nutritional value, which accumulates soluble polysaccharides in the endosperm, so it is sweeter than other types of corn. The consumption of sweet corn is increasing in Brazil. Being one of the major producers of corn in the world, there is also an enormous potential for the production of sweet corn. Currently, there are 53 sweet corn varieties registered in the country, but only one prevails in crops of this species. There is a demand for new varieties adapted to tropical conditions with high grain yield and superior grain quality. Additionally, there is not enough information about evaluation and development of sweet corn varieties for the Brazilian conditions. The goals of this project were: (i) to verify the feasibility of using a tester with high level of inbreeding and more selected in relation to testers with lower levels of inbreeding and less selected to obtain testcrosses; (ii) to verify the improvement of the testcross means; (iii) to estimate correlations between ear yield and production components; (iv) to apply a selection index to rank and select the best testcrosses and (v) to verify the genetic variance available after selection and selfing in the testcrosses. Two populations, where one was the tester of the other, were evaluated. In each cycle of selection testers were obtained from a mixture of selected inbred lines of the previous generation, leading to two levels of selection and three levels of inbreeding. For selection of inbred lines, 176 testcrosses were evaluated in two seasons, in randomized completed blocks with three replications. The traits days to male flowering (FM), plant height (AP), number of commercial ears (EC), ear yield (PE), ear length (CE), ear diameter (DE) and tip fill (EP) were evaluated. There were significant differences between testcross in the individual and the combined analysis of variance. Interactions between testcrosses and testers, from the individual analysis, in general, were not significant, indicating no change in the ranking of testcrosses when using different testers. For this interaction, from the joint analysis, Spearman\'s rank correlations were estimated and showed significance in most cases. For all variables, the testcross means were either equal to or greater than the best control. The level of selection underlying the constitution of a tester did not affect the genetic variance among testcrosses. The tester stemming from more selected inbred lines was as good as testers derived from less selected lines. There was progress in the testcross means, generally higher than 1%; the use of selected testers maximized testcross means. Positive genetic correlations (rG &ge; 0.556) were detected between ear yield and EC, CE, DE and EP traits. The selection index ranked the testcrosses for all traits evaluated simultaneously and allowed selecting the superior ones.

In der vorliegenden Arbeit werden drei Modellrechnungen vorgestellt, die auf dem Selektionsindex basieren und mit denen der Nutzen genomischer Zusatzinformation auf aktuelle Selektionsstrategien für Reitpferde und Schweine ermittelt werden soll. In Kapitel eins werden sowohl die klassischen Instrumente der Tierzucht, der Selektionsindex, die ökonomische Modellierung und die Genfluss-Methode, als auch die genomische Selektion dargestellt. Zudem wird die Software ZPlan+, in welcher diese Instrumente miteinander kombiniert sind, kurz vorgestellt. Im zweiten Kapitel der Arbeit wird das Potenzial der genomischen Selektion für die Reitpferdezucht dargestellt. Der Zugewinn an Genauigkeit eines Zuchtwerts durch Hinzunahme genomischer Information wurde für drei praxisnahe Selektionsschritte betrachtet, nämlich für Pferde ohne Eigenleistung, Pferde mit Eigenleistung und Pferde mit Eigen- und Nachkommenleistungen. Die Modellrechnung zeigte, dass sich durch Hinzunahme genomischer Information besonders die Genauigkeit von Zuchtwerten junger Pferde ohne Eigen- oder Nachkommenleistung beträchtlich steigern ließe. Sobald Nachkommenleistungen unterstellt wurden war der Zugewinn an Genauigkeit durch genomische Information jedoch zu vernachlässigen. Für die praktische Pferdezucht ist die genomische Selektion daher vor allem für die Absicherung vorläufiger Zuchtzulassungen für junge Hengste nach der Körung und für leistungsgeprüfte Hengste ohne Nachkommenleistungen empfehlenswert. Im dritten Kapitel der Arbeit wurde untersucht, wie sich die Art der berücksichtigten Informationsquellen (konventionell oder genomisch) auf die Interaktion der Parameter genetische Korrelation, Heritabilität und ökonomische Gewichtung auswirkte. Als Vergleichsparameter wurde die Standardabweichung des jeweiligen Indexes herangezogen, welche sich direkt proportional zum Zuchtfortschritt verhält. Es wurden drei Indices mit zwei Zuchtzielmerkmalen verglichen, deren Informationsquellen in Anlehnung an die Schweinezucht gewählt wurden. Der erste Index wurde für ein Tier mit Eigenleistung aufgestellt, während im zweiten Index zusätzliche Vollgeschwisterleistungen angenommen wurden. Im dritten Index wurde die Eigenleistung mit genomischer Information für beide Zuchtzielmerkmale kombiniert. Die Genauigkeit der genomischen Zuchtwerte wurde durch Annahme unterschiedlich großer Referenzpopulationen variiert. Je mehr Information im Index berücksichtigt wurde, desto unabhängiger wurde die Standardabweichung des Indexes von den Parametern genetische Korrelation, Heritabilität und ökonomische Gewichtung. Dabei wurden für den Vollgeschwisterindex mit 7 Vollgeschwistern und den genomischen Indexes mit einer Referenzpopulation von 1.000 Tieren vergleichbare Ergebnisse gefunden. Die Anzahl von 1.000 Tieren in der Referenzpopulation kann somit als Mindestmaß für die Schweinezucht angenommen werden. Für geringere Heritabilitäten zeigte sich eine deutliche Überlegenheit des genomischen Indexes über den Vollgeschwisterindex. Im vierten Kapitel der Arbeit wurde ein Schweinezuchtprogramm optimiert. Dazu wurden verschiedene Zuchtziele und Selektionsstrategien gegen Ebergeruch verglichen. Das Zuchtziel war entweder die Selektion gegen den Gehalt der chemischen Leitkomponenten des Ebergeruchs, Androstenon, Skatol und Indol oder die Selektion gegen den, von Testpersonen bestimmten, Human Nose Score. Innerhalb der Selektion gegen die chemischen Komponenten wurden drei verschiedene Informationsquellen miteinander verglichen, nämlich eine Feldprüfung in Form einer Biopsie am lebenden Eber, genomische Selektion sowie die Kombination beider Informationen. Innerhalb der Selektion gegen den Human Nose Score wurden als Informationsquellen eine Stationsprüfung von Voll- und Halbgeschwistern des Selektionskandidaten sowie genomische Selektion miteinander verglichen. Das komplexe Zuchtprogramm wurde deterministisch mit der Software ZPlan+ modelliert. Bei der Selektion gegen die chemischen Komponenten des Ebergeruchs war der Zuchtfortschritt am höchsten, wenn als Informationsquelle die Eigenleistung in Form einer Biopsie der männlichen Selektionskandidaten genutzt wurde. Aufgrund der hohen Erblichkeit der Ebergeruchskomponenten war der Nutzen genomischer Zuchtwerte deutlich geringer und gleichzeitig teurer. Für die Selektion gegen den geringer erblichen Human Nose Score lieferte die genomische Selektion einen höheren Zuchtfortschritt als die Stationsprüfung der Geschwister des Selektions-kandidaten. Auch wenn der Human Nose Score als Zielmerkmal angesehen wurde, erwies sich eine Selektion gegen die chemischen Komponenten als zielführend, da der (korrelierte) naturale Zuchtfortschritt des Human Nose Scores bei Durchführung einer Biopsie deutlich höher war, als bei direkter Selektion gegen den Human Nose Score. Im fünften Kapitel wird das Potential der genomischen Selektion für die Reitpferde- und Schweinezucht diskutiert. Dabei wird besonders auf Möglichkeiten für die Vergrößerung der Referenzpopulation und der Kostenreduktion eingegangen. Für die Reitpferdezucht wer-den zusätzlich Möglichkeiten aufgezeigt, wie der Zuchtfortschritt mit konventionellen Methoden gesteigert werden könnte.

Resumo: O presente trabalho teve o objetivo de selecionar genótipos segregantes de soja em três gerações iniciais (F3, F4 e F5) através da estimativa de parâmetros genéticos e fenotípicos como herdabilidade, ganhos com a seleção e correlações. Além disso, utilizou-se o cálculo de índices de seleção de Mulamba & Mock e Pesek & Backer para o auxílio na seleção das melhores famílias. As populações de soja foram avaliadas em três safras consecutivas, 2002/03, 2003/04 e 2004/05 sendo o ensaio conduzido no esquema de famílias com testemunhas intercalares. Na geração F4, a população Embrapa 48 X IAC 17 apresentou maiores valores de herdabilidade e se apresentou como a mais promissora em relação ao caráter produtividade de grãos. Na mesma geração, também concluiu-se que a seleção entre famílias é mais promissora comparando-se com a seleção dentro de famílias. Em relação à correlação fenotípica, constatou-se que a mesma pode auxiliar no processo indireto de seleção. Na geração F5, a melhor população foi à derivada do cruzamento Embrapa 48 X Conquista, tendo em vista os maiores ganhos com a seleção obtidos. Também se concluiu que o uso dos índices de seleção apresenta grande utilidade no processo seletivo, já que proporcionam maiores ganhos totais, distribuídos entre todos os caracteres avaliados, com destaque para o índice de Mulamba & Mock, que apresentou-se mais adequado para as condições do presente experimento, com progressos superiores em várias situações. / Abstract: The present work had the objective to select soybean segregate genotypes in three initial generations (F3, F4 and F5) through the estimate of gene tic and phenotypic parameters as heritability, selection gains and correlations. Moreover, the calculation of Mulamba & Mock and Pesek & Backer index selection was used to select the best families. The soybean populations had been evaluated in three consecutive seasons, 2002/03, 2003/04 and 2004/05, being conducted on the scheme of families inserted between of the checks. In F4 generation, the population Embrapa 48 X IAC 17 presented greater values of heritability and presented as the most promising in relation to the yield. In the same generation, it was concluded that the selection between families is more promising comparing itself with the selection inside of families. In relation to the phenotypic correlation, it was evidenced that the same one can assist in the indirect process of selection. In the F5 generation, the best population was derivate of the crossing Embrapa 48 X Conquista, in view of the biggest selection gains. Also it can be concluded that the use of the selection index presents great utility in the selective process, already provide to greater total gains , distributed between all the evaluated characters, with prominence for the Mulamba & Mock index, that presented more adequate for the conditions of the present experiment, with superior progress in some situations. / Orientador: Maria Aparecida Pessôa da Cruz Centurion / Coorientador: Antonio Orlando Di Mauro / Banca: Neylson Eustáquio Arantes / Banca: Eduardo Antonio Gavioli / Banca: Dilermando Perecin / Banca: João Carlos de Oliveira / Doutor

Submitted by WILLIAM DE MEDEIROS SILVA null (wil_medeiros@hotmail.com) on 2016-04-25T23:25:09Z No. of bitstreams: 1 William de Medeiros Silva2.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-04-26T17:08:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_wm_me_ilha.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-26T17:08:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_wm_me_ilha.pdf: 1003911 bytes, checksum: 3f56d468c7e22b6f5ea35b9ad5081d06 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Para aumentar a eficiência da seleção de indivíduos superiores, o uso de delineamentos experimentais e de métodos adequados de seleção são fundamentais. Este trabalho teve como objetivo verificar a influência de dois tamanhos de parcelas experimentais e comparar os ganhos obtidos com três índices de seleção e seleção direta e indireta aplicados aos valores genotípicos individuais em testes de progênies de E. camaldulensis, para os caracteres forma de fuste, DAP e altura total das árvores. O EXP 1 e EXP 2 foram implantados em delineamento de blocos casualizados, com 133 progênies e espaçamento de 3,0 m x 1,8 m. O EXP 1 foi composto por parcelas experimentais de 5 plantas e quatro repetições e no EXP 2 utilizou-se uma planta por parcela e 20 repetições. As estimativas de componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas utilizando o método REML/BLUP. Os indivíduos foram selecionados com base nos valores genéticos aditivos individuais, por meio de seleção direta e indireta dos caracteres e por meio dos índices de seleção da soma de postos, dos ganhos genéticos esperados e do somatório Z. O experimento com uma planta por parcela se mostrou mais eficiente na seleção, proporcionando ganhos superiores para caracteres de crescimento e similares para forma de fuste, sendo recomendado para testes de progênies do gênero Eucalyptus. O EXP 2 proporcionou maiores ganhos genéticos com a seleção devido à maior herdabilidade estimada. Os índices de seleção da soma de postos e do somatório Z foram os mais eficientes com ligeira superioridade do índice da soma de postos em função da maior facilidade da seleção. / In order to increase the efficiency of selection of superior individuals, the use of experimental design and appropriate selection methods are crucial. This study aimed to investigate the influence of two sizes of plots and compare the gains made with three levels of selection, direct and indirect selection applied to individual genotypic values in E. camaldulensis progeny tests for the variables stem shape, DAP and total height of the trees. The EXP 1 and EXP 2 were established in a randomized complete block design with 133 progenies and spacing of 3.0 m x 1.8 m. The EXP 1 consisted of plots of 5 plants and four replications, and EXP 2 used a plant per plot and 20 replications. Estimates of variance components and genetic parameters were obtained using the REML / BLUP method. Those individuals were selected based on individual genetic additive values, through direct and indirect selection of characters and through the selection indexes of rank, the expected genetic gains and the sum Z. The experiment with one plant per plot was more efficient in the selection, providing superior gains for growth traits and similar to stem shape, being the right one for Eucalyptus progeny tests. In EXP 2 larger genetic gains were obtained with selection due to higher estimated heritability. The selection index of the rank and the sum Z were the most effective with slight superiority index of rank, due to the greater ease of selection by this index.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T19:42:45Z : No. of bitstreams: 1 tanaka_alr_dr_jabo.pdf: 606668 bytes, checksum: 5a7196c5b2fd4fce98bad3e0e8e4765f (MD5) / Objetivou-se avaliar a eficiência reprodutiva por meio de um índice denominado retorno maternal (RMat) (kg/vaca/ano), composto pelas características: precocidade sexual (PS), permanência produtiva (PP) e produtividade materna (PM), considerando o custo de mantença (CM) da fêmea. Para o estudo, utilizou-se o banco de dados da raça Nelore do programa PAINT®, da CRV Lagoa. Inicialmente, estudos específicos da PS e da PP foram conduzidos separadamente. A idade ao primeiro parto (IPP) e a inclusão no rebanho (IReb) foram utilizadas como expressões da PS. A PP foi avaliada pela habilidade de permanência (HP) no rebanho aos 48, 60 e 72 meses de idade. Os grupos de contemporâneos foram formados pela concatenação das variáveis rebanho, ano e estação de nascimento. Os parâmetros genéticos e ambientais foram estimados mediante metodologias frequentista e bayesiana. Os valores de herdabilidade da IPP (0,02), da IReb (0,00) e da HP nas três idades estudadas (0,00) permitiram concluir que para esses rebanhos, não seria eficaz a inclusão destas em um índice econômico de seleção, pelo fato de não se apresentarem herdáveis. Sendo assim, a combinação dessas características se deu de forma fenotípica mediante o emprego do RMat. Este índice bioeconômico apresentou valor médio de 48 kg/vaca/ano e se mostrou herdável (0,45 ± 0,02). Portanto, eficaz na identificação de touros cujas filhas tenderam a ser precoces, produziram dois bezerros até os quatro anos de idade e estes, de desempenho superior para a produção de carne, sem aumentar os custos de produção. A PP até os 53 meses foi o componente que resultou em maior variação do RMat, quando houve o aumento, em uma unidade, do número de partos da fêmea. A combinação da PS, PP e PM, considerando o CM das vacas, no índice RMat, foi eficaz na identificação de touros para eficiência reprodutiva / The objective of this research was to evaluate the reproductive efficiency of Nelore female cattle, using the index maternal return (MatR, kg of live weight/cow/year), considering the maintenance costs (MC) of females and including the following traits; sexual precocity (SP), stayability (ST), maternal productivity (MP). For this research the data bank of the breeding program PAINT® of CRV Lagoa has been used. Initially, the specific studies of SP and ST were been done separately. The age of first calving (AFC) and inclusion in the herd (IH) were used as SP expressions. The ST was evaluated at an age of 48, 60 and 72 months. Genetics and environmental parameters were estimated based on the frequentist and bayesian methodology. With heritability values of AFC (0.02), IH (0.00) and ST (0.00) at the three different ages one could conclude that for these herds it would not be efficient to include those traits in an economic selection index, due to the fact that those would not show inheritable. Therefore the combination of these traits was done in a phenotype way through the use of MatR, which estimated an average of 48 kg/cow/year. MatR proved to be heritable (0.45 ± 0.02) and was efficient to identify sires which daughters started their reproductive life at an early age; had assiduity; daughters were calving twice until four years of age; and had offspring with higher performance for beef production without increasing the production costs. The ST until 53 months of age was the component that resulted into more MatR variation, when increasing one extra calving. The combination between SP, ST and MP, considering MC of cows, in the MatR index was efficient to indentify sires for reproductive efficiency

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-05-21Bitstream added on 2014-06-13T20:03:34Z : No. of bitstreams: 1 silveira_gd_dr_jabo.pdf: 227440 bytes, checksum: 084f60ece613089c8d595752d750ad2e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho teve o objetivo de selecionar genótipos segregantes de soja em três gerações iniciais (F3, F4 e F5) através da estimativa de parâmetros genéticos e fenotípicos como herdabilidade, ganhos com a seleção e correlações. Além disso, utilizou-se o cálculo de índices de seleção de Mulamba & Mock e Pesek & Backer para o auxílio na seleção das melhores famílias. As populações de soja foram avaliadas em três safras consecutivas, 2002/03, 2003/04 e 2004/05 sendo o ensaio conduzido no esquema de famílias com testemunhas intercalares. Na geração F4, a população Embrapa 48 X IAC 17 apresentou maiores valores de herdabilidade e se apresentou como a mais promissora em relação ao caráter produtividade de grãos. Na mesma geração, também concluiu-se que a seleção entre famílias é mais promissora comparando-se com a seleção dentro de famílias. Em relação à correlação fenotípica, constatou-se que a mesma pode auxiliar no processo indireto de seleção. Na geração F5, a melhor população foi à derivada do cruzamento Embrapa 48 X Conquista, tendo em vista os maiores ganhos com a seleção obtidos. Também se concluiu que o uso dos índices de seleção apresenta grande utilidade no processo seletivo, já que proporcionam maiores ganhos totais, distribuídos entre todos os caracteres avaliados, com destaque para o índice de Mulamba & Mock, que apresentou-se mais adequado para as condições do presente experimento, com progressos superiores em várias situações. / The present work had the objective to select soybean segregate genotypes in three initial generations (F3, F4 and F5) through the estimate of gene tic and phenotypic parameters as heritability, selection gains and correlations. Moreover, the calculation of Mulamba & Mock and Pesek & Backer index selection was used to select the best families. The soybean populations had been evaluated in three consecutive seasons, 2002/03, 2003/04 and 2004/05, being conducted on the scheme of families inserted between of the checks. In F4 generation, the population Embrapa 48 X IAC 17 presented greater values of heritability and presented as the most promising in relation to the yield. In the same generation, it was concluded that the selection between families is more promising comparing itself with the selection inside of families. In relation to the phenotypic correlation, it was evidenced that the same one can assist in the indirect process of selection. In the F5 generation, the best population was derivate of the crossing Embrapa 48 X Conquista, in view of the biggest selection gains. Also it can be concluded that the use of the selection index presents great utility in the selective process, already provide to greater total gains , distributed between all the evaluated characters, with prominence for the Mulamba & Mock index, that presented more adequate for the conditions of the present experiment, with superior progress in some situations.