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Modelagem da função de incidência cumulativa na presença de riscos competitivos em análise de sobrevivência / Modeling the cumulative incidence function in the presence of competing risks in survival analysis

Tomaz, Flávia Sílvia Corrêa 12 December 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-03-22T16:23:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2386767 bytes, checksum: afcf24339e17dafff1d7bcc92f79fe8c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-22T16:23:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2386767 bytes, checksum: afcf24339e17dafff1d7bcc92f79fe8c (MD5) Previous issue date: 2017-12-12 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Riscos competitivos surgem em situações em que um indivíduo pode falhar devido à várias causas distintas. Na presença de riscos competitivos a estimação e/ou avaliação do efeito de covariáveis sobre a função de incidência cumulativa (subdistribuição) frequentemente é de interesse. Essa função quantifica a probabilidade de um indivíduo experimentar um evento específico, ou seja, falhar devido a uma determinada causa dentre um conjunto de causas de falha. A estimação não paramétrica da função de incidência, por vezes, é obtida por meio do complemento do estimador de Kaplan-Meier, embora esse procedimento não seja adequado e procedimento apropriado para este propósito esteja disponível. No que se refere a modelagem do efeito de covariáveis sobre a função de incidência, abordagens comumente difundidas baseiam-se ou no risco específico por causa ou no risco da subdistribuição. A primeira ignora a presença dos riscos competitivos, enquanto a segunda leva em consideração os riscos competitivos e frequentemente utiliza o modelo de Fine e Gray. Embora existam alternativas ao modelo de Fine e Gray, estas são pouco discutidas. Neste sentido, o objetivo deste trabalho foi avaliar a estimação da função de incidência cumulativa, bem como verificar como a censura e a relação entre proporção de eventos competitivos afetam a estimação dessa função. Ademais objetivou-se avaliar três modelos de regressão para a função de incidência (modelo de regressão com ligação logarítmica, modelo de regressão com ligação logit e modelo de Fine e Gray). Além de um conjunto de dados reais sobre lesões em cavalos foi utilizado também um estudo de simulação. Os resultados encontrados reforçam relatos encontrados na literatura, que apontam a superestimação da função de incidência cumulativa quando a mesma é estimada como complemento do estimador de Kaplan-Meier, bem como a não correspondência entre os efeitos das covariáveis estimados com base no risco específico por causa e o baseado no risco da subdistribuição. Por meio do estudo de simulação constatou-se que a percentagem de censura bem como a relação entre os eventos competitivos afeta a estimação da função de incidência cumulativa. Verificou-se também, que, em geral, o modelo de regressão com ligação logarítmica mostrou-se uma alternativa ao modelo de Fine e Gray. / Competing risks arise in situations where an individual may fail due to several different causes. In the presence of competing risks the estimation and / or evaluation of the effect of covariates on the cumulative incidence function (subdistribution) is often of interest. This function quantifies the probability of an individual experiencing a specific event, that is, failure due to a cause within a set of causes of failure. The non-parametric estimation of the incidence function is sometimes obtained through the complement of the Kaplan-Meier estimator, although this procedure is not adequate and an appropriate procedure for this purpose is available. With regard to modeling of the effect of covariates on the incidence function, commonly disseminated approaches are based either on the cause-specific hazard or at the subdistribution hazard. The former ignores the presence of competing risks, while the latter takes into account competing risks and often uses the Fine and Gray model. Although there are alternatives to the Fine and Gray model, these are little discussed. In this sense, the objective of this work was to evaluate the estimation of the cumulative incidence function, as well as to verify how the censorship and the relation between the proportion of competitive events affect the estimation of this function. In addition, we evaluated three regression models for the incidence function (regression model with log-link function, regression model with logit-link function and Fine and Gray model). In addition to a set of real data on injuries in horses was also used a simulation study. The results found reinforce reports found in the literature, which point to the overestimation of the cumulative incidence function when it is estimated to complement the Kaplan-Meier estimator, as well as the non match between the effects of covariates estimated based on the cause specific hazard and the of subdistribution hazard. By means of the simulation study it was verified that the percentage of censorship as well as the relation between the competitive events affects the estimation of the function of cumulative incidence. It was also found that, in general, the regression model with log-link function was an alternative to the Fine and Gray model.
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Avaliação da retenção de ionomero de vidro modificado por resina (Vitremer'TRADE MAKER') como selante oclusal, de acordo com o risco de carie dentaria / Avaliation of the retencion of ionomeric sealer modified by resin (Vitremer), as a oclusal sealer, according to cavities risk

Oliveira, Juliana Gobbo de 14 August 2018 (has links)
Orientador: Antonio Carlos Pereira / Dissertação (mestrado profissional) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-14T03:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_JulianaGobbode_M.pdf: 947660 bytes, checksum: 6fdaad170a78d94e585a32986b75b455 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O objetivo do presente estudo foi avaliar, por meio de um modelo de análise de sobrevivência, a retenção do selante ionomérico modificado por resina (Vitremer®) aplicado sobre as superfícies oclusais dos primeiros molares permanentes de escolares de 6 a 8 anos de idade em Piracicaba, SP. Os escolares foram selecionados por meio de exame prévio e de acordo com o risco individual, por uma única examinadora, calibrada e seguindo as recomendações da OMS para a cárie dentária e adicionalmente, foi feita a inclusão de lesões iniciais ativas (LI). Foram incluídos os indivíduos que apresentaram ao menos dois primeiros molares permanentes hígidos, num total de 93 escolares provenientes de duas escolas municipais e alocados em dois grupos de acordo com o risco individual - Grupo (AS) - alto risco selante (n= 57) e aqueles com ceod e CPOD=0 pertenceram ao Grupo (BS) - baixo risco selante (n=52). A aplicação do selante ionomérico (Vitremer®) nas superfícies oclusais dos primeiros molares permanentes hígidos foi realizada em ambiente clínico e as avaliações e realizadas a cada seis meses por uma examinadora calibrada. Um modelo de análise de Sobrevivência (método de Kaplan-Meier) estimou as probabilidades de sobrevivência do selante na superfície oclusal (tempo para a perda total do selante). Aos 18 meses de acompanhamento os grupos AS e BS apresentaram 8 e 6 selantes com perda total do material, respectivamente, correspondendo a 4,1% de perda para os de alto risco e 3,1% para os de baixo risco. Em relação à perda parcial, observou-se aos 18 meses 11,7% e 9,3% para os grupos AS e BS, respectivamente. Não houve diferença entre os grupos quanto à sobrevivência do selante. Conclui-se que o selante ionomérico modificado por resina (Vitremer®) é satisfatório quanto à retenção, após 18 meses de avaliação e sugere-se estudos longitudinais mais extensos para averiguar essa retenção ao longo do tempo. / Abstract: The objective of the present study was to evaluate, by an analysis surviving model, the retencion of ionomeric sealer modified by resin (Vitremer), applied on oclusal surface of permanent molar teeth of children of age range 6-8 years on schools of Piracicaba city, SP. Children were selected by a previus exam and according to individual riscs, by only one evaluator, blinded and following the recomendations of WHO (World Health Organization) to cavities and additionally, included the initial cavities lesion. Patients who had at least two permanent molars with no cavities were included. Ninetythree students from two schools were recruted and divided according to individual riscs into the following groups: Group (HS) - high level sealer (n=57) and Group (LS) - low level sealer (n=52) whose teeth had "dmf" and DMFT = 0. The ionomeric sealer (Vitremer®) was applied in a clinical procedure on teeth with no cavities. Evaluation was done at every six months by an evaluator. An analysis surviving model (Kaplan-Meier method) evaluated the loss of the sealer from oclusal surface of the teeth. After 18 months groups HS and LS demonstrated 8 and 6 total loss of sealer, respecitvely. The percentage of lost were 4,1% to high level and 3,1% to low level. According to partial loss, after 18 months the percentage presented to HS was 11,7% and 9,3% to LS. There was no statistically significant difference between the two treatment groups from surviving sealer. The evaluation of the groups led to a conclusion that ionomeric sealer (Vitremer®) is very satisfatory on retencion after 18 months evaluation. Further research is required to determine the effectiviness and efficiency of sealer activity. / Mestrado / Odontologia em Saude Coletiva / Mestre Profissional em Odontologia em Saúde Coletiva
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Avaliação da longevidade de vacas da raça Nelore por diferentes critérios utilizando análise de sobrevivência /

Ramos, Salvador Boccaletti. January 2014 (has links)
Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Sabrina Luzia Caetano / Banca: Humberto Tonhati / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: José Bento Sterman Ferraz / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Resumo: A habilidade de permanência da vaca no rebanho é economicamente importante em gado de corte. Quanto mais tempo a vaca permanecer no rebanho, maiores serão as chances da vaca pagar seus custos de recria e gerar lucro ao produtor. Este trabalho teve dois objetivos: primeiro, avaliar a variável idade da vaca ao último parto (IVUP) como medida de habilidade de permanência da vaca no rebanho em diferentes critérios de censura; segundo, estimar parâmetros genéticos para a mesma para cada um dos diferentes critérios de censura considerados. Registros de 22312 vacas da raça Nelore provenientes de 13 fazendas foram utilizados neste estudo. As variáveis explanatórias utilizadas foram idade ao primeiro parto, número de partos, estação e ano de nascimento e fazenda. Três critérios de censura foram escolhidos: 16, 26 e 36 meses de idade. Metodologias de análise de sobrevivência foram utilizadas para a análise dos dados e estimação dos parâmetros das curvas de sobrevivência e risco. A variância de IVUP foi estudada considerando o efeito de cada variável explanatória proposta para os três critérios de censura. A metodologia dos estimadores de Kaplan-Meier foi empregada para estimar a probabilidade da vaca permanecer no rebanho. O modelo de riscos proporcionais de Cox foi utilizado para estimar o risco da vaca deixar o rebanho. Os valores genéticos dos animais e a herdabilidade do risco da vaca deixar o rebanho foram estimados por modelo de riscos proporcionais de Weibull. A análise da classificação dos reprodutores com base no valor genético foi realizada por meio do teste de correlação de Spearman. Quanto maior o valor do critério de censura adotado, maior foi o número de vacas com informações completas incluídas na análise. Há diferenças significativas (P<0,05) entre as funções de sobrevivência e risco dos três critérios adotados. A habilidade de permanência da ... / Abstract: Stayability is economically importante in the beef cattle industry. The longer the cow ramains in the herd, the greater are the chances it will pay for its costs and generate revenue. This study had two objectives: first, evaluate the variable age of cow at last calving (ALC) as a measurement of stayability considering diferent censoring criteria; second, to estimate genetic parameters for the same variable considering the diferent censoring criteria. Records of 22313 Nellore cows, from 13 farms were used in this study. The explanatory variables considered were age at first calving, number of calvings, season and year of birth and farm. Three censoring criteria were chosen: 16, 26 and 36 months of age. Survival analysis techniques were used to evaluate the variable and to estimate survival and risk curves. The variance of the ALC was studied considering the effect of each explanatory variable. The Kaplan-Meier method was used to estimate the cows'survival curves. The Cox proportional hazards model was used to estimate the hazard of the cow being culled. The breeding values and heritability of the hazard of being culled were estimated by a proportional hazards Weibull model. The Spearman correlation test was used to study the rank of the animals considering the three censoring criteria. The greater the censoring criterion addopted, the greater was the number of cows with complete records. The estimated survival curves and hazard functions differ among each other (P<0.05). The stayability estimated considering the 16 months of age criterion was the greater when compared with the other censoring criteria. The heritability estimates for the 16, 26 and 36 months criteria were 0.1020, 0.1002 and 0.0871, respectively. The Spearman correlation estimates for the 16 and 26, 16 and36 and 26 and 36 months of censoring criteria were -0.2124, 0.1348 and 0.1211, respectively (P>0.05). A big part of the ... / Doutor
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Câncer de mama em mulheres com idade igual ou superior a 65 anos

Traebert, Érica Elaine January 2006 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências da Saúde. Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas. / Made available in DSpace on 2012-10-22T15:41:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 236949.pdf: 556485 bytes, checksum: 42c8d241d73a2a345a62d50c801e3363 (MD5) / O câncer de mama é a principal neoplasia malígna que acomete as mulheres e cerca de 50% dos casos ocorrem a partir dos 65 anos. Apesar da alta prevalência da doença nesta faixa etária, ainda permanecem controvérsias quanto ao seu prognóstico evolutivo.Objetivo: Conhecer a probabilidade de sobrevida livre de doença em mulheres com câncer de mama com idade igual ou superior a 65 anos ao longo do tempo.Método: Estudo com delineamento do tipo coorte histórica, a partir de levantamento de dados dos prontuários de 185 mulheres com câncer de mama atendidas no Serviço de Mastologia da Maternidade Carmela Dutra de Florianópolis/SC, no período de janeiro de 1992 a dezembro de 2003 e com seguimento até dezembro de 2004. Foi estudada a sobrevida livre de doença e utilizou-se o método de Kaplan-Meier.Resultados: A média de idade das pacientes foi de 72 anos. Ao final do período de seguimento, 69,7% das pacientes estavam vivas e sem doença, 14,1% estavam vivas e com doença, 10,3% foram a óbito por câncer de mama e 5,9% foram a óbito por outras causas. A probabilidade de sobrevida livre de doença em cinco e dez anos foi, respectivamente, de 73,1% e 47,6%. A partir do diagnóstico de câncer de mama, mulheres com idade igual ou superior a 65 anos, têm a probabilidade de sobrevida livre de doença de 73,1% em 5 anos e 47,6% em 10 anos.
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Análise de sobrevida dos pacientes com AIDS atendidos em um centro de pesquisa no Rio de Janeiro : 1986 a 2000

Dayse Pereira Campos 05 September 2001 (has links)
O objetivo deste trabalho é determinar o tempo decorrido e fatores relacionados a sobrevida, a partir do diagnóstico da AIDS dos pacientes atendidos no Centro de Pesquisa Hospital Evandro Chagas (CPqHEC). Comparar a sobrevida segundo os critérios definição de caso de AIDS estabelecidos pelo Centro de controle de doenças e prevenção dos EUA (CDC) em 1987 e 1993 e pelo Ministério da Saúde Brasil em 1998. De um total de 1591 indivíduos com sorologia positiva para HIV, cadastrados entre 1986 a 1999, foi selecionada uma amostra aleatória sistemática com 392 indivíduos, sendo identificados 193 casos de AIDS pelo critério CDC 1993. A sobrevida foi considerada como o tempo decorrido da data do diagnóstico da AIDS ao óbito (falha), sendo a censura definida para os pacientes com perda de seguimento ou que permaneceram vivos até dezembro de 2000, com a data da censura igual a data do último atendimento. A duração da sobrevida foi descrita através do método de Kaplan-Meier, sendo comparadas as funções de sobrevida das categorias das variáveis pelo teste log-rank. Um modelo com os co-fatores de maior relevância na sobrevida foi ajustado, utilizando-se o modelo dos riscos proporcionais de Cox. Dos 193 pacientes com AIDS, 92 (47,7%) morreram, 21 (10,9%) abandonaram o tratamento, e 80 (41,7%) permaneceram vivos até o fim do estudo. Encontramos sobrevida relativamente alta nos três critérios de definição de caso avaliados, em parte explicada pelos casos serem procedentes de um único hospital de pesquisa, com alto grau de conhecimento na condução da doença. A profilaxia primária para PPC foi preditor de melhor sobrevida. Casos com AIDS definida por herpes zoster apresentaram melhor prognóstico e os definidos por duas doenças o pior prognóstico.
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Avaliação da longevidade de vacas da raça Nelore por diferentes critérios utilizando análise de sobrevivência

Ramos, Salvador Boccaletti [UNESP] 20 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-20Bitstream added on 2014-11-10T11:57:52Z : No. of bitstreams: 1 000791444_20150320.pdf: 422723 bytes, checksum: 06f182b8a97cdf0fa0a0f4c67a5cf9d2 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-03-27T11:50:04Z: 000791444_20150320.pdf,Bitstream added on 2015-03-27T11:50:36Z : No. of bitstreams: 1 000791444.pdf: 1954582 bytes, checksum: 8a278cf67dc11ab83dab115a9bfc0bfc (MD5) / A habilidade de permanência da vaca no rebanho é economicamente importante em gado de corte. Quanto mais tempo a vaca permanecer no rebanho, maiores serão as chances da vaca pagar seus custos de recria e gerar lucro ao produtor. Este trabalho teve dois objetivos: primeiro, avaliar a variável idade da vaca ao último parto (IVUP) como medida de habilidade de permanência da vaca no rebanho em diferentes critérios de censura; segundo, estimar parâmetros genéticos para a mesma para cada um dos diferentes critérios de censura considerados. Registros de 22312 vacas da raça Nelore provenientes de 13 fazendas foram utilizados neste estudo. As variáveis explanatórias utilizadas foram idade ao primeiro parto, número de partos, estação e ano de nascimento e fazenda. Três critérios de censura foram escolhidos: 16, 26 e 36 meses de idade. Metodologias de análise de sobrevivência foram utilizadas para a análise dos dados e estimação dos parâmetros das curvas de sobrevivência e risco. A variância de IVUP foi estudada considerando o efeito de cada variável explanatória proposta para os três critérios de censura. A metodologia dos estimadores de Kaplan-Meier foi empregada para estimar a probabilidade da vaca permanecer no rebanho. O modelo de riscos proporcionais de Cox foi utilizado para estimar o risco da vaca deixar o rebanho. Os valores genéticos dos animais e a herdabilidade do risco da vaca deixar o rebanho foram estimados por modelo de riscos proporcionais de Weibull. A análise da classificação dos reprodutores com base no valor genético foi realizada por meio do teste de correlação de Spearman. Quanto maior o valor do critério de censura adotado, maior foi o número de vacas com informações completas incluídas na análise. Há diferenças significativas (P<0,05) entre as funções de sobrevivência e risco dos três critérios adotados. A habilidade de permanência da ... / Stayability is economically importante in the beef cattle industry. The longer the cow ramains in the herd, the greater are the chances it will pay for its costs and generate revenue. This study had two objectives: first, evaluate the variable age of cow at last calving (ALC) as a measurement of stayability considering diferent censoring criteria; second, to estimate genetic parameters for the same variable considering the diferent censoring criteria. Records of 22313 Nellore cows, from 13 farms were used in this study. The explanatory variables considered were age at first calving, number of calvings, season and year of birth and farm. Three censoring criteria were chosen: 16, 26 and 36 months of age. Survival analysis techniques were used to evaluate the variable and to estimate survival and risk curves. The variance of the ALC was studied considering the effect of each explanatory variable. The Kaplan-Meier method was used to estimate the cows’survival curves. The Cox proportional hazards model was used to estimate the hazard of the cow being culled. The breeding values and heritability of the hazard of being culled were estimated by a proportional hazards Weibull model. The Spearman correlation test was used to study the rank of the animals considering the three censoring criteria. The greater the censoring criterion addopted, the greater was the number of cows with complete records. The estimated survival curves and hazard functions differ among each other (P<0.05). The stayability estimated considering the 16 months of age criterion was the greater when compared with the other censoring criteria. The heritability estimates for the 16, 26 and 36 months criteria were 0.1020, 0.1002 and 0.0871, respectively. The Spearman correlation estimates for the 16 and 26, 16 and36 and 26 and 36 months of censoring criteria were -0.2124, 0.1348 and 0.1211, respectively (P>0.05). A big part of the ...
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Análise de sobrevida dos pacientes com AIDS atendidos em um centro de pesquisa no Rio de Janeiro : 1986 a 2000

Dayse Pereira Campos 05 September 2001 (has links)
O objetivo deste trabalho é determinar o tempo decorrido e fatores relacionados a sobrevida, a partir do diagnóstico da AIDS dos pacientes atendidos no Centro de Pesquisa Hospital Evandro Chagas (CPqHEC). Comparar a sobrevida segundo os critérios definição de caso de AIDS estabelecidos pelo Centro de controle de doenças e prevenção dos EUA (CDC) em 1987 e 1993 e pelo Ministério da Saúde Brasil em 1998. De um total de 1591 indivíduos com sorologia positiva para HIV, cadastrados entre 1986 a 1999, foi selecionada uma amostra aleatória sistemática com 392 indivíduos, sendo identificados 193 casos de AIDS pelo critério CDC 1993. A sobrevida foi considerada como o tempo decorrido da data do diagnóstico da AIDS ao óbito (falha), sendo a censura definida para os pacientes com perda de seguimento ou que permaneceram vivos até dezembro de 2000, com a data da censura igual a data do último atendimento. A duração da sobrevida foi descrita através do método de Kaplan-Meier, sendo comparadas as funções de sobrevida das categorias das variáveis pelo teste log-rank. Um modelo com os co-fatores de maior relevância na sobrevida foi ajustado, utilizando-se o modelo dos riscos proporcionais de Cox. Dos 193 pacientes com AIDS, 92 (47,7%) morreram, 21 (10,9%) abandonaram o tratamento, e 80 (41,7%) permaneceram vivos até o fim do estudo. Encontramos sobrevida relativamente alta nos três critérios de definição de caso avaliados, em parte explicada pelos casos serem procedentes de um único hospital de pesquisa, com alto grau de conhecimento na condução da doença. A profilaxia primária para PPC foi preditor de melhor sobrevida. Casos com AIDS definida por herpes zoster apresentaram melhor prognóstico e os definidos por duas doenças o pior prognóstico.
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Heterogeneidade não-observada na analise da historia de eventos

Matuda, Nivea da Silva 15 June 1998 (has links)
Orientador: Aida C. G. Verdugo Lazo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-23T18:33:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Matuda_NiveadaSilva_M.pdf: 3623854 bytes, checksum: 146f65b0f200872e091830629e681137 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed / Mestrado / Mestre em Estatística
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Modelos para dados grupados e sensurados aplicados à área biológica : comparação usando fator de Bayes /

Andrade, Sophia Lanza de. January 2015 (has links)
Orientador: Liciana Vaz de Arruda Silveira / Banca: Francisco Torres-Avilés / Banca: Rogério Antonio de Oliveira / Resumo: Dados grupados e um caso particular de dados de sobrevivência com censura intervalar, que ocorre quando as observações são avaliadas nos mesmos intervalos de tempo, e geralmente está associado a dados com grande número de empates, ou seja, quando a proporção de empates e maior que 25% (Chalita et al., 2002), e podem desta forma ser analisados considerando o tempo discreto e ajustando-se modelos a probabilidade do indivíduo falhar em um certo intervalo, dado que sobreviveu ao intervalo anterior (Lawless, 2002). Dentre os possíveis modelos adaptados a este tipo de dados, tem-se o Modelo Logístico e o Modelo de Cox. A comparação entre o ajuste destes dois modelos pode ser feita utilizando o teste escore proposto por Colosimo et al. (2000), Bootstrap não paramétrico ou Critérios de Informação de Akaike (AIC). Uma alternativa a estas téccnicas, do ponto de vista bayesiano, e a utilização do Fator de Bayes. O objetivo deste estudoé comparar o ajuste do Modelo Logístico com o do Modelo de Cox para dados grupados e censurados usando inicialmente critérios clássicos de seleção de modelos: o Critério de Informação de Akaike (AIC), o Critério de Informação de Akaike Corrigido (AICc) e o Critério de Informação Bayesiano (BIC). Posteriormente foi utilizado o Fator de Bayes, assim como o Critério de Informação Deviance (DIC) e adaptações dos critérios clássicos já citados, utilizando as amostras a posteriori geradas por um método MCMC. Como ilustração, foi usado um conjunto de dados referente a uma manifestação clínica da doença de Chagas, conhecida como megacólon chagásico (Almeida, 1996). / Abstract: Grouped data is a particular case of survival data with interval censoring, that occurs when the observations are evaluated at the same time intervals, and is generally associated at data with a large number of draws, or draws ratio more than 25% (Chalita et al., 2002). It can be analyzed considering discrete-time and tting models at the probability of an individual fails in a certain interval, given that survived the previous one (Lawless, 2002). Among the possible models adapted to this type of data we can mention the Logistic Model and the Cox's Model. The comparison between the t of these two models can be made using the score test proposed by Colosimo et al. (2000), nonparametric Bootstrap or the Akaike Information Criterion (AIC). An alternative to these techniques, from the Bayesian point of view, is the Bayes Factor. The purpose of this study is to compare the t of the Logistic Model with the Cox's Model to grouped and censoring data using, initially, classic model selection criteria: Akaike Information Criterion (AIC), Akaike Information Criterion corrected (AICc) and Bayesian Information Criterion (BIC). After that, was used the Bayes Factor, as well as Deviance Information Criterion (DIC) and adaptations of the classic model selection criteria above mentioned, using the posteriori sample generated by a MCMC method. As an example, was used a data set related to a clinical manifestation of Chagas disease known as chagasic megacolon (Almeida, 1996) / Mestre
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Aplicação de análise de sobrevivência no estudo da imobilidade tônica e do comportamento de reintegração social de perdizes (Rhynchotus rufescens) /

Hata, Milene Elissa. January 2014 (has links)
Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Sabrina Luzia Caetano / Banca: Janaina Della Torre da Silva / Banca: Patricia Tholon / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Isabel Cristina Boreli / Resumo: O estudo dos comportamentos de imobilidade tônica (IT) e de reintegração social (CRS) pode revelar as interações homem-animal e animalanimal, refletindo no bem-estar dos animais no ambiente de cativeiro, acarretando, assim, em respostas positivas ou negativas para a produção e lucratividade do sistema de criação. Visando entender o nível de medo e a manifestação de sociabilidade em perdizes (Rhynchotus rufescens), a metodologia de análise de sobrevivência foi utilizada para estimar o tempo de permanência em IT e o tempo transcorrido para um animal se unir com seu conspecífico. Para isto, perdizes criadas no Setor de Animais Silvestres - FCAV - Unesp submetidas às avaliações de IT e de CRS, no período de 2006 a 2010, foram utilizadas. As observações de IT foram realizadas em 539 aves e os resultados revelaram que os efeitos de ano de nascimento, mês e peso corporal da ave na época da medida de IT foram importantes fontes de variação na duração do tempo em catatonia. Além disso, aves com maior peso corporal tenderam a permanecer maior tempo em IT. Observações de CRS realizados em 503 aves mostraram que as mais velhas levaram mais tempo para unir-se ao conspecífico. O efeito aleatório de pai foi significativo (p < 0,05) para IT e a herdabilidade estimada (h2) empregando-se o software Survival Kit foi igual a 0,37. A h2 para CRS foi 0,31, entretanto supõe-se alto erro-padrão associado a esta estimativa devido ao efeito aleatório de pai não ter sido significativo (p < 0,05). A correlação entre os valores genéticos de IT e de CRS foi 0,0598 (p = 0,1491), evidenciando a inexistência de genes de efeito aditivo comuns entre estes dois comportamentos na população analisada. É possível aplicar a seleção nas aves para diminuir o tempo de permanência em IT, sem alterar o nível de socialização / Abstract: The study of tonic immobility (TI) and social reinstatement behavior (SRB) can reveal interactions between man-animal and animal-animal. Those interactions reflect on the welfare of captive animals and may result in positively or negatively effects on the production and profitability of production system. Aiming at understanding the level of fear and the manifestation of sociability in red-winged tinamou (Rhynchotus rufescens), the survival analysis was applied to estimate the time in TI and also the time expent to an animal join with its conspecific. For this, redwinged tinamous reared in the Setor de Animais Silvestres - FCAV - Unesp hatched from 2006 to 2010 underwent TI and SRB evaluations. The observations of TI were performed in 539 birds and the results revealed that the effects of year of birth, month, and body weight of the bird at the time the measure of TI were important sources of variation for the time in catatonia; furthermore, birds with higher body weight tended to remain longer in TI. The SRB observations made in 503 birds showed that the older birds spent more time then the younger to join with their conspecific. The random effect of sire was significant (p < 0.05) for TI and the estimated heritability (h2) by Survival Kit software was equal to 0.37. The h2 for SRB was 0.31, however the estimate is supposed to have a high standard error associated with due to the random effect of sire being not significant. The correlation between the predicted breeding values of TI and SRB was 0.0598 (p = 0.1491), evidencing the non existence of common additive genes between these two traits in the studied population. Therefore, selection to decrease the time in TI could be applied on TI, without changing the level of socialization in this population / Doutor

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