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Phenotypic and genetic evaluation of fitness characteristics in sheep under a range environmentBorg, Randy Charles 02 May 2007 (has links)
The objectives of this dissertation were to evaluate genetic and environmental relationships between lamb and ewe traits including body weight, fleece weight and quality, prolificacy, body condition, ewe stayability and lamb survival. Average heritability estimates for lamb birth weight (BWT), weaning weight (WW), maternal weaning weight, yearling body weight, fleece weight, spinning count and staple length were 0.19, 0.09, 0.08, 0.35, 0.38, 0.25, and 0.31 respectively. Heritability estimates for adult traits averaged 0.43 for body weight (AW), 0.13 for body condition (AC), and 0.12 for number of lambs born per ewe lambing (NLB). Correlations between direct additive AW and direct additive and maternal lamb weights ranged from 0.21 to 0.96 (P < 0.05) and 0.29 to 0.53 (P < 0.05), respectively, with residual correlations ranging from 0.05 to 0.95. Correlations of lamb traits with adult body condition and NLB were generally not different from zero; genetic and residual correlations ranged from -0.52 to 0.69 and -.39 to 0.31, respectively.
Ewe stayability was analyzed as overall stayability (STAYn|2) which indicated the presence or absence of a ewe at n yrs of age, given that she was present at 2 yrs of age, and marginal stayability (STAYn|1-n) recording the presences of a ewe at n yrs of age, given that she was in the flock the previous year. Additive variance in ewe stayability was only found in stayability at 5 and 6 yr of age (P < 0.05). Heritability estimates for STAY5|4 and STAY6|2 from multiple trait analyses with other traits averaged 0.08 and 0.10, respectively. Phenotypic correlations between STAY and all other traits were near zero, ranging from -0.04 to 0.03. The estimated correlations between additive effects on STAY5|4 and STAY6|2 and additive maternal effects on WW were positive (both 0.46; P < 0.05). Genetic correlations between STAY5|4 and WW, adult weight, and NLB were 0.06, 0.13 and -0.06 (P > 0.10), respectively. However, genetic correlations between STAY6|2 and WW, adult weight, and NLB were negative (-0.17, -0.32 (P < 0.05) and -0.03, respectively). Significant genetic variation was thus present in stayability, with nonzero genetic correlations present between STAY, maternal milk, WW, and adult weight.
Survival analysis was performed using a proportional hazards model to measure the probability of lamb death before weaning. Lamb survival was recorded as the day of age at death. Records were censored if a live lamb was artificially removed from their litter before death. Fixed effects on survival included ewe age, litter size, sex, and linear and quadratic BWT. Average age of death was 13.7 d. Censoring of records before weaning occurred in 12.9% of the total lambs born. Risk ratios indicated lambs from yearlings and ewes older than 5 yr had the greater risk of death, as did triplet and quadruplet lambs. Linear and quadratic BWT effects on lamb survival were found (P < 0.05) and accounted for most of the litter size effects in large litters. The influence of informative censoring was considered by assuming that lambs censored by 3 d of age had died at the time of censoring. Heritability of lamb survival at 3 d of age (estimated using an animal model in MTDFREML) was near zero, ranging from 0.00 to 0.01. The lack of additive variance suggests that improvement in lamb survival should be made through changes in management practices. / Ph. D.
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Eficiência reprodutiva de fêmeas Nelore /Tanaka, Aila Loise Ribeiro. January 2010 (has links)
Resumo: Objetivou-se avaliar a eficiência reprodutiva por meio de um índice denominado retorno maternal (RMat) (kg/vaca/ano), composto pelas características: precocidade sexual (PS), permanência produtiva (PP) e produtividade materna (PM), considerando o custo de mantença (CM) da fêmea. Para o estudo, utilizou-se o banco de dados da raça Nelore do programa PAINT®, da CRV Lagoa. Inicialmente, estudos específicos da PS e da PP foram conduzidos separadamente. A idade ao primeiro parto (IPP) e a inclusão no rebanho (IReb) foram utilizadas como expressões da PS. A PP foi avaliada pela habilidade de permanência (HP) no rebanho aos 48, 60 e 72 meses de idade. Os grupos de contemporâneos foram formados pela concatenação das variáveis rebanho, ano e estação de nascimento. Os parâmetros genéticos e ambientais foram estimados mediante metodologias frequentista e bayesiana. Os valores de herdabilidade da IPP (0,02), da IReb (0,00) e da HP nas três idades estudadas (0,00) permitiram concluir que para esses rebanhos, não seria eficaz a inclusão destas em um índice econômico de seleção, pelo fato de não se apresentarem herdáveis. Sendo assim, a combinação dessas características se deu de forma fenotípica mediante o emprego do RMat. Este índice bioeconômico apresentou valor médio de 48 kg/vaca/ano e se mostrou herdável (0,45 ± 0,02). Portanto, eficaz na identificação de touros cujas filhas tenderam a ser precoces, produziram dois bezerros até os quatro anos de idade e estes, de desempenho superior para a produção de carne, sem aumentar os custos de produção. A PP até os 53 meses foi o componente que resultou em maior variação do RMat, quando houve o aumento, em uma unidade, do número de partos da fêmea. A combinação da PS, PP e PM, considerando o CM das vacas, no índice RMat, foi eficaz na identificação de touros para eficiência reprodutiva / Abstract: The objective of this research was to evaluate the reproductive efficiency of Nelore female cattle, using the index maternal return (MatR, kg of live weight/cow/year), considering the maintenance costs (MC) of females and including the following traits; sexual precocity (SP), stayability (ST), maternal productivity (MP). For this research the data bank of the breeding program PAINT® of CRV Lagoa has been used. Initially, the specific studies of SP and ST were been done separately. The age of first calving (AFC) and inclusion in the herd (IH) were used as SP expressions. The ST was evaluated at an age of 48, 60 and 72 months. Genetics and environmental parameters were estimated based on the frequentist and bayesian methodology. With heritability values of AFC (0.02), IH (0.00) and ST (0.00) at the three different ages one could conclude that for these herds it would not be efficient to include those traits in an economic selection index, due to the fact that those would not show inheritable. Therefore the combination of these traits was done in a phenotype way through the use of MatR, which estimated an average of 48 kg/cow/year. MatR proved to be heritable (0.45 ± 0.02) and was efficient to identify sires which daughters started their reproductive life at an early age; had assiduity; daughters were calving twice until four years of age; and had offspring with higher performance for beef production without increasing the production costs. The ST until 53 months of age was the component that resulted into more MatR variation, when increasing one extra calving. The combination between SP, ST and MP, considering MC of cows, in the MatR index was efficient to indentify sires for reproductive efficiency / Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Roberto Carvalheiro / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Vânia Cardoso / Doutor
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Eficiência reprodutiva de fêmeas NeloreTanaka, Aila Loise Ribeiro [UNESP] 26 February 2010 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T19:42:45Z : No. of bitstreams: 1
tanaka_alr_dr_jabo.pdf: 606668 bytes, checksum: 5a7196c5b2fd4fce98bad3e0e8e4765f (MD5) / Objetivou-se avaliar a eficiência reprodutiva por meio de um índice denominado retorno maternal (RMat) (kg/vaca/ano), composto pelas características: precocidade sexual (PS), permanência produtiva (PP) e produtividade materna (PM), considerando o custo de mantença (CM) da fêmea. Para o estudo, utilizou-se o banco de dados da raça Nelore do programa PAINT®, da CRV Lagoa. Inicialmente, estudos específicos da PS e da PP foram conduzidos separadamente. A idade ao primeiro parto (IPP) e a inclusão no rebanho (IReb) foram utilizadas como expressões da PS. A PP foi avaliada pela habilidade de permanência (HP) no rebanho aos 48, 60 e 72 meses de idade. Os grupos de contemporâneos foram formados pela concatenação das variáveis rebanho, ano e estação de nascimento. Os parâmetros genéticos e ambientais foram estimados mediante metodologias frequentista e bayesiana. Os valores de herdabilidade da IPP (0,02), da IReb (0,00) e da HP nas três idades estudadas (0,00) permitiram concluir que para esses rebanhos, não seria eficaz a inclusão destas em um índice econômico de seleção, pelo fato de não se apresentarem herdáveis. Sendo assim, a combinação dessas características se deu de forma fenotípica mediante o emprego do RMat. Este índice bioeconômico apresentou valor médio de 48 kg/vaca/ano e se mostrou herdável (0,45 ± 0,02). Portanto, eficaz na identificação de touros cujas filhas tenderam a ser precoces, produziram dois bezerros até os quatro anos de idade e estes, de desempenho superior para a produção de carne, sem aumentar os custos de produção. A PP até os 53 meses foi o componente que resultou em maior variação do RMat, quando houve o aumento, em uma unidade, do número de partos da fêmea. A combinação da PS, PP e PM, considerando o CM das vacas, no índice RMat, foi eficaz na identificação de touros para eficiência reprodutiva / The objective of this research was to evaluate the reproductive efficiency of Nelore female cattle, using the index maternal return (MatR, kg of live weight/cow/year), considering the maintenance costs (MC) of females and including the following traits; sexual precocity (SP), stayability (ST), maternal productivity (MP). For this research the data bank of the breeding program PAINT® of CRV Lagoa has been used. Initially, the specific studies of SP and ST were been done separately. The age of first calving (AFC) and inclusion in the herd (IH) were used as SP expressions. The ST was evaluated at an age of 48, 60 and 72 months. Genetics and environmental parameters were estimated based on the frequentist and bayesian methodology. With heritability values of AFC (0.02), IH (0.00) and ST (0.00) at the three different ages one could conclude that for these herds it would not be efficient to include those traits in an economic selection index, due to the fact that those would not show inheritable. Therefore the combination of these traits was done in a phenotype way through the use of MatR, which estimated an average of 48 kg/cow/year. MatR proved to be heritable (0.45 ± 0.02) and was efficient to identify sires which daughters started their reproductive life at an early age; had assiduity; daughters were calving twice until four years of age; and had offspring with higher performance for beef production without increasing the production costs. The ST until 53 months of age was the component that resulted into more MatR variation, when increasing one extra calving. The combination between SP, ST and MP, considering MC of cows, in the MatR index was efficient to indentify sires for reproductive efficiency
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Estudo da idade da vaca ao último parto para avaliar longevidade em rebanhos da raça nelore por análise de sobrevivência /Caetano, Sabrina Luzia. January 2011 (has links)
Resumo: No Brasil, existem poucos estudos sobre longevidade de vacas de corte, principalmente utilizando ferramentas de análise de sobrevivência na estimação de parâmetros genéticos. Todavia, os critérios para avaliar esta característica são vários, tal que em alguns destes nem todos os registros das vacas nos rebanhos podem ser levados em consideração, devido à metodologia de análise utilizada. Uma variável que é de fácil mensuração e já faz parte da maioria dos controles zootécnicos das fazendas é a idade da vaca ao último parto (IVUP). Neste trabalho, objetivo foi avaliar a longevidade das vacas nos rebanhos utilizando a variável IVUP, por meio da metodologia de análise de sobrevivência. Esta variável foi utilizada mediante um critério para analisar a longevidade produtiva de vacas nos rebanhos. O critério adotado foi a diferença entre a data em relação ao último parto de cada vaca e a data do último parto de cada fazenda. Se esta diferença foi superior a 36 meses, a vaca falhou e foi considerada descartada. Caso contrário, esta vaca foi censurada, indicando que esta ainda poderia ter futuras parições. O critério de 36 meses foi proposto por ser período suficiente para a ocorrência de um novo parto. A metodologia de análise de sobrevivência foi utilizada por considerar dados censurados e não censurados. As variáveis: estação e ano de nascimento de cada vaca, a fazenda e a idade ao primeiro parto foram utilizadas para as análises da variável IVUP. Um estudo prévio por meio de curvas de Kaplan-Meier e o modelo de Cox, utilizando a distribuição gama para os touros, desconsiderando o parentesco entre eles, foram realizados. O software Survival Kit foi empregado para estimação dos parâmetros genéticos, levando em consideração o parentesco entre os animais. Verificou-se que a IVUP apresentou herdabilidade de 0,25, e que seu uso permite avaliar a ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In Brazil, there are few studies about stayability, especially using tools of survival analysis in the estimation of breeding values and heritability. The criteria for evaluating this characteristic are different, such that in some of these not all information in the herds of cows can be taken into consideration, because the method of analysis used. In addition, the definitions that consider the date of disposal of the animal affect the use of information obtained in practice, because until the cows come out of the flock may take years, thus the evaluation of their parents is impaired, since the goal is selection. A variable that is easy to measure and is already part of most controls husbandry farms are cow age at last birth (IVUP). This variable was used by one criterion to analyze the productive longevity of cows in herds. The criterion was the difference between the date from the last delivery date of each cow and the last part of each farm. If this difference was more than 36 months, the cow was considered failed and discarded. Otherwise, this cow was censored, indicating that this could still have further parities. The criterion of 36 months was proposed to be sufficient time for the occurrence of a new birth. The methodology of survival analysis was used. The variables season and year of birth of each cow, farm and age at first birth were used for analysis of variable IVUP. The objective of this study was to evaluate the performance of the variable IVUP through estimates of genetic and fixed effect, to study the longevity of cows in the herd. A previous study by Kaplan-Meier and Cox model using the gamma distribution for the bulls, disregarding the relationship between them, were performed. The Survival Kit software was used to estimate the genetic parameters, taking into account the relationship between the animals. It was found that the heritability of 0.25 for IVUP ... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Claudia Cristina Paro da Paz / Coorientador: Raysildo Barbosa Lobo / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Henrique Nunes De Oliveira / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Lenira El Faro Zadra / Doutor
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Estudo da idade da vaca ao último parto para avaliar longevidade em rebanhos da raça nelore por análise de sobrevivênciaCaetano, Sabrina Luzia [UNESP] 05 July 2011 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2011-07-05Bitstream added on 2014-06-13T18:43:23Z : No. of bitstreams: 1
caetano_sl_dr_jabo.pdf: 775583 bytes, checksum: a57f6e271b7d34656d680987f933ba7d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / No Brasil, existem poucos estudos sobre longevidade de vacas de corte, principalmente utilizando ferramentas de análise de sobrevivência na estimação de parâmetros genéticos. Todavia, os critérios para avaliar esta característica são vários, tal que em alguns destes nem todos os registros das vacas nos rebanhos podem ser levados em consideração, devido à metodologia de análise utilizada. Uma variável que é de fácil mensuração e já faz parte da maioria dos controles zootécnicos das fazendas é a idade da vaca ao último parto (IVUP). Neste trabalho, objetivo foi avaliar a longevidade das vacas nos rebanhos utilizando a variável IVUP, por meio da metodologia de análise de sobrevivência. Esta variável foi utilizada mediante um critério para analisar a longevidade produtiva de vacas nos rebanhos. O critério adotado foi a diferença entre a data em relação ao último parto de cada vaca e a data do último parto de cada fazenda. Se esta diferença foi superior a 36 meses, a vaca falhou e foi considerada descartada. Caso contrário, esta vaca foi censurada, indicando que esta ainda poderia ter futuras parições. O critério de 36 meses foi proposto por ser período suficiente para a ocorrência de um novo parto. A metodologia de análise de sobrevivência foi utilizada por considerar dados censurados e não censurados. As variáveis: estação e ano de nascimento de cada vaca, a fazenda e a idade ao primeiro parto foram utilizadas para as análises da variável IVUP. Um estudo prévio por meio de curvas de Kaplan-Meier e o modelo de Cox, utilizando a distribuição gama para os touros, desconsiderando o parentesco entre eles, foram realizados. O software Survival Kit foi empregado para estimação dos parâmetros genéticos, levando em consideração o parentesco entre os animais. Verificou-se que a IVUP apresentou herdabilidade de 0,25, e que seu uso permite avaliar a... / In Brazil, there are few studies about stayability, especially using tools of survival analysis in the estimation of breeding values and heritability. The criteria for evaluating this characteristic are different, such that in some of these not all information in the herds of cows can be taken into consideration, because the method of analysis used. In addition, the definitions that consider the date of disposal of the animal affect the use of information obtained in practice, because until the cows come out of the flock may take years, thus the evaluation of their parents is impaired, since the goal is selection. A variable that is easy to measure and is already part of most controls husbandry farms are cow age at last birth (IVUP). This variable was used by one criterion to analyze the productive longevity of cows in herds. The criterion was the difference between the date from the last delivery date of each cow and the last part of each farm. If this difference was more than 36 months, the cow was considered failed and discarded. Otherwise, this cow was censored, indicating that this could still have further parities. The criterion of 36 months was proposed to be sufficient time for the occurrence of a new birth. The methodology of survival analysis was used. The variables season and year of birth of each cow, farm and age at first birth were used for analysis of variable IVUP. The objective of this study was to evaluate the performance of the variable IVUP through estimates of genetic and fixed effect, to study the longevity of cows in the herd. A previous study by Kaplan-Meier and Cox model using the gamma distribution for the bulls, disregarding the relationship between them, were performed. The Survival Kit software was used to estimate the genetic parameters, taking into account the relationship between the animals. It was found that the heritability of 0.25 for IVUP ... (Complete abstract click electronic access below)
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"Análise bayesiana da probabilidade de permanência no rebanho como característica de seleção para a raça Nelore" / Bayesian inference for stayability as selection criteria in Nelore beef cattleMarcondes, Cintia Righetti 12 September 2003 (has links)
As novas biotecnologias em reprodução, como a transferência de embriões e a fecundação in vitro, de certo modo, despertaram nos produtores e pesquisadores da área de melhoramento animal o interesse na seleção de fêmeas, antes pouco explorada dada a grande ênfase empregada na seleção e avaliação de reprodutores machos. A cada ano é percebido que a pecuária de corte funciona como uma empresa e, como tal, deve-se preocupar com todos os detalhes e não enfocando apenas um, como o mais importante, e é com isso que o Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-USP) estuda cada vez mais um número maior de características como, stayability e suas possíveis aplicações à seleção das vacas Nelore, pois tem grande importância econômica. Com o objetivo de analisar a característica stayability sob enfoque Bayesiano, em registros de produção de vacas da raça Nelore, inicialmente foram implementados dois tamanhos de cadeia de Gibbs (225 ou 550 mil), dois períodos de descarte amostral (25 ou 50 mil) e duas formas de tomadas de amostra (a cada 1000 ou 250 rodadas). Os registros foram codificados como 0 (fracasso, ou menos de três partos até os 6 anos de idade) ou 1 (sucesso, ou pelo menos três partos até os 6 anos de idade) e os arquivos sofreram restrição ou não para NEP (Número Efetivo de Progênie), para número de touros dentro do grupo de contemporâneos (GC) e exclusão de grupos inteiros com média para a característica igual a 0 ou 1 (ou seja, sem variabilidade dentro do GC). Testaram-se três definições para GC. Utilizou-se o software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models), sob modelo unicaráter de touro-avô materno, para obtenção de componentes de (co)variância, estimativas de herdabilidade e soluções para cada touro (que originam as Diferenças Esperadas na Progênie - DEPs). As análises resultaram em amostras com baixa correlação serial, mostraram pequenas diferenças entre as estimativas pontuais de herdabilidade e alta correlação de rank para as DEPs dos 4180 touros avaliados. Adotou-se a implementação tamanho da cadeia/descarte amostral/amostragem como 225mil/25mil/1000 para as análises subseqüentes. A comparação entre estimativas de herdabilidade obtidas sob modelo de limiar e sob modelo linear não mostrou vantagens do primeiro, sendo que análises sob modelo linear, que têm reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas quando houver muitos registros de produção, bastando transformar as estimativas de herdabilidade para escala subjacente. As comparações, sob modelo linear ajustadas para escala subjacente, entre a stayability padrão (0 ou 1) e a alternativa (considerando o número de partos até os seis anos de idade para aquelas vacas antes codificadas com valor 1), mostraram que podem ocorrer alterações na classificação de um número significativo de touros avaliados, mesmo sendo nas posições intermediárias do rank, talvez pela ligeira capacidade da característica alternativa em detectar variabilidade entre touros. Classificaram-se os 4180 touros em ordem decrescente e foram estudadas as genealogias dos 42 melhores (também chamados de TOP 1% ou aqueles que apresentam DEP para stayability superior a 57,6%) para identificar famílias importantes e avaliar a variabilidade genética da stayability. Além do touro Karvadi Imp. (essencialmente presente como avô, bisavô ou tataravô das mães dos touros TOP1%), outros genearcas com grande representatividade entre os TOP1% foram os touros Godhavari Imp. (via Kurupathy e Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã e Falo da BV (estes últimos pela via materna). / The new reproduction technologies like embryo transfer and in vitro fertilization brought to animal breeding researchers, and producers, a growing interest in the selection of females, which was a subject not well explored before, when the focus used to be only on evaluation and selection of males. The beef cattle industry is becoming more competitive each year, and the producers must think about all the aspects and details that can affect the production process. The PMGRN-USP (Nelore Breeding Program of the São Paulo University) studies a large number of traits to be used as selection criteria. Among these traits, there is stayability, which has a great economic importance. The aim of this project was to analyze the trait stayability, with a Bayesian approach, in a Nelore cattle population. Firstly, the implementation used two lengths of Gibbs chain (225 or 550 thousand), two periods of burn-in (25 or 50 thousand) and two thinning intervals (at each 1000 or 250 rounds). The cows were classified as 0 (failure, or less than three calves until six years of age), or 1 (success, or at least 3 calves until six years of age). The data were, or were not, restricted for NEP (Effective Number of Progeny), for number of sires in the contemporary group (GC), and for lack of variability in the contemporary group. Three different definitions of GC were tested. The software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models) was used, under an univariate sire-maternal grandsire model to get the (co)variance components, the heritability estimate and the solutions to each sire (that are used to get the Expected Progeny Differences - EPD). The results showed a low serial correlation in the samples, small differences among heritability estimates and a high rank correlation among the EPD estimates of the 4180 sires evaluated. The implementation 225000/25000/1000 was adopted to the subsequent analysis. The comparison between the heritability estimates obtained under the threshold model and the linear model didnt show any advantage to the first. The analysis under linear models could be preferred because of its reduced processing time in large data sets, needing only a transformation of the heritability estimates to the underlying scale. The comparisons, under linear model adjusted to the underlying scale, between the standard stayalility (0 or 1) and the alternative (obtained from the perception of the fertility differences among the cows classified as 1) showed a variation in the position of a considerable number of sires in the rank, maybe because the alternative trait gets some additional variation among sires. 4180 sires were classified in a rank and the genealogies of the 42 best sires (or TOP 1%, or the ones with stayability EPD greater than 57,6%) were studied to identify major families and evaluate the genetic variation of stayability. Besides of Karvardi Imp (a bull very present as an ascendant (2, 3 or 4 generations) of the dams of the TOP1% sires), another founder sires with influence among the TOP1% were Godhavari Imp (via Kurupathy and Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã, and Falo da BV (the last two via maternal).
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"Análise bayesiana da probabilidade de permanência no rebanho como característica de seleção para a raça Nelore" / Bayesian inference for stayability as selection criteria in Nelore beef cattleCintia Righetti Marcondes 12 September 2003 (has links)
As novas biotecnologias em reprodução, como a transferência de embriões e a fecundação in vitro, de certo modo, despertaram nos produtores e pesquisadores da área de melhoramento animal o interesse na seleção de fêmeas, antes pouco explorada dada a grande ênfase empregada na seleção e avaliação de reprodutores machos. A cada ano é percebido que a pecuária de corte funciona como uma empresa e, como tal, deve-se preocupar com todos os detalhes e não enfocando apenas um, como o mais importante, e é com isso que o Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-USP) estuda cada vez mais um número maior de características como, stayability e suas possíveis aplicações à seleção das vacas Nelore, pois tem grande importância econômica. Com o objetivo de analisar a característica stayability sob enfoque Bayesiano, em registros de produção de vacas da raça Nelore, inicialmente foram implementados dois tamanhos de cadeia de Gibbs (225 ou 550 mil), dois períodos de descarte amostral (25 ou 50 mil) e duas formas de tomadas de amostra (a cada 1000 ou 250 rodadas). Os registros foram codificados como 0 (fracasso, ou menos de três partos até os 6 anos de idade) ou 1 (sucesso, ou pelo menos três partos até os 6 anos de idade) e os arquivos sofreram restrição ou não para NEP (Número Efetivo de Progênie), para número de touros dentro do grupo de contemporâneos (GC) e exclusão de grupos inteiros com média para a característica igual a 0 ou 1 (ou seja, sem variabilidade dentro do GC). Testaram-se três definições para GC. Utilizou-se o software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models), sob modelo unicaráter de touro-avô materno, para obtenção de componentes de (co)variância, estimativas de herdabilidade e soluções para cada touro (que originam as Diferenças Esperadas na Progênie - DEPs). As análises resultaram em amostras com baixa correlação serial, mostraram pequenas diferenças entre as estimativas pontuais de herdabilidade e alta correlação de rank para as DEPs dos 4180 touros avaliados. Adotou-se a implementação tamanho da cadeia/descarte amostral/amostragem como 225mil/25mil/1000 para as análises subseqüentes. A comparação entre estimativas de herdabilidade obtidas sob modelo de limiar e sob modelo linear não mostrou vantagens do primeiro, sendo que análises sob modelo linear, que têm reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas quando houver muitos registros de produção, bastando transformar as estimativas de herdabilidade para escala subjacente. As comparações, sob modelo linear ajustadas para escala subjacente, entre a stayability padrão (0 ou 1) e a alternativa (considerando o número de partos até os seis anos de idade para aquelas vacas antes codificadas com valor 1), mostraram que podem ocorrer alterações na classificação de um número significativo de touros avaliados, mesmo sendo nas posições intermediárias do rank, talvez pela ligeira capacidade da característica alternativa em detectar variabilidade entre touros. Classificaram-se os 4180 touros em ordem decrescente e foram estudadas as genealogias dos 42 melhores (também chamados de TOP 1% ou aqueles que apresentam DEP para stayability superior a 57,6%) para identificar famílias importantes e avaliar a variabilidade genética da stayability. Além do touro Karvadi Imp. (essencialmente presente como avô, bisavô ou tataravô das mães dos touros TOP1%), outros genearcas com grande representatividade entre os TOP1% foram os touros Godhavari Imp. (via Kurupathy e Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã e Falo da BV (estes últimos pela via materna). / The new reproduction technologies like embryo transfer and in vitro fertilization brought to animal breeding researchers, and producers, a growing interest in the selection of females, which was a subject not well explored before, when the focus used to be only on evaluation and selection of males. The beef cattle industry is becoming more competitive each year, and the producers must think about all the aspects and details that can affect the production process. The PMGRN-USP (Nelore Breeding Program of the São Paulo University) studies a large number of traits to be used as selection criteria. Among these traits, there is stayability, which has a great economic importance. The aim of this project was to analyze the trait stayability, with a Bayesian approach, in a Nelore cattle population. Firstly, the implementation used two lengths of Gibbs chain (225 or 550 thousand), two periods of burn-in (25 or 50 thousand) and two thinning intervals (at each 1000 or 250 rounds). The cows were classified as 0 (failure, or less than three calves until six years of age), or 1 (success, or at least 3 calves until six years of age). The data were, or were not, restricted for NEP (Effective Number of Progeny), for number of sires in the contemporary group (GC), and for lack of variability in the contemporary group. Three different definitions of GC were tested. The software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models) was used, under an univariate sire-maternal grandsire model to get the (co)variance components, the heritability estimate and the solutions to each sire (that are used to get the Expected Progeny Differences - EPD). The results showed a low serial correlation in the samples, small differences among heritability estimates and a high rank correlation among the EPD estimates of the 4180 sires evaluated. The implementation 225000/25000/1000 was adopted to the subsequent analysis. The comparison between the heritability estimates obtained under the threshold model and the linear model didnt show any advantage to the first. The analysis under linear models could be preferred because of its reduced processing time in large data sets, needing only a transformation of the heritability estimates to the underlying scale. The comparisons, under linear model adjusted to the underlying scale, between the standard stayalility (0 or 1) and the alternative (obtained from the perception of the fertility differences among the cows classified as 1) showed a variation in the position of a considerable number of sires in the rank, maybe because the alternative trait gets some additional variation among sires. 4180 sires were classified in a rank and the genealogies of the 42 best sires (or TOP 1%, or the ones with stayability EPD greater than 57,6%) were studied to identify major families and evaluate the genetic variation of stayability. Besides of Karvardi Imp (a bull very present as an ascendant (2, 3 or 4 generations) of the dams of the TOP1% sires), another founder sires with influence among the TOP1% were Godhavari Imp (via Kurupathy and Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã, and Falo da BV (the last two via maternal).
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